DNA Extraction from Paraffin Embedded Material for Genetic and Epigenetic Analyses

Disease development and progression are characterized by frequent genetic and epigenetic aberrations including chromosomal rearrangements, copy number ...

BC Cancer Research Centre

University of British Columbia - UBC

Carcinomi a cellule squamose (SqCCs) sorgono in una vasta gamma di tessuti tra cui pelle, polmone e della mucosa orale. Anche se tutti i SqCCs sono in origine epiteliale e condividere nomenclatura comune, questi tumori differiscono notevolmente per quanto riguarda l&#39;incidenza, la prognosi e il trattamento. Attuali conoscenze di genetiche somiglianze e differenze tra SqCCs sono insufficiente per descrivere la biologia di questi tumori, che derivano dalle origini di diversi tessuti. In questo paper ci forniscono una panoramica generale dell&#39;intero genoma approcci per la scoperta del gene e pathway ed evidenziare l&#39;avanzamento della genomica integrativa come una stato-of-the-art tecnologia nello studio della genetica SqCC.

Carcinoma a cellule squamose utilizzando approcci multidimensionali genomici di decifrazione.

&#x5728;&#x8303;&#x56F4;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x5305;&#x62EC;&#x76AE;&#x80A4;&#x3001; &#x80BA;&#x548C;&#x53E3;&#x8154;&#x9ECF;&#x819C;&#x51FA;&#x73B0;&#x9CDE;&#x72B6;&#x7EC6;&#x80DE;&#x764C; (SqCCs)&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x6240;&#x6709;&#x7684; SqCCs &#x662F;&#x5728;&#x8D77;&#x6E90;&#x4E0A;&#x76AE;&#x548C;&#x5171;&#x4EAB;&#x901A;&#x7528;&#x7684;&#x547D;&#x540D;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x764C;&#x75C7;&#x5DEE;&#x522B;&#x5F88;&#x5927;&#x7684;&#x53D1;&#x751F;&#x7387;&#x3001; &#x9884;&#x540E;&#x3001; &#x548C;&#x6CBB;&#x7597;&#x3002;&#x5F53;&#x524D;&#x77E5;&#x8BC6;&#x7684;&#x9057;&#x4F20;&#x76F8;&#x4F3C;&#x6027;&#x548C; SqCCs &#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x662F;&#x4E0D;&#x8DB3;&#x4EE5;&#x5F62;&#x5BB9;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x764C;&#x75C7;&#x51FA;&#x73B0;&#x4E0D;&#x540C;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x6765;&#x6E90;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x3002;&#x5728;&#x672C;&#x6587;&#x4E2D;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x901A;&#x8DEF;&#x7684;&#x53D1;&#x73B0;&#x63D0;&#x4F9B;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x65B9;&#x6CD5;&#x7684;&#x4E00;&#x822C;&#x6982;&#x8FF0;&#xFF0C;&#x5E76;&#x7A81;&#x51FA;&#x663E;&#x793A;&#x7EFC;&#x5408;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5B66;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E00;&#x79CD;&#x5148;&#x8FDB;&#x7684;&#x6280;&#x672F;&#x7684; SqCC &#x9057;&#x4F20;&#x5B66;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#x7684;&#x5730;&#x4F4D;&#x3002;

&#x7834;&#x8BD1;&#x4F7F;&#x7528;&#x591A;&#x7EF4;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5B66;&#x7684;&#x9CDE;&#x72B6;&#x7EC6;&#x80DE;&#x764C;&#x3002;

Squamous cell carcinomas (SqCCs) arise in a wide range of tissues including skin, lung, and oral mucosa. Although all SqCCs are epithelial in origin and share common nomenclature, these cancers differ greatly with respect to incidence, prognosis, and treatment. Current knowledge of genetic similarities and differences between SqCCs is insufficient to describe the biology of these cancers, which arise from diverse tissue origins. In this paper we provide a general overview of whole genome approaches for gene and pathway discovery and highlight the advancement of integrative genomics as a state-of-the-art technology in the study of SqCC genetics.

Deciphering squamous cell carcinoma using multidimensional genomic approaches.

Les carcinomes spinocellulaires (SqCCs) provenant d&#x26;#39;un large &#xE9;ventail de tissus, y compris la peau, du poumon, et la muqueuse buccale. Bien que tous les SqCCs sont &#xE9;pith&#xE9;liale dans la nomenclature d&#x26;#39;origine et l&#x26;#39;action ordinaire, ces cancers diff&#xE8;rent grandement en ce qui concerne l&#x26;#39;incidence, le pronostic et le traitement. Les connaissances actuelles sur les similitudes et les diff&#xE9;rences g&#xE9;n&#xE9;tiques entre SqCCs est insuffisante pour d&#xE9;crire la biologie de ces cancers, qui d&#xE9;coulent de diverses origines tissulaires. Dans cet article nous donner un aper&#xE7;u g&#xE9;n&#xE9;ral des approches g&#xE9;nomiques enti&#xE8;res pour le g&#xE8;ne et la voie de la d&#xE9;couverte et mettre en &#xE9;vidence l&#x26;#39;avancement de la g&#xE9;nomique int&#xE9;grative comme une technologie state-of-the-art dans l&#x26;#39;&#xE9;tude de la g&#xE9;n&#xE9;tique SqCC.

D&#xE9;crypter carcinome spinocellulaire aide multidimensionnelles Approches g&#xE9;nomiques

Squamous Zelle Karzinome (SqCCs) auftreten in eine Vielzahl der Gewebe wie Haut, Lunge und Mundschleimhaut. Obwohl alle SqCCs epithelialen Ursprungs sind und gemeinsame Nomenklatur teilen, unterschiedlich diese Krebsarten sehr in Bezug auf die Inzidenz, Prognose und Behandlung. Aktuelles wissen &uuml;ber genetische &Auml;hnlichkeiten und Unterschiede von SqCCs ausreicht, um die Biologie dieser Krebserkrankungen beschreiben die Herkunft der verschiedenen Gewebe entstehen. In diesem Papier wir bieten einen allgemeinen &Uuml;berblick &uuml;ber das gesamte Genom Ans&auml;tze f&uuml;r gen und Pathway Entdeckung und die F&ouml;rderung der integrativen Genomics als Zustand-of-the-Art Technologie in der Studie der SqCC Genetik zu markieren.

Entschl&uuml;sselung Plattenepithelkarzinom mit mehrdimensionale genomische Ans&auml;tzen.

&#x6241;&#x5E73;&#x4E0A;&#x76AE;&#x764C;&#xFF08;SqCCs&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x76AE;&#x819A;&#x3001;&#x80BA;&#x3001;&#x53E3;&#x8154;&#x7C98;&#x819C;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x7D44;&#x7E54;&#x306E;&#x5E83;&#x3044;&#x7BC4;&#x56F2;&#x3067;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;SqCCs&#x304C;&#x8D77;&#x6E90;&#x3068;&#x5171;&#x901A;&#x306E;&#x547D;&#x540D;&#x306E;&#x4E0A;&#x76AE;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x304C;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x764C;&#x306F;&#x767A;&#x751F;&#x7387;&#x3001;&#x4E88;&#x5F8C;&#x3001;&#x6CBB;&#x7642;&#x306B;&#x95A2;&#x3057;&#x3066;&#x5927;&#x304D;&#x304F;&#x7570;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002; SqCCs&#x9593;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x985E;&#x4F3C;&#x70B9;&#x3068;&#x76F8;&#x9055;&#x70B9;&#x306E;&#x73FE;&#x5728;&#x306E;&#x77E5;&#x8B58;&#x306F;&#x3001;&#x591A;&#x69D8;&#x306A;&#x7D44;&#x7E54;&#x306E;&#x8D77;&#x6E90;&#x304B;&#x3089;&#x751F;&#x3058;&#x308B;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x764C;&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x3092;&#x8A18;&#x8FF0;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x4E0D;&#x5341;&#x5206;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x672C;&#x7A3F;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3068;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x767A;&#x898B;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x5168;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306E;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306A;&#x6982;&#x8981;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3001;SqCC&#x907A;&#x4F1D;&#x5B66;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x200B;&#x200B;&#x6700;&#x5148;&#x7AEF;&#x306E;&#x6280;&#x8853;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x7D71;&#x5408;&#x30B2;&#x30CE;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x306E;&#x9032;&#x6B69;&#x3092;&#x5F37;&#x8ABF;&#x8868;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x591A;&#x6B21;&#x5143;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x3066;&#x6241;&#x5E73;&#x4E0A;&#x76AE;&#x764C;&#x306E;&#x89E3;&#x8AAD;

&#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xD53C;&#xBD80;, &#xAD6C;&#xAC15; &#xC810; &#xB9C9;, &#xD3D0;, &#xB4F1; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD558;&#xB294; &#xD3B8;&#xD3C9; &#xC138;&#xD3EC; carcinomas (SqCCs). &#xBE44;&#xB85D; &#xBAA8;&#xB4E0; SqCCs &#xC0C1;&#xD53C; &#xAE30;&#xC6D0;&#xC5D0; &#xD558; &#xACE0; &#xACF5;&#xC720; &#xD558;&#xB294; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xBA85;&#xCE6D;,&#xC774; &#xC554; &#xBC1C;&#xBCD1; &#xB960;, &#xC608; &#xD6C4;, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xCE58;&#xB8CC;&#xC5D0; &#xB300;&#xD574; &#xD06C;&#xAC8C; &#xB2E4;&#xB985;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD604;&#xC7AC; &#xC9C0;&#xC2DD;&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC801; &#xC720;&#xC0AC;&#xC131;&#xACFC; &#xCC28;&#xC774;&#xC810; SqCCs &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC870;&#xC9C1;&#xC758; &#xAE30;&#xC6D0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD558;&#xB294; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC554; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559;&#xC744; &#xC124;&#xBA85; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xCDA9;&#xBD84; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC885;&#xC774;&#xC5D0; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC0F; &#xD1B5;&#xB85C; &#xBC1C;&#xACAC;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xC804;&#xCCB4; &#xAC8C;&#xB188; &#xC811;&#xADFC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xAC1C;&#xC694;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558; &#xACE0; SqCC &#xC720;&#xC804;&#xD559; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xCD5C;&#xC2E0; &#xAE30;&#xC220;&#xB85C; &#xD1B5;&#xD569; &#xC720;&#xC804;&#xCCB4;&#xD559;&#xC758; &#xBC1C;&#xC804;&#xC744; &#xAC15;&#xC870;.

&#xD3B8;&#xD3C9; &#xC138;&#xD3EC; &#xC554; &#xC885; &#xB2E4;&#xCC28;&#xC6D0; &#xAC8C;&#xB188; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xD574;&#xB3C5;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Carcinomas de c&#xE9;lulas escamosas (SqCCs) surgen en una amplia gama de tejidos, incluyendo piel, los pulmones y la mucosa oral. A pesar de todos los SqCCs son epiteliales en la nomenclatura de origen y acci&#xF3;n com&#xFA;n, estos c&#xE1;nceres son muy diferentes con respecto a la incidencia, pron&#xF3;stico y tratamiento. El conocimiento actual de las similitudes y diferencias gen&#xE9;ticas entre SqCCs es insuficiente para describir la biolog&#xED;a de estos c&#xE1;nceres que surgen de or&#xED;genes diversos tejidos. En este art&#xED;culo ofrecemos una visi&#xF3;n general de los enfoques de todo el genoma para el descubrimiento de genes y la v&#xED;a y poner de relieve el avance de la gen&#xF3;mica de integraci&#xF3;n como una tecnolog&#xED;a de vanguardia en el estudio de la gen&#xE9;tica SQCC.

Descifrar carcinoma de c&#xE9;lulas escamosas multidimensionales Uso de enfoques gen&#xF3;micos

&#x5316;&#x7597;&#x8010;&#x836F;&#x662F;&#x4EE4;&#x4EBA;&#x6CAE;&#x4E27;&#x7684;&#x80BA;&#x764C;&#x60A3;&#x8005;&#x9884;&#x540E;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x8D21;&#x732E;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x7814;&#x7A76;&#x96C6;&#x4E2D;&#x4E8E;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x7A81;&#x53D8;&#x548C;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7F16;&#x7801;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#xFF0C;&#x6700;&#x8FD1;&#x7684;&#x62A5;&#x544A;&#x8868;&#x660E; microRNA (&#x7C73;&#x5C14;) &#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x8FD8;&#x5728;&#x5316;&#x7597;&#x53CD;&#x5E94;&#x4E2D;&#x53D1;&#x6325;&#x4E3E;&#x8DB3;&#x8F7B;&#x91CD;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x4F46;&#x662F;&#xFF0C;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x6539;&#x53D8;&#xFF0C;&#x7C73;&#x5C14;&#x4F4D;&#x70B9;&#x5728;&#x4E0A;&#x4E0B;&#x6587;&#x4E2D;&#x7684;&#x5316;&#x7597;&#x53CD;&#x5E94;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x5C1A;&#x672A;&#x8FDB;&#x884C;&#x8C03;&#x67E5;&#x3002;&#x5728;&#x6B64;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5C55;&#x793A;&#x5E94;&#x7528;&#x7EFC;&#x5408;&#x7684;&#x3001; &#x591A;&#x5C42;&#x9762;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x67E5;&#x660E;&#x4E0E;&#x5316;&#x7597;&#x836F;&#x7269;&#x8010;&#x836F;&#x548C;&#x5229;&#x7528;&#x516C;&#x5F00;&#x53EF;&#x7528;&#x7684;&#x836F;&#x7269;&#x53CD;&#x5E94;&#x7684;&#x654F;&#x611F;&#x6027;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x7684; Mirna&#xFF0C;&#x7C73;&#x5C14;&#x5EA7;&#x4F4D;&#x6570;&#x3001; &#x7C73;&#x5C14;&#x8868;&#x8FBE;&#x548C; mRNA &#x8868;&#x8FBE;&#x6570;&#x636E;&#x590D;&#x5236;&#x4ECE;&#x72EC;&#x7ACB;&#x7684;&#x8D44;&#x6E90;&#x3002;&#x717D;&#x52A8;&#x903B;&#x8F91;&#x9010;&#x6B65;&#x6218;&#x7565;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x5177;&#x4F53; Mirna &#x4E0E;&#x51E0;&#x79CD;&#x5316;&#x7597;&#x836F;&#x7269;&#x6297;&#x6027;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x5E76;&#x63D0;&#x4F9B;&#x539F;&#x5219;&#x793A;&#x8303;&#x5982;&#x4F55;&#x53EF;&#x80FD;&#x5229;&#x7528;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x5E93;&#x4E2D;&#x83B7;&#x5F97;&#x6709;&#x5173;&#x82B1;&#x67B6;&#x5B50;&#x7ED3;&#x679C;&#x7684;&#x8BC1;&#x660E;&#x3002;

MicroRNA &#x57FA;&#x56E0;&#x7528;&#x91CF;&#x6539;&#x5EFA;&#x548C;&#x80BA;&#x764C;&#x7684;&#x836F;&#x7269;&#x53CD;&#x5E94;&#x3002;

Chemotherapy resistance is a key contributor to the dismal prognoses for lung cancer patients. While the majority of studies have focused on sequence mutations and expression changes in protein-coding genes, recent reports have suggested that microRNA (miRNA) expression changes also play an influential role in chemotherapy response. However, the role of genetic alterations at miRNA loci in the context of chemotherapy response has yet to be investigated. In this study, we demonstrate the application of an integrative, multidimensional approach in order to identify miRNAs that are associated with chemotherapeutic resistance and sensitivity utilizing publicly available drug response, miRNA loci copy number, miRNA expression, and mRNA expression data from independent resources. By instigating a logical stepwise strategy, we have identified specific miRNAs that are associated with resistance to several chemotherapeutic agents and provide a proof of principle demonstration of how these various databases may be exploited to derive relevant pharmacogenomic results.

MicroRNA gene dosage alterations and drug response in lung cancer.

R&#xE9;sistance &#xE0; la chimioth&#xE9;rapie est un facteur cl&#xE9; pour les pronostics sombres pour les patients du cancer du poumon. Alors que la majorit&#xE9; des &#xE9;tudes ont mis l&#x26;#39;accent sur les mutations et les changements de s&#xE9;quence d&#x26;#39;expression dans g&#xE8;nes codant des prot&#xE9;ines, des rapports r&#xE9;cents ont sugg&#xE9;r&#xE9; que les changements d&#x26;#39;expression de microARN (miARN) jouent &#xE9;galement un r&#xF4;le influent dans r&#xE9;ponse &#xE0; la chimioth&#xE9;rapie. Cependant, le r&#xF4;le des alt&#xE9;rations g&#xE9;n&#xE9;tiques &#xE0; des loci miRNA dans le contexte de r&#xE9;ponse &#xE0; la chimioth&#xE9;rapie n&#x26;#39;a pas encore &#xE9;t&#xE9; &#xE9;tudi&#xE9;. Dans cette &#xE9;tude, nous d&#xE9;montrons l&#x26;#39;application d&#x26;#39;une approche globale et multidimensionnelle afin d&#x26;#39;identifier les miARN qui sont associ&#xE9;es &#xE0; la r&#xE9;sistance et la sensibilit&#xE9; chimioth&#xE9;rapeutique en utilisant la r&#xE9;ponse aux m&#xE9;dicaments accessibles au public, loci miRNA copier le num&#xE9;ro, l&#x26;#39;expression du miARN et des donn&#xE9;es d&#x26;#39;expression d&#x26;#39;ARNm de ressources ind&#xE9;pendantes. Par l&#x26;#39;incitation, une strat&#xE9;gie logique progressive, nous avons identifi&#xE9; miRNAs sp&#xE9;cifiques qui sont associ&#xE9;es &#xE0; une r&#xE9;sistance &#xE0; plusieurs agents chimioth&#xE9;rapeutiques et fournir une preuve de la d&#xE9;monstration principe de la fa&#xE7;on dont ces diff&#xE9;rentes bases de donn&#xE9;es peuvent &#xEA;tre exploit&#xE9;es pour d&#xE9;river des r&#xE9;sultats pertinents pharmacog&#xE9;nomiques.

Modifications microARN Gene dosage et la r&#xE9;ponse aux m&#xE9;dicaments dans le cancer du poumon

Chemotherapie-Resistenz ist eine Schl&uuml;sselfigur f&uuml;r die d&uuml;steren Prognosen f&uuml;r Patienten mit Lungenkrebs. W&auml;hrend die Mehrzahl der Studien auf Sequenz-Mutationen und Ausdruck &Auml;nderungen im Protein-kodierenden Gene konzentriert haben, haben die j&uuml;ngsten Berichte vorgeschlagen, dass MicroRNA (MiRNA) Ausdruck &Auml;nderungen in der Chemotherapie als Antwort auch eine einflussreiche Rolle spielen. Allerdings hat die Rolle der genetischen Ver&auml;nderungen bei MiRNA Loci im Zusammenhang mit der Chemotherapie-Antwort noch untersucht werden. In dieser Studie zeigen wir die Anwendung der integrativen, mehrdimensionalen Ansatz um MiRNAs zu identifizieren, die mit chemotherapeutischen Widerstand und Empfindlichkeit Nutzung &ouml;ffentlich zug&auml;nglicher Ansprechens, MiRNA Loci Anzahl, MiRNA-Ausdruck und mRNA Ausdruck Daten aus unabh&auml;ngigen Ressourcen kopieren. Durch eine logische schrittweise Strategie Anstiftung, haben wir bestimmte MiRNAs identifiziert, die Resistenz gegen verschiedene Chemotherapeutika zugeordnet sind und belegen Sie einen Grundsatz Demonstration wie diese verschiedenen Datenbanken ausgenutzt werden k&ouml;nnen, um die relevanten pharmakogenomischer Ergebnisse ableiten.

MicroRNA Genver&auml;nderungen Dosierung und Ansprechens bei Lungenkrebs.

Chemioterapia la resistenza &egrave; un fattore chiave per il triste prognosi per pazienti affetti da cancro del polmone. Mentre la maggior parte degli studi si &egrave; concentrati sulle mutazioni di sequenza e cambiamenti di espressione di geni codificanti proteine, rapporti recenti hanno suggerito che cambiamenti di espressione di microRNA (miRNA) giocano anche un ruolo influente nella risposta di chemioterapia. Tuttavia, il ruolo delle alterazioni genetiche a miRNA loci nel contesto della risposta chemioterapia deve ancora essere studiata. In questo studio, ci dimostrano l&#39;applicazione di un approccio multidimensionale, integrativo al fine di identificare i miRNAs che sono associati con chemioterapico resistenza e sensibilit&agrave; che utilizzano risposta farmaco pubblicamente disponibile, miRNA loci copia numero, espressione di miRNA e dati di espressione di mRNA da risorse indipendenti. Istigando una logica strategia graduale, abbiamo identificato miRNAs specifici che sono associate a resistenza a diversi agenti chemioterapici e fornire una prova di dimostrazione di principio di come questi vari database possono essere sfruttati per ricavare risultati pertinenti farmacogenomica.

Alterazioni di dosaggio gene MicroRNA e risposta di droga nel cancro del polmone.

&#x5316;&#x5B66;&#x7642;&#x6CD5;&#x62B5;&#x6297;&#x6027;&#x306F;&#x80BA;&#x304C;&#x3093;&#x60A3;&#x8005;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x60B2;&#x60E8;&#x306A;&#x4E88;&#x5F8C;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x8CA2;&#x732E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x5927;&#x534A;&#x306F;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3092;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x5909;&#x7570;&#x3068;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x306B;&#x7126;&#x70B9;&#x3092;&#x5F53;&#x3066;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304C;&#x3001;&#x6700;&#x8FD1;&#x306E;&#x5831;&#x544A;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;RNA&#xFF08;miRNA&#xFF09;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x306F;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x5316;&#x5B66;&#x7642;&#x6CD5;&#x306E;&#x5FDC;&#x7B54;&#x306B;&#x5F71;&#x97FF;&#x529B;&#x306E;&#x3042;&#x308B;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x679C;&#x305F;&#x3059;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x5506;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x5316;&#x5B66;&#x7642;&#x6CD5;&#x5FDC;&#x7B54;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C6;&#x30AD;&#x30B9;&#x30C8;&#x5185;&#x3067;&#x306E;miRNA&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5EA7;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5909;&#x7570;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x304C;&#x8ABF;&#x67FB;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;miRNA&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5EA7;&#x306E;&#x6570;&#x3001;miRNA&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x72EC;&#x7ACB;&#x3057;&#x305F;&#x30EA;&#x30BD;&#x30FC;&#x30B9;&#x304B;&#x3089;&#x306E;mRNA&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x30B3;&#x30D4;&#x30FC;&#x3057;&#x3001;&#x516C;&#x7684;&#x306B;&#x5229;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x306A;&#x85AC;&#x7269;&#x53CD;&#x5FDC;&#x3092;&#x5229;&#x7528;&#x3057;&#x305F;&#x5316;&#x5B66;&#x7642;&#x6CD5;&#x62B5;&#x6297;&#x6027;&#x3068;&#x611F;&#x53D7;&#x6027;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;miRNA&#x3092;&#x540C;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x7D71;&#x5408;&#x7684;&#x3001;&#x591A;&#x6B21;&#x5143;&#x7684;&#x306A;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306E;&#x9069;&#x7528;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x8AD6;&#x7406;&#x7684;&#x306A;&#x6BB5;&#x968E;&#x7684;&#x306A;&#x6226;&#x7565;&#x3092;&#x6247;&#x52D5;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x5316;&#x5B66;&#x7642;&#x6CD5;&#x5264;&#x306B;&#x5BFE;&#x3059;&#x308B;&#x62B5;&#x6297;&#x6027;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;miRNA&#x3092;&#x540C;&#x5B9A;&#x3057;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x69D8;&#x3005;&#x306A;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306F;&#x3001;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x85AC;&#x7406;&#x7D50;&#x679C;&#x3092;&#x5C0E;&#x51FA;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x60AA;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x65B9;&#x6CD5;&#x306E;&#x539F;&#x7406;&#x5B9F;&#x8A3C;&#x306E;&#x8A3C;&#x62E0;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x80BA;&#x764C;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;microRNA&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x91CF;&#x306E;&#x5909;&#x7570;&#x3068;&#x85AC;&#x7269;&#x53CD;&#x5FDC;

&#xD654;&#xD559; &#xC694;&#xBC95; &#xC800;&#xD56D; &#xD3D0; &#xC554; &#xD658;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC74C;&#xCE68;&#xD55C; prognoses&#xC5D0; &#xD575;&#xC2EC; &#xAE30;&#xC5EC;&#xC790; &#xC774;&#xB2E4;. &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC758; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xBC0F; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xCF54;&#xB529; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC2DD; &#xBCC0;&#xD654;&#xC5D0; &#xCD08;&#xC810;&#xC744; &#xB9DE;&#xCD94;&#xACE0; &#xC788;&#xB2E4;, &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xCD5C;&#xADFC; &#xBCF4;&#xACE0;&#xC11C;&#xB294; microRNA (&#xBBF8;&#xB974;) &#xC2DD; &#xBCC0;&#xACBD; &#xB610;&#xD55C; &#xD654;&#xD559; &#xC694;&#xBC95; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC601;&#xD5A5;&#xB825; &#xC788;&#xB294; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xD560; &#xC81C;&#xC548; &#xD588;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098; &#xD654;&#xD559; &#xC694;&#xBC95; &#xC751;&#xB2F5;&#xC758; &#xB9E5;&#xB77D;&#xC5D0;&#xC11C; miRNA loci&#xC5D0; &#xC720;&#xC804; &#xBCC0;&#xACBD;&#xC758; &#xC5ED;&#xD560;&#xC740; &#xC544;&#xC9C1; &#xC870;&#xC0AC;&#xC5D0;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; miRNA loci &#xB3C5;&#xB9BD;&#xC801;&#xC778; &#xB9AC;&#xC18C;&#xC2A4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC218; &#xBBF8;&#xB974; &#xD45C;&#xD604;&#xACFC; mRNA &#xC2DD; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xBCF5;&#xC0AC;, miRNAs &#xD654;&#xD559;&#xC694;&#xBC95; &#xC800;&#xD56D;&#xACFC; &#xD65C;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xACF5;&#xAC1C;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; &#xC57D;&#xBB3C; &#xBC18;&#xC751; &#xAC10;&#xB3C4;&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xC744; &#xC704;&#xD574; &#xD1B5;&#xD569;, &#xB2E4;&#xCC28;&#xC6D0; &#xC811;&#xADFC; &#xC751;&#xC6A9; &#xD504;&#xB85C;&#xADF8;&#xB7A8; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB17C;&#xB9AC;&#xC801; stepwise &#xC804;&#xB7B5; &#xC0AC;&#xC8FC;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xD654;&#xD559;&#xC694;&#xBC95; &#xC5D0;&#xC774;&#xC804;&#xD2B8;&#xC5D0; &#xC800;&#xD56D; &#xBC0F; &#xD30C;&#xC0DD; &#xAD00;&#xB828; pharmacogenomic &#xACB0;&#xACFC; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xBCA0;&#xC774;&#xC2A4; &#xC218; &#xC774;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xBC29;&#xBC95;&#xC758; &#xB370;&#xBAA8; &#xC6D0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC99D;&#xAC70;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xB294; &#xD2B9;&#xC815; miRNAs &#xD30C;&#xC545; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

MicroRNA &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBCF5;&#xC6A9;&#xB7C9; &#xBCC0;&#xACBD; &#xBC0F; &#xD3D0;&#xC554;&#xC758; &#xC57D;&#xBB3C; &#xBC18;&#xC751;.

Resistencia a la quimioterapia es un factor clave en el pron&#xF3;stico sombr&#xED;o para aquellos pacientes con c&#xE1;ncer de pulm&#xF3;n. Mientras que la mayor&#xED;a de los estudios se han centrado en la secuencia de mutaciones y cambios de expresi&#xF3;n en genes codificadores de prote&#xED;nas, los informes recientes han sugerido que el microRNA (miRNA) los cambios de expresi&#xF3;n tambi&#xE9;n juegan un papel influyente en la respuesta a la quimioterapia. Sin embargo, el papel de las alteraciones gen&#xE9;ticas en los loci miRNA en el contexto de la respuesta a la quimioterapia a&#xFA;n no se ha investigado. En este estudio, se demuestra la aplicaci&#xF3;n de un enfoque integral, multidimensional, con el fin de identificar miRNAs que est&#xE1;n asociadas con resistencia a la quimioterapia y la sensibilidad de la utilizaci&#xF3;n de la respuesta al f&#xE1;rmaco a disposici&#xF3;n del p&#xFA;blico, los loci miARN copiar el n&#xFA;mero, la expresi&#xF3;n de miRNA, y los datos de expresi&#xF3;n de ARNm de recursos independientes. Por instigaci&#xF3;n de una estrategia paso a paso l&#xF3;gico, hemos identificado miRNAs espec&#xED;ficos que est&#xE1;n asociados con la resistencia a varios agentes quimioter&#xE1;picos y proporcionar una prueba de demostraci&#xF3;n de principio de c&#xF3;mo estas diversas bases de datos pueden ser explotadas para obtener resultados relevantes de farmacogen&#xF3;mica.

Alteraciones en los genes microARN dosis y respuesta a f&#xE1;rmacos en el c&#xE1;ncer de pulm&#xF3;n

&#x53E3;&#x8154;&#x4E0A;&#x76AE; dysplasias &#x88AB;&#x8BA4;&#x4E3A;&#x901A;&#x8FC7;&#x4E00;&#x7CFB;&#x5217;&#x7684;&#x75C5;&#x7406;&#x9636;&#x6BB5; &#xFF1B; &#x53D6;&#x5F97;&#x8FDB;&#x5C55;&#x4ECE;&#x8F7B;&#x5EA6;&#x5230;&#x91CD;&#x5EA6;&#x4E0D;&#x5178;&#x578B;&#x589E;&#x751F;&#xFF0C;&#x539F;&#x4F4D;&#x764C;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x5411;&#x548C;&#x6700;&#x540E;&#x5230;&#x521B;&#x764C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x3002;&#x57FA;&#x672C;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x75C5;&#x7406;&#x5B66;&#x54C1;&#x4F4D;&#x8FD9;&#x79CD;&#x53D8;&#x5316;&#x662F;&#x6BDB;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x6539;&#x5EFA;&#x548C;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7F16;&#x7801;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x975E;&#x7F16;&#x7801; Rna &#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x7684;&#x8BBA;&#x6587;&#x63CF;&#x8FF0;&#x4E86;&#x534F;&#x4F1A;&#x7684; Microrna&#xFF0C;&#x4E00;&#x7C7B;&#x7684;&#x975E;&#x7F16;&#x7801; Rna&#xFF0C;&#x4E0E;&#x53E3;&#x8154;&#x764C;&#x7684;&#x5F02;&#x5E38;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x8868;&#x8FBE;&#x8C31;&#x7684;&#x957F;&#x975E;&#x7F16;&#x7801; Rna &#xFF08;lncRNAs&#xFF09; &#x6709;&#x4E0D;&#x62A5;&#x9053;&#x3002;&#x957F;&#x975E;&#x7F16;&#x7801; Rna &#x662F;&#x4E00;&#x7C7B;&#x65B0;&#x578B;&#x7684; mRNA &#x6837;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355;&#x6CA1;&#x6709;&#x86CB;&#x767D;&#x7F16;&#x7801;&#x80FD;&#x529B;&#xFF0C;&#x4F46;&#x5177;&#x6709;&#x591A;&#x79CD;&#x529F;&#x80FD;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x5728;&#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20;&#x5B66;&#x53CA;&#x57FA;&#x56E0;&#x8C03;&#x63A7;&#x7684;&#x89D2;&#x8272;&#x3002;&#x5728;&#x6700;&#x8FD1;&#x7684;&#x62A5;&#x9053;&#xFF0C;lncRNAs &#x7684;&#x5F02;&#x5E38;&#x8868;&#x8FBE;&#x4E86;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x764C;&#x75C7;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x8868;&#x660E;&#x5728;&#x80BF;&#x7624;&#x53D1;&#x751F;&#x4E2D;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x4F5C;&#x7528;&#x4E0E;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x63D0;&#x51FA;&#x7684;&#x7B2C;&#x4E00;&#x4E2A;&#x957F;&#x975E;&#x7F16;&#x7801; RNA &#x8868;&#x8FBE;&#x6620;&#x5C04;&#x4E3A;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x53E3;&#x8154;&#x9ECF;&#x819C;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x63CF;&#x8FF0; 325 &#x957F;&#x975E;&#x7F16;&#x7801; Rna&#xFF0C;&#x6697;&#x793A; lncRNA &#x8868;&#x8FBE;&#x5927;&#x5927;&#x6709;&#x52A9;&#x4E8E;&#x53E3;&#x8154;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x8010;&#x4EBA;&#x5BFB;&#x5473;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x68C0;&#x6D4B;&#x5230;&#x7684; lncRNAs &sim;60%&#x663E;&#x793A;&#x5F02;&#x5E38;&#x8868;&#x8FBE;&#x5728;&#x53E3;&#x8154;&#x764C;&#x524D;&#x75C5;&#x53D8;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B; lncRNAs &#x7684;&#x4E00;&#x4E9B;&#x4E00;&#x76F4;&#x5148;&#x524D;&#x4E0E;&#x5176;&#x4ED6;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x764C;&#x75C7;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;

&#x957F;&#x975E;&#x7F16;&#x7801; Rna &#x662F;&#x53E3;&#x8154;&#x7C98;&#x819C;&#x4E2D;&#x8868;&#x8FBE;&#xFF0C;&#x4E14;&#x5728;&#x53E3;&#x8154;&#x764C;&#x524D;&#x75C5;&#x53D8;&#x4E2D;&#x66F4;&#x6539;&#x3002;

Oral epithelial dysplasias are believed to progress through a series of histopathological stages; from mild to severe dysplasia, to carcinoma in situ, and finally to invasive OSCC. Underlying this change in histopathological grade are gross chromosome alterations and changes in gene expression of both protein-coding genes and non-coding RNAs. Recent papers have described associations of aberrant expression of microRNAs, one class of non-coding RNAs, with oral cancer. However, expression profiling of long non-coding RNAs (lncRNAs) has not been reported. Long non-coding RNAs are a novel class of mRNA-like transcripts with no protein coding capacity, but with a variety of functions including roles in epigenetics and gene regulation. In recent reports, the aberrant expression of lncRNAs has been associated with human cancers, suggesting a critical role in tumorigenesis. Here, we present the first long non-coding RNA expression map for the human oral mucosa. We describe the expression of 325 long non-coding RNAs, suggesting lncRNA expression contributes significantly to the oral transcriptome. Intriguingly, âˆ¼60% of the detected lncRNAs show aberrant expression in oral premalignant lesions. A number of these lncRNAs have been previously associated with other human cancers.

Long non-coding RNAs are expressed in oral mucosa and altered in oral premalignant lesions.

Orales dysplasies &#xE9;pith&#xE9;liales sont cens&#xE9;es progresser &#xE0; travers une s&#xE9;rie d&#x26;#39;&#xE9;tapes histopathologiques; de doux &#xE0; une dysplasie s&#xE9;v&#xE8;re, au carcinome in situ, et enfin &#xE0; CCCO invasive. Sous-jacente de ce changement dans le grade histopathologique sont des alt&#xE9;rations chromosomiques bruts et des changements dans l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes des deux g&#xE8;nes codant des prot&#xE9;ines et ARN non-codants. Des articles r&#xE9;cents ont d&#xE9;crit des associations de l&#x26;#39;expression aberrante de microARN, une classe de ARN non-codants, de cancer buccal. Toutefois, le profil d&#x26;#39;expression de longues ARN non-codants (lncRNAs) n&#x26;#39;a pas &#xE9;t&#xE9; signal&#xE9;e. Longues ARN non-codants sont une nouvelle classe de l&#x26;#39;ARNm de type relev&#xE9;s de notes, sans capacit&#xE9; de codage de la prot&#xE9;ine, mais avec une vari&#xE9;t&#xE9; de fonctions, y compris des r&#xF4;les dans l&#x26;#39;&#xE9;pig&#xE9;n&#xE9;tique et la r&#xE9;gulation des g&#xE8;nes. Dans des rapports r&#xE9;cents, l&#x26;#39;expression aberrante de lncRNAs a &#xE9;t&#xE9; associ&#xE9;e &#xE0; des cancers humains, ce qui sugg&#xE8;re un r&#xF4;le essentiel dans la tumorigen&#xE8;se. Ici, nous pr&#xE9;sentons le premier long non codante carte expression de l&#x26;#39;ARN pour la muqueuse buccale humaine. Nous d&#xE9;crivons l&#x26;#39;expression de 325 longs ARN non-codants, sugg&#xE9;rant l&#x26;#39;expression lncRNA contribue de mani&#xE8;re significative au transcriptome orale. Curieusement, ~ 60% des lncRNAs d&#xE9;tect&#xE9;s montrent une expression aberrante dans orales des l&#xE9;sions pr&#xE9;canc&#xE9;reuses. Un certain nombre de ces lncRNAs ont d&#xE9;j&#xE0; &#xE9;t&#xE9; associ&#xE9;e &#xE0; d&#x26;#39;autres cancers humains.

Longues ARN non-codants sont exprim&#xE9;s en muqueuse buccale et modifi&#xE9;s aux oraux des l&#xE9;sions pr&#xE9;canc&#xE9;reuses

Orale Epithel-Dysplasien werden geglaubt, um Fortschritte durch eine Reihe von histopathologischen Stufen; von mild bis schwere Dysplasie, Carcinoma in situ, und schlie&szlig;lich zu invasiven OSCC. Diese &Auml;nderung der histopathologischen Besoldungsgruppe zugrunde, sind Brutto Chromosom &Auml;nderungen und &Auml;nderungen in der Genexpression der Protein-kodierenden Gene und der nicht-kodierenden RNAs. Neuere Arbeiten haben die Verb&auml;nde der aberrante Expression von MicroRNAs, eine Klasse von nicht-kodierenden RNAs, mit Mundkrebs beschrieben. Jedoch hat Expression profiling von lange nicht-kodierenden RNAs (LncRNAs) nicht gemeldet. Lange nicht-kodierenden RNAs sind eine neuartige Klasse von mRNA-wie Abschriften mit keine Proteins Kapazit&auml;t, aber mit einer Vielzahl von Funktionen, einschlie&szlig;lich Rollen in Epigenetics und gen-Verordnung. In den letzten Berichten wurde der abwegigen Ausdruck der LncRNAs menschlichen Krebserkrankungen, was auf eine entscheidende Rolle bei der Tumorentstehung zugeordnet. Hier pr&auml;sentieren wir die erste lange non-coding RNA Ausdruck Karte f&uuml;r die menschliche Mundschleimhaut. Wir beschreiben den Ausdruck von 325 lange nicht-kodierenden RNAs, was darauf hindeutet, LncRNA Ausdruck tr&auml;gt erheblich zu den m&uuml;ndlichen Transkriptom. Interessanterweise zeigen &sim;60 % der erkannten LncRNAs aberrante Expression in m&uuml;ndlichen pr&auml;maligne L&auml;sionen. Eine Anzahl von diesen LncRNAs wurden zuvor mit anderen menschlichen Krebserkrankungen verkn&uuml;pft.

Lange nicht-kodierenden RNAs sind in Mundschleimhaut ausgedr&uuml;ckt und in m&uuml;ndlichen pr&auml;maligne L&auml;sionen ver&auml;ndert.

Displasie epiteliali orali sono credute a progredire attraverso una serie di stadi istopatologici; da lieve a grave displasia, al carcinoma in situ e infine a invasivi OSCC. Alla base di questo cambiamento in grado istopatologico sono alterazioni cromosomiche lordo e cambiamenti nell&#39;espressione genica di geni codificanti proteine e di RNA non codificanti. Articoli recenti sono descritte associazioni di aberrante espressione di microRNA, una classe di non-coding RNAs, con cancro orale. Tuttavia, analisi di espressione di lunga non-coding RNAs (lncRNAs) non &egrave; stata segnalata. Lunga non-coding RNAs sono una classe di romanzo dei trascritti di mRNA-come con nessuna capacit&agrave; di codificazione della proteina, ma con una variet&agrave; di funzioni, inclusi i ruoli nella regolazione epigenetica e gene. In recenti rapporti, l&#39;espressione aberrante di lncRNAs &egrave; stato associato con tumori umani, suggerendo un ruolo critico nella tumorigenesi. Qui, vi presentiamo il prima lungo non codificanti RNA espressione mappa per la mucosa orale umano. Descriviamo l&#39;espressione di 325 lungo non-coding RNAs, suggerendo lncRNA espressione contribuisce significativamente alla transcriptome orale. Curiosamente, % &sim;60 della lncRNAs rilevati mostrano aberrante espressione orale lesioni precancerose. Un certo numero di questi lncRNAs &egrave; stati precedentemente associato con altri tumori umani.

Lunga non-coding RNAs sono espressi nella mucosa orale e alterato in lesioni precancerose orali.

&#x53E3;&#x8154;&#x4E0A;&#x76AE;&#x7570;&#x5F62;&#x6210;&#x306F;&#x75C5;&#x7406;&#x7D44;&#x7E54;&#x5B66;&#x7684;&#x30B9;&#x30C6;&#x30FC;&#x30B8;&#x306E;&#x30B7;&#x30EA;&#x30FC;&#x30BA;&#x3092;&#x7D4C;&#x3066;&#x9032;&#x884C;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x8003;&#x3048;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x8EFD;&#x5EA6;&#x304B;&#x3089;&#x91CD;&#x5EA6;&#x7570;&#x5F62;&#x6210;&#x306B;&#x3001;&#x4E0A;&#x76AE;&#x5185;&#x764C;&#x3078;&#x3001;&#x305D;&#x3057;&#x3066;&#x6700;&#x7D42;&#x7684;&#x306B;&#x4FB5;&#x8972;&#x7684;&#x306A;OSCC&#x306B;&#x3002;&#x75C5;&#x7406;&#x7D44;&#x7E54;&#x5B66;&#x7684;&#x30B0;&#x30EC;&#x30FC;&#x30C9;&#x306E;&#x3053;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x306E;&#x6839;&#x5E95;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x7DCF;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x3068;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3092;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3068;&#x975E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;RNA&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x306E;&#x8AD6;&#x6587;&#x306F;&#x3001;&#x53E3;&#x8154;&#x764C;&#x3067;&#x3001;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;RNA&#x306E;&#x7570;&#x5E38;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3001;&#x975E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;RNA&#x306E;&#x3044;&#x305A;&#x308C;&#x304B;&#x306E;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x3092;&#x8A18;&#x8FF0;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x9577;&#x3044;&#x975E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;RNA&#xFF08;lncRNAs&#xFF09;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x304C;&#x5831;&#x544A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x3002;&#x9577;&#x3044;&#x975E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;RNA&#x306F;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3092;&#x542B;&#x307E;&#x306A;&#x3044;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x80FD;&#x529B;&#x3092;&#x6709;&#x3059;&#x308B;mRNA&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x8EE2;&#x5199;&#x7523;&#x7269;&#x306E;&#x65B0;&#x305F;&#x306A;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x304C;&#x3001;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30AF;&#x30B9;&#x3068;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x5236;&#x5FA1;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x5F79;&#x5272;&#x306A;&#x3069;&#x3001;&#x3055;&#x307E;&#x3056;&#x307E;&#x306A;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x306E;&#x30EC;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x3067;&#x306F;&#x3001;lncRNAs&#x306E;&#x7570;&#x5E38;&#x767A;&#x73FE;&#x306F;&#x3001;&#x816B;&#x760D;&#x5F62;&#x6210;&#x306B;&#x304A;&#x3044;&#x3066;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x306E;&#x764C;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x53E3;&#x8154;&#x7C98;&#x819C;&#x306E;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x9577;&#x3044;&#x975E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;RNA&#x767A;&#x73FE;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D7;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;lncRNA&#x5F0F;&#x7D4C;&#x53E3;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x306B;&#x5927;&#x304D;&#x304F;&#x5BC4;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3001;325&#x9577;&#x3044;&#x975E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;RNA&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x8208;&#x5473;&#x6DF1;&#x3044;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3001;&#x691C;&#x51FA;&#x3055;&#x308C;&#x305F;lncRNAs&#x306E;&#x301C;60&#xFF05;&#x306F;&#x53E3;&#x8154;&#x524D;&#x764C;&#x75C5;&#x5909;&#x306E;&#x7570;&#x5E38;&#x306A;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;lncRNAs&#x306E;&#x6570;&#x306F;&#x4EE5;&#x524D;&#x306B;&#x4ED6;&#x306E;&#x30D2;&#x30C8;&#x306E;&#x764C;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;

&#x9577;&#x3044;&#x975E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;RNA&#x306F;&#x3001;&#x53E3;&#x8154;&#x7C98;&#x819C;&#x306B;&#x767A;&#x73FE;&#x3057;&#x3001;&#x53E3;&#x8154;&#x524D;&#x764C;&#x75C5;&#x5909;&#x3067;&#x5909;&#x66F4;&#x3055;&#x308C;

&#xAD6C;&#xAC15; &#xC0C1;&#xD53C; dysplasias histopathological &#xB2E8;&#xACC4;;&#xC758; &#xC2DC;&#xB9AC;&#xC988;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xC9C4;&#xD589; &#xD558;&#xB294; &#xAC83;&#xC73C;&#xB85C; &#xCD94;&#xC815; &#xB41C;&#xB2E4; &#xD604;&#xC7A5;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC554;&#xC5D0; &#xC2EC;&#xD55C; &#xBC1C;&#xC721; &#xC774;&#xC0C1; &#xD558; &#xACE0; &#xB9C8;&#xC9C0;&#xB9C9;&#xC73C;&#xB85C; &#xCE68;&#xB7B5;&#xC744; OSCC&#xC5D0; &#xC57D;&#xD55C;. Histopathological &#xD559;&#xB144;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC774; &#xBCC0;&#xACBD; &#xAE30;&#xBCF8; &#xCD1D; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xBCC0;&#xACBD; &#xBC0F; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xCF54;&#xB529; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC0F; &#xBE44; &#xCF54;&#xB529; Rnas&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; &#xBCC0;&#xD654;&#xB294;. &#xCD5C;&#xADFC; &#xB17C;&#xBB38; microRNAs, &#xBE44; &#xCF54;&#xB529; RNAs, &#xAD6C;&#xAC15; &#xC554; &#xC911; &#xD558;&#xB098;&#xC758; &#xD074;&#xB798;&#xC2A4;&#xC758; &#xD0C8; &#xC120; &#xC2DD;&#xC758; &#xC5F0;&#xACB0;&#xC744; &#xC124;&#xBA85; &#xD588;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098; &#xC2DD; RNAs &#xC624;&#xB798; &#xBE44; &#xCF54;&#xB529; (lncRNAs)&#xC758; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xB418;&#xC9C0; &#xBCF4;&#xACE0; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC624;&#xB798; &#xBE44; &#xCF54;&#xB529; Rnas&#xB294; Mrna&#xC640; &#xAC19;&#xC740; &#xC131;&#xC801; &#xB2A5;&#xB825;, &#xCF54;&#xB529; &#xC5C6;&#xC774; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xB9CC; epigenetics&#xC640; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC870;&#xC808;&#xC5D0; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC758; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC18C;&#xC124; &#xB5A0;&#xC624;&#xB974;&#xACE0; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCD5C;&#xADFC; &#xBCF4;&#xACE0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; Lncrnas&#xC758; &#xD0C8; &#xC120; &#xC2DD; tumorigenesis&#xC5D0;&#xC11C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xC81C;&#xC548; &#xD558;&#xB294; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC554;&#xACFC; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;&#xC5D0;&#xC11C;, &#xCCAB;&#xBC88;&#xC9F8; &#xAE34; &#xBE44; &#xCF54;&#xB529; RNA &#xC2DD; &#xC9C0;&#xB3C4; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xAD6C;&#xAC15; &#xC810; &#xB9C9;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC120;&#xBB3C;&#xC774;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xC624;&#xB798; &#xBE44; &#xCF54;&#xB529; lncRNA &#xC2DD; &#xAD6C;&#xAC15; transcriptome&#xC5D0; &#xD06C;&#xAC8C; &#xAE30;&#xC5EC; &#xD558; &#xACE0; &#xC81C;&#xC548; &#xD558;&#xB294; RNAs 325&#xC758; &#xC2DD;&#xC744; &#xC124;&#xBA85; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xAE00;, &#xAC80;&#xC0C9; &#xB41C; Lncrnas&#xC758; &sim;60% &#xAD6C;&#xAC15; premalignant &#xBCD1; &#xBCC0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD0C8; &#xC120; &#xC2DD;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; lncRNAs &#xC218; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xB2E4;&#xB978; &#xC778;&#xAC04; &#xC554;&#xC5D0; &#xC5F0;&#xAD00; &#xB41C;.

&#xC624;&#xB798; &#xBE44; &#xCF54;&#xB529; RNAs &#xAD6C;&#xAC15; &#xC810; &#xB9C9;&#xC5D0; &#xD45C;&#xD604; &#xB418; &#xACE0; &#xAD6C;&#xAC15; premalignant &#xBCD1; &#xBCC0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBCC0;&#xACBD; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Orales displasias epiteliales se cree que el progreso a trav&#xE9;s de una serie de etapas histopatol&#xF3;gicas de leve a displasia severa, carcinoma in situ, y finalmente a COCE invasiva. Detr&#xE1;s de este cambio en el grado histopatol&#xF3;gico son las alteraciones cromos&#xF3;micas importantes y los cambios en la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica de los dos genes que codifican prote&#xED;nas y ARN no codificantes. Informes recientes han descrito la asociaci&#xF3;n de la expresi&#xF3;n aberrante de microARN, una clase de RNAs no codificantes, con el c&#xE1;ncer oral. Sin embargo, los perfiles de expresi&#xF3;n de los largos ARNs no codificantes (lncRNAs) no se ha informado. Long ARNs no codificantes son una nueva clase de ARNm como-transcripciones sin capacidad de codificaci&#xF3;n de prote&#xED;nas, pero con una variedad de funciones incluyendo papeles en la epigen&#xE9;tica y la regulaci&#xF3;n g&#xE9;nica. En informes recientes, la expresi&#xF3;n aberrante de lncRNAs se ha asociado con los c&#xE1;nceres humanos, lo que sugiere un papel fundamental en la tumorig&#xE9;nesis. A continuaci&#xF3;n, presentamos el primer tiempo no codificante mapa de la expresi&#xF3;n del ARN de la mucosa oral humana. Se describe la expresi&#xF3;n de 325 largos ARNs no codificantes, lo que sugiere la expresi&#xF3;n lncRNA contribuye significativamente a la transcriptoma oral. Curiosamente, alrededor del 60% de los lncRNAs detectadas muestran una expresi&#xF3;n aberrante en lesiones orales premalignas. Un n&#xFA;mero de estos lncRNAs han sido previamente asociados con otros c&#xE1;nceres humanos.

Largas RNAs no codificantes est&#xE1;n expresados &#x200B;&#x200B;en la mucosa oral y alterada en lesiones orales premalignas

Once thought to be a part of the 'dark matter' of the genome, long non-coding RNAs (lncRNAs) are emerging as an integral functional component of the mammalian transcriptome. LncRNAs are a novel class of mRNA-like transcripts which, despite no known protein-coding potential, demonstrate a wide range of structural and functional roles in cellular biology. However, the magnitude of the contribution of lncRNA expression to normal human tissues and cancers has not been investigated in a comprehensive manner. In this study, we compiled 272 human serial analysis of gene expression (SAGE) libraries to delineate lncRNA transcription patterns across a broad spectrum of normal human tissues and cancers. Using a novel lncRNA discovery pipeline we parsed over 24 million SAGE tags and report lncRNA expression profiles across a panel of 26 different normal human tissues and 19 human cancers. Our findings show extensive, tissue-specific lncRNA expression in normal tissues and highly aberrant lncRNA expression in human cancers. Here, we present a first generation atlas for lncRNA profiling in cancer.

Human cancer long non-coding RNA transcriptomes.

&#x4E00;&#x65E6;&#x8BA4;&#x4E3A;&#x662F;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7684;&#x6697;&#x7269;&#x8D28;&#x7684;&#x4E00;&#x90E8;&#x5206;&#xFF0C;&#x957F;&#x975E;&#x7F16;&#x7801; Rna &#xFF08;lncRNAs&#xFF09; &#x6B63;&#x5728;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E00;&#x4E2A;&#x7EC4;&#x6210;&#x90E8;&#x5206;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x54FA;&#x4E73;&#x52A8;&#x7269;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x3002;LncRNAs &#x662F;&#x4E00;&#x7C7B;&#x65B0;&#x578B; mRNA &#x6837;&#x8A8A;&#x672C;&#xFF0C;&#x5C3D;&#x7BA1;&#x6CA1;&#x6709;&#x5DF2;&#x77E5;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7F16;&#x7801;&#x7684;&#x6F5C;&#x529B;&#xFF0C;&#x8868;&#x73B0;&#x51FA;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x548C;&#x529F;&#x80FD;&#x5728;&#x7EC6;&#x80DE;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x4E2D;&#x7684;&#x89D2;&#x8272;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x5BF9;&#x6B63;&#x5E38;&#x7684;&#x4EBA;&#x4F53;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x548C;&#x764C;&#x75C7;&#x7684; lncRNA &#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x6240;&#x4F5C;&#x8D21;&#x732E;&#x7684;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x5DF2;&#x4E0D;&#x5168;&#x9762;&#x5730;&#x8C03;&#x67E5;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7F16;&#x8BD1; 272 &#x4EBA;&#x7CFB;&#x5217;&#x5206;&#x6790;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE; (SAGE) &#x5E93;&#x6765;&#x63CF;&#x7ED8; lncRNA &#x8F6C;&#x5F55;&#x6A21;&#x5F0F;&#x5728;&#x6B63;&#x5E38;&#x7684;&#x4EBA;&#x4F53;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x548C;&#x764C;&#x75C7;&#x7684;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x3002;&#x4F7F;&#x7528;&#x4E00;&#x79CD;&#x65B0;&#x578B;&#x7684; lncRNA &#x53D1;&#x73B0;&#x7BA1;&#x9053;&#x6211;&#x4EEC;&#x5206;&#x6790;&#x8D85;&#x8FC7; 2400 &#x4E07; SAGE &#x6807;&#x8BB0;&#x548C;&#x62A5;&#x544A; lncRNA &#x8868;&#x8FBE;&#x8C31;&#x8FC7;&#x6574;&#x4E2A;&#x9762;&#x677F; 26 &#x4E0D;&#x540C;&#x6B63;&#x5E38;&#x4EBA;&#x4F53;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x548C; 19 &#x4EBA;&#x7C7B;&#x764C;&#x75C7;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x663E;&#x793A;&#x6B63;&#x5E38;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x548C;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x5F02;&#x5E38; lncRNA &#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x764C;&#x75C7;&#x4E2D;&#x7684; lncRNA &#x5E7F;&#x6CDB;&#x3001; &#x7EC4;&#x7EC7;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x76EE;&#x524D; lncRNA &#x5206;&#x6790;&#x5728;&#x764C;&#x75C7;&#x4E2D;&#x7684;&#x7B2C;&#x4E00;&#x4EE3;&#x7684;&#x56FE;&#x96C6;&#x3002;

&#x4EBA;&#x7C7B;&#x764C;&#x75C7;&#x957F;&#x975E;&#x7F16;&#x7801; RNA transcriptomes&#x3002;

Une fois pens&#xE9; pour &#xEA;tre une partie de la &#xAB;mati&#xE8;re noire&#xBB; du g&#xE9;nome, de longues ARN non-codants (lncRNAs) sont en train de devenir une composante int&#xE9;grale fonctionnelle du transcriptome chez les mammif&#xE8;res. LncRNAs sont une nouvelle classe de l&#x26;#39;ARNm de type relev&#xE9;s de notes qui, malgr&#xE9; l&#x26;#39;absence de connu codant pour des prot&#xE9;ines potentiel, d&#xE9;montrent un large &#xE9;ventail de r&#xF4;les structurels et fonctionnels de la biologie cellulaire. Toutefois, l&#x26;#39;ampleur de la contribution de l&#x26;#39;expression lncRNA &#xE0; des tissus humains normaux et les cancers n&#x26;#39;a pas &#xE9;t&#xE9; &#xE9;tudi&#xE9; d&#x26;#39;une mani&#xE8;re globale. Dans cette &#xE9;tude, nous avons compil&#xE9; 272 analyse humaine de s&#xE9;rie de l&#x26;#39;expression g&#xE9;nique (SAGE) des biblioth&#xE8;ques de cerner les profils de transcription lncRNA travers un large spectre de tissus humains normaux et les cancers. Utilisation d&#x26;#39;un roman lncRNA d&#xE9;couverte par pipeline, nous analys&#xE9; plus de 24 millions d&#x26;#39;&#xE9;tiquettes SAGE et les profils d&#x26;#39;expression Rapport lncRNA &#xE0; travers un panel de 26 diff&#xE9;rents tissus humains normaux et 19 cancers de l&#x26;#39;homme. Nos r&#xE9;sultats montrent une vaste, expression tissu-sp&#xE9;cifique dans les tissus normaux lncRNA et d&#x26;#39;expression lncRNA tr&#xE8;s aberrante dans les cancers humains. Ici, nous pr&#xE9;sentons un atlas de la premi&#xE8;re g&#xE9;n&#xE9;ration pour le profilage lncRNA dans le cancer.

L&#x26;#39;homme cancer &#xE0; long non-codantes transcriptomes ARN

Einmal angenommen, dass ein Teil der &quot;dunklen Materie&quot; des Genoms, entstehen lange nicht-kodierenden RNAs (LncRNAs) als funktionalen Bestandteil der S&auml;ugetier-Transkriptom. LncRNAs sind eine neuartige Klasse von mRNA-wie Abschriften, die trotz keine bekannten Proteinkodierung Potenzial, eine Vielzahl von strukturellen und funktionellen Rollen in der zellularen Biologie belegen. Jedoch ist das Ausma&szlig; des Beitrags der LncRNA Ausdruck f&uuml;r die normalen menschlichen Geweben und Krebserkrankungen nicht umfassend untersucht worden. In dieser Studie haben wir 272 menschliche serielle Analyse der Gen-Ausdruck (SAGE) Bibliotheken, LncRNA Transkription Muster f&uuml;r ein breites Spektrum von normalen menschlichen Geweben und Krebserkrankungen abzugrenzen. Mit eine neuartigen LncRNA-Entdeckung-Pipeline analysiert wir &uuml;ber 24 Millionen Salbei Markierungen und Bericht LncRNA Ausdruck Profile &uuml;ber ein Panel von 26 verschiedenen normalen menschlichen Geweben und 19 menschlichen Krebserkrankungen. Unsere Ergebnisse zeigen umfangreiche, Gewebe-spezifischen LncRNA Ausdruck in normalen Geweben und stark abweichenden LncRNA Ausdruck im menschlichen Krebserkrankungen. Hier pr&auml;sentieren wir einen erste Generation-Atlas f&uuml;r LncRNA, die Profilerstellung in Krebs.

Menschlichen Krebs lange non-coding RNA Transcriptomes.

Una volta pensato per essere una parte di &#39;materia oscura&#39; del genoma, lunga non-coding RNAs (lncRNAs) stanno emergendo come un componente integrale funzionale del transcriptome dei mammiferi. LncRNAs sono una classe di romanzo dei trascritti di mRNA-come che, nonostante non noto rischio di proteina-codificazione, dimostrano un&#39;ampia gamma di ruoli strutturali e funzionali in biologia cellulare. Tuttavia, l&#39;entit&agrave; del contributo dell&#39;espressione lncRNA di tessuti umani normali e tumori non &egrave; stato studiato in modo esauriente. In questo studio, abbiamo compilato 272 umano analisi seriale delle librerie di espressione (SAGE) gene per delineare modelli di trascrizione lncRNA attraverso un ampio spettro di tessuti umani normali e tumori. Utilizzando una pipeline di scoperta lncRNA romanzo analizzato i tag salvia oltre 24 milioni e profili di espressione lncRNA relazione attraverso un pannello di 26 diversi tessuti umani normali e 19 tumori umani. I nostri risultati mostrano espressione tessuto-specifiche, vasto lncRNA in tessuti normali e lncRNA altamente aberrante espressione nei tumori umani. Presentiamo qui, un Atlante di prima generazione per profilatura in cancro lncRNA.

Cancro umano lungo non codificanti RNA transcriptomes.

&#x4E00;&#x5EA6;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E; &#x26;quot;&#x30C0;&#x30FC;&#x30AF;&#x30DE;&#x30BF;&#x30FC;&#x26;quot;&#x306E;&#x4E00;&#x90E8;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3068;&#x8003;&#x3048;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3001;&#x9577;&#x3044;&#x975E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;RNA&#xFF08;lncRNAs&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x54FA;&#x4E73;&#x52D5;&#x7269;&#x306E;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x306A;&#x6A5F;&#x80FD;&#x6027;&#x6210;&#x5206;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x6D6E;&#x4E0A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002; LncRNAs&#x306F;&#x3001;&#x65E2;&#x77E5;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3092;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3059;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x306B;&#x3082;&#x304B;&#x304B;&#x308F;&#x3089;&#x305A;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x3068;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x5F79;&#x5272;&#x306E;&#x5E83;&#x3044;&#x7BC4;&#x56F2;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3001;mRNA&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x8EE2;&#x5199;&#x7523;&#x7269;&#x306E;&#x65B0;&#x305F;&#x306A;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x6B63;&#x5E38;&#x306A;&#x30D2;&#x30C8;&#x7D44;&#x7E54;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x764C;&#x306B;lncRNA&#x5F0F;&#x306E;&#x5BC4;&#x4E0E;&#x306E;&#x5927;&#x304D;&#x3055;&#x306F;&#x7DCF;&#x5408;&#x7684;&#x306B;&#x691C;&#x8A0E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x6B63;&#x5E38;&#x30D2;&#x30C8;&#x7D44;&#x7E54;&#x3068;&#x764C;&#x306E;&#x5E83;&#x7BC4;&#x56F2;&#x306B;&#x308F;&#x305F;&#x3063;&#x3066;lncRNA&#x8EE2;&#x5199;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x3092;&#x63CF;&#x304F;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;272&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x30B7;&#x30EA;&#x30A2;&#x30EB;&#x89E3;&#x6790;&#xFF08;SAGE&#xFF09;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x3092;&#x30B3;&#x30F3;&#x30D1;&#x30A4;&#x30EB;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;26&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x30D2;&#x30C8;&#x6B63;&#x5E38;&#x7D44;&#x7E54;&#x3068;19&#x306E;&#x30D2;&#x30C8;&#x764C;&#x30D1;&#x30CD;&#x30EB;&#x5168;&#x4F53;2400&#x4E07;SAGE&#x30BF;&#x30B0;&#x3068;&#x30EC;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;lncRNA&#x767A;&#x73FE;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x89E3;&#x6790;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5C0F;&#x8AAC;lncRNA&#x767A;&#x898B;&#x30D1;&#x30A4;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3002;&#x4ECA;&#x56DE;&#x306E;&#x77E5;&#x898B;&#x306F;&#x3001;&#x6B63;&#x5E38;&#x7D44;&#x7E54;&#x306E;&#x5E83;&#x7BC4;&#x306A;&#x3001;&#x7D44;&#x7E54;&#x7279;&#x7570;&#x7684;lncRNA&#x767A;&#x73FE;&#x3068;&#x30D2;&#x30C8;&#x306E;&#x764C;&#x3067;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x7570;&#x5E38;&#x306A;lncRNA&#x5F0F;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x304C;&#x3093;&#x306E;lncRNA&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x7B2C;&#x4E00;&#x4E16;&#x4EE3;&#x306E;&#x30A2;&#x30C8;&#x30E9;&#x30B9;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30D2;&#x30C8;&#x764C;&#x9577;&#x3044;&#x975E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;RNA&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;

&#39;&#xC554;&#xD751; &#xBB3C;&#xC9C8;&#39; &#xAC8C;&#xB188;&#xC758; &#xC77C;&#xBD80;&#xB85C; &#xC0DD;&#xAC01; &#xB418; &#xBA74; &#xC624;&#xB798; &#xBE44; &#xCF54;&#xB529; RNAs (lncRNAs) &#xD3EC;&#xC720;&#xB958; transcriptome&#xC758; &#xD575;&#xC2EC; &#xAE30;&#xB2A5; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;&#xB85C; &#xB5A0;&#xC624;&#xB974;&#xACE0; &#xC788;&#xB2E4;. Lncrnas&#xB294; &#xC544;&#xBB34; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xCF54;&#xB529; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xB825;&#xC5D0;&#xB3C4; &#xBD88;&#xAD6C; &#xD558; &#xACE0; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xC138;&#xD3EC; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAD6C;&#xC870; &#xBC0F; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xC124;&#xBA85; &#xD558;&#xB294; mRNA &#xAC19;&#xC740; &#xB179;&#xCDE8; &#xB85D;&#xC758; &#xC18C;&#xC124; &#xD074;&#xB798;&#xC2A4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC815;&#xC0C1; &#xC870;&#xC9C1; &#xBC0F; &#xC554; lncRNA &#xC2DD;&#xC758; &#xAE30;&#xC5EC; &#xD06C;&#xAE30; &#xC885;&#xD569;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC870;&#xC0AC; &#xD558;&#xC9C0;&#xB294;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC870;&#xC9C1; &#xBC0F; &#xC554; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCCD0; lncRNA &#xC804;&#xC0AC; &#xD328;&#xD134; &#xC724;&#xACFD;&#xC744; &#xADF8;&#xB9AC; &#xB2E4; (&#xC138;&#xC774; &#xC9C0;) &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC;&#xC758; 272 &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC9C1;&#xB82C; &#xBD84;&#xC11D; &#xCEF4;&#xD30C;&#xC77C;. 26 &#xB2E4;&#xB978; &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC870;&#xC9C1; &#xBC0F; 19 &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC554; &#xD328;&#xB110;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCCD0; 24 &#xBC31;&#xB9CC; &#xC0D0;&#xBE44;&#xC5B4; &#xD0DC;&#xADF8; &#xBC0F; &#xBCF4;&#xACE0;&#xC11C; lncRNA &#xC2DD; &#xD504;&#xB85C;&#xD544;&#xC744; &#xBD84;&#xC11D; &#xC18C;&#xC124; lncRNA &#xAC80;&#xC0C9; &#xD30C;&#xC774;&#xD504;&#xB77C;&#xC778;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC6B0;&#xB9AC;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xACB0;&#xACFC; &#xC815;&#xC0C1; &#xC870;&#xC9C1;&#xACFC; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC554; &#xBC1C;&#xC0DD;&#xC5D0; &#xB9E4;&#xC6B0; &#xD0C8; &#xC120; lncRNA &#xC2DD;&#xC758; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C;, &#xC870;&#xC9C1; &#xAD00;&#xB828; lncRNA &#xC2DD;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;, lncRNA &#xC554;&#xC5D0; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; 1 &#xC138;&#xB300; &#xC544;&#xD2C0;&#xB77C;&#xC2A4; &#xC120;&#xBB3C;&#xC774;.

&#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC554; &#xC624;&#xB798; &#xBE44; &#xCF54;&#xB529; RNA transcriptomes&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Una vez que piensa que es una parte de la &#x26;quot;materia oscura&#x26;quot; del genoma, ARN largos no codificantes (lncRNAs) se est&#xE1;n convirtiendo en un componente integral funcional del transcriptoma de los mam&#xED;feros. LncRNAs son una nueva clase de ARNm como las transcripciones que, a pesar de no conocido potencial de la codificaci&#xF3;n de prote&#xED;nas, demuestran una amplia gama de funciones estructurales y funcionales de la biolog&#xED;a celular. Sin embargo, la magnitud de la contribuci&#xF3;n de expresi&#xF3;n lncRNA de tejidos humanos normales y el c&#xE1;ncer no se ha investigado de manera exhaustiva. En este estudio, hemos recopilado 272 an&#xE1;lisis humano de serie de la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica (SAGE) de las bibliotecas para delinear los patrones de transcripci&#xF3;n lncRNA en un amplio espectro de tejidos humanos normales y el c&#xE1;ncer. Usando una nueva lncRNA descubrimiento de tuber&#xED;as que analiza m&#xE1;s de 24 millones de etiquetas SAGE y el informe de perfiles de expresi&#xF3;n de todo lncRNA un panel de 26 diferentes tejidos humanos normales y 19 c&#xE1;nceres humanos. Nuestros resultados muestran una amplia, expresi&#xF3;n espec&#xED;fica de tejido lncRNA en los tejidos normales y de expresi&#xF3;n lncRNA sumamente aberrante en los c&#xE1;nceres humanos. A continuaci&#xF3;n, presentamos un atlas de la primera generaci&#xF3;n de perfiles de lncRNA en el c&#xE1;ncer.

Katey S. S. Enfield

Department of Integrative Oncology

BC Cancer Research Centre

DNA Extraction from Paraffin Embedded Material for Genetic and Epigenetic Analyses

Katey S. S. Enfield

.css-o250i3{font-size:18px;font-family:Open Sans,sans-serif;line-height:21.6px;}Department of Integrative Oncology

BC Cancer Research Centre

DNA Extraction from Paraffin Embedded Material for Genetic and Epigenetic Analyses

Department of Integrative Oncology