Methylated DNA Immunoprecipitation

The identification of DNA methylation patterns is a common procedure in the study of epigenetics, as methylation is known to have significant effects on ...

BC Cancer Research Centre

University of British Columbia - UBC

&#x764C;&#x75C7;&#x662F;&#x4E00;&#x79CD;&#x75BE;&#x75C5;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x4E0D;&#x7A33;&#x5B9A;&#x6027;&#x7684;&#x7279;&#x70B9;&#x3002;&#x6BD4;&#x8F83;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6742;&#x4EA4; &#xFF08;&#x8BA1;&#x7B97;&#x5168;&#x606F;&#x56FE;&#xFF09; &#x662F;&#x4E00;&#x79CD;&#x6280;&#x672F;&#xFF0C;&#x7528;&#x4E8E;&#x68C0;&#x6D4B;&#x8282;&#x6BB5;&#x6027;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6539;&#x5EFA;&#x3002;&#x57FA;&#x4E8E;&#x9635;&#x5217;&#x7684;&#x5168;&#x606F;&#x6280;&#x672F;&#x6700;&#x65B0;&#x8FDB;&#x5C55;&#x5DF2;&#x542F;&#x7528;&#x8003;&#x8BD5;&#x7684;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x533A;&#x57DF;&#x524D;&#x6240;&#x672A;&#x6709;&#x7684;&#x7EC6;&#x8282;&#xFF0C;&#x9769;&#x547D;&#x5316;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x80BF;&#x7624;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7684;&#x7406;&#x89E3;&#x3002;&#x4E00;&#x4E9B;&#x57FA;&#x4E8E;&#x9635;&#x5217;&#x7684;&#x6280;&#x672F;&#x5DF2;&#x7ECF;&#x5236;&#x5B9A;&#x3001; &#x65E8;&#x5728;&#x63D0;&#x9AD8;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x8BA1;&#x7B97;&#x5168;&#x606F;&#x56FE;&#xFF0C;&#x4F7F;&#x7814;&#x7A76;&#x4EBA;&#x5458;&#x5BF9;&#x5B8C;&#x5584;&#x548C;&#x53EF;&#x80FD;&#x662F;&#x56E0;&#x679C;&#x764C;&#x75C7;&#xFF0C;&#x5E76;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x57FA;&#x56E0;&#x53D1;&#x73B0;&#x5728;&#x5FEB;&#x901F;&#x589E;&#x957F;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x4E2D;&#x5B9A;&#x4E49;&#x7684;&#x533A;&#x57DF;&#x3002;&#x8FD9;&#x7BC7;&#x6587;&#x7AE0;&#x56DE;&#x987E;&#x5404;&#x79CD;&#x9635;&#x5217;&#x5168;&#x606F;&#x5E73;&#x53F0;&#x548C;&#x5176;&#x764C;&#x75C7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#x7684;&#x4F7F;&#x7528;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x9700;&#x8981;&#x9AD8;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x88AB;&#x8BA8;&#x8BBA;&#x4EE5;&#x53CA;&#x65E9;&#x671F;&#x75BE;&#x75C5;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53D1;&#x73B0;&#x53EF;&#x80FD;&#x662F;&#x56E0;&#x679C;&#x764C;&#x75C7;&#x8FDB;&#x5C55;&#x548C;&#x75C5;&#x56E0;&#x7684;&#x9057;&#x4F20;&#x5B66;&#x7814;&#x7A76;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x6027;&#x3002;

&#x6570;&#x7EC4;&#x8BA1;&#x7B97;&#x5168;&#x606F;&#x56FE;&#x6280;&#x672F;&#x548C;&#x764C;&#x75C7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x53CA;&#x5176;&#x5E94;&#x7528;&#x3002;

Cancer is a disease characterized by genomic instability. Comparative genomic hybridization (CGH) is a technique designed for detecting segmental genomic alterations. Recent advances in array-based CGH technology have enabled examination of chromosomal regions in unprecedented detail, revolutionizing our understanding of tumour genomes. A number of array-based technologies have been developed, aiming to improve the resolution of CGH, enabling researchers to refine and define regions in the genome that may be causal to cancer, and facilitating gene discovery at a rapid rate. This article reviews the various array CGH platforms and their use in the study of cancer genomes. In addition, the need for high-resolution analysis is discussed as well as the importance of studying early-stage disease to discover genetic alterations that may be causal to cancer progression and aetiology.

Array CGH technologies and their applications to cancer genomes.

Le cancer est une maladie caract&#xE9;ris&#xE9;e par une instabilit&#xE9; g&#xE9;nomique. Hybridation g&#xE9;nomique comparative (CGH) est une technique con&#xE7;ue pour d&#xE9;tecter des alt&#xE9;rations g&#xE9;nomiques segmentaires. Les progr&#xE8;s r&#xE9;cents dans bas&#xE9;e sur la baie CGH la technologie ont permis l&#x26;#39;examen des r&#xE9;gions chromosomiques dans des d&#xE9;tails sans pr&#xE9;c&#xE9;dent, en train de r&#xE9;volutionner notre compr&#xE9;hension des g&#xE9;nomes tumoraux. Un certain nombre de technologies de r&#xE9;seau bas&#xE9;es sur ont &#xE9;t&#xE9; d&#xE9;velopp&#xE9;s, visant &#xE0; am&#xE9;liorer la r&#xE9;solution de la CGH, qui permet aux chercheurs d&#x26;#39;affiner et de d&#xE9;finir des r&#xE9;gions dans le g&#xE9;nome qui peuvent &#xEA;tre causales au cancer, et de faciliter la d&#xE9;couverte de g&#xE8;nes &#xE0; un rythme rapide. Cet article passe en revue les diverses plates-formes CGH tableau et leur utilisation dans l&#x26;#39;&#xE9;tude des g&#xE9;nomes du cancer. En outre, la n&#xE9;cessit&#xE9; d&#x26;#39;une analyse haute r&#xE9;solution est discut&#xE9;e ainsi que l&#x26;#39;importance d&#x26;#39;&#xE9;tudier la maladie au stade de d&#xE9;couvrir des alt&#xE9;rations g&#xE9;n&#xE9;tiques qui peuvent &#xEA;tre de cause &#xE0; effet la progression du cancer et l&#x26;#39;&#xE9;tiologie.

Tableau Technologies CGH et leurs applications aux g&#xE9;nomes du cancer

Array-CGH Technologien und deren Anwendungen zu Krebsgenomen.

Il cancro &egrave; una malattia caratterizzata da instabilit&agrave; genomica. Ibridazione genomic comparativa (CGH) &egrave; una tecnica progettata per la rilevazione di alterazioni genomiche segmentale. Recenti progressi nella tecnologia CGH array-based hanno permesso esame di regioni cromosomiche in dettaglio senza precedenti, rivoluzionando la nostra comprensione dei genomi di tumore. Un certo numero di tecnologie basate su array sono stati sviluppati, con l&#39;obiettivo di migliorare la risoluzione di CGH, consentendo ai ricercatori di perfezionare e definire le regioni del genoma che possono essere causale al cancro e facilitare la scoperta del gene ad un tasso veloce. Questo articolo recensisce le varie piattaforme CGH array e loro uso nello studio del genoma del cancro. Inoltre, la necessit&agrave; di analisi ad alta risoluzione &egrave; discussa cos&igrave; come l&#39;importanza di studiare la fase iniziale di malattia per scoprire alterazioni genetiche che possono essere causali a eziologia e progressione del cancro.

Tecnologie di CGH array e le loro applicazioni ai genomi cancro.

&#x304C;&#x3093;&#x306F;&#x3001;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x4E0D;&#x5B89;&#x5B9A;&#x6027;&#x3092;&#x7279;&#x5FB4;&#x3068;&#x3059;&#x308B;&#x75BE;&#x60A3;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x6BD4;&#x8F03;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C0;&#x30A4;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#xFF08;CGH&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x5206;&#x7BC0;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5909;&#x5316;&#x3092;&#x691C;&#x51FA;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x8A2D;&#x8A08;&#x624B;&#x6CD5;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;CGH&#x6280;&#x8853;&#x306E;&#x6700;&#x8FD1;&#x306E;&#x9032;&#x6B69;&#x306F;&#x3001;&#x816B;&#x760D;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x7406;&#x89E3;&#x306B;&#x9769;&#x547D;&#x3092;&#x3082;&#x305F;&#x3089;&#x3057;&#x3001;&#x524D;&#x4F8B;&#x306E;&#x306A;&#x3044;&#x8A73;&#x7D30;&#x306B;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x9818;&#x57DF;&#x306E;&#x691C;&#x67FB;&#x3092;&#x6709;&#x52B9;&#x306B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x6280;&#x8853;&#x306E;&#x6570;&#x306F;&#x3001;&#x7814;&#x7A76;&#x8005;&#x306F;&#x3001;&#x6D17;&#x7DF4;&#x3068;&#x764C;&#x306E;&#x56E0;&#x679C;&#x304B;&#x3082;&#x3057;&#x308C;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x9818;&#x57DF;&#x3092;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x3001;&#x3068;&#x6025;&#x901F;&#x306B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x767A;&#x898B;&#x3092;&#x5BB9;&#x6613;&#x306B;&#x3001;CGH&#x306E;&#x5206;&#x89E3;&#x80FD;&#x3092;&#x5411;&#x4E0A;&#x3055;&#x305B;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x76EE;&#x6307;&#x3057;&#x3001;&#x958B;&#x767A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x8CC7;&#x6599;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x764C;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x69D8;&#x3005;&#x306A;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;CGH&#x30D7;&#x30E9;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x3068;&#x305D;&#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3092;&#x691C;&#x8A0E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x9AD8;&#x5206;&#x89E3;&#x80FD;&#x306E;&#x5206;&#x6790;&#x306E;&#x5FC5;&#x8981;&#x6027;&#x306F;&#x3001;&#x764C;&#x306E;&#x9032;&#x884C;&#x3068;&#x75C5;&#x56E0;&#x3068;&#x306E;&#x56E0;&#x679C;&#x304B;&#x3082;&#x3057;&#x308C;&#x306A;&#x3044;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5909;&#x7570;&#x3092;&#x767A;&#x898B;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x65E9;&#x671F;&#x306E;&#x75BE;&#x60A3;&#x3092;&#x7814;&#x7A76;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x6027;&#x3068;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x8AAC;&#x660E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;CGH&#x30C6;&#x30AF;&#x30CE;&#x30ED;&#x30B8;&#x30FC;&#x3068;&#x304C;&#x3093;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x3078;&#x306E;&#x5FDC;&#x7528;

&#xC554;&#xC740; &#xC9C8;&#xBCD1; genomic &#xBD88;&#xC548;&#xC815;&#xC131;&#xC774; &#xD2B9;&#xC9D5; &#xC774;&#xB2E4;. &#xBE44;&#xAD50; genomic &#xAD50; &#xC7A1; (CGH) &#xAE30;&#xC220;&#xC740; segmental genomic &#xBCC0;&#xACBD;&#xC744; &#xAC10;&#xC9C0; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xC124;&#xACC4; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5B4;&#xB808;&#xC774; &#xAE30;&#xBC18; CGH &#xAE30;&#xC220;&#xC758; &#xCD5C;&#xADFC; &#xBC1C;&#xC804; &#xC885;&#xC591; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC774;&#xD574;&#xC5D0; &#xD601;&#xBA85;&#xC744; &#xC77C;&#xC73C;&#xD0A4;&#xACE0; &#xC804;&#xB840;&#xAC00; &#xC5C6;&#xB294; &#xC790;&#xC138;&#xD558;&#xAC8C; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC601;&#xC5ED;&#xC758; &#xC2DC;&#xD5D8;&#xC744; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xBC30;&#xC5F4; &#xAE30;&#xBC18; &#xAE30;&#xC220; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC790;&#xB97C; &#xAC00;&#xB2A5; &#xD558; &#xAC8C; &#xD558;&#xB294; CGH&#xC758; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xD5A5;&#xC0C1;&#xC744; &#xBAA9;&#xD45C;&#xB85C; &#xAD6C;&#xCCB4;&#xD654; &#xD558; &#xACE0; &#xC554;, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xBE60;&#xB978; &#xC18D;&#xB3C4;&#xB85C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xACAC;&#xC744; &#xCD09;&#xC9C4; &#xD558;&#xB294; &#xC778;&#xACFC; &#xAD00;&#xACC4;&#xB97C; &#xAC8C;&#xB188;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xC601;&#xC5ED;&#xC744; &#xC815;&#xC758; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xBB38;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C;&#xB294; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xBC30;&#xC5F4; CGH &#xD50C;&#xB7AB;&#xD3FC; &#xBC0F; &#xC554; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xAC80;&#xD1A0;. &#xB610;&#xD55C;, &#xACE0;&#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xBD84;&#xC11D;&#xC758; &#xD544;&#xC694;&#xC131; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C;, &#xC554; &#xC9C4;&#xD589; &#xBC0F; aetiology &#xC778;&#xACFC; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xC720;&#xC804; &#xBCC0;&#xACBD; &#xBC1C;&#xACAC; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xCD08;&#xAE30; &#xB2E8;&#xACC4;&#xB97C; &#xACF5;&#xBD80; &#xD558;&#xB294; &#xC911;&#xC694;&#xC131; &#xC124;&#xBA85; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xBC30;&#xC5F4; CGH &#xAE30;&#xC220;&#xACFC; &#xC554; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xC751;&#xC6A9; &#xD504;&#xB85C;&#xADF8;&#xB7A8;.

El c&#xE1;ncer es una enfermedad caracterizada por la inestabilidad gen&#xF3;mica. Hibridaci&#xF3;n gen&#xF3;mica comparada (CGH) es una t&#xE9;cnica dise&#xF1;ada para la detecci&#xF3;n de alteraciones segmentarias gen&#xF3;micas. Los recientes avances en la tecnolog&#xED;a basada en arreglos de CGH han permitido que el examen de las regiones cromos&#xF3;micas en un detalle sin precedentes, revolucionando nuestra comprensi&#xF3;n de los genomas tumorales. Una serie de tecnolog&#xED;as basadas en la matriz se han desarrollado, con el objetivo de mejorar la resoluci&#xF3;n de la CGH, que permite a los investigadores a perfeccionar y definir las regiones en el genoma que pueden ser causal con el c&#xE1;ncer, y facilitar el descubrimiento de genes a un ritmo r&#xE1;pido. Este art&#xED;culo revisa las distintas plataformas de gama CGH y su uso en el estudio de los genomas del c&#xE1;ncer. Adem&#xE1;s, la necesidad de un an&#xE1;lisis de alta resoluci&#xF3;n se discute, as&#xED; como la importancia del estudio de enfermedad en estadio temprano para descubrir las alteraciones gen&#xE9;ticas que pueden ser causal con la progresi&#xF3;n del c&#xE1;ncer y la etiolog&#xED;a.

Array CGH tecnolog&#xED;as y sus aplicaciones a los genomas del c&#xE1;ncer

DNA &#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x662F;&#x6B63;&#x5E38;&#x7684;&#x53D1;&#x5C55;&#x548C;&#x75BE;&#x75C5;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x7684;&#x7EC4;&#x6210;&#x90E8;&#x5206;&#x3002;&#x4E0D;&#x8FC7;&#xFF0C;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5206;&#x5E03;&#x7684;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x5E8F;&#x5217; &mdash; &mdash; methylome &mdash; &mdash; &#x4E86;&#x89E3;&#x751A;&#x5C11;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x6700;&#x8FD1;&#x5236;&#x8BA2;&#x4E86;&#x6574;&#x4E2A;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x72B6;&#x6001;&#x7684;&#x5FEB;&#x901F;&#x8BC4;&#x4F30;&#x5E73;&#x53F0;&#x6280;&#x672F;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x9AD8;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x3001; &#x9AD8;&#x541E;&#x5410;&#x91CF;&#x7684;&#x65B9;&#x5F0F;&#x3002;&#x8FD9;&#x662F;&#x901A;&#x8FC7;&#x8026;&#x5408;&#x5206;&#x79BB;&#x5177;&#x6709;&#x57FA;&#x4E8E;&#x9635;&#x5217;&#x7684;&#x6BD4;&#x8F83;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6742;&#x4EA4; &#xFF08;&#x6570;&#x7EC4;&#x8BA1;&#x7B97;&#x5168;&#x606F;&#x56FE;&#xFF09; &#x7532;&#x57FA;&#x80DE;&#x5627;&#x5576;&#x4E30;&#x5BCC;&#x7247;&#x6BB5;&#x7684;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x7684; DNA &#x6C89;&#x6DC0; (MeDIP) &#x65B9;&#x6CD5;&#x5B9E;&#x73B0;&#x7684;&#x3002;&#x4F7F;&#x7528;&#x7684;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5E73;&#x94FA; BAC &#x8DEF;&#x5F84;&#x6570;&#x7EC4;&#x548C; CpG &#x5C9B;&#x82AF;&#x7247;&#x7EC4;&#x5408;&#xFF0C;DNA &#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x56FE;&#x8C31;&#x83B7;&#x5F97;&#x540C;&#x65F6;&#x5728;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x548C;&#x7279;&#x5B9A;&#x8F68;&#x8FF9;&#x7684;&#x4E00;&#x7EA7;&#x3002;&#x4F7F;&#x7528; MeDIP &#x6570;&#x7EC4;&#x8BA1;&#x7B97;&#x5168;&#x606F;&#x56FE;&#x7684;&#x7537;&#x6027;&#x548C;&#x5973;&#x6027; DNA &#x6BD4;&#x8F83;&#x53D1;&#x73B0;&#x610F;&#x5916;&#x7684;&#x7532;&#x57FA;&#x5904;&#x4E8E;&#x975E;&#x6D3B;&#x52A8;&#x72B6;&#x6001; x &#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x57FA;&#x56E0;&#x8D2B;&#x56F0;&#x5730;&#x533A;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x764C;&#x75C7;&#x548C; noncancer &#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7C7B;&#x578B;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x6BD4;&#x8F83;&#x4EA7;&#x751F;&#x94FE;&#x63A5;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E00;&#x79CD;&#x65B0;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#x6765;&#x7834;&#x8BD1;&#x764C;&#x75C7;&#x7684;&#x98CE;&#x6F6E;&#x7684;&#x9057;&#x4F20;&#x548C;&#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20;&#x4E0D;&#x7A33;&#x5B9A;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x6A21;&#x5F0F;&#x3002;&#x6700;&#x540E;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x63D0;&#x4F9B;&#x65B0;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x663E;&#x793A;&#x80BA;&#x764C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E0E;&#x5E76;&#x884C;&#x533A;&#x57DF;&#x7684;&#x9057;&#x4F20;&#x548C;&#x540E;&#x5929;&#x7684;&#x6539;&#x53D8;&#xFF0C;&#x7A9D;&#x85CF;&#x5DF2;&#x77E5;&#x764C;&#x57FA;&#x56E0; epigenomic &#x4E0D;&#x7A33;&#x5B9A;&#x3002;

&#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20;&#x7EC4;&#xFF1A; &#x6620;&#x5C04; methylome&#x3002;

DNA methylation is integral to normal development and disease processes. However, the genomic distribution of methylated sequences--the methylome--is poorly understood. We have recently developed a platform technology for rapid assessment of methylation status throughout the human genome in a high-resolution, high-throughput manner. This is achieved by coupling a methylated DNA immunoprecipitation (MeDIP) method for isolating methyl cytosine rich fragments with array-based comparative genomic hybridization (array CGH). Using a combination of whole genome tiling path BAC arrays and CpG island microarrays, DNA methylation profiles are obtained simultaneously at both genome-wide and locus-specific levels. A comparison between male and female DNA using MeDIP-array CGH revealed unexpected hypomethylation of the inactive x-chromosome in gene-poor regions. Furthermore, comparisons between cancer and noncancer cell types yielded differential methylation patterns that link genetic and epigenetic instability offering a new approach to decipher misregulation in cancer. Finally, we provide new data showing epigenomic instability in lung cancer cells with concurrent regions of genetic and epigenetic alterations harboring known oncogenes.

Epigenomics: mapping the methylome.

M&#xE9;thylation de l&#x26;#39;ADN est partie int&#xE9;grante du d&#xE9;veloppement normal et processus de la maladie. Cependant, la distribution g&#xE9;nomique des s&#xE9;quences m&#xE9;thyl&#xE9;es - l&#x26;#39;m&#xE9;thylome - est mal comprise. Nous avons r&#xE9;cemment d&#xE9;velopp&#xE9; une plateforme technologique pour l&#x26;#39;&#xE9;valuation rapide de l&#x26;#39;&#xE9;tat de m&#xE9;thylation dans le g&#xE9;nome humain dans une haute r&#xE9;solution, &#xE0; haut d&#xE9;bit de mani&#xE8;re. Ce r&#xE9;sultat est obtenu par couplage d&#x26;#39;un immunopr&#xE9;cipitation m&#xE9;thyl&#xE9; ADN (MEDIP) proc&#xE9;d&#xE9; pour isoler des fragments de m&#xE9;thyle cytosine riches avec bas&#xE9;e sur la baie d&#x26;#39;hybridation g&#xE9;nomique comparative (CGH array). En utilisant une combinaison de l&#x26;#39;ensemble du g&#xE9;nome de carrelage chemin tableaux d&#x26;#39;alcool&#xE9;mie et des micror&#xE9;seaux &#xEE;lot CpG, les profils de m&#xE9;thylation d&#x26;#39;ADN sont obtenus simultan&#xE9;ment &#xE0; la fois l&#x26;#39;&#xE9;chelle du g&#xE9;nome et le locus sp&#xE9;cifiques niveaux. Une comparaison entre l&#x26;#39;ADN m&#xE2;le et femelle &#xE0; l&#x26;#39;aide MEDIP-CGH array r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9; hypom&#xE9;thylation inattendue du chromosome X inactif dans le g&#xE8;ne des r&#xE9;gions pauvres. En outre, les comparaisons entre le cancer et les types de cellules non canc&#xE9;reuses donn&#xE9; les profils de m&#xE9;thylation diff&#xE9;rentielles qui lient l&#x26;#39;instabilit&#xE9; g&#xE9;n&#xE9;tique et &#xE9;pig&#xE9;n&#xE9;tique offrant une nouvelle approche de la d&#xE9;r&#xE9;gulation d&#xE9;chiffrer dans le cancer. Enfin, nous fournissons de nouvelles donn&#xE9;es montrant l&#x26;#39;instabilit&#xE9; &#xE9;pig&#xE9;nomiques dans les cellules de cancer du poumon avec les r&#xE9;gions concurrentes d&#x26;#39;alt&#xE9;rations g&#xE9;n&#xE9;tiques et &#xE9;pig&#xE9;n&#xE9;tiques h&#xE9;bergeant oncog&#xE8;nes connus.

Epigenomics: Cartographier l&#x26;#39;m&#xE9;thylome

DNA-Methylierung ist f&uuml;r normale Entwicklung und Krankheit-Prozesse. Jedoch die genomische Verteilung methylierte Sequenzen--die Methylome--kaum verstanden wird. Wir haben vor kurzem eine Plattformtechnologie f&uuml;r schnelle Beurteilung der Methylierung Status &uuml;ber das menschliche Genom in gewissem Sinne mit hoher Aufl&ouml;sung und hohem Durchsatz entwickelt. Dies wird erreicht durch die Kopplung einer methylierte DNA Immunopr&auml;zipitation (MeDIP) Methode f&uuml;r die Isolierung von Methyl Cytosin reichen Fragmente mit Array-vergleichende genomische Hybridisierung (CGH Array). Mit einer Kombination des gesamten Genoms Fliesen Pfad BAC Arrays und CpG-Insel-Microarrays, werden DNA-Methylierungs-Profile gleichzeitig genomweiten sowohl Locus-spezifische Ebene gewonnen. Ein Vergleich zwischen m&auml;nnlichen und weiblichen DNA mit MeDIP-Array-CGH offenbart unerwartete Hypomethylierung von der inaktiven Darstellung in gen-armen Regionen. Dar&uuml;ber hinaus ergab Vergleiche zwischen Krebs und Noncancer Zelltypen differenzielle Methylierungsmuster, die genetische und epigenetische Instabilit&auml;t bietet einen neuen Ansatz zur Misregulation in Krebs entziffern zu verkn&uuml;pfen. Schlie&szlig;lich bieten wir neue Daten epigenomischen Instabilit&auml;t in Lungenkrebszellen mit gleichzeitiger Regionen der genetischen und epigenetischen Ver&auml;nderungen beherbergen Onkogene bekannt.

Epigenomics: Zuordnung der Methylome.

Metilazione del DNA &egrave; parte integrante dei processi di sviluppo e malattia normali. Tuttavia, la distribuzione genomica delle sequenze metilati - methylome - &egrave; capita male. Recentemente abbiamo sviluppato una piattaforma tecnologica per la rapida valutazione dello stato di metilazione in tutto il genoma umano in un modo ad alta risoluzione, ad alta velocit&agrave;. Questo risultato &egrave; ottenuto dall&#39;accoppiamento di un metodo di immunoprecipitazione (MeDIP) DNA metilato per isolare frammenti ricchi di metil citosina con array-based ibridazione genomic comparativa (CGH array). Utilizzando una combinazione di intero genoma tiling path BAC matrici e microarrays isola CpG, profili di metilazione del DNA sono ottenuti simultaneamente a livello genome-wide e locus-specifiche. Un confronto tra il DNA maschile e femmina utilizzando MeDIP-array CGH ha rivelato inaspettati ipometilazione del cromosoma x inattivo nelle regioni del gene-poveri. Inoltre, il confronto tra i tipi di cellule di cancro e noncancer ceduto schemi differenziali di metilazione che collegano instabilit&agrave; genetiche ed epigenetiche che offre un nuovo approccio per decifrare misregolazione in cancro. Infine, mettiamo a disposizione nuovi dati mostrando epigenomic instabilit&agrave; nelle cellule tumorali polmonari con regioni simultanee di alterazioni genetiche ed epigenetiche harboring noti oncogeni.

Epigenomics: la mappatura del methylome.

DNA&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306F;&#x3001;&#x901A;&#x5E38;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x3084;&#x75C5;&#x6C17;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x306B;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5206;&#x5E03; -  methylome  - &#x306F;&#x3042;&#x307E;&#x308A;&#x7406;&#x89E3;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x6700;&#x8FD1;&#x3001;&#x9AD8;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x3001;&#x9AD8;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3067;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x72B6;&#x614B;&#x306E;&#x8FC5;&#x901F;&#x8A55;&#x4FA1;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30D7;&#x30E9;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x6280;&#x8853;&#x3092;&#x958B;&#x767A;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x306F;&#x3001;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#xB7;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C0;&#x30A4;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#xFF08;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;CGH&#xFF09;&#x3068;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30B7;&#x30C8;&#x30B7;&#x30F3;&#x30EA;&#x30C3;&#x30C1;&#x306A;&#x65AD;&#x7247;&#x3092;&#x5358;&#x96E2;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;DNA&#x514D;&#x75AB;&#x6C88;&#x964D;&#xFF08;MeDIP&#xFF09;&#x30E1;&#x30BD;&#x30C3;&#x30C9;&#x3092;&#x30AB;&#x30C3;&#x30D7;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x9054;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3002;&#x30D1;&#x30B9;BAC&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x3068;CpG&#x30A2;&#x30A4;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C9;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x3092;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EB;&#x5168;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;DNA&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x306F;&#x3001;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30EF;&#x30A4;&#x30C9;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5EA7;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x3067;&#x540C;&#x6642;&#x306B;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002; MeDIP&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;CGH&#x3092;&#x4F7F;&#x3063;&#x3066;&#x7537;&#x6027;&#x3068;&#x5973;&#x6027;&#x306E;DNA&#x3068;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x306F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x8CA7;&#x3057;&#x3044;&#x5730;&#x57DF;&#x3067;&#x306F;&#x4E0D;&#x6D3B;&#x6027;&#x306A;X&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x306E;&#x4E88;&#x60F3;&#x5916;&#x306E;&#x4F4E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x304C;&#x3093;&#x3084;&#x304C;&#x3093;&#x4EE5;&#x5916;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x578B;&#x9593;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x306F;&#x3001;&#x304C;&#x3093;&#x306E;&#x89E3;&#x8AAD;&#x306E;&#x5236;&#x5FA1;&#x30DF;&#x30B9;&#x3078;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x4E0D;&#x5B89;&#x5B9A;&#x6027;&#x3092;&#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x3059;&#x308B;&#x5DEE;&#x52D5;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x304C;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x6700;&#x5F8C;&#x306B;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x65E2;&#x77E5;&#x306E;&#x764C;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x4FDD;&#x6709;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x5909;&#x5316;&#x306E;&#x540C;&#x6642;&#x306E;&#x5730;&#x57DF;&#x3068;&#x80BA;&#x764C;&#x7D30;&#x80DE;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30A8;&#x30D4;&#x4E0D;&#x5B89;&#x5B9A;&#x6027;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30A8;&#x30D4;&#xFF1A;Methylome&#x306E;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;

DNA &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xC815;&#xC0C1; &#xBC1C;&#xB2EC;&#xACFC; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC778; &#xBD80;&#xBD84;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xAC8C;&#xB188; &#xBD84;&#xD3EC; methylated &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;-methylome-&#xC81C;&#xB300;&#xB85C; &#xC774;&#xD574; &#xB41C;&#xB2E4;. &#xCD5C;&#xADFC; &#xACE0;&#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4;, &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC; &#xBC29;&#xC2DD;&#xC73C;&#xB85C; &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188; &#xC804;&#xCCB4; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xC0C1;&#xD0DC;&#xC758; &#xC2E0;&#xC18D;&#xD55C; &#xD3C9;&#xAC00; &#xC704;&#xD55C; &#xD50C;&#xB7AB;&#xD3FC; &#xAE30;&#xC220;&#xC744; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB807;&#xAC8C; &#xAD50; &#xBC30;&#xC5F4; &#xAE30;&#xBC18; &#xBE44;&#xAD50; genomic &#xC7A1; (&#xBC30;&#xC5F4; CGH)&#xC640; &#xBA54; &#xD2F8; &#xC2DC; &#xD48D;&#xBD80;&#xD55C; &#xC870;&#xAC01;&#xC744; &#xACE0;&#xB9BD; &#xC2DC;&#xD0A4;&#xAE30;&#xB97C; &#xC704;&#xD55C; methylated DNA immunoprecipitation (MeDIP) &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xCEE4;&#xD50C;&#xB9C1;. &#xC804;&#xCCB4; &#xAC8C;&#xB188; &#xAE30;&#xC640; &#xACBD;&#xB85C; BAC &#xBC30;&#xC5F4; &#xBC0F; CpG &#xC12C; microarrays&#xC758; &#xC870;&#xD569;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;, DNA &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xD504;&#xB85C;&#xD544; &#xAC8C;&#xB188; &#xC804;&#xCCB4; &#xBC0F; &#xB85C;&#xCEE4; &#xC2A4; &#xD2B9;&#xC815; &#xC218;&#xC900;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB3D9;&#xC2DC;&#xC5D0; &#xAC00;&#xC838;&#xC628;&#xB294;. MeDIP-&#xBC30;&#xC5F4; CGH&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xB0A8;&#xC131;&#xACFC; &#xC5EC;&#xC131;&#xC758; DNA &#xBE44;&#xAD50; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAC00;&#xB09C;&#xD55C; &#xC9C0;&#xC5ED;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBE44;&#xD65C;&#xC131; x &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4;&#xC758; &#xC608;&#xAE30;&#xCE58; &#xC54A;&#xC740; hypomethylation&#xC744; &#xBC1D;&#xD614;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, &#xC554; &#xBC0F; noncancer &#xC140; &#xC720;&#xD615; &#xAC04;&#xC758; &#xBE44;&#xAD50; &#xD574;&#xB3C5; misregulation &#xC554;&#xC5D0; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC811;&#xADFC;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xB294; &#xBD88;&#xC548;&#xC815;&#xC131;&#xC744; &#xC720;&#xC804;&#xACFC; &#xD6C4; &#xC131;&#xC801;&#xC778; &#xB9C1;&#xD06C; &#xCC28;&#xB3D9; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xD328;&#xD134;&#xC744; &#xC5BB;&#xC9C0; &#xBABB;&#xD588;&#xB2E4;. &#xB9C8;&#xC9C0;&#xB9C9;&#xC73C;&#xB85C;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; oncogenes &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4; &#xC720;&#xC804;&#xACFC; &#xD6C4; &#xC131;&#xC801;&#xC778; &#xBCC0;&#xACBD; &#xC740;&#xB2C9;&#xC758; &#xB3D9;&#xC2DC; &#xC601;&#xC5ED; &#xD3D0; &#xC554; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; epigenomic &#xBD88;&#xC548;&#xC815;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC8FC;&#xB294; &#xC0C8; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Epigenomics: &#xB9E4;&#xD551; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4; methylome.

Metilaci&#xF3;n del ADN es esencial para el normal desarrollo y los procesos de enfermedad. Sin embargo, la distribuci&#xF3;n gen&#xF3;mica de secuencias metiladas: el metiloma - es poco conocida. Recientemente hemos desarrollado una plataforma tecnol&#xF3;gica para la evaluaci&#xF3;n r&#xE1;pida del estado de metilaci&#xF3;n en el genoma humano en una de alta resoluci&#xF3;n, alto rendimiento de forma. Esto se consigue mediante el acoplamiento de una inmunoprecipitaci&#xF3;n ADN metilado (MeDIP) m&#xE9;todo para aislar met&#xED;licos ricos fragmentos de citosina con matriz basada en la hibridaci&#xF3;n gen&#xF3;mica comparada (CGH array). Usando una combinaci&#xF3;n de todo el genoma suelo de baldosas camino matrices y BAC microarrays isla CpG, los perfiles de metilaci&#xF3;n del ADN se obtienen de forma simult&#xE1;nea, tanto en el genoma y los niveles de locus espec&#xED;ficos. Una comparaci&#xF3;n entre el ADN masculino y femenino con MeDIP-CGH array revel&#xF3; hipometilaci&#xF3;n inesperada del cromosoma X inactivo en el gen de las regiones pobres. Por otra parte, las comparaciones entre los tipos de c&#xE1;ncer y sin c&#xE1;ncer de c&#xE9;lulas produjo patrones diferenciales de metilaci&#xF3;n que vinculan la inestabilidad gen&#xE9;tica y epigen&#xE9;tica ofreciendo un nuevo enfoque para descifrar la regulaci&#xF3;n deficiente en el c&#xE1;ncer. Finalmente, se aportan nuevos datos que muestran la inestabilidad epigen&#xF3;mico en las c&#xE9;lulas de c&#xE1;ncer de pulm&#xF3;n con las regiones concurrentes de alteraciones gen&#xE9;ticas y epigen&#xE9;ticas albergar oncogenes conocidos.

Epigenomics: panorama del metiloma

&#x8D1F;&#x8D23;&#x6DCB;&#x5DF4;&#x7624;&#x5E38;&#x6297;&#x6027;&#x7EC6;&#x80DE;&#x51CB;&#x4EA1;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x673A;&#x5236;&#x6D89;&#x53CA; bcl-2 &#x901A;&#x8DEF;&#x3002;&#x5728;&#x6B64;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8C03;&#x67E5;&#x4E86;&#x4FE1;&#x53F7;&#x901A;&#x8DEF;&#x5728; bcl 2 &#x8D85;&#x91CF;&#x8868;&#x8FBE;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x4E2D;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x5730;&#x5E54;&#x5747;&#x66FE;&#x6CBB;&#x7597; oblimersen&#xFF0C;&#x5206;&#x5B50;&#x57FA;&#x56E0;&#x6C89;&#x9ED8;&#x7684;&#x6218;&#x7565;&#xFF0C;&#x6709;&#x6548;&#x5730;&#x6291;&#x5236; bcl-2 &#x4F53;&#x5916;&#x548C;&#x4F53;&#x5185;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6DCB;&#x5DF4;&#x7624;&#x7EC6;&#x80DE;&#x682A; &#xFF08;JVM 2 &#x548C; Z 138&#xFF09;&#x3002;Z-138 &#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x8868;&#x793A;&#x66F4;&#x9AD8;&#x6C34;&#x5E73;&#x7684; bcl-2&#xFF0C;&#x662F;&#x66F4;&#x654F;&#x611F;&#x7684; bcl-2 &#x6C89;&#x9ED8;&#xFF0C;&#x5F71;&#x54CD;&#x4ECB;&#x5BFC; oblimersen &#x6216; bcl-2 &#x5C0F;&#x5206;&#x5B50;&#x5E72;&#x6270; RNA&#xFF0C;&#x4F53;&#x5916;&#x3002;Z-138 &#x7EC6;&#x80DE;&#x80BF;&#x7624;&#x6D3E;&#x751F;&#x4EE5;&#x4E0B;&#x6CE8;&#x5C04;&#x4E86;&#x654F;&#x611F;&#x5230; oblimersen &#x6839;&#x636E;&#x80BF;&#x7624;&#x6210;&#x957F;&#x7387;&#x8DCC;&#x5E45;&#x8DCC;&#x5E45;&#x7EC6;&#x80DE;&#x589E;&#x6B96; &#xFF08;&#x6309;&#x8861;&#x91CF; Ki-67&#xFF09; &#x6765;&#x5224;&#x65AD;&#x3002;&#x514D;&#x75AB;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x5316;&#x5B66;&#x548C; oblimersen &#x6CBB;&#x7597; Z 138 &#x80BF;&#x7624;&#x5370;&#x8FF9;&#x5206;&#x6790;&#x63ED;&#x793A; bcl-2 &#x6C34;&#x5E73;&#x7684;&#x8DCC;&#x5E45;&#x4E3A;&#x5242;&#x91CF;&#x4F9D;&#x8D56;&#x6027;&#x548C;&#x534A;&#x80F1;&#x6C28;&#x9178;&#x86CB;&#x767D;&#x9176;-3 &#x548C;&#x534A;&#x80F1;&#x6C28;&#x9178;&#x86CB;&#x767D;&#x9176;-9 &#x7684;&#x6D46;&#x6DB2;&#x86CB;&#x767D;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x589E;&#x52A0;&#x3002;&#x6C89;&#x9ED8; bcl-2 Z 138 &#x5F02;&#x79CD;&#x79FB;&#x690D;&#x4E2D;&#x900F;&#x9732; bax&#xFF0C;&#x51CF;&#x5C11;&#x6838;&#x56E0;&#x5B50; kappaB &#x548C;&#x78F7;&#x6838;&#x56E0;&#x5B50; kappaB&#xFF0C;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x5242;&#x91CF;&#x4F9D;&#x8D56;&#x6027;&#x6291;&#x5236; p53 &#x6C34;&#x5E73;&#x7684;&#x77AC;&#x6001;&#x635F;&#x5931;&#x3002;Coimmunoprecipitation &#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x8868;&#x660E;&#x540E;&#x8005;&#x7684;&#x89C2;&#x5BDF;&#x4ECB;&#x5BFC; bcl 2 &#x548C;&#x78F7; mdm2 &#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x5173;&#x8054;&#x3002;Bcl-2 &#x6C89;&#x9ED8;&#x4E5F;&#x5BFC;&#x81F4; p27 &#x4E0B;&#x8C03;&#x548C; coimmunoprecipitation &#x7814;&#x7A76;&#x6307;&#x5411; bcl-2 p27 &#x672C;&#x5730;&#x5316;/&#x9000;&#x5316;&#x7684;&#x8C03;&#x63A7;&#x4E2D;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;Bcl-2 &#x6C89;&#x9ED8;&#x4E5F;&#x662F;&#x635F;&#x5931;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5468;&#x671F; D1a &#x86CB;&#x767D;&#x6C34;&#x5E73;&#x4F46;&#x4E0D;&#x662F;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5468;&#x671F;&#x86CB;&#x767D; D1b &#x6C34;&#x5E73;&#x4E0E;&#x76F8;&#x5173;&#x7684;&#x3002;Coimmunoprecipitation &#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x8868;&#x660E;&#xFF0C;bcl-2 &#x53EF;&#x8C03;&#x89E3;&#x53CA;&#x5176;&#x5BF9;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5468;&#x671F;&#x86CB;&#x767D; D1a &#x901A;&#x8FC7; p38 &#x4E1D;&#x88C2;&#x7D20;&#x6D3B;&#x5316;&#x86CB;&#x767D;&#x6FC0;&#x9176;&#x4E0E;&#x4E92;&#x52A8;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA; bcl-2 &#x548C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5468;&#x671F; D1a &#x4EE5;&#x524D;&#x672A;&#x62A5;&#x7684;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;

&#x6C89;&#x9ED8; Bcl-2 &#x5957;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6DCB;&#x5DF4;&#x7624;&#x7684;&#x6A21;&#x578B;&#x4E2D;&#x662F;&#x4E0E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5468;&#x671F; D1&#x3001; &#x6838;&#x56E0;&#x5B50; kappaB&#x3001; p53&#x3001; bax &#x548C; p27 &#x6C34;&#x5E73;&#x8DCC;&#x5E45;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;

Molecular mechanisms responsible for lymphoma resistance to apoptosis often involve the bcl-2 pathway. In this study, we investigated the cell signaling pathways activated in bcl-2-overexpressing human mantle cell lymphoma cell lines (JVM-2 and Z-138) that have been treated with oblimersen, a molecular gene silencing strategy that effectively suppresses bcl-2 in vitro and in vivo. Z-138 cells expressed higher levels of bcl-2 and were more sensitive to the effects of bcl-2 silencing, mediated by oblimersen or bcl-2 small interfering RNA, in vitro. Tumors derived following injection of Z-138 cells were sensitive to oblimersen as judged by decreases in tumor growth rate and decreases in cell proliferation (as measured by Ki-67). Immunohistochemistry and Western blot analysis of oblimersen-treated Z-138 tumors revealed a dose-dependent decrease in bcl-2 levels and an associated increase in the proapoptotic proteins caspase-3 and caspase-9. Silencing bcl-2 in Z-138 xenografts revealed an associated dose-dependent suppression of bax, a decrease in nuclear factor-kappaB and phospho-nuclear factor-kappaB, and transient loss of p53 levels. Coimmunoprecipitation studies suggest that the latter observation is mediated by an association between bcl-2 and phospho-mdm2. Bcl-2 silencing also led to p27 down-regulation and coimmunoprecipitation studies point to a role for bcl-2 in regulation of p27 localization/degradation. Bcl-2 silencing was also correlated with loss of cyclin D1a protein levels but not cyclin D1b levels. Coimmunoprecipitation studies indicate that bcl-2 may mediate its effects on cyclin D1a via interaction with p38 mitogen-activated protein kinase as well as a previously unreported interaction between bcl-2 and cyclin D1a.

Silencing Bcl-2 in models of mantle cell lymphoma is associated with decreases in cyclin D1, nuclear factor-kappaB, p53, bax, and p27 levels.

Les m&#xE9;canismes mol&#xE9;culaires responsables de la r&#xE9;sistance &#xE0; l&#x26;#39;apoptose lymphome impliquent souvent la voie bcl-2. Dans cette &#xE9;tude, nous avons &#xE9;tudi&#xE9; les voies de signalisation cellulaires activ&#xE9;s dans bcl-2-surexprimant des lign&#xE9;es cellulaires humaines de lymphome &#xE0; cellules du manteau (JVM-2 et Z-138) qui ont &#xE9;t&#xE9; trait&#xE9;s avec oblimersen, une strat&#xE9;gie g&#xE8;ne mol&#xE9;culaire silence qui supprime efficacement bcl-2 in vitro et in vivo. Z-138 cellules expriment des niveaux &#xE9;lev&#xE9;s de bcl-2 et sont plus sensibles aux effets de bcl-2 silencieux, m&#xE9;di&#xE9;s par oblimersen ou Bcl-2 petits ARN interf&#xE9;rents, in vitro. Les tumeurs d&#xE9;riv&#xE9;es suite &#xE0; l&#x26;#39;injection de Z-138 cellules &#xE9;taient sensibles &#xE0; oblimersen &#xE0; en juger par la baisse des taux de croissance de la tumeur et diminue dans la prolif&#xE9;ration cellulaire (tel que mesur&#xE9; par Ki-67). L&#x26;#39;immunohistochimie et l&#x26;#39;analyse par Western blot de oblimersen-trait&#xE9;s Z-138 tumeurs a r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9; une diminution dose-d&#xE9;pendante de bcl-2 niveaux et une augmentation associ&#xE9;e dans les prot&#xE9;ines pro-apoptotiques de la caspase-3 et la caspase-9. Taire bcl-2 dans Z-138 x&#xE9;nogreffes a r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9; un associ&#xE9; dose-d&#xE9;pendante la suppression de bax, un facteur de diminution de la perte-kappaB et phospho-facteur nucl&#xE9;aire kappa B, et transitoire des niveaux de p53 nucl&#xE9;aire. Des &#xE9;tudes sugg&#xE8;rent que la co-immunopr&#xE9;cipitation derni&#xE8;re observation est m&#xE9;di&#xE9;e par une association entre bcl-2 et phospho-mdm2. Bcl-2 silencieux a &#xE9;galement conduit &#xE0; p27 r&#xE9;gulation &#xE0; la baisse et co-immunopr&#xE9;cipitation des &#xE9;tudes indiquent un r&#xF4;le de bcl-2 dans la r&#xE9;gulation de p27 localisation / d&#xE9;gradation. Bcl-2 silencieux est &#xE9;galement corr&#xE9;l&#xE9;e avec la perte de prot&#xE9;ines cycline D1a niveaux, mais pas la cycline niveaux D1B. Des &#xE9;tudes indiquent que co-immunopr&#xE9;cipitation bcl-2 peut servir de m&#xE9;diateur de ses effets sur la cycline D1a via l&#x26;#39;interaction avec la prot&#xE9;ine kinase p38 activ&#xE9;e par le mitog&#xE8;ne ainsi que d&#x26;#39;une interaction non d&#xE9;clar&#xE9;s ant&#xE9;rieurement entre bcl-2 et la cycline D1a.

Taire de Bcl-2 dans les mod&#xE8;les de lymphome &#xE0; cellules du manteau est associ&#xE9;e &#xE0; une diminution dans la cycline D1, le facteur nucl&#xE9;aire kappa B, p53, le Bax, et P27 niveaux

Molekulare Mechanismen, Lymphom Widerstand zum Apoptosis oft umfassen die Bcl-2-Pathway. In dieser Studie untersuchten wir die Zelle Signalisierung aktiviert in der Bcl-2-&uuml;berexprimierenden menschlichen Wege Frauenmantel Zelle Lymphom Zelllinien (JVM-2 und Z-138), die behandelt wurden mit Oblimersen, molekulare Gene silencing Strategie, die Bcl-2 in vitro und in vivo effektiv unterdr&uuml;ckt. Z-138-Zellen ausgedr&uuml;ckt h&ouml;here Ebenen der Bcl-2 und waren empfindlicher auf die Wirkungen der Bcl-2 zum Schweigen, von Oblimersen oder Bcl-2 small interfering RNA, in-vitro-vermittelt. Tumoren abgeleiteten folgenden Injektion von Z-138 Zellen waren sensibel auf Oblimersen, wie durch den R&uuml;ckgang der Wachstumsrate der Tumor und Verringerungen der Zellproliferation (gemessen an Ki-67) beurteilt. Immunhistochemie und Western-Blot-Analyse von Oblimersen-behandelten Z-138 Tumoren ergab eine dosisabh&auml;ngige Abnahme der Bcl-2 Ebenen und einer damit verbundenen Zunahme der Proapoptotischen Proteine Caspase-3 und Caspase-9. Unterdr&uuml;ckender Bcl-2 in Z-138 Xenografts ergab eine zugeordnete dosisabh&auml;ngige Unterdr&uuml;ckung von Bax, eine Abnahme der nuclear Factor-KappaB und Phospho-nuclear Factor-KappaB und vor&uuml;bergehender Verlust von p53-Ebenen. Coimmunoprecipitation Studien deuten darauf hin, dass die letztere Beobachtung von einer Assoziation zwischen Bcl-2 und Phospho-mdm2 vermittelt wird. BCL-2 zum Schweigen auch p27 Herunterregulation und Coimmunoprecipitation Studien weisen auf eine Rolle f&uuml;r Bcl-2 bei Regulierung der p27 Lokalisierung/Abbau. BCL-2 zum Schweigen war auch mit Verlust von cyclin D1a Protein-Ebene, aber nicht cyclin D1b Ebene wurde. Coimmunoprecipitation Studien zeigen, dass die Bcl-2 Auswirkungen auf cyclin D1a &uuml;ber Interaktion mit p38 Mitogen-aktivierte Proteinkinase sowie eine bisher nicht gemeldete Interaktion zwischen Bcl-2 und cyclin D1a vermitteln kann.

Unterdr&uuml;ckender Bcl-2 in Modellen der Mantelzell-Lymphom ist mit Verringerungen der cyclin D1, nuclear Factor-KappaB, p53 und Bax p27 Ebenen verbunden.

Meccanismi molecolari responsabili di resistenza linfoma al apoptosis spesso coinvolgono il pathway di bcl-2. In questo studio, abbiamo studiato il cell signaling pathways attivato in bcl-2 con sovraesprimono relativa umani mantello linee di cellule di linfoma delle cellule (JVM-2 e Z-138) sono state trattate con oblimersen, un gene molecolare silenziamento strategia che sopprime efficacemente bcl-2 in vitro e in vivo. Z-138 cellule espresso pi&ugrave; elevati livelli di bcl-2 e sono stati pi&ugrave; sensibili agli effetti del silenziamento di bcl-2, mediata da oblimersen o bcl-2 piccolo RNA interferente, in vitro. Tumori derivata nell&#39;iniezione di cellule Z-138 erano sensibili a oblimersen a giudicare dalle diminuzioni nel tasso di crescita del tumore e diminuzioni nella proliferazione cellulare (come misurato dal Ki-67). Immunoistochimica e analisi Western blot dei trattati oblimersen Z-138 tumori hanno rivelato una diminuzione dose-dipendente nei livelli di bcl-2 e un associato aumento delle proteine Miselli caspase-3 e caspasi-9. Silenziamento bcl-2 nei xenotrapianti Z-138, ha rivelato una soppressione dose-dipendente associata di bax, una diminuzione della nuclear factor-kappaB e fosfo-nuclear factor-kappaB e perdita transitoria dei livelli di p53. Coimmunoprecipitation studi suggeriscono che l&#39;osservazione di quest&#39;ultimo &egrave; mediata da un&#39;associazione tra bcl-2 e fosfo-mdm2. Silenziamento di Bcl-2 port&ograve; anche p27 down-regulation e studi coimmunoprecipitation puntare a un ruolo di bcl-2 nella regolazione di p27 localizzazione/degradazione. Silenziamento di Bcl-2 &egrave; stata anche correlata con la perdita della ciclina D1a livelli di proteine ma non cyclin D1b livelli. Studi coimmunoprecipitation indicano che bcl-2 pu&ograve; mediare i suoi effetti su cyclin D1a tramite l&#39;interazione con la chinasi di proteina mitogene-attivata p38 cos&igrave; come un&#39;interazione tra bcl-2 e ciclina D1a precedentemente non dichiarata.

Silenziamento Bcl-2 nei modelli del linfoma mantellare &egrave; associato a diminuzioni nella ciclina D1, nuclear factor-kappaB, p53, bax e livelli di p27.

&#x30A2;&#x30DD;&#x30C8;&#x30FC;&#x30B7;&#x30B9;&#x306B;&#x62B5;&#x6297;&#x6027;&#x30EA;&#x30F3;&#x30D1;&#x816B;&#x306E;&#x8CAC;&#x4EFB;&#x5206;&#x5B50;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x306F;&#x3001;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x5834;&#x5408;&#x3001;bcl-2&#x306E;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3092;&#x542B;&#x3093;&#x3067;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;oblimersen&#x3001;&#x52B9;&#x679C;&#x7684;&#x306B;bcl-2&#x306E;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3059;&#x308B;&#x5206;&#x5B50;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30B5;&#x30A4;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x6226;&#x7565;&#x306B;&#x6271;&#x308F;&#x308C;&#x3066;&#x304D;&#x305F;BCL-2&#x904E;&#x5270;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x30D2;&#x30C8;&#x30DE;&#x30F3;&#x30C8;&#x30EB;&#x7D30;&#x80DE;&#x30EA;&#x30F3;&#x30D1;&#x816B;&#x7D30;&#x80DE;&#x682A;&#xFF08;JVM-2&#x3068;Z-138&#xFF09;&#x3067;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x7D30;&#x80DE;&#x5185;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3092;&#x8ABF;&#x3079;&#x305F;in vitro&#x304A;&#x3088;&#x3073;in vivo&#x30A4;&#x30F3;&#x30C1;Z-138&#x7D30;&#x80DE;&#x306F;&#x3001;Bcl-2&#x306E;&#x3088;&#x308A;&#x9AD8;&#x3044;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3092;&#x767A;&#x73FE;&#x3057;&#x3001;in vitro&#x3067;oblimersen&#x307E;&#x305F;&#x306F;bcl-2&#x306E;&#x4F4E;&#x5206;&#x5B50;&#x5E72;&#x6E09;RNA&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5A92;&#x4ECB;&#x3055;&#x308C;&#x308B;bcl-2&#x306E;&#x30B5;&#x30A4;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x52B9;&#x679C;&#x306B;&#x5BFE;&#x3059;&#x308B;&#x9AD8;&#x3044;&#x611F;&#x53D7;&#x6027;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002; Z-138&#x306E;&#x6CE8;&#x5165;&#x5F8C;&#x306B;&#x6D3E;&#x751F;&#x3057;&#x305F;&#x816B;&#x760D;&#x7D30;&#x80DE;&#x306F;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x5897;&#x6B96;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x816B;&#x760D;&#x5897;&#x6B96;&#x7387;&#x3068;&#x6E1B;&#x5C11;&#xFF08;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x306E;Ki-67&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x6E2C;&#x5B9A;&#xFF09;&#x306E;&#x6E1B;&#x5C11;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5224;&#x65AD;oblimersen&#x306B;&#x611F;&#x53D7;&#x6027;&#x3067;&#x3042;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x514D;&#x75AB;&#x7D44;&#x7E54;&#x5316;&#x5B66;&#x3068;oblimersen&#x51E6;&#x7406;Z-138&#x306E;&#x816B;&#x760D;&#x306E;&#x30A6;&#x30A7;&#x30B9;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D6;&#x30ED;&#x30C3;&#x30C8;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x3001;Bcl-2&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306E;&#x7528;&#x91CF;&#x4F9D;&#x5B58;&#x7684;&#x6E1B;&#x5C11;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30A2;&#x30DD;&#x30C8;&#x30FC;&#x30B7;&#x30B9;&#x4FC3;&#x9032;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x304C;&#x30AB;&#x30B9;&#x30D1;&#x30FC;&#x30BC;-3&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30AB;&#x30B9;&#x30D1;&#x30FC;&#x30BC;-9&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3057;&#x305F;&#x5897;&#x52A0;&#x3092;&#x8A8D;&#x3081;&#x305F;&#x3002; Z-138&#x7570;&#x7A2E;&#x79FB;&#x690D;&#x7247;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30B5;&#x30A4;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;Bcl-2&#x306F;&#x3001;Bax&#x306E;&#x95A2;&#x9023;&#x7528;&#x91CF;&#x4F9D;&#x5B58;&#x7684;&#x306A;&#x6291;&#x5236;&#x3001;&#x6838;&#x56E0;&#x5B50;-&#x3BA;B&#x306E;&#x30EA;&#x30F3;&#x9178;&#x5316;&#x3068;&#x6838;&#x56E0;&#x5B50;-&#x3BA;B&#x306E;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;p53&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306E;&#x4E00;&#x6642;&#x7684;&#x306A;&#x640D;&#x5931;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x514D;&#x75AB;&#x6C88;&#x964D;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x5F8C;&#x8005;&#x306E;&#x89B3;&#x6E2C;&#x306F;Bcl-2&#x3068;&#x30DB;&#x30B9;&#x30DB;-MDM2&#x3068;&#x306E;&#x9593;&#x306E;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5A92;&#x4ECB;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002; Bcl-2&#x306E;&#x30B5;&#x30A4;&#x30EC;&#x30F3;&#x3082;p27&#x306E;&#x5C40;&#x5728;/&#x5206;&#x89E3;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;bcl-2&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x3078;&#x306E;p27&#x306E;&#x30C0;&#x30A6;&#x30F3;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3068;&#x5171;&#x514D;&#x75AB;&#x6C88;&#x964D;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x30DD;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x306B;&#x3064;&#x306A;&#x304C;&#x3063;&#x305F;&#x3002; Bcl-2&#x306E;&#x30B5;&#x30A4;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306F;&#x3001;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EA;&#x30F3;D1A&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306E;&#x640D;&#x5931;&#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x304F;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EA;&#x30F3;D1B&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3068;&#x76F8;&#x95A2;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x514D;&#x75AB;&#x6C88;&#x964D;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;BCL-2&#x306F;p38&#x30DE;&#x30A4;&#x30C8;&#x30B8;&#x30A7;&#x30F3;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30A4;&#x30F3;&#x30AD;&#x30CA;&#x30FC;&#x30BC;&#x3068;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3068;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;Bcl-2&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EA;&#x30F3;D1A&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x4EE5;&#x524D;&#x306B;&#x5831;&#x544A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EA;&#x30F3;D1A&#x3078;&#x306E;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x5A92;&#x4ECB;&#x3059;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30DE;&#x30F3;&#x30C8;&#x30EB;&#x7D30;&#x80DE;&#x30EA;&#x30F3;&#x30D1;&#x816B;&#x306E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3067;&#x306E;Bcl-2&#x306E;&#x30B5;&#x30A4;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306F;&#x3001;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EA;&#x30F3;D1&#x3001;&#x6838;&#x56E0;&#x5B50;-&#x3BA;B&#x306E;&#x3001;P53&#x3001;&#x30D0;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;P27&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306E;&#x6E1B;&#x5C11;&#x306B;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;

&#xBD84;&#xC790; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998; &#xB9BC;&#xD504; &#xC885; &#xC800;&#xD56D; apoptosis &#xC790;&#xC8FC; &#xB2F4;&#xB2F9; bcl-2 &#xD1B5;&#xB85C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD55C;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xC870;&#xC0AC; bcl-2 overexpressing &#xC778;&#xAC04;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xACBD;&#xB85C; &#xC2E0;&#xD638; &#xC140; &#xB9E8; &#xD2C0; &#xC138;&#xD3EC; &#xB9BC;&#xD504; &#xC885; &#xC140; &#xC120; (JVM-2&#xC640; Z-138) oblimersen, &#xBD84;&#xC790; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xCE68;&#xBB35; &#xC804;&#xB7B5;&#xC744; &#xD6A8;&#xACFC;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC5B5;&#xC81C; bcl-2 &#xC0DD;&#xCCB4; &#xC678; &#xBC0F; &#xC0DD;&#xCCB4; &#xC870;&#xAC74;&#xC73C;&#xB85C; &#xCDE8;&#xAE09; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Z 138 &#xC140; bcl-2 &#xB192;&#xC740; &#xC218;&#xC900;&#xC758; &#xD45C;&#xD604;&#xACFC; bcl-2 &#xCE68;&#xBB35;&#xC758; &#xD6A8;&#xACFC;&#xC5D0; &#xB354; &#xBBFC;&#xAC10;&#xD55C; oblimersen &#xB610;&#xB294; bcl-2 &#xC791;&#xC740; &#xAC04;&#xC12D; RNA, &#xC0DD;&#xCCB4; &#xC678;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC911;&#xC7AC; &#xD588;&#xB2E4;. Z 138 &#xC140;&#xC758; &#xC885;&#xC591; &#xD30C;&#xC0DD;&#xB41C; &#xB2E4;&#xC74C; &#xC8FC;&#xC785; &#xC885;&#xC591; &#xC131;&#xC7A5; &#xC18D;&#xB3C4;&#xC758; &#xAC10;&#xC18C;&#xC640; &#xC138;&#xD3EC; &#xC99D;&#xC2DD; (&#xC11C; &#xAE30; 67&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xCE21;&#xC815;)&#xC758; &#xAC10;&#xC18C;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC2EC;&#xD310;&#xC73C;&#xB85C; oblimersen&#xC5D0; &#xBBFC;&#xAC10; &#xD588;&#xB2E4;. &#xAE30;&#xC220; &#xBC0F; oblimersen &#xCC98;&#xB9AC; Z 138 &#xC885;&#xC591;&#xC758; &#xC11C;&#xCABD; &#xC624; &#xC810; &#xBD84;&#xC11D; &#xACF5;&#xAC1C; bcl-2 &#xB808;&#xBCA8;&#xC758; &#xBCF5;&#xC6A9;&#xB7C9; &#xC758;&#xC874; &#xAC10;&#xC18C; &#xBC0F; caspase 3 &#xBC0F; caspase-9 proapoptotic &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC5D0; &#xAD00;&#xB828;&#xB41C; &#xB41C; &#xC99D;&#xAC00; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Bcl-2 Z 138 xenografts &#xC785;&#xC744; bax, &#xD575; &#xC778;&#xC790;-kappaB &#xC778; &#xD575; &#xC778;&#xC790;-kappaB, &#xAC10;&#xC18C;&#xC758; &#xC5F0;&#xACB0;&#xB41C; &#xBCF5;&#xC6A9;&#xB7C9; &#xC758;&#xC874; &#xC5B5;&#xC81C; &#xBC0F; p53 &#xC218;&#xC900;&#xC758; &#xC77C;&#xC2DC;&#xC801;&#xC778; &#xC190;&#xC2E4;&#xC744; &#xACF5;&#xAC1C; &#xD588;&#xB2E4;. Coimmunoprecipitation &#xC5F0;&#xAD6C; &#xD6C4;&#xC790;&#xC758; &#xAD00;&#xCC30; bcl-2 &#xC778; mdm2 &#xC0AC;&#xC774; &#xD611;&#xD68C; &#xC911;&#xC7AC; &#xAC83;&#xC774; &#xC88B;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. P27 &#xB2E4;&#xC6B4; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xC158;&#xC744; &#xC8FC;&#xB3C4; &#xB610;&#xD55C; Bcl-2 &#xC785; &#xBC0F; coimmunoprecipitation &#xC5F0;&#xAD6C; p27 &#xC9C0;&#xC5ED;&#xD654;/&#xC800;&#xD558;&#xC758; &#xADDC;&#xC81C;&#xC5D0;&#xC11C; bcl-2&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xAC00;&#xB9AC;&#xD0B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Bcl-2 &#xC785;&#xC744; &#xC190;&#xC2E4; &#xF06C; D1a &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC218;&#xC900; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xD558;&#xC9C0; cyclin D1b &#xB808;&#xBCA8;&#xC758; &#xC0C1;&#xD638; &#xC5F0;&#xAD00;&#xB3C4;. Coimmunoprecipitation &#xC5F0;&#xAD6C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4; bcl-2 bcl-2&#xC640; D1a &#xF06C; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xBCF4;&#xACE0; &#xB418;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC740; &#xC0C1;&#xD638;&#xC791;&#xC6A9;&#xC73C;&#xB85C; p38 &#xBB3C;&#xC9C8; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xD55C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD0A4; &#xB2C8; &#xC544; &#xC81C;&#xC640;&#xC758; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; cyclin d1a&#xC5D0; &#xBBF8;&#xCE58;&#xB294; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xC911;&#xC7AC;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xB9E8; &#xD2C0; &#xC138;&#xD3EC; &#xB9BC;&#xD504; &#xC885; &#xBAA8;&#xB378;&#xC5D0;&#xC11C; Bcl-2 &#xC785;&#xC744; &#xF06C; D1, &#xD575; &#xC778;&#xC790;-kappaB, p53, bax, &#xBC0F; p27 &#xC218;&#xC900;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xAC10;&#xC18C;&#xC640; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Los mecanismos moleculares responsables de la resistencia a la apoptosis linfoma a menudo implican la v&#xED;a de Bcl-2. En este estudio, se investigaron las v&#xED;as de se&#xF1;ales celulares activadas en Bcl-2-overexpressing l&#xED;neas celulares humanas del linfoma de c&#xE9;lulas del manto (JVM-dos Y y Z de 138) que han sido tratados con oblimersen, una estrategia de silenciamiento g&#xE9;nico molecular que suprime de manera efectiva Bcl-2 in vitro e in vivo. Z-138 c&#xE9;lulas expresaron mayores niveles de Bcl-2 y son m&#xE1;s sensibles a los efectos de la Bcl-2, mediada por silenciamiento oblimersen o Bcl-2 ARN interferente peque&#xF1;o, in vitro. Los tumores derivados de inyecci&#xF3;n siguiente de Z-138 c&#xE9;lulas fueron sensibles a oblimersen a juzgar por la disminuci&#xF3;n en la tasa de crecimiento del tumor y disminuye en la proliferaci&#xF3;n de c&#xE9;lulas (medida por el Ki-67). La inmunohistoqu&#xED;mica y Western blot de oblimersen tratadas con Z-138 los tumores revel&#xF3; una disminuci&#xF3;n dosis-dependiente de Bcl-2 niveles y un incremento asociado en las prote&#xED;nas pro-apopt&#xF3;ticos caspasa-3 ya la caspasa 9. Silenciar Bcl-2 en Z-138 xenoinjertos revel&#xF3; un asociado dependiente de la dosis la supresi&#xF3;n de Bax, una disminuci&#xF3;n de la p&#xE9;rdida del factor nuclear-kappaB y fosfato factor nuclear kappa B, y transitoria de los niveles de p53. Los estudios sugieren que la coimmunoprecipitation &#xFA;ltima observaci&#xF3;n est&#xE1; mediada por una asociaci&#xF3;n entre la Bcl-2 y fosfo-MDM2. Bcl-2 silenciamiento de p27 tambi&#xE9;n dio lugar a la baja regulaci&#xF3;n y el punto de coimmunoprecipitation estudios para un papel de Bcl-2 en la regulaci&#xF3;n de p27 localizaci&#xF3;n / degradaci&#xF3;n. Bcl-2 silenciamiento tambi&#xE9;n se correlaciona con la p&#xE9;rdida de los niveles de la prote&#xED;na ciclina D1A pero no los niveles de ciclina D1B. Los estudios indican que coimmunoprecipitation Bcl-2 puede mediar sus efectos sobre la ciclina D1a a trav&#xE9;s de la interacci&#xF3;n con la prote&#xED;na quinasa p38 activada por mit&#xF3;genos, as&#xED; como una interacci&#xF3;n no declarada previamente entre Bcl-2 y ciclina D1a.

Silenciar Bcl-2 en los modelos de linfoma de c&#xE9;lulas del manto se asocia con la disminuci&#xF3;n de ciclina D1, el factor nuclear kappa B, p53, Bax y los niveles de P27

&#x9AD8;&#x901A;&#x91CF;&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#x6280;&#x672F;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E86;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x3001; &#x56FE;&#x8C31;&#xFF0C;&#x5E76;&#x4EE5;&#x7A7A;&#x524D;&#x7684;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387; transcriptomes &#x7684;&#x8C03;&#x67E5;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x8F6F;&#x4EF6;&#x5305;&#x6765;&#x5904;&#x7406;&#x3001; &#x5206;&#x6790;&#x548C;&#x53EF;&#x89C6;&#x5316;&#x6570;&#x636E;&#x4ECE;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x591A;&#x4E2A; &#39; &#x5B66;&#x5B66;&#x79D1;&#x672A;&#x5F97;&#x5230;&#x5145;&#x5206;&#x5F00;&#x53D1;&#x3002;

SIGMA2&#xFF1A; &#x7EFC;&#x5408;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x591A;&#x7EF4;&#x5206;&#x6790;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x764C;&#x75C7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x56FE;&#x8C31;&#x548C; transcriptomes&#x3002;

High throughput microarray technologies have afforded the investigation of genomes, epigenomes, and transcriptomes at unprecedented resolution. However, software packages to handle, analyze, and visualize data from these multiple 'omics disciplines have not been adequately developed.

SIGMA2: a system for the integrative genomic multi-dimensional analysis of cancer genomes, epigenomes, and transcriptomes.

Hautes technologies microarray d&#xE9;bit ont donn&#xE9; de l&#x26;#39;enqu&#xEA;te de g&#xE9;nomes, &#xE9;pig&#xE9;nome et transcriptomes &#xE0; une r&#xE9;solution sans pr&#xE9;c&#xE9;dent. Cependant, les logiciels pour g&#xE9;rer, analyser et visualiser les donn&#xE9;es provenant de ces multiples &#xAB;disciplines omique n&#x26;#39;ont pas &#xE9;t&#xE9; suffisamment d&#xE9;velopp&#xE9;s.

SIGMA2: un syst&#xE8;me pour la g&#xE9;nomique int&#xE9;grative analyse multi-dimensionnelle des g&#xE9;nomes du cancer, &#xE9;pig&#xE9;nomes et transcriptomes

Hoher Durchsatz Microarray Technologien haben die Untersuchung von Genomen, Epigenomes und Transcriptomes mit beispielloser Aufl&ouml;sung gew&auml;hrt. Jedoch Software-Pakete verarbeiten, analysieren und Visualisieren von Daten aus diesen mehreren &#39; Omics-Disziplinen sind nicht ausreichend entwickelt worden.

SIGMA2: ein System f&uuml;r die integrative genomische mehrdimensionale Analyse von Krebs Genomen, Epigenomes und Transcriptomes.

Tecnologie di high throughput microarray hanno offerto l&#39;inchiesta di genomi, epigenomes e transcriptomes a risoluzione senza precedenti. Tuttavia, i pacchetti software per gestire, analizzare e visualizzare dati da questi multipli &#39; omics discipline non sono state adeguatamente sviluppate.

SIGMA2: un sistema per l&#39;analisi multidimensionale genomic integrativa di genomi cancro, epigenomes e transcriptomes.

&#x9AD8;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x6280;&#x8853;&#x306F;&#x3001;&#x524D;&#x4F8B;&#x306E;&#x306A;&#x3044;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x3067;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;epigenomes&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x8ABF;&#x67FB;&#x3092;&#x4E0E;&#x3048;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x51E6;&#x7406;&#x3001;&#x5206;&#x6790;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x8907;&#x6570;&#x306E; &#x26;quot;&#x30AA;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x5206;&#x91CE;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x8996;&#x899A;&#x5316;&#x3059;&#x308B;&#x30BD;&#x30D5;&#x30C8;&#x30A6;&#x30A7;&#x30A2;&#x30D1;&#x30C3;&#x30B1;&#x30FC;&#x30B8;&#x306F;&#x3001;&#x5341;&#x5206;&#x306B;&#x958B;&#x767A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x3002;

SIGMA2&#xFF1A;&#x304C;&#x3093;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x3001;Ep&#x200B;&#x200B;igenomes&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x7D71;&#x5408;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x591A;&#x6B21;&#x5143;&#x5206;&#x6790;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;

&#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9; microarray &#xAE30;&#xC220;&#xC744; &#xAC8C;&#xB188;, epigenomes, &#xBC0F; transcriptomes&#xC5D0;&#xC11C; &#xC804;&#xB840; &#xC5C6;&#xB294; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4;&#xC758; &#xC870;&#xC0AC;&#xB97C; &#xBC1B;&#xC73C;&#xBA74; &#xC788;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xC18C;&#xD504;&#xD2B8;&#xC6E8;&#xC5B4; &#xD328;&#xD0A4;&#xC9C0;&#xB97C; &#xCC98;&#xB9AC;, &#xBD84;&#xC11D;, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC2DC;&#xAC01;&#xD654; &#39; omics &#xBD84;&#xC57C; &#xC801;&#xC808; &#xD558; &#xAC8C; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC740;.

SIGMA2: &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; &#xD1B5;&#xD569; &#xAC8C;&#xB188; &#xB2E4;&#xCC28;&#xC6D0; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xC554; &#xAC8C;&#xB188;, epigenomes, &#xBC0F; transcriptomes.

Altas tecnolog&#xED;as de microarrays de rendimiento han brindado a la investigaci&#xF3;n de los genomas, epigenomas y transcriptomes con una resoluci&#xF3;n sin precedentes. Sin embargo, los paquetes de software para gestionar, analizar y visualizar datos de estos m&#xFA;ltiples &#x26;quot;disciplinas &#xF3;micas no han sido suficientemente desarrollados.

SIGMA2: un Sistema Integral para la Gen&#xF3;mica an&#xE1;lisis multidimensional de los genomas del c&#xE1;ncer, epigenomas y transcriptomes

&#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20;&#x8C03;&#x63A7;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x5728;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x764C;&#x75C7;&#x548C;&#x53D1;&#x80B2;&#x75BE;&#x75C5;&#x662F;&#x5E38;&#x89C1;&#x7684;&#x4E8B;&#x4EF6;&#x3002;CpG &#x5C9B;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x548C;&#x968F;&#x4E4B;&#x800C;&#x6765;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x6C89;&#x9ED8;&#x88AB;&#x8FD0;&#x8F93;&#x4E1A;&#x7684;&#x8BB8;&#x591A;&#x57FA;&#x56E0;&#x53C2;&#x4E0E;&#x591A;&#x79CD;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x804C;&#x80FD;&#x548C;&#x6210;&#x4E3A;&#x64A4;&#x9500;&#x5728;&#x75BE;&#x75C5;&#x72B6;&#x6001;&#x7684;&#x9014;&#x5F84;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#x5728;&#x75BE;&#x75C5;&#x57FA;&#x56E0;&#x53D1;&#x73B0;&#x6709;&#x7528; methylome &#x7684;&#x6BD4;&#x8F83;&#x5206;&#x6790;&#x3002;&#x80FD;&#x591F;&#x6807;&#x8BC6;&#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20;&#x53D8;&#x5F02;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x5168;&#x7403;&#x8303;&#x56F4;&#x5185;&#x662F;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x5FC5;&#x987B;&#x4E86;&#x89E3;&#x6C89;&#x9ED8;&#x8BE5;&#x5E76;&#x884C;&#x75C5;&#x60C5;&#x53D1;&#x5C55;&#x6A21;&#x5F0F;&#x3002;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x7684; DNA &#x6C89;&#x6DC0; &#xFF08;MeDIP&#xFF09; &#x662F;&#x4E00;&#x79CD;&#x6280;&#x672F;&#xFF0C;&#x901A;&#x8FC7; immunoprecipitating &#x4E0E; 5&#39;-&#x7532;&#x57FA;&#x80DE;&#x5627;&#x5576;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x6297;&#x4F53;&#x5206;&#x79BB;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x7684; DNA &#x7247;&#x6BB5;&#x3002;&#x6D53;&#x7F29;&#x7684;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x7684; DNA &#x7136;&#x540E;&#xFF0C;&#x53EF;&#x4EE5;&#x5206;&#x6790;&#x7279;&#x5B9A;&#x8F68;&#x8FF9;&#x7684;&#x65B9;&#x5F0F;&#x4F7F;&#x7528; pcr &#x6216;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7684;&#x65B9;&#x5F0F;&#x5BF9;&#x672A;&#x7ECF; MeDIP &#x6D53;&#x7F29;&#x6837;&#x672C;&#x7684;&#x6BD4;&#x8F83;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6742;&#x4EA4;&#x3002;&#x8FD9;&#x7BC7;&#x6587;&#x7AE0;&#x4ECB;&#x7ECD; MeDIP &#x548C;&#x62FC;&#x8D34;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4; BAC &#x8DEF;&#x5F84;&#x6570;&#x7EC4;&#x7684; MeDIP DNA &#x6742;&#x4EA4;&#x6280;&#x672F;&#x8BE6;&#x7EC6;&#x7684;&#x534F;&#x8BAE;&#x3002;

&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x7684; DNA &#x6C89;&#x6DC0; &#xFF08;MeDIP&#xFF09; &#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x3002;

Alteration in epigenetic regulation of gene expression is a common event in human cancer and developmental disease. CpG island hypermethylation and consequent gene silencing is observed for many genes involved in a diverse range of functions and pathways that become deregulated in the disease state. Comparative profiling of the methylome is therefore useful in disease gene discovery. The ability to identify epigenetic alterations on a global scale is imperative to understanding the patterns of gene silencing that parallel disease progression. Methylated DNA immunoprecipitation (MeDIP) is a technique that isolates methylated DNA fragments by immunoprecipitating with 5'-methylcytosine-specific antibodies. The enriched methylated DNA can then be analyzed in a locus-specific manner using PCR assay or in a genome-wide fashion by comparative genomic hybridization against a sample without MeDIP enrichment. This article describes the detailed protocol for MeDIP and hybridization of MeDIP DNA to a whole-genome tiling path BAC array.

Methylation analysis by DNA immunoprecipitation (MeDIP).

L&#x26;#39;alt&#xE9;ration de la r&#xE9;gulation &#xE9;pig&#xE9;n&#xE9;tique de l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes est un ph&#xE9;nom&#xE8;ne courant dans le cancer et les maladies humaines du d&#xE9;veloppement. CpG hyperm&#xE9;thylation &#xEE;le et gene silencing cons&#xE9;quente est observ&#xE9;e pour de nombreux g&#xE8;nes impliqu&#xE9;s dans un large &#xE9;ventail de fonctions et les voies qui deviennent d&#xE9;r&#xE9;glement&#xE9;s dans l&#x26;#39;&#xE9;tat de maladie. Profilage comparative de la m&#xE9;thylome est donc utile dans la d&#xE9;couverte de g&#xE8;ne de la maladie. La capacit&#xE9; d&#x26;#39;identifier des alt&#xE9;rations &#xE9;pig&#xE9;n&#xE9;tiques &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;chelle mondiale est imp&#xE9;ratif de comprendre les tendances du g&#xE8;ne silencing que progression de la maladie en parall&#xE8;le. M&#xE9;thyl&#xE9; ADN immunopr&#xE9;cipitation (MEDIP) est une technique qui isole des fragments d&#x26;#39;ADN m&#xE9;thyl&#xE9;s par immunopr&#xE9;cipitation avec 5&#x26;#39;-m&#xE9;thylcytosine anticorps sp&#xE9;cifiques. Le enrichi ADN m&#xE9;thyl&#xE9; peuvent ensuite &#xEA;tre analys&#xE9;es d&#x26;#39;une mani&#xE8;re sp&#xE9;cifique du locus en utilisant la PCR ou dans un mode &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;chelle du g&#xE9;nome par hybridation g&#xE9;nomique comparative sur un &#xE9;chantillon sans enrichissement MEDIP. Cet article d&#xE9;crit le protocole d&#xE9;taill&#xE9; pour MEDIP et l&#x26;#39;hybridation de l&#x26;#39;ADN MEDIP &#xE0; un g&#xE9;nome entier chemin de recouvrement BAC tableau.

Analyse de la m&#xE9;thylation de l&#x26;#39;ADN immunopr&#xE9;cipitation (MEDIP)

Ver&auml;nderung in epigenetische Regulierung der Genexpression ist eine gemeinsame Veranstaltung im menschlichen Krebs und Entwicklungsst&ouml;rungen. CpG-Insel-Hypermethylierung und konsequente gen-silencing eingehalten wird f&uuml;r viele Gene beteiligt ein breites Spektrum von Funktionen und Bahnen, die in das Krankheitsstadium dereguliert werden. Vergleichende Profilerstellung f&uuml;r die Methylome eignet sich daher in Krankheit-Gen-Entdeckung. Epigenetische Ver&auml;nderungen im globalen Ma&szlig;stab zu identifizieren ist unerl&auml;sslich f&uuml;r das Verst&auml;ndnis der Muster des Gens zum Schweigen, dass parallel zur Krankheitsprogression. Methylierte DNA Immunopr&auml;zipitation (MeDIP) ist eine Technik, die methylierte DNA-Fragmente von Immunoprecipitating mit 5&#39;-Methylcytosine-spezifische Antik&ouml;rper isoliert. Die angereicherte methylierte DNA kann dann durch vergleichende genomische Hybridisierung gegen eine Probe ohne MeDIP Anreicherung in Locus-spezifische Weise mit PCR-Assay oder in einer genomweiten analysiert werden. Dieser Artikel beschreibt das ausf&uuml;hrliche Protokoll f&uuml;r MeDIP und Hybridisierung MeDIP DNA in ein ganzes Genom Fliesen-Pfad BAC-Array.

Analyse der Methylierung von DNA-Immunopr&auml;zipitation (MeDIP).

Alterazione nella regolazione epigenetica dell&#39;espressione genica &egrave; un evento comune nel cancro umano e malattia evolutiva. Hypermethylation isola CpG e silenziamento genico conseguente &egrave; osservato per molti geni coinvolti in una vasta gamma di funzioni e percorsi che diventano deregolamentati nello stato di malattia. Analisi comparativa della methylome quindi &egrave; utile nell&#39;individuazione del gene malattia. La capacit&agrave; di identificare alterazioni epigenetiche su scala globale &egrave; indispensabile per comprendere i motivi di tale progressione della malattia parallela di silenziamento genico. Immunoprecipitazione DNA metilato (MeDIP) &egrave; una tecnica che consente di isolare frammenti di DNA metilati da immunoprecipitating con 5&#39;--metilcitosina anticorpi specifici. Il DNA metilato arricchito poi pu&ograve; essere analizzato in modo specifico locus usando analisi di PCR o di una moda genome-wide di ibridazione genomic comparativa contro un campione senza alcun arricchimento MeDIP. Questo articolo descrive il protocollo dettagliato per MeDIP e ibridazione del DNA MeDIP in una matrice di percorso BAC whole genome tiling.

Analisi di metilazione di DNA immunoprecipitazione (MeDIP).

&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x5236;&#x5FA1;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x764C;&#x3068;&#x767A;&#x9054;&#x969C;&#x5BB3;&#x306E;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306A;&#x30A4;&#x30D9;&#x30F3;&#x30C8;&#x3067;&#x3059;&#x3002; CpG&#x30A2;&#x30A4;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C9;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3068;&#x305D;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30B5;&#x30A4;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306F;&#x3001;&#x75C5;&#x6C17;&#x306E;&#x72B6;&#x614B;&#x306B;&#x306A;&#x308B;&#x898F;&#x5236;&#x7DE9;&#x548C;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3068;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x591A;&#x69D8;&#x5316;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002; methylome&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x306F;&#x3001;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x75BE;&#x60A3;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x767A;&#x898B;&#x306B;&#x6709;&#x7528;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x5730;&#x7403;&#x898F;&#x6A21;&#x3067;&#x306E;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x5909;&#x5316;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x80FD;&#x529B;&#x306F;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x4E26;&#x5217;&#x75C5;&#x6C17;&#x306E;&#x9032;&#x884C;&#x3092;&#x30B5;&#x30A4;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x3092;&#x7406;&#x89E3;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;DNA&#x514D;&#x75AB;&#x6C88;&#x964D;&#xFF08;MeDIP&#xFF09;&#x306F;5&#x26;#39;-&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30B7;&#x30C8;&#x30B7;&#x30F3;&#x306B;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x306A;&#x6297;&#x4F53;&#x3067;&#x514D;&#x75AB;&#x6C88;&#x964D;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;DNA&#x65AD;&#x7247;&#x3092;&#x5206;&#x96E2;&#x3059;&#x308B;&#x624B;&#x6CD5;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x6FC3;&#x7E2E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;DNA&#x3092;PCR&#x30A2;&#x30C3;&#x30BB;&#x30A4;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x3066;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5EA7;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x306B;&#x307E;&#x305F;&#x306F;MeDIP&#x6FC3;&#x7E2E;&#x305B;&#x305A;&#x306B;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x306B;&#x5BFE;&#x3059;&#x308B;&#x6BD4;&#x8F03;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C0;&#x30A4;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30EF;&#x30A4;&#x30C9;&#x306A;&#x30D5;&#x30A1;&#x30C3;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3067;&#x5206;&#x6790;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x8CC7;&#x6599;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x5168;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x30D1;&#x30B9;BAC&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x3078;&#x306E;MeDIP DNA&#x306E;MeDIP&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C0;&#x30A4;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x8A73;&#x7D30;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C8;&#x30B3;&#x30EB;&#x3092;&#x8A18;&#x8FF0;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

DNA&#x514D;&#x75AB;&#x6C88;&#x964D;&#xFF08;MeDIP&#xFF09;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x89E3;&#x6790;

&#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; epigenetic &#xADDC;&#xC815;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBCC0;&#xACBD; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC554;&#xACFC; &#xBC1C;&#xB2EC; &#xC9C8;&#xD658;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xC774;&#xBCA4;&#xD2B8;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. CpG &#xC12C; hypermethylation &#xBC0F; &#xACB0;&#xACFC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC785;&#xC744; &#xAD00;&#xCC30; &#xB9CE;&#xC740; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xAE30;&#xB2A5; &#xBC0F; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xC0C1;&#xD0DC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xADDC;&#xC81C; &#xC644;&#xD654; &#xB420; &#xACBD;&#xB85C;&#xC5D0; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C;. Methylome&#xC758; &#xBE44;&#xAD50; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xD558;&#xB294; &#xAC83;&#xC740; &#xB530;&#xB77C;&#xC11C; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAC80;&#xC0C9;&#xC5D0; &#xC720;&#xC6A9; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC138;&#xACC4;&#xC801;&#xC778; &#xADDC;&#xBAA8;&#xC5D0; epigenetic &#xBCC0;&#xACBD; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558;&#xB294; &#xAE30;&#xB2A5; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xCE68;&#xBB35; &#xADF8; &#xBCD1;&#xB82C; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xC9C4;&#xD589;&#xC758; &#xD328;&#xD134;&#xC744; &#xD30C;&#xC545; &#xD558;&#xB294; &#xAC83;&#xC774; &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. Methylated DNA immunoprecipitation (MeDIP) 5&#39;-methylcytosine-&#xD2B9;&#xC815; &#xD56D; &#xCCB4;&#xC640; immunoprecipitating&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; methylated DNA &#xD30C;&#xD3B8; &#xBD84;&#xB9AC; &#xD558;&#xB294; &#xAE30;&#xC220;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB18D;&#xCD95;&#xB41C; methylated DNA &#xB2E4;&#xC74C; &#xBD84;&#xC11D;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xB85C;&#xCEE4; &#xC2A4; &#xD2B9;&#xC815; &#xBC29;&#xC2DD;&#xC73C;&#xB85C; PCR &#xBD84;&#xC11D; &#xACB0;&#xACFC; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xB610;&#xB294; &#xAC8C;&#xB188; &#xB113;&#xC740; &#xD328;&#xC158; MeDIP &#xB18D;&#xCD95; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xACE0; &#xC0D8;&#xD50C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBE44;&#xAD50; genomic &#xAD50; &#xC7A1;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574;. &#xC774; &#xBB38;&#xC11C; MeDIP &#xBC0F; &#xC804;&#xCCB4; &#xAC8C;&#xB188; &#xAE30;&#xC640; &#xACBD;&#xB85C; BAC &#xBC30;&#xC5F4;&#xC5D0; MeDIP DNA&#xC758; &#xAD50; &#xC7A1;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0C1;&#xC138;&#xD55C; &#xD504;&#xB85C;&#xD1A0;&#xCF5C;&#xC744; &#xC124;&#xBA85;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

DNA immunoprecipitation (MeDIP)&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xBD84;&#xC11D;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

La alteraci&#xF3;n en la regulaci&#xF3;n epigen&#xE9;tica de la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica es un evento com&#xFA;n en el c&#xE1;ncer y las enfermedades humanas de desarrollo. CpG hipermetilaci&#xF3;n isla y el silenciamiento de genes como consecuencia se observa en muchos genes implicados en una amplia gama de funciones y las v&#xED;as que quedan liberalizados en el estado de la enfermedad. Comparativo de perfiles de la metiloma tanto, es &#xFA;til en el descubrimiento de genes asociados a enfermedades. La capacidad de identificar las alteraciones epigen&#xE9;ticas en una escala global es imprescindible para entender los patrones de silenciamiento de los genes que la progresi&#xF3;n de la enfermedad en paralelo. Metilado inmunoprecipitaci&#xF3;n de ADN (MeDIP) es una t&#xE9;cnica que a&#xED;sla fragmentos de ADN metilado por inmunoprecipitaci&#xF3;n con 5&#x26;#39;-metilcitosina anticuerpos espec&#xED;ficos. El ADN metilado enriquecido puede ser analizada de una manera espec&#xED;fica de locus mediante la t&#xE9;cnica de PCR o de una manera en todo el genoma mediante hibridaci&#xF3;n gen&#xF3;mica comparativa frente a una muestra sin enriquecimiento MeDIP. En este art&#xED;culo se describe el protocolo detallado para MeDIP y la hibridaci&#xF3;n de ADN MeDIP a una ruta de todo el genoma de amplia baldosas de BAC.

El an&#xE1;lisis por metilaci&#xF3;n del ADN inmunoprecipitaci&#xF3;n (MeDIP)

&#x533B;&#x5B66;&#x56FE;&#x50CF;&#x3002;&#x88C2;&#x9699;&#x4E0B;&#x988C;&#x9AA8; &mdash; &mdash; &#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x9677;&#x9631;&#x3002;

Medical image. The fractured mandible--potential pitfall.

D&#x26;#39;images m&#xE9;dicales. La Fracture mandibulaire - Pitfall potentiel

Medizinische Bildverarbeitung. Die gebrochenen Unterkiefer--potenziellen Fallstrick.

Immagini mediche. La mandibola fratturata - potenziale insidia.

&#x533B;&#x7528;&#x753B;&#x50CF;&#x3002;&#x7834;&#x65AD;&#x4E0B;&#x984E; - &#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x843D;&#x3068;&#x3057;&#x7A74;

&#xC758;&#xB8CC; &#xC774;&#xBBF8;&#xC9C0;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xACE8;&#xC808;&#xB41C; mandible-&#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xD568;&#xC815;&#xC774; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Im&#xE1;genes M&#xE9;dicas. La Fractura de mand&#xED;bula - riesgo potencial

&#x9AD8;&#x541E;&#x5410;&#x91CF;&#x7684;&#x8FDB;&#x6B65;&#xFF0C;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5206;&#x6790;&#x6280;&#x672F;&#x8BA9;&#x764C;&#x75C7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x666F;&#x89C2;&#x7A7A;&#x524D;&#x89C6;&#x56FE;&#x3002;&#x9AD8;&#x5BC6;&#x5EA6;&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#x548C;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x4E3A;&#x57FA;&#x7840;&#x7684;&#x6218;&#x7565;&#x5177;&#x4F53;&#x800C;&#x8A00;&#xFF0C;&#x5DF2;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7528;&#x6765;&#x6807;&#x8BC6; &#xFF08;&#x5982;&#x57FA;&#x56E0;&#x7528;&#x91CF;&#x3001; &#x7B49;&#x4F4D;&#x57FA;&#x56E0;&#x72B6;&#x6001;&#x548C;&#x7A81;&#x53D8;&#x57FA;&#x56E0;&#x5E8F;&#x5217;&#x4E2D;&#x7684;) &#x9057;&#x4F20;&#x548C;&#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20; &#xFF08;&#x5982; DNA &#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x3001; &#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x4FEE;&#x9970;&#x548C; microRNA) &#x5728;&#x764C;&#x75C7;&#x4E2D;&#x7684;&#x7578;&#x53D8;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5206;&#x6790;&#x6280;&#x672F;&#x5728;&#x5355;&#x7EF4;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x4E2D;&#x7684;&#x5E94;&#x7528;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x4E00;&#x76F4;&#x5728;&#x764C;&#x75C7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x53D1;&#x73B0;&#xFF0C;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x4F4E;&#x9891;&#x7387;&#x4E8B;&#x4EF6;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x5F80;&#x5F80;&#x88AB;&#x5FFD;&#x7565;&#x3002;&#x5206;&#x6790;&#x5E73;&#x884C;&#x7EF4;&#x5EA6;&#x7684;&#x7EFC;&#x5408;&#x6027;&#x529E;&#x6CD5;&#x5DF2;&#x542F;&#x7528; (a) &#x7ECF;&#x5E38;&#x4E2D;&#x65AD;&#x901A;&#x8FC7;&#x591A;&#x79CD;&#x673A;&#x5236;&#xFF0C;&#x4F46;&#x5728;&#x4F4E;&#x9891;&#x7387;&#x7684;&#x4EFB;&#x4F55;&#x4E00;&#x79CD;&#x673A;&#x5236;&#x548C; (b) &#x7ECF;&#x5E38;&#x53D7;&#x5230;&#x7834;&#x574F;&#xFF0C;&#x5728;&#x591A;&#x4E2A;&#x7EC4;&#x4EF6;&#xFF0C;&#x4F46;&#x5728;&#x4F4E;&#x9891;&#x7387;&#x5728;&#x5355;&#x4E2A;&#x7EC4;&#x4EF6;&#x7684;&#x901A;&#x8DEF;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x9274;&#x5B9A;&#x3002;&#x4F7F;&#x7528;&#x7EFC;&#x5408;&#x65B9;&#x6CD5;&#x7684;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x597D;&#x5904;&#x8BF4;&#x660E;&#x8FD9;&#x4E2A;&#x6982;&#x5FF5;&#xFF0C;&#x6574;&#x4F53;&#x5927;&#x4E8E;&#x5176;&#x5404;&#x90E8;&#x5206;&#x7684;&#x603B;&#x548C;&#x3002;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x52AA;&#x529B;&#x73B0;&#x5728;&#x5DF2;&#x8F6C;&#x5411;&#x5E76;&#x884C;&#x548C;&#x7EFC;&#x5408;&#x591A;&#x7EF4;&#x9014;&#x5F84;&#x7814;&#x7A76;&#x764C;&#x75C7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x666F;&#x89C2;&#x4EE5;&#x83B7;&#x5F97;&#x66F4;&#x6DF1;&#x523B;&#x4E86;&#x89E3;&#x7684;&#x5173;&#x952E;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x9A7E;&#x9A76;&#x764C;&#x75C7;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x9014;&#x5F84;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E00;&#x5BA1;&#x67E5;&#x63CF;&#x8FF0;&#x4ECE;&#x8FD9;&#x79CD;&#x9AD8;&#x541E;&#x5410;&#x91CF;&#x3001; &#x7EFC;&#x5408;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x81F4;&#x75C5;&#x9057;&#x4F20;&#x4E8B;&#x4EF6;&#x6211;&#x4EEC;&#x7406;&#x89E3;&#x7684;&#x8D21;&#x732E;&#x5728;&#x80BF;&#x7624;&#x7EC6;&#x80DE;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x4E2D;&#x4F20;&#x64AD;&#x7684;&#x4E3B;&#x8981;&#x8C03;&#x67E5;&#x7ED3;&#x679C;&#x3002;

&#x6574;&#x5408;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7684;&#x591A;&#x4E2A;&#x7EF4;&#x5EA6;&#x548C; epigenomic &#x666F;&#x89C2;&#x7684;&#x764C;&#x75C7;&#x3002;

Advances in high-throughput, genome-wide profiling technologies have allowed for an unprecedented view of the cancer genome landscape. Specifically, high-density microarrays and sequencing-based strategies have been widely utilized to identify genetic (such as gene dosage, allelic status, and mutations in gene sequence) and epigenetic (such as DNA methylation, histone modification, and microRNA) aberrations in cancer. Although the application of these profiling technologies in unidimensional analyses has been instrumental in cancer gene discovery, genes affected by low-frequency events are often overlooked. The integrative approach of analyzing parallel dimensions has enabled the identification of (a) genes that are often disrupted by multiple mechanisms but at low frequencies by any one mechanism and (b) pathways that are often disrupted at multiple components but at low frequencies at individual components. These benefits of using an integrative approach illustrate the concept that the whole is greater than the sum of its parts. As efforts have now turned toward parallel and integrative multidimensional approaches for studying the cancer genome landscape in hopes of obtaining a more insightful understanding of the key genes and pathways driving cancer cells, this review describes key findings disseminating from such high-throughput, integrative analyses, including contributions to our understanding of causative genetic events in cancer cell biology.

Integrating the multiple dimensions of genomic and epigenomic landscapes of cancer.

Les progr&#xE8;s des technologies de profilage haut d&#xE9;bit, l&#x26;#39;ensemble du g&#xE9;nome ont permis une vue sans pr&#xE9;c&#xE9;dent sur le paysage du g&#xE9;nome du cancer. Plus pr&#xE9;cis&#xE9;ment, biopuces &#xE0; haute densit&#xE9; et de s&#xE9;quen&#xE7;age &#xE0; base de strat&#xE9;gies ont &#xE9;t&#xE9; largement utilis&#xE9;es pour identifier g&#xE9;n&#xE9;tique (tels que le dosage g&#xE9;nique, le statut all&#xE9;lique, et les mutations dans la s&#xE9;quence du g&#xE8;ne) et les aberrations &#xE9;pig&#xE9;n&#xE9;tiques (m&#xE9;thylation de l&#x26;#39;ADN tels que, la modification des histones, et microARN) dans le cancer . Bien que l&#x26;#39;application de ces technologies de profilage dans les analyses unidimensionnelles a jou&#xE9; un r&#xF4;le dans la d&#xE9;couverte du g&#xE8;ne du cancer, les g&#xE8;nes affect&#xE9;s par basse fr&#xE9;quence des &#xE9;v&#xE9;nements sont souvent n&#xE9;glig&#xE9;s. L&#x26;#39;approche int&#xE9;gr&#xE9;e de l&#x26;#39;analyse des dimensions parall&#xE8;les a permis l&#x26;#39;identification de (a) des g&#xE8;nes qui sont souvent perturb&#xE9;s par des m&#xE9;canismes multiples, mais dans les basses fr&#xE9;quences par un seul m&#xE9;canisme et (b) Les voies qui sont souvent perturb&#xE9;s &#xE0; composants multiples, mais aux basses fr&#xE9;quences &#xE0; des composants individuels . Ces avantages de l&#x26;#39;utilisation d&#x26;#39;une approche int&#xE9;grative illustrer le concept que le tout est plus grand que la somme de ses parties. Alors que les efforts sont maintenant tourn&#xE9;s vers parall&#xE8;les et d&#x26;#39;int&#xE9;gration des approches multidimensionnelles pour &#xE9;tudier le paysage du g&#xE9;nome du cancer dans l&#x26;#39;espoir d&#x26;#39;obtenir une compr&#xE9;hension plus perspicace des g&#xE8;nes cl&#xE9;s et les voies de conduire les cellules canc&#xE9;reuses, cette revue d&#xE9;crit les principales conclusions de la diffusion de ces haut-d&#xE9;bit, des analyses int&#xE9;gratives, y compris les contributions &#xE0; notre compr&#xE9;hension de causalit&#xE9; des &#xE9;v&#xE9;nements g&#xE9;n&#xE9;tiques en biologie cellulaire du cancer.

Int&#xE9;grer les multiples dimensions de paysages g&#xE9;nomiques et &#xE9;pig&#xE9;nomiques de cancer

Fortschritte in hohem Durchsatz, haben genomweiter Profilerstellung Technologien f&uuml;r eine beispiellose Sicht der Krebs Genom Landschaft erlaubt. Insbesondere High-Density-Microarrays und Sequenzierung-basierte Strategien wurden weithin genutzten genetischen (z. B. gen Dosierung, allelische Status und Mutationen im Gensequenz) identifizieren und epigenetische (z. B. DNA-Methylierung, Histon &Auml;nderungen und MicroRNA) Aberrationen in Krebs. Obwohl die Anwendung dieser Profilerstellung Technologien in eindimensionalen Analysen ma&szlig;geblich an Krebs-Gen-Entdeckung wurde, werden die Gene von niederfrequenten Ereignissen betroffen oft &uuml;bersehen. Der integrative Ansatz der Analyse paralleler Dimensions hat die Identifizierung von a Gene aktiviert, die oft gest&ouml;rt werden durch mehrere Mechanismen, aber bei niedrigen Frequenzen von jedem ein Mechanismus und (b) Bahnen, die oft auf mehrere Komponenten aber bei niedrigen Frequenzen an einzelnen Komponenten gest&ouml;rt sind. Diese Vorteile der Verwendung von eines integrativen Ansatzes erl&auml;utern Sie das Konzept, dass das ganze gr&ouml;&szlig;er als die Summe seiner Teile. Wie Anstrengungen nun in Richtung parallel und integrative mehrdimensionale Ans&auml;tze zur Untersuchung der Krebs Genom-Landschaft, in der Hoffnung ein insightful Verst&auml;ndnis der wichtigsten Gene und Bahnen fahren Krebszellen eingeschaltet haben, beschreibt diesen Bericht wichtige Erkenntnisse, die Verbreitung von solchen Hochdurchsatz, integrativen Analysen, einschlie&szlig;lich der Beitr&auml;ge zu unserem Verst&auml;ndnis der urs&auml;chlichen genetischen Ereignisse in Krebs-Zellen-Biologie.

Die Vielschichtigkeit der genomischen Integration und epigenomischen Landschaften von Krebs.

Advances in high-throughput, genome-wide profilatura tecnologie hanno permesso per una visione senza precedenti del paesaggio di genoma del cancro. In particolare, microarrays ad alta densit&agrave; e strategie basate sul sequenziamento sono stati ampiamente utilizzati per identificare genetica (come il dosaggio del gene status allelica e mutazioni nella sequenza del gene) ed epigenetico (ad esempio DNA metilazione, modifiche dell&#39;istone e microRNA) aberrazioni in cancro. Anche se l&#39;applicazione di queste tecnologie di profilatura in analisi unidimensionale &egrave; stato strumentale nella scoperta del gene cancro, geni colpiti da eventi di bassa frequenza sono spesso trascurati. L&#39;approccio integrativo di analizzare dimensioni parallele ha permesso l&#39;identificazione di geni (a) che spesso sono interrotti da meccanismi multipli, ma alle basse frequenze da qualsiasi meccanismo di uno e (b) percorsi che spesso sono interrotti a pi&ugrave; componenti, ma a basse frequenze ai singoli componenti. Questi benefici di usando un approccio integrativo illustrano il concetto che il tutto &egrave; maggiore della somma delle sue parti. Come gli sforzi sono ora rivolto verso approcci multidimensionali paralleli e integrativi per studiare il paesaggio di genoma del cancro nella speranza di ottenere una comprensione pi&ugrave; penetranti dei geni chiave e percorsi guida le cellule tumorali, questa recensione descrive risultati chiave diffondendo da tali analisi high-throughput, integrative, compresi contributi alla nostra comprensione degli eventi genetici causativi nella biologia delle cellule di cancro.

Integrando le dimensioni multiple di genomic e paesaggi epigenomic del cancro.

&#x9AD8;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x3001;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30EF;&#x30A4;&#x30C9;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x6280;&#x8853;&#x306E;&#x9032;&#x6B69;&#x306F;&#x3001;&#x304C;&#x3093;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x666F;&#x89B3;&#x306E;&#x524D;&#x4F8B;&#x306E;&#x306A;&#x3044;&#x30D3;&#x30E5;&#x30FC;&#x306B;&#x8A31;&#x53EF;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5177;&#x4F53;&#x7684;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x9AD8;&#x5BC6;&#x5EA6;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x6226;&#x7565;&#x306F;&#x3001;&#x5E83;&#x304F;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#xFF08;&#x4F8B;&#x3048;&#x3070;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x91CF;&#x3001;&#x5BFE;&#x7ACB;&#x72B6;&#x6CC1;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x5909;&#x7570;&#x306A;&#x3069;&#xFF09;&#x3068;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5229;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#xFF08;&#x4F8B;&#x3048;&#x3070;&#x3001;DNA&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3001;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x4FEE;&#x98FE;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;RNA&#x306A;&#x3069;&#xFF09;&#x304C;&#x7570;&#x5E38;&#x764C;&#x3067;&#x3002;&#x4E00;&#x6B21;&#x5143;&#x89E3;&#x6790;&#x3067;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x6280;&#x8853;&#x306E;&#x5FDC;&#x7528;&#x306F;&#x3001;&#x304C;&#x3093;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x767A;&#x898B;&#x306B;&#x5C3D;&#x529B;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304C;&#x3001;&#x4F4E;&#x5468;&#x6CE2;&#x30A4;&#x30D9;&#x30F3;&#x30C8;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x53D7;&#x3051;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x3057;&#x3070;&#x3057;&#x3070;&#x898B;&#x843D;&#x3068;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x4E26;&#x5217;&#x5BF8;&#x6CD5;&#x3092;&#x5206;&#x6790;&#x3059;&#x308B;&#x7D71;&#x5408;&#x7684;&#x306A;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306F;&#x3001;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x5834;&#x5408;&#x3001;&#x3044;&#x305A;&#x308C;&#x304B;&#x306E;&#x6A5F;&#x69CB;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8907;&#x6570;&#x306E;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x304F;&#x3001;&#x4F4E;&#x5468;&#x6CE2;&#x6570;&#x3067;&#x7834;&#x58CA;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3068;&#x3001;&#xFF08;b&#xFF09;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306F;&#x3001;&#x3057;&#x3070;&#x3057;&#x3070;&#x8907;&#x6570;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x3067;&#x7834;&#x58CA;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#xFF08;1&#xFF09;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x3092;&#x6709;&#x52B9;&#x306B;&#x3057;&#x3066;&#x304D;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3001;&#x500B;&#x3005;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x3067;&#x306F;&#x4F4E;&#x5468;&#x6CE2;&#x6570;&#x3067;&#x3002;&#x7D71;&#x5408;&#x7684;&#x306A;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x3066;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x5229;&#x70B9;&#x306F;&#x3001;&#x5168;&#x4F53;&#x306F;&#x90E8;&#x5206;&#x306E;&#x7DCF;&#x548C;&#x3088;&#x308A;&#x3082;&#x5927;&#x304D;&#x3044;&#x3068;&#x3044;&#x3046;&#x6982;&#x5FF5;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x52AA;&#x529B;&#x306F;&#x4ECA;&#x3001;&#x764C;&#x7D30;&#x80DE;&#x3092;&#x99C6;&#x52D5;&#x3059;&#x308B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3068;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x3088;&#x308A;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x529B;&#x306E;&#x7406;&#x89E3;&#x3092;&#x5F97;&#x308B;&#x306E;&#x3092;&#x671F;&#x5F85;&#x3057;&#x3066;&#x764C;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x666F;&#x89B3;&#x3092;&#x7814;&#x7A76;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30D1;&#x30E9;&#x30EC;&#x30EB;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x7D71;&#x5408;&#x7684;&#x306A;&#x591A;&#x6B21;&#x5143;&#x7684;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306B;&#x5411;&#x304B;&#x3063;&#x3066;&#x306A;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x65E5;&#x306F;&#x3001;&#x9AD8;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x3001;&#x7D71;&#x5408;&#x7684;&#x306A;&#x5206;&#x6790;&#x304B;&#x3089;&#x666E;&#x53CA;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x8ABF;&#x67FB;&#x7D50;&#x679C;&#x3092;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x3001;&#x764C;&#x7D30;&#x80DE;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x306E;&#x539F;&#x56E0;&#x3068;&#x306A;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x4E8B;&#x8C61;&#x306E;&#x7406;&#x89E3;&#x3078;&#x306E;&#x8CA2;&#x732E;&#x7B49;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x3002;

&#x304C;&#x3093;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x3068;epigenomic&#x98A8;&#x666F;&#x306E;&#x8907;&#x6570;&#x306E;&#x6B21;&#x5143;&#x306E;&#x7D71;&#x5408;

&#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9;&#xC758; &#xBC1C;&#xC804;, &#xAC8C;&#xB188; &#xC804;&#xCCB4; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xAE30;&#xC220;&#xC744; &#xC554; &#xAC8C;&#xB188; &#xD48D;&#xACBD;&#xC758; &#xC804;&#xB840; &#xC5C6;&#xB294; &#xBCF4;&#xAE30;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD5C8;&#xC6A9; &#xD588;&#xB2E4;. &#xD2B9;&#xD788;, &#xACE0;&#xBC00;&#xB3C4; microarrays &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xAE30;&#xBC18; &#xC804;&#xB7B5; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD558; &#xAC8C; &#xD65C;&#xC6A9; (&#xC608;: &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBCF5;&#xC6A9;&#xB7C9;, &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC0C1;&#xD0DC; &#xBC0F; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774;) &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558; &#xACE0; (&#xC608;: DNA &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654;, &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xC218;&#xC815; &#xBC0F; microRNA) epigenetic &#xC554;&#xC5D0; &#xCC29;&#xC624;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xAE30;&#xC220; unidimensional &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0;&#xC758; &#xC751;&#xC6A9;&#xC740; &#xC554; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xACAC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;, &#xBE44;&#xB85D; &#xB0AE;&#xC740; &#xC8FC;&#xD30C;&#xC218; &#xC774;&#xBCA4;&#xD2B8;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBC1B;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC790;&#xC8FC; &#xAC04;&#xACFC; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBCD1;&#xB82C; &#xCE58;&#xC218; &#xBD84;&#xC11D;&#xC758; &#xD1B5;&#xD569; &#xC811;&#xADFC; (a) &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB294; &#xC885;&#xC885; &#xC911;&#xB2E8; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xC800;&#xC8FC;&#xD30C; &#xC218;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5B4;&#xB5A4; &#xD558;&#xB098;&#xC758; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998; &#xBC0F; (b) &#xC5EC;&#xB7EC; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;&#xC5D0; &#xC788;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xAC1C;&#xBCC4; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC800;&#xC8FC;&#xD30C; &#xC218;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC790;&#xC8FC; &#xC911;&#xB2E8; &#xB420; &#xACBD;&#xB85C; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xAC8C; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD1B5;&#xD569; &#xC811;&#xADFC;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xD61C;&#xD0DD; &#xC804;&#xCCB4;&#xB294; &#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xD569; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xB354; &#xD070; &#xAC1C;&#xB150;&#xC744; &#xC124;&#xBA85; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB178;&#xB825; &#xC9C0;&#xAE08; &#xC554; &#xAC8C;&#xB188; &#xD504;&#xB9AC; &#xD0A4; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC0F; &#xC554; &#xC138;&#xD3EC;&#xB97C; &#xC6B4;&#xC804; &#xD558;&#xB294; &#xD1B5;&#xB85C;&#xC758; &#xB354; &#xB9CE;&#xC740; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825; &#xC788;&#xB294; &#xC774;&#xD574;&#xB97C; &#xC5BB;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xACF5;&#xBD80;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBCD1;&#xB82C; &#xD1B5;&#xD569; &#xB2E4;&#xCC28;&#xC6D0; &#xC811;&#xADFC;&#xC73C;&#xB85C; &#xC544;&#xB2D9;&#xB2C8;&#xB2E4;&#xB85C;&#xC774; &#xAC80;&#xD1A0; &#xC804;&#xD30C; &#xC6D0;&#xC778; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC774;&#xBCA4;&#xD2B8;&#xC758; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC774;&#xD574;&#xC5D0; &#xAE30;&#xC5EC;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; &#xC554; &#xC138;&#xD3EC; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC19;&#xC740; &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9;, &#xD1B5;&#xD569; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC8FC;&#xC694; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xACB0;&#xACFC;&#xB97C; &#xC124;&#xBA85; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xAC8C;&#xB188;&#xC758; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xCC28;&#xC6D0; &#xD1B5;&#xD569; &#xBC0F; &#xC554; epigenomic &#xD48D;&#xACBD;.

Los avances en las tecnolog&#xED;as de creaci&#xF3;n de perfiles de alto rendimiento, en todo el genoma han permitido una visi&#xF3;n sin precedentes del paisaje genoma del c&#xE1;ncer. Espec&#xED;ficamente, micromatrices de alta densidad y las estrategias de secuenciaci&#xF3;n basados &#x200B;&#x200B;han sido ampliamente utilizados para identificar gen&#xE9;tica (por ejemplo, la dosis de genes, el estado al&#xE9;lica, y las mutaciones en la secuencia g&#xE9;nica) y aberraciones epigen&#xE9;ticas (tales como la metilaci&#xF3;n del ADN, modificaci&#xF3;n de las histonas, y microRNA) en el c&#xE1;ncer . Aunque la aplicaci&#xF3;n de estas tecnolog&#xED;as en los an&#xE1;lisis de perfiles unidimensionales ha sido fundamental en el descubrimiento del gen de c&#xE1;ncer, los genes afectados por eventos de baja frecuencia se pasan por alto. El enfoque integrador de analizar las dimensiones paralelas ha permitido la identificaci&#xF3;n de: (a) los genes que son a menudo interrumpidos por m&#xFA;ltiples mecanismos, pero en las frecuencias bajas por cualquier mecanismo de uno y (b) Las v&#xED;as que a menudo se interrumpe en varios componentes, pero en las bajas frecuencias en los componentes individuales . Estos beneficios de utilizar un enfoque integrador ilustrar el concepto de que el conjunto es mayor que la suma de sus partes. Mientras que los esfuerzos se han convertido ahora en favor de enfoques multidimensionales paralelas e integrador para el estudio del paisaje del genoma del c&#xE1;ncer con la esperanza de obtener una comprensi&#xF3;n m&#xE1;s perspicaz de los genes y las v&#xED;as principales de conducci&#xF3;n c&#xE9;lulas cancerosas, esta revisi&#xF3;n se describen las principales conclusiones de la difusi&#xF3;n de este tipo de alto rendimiento, an&#xE1;lisis de integraci&#xF3;n, incluidas las contribuciones a nuestra comprensi&#xF3;n de los fen&#xF3;menos gen&#xE9;ticos causantes de la biolog&#xED;a de las c&#xE9;lulas cancerosas.

La integraci&#xF3;n de las m&#xFA;ltiples dimensiones de paisajes gen&#xF3;micas y epigen&#xF3;micas de c&#xE1;ncer

&#x975E;&#x5C0F;&#x7EC6;&#x80DE;&#x80BA;&#x764C; &#xFF08;&#x975E;&#x5C0F;&#x7EC6;&#x80DE;&#x80BA;&#x764C;&#xFF09; &#x5C06;&#x663E;&#x793A;&#x4E3A;&#x9010;&#x6B65;&#x8DE8;&#x8D8A;&#x764C;&#x524D;&#x75C5;&#x53D8;&#x3001; &#x6D78;&#x6DA6;&#x524D;&#x3001; &#x5C40;&#x90E8;&#x4FB5;&#x88AD;&#x6027;&#xFF0C;&#x548C;&#x8F6C;&#x79FB;&#x6027;&#x75C5;&#x53D8;&#x7684;&#x75BE;&#x75C5;&#x3002;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x901A;&#x8DEF;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5206;&#x9636;&#x6BB5;&#x9010;&#x6B65;&#x548C;&#x95ED;&#x5408;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x4E0E;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x8DEF;&#x5F84;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x53CD;&#x5149;&#x6807;&#x8BC6;&#x53EF;&#x4EE5;&#x60F3;&#x8C61;&#x5C06;&#x4F1A;&#x52A0;&#x5F3A;&#x5BF9;&#x8FD9;&#x79CD;&#x7834;&#x574F;&#x6027;&#x75BE;&#x75C5;&#x7684;&#x6CBB;&#x7597;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;

&#x914D;&#x7F6E;&#x6587;&#x4EF6;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x7684;&#x539F;&#x4F4D;&#x764C;&#x548C;&#x4FB5;&#x88AD;&#x6027;&#x975E;&#x5C0F;&#x7EC6;&#x80DE;&#x80BA;&#x764C;&#x6240;&#x663E;&#x793A;&#x7684;&#x5723;&#x4EBA;&#x3002;

Non-small cell lung cancer (NSCLC) presents as a progressive disease spanning precancerous, preinvasive, locally invasive, and metastatic lesions. Identification of biological pathways reflective of these progressive stages, and aberrantly expressed genes associated with these pathways, would conceivably enhance therapeutic approaches to this devastating disease.

Transcriptome profiles of carcinoma-in-situ and invasive non-small cell lung cancer as revealed by SAGE.

Non-small cell lung cancer (NSCLC) pr&#xE9;sente comme une maladie progressive s&#x26;#39;&#xE9;tendant sur pr&#xE9;canc&#xE9;reuses, pr&#xE9;invasives, des l&#xE9;sions localement invasives, et m&#xE9;tastatique. Identification des fili&#xE8;res biologiques r&#xE9;fl&#xE9;chissantes de ces &#xE9;tapes progressives, et des g&#xE8;nes exprim&#xE9;s de mani&#xE8;re aberrante associ&#xE9;s &#xE0; ces voies, serait concevable d&#x26;#39;am&#xE9;liorer les approches th&#xE9;rapeutiques &#xE0; cette maladie d&#xE9;vastatrice.

Profils du transcriptome de carcinome in situ et non invasive-Small Cell Lung Cancer Comme l&#x26;#39;a r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9; par le SAGE

Nicht-kleinzelliger Lungenkrebs (NSCLC) pr&auml;sentiert sich als eine progressive Krankheit, spanning pr&auml;kanzer&ouml;sen, preinvasive, lokal invasive und metastasiertem L&auml;sionen. Identifizierung von biologischen Bahnen dieser schrittweise und abnorm exprimierten Genen verbunden mit diesen wegen, reflektierende w&auml;re denkbar therapeutische Ans&auml;tze zu dieser verheerenden Krankheit verbessern.

Transkriptom-Profile von Karzinom-in-Situ und invasiven nicht-kleinzelligem Lungenkrebs wie von SAGE offenbart.

Cancro del polmone non a piccole cellule (NSCLC) si presenta come una malattia progressiva che abbracciano le lesioni precancerose, preinvasive, localmente invasive e metastatiche. Identificazione di percorsi biologici riflettente di questi stadi progressivi e geni espressi in modo anomalo associati a questi percorsi, avrebbe plausibilmente migliorare approcci terapeutici a questa malattia devastante.

Profili transcriptome del cancro del polmone non a piccole cellule di carcinoma in situ e invasivi come rivelato da SAGE.

&#x975E;&#x5C0F;&#x7D30;&#x80DE;&#x80BA;&#x764C;&#xFF08;NSCLC&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x524D;&#x764C;&#x3001;&#x4E0A;&#x76AE;&#x5185;&#x3001;&#x5C40;&#x6240;&#x6D78;&#x6F64;&#x3001;&#x8EE2;&#x79FB;&#x6027;&#x75C5;&#x5909;&#x304C;&#x53CA;&#x3076;&#x9032;&#x884C;&#x6027;&#x75BE;&#x60A3;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x73FE;&#x308C;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x9032;&#x6B69;&#x7684;&#x306A;&#x6BB5;&#x968E;&#x306E;&#x53CD;&#x5C04;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3068;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x7570;&#x5E38;&#x306B;&#x767A;&#x73FE;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x306F;&#x3001;&#x591A;&#x5206;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x7834;&#x58CA;&#x7684;&#x306A;&#x75C5;&#x6C17;&#x3078;&#x306E;&#x6CBB;&#x7642;&#x7684;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3092;&#x9AD8;&#x3081;&#x308B;&#x3067;&#x3042;&#x308D;&#x3046;&#x3002;

SAGE&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x764C;&#x306E;in-situ&#x3068;&#x4FB5;&#x8972;&#x6027;&#x975E;&#x5C0F;&#x7D30;&#x80DE;&#x80BA;&#x764C;&#x306E;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;

&#xBE44; &#xC791;&#xC740; &#xC138;&#xD3EC; &#xD3D0;&#xC554; (NSCLC) &#xC9C4;&#xBCF4;&#xC801;&#xC778; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xAC78;&#xCE5C; &#xC804; &#xC554;, preinvasive, &#xB85C;&#xCEEC; &#xCE68;&#xB7B5;&#xACFC; &#xC804;&#xC774;&#xC131; &#xBCD1; &#xBCC0;&#xC73C;&#xB85C; &#xC120;&#xBB3C; &#xD55C;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC9C4;&#xBCF4;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC640; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xACBD;&#xB85C;&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; aberrantly &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xBC18;&#xC0AC; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559; &#xD1B5;&#xB85C;&#xC758; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xC774; &#xCE58;&#xBA85;&#xC801;&#xC778; &#xC9C8;&#xBCD1;&#xC5D0; &#xCE58;&#xB8CC; &#xC811;&#xADFC; &#xAC15;&#xD654; &#xC54C;&#xB9CC; &#xD588;&#xB2E4;.

&#xC138;&#xC774; &#xC9C0;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xBC1D;&#xD600; &#xC554; &#xB77C; &#xD558; &#xACE0; &#xCE68;&#xB7B5; &#xC801; &#xBE44; &#xC791;&#xC740; &#xC138;&#xD3EC; &#xD3D0;&#xC554;&#xC758; Transcriptome &#xD504;&#xB85C;&#xD544;.

El c&#xE1;ncer no microc&#xED;tico de pulm&#xF3;n (NSCLC) se presenta como una enfermedad progresiva que abarca precancerosas, lesiones preinvasoras, localmente invasivos y metast&#xE1;sicos. La identificaci&#xF3;n de las v&#xED;as biol&#xF3;gicas que reflejan estas etapas progresivas, y los genes asociados con la expresan de forma aberrante de estas v&#xED;as, posiblemente aumentar&#xED;a los enfoques terap&#xE9;uticos para esta enfermedad devastadora.

Perfiles transcriptome de carcinoma in-situ y no invasivo c&#xE1;ncer de pulm&#xF3;n Seg&#xFA;n lo revelado por SAGE

X &#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x5931;&#x6D3B; (XCI) &#x7684;&#x9274;&#x522B;&#x6807;&#x5FD7;&#x6807;&#x51FA;&#x7684;&#x6D3B;&#x52A8;&#x548C;&#x975E;&#x6D3B;&#x52A8; X &#x7ED3;&#x679C;&#x4E0E;&#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20;&#x7684;&#x4FEE;&#x6539;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC; DNA &#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x3002;&#x7B26;&#x5408;&#x4EE5;&#x524D;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x663E;&#x793A; XCI &#x7684;&#x57FA;&#x56E0; CpG &#x5C9B;&#x542B;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x5927;&#x7EA6; 50%&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x800C;&#x9003;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0; unmethylated &#x5728;&#x7537;&#x5973; XCI &#x6709; unmethylated &#x7684;&#x7537;&#x5973; &#xFF1B;&#x6211;&#x4EEC;&#x5168;&#x7684;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; (DNA &#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x6C89;&#x6DC0;&#xFF09; &#x548C;&#x6709;&#x9488;&#x5BF9;&#x6027;&#x7684;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x7684;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x5206;&#x6790; &#xFF08;&#x7167;&#x6392;&#x80F6;&#x7247; Infinium HumanMethylation27 &#x9635;&#x5217;&#xFF09; &#x663E;&#x793A;&#x6700;&#x5927;&#x7684;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x5DEE;&#x5F02; (D = 0.12&#xFF0C;p &lt; 2.2 E 16&#xFF09; &#x4E4B;&#x95F4;&#x5728; X-&#x8FDE;&#x9501;&#x4E2D;&#x592E;&#x4EBA;&#x6C11;&#x653F;&#x5E9C;&#x7684;&#x7537;&#x6027;&#x548C;&#x5973;&#x6027;&#x8840;&#x6DB2;&#x7FA4;&#x5C9B;&#x5BA3;&#x4F20;&#x5458;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x4F7F;&#x7528;&#x7537;&#x6027;&#x548C;&#x5973;&#x6027;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x9884;&#x6D4B; XCI &#x72B6;&#x6001;&#x8840;&#x548C;&#x53D1;&#x73B0; 81%&#x6709;&#x76F8;&#x540C;&#x7684; XCI &#x5730;&#x4F4D;&#x6B63;&#x5982;&#x5148;&#x524D;&#x4F7F;&#x7528;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x6570;&#x636E;&#x786E;&#x5B9A;&#x3002;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x57FA;&#x56E0; (83%) &#x663E;&#x793A;&#x76F8;&#x540C;&#x7684; XCI &#x5730;&#x4F4D;&#x8DE8;&#x7EC4;&#x7EC7; (&#x8840;&#x6DB2;&#x3001; &#x80CE;&#x513F;&#xFF1A; &#x808C;&#x8089;&#x3001; &#x80BE;&#x3001; &#x795E;&#x7ECF;&#xFF09; &#xFF1B; &#x4F46;&#x662F;&#xFF0C;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5B50;&#x96C6;&#x9884;&#x6D4B;&#x5728;&#x4E0D;&#x540C;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x4E2D;&#x7684;&#x4E0D;&#x540C; XCI &#x72B6;&#x6001;&#x3002;&#x4F7F;&#x7528;&#x4EE5;&#x524D;&#x53D1;&#x5E03;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x6570;&#x636E;&#x8F6C;&#x5F55;&#x57FA;&#x56E0;&#x4F53;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x6C34;&#x5E73;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x8C03;&#x67E5;&#x548C;&#x867D;&#x7136; X-&#x8FDE;&#x9501;&#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x7684;&#x9AD8;&#x8868;&#x8FBE;&#x57FA;&#x56E0;&#x66F4;&#x6BD4;&#x4F4E;&#x8868;&#x8FBE;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x3001; exonic &#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x6CA1;&#x6709;&#x4E0D;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x6C34;&#x5E73;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5F97;&#x51FA;&#x7684;&#x7ED3;&#x8BBA; XCI &#x72B6;&#x6001;&#x9884;&#x6D4B;&#x4F7F;&#x7528; CpG &#x5C9B;&#x7684;&#x7532;&#x57FA;&#x5316; X-&#x8FDE;&#x9501;&#x7684;&#x521B;&#x529E;&#x4EBA;&#x901A;&#x5E38;&#x662F;&#x7531;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x5206;&#x6790;&#x786E;&#x5B9A;&#x76F8;&#x540C;&#x548C; 12%&#x7684; X &#x8FDE;&#x9501;&#x57FA;&#x56E0;&#x68C0;&#x67E5;&#x663E;&#x793A; XCI &#x7EC4;&#x7EC7;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x57FA;&#x56E0;&#x4E2D;&#x81F3;&#x5C11;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5BA1;&#x67E5;&#x7684;&#x56DB;&#x4E2A;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x5177;&#x6709;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684; XCI &#x72B6;&#x6001;&#x7684;&#x89C4;&#x5B9A;&#x3002;

&#x5168;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x7684; DNA &#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x5206;&#x6790;&#x9884;&#x6D4B;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x7279;&#x5F02;&#x6027; X &#x706D;&#x6D3B;&#x3002;

X-chromosome inactivation (XCI) results in the differential marking of the active and inactive X with epigenetic modifications including DNA methylation. Consistent with the previous studies showing that CpG island-containing promoters of genes subject to XCI are approximately 50% methylated in females and unmethylated in males while genes which escape XCI are unmethylated in both sexes; our chromosome-wide (Methylated DNA ImmunoPrecipitation) and promoter-targeted methylation analyses (Illumina Infinium HumanMethylation27 array) showed the largest methylation difference (DÂ =Â 0.12, pÂ <Â 2.2 E-16) between male and female blood at X-linked CpG islands promoters. We used the methylation differences between males and females to predict XCI statuses in blood and found that 81% had the same XCI status as previously determined using expression data. Most genes (83%) showed the same XCI status across tissues (blood, fetal: muscle, kidney and nerual); however, the methylation of a subset of genes predicted different XCI statuses in different tissues. Using previously published expression data the effect of transcription on gene-body methylation was investigated and while X-linked introns of highly expressed genes were more methylated than the introns of lowly expressed genes, exonic methylation did not differ based on expression level. We conclude that the XCI status predicted using methylation of X-linked promoters with CpG islands was usually the same as determined by expression analysis and that 12% of X-linked genes examined show tissue-specific XCI whereby a gene has a different XCI status in at least one of the four tissues examined.

Chromosome-wide DNA methylation analysis predicts human tissue-specific X inactivation.

Inactivation du chromosome X (XCI) les r&#xE9;sultats dans le diff&#xE9;rentiel de marquage des X actifs et inactifs avec les modifications &#xE9;pig&#xE9;n&#xE9;tiques m&#xE9;thylation de l&#x26;#39;ADN, y compris. Conform&#xE9;ment aux &#xE9;tudes pr&#xE9;c&#xE9;dentes montrant que l&#x26;#39;&#xEE;le contenant CpG des promoteurs de g&#xE8;nes soumis &#xE0; XCI sont environ 50% m&#xE9;thyl&#xE9; chez les femelles et les m&#xE2;les non m&#xE9;thyl&#xE9; dans alors que les g&#xE8;nes qui &#xE9;chappent XCI sont non m&#xE9;thyl&#xE9; dans les deux sexes; notre chromosome entier (ImmunoPr&#xE9;cipitation ADN m&#xE9;thyl&#xE9;) et le promoteur des analyses cibl&#xE9;es m&#xE9;thylation (Illumina Infinium HumanMethylation27 tableau) a montr&#xE9; la plus grande diff&#xE9;rence de m&#xE9;thylation (D = 0,12, p &#x26;lt;2,2 E-16) entre le sang des hommes et des femmes &#xE0; la X-li&#xE9;s promoteurs &#xEE;lots CpG. Nous avons utilis&#xE9; les diff&#xE9;rences de m&#xE9;thylation entre les hommes et les femmes de pr&#xE9;dire statuts XCI dans le sang et a constat&#xE9; que 81% avaient le m&#xEA;me statut XCI comme pr&#xE9;c&#xE9;demment d&#xE9;termin&#xE9;e &#xE0; l&#x26;#39;aide des donn&#xE9;es d&#x26;#39;expression. La plupart des g&#xE8;nes (83%) ont montr&#xE9; le m&#xEA;me statut XCI &#xE0; travers des tissus (sang, du foetus: les muscles, les reins et nerual); cependant, la m&#xE9;thylation d&#x26;#39;une partie de g&#xE8;nes diff&#xE9;rents statuts pr&#xE9;dit XCI dans diff&#xE9;rents tissus. En utilisant les donn&#xE9;es d&#x26;#39;expression publi&#xE9;es pr&#xE9;c&#xE9;demment l&#x26;#39;effet de la transcription sur le g&#xE8;ne du corps m&#xE9;thylation a &#xE9;t&#xE9; &#xE9;tudi&#xE9;e et tout en introns X-li&#xE9;s de g&#xE8;nes fortement exprim&#xE9;s &#xE9;taient plus m&#xE9;thyl&#xE9; que les introns de g&#xE8;nes exprim&#xE9;s humbles, la m&#xE9;thylation exonique ne diff&#xE8;rent pas en fonction du niveau d&#x26;#39;expression. Nous concluons que le statut XCI pr&#xE9;dite &#xE0; l&#x26;#39;aide de m&#xE9;thylation de promoteurs li&#xE9;es &#xE0; l&#x26;#39;X avec des &#xEE;lots CpG &#xE9;tait g&#xE9;n&#xE9;ralement le m&#xEA;me que d&#xE9;termin&#xE9;e par analyse de l&#x26;#39;expression et que 12% des X-linked g&#xE8;nes examin&#xE9;s montrent tissu-sp&#xE9;cifique XCI lequel un g&#xE8;ne a un statut diff&#xE9;rent dans XCI au moins un des quatre tissus examin&#xE9;s.

Chromosome-analyse &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;chelle m&#xE9;thylation de l&#x26;#39;ADN humain pr&#xE9;dit inactivation du chromosome X tissu-sp&#xE9;cifique

Wissenschaftlerhaus Inaktivierung (XCI) f&uuml;hrt die differenzielle Kennzeichnung der aktiven und inaktiven X mit epigenetischen Modifikationen einschlie&szlig;lich DNA-Methylierung. Einklang mit der fr&uuml;heren Studien, die zeigen, dass CpG Insel-haltigen Promotoren von Genen unterliegt XCI ca. 50 % methyliert sind in Weibchen und unmethylated in M&auml;nnchen w&auml;hrend der Gene, die entkommen XCI sind bei beiden Geschlechtern unmethylated; Unsere Chromosom-weite (DNA-Immunopr&auml;zipitation methyliert) und Projekttr&auml;ger ausgerichtete Methylierung Analysen (Illumina Infinium HumanMethylation27 Array) zeigte die gr&ouml;&szlig;te Differenz der Methylierung (D = 0,12, p &lt; 2.2 E-16) zwischen m&auml;nnlichen und weiblichen Blutes bei X-chromosomal CpG Inseln Promotoren. Wir verwendet die Methylierung-Unterschiede zwischen M&auml;nnchen und Weibchen zur Vorhersage XCI-Status im Blut und festgestellt, dass 81 % den gleichen XCI-Status mit Ausdruck Daten wie zuvor ermittelt hatte. Die meisten Gene (83 %) zeigte den gleichen XCI-Status &uuml;ber Gewebe (Blut, fetale: Muskel-, Nieren- und Nerual), jedoch die Methylierung von einer Teilmenge von Genen vorhergesagt verschiedene XCI Status in verschiedenen Geweben. Mit zuvor ver&ouml;ffentlichten Ausdruck Daten die Wirkung der Transkription auf Gen-K&ouml;rper-Methylierung wurde untersucht und w&auml;hrend X-chromosomale Introns der hoch ausgedr&uuml;ckt Gene wurden mehr als die Introns gering exprimierten Gene methyliert, exonic Methylierung wich nicht basierend auf Ausdrucksebene ab. Wir schlie&szlig;en, dass der XCI Status voraus &uuml;ber Methylierung der X-chromosomalen F&ouml;rderer mit CpG-Inseln in der Regel war das gleiche wie von Expressionsanalyse bestimmt und 12 % der X-chromosomale Gene untersucht Gewebe-spezifischen XCI zeigen, bei dem ein gen einen anderen XCI-Status in mindestens einem der vier Gewebe untersucht hat.

Chromosom-weite DNA-Methylierungs-Analyse prognostiziert menschlichen Gewebe-spezifischen X Inaktivierung.

Inattivazione del cromosoma x (XCI) comporta la marcatura differenziale dell&#39;attivo e inattivo X con modifiche epigenetiche compresa la metilazione del DNA. Coerente con precedenti studi che dimostrano che CpG island-contenente promotori dei geni soggetti XCI sono circa il 50% metilato in maschi e femmine non metilati nel mentre geni che sfuggono XCI sono non metilato in entrambi i sessi; nostro tutto il cromosoma (immunoprecipitazione di DNA metilato) e analisi mirate promotore metilazione (matrice Illumina Infinium HumanMethylation27) ha mostrato la pi&ugrave; grande differenza di metilazione (D = 0.12, p &lt; 2.2 E-16) tra maschio e femmina sangue presso X-linked CpG islands promotori. Abbiamo usato le differenze di metilazione tra maschi e femmine per prevedere gli status XCI nel sangue e ha trovato che l&#39;81% ha avuto lo stesso status XCI, come precedentemente determinato utilizzando i dati di espressione. La maggior parte dei geni (83%) hanno mostrato lo stesso status XCI attraverso tessuti (sangue fetale: muscolo, rene e nerual); Tuttavia, la metilazione di un sottoinsieme dei geni predetto status XCI differenti nei diversi tessuti. Utilizzando i dati di espressione precedentemente pubblicato &egrave; stato studiato l&#39;effetto della trascrizione su metilazione del gene-corpo e mentre gli introni X-linked di altamente espresso geni erano pi&ugrave; metilati rispetto gli introni dei geni espressi umile, metilazione esonico non differiscono basato sul livello di espressione. Possiamo concludere che lo stato XCI previsto utilizzando la metilazione dei promotori X-linked con isole di CpG di solito era lo stesso come determinato dall&#39;analisi di espressione e che il 12% di geni X-linked esaminati mostrano XCI tessuto-specifici per cui un gene ha un diverso status XCI in almeno uno dei quattro tessuti esaminati.

Analisi di metilazione del DNA cromosoma-wide prevede specifiche del tessuto umano X inattivazione.

DNA&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x4FEE;&#x6B63;&#x3092;&#x52A0;&#x3048;&#x305F;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x200B;&#x200B;&#x30A3;&#x30D6;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x975E;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D6;X&#x306E;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AD;&#x30F3;&#x30B0;&#x5DEE;&#x306E;X&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x4E0D;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#xFF08;XCI&#xFF09;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3002; CpG&#x30A2;&#x30A4;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C9;&#x3092;&#x542B;&#x3080;XCI&#x306E;&#x5BFE;&#x8C61;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306F;&#x3001;XCI&#x3092;&#x9003;&#x308C;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x96CC;&#x96C4;&#x3068;&#x3082;&#x306B;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x9593;&#x3001;&#x96CC;&#x3067;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3057;&#x3001;&#x7537;&#x6027;&#x3067;&#x306F;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x7D04;50&#xFF05;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x5148;&#x884C;&#x7814;&#x7A76;&#x3068;&#x4E00;&#x81F4;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306E;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x30EF;&#x30A4;&#x30C9;&#xFF08;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;DNA&#x514D;&#x75AB;&#x6C88;&#x964D;&#xFF09;&#x3068;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x6A19;&#x7684;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x5206;&#x6790;&#xFF08;&#x30A4;&#x30EB;&#x30DF;&#x30CA;&#x306E;Infinium HumanMethylation27&#x914D;&#x5217;&#xFF09;&#x306F;&#x3001;X&#x9023;&#x9396;&#x6027;CpG&#x30A2;&#x30A4;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C9;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3067;&#x3001;&#x7537;&#x6027;&#x3068;&#x5973;&#x6027;&#x306E;&#x8840;&#x6DB2;&#x3068;&#x306E;&#x9593;&#x306E;&#x6700;&#x5927;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x5DEE;&#xFF08;D = 0.12&#x3001;P &#x26;lt;2.2 E-16&#xFF09;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x8840;&#x6DB2;&#x4E2D;&#x306B;XCI&#x306E;&#x72B6;&#x614B;&#x3092;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x7537;&#x6027;&#x3068;&#x5973;&#x6027;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x9055;&#x3044;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3001;81&#xFF05;&#x304C;&#x4EE5;&#x524D;&#x306B;&#x767A;&#x73FE;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x3066;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x306E;&#x3068;&#x540C;&#x3058;XCI&#x306E;&#x30B9;&#x30C6;&#x30FC;&#x30BF;&#x30B9;&#x3092;&#x6301;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x5206;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#xFF08;83&#xFF05;&#xFF09;&#x306F;&#x7D44;&#x7E54;&#x5168;&#x4F53;&#x3067;&#x540C;&#x3058;XCI&#x306E;&#x72B6;&#x614B;&#xFF08;&#x80CE;&#x5150;&#x306E;&#x8840;&#xFF1A;&#x7B4B;&#x8089;&#x3001;&#x814E;&#x81D3;&#x3001;nerual&#xFF09;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30B5;&#x30D6;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306F;&#x3001;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x7D44;&#x7E54;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;XCI&#x306E;&#x72B6;&#x614B;&#x3092;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x4EE5;&#x524D;&#x306B;&#x767A;&#x884C;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x767A;&#x73FE;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x3066;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x672C;&#x4F53;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3067;&#x8EE2;&#x5199;&#x306E;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x8ABF;&#x67FB;&#x3057;&#x3001;&#x9AD8;&#x767A;&#x73FE;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;X&#x9023;&#x9396;&#x6027;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x306F;&#x5351;&#x3057;&#x3044;&#x767A;&#x73FE;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x3088;&#x308A;&#x3082;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x9593;&#x3001;&#x30A8;&#x30AF;&#x30BD;&#x30F3;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306F;&#x767A;&#x73FE;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x5DEE;&#x306F;&#x8A8D;&#x3081;&#x3089;&#x308C;&#x306A;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x767A;&#x73FE;&#x89E3;&#x6790;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;XCI&#x306E;&#x30B9;&#x30C6;&#x30FC;&#x30BF;&#x30B9;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;X&#x9023;&#x9396;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;12&#xFF05;&#x304C;&#x7D44;&#x7E54;&#x7279;&#x7570;&#x7684;XCI&#x30B7;&#x30E7;&#x30FC;&#x3092;&#x8ABF;&#x3079;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3068;&#x901A;&#x5E38;&#x306F;&#x540C;&#x3058;&#x3067;&#x3057;&#x305F;XCI&#x306E;&#x72B6;&#x614B;&#x306F;CpG&#x30A2;&#x30A4;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C9;&#x3068;X&#x9023;&#x9396;&#x6027;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3068;&#x7D50;&#x8AD6;4&#x7D44;&#x7E54;&#x306E;&#x5C11;&#x306A;&#x304F;&#x3068;&#x3082;&#x4E00;&#x3064;&#x306F;&#x3001;&#x691C;&#x8A0E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;DNA&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x89E3;&#x6790;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x7D44;&#x7E54;&#x56FA;&#x6709;&#x306E;X&#x4E0D;&#x6D3B;&#x5316;&#x3092;&#x4E88;&#x6E2C;

X &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xBE44;&#xD65C;&#xC131;&#xD654; (XCI) &#xD65C;&#xC131; &#xBC0F; &#xBE44;&#xD65C;&#xC131; X&#xC758; &#xCC28;&#xB3D9; &#xB9C8;&#xD0B9; epigenetic &#xC218;&#xC815; DNA &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD55C; &#xACB0;&#xACFC;. XCI &#xB300;&#xC0C1; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; CpG &#xC12C; &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC740; &#xC57D; 50% &#xAC20; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC8FC;&#xB294; &#xC774;&#xC804;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC640; &#xC77C;&#xCE58; &#xC131;&#xACFC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD0C8;&#xCD9C; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548;&#xC5D0; unmethylated &#xB0A8;&#xC131; XCI &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; methylated &#xB0A8;&#xB140;;&#xC5D0; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC804;&#xCCB4; (DNA ImmunoPrecipitation &#xAC20;) &#xBC0F; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC744; &#xB300;&#xC0C1; &#xD55C; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xBD84;&#xC11D; (Illumina Infinium HumanMethylation27 &#xBC30;&#xC5F4;) &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC900; &#xAC00;&#xC7A5; &#xD070; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xCC28;&#xC774; (D = 0.12, p &lt; 2.2 E 16) &#xC81C;&#xB3C4; &#xD504;&#xB85C;&#xBAA8;&#xD130; CpG X &#xC5F0;&#xACB0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB0A8;&#xC131;&#xACFC; &#xC5EC;&#xC131;&#xC758; &#xD608;&#xC561; &#xC0AC;&#xC774;. &#xC218; &#xCEF7;&#xACFC; &#xC554;&#xCEF7;&#xC758; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xCC28;&#xC774;&#xC810; &#xD53C;&#xC5D0;&#xC11C; XCI &#xC0C1;&#xD0DC;&#xB97C; &#xC608;&#xCE21; &#xD558; &#xACE0; 81% &#xB3D9;&#xC77C;&#xD55C; XCI &#xC0C1;&#xD0DC; &#xC2DD; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xACB0;&#xC815; &#xD588;&#xB2E4;&#xB294; &#xBC1C;&#xACAC;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790; (83%) &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCCD0; &#xB3D9;&#xC77C;&#xD55C; XCI &#xC0C1;&#xD0DC;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4; (&#xD0DC;&#xC544; &#xD608;&#xC561;: &#xADFC;&#xC721;, &#xC2E0;&#xC7A5; &#xBC0F; nerual); &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC;, &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xBD80;&#xBD84; &#xC9D1;&#xD569;&#xC758; &#xC11C;&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2E4;&#xB978; XCI &#xC0C1;&#xD0DC; &#xC608;&#xCE21;. &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xAC8C;&#xC2DC; &#xB41C; &#xC2DD; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC804;&#xC0AC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBAB8; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654;&#xC5D0; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xC870;&#xC0AC;&#xC640;&#xC758; introns X &#xC5F0;&#xACB0; &#xB192;&#xC740; &#xD45C;&#xD604; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xBBF8; &#xCC9C; &#xD55C; &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; introns &#xAC20; &#xB354; &#xD588;&#xB2E4;, exonic &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xC2DD; &#xC218;&#xC900;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xB2E4;&#xB985;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC558;&#xB2E4;. XCI &#xC0C1;&#xD0DC; &#xC608;&#xCE21; CpG &#xC12C; &#xBA54; &#xD2F8; X &#xC5F0;&#xACB0; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC758;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xB3D9;&#xC77C; &#xC2DD; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xACB0;&#xC815; &#xB418;&#xB294; &#xACE0; X &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAC80;&#xC0AC;&#xC758; 12%&#xC5D0; 4 &#xAC1C;&#xC758; &#xC870;&#xC9C1; &#xAC80;&#xC0AC;&#xC758; &#xD558;&#xB098;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB294; &#xB2E4;&#xB978; XCI &#xC0C1;&#xD0DC; &#xADF8;&#xAC83;&#xC5D0; &#xC758;&#xD558;&#xC5EC; &#xC870;&#xC9C1; &#xAD00;&#xB828; XCI &#xD45C;&#xC2DC; &#xB9C8;&#xC9C0;&#xB9C9; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC804;&#xCCB4;&#xC758; DNA &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xBD84;&#xC11D; &#xC608;&#xCE21; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC870;&#xC9C1; &#xAD00;&#xB828; &#xBE44;&#xD65C;&#xC131;&#xD654; X.

Inactivaci&#xF3;n del cromosoma X (XCI) resulta en el diferencial de calificaci&#xF3;n de las X activas e inactivas, con las modificaciones epigen&#xE9;ticas como la metilaci&#xF3;n del ADN. De acuerdo con los estudios anteriores que muestran que las islas CpG que contienen promotores de genes sujetos a XCI son aproximadamente el 50% en las mujeres y metilado unmethylated en hombres, mientras que los genes que escapan a XCI no est&#xE1;n metilados en ambos sexos, nuestra gama de cromosomas (Inmunoprecipitaci&#xF3;n ADN metilado) y el promotor los an&#xE1;lisis espec&#xED;ficos de metilaci&#xF3;n (Illumina Infinium HumanMethylation27 matriz) mostr&#xF3; la mayor diferencia de metilaci&#xF3;n (D = 0,12, p &#x26;lt;2.2 E-16) entre la sangre masculina y femenina en el X-ligados promotores islas CpG. Se utilizaron las diferencias de metilaci&#xF3;n entre machos y hembras para predecir estados XCI en la sangre y se encontr&#xF3; que el 81% ten&#xED;an el mismo estatus de XCI como ya se ha determinado utilizando los datos de expresi&#xF3;n. La mayor&#xED;a de los genes (83%) mostr&#xF3; el mismo estado XCI trav&#xE9;s de los tejidos (sangre, del feto: los m&#xFA;sculos, los ri&#xF1;ones y nerual), sin embargo, la metilaci&#xF3;n de un subconjunto de genes predice los diferentes estados de XCI en diferentes tejidos. Usando los datos publicados anteriormente de expresi&#xF3;n el efecto de la metilaci&#xF3;n de genes de transcripci&#xF3;n en el cuerpo fue investigado y al mismo tiempo intrones ligadas al cromosoma X de los genes altamente expresados &#x200B;&#x200B;eran m&#xE1;s metilado que los intrones de los genes expresados &#x200B;&#x200B;humildes, la metilaci&#xF3;n exonic no fue diferente seg&#xFA;n el nivel de expresi&#xF3;n. Llegamos a la conclusi&#xF3;n de que el estado XCI predecirse mediante la metilaci&#xF3;n de promotores ligados al cromosoma X, con las islas CpG era generalmente el mismo que el establecido por el an&#xE1;lisis de expresi&#xF3;n y que el 12% de los genes ligados al X examinados muestran tejido-espec&#xED;fica XCI por el cual un gen tiene un diferente estado de XCI en al menos uno de los cuatro tejidos examinados.

Cromosoma en todo el an&#xE1;lisis de metilaci&#xF3;n del ADN predice tejido humano espec&#xED;fico de inactivaci&#xF3;n del cromosoma X

Kappa &#x8F7B;&#x591A;&#x80BD;&#x57FA;&#x56E0;&#x589E;&#x5F3A; B &#x7EC6;&#x80DE;&#x6FC0;&#x9176; &beta; (IKBKB) (IKK-&beta;/IKK-2&#xFF09;&#xFF0C;&#x6FC0;&#x6D3B; NF-&kappa; B&#xFF0C;&#x662F; KEAP1-CUL3-RBX1 E3-&#x6CDB;&#x7D20;&#x8FDE;&#x63A5;&#x9176;&#x590D;&#x5408;&#x7269;&#x7684;&#x886C;&#x5E95;&#xFF0C;&#x7275;&#x8FDE;&#x8FD9;&#x590D;&#x6742;&#x7684; NF-&kappa; B &#x901A;&#x8DEF;&#x8C03;&#x63A7;&#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x5242;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8C03;&#x67E5; NF-&kappa; B &#x6D3B;&#x5316;&#x7684;&#x975E;&#x5C0F;&#x7EC6;&#x80DE;&#x80BA;&#x764C;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E00;&#x79CD;&#x65B0;&#x578B;&#x7684;&#x9057;&#x4F20;&#x673A;&#x5236;&#x590D;&#x6742;&#x7EC4;&#x4EF6;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x4E2D;&#x65AD;&#x3002;

KEAP1/CUL3 E3 &#x6CDB;&#x7D20;&#x8FDE;&#x63A5;&#x9176;&#x6210;&#x5206;&#x590D;&#x6742;&#x7684;&#x9057;&#x4F20;&#x4E2D;&#x65AD;&#x662F; NF &#x6D3B;&#x5316;&#x901A;&#x8DEF;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x5728;&#x80BA;&#x764C;&#x4E2D;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5173;&#x952E;&#x673A;&#x5236;&#x3002;

Inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase beta (IKBKB) (IKK-Î²/IKK-2), which activates NF-ÎºB, is a substrate of the KEAP1-CUL3-RBX1 E3-ubiquitin ligase complex, implicating this complex in NF-ÎºB pathway regulation. We investigated complex component gene disruption as a novel genetic mechanism of NF-ÎºB activation in non-small cell lung cancer.

Genetic disruption of KEAP1/CUL3 E3 ubiquitin ligase complex components is a key mechanism of NF-kappaB pathway activation in lung cancer.

Inhibiteur de la l&#xE9;g&#xE8;re kappa polypeptide activateur du g&#xE8;ne dans les cellules B, la kinase b&#xEA;ta (IKBKB) (IKK-&#x3B2;/IKK-2), qui active NF-kB, est un substrat du complexe Keap1-CUL3-RBX1 E3-ubiquitine ligase, impliquant ce complexe dans la r&#xE9;gulation de la voie NF-kB. Nous avons &#xE9;tudi&#xE9; complexe disruption g&#xE9;nique composant en tant que nouveau m&#xE9;canisme g&#xE9;n&#xE9;tique de l&#x26;#39;activation de NF-kB dans les non-small cell lung cancer.

Perturbation de la g&#xE9;n&#xE9;tique KEAP1/CUL3 E3 ubiquitine ligase composants complexes est un m&#xE9;canisme cl&#xE9; de activation de la voie NF-kappaB dans le cancer du poumon

Inhibitor von Kappa leichte Polypeptid gen Enhancer in B-Zellen, Kinase Beta (IKBKB) (IKK-&beta;/IKK-2), die NF-&kappa;B aktiviert, ist ein Substrat des KEAP1-CUL3-RBX1 E3-Ubiquitin Ligase-komplexes, zielbewu&szlig;t Komplex in NF-&kappa;B-Signalweg-Verordnung. Wir untersuchten komplexes Bauteil gen St&ouml;rung als neuartige genetische Mechanismus der NF-&kappa;B Aktivierung bei nicht-kleinzelligem Lungenkrebs.

Genetische St&ouml;rung KEAP1/CUL3 E3 Ubiquitin Ligase komplexer Bauteile ist ein wichtiges Instrument der NF-KappaB-Signalweg-Aktivierung bei Lungenkrebs.

Inibitore di kappa polipeptide leggero gene enhancer in cellule B, beta chinasi (IKBKB) (IKK-&beta;/IKK-2), che attiva il NF-&kappa;B, &egrave; un substrato del complesso KEAP1-CUL3-RBX1 E3-ubiquitina ligasi, implicando questo complesso nel regolamento pathway NF-&kappa;B. Abbiamo studiato la rottura del gene componente complessa come un romanzo meccanismo genetico dell&#39;attivazione di NF-&kappa;B nel carcinoma polmonare non a piccole cellule.

Disturbo genetico di componenti complessi KEAP1/CUL3 E3 ubiquitina ligasi &egrave; un meccanismo chiave di attivazione di pathway NF-kappaB nel cancro del polmone.

&#x3BA;&#x8EFD;&#x30DD;&#x30EA;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30A8;&#x30F3;&#x30CF;&#x30F3;&#x30B5;&#x30FC;&#x306E;&#x963B;&#x5BB3;&#x5264;&#x306F;&#x3001;B&#x7D30;&#x80DE;&#x3067;&#x306F;&#x3001;NF-&#x3BA;B&#x3092;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x3059;&#x308B;&#x30AD;&#x30CA;&#x30FC;&#x30BC;&#x3B2;&#xFF08;IKBKB&#xFF09;&#xFF08;IKK-&#x3B2;/IKK-2&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x304C;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3057;&#x3001;KEAP1-CUL3-RBX1 E3-&#x30E6;&#x30D3;&#x30AD;&#x30C1;&#x30F3;&#x30EA;&#x30AC;&#x30FC;&#x30BC;&#x8907;&#x5408;&#x4F53;&#x306E;&#x57FA;&#x8CEA;&#x3067;&#x3042;&#x308B;NF-&#x3BA;B&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x3053;&#x306E;&#x8907;&#x96D1;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x975E;&#x5C0F;&#x7D30;&#x80DE;&#x80BA;&#x764C;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;NF-&#x3BA;B&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x306E;&#x65B0;&#x305F;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7834;&#x58CA;&#x3092;&#x691C;&#x8A0E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

KEAP1/CUL3 E3&#x30E6;&#x30D3;&#x30AD;&#x30C1;&#x30F3;&#x30EA;&#x30AC;&#x30FC;&#x30BC;&#x8907;&#x5408;&#x4F53;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7834;&#x58CA;&#x306F;&#x3001;&#x80BA;&#x764C;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;NF-&#x3BA;B&#x306E;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

&#xCE74;&#xD30C; &#xBE5B; polypeptide &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC99D;&#xAC15; B &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; NF-&kappa;B, KEAP1-CUL3-RBX1 E3 &#xC720;&#xBE44;&#xD034;&#xD2F4; &#xB9AC;&#xAC00; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; &#xAE30;&#xD310;, &#xB2C8; &#xBCA0;&#xD0C0; (IKBKB) (IKK-&beta;/IKK-2),&#xC774; &#xB2E8;&#xC9C0; NF &kappa;B &#xD1B5;&#xB85C; &#xADDC;&#xC81C;&#xC5D0; &#xC5F0;&#xB8E8;&#xC758; &#xC5B5;&#xC81C; &#xBB3C;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xC870;&#xC0AC; &#xBE44; &#xC791;&#xC740; &#xC138;&#xD3EC; &#xD3D0;&#xC554;&#xC5D0;&#xC11C; NF &kappa;B &#xD65C;&#xC131;&#xD654;&#xC758; &#xC18C;&#xC124;&#xC744; &#xC720;&#xC804; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC73C;&#xB85C; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC911;&#xB2E8;.

KEAP1/CUL3 E3 &#xC720;&#xBE44;&#xD034;&#xD2F4; &#xB9AC;&#xAC00; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; &#xAD6C;&#xC131;&#xC758; &#xC720;&#xC804; &#xC7A5;&#xC560; &#xD3D0;&#xC554;&#xC5D0;&#xC11C; NF kappaB &#xD1B5;&#xB85C; &#xD65C;&#xC131;&#xD654;&#xC758; &#xD575;&#xC2EC; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998; &#xC774;&#xB2E4;.

Inhibidor de la ligera kappa polip&#xE9;ptido potenciador del gen en las c&#xE9;lulas B, la cinasa beta (IKBKB) (IKK-&#x3B2;/IKK-2), que activa la NF-kB, es un sustrato del complejo Keap1-CUL3 RBX1-E3-ubiquitina ligasa, lo que implica este complejo en la regulaci&#xF3;n de NF-kB. Hemos investigado la interrupci&#xF3;n complejo de genes componente como un nuevo mecanismo gen&#xE9;tico de activaci&#xF3;n de NF-kB en el c&#xE1;ncer no microc&#xED;tico de pulm&#xF3;n de c&#xE9;lulas.

La alteraci&#xF3;n gen&#xE9;tica de los componentes KEAP1/CUL3 E3 ubiquitina ligase complejos es un mecanismo clave de activaci&#xF3;n de la v&#xED;a NF-kappaB en el c&#xE1;ncer de pulm&#xF3;n

Ian M. Wilson

Department of Cancer Genetics and Developmental Biology

BC Cancer Research Centre

Methylated DNA Immunoprecipitation

Ian M. Wilson

.css-o250i3{font-size:18px;font-family:Open Sans,sans-serif;line-height:21.6px;}Department of Cancer Genetics and Developmental Biology

BC Cancer Research Centre

Methylated DNA Immunoprecipitation

Department of Cancer Genetics and Developmental Biology