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Application of MassSQUIRM for Quantitative Measurements of Lysine Demethylase Activity

Recently, epigenetic regulators have been discovered as key players in many different diseases 1-3. As a result, these enzymes are prime targets for small ...

University of Arkansas for Medical Sciences 

&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x540E;&#x4FEE;&#x9970;&#x53C2;&#x4E0E;&#x8C03;&#x8282;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x548C;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x3002;&#x8F6C;&#x5F55;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x90FD;&#x5BCC;&#x542B; K4 trimethylation &#x548C; hyperacetylation &#x5728;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D; H3 N-&#x672B;&#x7AEF;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#xFF0C;&#x535A;&#x58EB;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7684;&#x624B;&#x6307;&#xFF0C;&#x50CF; Yng1 NuA3 &#x6234;&#x7740;&#x5E3D;&#x5B50;&#x590D;&#x6742;&#xFF0C;&#x662F;&#x663E;&#x793A;&#x4EA4;&#x4E92; H3K4me3&#xFF0C;&#x6307;&#x793A;&#x751F;&#x5316; K4 &#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x548C; hyperacetylation &#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x94FE;&#x63A5;&#x3002;&#x901A;&#x8FC7;&#x4F7F;&#x7528;&#x8D28;&#x8C31;&#x6CD5;&#x3001; &#x751F;&#x7269;&#x5316;&#x5B66;&#x3001; &#x548C;&#x6838;&#x78C1;&#x5171;&#x632F;&#x7684;&#x7EC4;&#x5408;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8BE6;&#x7EC6;&#x4ECB;&#x7ECD; Yng1 &#x535A;&#x58EB; H3K4me3 &#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x548C;&#x5728; K14 NuA3 &#x4F9D;&#x8D56;&#x4E59;&#x9170;&#x5316;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x6027;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x82AF;&#x7247;&#x5206;&#x6790;&#x6F14;&#x793A; Yng1 &#x548C; H3K4me3 &#x5728;&#x4F53;&#x5185;&#x5171;&#x7684;&#x5B9A;&#x4F4D;&#x3002;&#x4E2D;&#x65AD;&#x7684; Yng1 K4me3 &#x7ED1;&#x5B9A;&#xFF0C;&#x6539;&#x53D8;&#x4E86; K14ac &#x548C;&#x8F6C;&#x5F55;&#x5728;&#x67D0;&#x4E9B;&#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;&#x4ECE;&#x800C;&#x8868;&#x660E;&#x8FDE;&#x7EED;&#x4E09;&#x7532;&#x57FA;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x3001; &#x4E59;&#x9170;&#x57FA;&#x8F6C;&#x79FB;&#x9176;&#x6D3B;&#x6027;&#x548C; NuA3 &#x57FA;&#x56E0;&#x8C03;&#x8282;&#x4F53;&#x5185;&#x7684;&#x76F4;&#x63A5;&#x8BC1;&#x636E;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x652F;&#x6301;&#x4E00;&#x822C;&#x901A;&#x8FC7;&#x54EA;&#x4E9B;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x4E59;&#x9170;&#x5316;&#x4E0A;&#x6E38;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x6D3B;&#x5316;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x90E8;&#x5206;&#x901A;&#x8FC7; H3K4me3&#xFF0C;&quot;&#x9605;&#x8BFB;&quot;&#xFF0C;&#x9009;&#x62E9;&#x4E9A;&#x57FA;&#x4E2D;&#x7684;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x6A21;&#x5757;&#x7684;&#x53EF;&#x7528;&#x6027;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x673A;&#x5236;&#x3002;

Yng1 &#x535A;&#x58EB;&#x624B;&#x6307;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x5230;&#x5728; K4 H3 trimethylated &#x4FC3;&#x8FDB;&#x6709;&#x9488;&#x5BF9;&#x6027; ORFs &#x5B50;&#x96C6;&#x65F6;&#x8F6C;&#x5F55;&#x548C; K14 H3 NuA3 &#x5E3D;&#x5B50;&#x6D3B;&#x52A8;&#x3002;

Posttranslational histone modifications participate in modulating the structure and function of chromatin. Promoters of transcribed genes are enriched with K4 trimethylation and hyperacetylation on the N-terminal tail of histone H3. Recently, PHD finger proteins, like Yng1 in the NuA3 HAT complex, were shown to interact with H3K4me3, indicating a biochemical link between K4 methylation and hyperacetylation. By using a combination of mass spectrometry, biochemistry, and NMR, we detail the Yng1 PHD-H3K4me3 interaction and the importance of NuA3-dependent acetylation at K14. Furthermore, genome-wide ChIP-Chip analysis demonstrates colocalization of Yng1 and H3K4me3 in vivo. Disrupting the K4me3 binding of Yng1 altered K14ac and transcription at certain genes, thereby demonstrating direct in vivo evidence of sequential trimethyl binding, acetyltransferase activity, and gene regulation by NuA3. Our data support a general mechanism of transcriptional control through which histone acetylation upstream of gene activation is promoted partially through availability of H3K4me3, "read" by binding modules in select subunits.

Yng1 PHD finger binding to H3 trimethylated at K4 promotes NuA3 HAT activity at K14 of H3 and transcription at a subset of targeted ORFs.

Post-traductionnelles des modifications des histones participent &#xE0; la modulation de la structure et la fonction de la chromatine. Promoteurs de g&#xE8;nes transcrits sont enrichies en K4 trim&#xE9;thylation et hyperac&#xE9;tylation sur la queue N-terminale de l&#x26;#39;histone H3. R&#xE9;cemment, prot&#xE9;ines &#xE0; doigts de PHD, comme Yng1 dans le complexe HAT NuA3, ont &#xE9;t&#xE9; montr&#xE9; pour interagir avec H3K4me3, indiquant un lien biochimique entre la m&#xE9;thylation et K4 hyperac&#xE9;tylation. En utilisant une combinaison de spectrom&#xE9;trie de masse, de la biochimie, et la RMN, nous d&#xE9;taillons la Yng1 PHD-H3K4me3 interaction et l&#x26;#39;importance de NuA3-d&#xE9;pendante ac&#xE9;tylation au K14. En outre, l&#x26;#39;&#xE9;chelle du g&#xE9;nome ChIP-Chip analyse d&#xE9;montre colocalisation de Yng1 et H3K4me3 in vivo. Perturber la liaison K4me3 de Yng1 K14ac alt&#xE9;r&#xE9;e et la transcription &#xE0; certains g&#xE8;nes, ce qui d&#xE9;montre directe des preuves in vivo d&#x26;#39;s&#xE9;quentielle trim&#xE9;thyl contraignant, l&#x26;#39;activit&#xE9; ac&#xE9;tyltransf&#xE9;rase, et la r&#xE9;gulation des g&#xE8;nes par NuA3. Nos donn&#xE9;es appuient un m&#xE9;canisme g&#xE9;n&#xE9;ral de contr&#xF4;le transcriptionnel &#xE0; travers lequel l&#x26;#39;ac&#xE9;tylation des histones en amont de l&#x26;#39;activation des g&#xE8;nes est promu en partie gr&#xE2;ce &#xE0; la disponibilit&#xE9; des H3K4me3, &#xAB;lire&#xBB; par des modules de liaison dans les sous-unit&#xE9;s de s&#xE9;lection.

Yng1 PHD Finger liaison &#xE0; H3 trim&#xE9;thyl&#xE9;e &#xE0; K4 Favorise NuA3 activit&#xE9; HAT au K14 de H3 et de transcription &#xE0; un sous-ensemble des ORF cibl&#xE9;es

Posttranslationale Histon-Modifikationen beteiligt Modulation, die Struktur und Funktion des Chromatins. F&ouml;rderer der transkribierten Gene werden mit K4 Trimethylation und Hyperacetylation auf der N-terminalen Schwanz Histon H3 bereichert. K&uuml;rzlich wurden PHD Finger Proteine, wie Yng1 in den NuA3 Hut Komplex, gezeigt f&uuml;r die Interaktion mit H3K4me3, Hinweis auf eine biochemische Verbindung zwischen K4-Methylierung und Hyperacetylation. Durch eine Kombination von Massenspektrometrie, Biochemie und NMR, ausf&uuml;hrlich wir die Yng1 PHD-H3K4me3-Interaktion und die Bedeutung der NuA3-abh&auml;ngige Acetylierung auf K14. Au&szlig;erdem zeigt genomweiten ChIP-Chip-Analyse Kolokalisation von Yng1 und H3K4me3 in-vivo. St&ouml;rung der K4me3-Bindung des Yng1 ver&auml;ndert, K14ac und Transkription am bestimmter Gene damit demonstrieren in-vivo Beweise f&uuml;r eine sequenzielle Trimethyl-Bindung, Acetyltransferase Aktivit&auml;t und Genregulation durch NuA3. Unsere Daten unterst&uuml;tzen einen allgemeinen Mechanismus der transkriptionelle Kontrolle durch die Histon Acetylierung stromaufw&auml;rts der Genaktivierung teilweise durch die Verf&uuml;gbarkeit von H3K4me3, &quot;lesen&quot;, durch die Bindung von Modulen w&auml;hlen Sie Verf&uuml;gbare Unterseiten gef&ouml;rdert wird.

Yng1 PHD Finger Bindung an H3 Trimethylated am K4 f&ouml;rdert NuA3 Hut-Aktivit&auml;t bei K14 H3 und Transkription auf eine Teilmenge der gezielten ORFs.

Le modifiche dell&#39;istone posttranslational partecipano nel modulare la struttura e la funzione della cromatina. Promotori dei geni trascritti sono arricchiti con K4 trimethylation e hyperacetylation sulla coda N-terminale dell&#39;istone H3. Recentemente, proteine dito PHD, come Yng1 nel cappello NuA3 complesso, sono state mostrate per interagire con H3K4me3, che indica un legame biochimico tra metilazione K4 e hyperacetylation. Utilizzando una combinazione di spettrometria di massa, biochimica e NMR, abbiamo in dettaglio l&#39;interazione Yng1 PHD-H3K4me3 e l&#39;importanza di acetilazione NuA3-dipendente presso K14. Inoltre, genome-wide truciolo-truciolo analisi dimostra la presenza di Yng1 e H3K4me3 in vivo. Perturbare l&#39;associazione K4me3 di Yng1 alterati K14ac e trascrizione di alcuni geni, dimostrando quindi prove dirette in vivo della trimetil sequenziale associazione, attivit&agrave; acetiltransferasi e regolazione genica da NuA3. I nostri dati supportano un meccanismo di controllo trascrizionale attraverso cui istone acetilazione a Monte di attivazione genica &egrave; promosso parzialmente attraverso la disponibilit&agrave; di H3K4me3, &quot;leggere&quot; da moduli di associazione nella subunit&agrave; selezionare generale.

Associazione dito Yng1 PHD a H3 trimetilato a K4 promuove attivit&agrave; NuA3 cappello a K14 di H3 e trascrizione a un sottoinsieme di ORFs mirati.

&#x7FFB;&#x8A33;&#x5F8C;&#x4FEE;&#x98FE;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x4FEE;&#x98FE;&#x306F;&#x3001;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x5909;&#x8ABF;&#x69CB;&#x9020;&#x3068;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306B;&#x53C2;&#x52A0;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x8EE2;&#x5199;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;H3&#x306E;N&#x672B;&#x7AEF;&#x5C3E;&#x90E8;&#x306B;K4&#x30C8;&#x30EA;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x3068;&#x904E;&#x5270;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x98FE;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x3001;NuA3 HAT&#x8907;&#x5408;&#x4F53;&#x306E;Yng1&#x3088;&#x3046;&#x306A;PHD&#x30D5;&#x30A3;&#x30F3;&#x30AC;&#x30FC;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306F;&#x3001;K4&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3068;&#x9AD8;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3068;&#x306E;&#x9593;&#x306E;&#x751F;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3001;H3K4me3&#x3068;&#x3084;&#x308A;&#x53D6;&#x308A;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5;&#x3001;&#x751F;&#x5316;&#x5B66;&#x3001;NMR&#x306E;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x8A73;&#x7D30;Yng1 PHD-H3K4me3&#x3068;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3057;&#x3001;K14&#x3067;NuA3&#x4F9D;&#x5B58;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x6027;&#x3092;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30EF;&#x30A4;&#x30C9;&#x306A;ChIP&#x7528;&#x30C1;&#x30C3;&#x30D7;&#x306E;&#x89E3;&#x6790;&#x306F;&#x3001;&#x751F;&#x4F53;&#x5185;&#x3067;Yng1&#x3068;H3K4me3&#x3068;&#x306E;&#x5171;&#x5C40;&#x5728;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;NuA3&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;in vivo&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30E3;&#x30EB;&#x30C8;&#x30EA;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x7D50;&#x5408;&#x3001;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30D5;&#x30A7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x6D3B;&#x6027;&#x306E;&#x8A3C;&#x62E0;&#x306F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306B;&#x76F4;&#x63A5;&#x30C7;&#x30E2;&#x30F3;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3001;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3067;Yng1&#x5909;&#x66F4;&#x3055;&#x308C;&#x305F;K14ac&#x3068;&#x8EE2;&#x5199;&#x306E;K4me3&#x306E;&#x7D50;&#x5408;&#x3092;&#x7834;&#x58CA;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;H3K4me3&#x3068;&#x306E;&#x53EF;&#x7528;&#x6027;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x90E8;&#x5206;&#x7684;&#x306B;&#x63A8;&#x9032;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x4E0A;&#x6D41;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x306E;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x8EE2;&#x5199;&#x5236;&#x5FA1;&#x306E;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306A;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3092;&#x30B5;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x3057;&#x3001;&#x9078;&#x629E;&#x3057;&#x3066;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x7D50;&#x5408;&#x30E2;&#x30B8;&#x30E5;&#x30FC;&#x30EB;&#x3067; &#x26;quot;&#x8AAD;&#x307F;&#x53D6;&#x308A;&#x26;quot;&#x3002;

K4&#x3067;&#x30C8;&#x30EA;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;H3&#x3078;&#x306E;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;Yng1 PHD&#x30D5;&#x30A3;&#x30F3;&#x30AC;&#x30FC;&#x306F;&#x3001;H3&#x306E;K14&#x3067;NuA3 HAT&#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x4FC3;&#x9032;&#x3057;&#x3001;&#x6A19;&#x7684;ORF&#x306E;&#x30B5;&#x30D6;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3067;&#x8EE2;&#x5199;

Posttranslational &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xC218;&#xC815; &#xBCC0;&#xC870; &#xAD6C;&#xC870;&#xC640; chromatin&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC5D0; &#xCC38;&#xC5EC; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBCA0;&#xB080;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD504;&#xB85C;&#xBAA8;&#xD130; K4 trimethylation&#xC640; hyperacetylation H3 &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4;&#xC758; N &#xB9E8;&#xB05D; &#xAF2C;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xB18D;&#xCD95; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCD5C;&#xADFC;, &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C;, NuA3 &#xBAA8;&#xC790;&#xC5D0; Yng1 &#xAC19;&#xC740; &#xBC15;&#xC0AC; &#xC190;&#xAC00;&#xB77D; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; K4 &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654;&#xC640; hyperacetylation &#xC0AC;&#xC774; &#xC0DD; &#xD654; &#xD655; &#xC801;&#xC778; &#xC5F0;&#xACB0;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; H3K4me3, &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D;, &#xC0DD;&#xD654;&#xD559;, NMR&#xC758; &#xC870;&#xD569;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xC138;&#xBD80; Yng1 &#xBC15;&#xC0AC;-H3K4me3 &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xBC0F; NuA3 &#xC885;&#xC18D; acetylation k14&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xC911;&#xC694;&#xC131;. &#xB610;&#xD55C;, &#xAC8C;&#xB188; &#xC804;&#xCCB4; &#xCE69; &#xBD84;&#xC11D; Yng1 &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; vivo&#xC5D0;&#xC11C; h3k4me3&#xC758; colocalization&#xB97C; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. Yng1&#xC758; K4me3 &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xC744; &#xBC29;&#xD574; K14ac &#xBC0F; &#xC804;&#xC0AC; &#xD568;&#xC73C;&#xB85C;&#xC368; &#xC21C;&#xCC28;&#xC801; trimethyl &#xBC14;&#xC778;&#xB529;, acetyltransferase &#xD65C;&#xB3D9;, &#xBC0F; Nua3&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC870;&#xC808;&#xC758; &#xC9C1;&#xC811; vivo&#xC5D0;&#xC11C; &#xC99D;&#xAC70;&#xB97C; &#xC124;&#xBA85; &#xD558;&#xB294; &#xD2B9;&#xC815; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xBCC0;&#xACBD;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB294; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD65C;&#xC131;&#xD654;&#xC758; acetylation &#xC0C1;&#xB958;&#xB294; &#xBD80;&#xBD84;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD1B5;&#xD574; &#xD64D;&#xBCF4; H3K4me3, &quot;&#xC77D;&#xAE30;&quot; &#xC120;&#xD0DD; subunits&#xC5D0; &#xBAA8;&#xB4C8;&#xC5D0; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xD558;&#xC5EC;&#xC758; transcriptional &#xC81C;&#xC5B4;&#xC758; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xC9C0;&#xC6D0; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

K4&#xC5D0;&#xC11C; H3 trimethylated Yng1 &#xBC15;&#xC0AC; &#xC190;&#xAC00;&#xB77D; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xC744; H3 k14&#xC5D0;&#xC11C; NuA3 &#xD587; &#xD65C;&#xB3D9;&#xACFC; &#xD0C0;&#xAC9F;&#xB41C; Orfs&#xC758; &#xD558;&#xC704; &#xC9D1;&#xD569;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC804;&#xC0AC;&#xB97C; &#xCD09;&#xC9C4;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Postraduccionales modificaciones de las histonas participar en la modulaci&#xF3;n de la estructura y funci&#xF3;n de la cromatina. Los promotores de genes transcritos est&#xE1;n enriquecidas con K4 trimethylation y hyperacetylation en la cola N-terminal de la histona H3. Recientemente, las prote&#xED;nas dedo de PHD, como Yng1 en el complejo HAT NuA3, se muestra a interactuar con H3K4me3, lo que indica una relaci&#xF3;n bioqu&#xED;mica entre K4 metilaci&#xF3;n y hiperacetilaci&#xF3;n. Mediante el uso de una combinaci&#xF3;n de espectrometr&#xED;a de masas, la bioqu&#xED;mica y la RMN, se detalla el Yng1 PHD-H3K4me3 la interacci&#xF3;n y la importancia de NuA3 dependiente de la acetilaci&#xF3;n en K14. Por otra parte, en todo el genoma chip-chip an&#xE1;lisis demuestra colocalizaci&#xF3;n de Yng1 y H3K4me3 in vivo. La interrupci&#xF3;n de la uni&#xF3;n de K4me3 Yng1 K14ac alterada y la transcripci&#xF3;n en ciertos genes, lo que demuestra directamente en las pruebas in vivo de la actividad de uni&#xF3;n secuencial de trimetil, acetiltransferasa y la regulaci&#xF3;n de genes por NuA3. Nuestros datos apoyan un mecanismo general de control de la transcripci&#xF3;n a trav&#xE9;s del cual se promueve la acetilaci&#xF3;n de la histona aguas arriba de la activaci&#xF3;n del gen parcialmente a trav&#xE9;s de la disponibilidad de H3K4me3, &#x26;quot;le&#xED;dos&#x26;quot; por los m&#xF3;dulos de uni&#xF3;n en las subunidades de selecci&#xF3;n.

Yng1 dedos PHD uni&#xF3;n a trimetilada H3 en K4 Promueve NuA3 actividad HAT en el K14 de la H3 y la transcripci&#xF3;n en un subconjunto de ORFs dirigidas

Helicases &#x662F;&#x5C55;&#x5F00;&#x53CC;&#x94FE;&#x6838;&#x9178;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x3002;&#x4ECE;&#x566C;&#x83CC;&#x4F53; T4 Dda &#x89E3;&#x65CB;&#x9176;&#x4E00;&#x76F4;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4F18;&#x79C0;&#x6A21;&#x578B;&#x5BF9;&#x4E8E;&#x4E86;&#x89E3;&#x8FD9;&#x4E00;&#x7C7B;&#x9176;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x673A;&#x5236;&#x3002;&#x591A;&#x54C8;&#x53D1;&#x5C55;&#x8BAE;&#x7A0B;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x53EF;&#x80FD;&#x4F1A;&#x53D1;&#x73B0;&#x4E3A;&#x4EC0;&#x4E48;&#x4E00;&#x4E9B; helicases &#x8F6C;&#x79FB;&#x4E2D; 5&#39; &#x5230; 3&#39; &#x65B9;&#x5411;&#x4E0A;&#x7684; DNA&#xFF0C;&#x800C;&#x5176;&#x4ED6;&#x4EBA;&#x5728; 3&#39; &#x5230; 5&#39; &#x65B9;&#x5411;&#x8F6C;&#x79FB;&#x3002;&#x5B9E;&#x73B0;&#x591A;&#x54C8;&#x53D1;&#x5C55;&#x8BAE;&#x7A0B;&#x7684;&#x4E00;&#x79CD;&#x7ED3;&#x6784;&#x8BC1;&#x660E;&#x5F88;&#x96BE;&#xFF0C;&#x56E0;&#x4E3A;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x5931;&#x8D25;&#x5F88;&#x5BB9;&#x6613;&#x5F62;&#x6210;&#x7ED3;&#x6676;&#x548C;&#x5BF9;&#x5F53;&#x524D;&#x7684;&#x6838;&#x78C1;&#x5171;&#x632F;&#x6280;&#x672F;&#x6765;&#x8BF4;&#x592A;&#x5927;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5236;&#x5B9A;&#x4E86;&#x540C;&#x6E90;&#x6027;&#x6A21;&#x578B;&#x7684;&#x8FD9;&#x79CD;&#x9176;&#x5C06;&#x6709;&#x5229;&#x4E8E;&#x6307;&#x5BFC;&#x68C0;&#x67E5; Dda &#x4E0E; DNA &#x548C;&#x8FD9;&#x79CD;&#x4E92;&#x52A8;&#x5982;&#x4F55;&#x5F71;&#x54CD;&#x6613;&#x4F4D;&#x548C;&#x5E73;&#x4ED3;&#x7684; DNA &#x4E4B;&#x95F4;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x548C;&#x529F;&#x80FD;&#x610F;&#x4E49;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5DF2;&#x901A;&#x8FC7;&#x4F7F;&#x7528;&#x65B9;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x7528;&#x4E8E;&#x6620;&#x5C04;&#x86CB;&#x767D;&#x57DF;&#xFF0C;&#x5E76;&#x5BA1;&#x67E5;&#x4E0E; DNA &#x5206;&#x5B50;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8868;&#x9762;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x6A21;&#x578B;&#x3002;

&#x53D1;&#x5C55;&#x548C;&#x8BC4;&#x4EF7;&#x7ED3;&#x6784;&#x6A21;&#x578B;&#x7684;&#x89E3;&#x65CB;&#x9176; SF1B &#x591A;&#x54C8;&#x53D1;&#x5C55;&#x8BAE;&#x7A0B;&#x3002;

Helicases are proteins that unwind double-stranded nucleic acids. Dda helicase from bacteriophage T4 has served as an excellent model for understanding the molecular mechanism of this class of enzymes. Study of the structure of Dda may reveal why some helicases translocate in a 5' to 3' direction on DNA, while others translocate in a 3' to 5' direction. Attaining a structure of Dda has proven difficult because the protein fails to readily form crystals and is too large for current NMR technologies. We have developed a homology model of the enzyme which will serve to guide studies that examine the structural and functional significance of the interaction between Dda and DNA and how this interaction affects translocation and unwinding of DNA. We have tested the structural model by using methods for mapping protein domains and for examining protein surfaces that interact with DNA.

Development and evaluation of a structural model for SF1B helicase Dda.

H&#xE9;licases sont des prot&#xE9;ines qui se d&#xE9;tendre double brin acides nucl&#xE9;iques. Dda h&#xE9;licase du bact&#xE9;riophage T4 a servi comme un excellent mod&#xE8;le pour comprendre le m&#xE9;canisme mol&#xE9;culaire de cette classe d&#x26;#39;enzymes. &#xC9;tude de la structure de Dda peut r&#xE9;v&#xE9;ler pourquoi certaines h&#xE9;licases translocation dans un 5 &#x26;#39;vers 3&#x26;#39; sur l&#x26;#39;ADN, tandis que d&#x26;#39;autres dans une translocation 3 &#x26;#39;vers 5&#x26;#39;. Atteindre une structure de Dda s&#x26;#39;est av&#xE9;r&#xE9; difficile parce que la prot&#xE9;ine ne parvient pas &#xE0; former des cristaux facilement et est trop grande pour les technologies actuelles de RMN. Nous avons d&#xE9;velopp&#xE9; un mod&#xE8;le d&#x26;#39;homologie de l&#x26;#39;enzyme qui servira &#xE0; orienter les &#xE9;tudes qui examinent l&#x26;#39;importance structurelle et fonctionnelle de l&#x26;#39;interaction entre l&#x26;#39;ADN et de Dda et comment cette interaction affecte la translocation et le d&#xE9;roulement de l&#x26;#39;ADN. Nous avons test&#xE9; le mod&#xE8;le structurel en utilisant des m&#xE9;thodes de domaines prot&#xE9;iques de cartographie et d&#x26;#39;examiner la surface des prot&#xE9;ines qui interagissent avec l&#x26;#39;ADN.

D&#xE9;veloppement et &#xE9;valuation d&#x26;#39;un mod&#xE8;le structurel pour les h&#xE9;licase SF1B Dda

Helikasen sind Proteine, die Double-Stranded Nukleins&auml;ure zu entspannen. DDA Helicase aus Bakteriophage T4 diente als ein hervorragendes Modell f&uuml;r das Verst&auml;ndnis der molekularen Mechanismen dieser Klasse von Enzymen. Studie der Struktur der Dda kann zeigen, warum einige Helikasen in eine 5&#39; bis 3&#39; Richtung auf DNA, akkumulieren w&auml;hrend andere in einer 3&#39; bis 5&#39; Richtung akkumulieren. Erreichung einer Struktur der Dda hat schwierig erwiesen, da das Protein nicht bereitwillig Form Kristalle und zu gro&szlig; f&uuml;r aktuelle NMR-Technologien ist. Wir haben eine Homologie-Modell des Enzyms entwickelt, die dazu dienen, Studien zu f&uuml;hren, die die strukturelle und funktionelle Bedeutung der Interaktion zwischen Dda und DNA und ihre Auswirkungen dieser Interaktion Translokation und Abrollen von DNA zu untersuchen. Wir haben das strukturelle Modell getestet, mithilfe von Methoden f&uuml;r die Zuordnung von Protein-Gebiete und f&uuml;r die Pr&uuml;fung von Protein-Oberfl&auml;chen, die mit der DNA interagieren.

Entwicklung und Evaluation eines strukturellen Modells f&uuml;r SF1B Helicase Dda.

Elicasi sono proteine che acidi nucleici double-stranded di rilassarsi. DDA elicasi dal batteriofago T4 ha servito come un eccellente modello per la comprensione del meccanismo molecolare di questa classe di enzimi. Studio della struttura della Dda pu&ograve; rivelare perch&eacute; alcuni elicasi traslocano in un 5&#39; 3&#39; direzione sul DNA, mentre gli altri traslocano nel in un 3&#39;-5&#39; direzione. Conseguimento di una struttura di Dda ha dimostrato difficile perch&eacute; la proteina riesce a cristalli di forma facilmente ed &egrave; troppo grande per le attuali tecnologie di NMR. Abbiamo sviluppato un modello di omologia dell&#39;enzima che servir&agrave; a guidare gli studi che esaminano il significato strutturale e funzionale dell&#39;interazione tra Dda e DNA e come questa interazione influenza la traslocazione e svolgimento del DNA. Abbiamo testato il modello strutturale utilizzando metodi di mappatura domini della proteina e per l&#39;esame di superfici di proteine che interagiscono con il DNA.

Sviluppo e valutazione di un modello strutturale per helicase SF1B Dda.

&#x30D8;&#x30EA;&#x30AB;&#x30FC;&#x30BC;&#x306F;&#x3001;&#x4E8C;&#x672C;&#x9396;&#x6838;&#x9178;&#x3092;&#x30A2;&#x30F3;&#x30EF;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x3059;&#x308B;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002; T4&#x30D0;&#x30AF;&#x30C6;&#x30EA;&#x30AA;&#x30D5;&#x30A1;&#x30FC;&#x30B8;&#x304B;&#x3089;DDA&#x30D8;&#x30EA;&#x30AB;&#x30FC;&#x30BC;&#x306F;&#x3001;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x3053;&#x306E;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x6A5F;&#x69CB;&#x3092;&#x7406;&#x89E3;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x512A;&#x308C;&#x305F;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3092;&#x52D9;&#x3081;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x4ED6;&#x306E;3&#x65B9;&#x5411; &#x26;#39;&#x304B;&#x3089;5&#x26;#39;&#x306B;&#x8EE2;&#x4F4D;&#x3059;&#x308B;&#x4E00;&#x65B9;&#x3001;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x30D8;&#x30EA;&#x30AB;&#x30FC;&#x30BC;&#x306F;&#x3001;DNA&#x4E0A;&#x306E;5&#x65B9;&#x5411; &#x26;#39;&#x304B;&#x3089;3&#x26;#39;&#x306B;&#x8EE2;&#x4F4D;&#x3059;&#x308B;&#x7406;&#x7531;&#x30C9;&#x30FC;&#x30CF;&#x958B;&#x767A;&#x30A2;&#x30B8;&#x30A7;&#x30F3;&#x30C0;&#xFF08;DDA&#xFF09;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x304C;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x306A;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306F;&#x5BB9;&#x6613;&#x306B;&#x7D50;&#x6676;&#x3092;&#x5F62;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5931;&#x6557;&#x3057;&#x3001;&#x73FE;&#x5728;&#x306E;NMR&#x6280;&#x8853;&#x306B;&#x5927;&#x304D;&#x3059;&#x304E;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x3001;&#x30C9;&#x30FC;&#x30CF;&#x958B;&#x767A;&#x30A2;&#x30B8;&#x30A7;&#x30F3;&#x30C0;&#xFF08;DDA&#xFF09;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x3092;&#x9054;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306F;&#x56F0;&#x96E3;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x5224;&#x660E;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;DDA&#x3068;DNA&#x3068;&#x3069;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x3053;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306F;&#x8EE2;&#x306B;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x4E0E;&#x3048;&#x3001;&#x5DFB;&#x304D;&#x623B;&#x3057;DNA&#x306E;&#x9593;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x7684;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x610F;&#x7FA9;&#x3092;&#x691C;&#x8A0E;&#x3059;&#x308B;&#x7814;&#x7A76;&#x3092;&#x6307;&#x5C0E;&#x3059;&#x308B;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x679C;&#x305F;&#x3059;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x30DB;&#x30E2;&#x30ED;&#x30B8;&#x30FC;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3092;&#x958B;&#x767A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x3092;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;DNA&#x3068;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x8868;&#x9762;&#x3092;&#x8ABF;&#x3079;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30E1;&#x30BD;&#x30C3;&#x30C9;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x69CB;&#x9020;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3092;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

SF1B&#x30D8;&#x30EA;&#x30AB;&#x30FC;&#x30BC;DDA&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x3068;&#x8A55;&#x4FA1;

Helicases&#xB294; &#xAE34;&#xC7A5;&#xC744; &#xD480;&#xACE0; &#xC774;&#xC911; &#xAC00;&#xB2E5; &#xD575; &#xC0B0; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;. &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC624;&#xD30C;&#xC9C0; t 4&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; Dda helicase &#xD6A8;&#xC18C;&#xC758;&#xC774; &#xD074;&#xB798;&#xC2A4;&#xC758; &#xBD84;&#xC790; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xC774;&#xD574; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD55C; &#xD6CC;&#xB96D;&#xD55C; &#xBAA8;&#xB378;&#xC744; &#xC5ED;&#xC784; &#xD588;&#xB2E4;. Dda &#xD611;&#xC0C1;&#xC758; &#xAD6C;&#xC870; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294; &#xC77C;&#xBD80; helicases &#xB2E4;&#xB978; &#xC0AC;&#xB78C;&#xC5D0; 3&#39; 5&#39; &#xBC29;&#xD5A5;&#xC73C;&#xB85C; &#xC774;&#xB3D9; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548;&#xC5D0; 5&#39; DNA&#xC5D0;&#xC11C; 3&#39; &#xBC29;&#xD5A5;&#xC73C;&#xB85C; &#xC774;&#xB3D9; &#xD558;&#xB294; &#xC774;&#xC720;&#xB97C; &#xBC1D;&#xD790; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xACFC; &#xC27D;&#xAC8C; &#xC591;&#xC2DD; &#xACB0;&#xC815;&#xC5D0; &#xC2E4;&#xD328; &#xD558;&#xBA74; &#xD604;&#xC7AC; NMR &#xAE30;&#xC220;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xB108;&#xBB34; &#xD070; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; dda &#xD611;&#xC0C1;&#xC758; &#xAD6C;&#xC870;&#xB97C; &#xB2EC;&#xC131; &#xC5B4;&#xB824;&#xC6B4; &#xC785;&#xC99D; &#xD588;&#xB2E4;. Dda &#xBC0F; DNA&#xC640;&#xC774; &#xC0C1;&#xD638; &#xC804; &#xC88C;&#xC640; DNA&#xC758; &#xD574;&#xC81C;&#xC5D0; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBBF8;&#xCE58;&#xB294; &#xC0C1;&#xD638;&#xC791;&#xC6A9;&#xC758; &#xAD6C;&#xC870;&#xC801; &#xBC0F; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801; &#xC911;&#xC694;&#xC131;&#xC744; &#xAC80;&#xD1A0; &#xD558;&#xB294; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB97C; &#xC548;&#xB0B4; &#xB4DC;&#xB9B4; &#xAC83;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xD558;&#xB294; &#xD6A8;&#xC18C;&#xC758; homology &#xBAA8;&#xB378;&#xC744; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xAD6C;&#xC870; &#xBAA8;&#xB378; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; &#xB9E4;&#xD551; &#xD558; &#xACE0; DNA&#xC640; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD45C;&#xBA74; &#xAC80;&#xC0AC; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xAC1C;&#xBC1C; &#xBC0F; SF1B helicase dda &#xD611;&#xC0C1;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAD6C;&#xC870; &#xBAA8;&#xB378;&#xC758; &#xD3C9;&#xAC00;.

Helicasas son prote&#xED;nas que desenrollan de doble cadena &#xE1;cidos nucleicos. Dda helicasa del bacteri&#xF3;fago T4 ha servido como un excelente modelo para la comprensi&#xF3;n del mecanismo molecular de esta clase de enzimas. Estudio de la estructura de DDA puede revelar por qu&#xE9; algunos helicasas translocate en un 5 &#x26;#39;a 3&#x26;#39; en el ADN, mientras que otros translocate en un 3 &#x26;#39;a 5&#x26;#39;. La consecuci&#xF3;n de una estructura de DDA ha sido dif&#xED;cil porque la prote&#xED;na no se forma con facilidad los cristales y es demasiado grande para las tecnolog&#xED;as actuales de RMN. Hemos desarrollado un modelo de homolog&#xED;a de la enzima que servir&#xE1; para orientar los estudios que examinan la importancia estructural y funcional de la interacci&#xF3;n entre el DAD y el ADN y c&#xF3;mo esta interacci&#xF3;n afecta a la translocaci&#xF3;n y la anulaci&#xF3;n de ADN. Hemos probado el modelo estructural mediante el uso de m&#xE9;todos para dominios de la prote&#xED;na de mapeo y del examen de las superficies de las prote&#xED;nas que interact&#xFA;an con el ADN.

Desarrollo y Evaluaci&#xF3;n de un modelo estructural para SF1B helicasa Dda

&#x917F;&#x9152;&#x9175;&#x6BCD; Yta7 &#x662F;&#x8C03;&#x8282;&#x8F6C;&#x5F55;&#x5404;&#x56FD;&#x5728;&#x6C89;&#x9ED8;&#x7684;&#x4EA4;&#x914D;&#x8F68;&#x8FF9;&#xFF0C;HMR &#x5C4F;&#x969C;&#x6D3B;&#x6027;&#x86CB;&#x767D;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;Yta7 &#x8C03;&#x8282;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x57FA;&#x56E0;&#x8F6C;&#x5F55;&#x548C;&#x5177;&#x6709;&#x91CD;&#x53E0;&#x4E0E;&#x5DF2;&#x77E5;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x5206;&#x5B50;&#x4F34;&#x4FA3;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x3002;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x4FA7;&#x91CD;&#x4E8E;&#x7834;&#x8BD1;&#x7684;&#x975E;&#x89C4;&#x8303;&#x5316;&#x7684; Yta7 bromodomain &#x529F;&#x80FD;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x901A;&#x8FC7;&#x4F7F;&#x7528;&#x9057;&#x4F20;&#x548C;&#x4E0A;&#x4F4D;&#x6027;&#x5206;&#x6790;&#xFF0C;Yta7 bromodomain &#x662F;&#x6240;&#x793A;&#xFF0C;&#x5E94;&#x5728; HMR &#x5C4F;&#x969C;&#x6D3B;&#x52A8;&#x6240;&#x5FC5;&#x9700;&#x7684;&#x6709;&#x91CD;&#x53E0;&#x4E0E;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x76D1;&#x7BA1;&#x673A;&#x6784; &#xFF08;Asf1 &#x548C; Spt16&#xFF09; &#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x3002;&#x89C4;&#x8303; bromodomains &#x53EF;&#x4EE5;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x5230;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D; &#xFF1B; &#x5BF9;&#x4E59;&#x9170;&#x5316; lysines&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;Yta7 bromodomain &#x663E;&#x793A;&#x5728;&#x72EC;&#x7ACB;&#x7684;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x540E;&#x4FEE;&#x9970;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x4E0E;&#x5173;&#x8054;&#x3002;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x8C03;&#x67E5;&#x663E;&#x793A; Yta7 bromodomain &#x4EE5;&#x5916;&#x5730;&#x533A;&#x6240;&#x8D4B;&#x4E88;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x534F;&#x4F1A;&#x3002;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x6C89;&#x6DC0;&#x82AF;&#x7247;&#x5206;&#x6790;&#x663E;&#x793A; Yta7 bromodomain &#x4E0D;&#x662F;&#x72EC;&#x81EA;&#x8D1F;&#x8D23;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x534F;&#x4F1A;&#xFF0C;&#x4F46;&#x4E5F;&#x662F;&#x5FC5;&#x8981;&#x7684;&#x6B63;&#x786E;&#x7684; Yta7 &#x7684;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x5B9A;&#x4F4D;&#x3002;&#x8FD9;&#x9879;&#x5DE5;&#x4F5C;&#x6F14;&#x793A; Yta7 bromodomain &#x4ECE;&#x4E8B;&#x7684;&#x67D0;&#x4E9B;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#xFF0C;&#x5982;&#x5C4F;&#x969C;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x7EF4;&#x62A4;&#x548C;&#x7279;&#x5B9A; Spt16/Asf1 &#x7EC6;&#x80DE;&#x901A;&#x8DEF;&#x7684;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x8C03;&#x63A7;&#x86CB;&#x767D;&#x3002;

AAA ATPase &#x86CB;&#x767D;&#x8D28; Yta7 &#x7684;&#x975E;&#x89C4;&#x8303;&#x5316; bromodomain &#x6307;&#x793A;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x5B9A;&#x4F4D;&#x548C;&#x5C4F;&#x969C;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x6D3B;&#x52A8;&#x3002;

Saccharomyces cerevisiae Yta7 is a barrier active protein that modulates transcriptional states at the silent mating locus, HMR. Additionally, Yta7 regulates histone gene transcription and has overlapping functions with known histone chaperones. This study focused on deciphering the functional role of the noncanonical Yta7 bromodomain. By use of genetic and epistasis analyses, the Yta7 bromodomain was shown to be necessary for barrier activity at HMR and to have overlapping functions with histone regulators (Asf1 and Spt16). Canonical bromodomains can bind to acetylated lysines on histones; however, the Yta7 bromodomain showed an association with histones that was independent of posttranslational modification. Further investigation showed that regions of Yta7 other than the bromodomain conferred histone association. Chromatin immunoprecipitation-chip analyses revealed that the Yta7 bromodomain was not solely responsible for histone association but was also necessary for proper chromosomal positioning of Yta7. This work demonstrates that the Yta7 bromodomain engages histones for certain cellular functions like barrier chromatin maintenance and particular Spt16/Asf1 cellular pathways of chromatin regulation.

A noncanonical bromodomain in the AAA ATPase protein Yta7 directs chromosomal positioning and barrier chromatin activity.

Saccharomyces cerevisiae est une prot&#xE9;ine Yta7 barri&#xE8;re active qui module les Etats de la transcription au niveau du locus accouplement silencieuse, HMR. En outre, Yta7 r&#xE9;gule la transcription du g&#xE8;ne histone et a chevauchement des fonctions dont on conna&#xEE;t les chaperons d&#x26;#39;histones. Cette &#xE9;tude a port&#xE9; sur le d&#xE9;cryptage du r&#xF4;le fonctionnel de la non canonique Yta7 bromodomaine. Par l&#x26;#39;utilisation d&#x26;#39;analyses g&#xE9;n&#xE9;tiques et &#xE9;pistasie, le bromodomaine Yta7 s&#x26;#39;est av&#xE9;r&#xE9; n&#xE9;cessaire pour l&#x26;#39;activit&#xE9; barri&#xE8;re &#xE0; HMR et avoir cumul des fonctions de r&#xE9;glementation des histones (Asf1 et Spt16). Bromodomaines canoniques peut se lier &#xE0; des lysines ac&#xE9;tyl&#xE9;es sur les histones, mais le bromodomaine Yta7 ont montr&#xE9; une association avec les histones qui &#xE9;tait ind&#xE9;pendante de la modification post-traductionnelle. Une enqu&#xEA;te plus pouss&#xE9;e a montr&#xE9; que les r&#xE9;gions de Yta7 autre que le bromodomaine conf&#xE9;r&#xE9; association des histones. Immunopr&#xE9;cipitation de la chromatine puce analyses ont r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9; que le bromodomaine Yta7 n&#x26;#39;&#xE9;tait pas seul responsable de l&#x26;#39;association des histones, mais &#xE9;tait &#xE9;galement n&#xE9;cessaire pour le positionnement chromosomique bon Yta7. Ce travail d&#xE9;montre que le bromodomaine Yta7 s&#x26;#39;engage histones pour certaines fonctions cellulaires comme la maintenance chromatine barri&#xE8;re et particuliers Spt16/Asf1 voies cellulaires de r&#xE9;gulation chromatine.

Un Bromodomain non canonique dans le AAA prot&#xE9;ine ATPase Yta7 Diriger positionnement chromosomique et de l&#x26;#39;activit&#xE9; chromatine Barri&#xE8;re

Saccharomyces Cerevisiae Yta7 ist ein aktive Barriere-Protein, das in der Stille Paarung Locus, HMR transkriptionelle Bundesstaaten moduliert. Dar&uuml;ber hinaus Yta7 reguliert Histon-gen-Transkription und &uuml;berlappende Funktionen mit bekannten Histon Chaperone hat. Diese Studie konzentrierte sich auf die funktionale Rolle der Mitgliedattribut Yta7 Bromodomain Entschl&uuml;sselung. Durch Verwendung von genetischen und Epistase Analysen zeigte die Yta7 Bromodomain f&uuml;r Barriere-Aktivit&auml;t bei HMR erforderlich und &uuml;berlappende Funktionen mit Histon-Regulatoren (Asf1 und Spt16). Kanonische Bromodomains k&ouml;nnen an Acetyliertes Lysin auf Histone binden; die Yta7 Bromodomain zeigte allerdings eine Vereinigung mit Histone, die unabh&auml;ngig von posttranslationale Modifikation war. Weiterer Untersuchungen zeigten, dass Regionen des Yta7 als das Bromodomain Histon-Verband verliehen. Chromatin Immunopr&auml;zipitation-Chip-Analysen ergaben, dass die Yta7 Bromodomain nicht alleinverantwortlich f&uuml;r die Histon-Vereinigung war aber auch f&uuml;r richtige chromosomalen Positionierung des Yta7 notwendig. Diese Arbeit zeigt, dass die Yta7 Bromodomain Histone f&uuml;r bestimmte Zellfunktionen wie Barriere Chromatin Wartung und bestimmten Spt16/Asf1 zellul&auml;ren Wege Chromatin-Verordnung besch&auml;ftigt.

Ein Mitgliedattribut Bromodomain im AAA-ATPase Protein Yta7 leitet chromosomalen Positionierung und Barriere-Chromatin-Aktivit&auml;t.

Saccharomyces cerevisiae Yta7 &egrave; una proteina attiva barriera che modula stati transcriptional presso il locus accoppiamento silenzioso, HMR. Inoltre, Yta7 regola la trascrizione del gene dell&#39;istone e ha sovrapposti funzioni con istone noto accompagnatori. Questo studio si &egrave; concentrato sulla decifrazione il ruolo funzionale della canonica che Yta7. Uso della genetica e analisi di epistasi, il Yta7 che &egrave; stato mostrato per essere necessari per l&#39;attivit&agrave; di barriera all&#39;HMR e hanno funzioni di sovrapposizione con regolatori dell&#39;istone (Asf1 e Spt16). Bromodomains canonico pu&ograve; associare a acetilato Lisine su istoni; Tuttavia, la Yta7 che ha mostrato un&#39;associazione con gli istoni che era indipendente di modificazione post traduzionale. Ulteriori indagini hanno mostrato che regioni di Yta7 diverso dal che conferiva associazione dell&#39;istone. Analisi di chip di immunoprecipitazione della cromatina ha rivelato che il Yta7 che non era solamente responsabile associazione istone ma anche era necessario per un corretto posizionamento cromosomica di Yta7. Questo lavoro dimostra che il Yta7 che coinvolge gli istoni per certe funzioni cellulari come barriera della cromatina manutenzione e particolari percorsi cellulare Spt16/Asf1 del regolamento della cromatina.

Una canonica che nella proteina ATPasi AAA Yta7 dirige posizionamento cromosomiche e attivit&agrave; di barriera della cromatina.

&#x30B5;&#x30C3;&#x30AB;&#x30ED;&#x30DF;&#x30BB;&#x30B9;&#xB7;&#x30BB;&#x30EC;&#x30D3;&#x30B7;&#x30A8;&#xFF08;Saccharomyces cerevisiae&#xFF09;Yta7&#x306F;&#x3001;&#x30B5;&#x30A4;&#x30EC;&#x30F3;&#x30C8;&#x4EA4;&#x914D;&#x5EA7;&#x3001;HMR&#x3067;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x72B6;&#x614B;&#x3092;&#x5909;&#x8ABF;&#x3059;&#x308B;&#x969C;&#x58C1;&#x6D3B;&#x6027;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;Yta7&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3057;&#x3001;&#x65E2;&#x77E5;&#x306E;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x30B7;&#x30E3;&#x30DA;&#x30ED;&#x30F3;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3092;&#x91CD;&#x8907;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x975E;&#x6A19;&#x6E96;Yta7&#x30D6;&#x30ED;&#x30E2;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x89E3;&#x8AAD;&#x306B;&#x7126;&#x70B9;&#x3092;&#x5F53;&#x3066;&#x305F;&#x3002;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B9;&#x30BF;&#x30B7;&#x30B9;&#x89E3;&#x6790;&#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x3001;Yta7&#x30D6;&#x30ED;&#x30E2;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;HMR&#x3067;&#x306E;&#x969C;&#x58C1;&#x306E;&#x6D3B;&#x52D5;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3068;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30BF;&#xFF08;ASF1&#x3068;Spt16&#xFF09;&#x3067;&#x6A5F;&#x80FD;&#x304C;&#x91CD;&#x8907;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x6A19;&#x6E96;&#x7684;&#x306A;bromodomains&#x306F;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x30A2;&#x30BB;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x30EA;&#x30B8;&#x30F3;&#x306B;&#x7D50;&#x5408;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x304C;&#x3001;Yta7&#x306E;&#x30D6;&#x30ED;&#x30E2;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306F;&#x7FFB;&#x8A33;&#x5F8C;&#x4FEE;&#x98FE;&#x3068;&#x306F;&#x7121;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3067;&#x3042;&#x3063;&#x305F;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x3068;&#x306E;&#x95A2;&#x9023;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x8A73;&#x3057;&#x3044;&#x8ABF;&#x67FB;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3001;&#x30D6;&#x30ED;&#x30E2;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x4EE5;&#x5916;&#x306E;Yta7&#x306E;&#x9818;&#x57DF;&#x306F;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x5354;&#x4F1A;&#x3092;&#x6388;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x514D;&#x75AB;&#x6C88;&#x964D;&#x30AA;&#x30F3;&#x30C1;&#x30C3;&#x30D7;&#x89E3;&#x6790;&#x306F;Yta7&#x30D6;&#x30ED;&#x30E2;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306F;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x8CAC;&#x4EFB;&#x3092;&#x8CA0;&#x3044;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3067;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3001;Yta7&#x306E;&#x9069;&#x5207;&#x306A;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x306E;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x6C7A;&#x3081;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3082;&#x5FC5;&#x8981;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x4F5C;&#x54C1;&#x306F;&#x3001;Yta7&#x30D6;&#x30ED;&#x30E2;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306F;&#x30D0;&#x30EA;&#x30A2;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C6;&#x30CA;&#x30F3;&#x30B9;&#x3068;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x5236;&#x5FA1;&#x306E;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;Spt16/Asf1&#x7D30;&#x80DE;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x306B;&#x4FC2;&#x5408;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

AAA ATPase&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;Yta7&#x3067;&#x975E;&#x6A19;&#x6E96;&#x30D6;&#x30ED;&#x30E2;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x3068;&#x30D0;&#x30EA;&#x30A2;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x6D3B;&#x52D5;&#x3092;&#x6307;&#x793A;

Saccharomyces cerevisiae Yta7 &#xC790;&#xB3D9; &#xC9DD;&#xC9D3;&#xAE30; &#xB85C;&#xCEE4; &#xC2A4; HMR&#xC5D0; transcriptional &#xC0C1;&#xD0DC; &#xBCC0;&#xC870; &#xC7A5;&#xBCBD; &#xD65C;&#xC131; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, Yta7 &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC804;&#xC0AC;&#xB97C; &#xC870;&#xC808; &#xD558; &#xACE0; &#xACB9;&#xCE58;&#xB294; &#xAE30;&#xB2A5; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xBCF4;&#xD638;&#xC790;&#xC640; &#xD568;&#xAED8; &#xC788;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294; &#xD574;&#xB3C5; &#xBE44;&#xC815;&#xADDC; Yta7 bromodomain&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801; &#xC5ED;&#xD560;&#xC5D0; &#xC9D1;&#xC911; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xBC0F; epistasis &#xBD84;&#xC11D;, HMR&#xC5D0; &#xC7A5;&#xBCBD; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC5D0; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; &#xACE0; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xD130; (Asf1 &#xBC0F; Spt16)&#xC640; &#xD568;&#xC218;&#xB97C; &#xC911;&#xCCA9; &#xD558;&#xB294; &#xAC83; Yta7 bromodomain &#xD45C;&#xC2DC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC815;&#xC2DD; bromodomains acetylated lysines &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4;;&#xC5D0; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, Yta7 bromodomain posttranslational &#xC218;&#xC815;&#xC758; &#xB3C5;&#xB9BD; &#xB41C; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4;&#xACFC; &#xC5F0;&#xACB0;&#xC744; &#xD588;&#xB2E4;. &#xCD94;&#xAC00; &#xC870;&#xC0AC;&#xB294; bromodomain &#xC774;&#xC678;&#xC758; yta7&#xC758; &#xC9C0;&#xC5ED; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xD611;&#xD68C; &#xC218; &#xC5EC; &#xD588;&#xB2E4;. Chromatin immunoprecipitation &#xCE69; &#xBD84;&#xC11D; &#xBC1D;&#xD600; Yta7 bromodomain&#xB294; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xD611;&#xD68C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xCC45;&#xC784;&#xC774; &#xC804;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; yta7&#xC758; &#xC801;&#xC808; &#xD55C; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC704;&#xCE58; &#xC9C0;&#xC815;&#xC744; &#xC704;&#xD574; &#xD544;&#xC694; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC791;&#xD488; Yta7 bromodomain &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xC7A5;&#xBCBD; chromatin &#xC720;&#xC9C0; &#xBCF4;&#xC218; chromatin &#xADDC;&#xC81C;&#xC758; &#xD2B9;&#xC815; Spt16/Asf1 &#xC140;&#xB8F0;&#xB7EC; &#xACBD;&#xB85C; &#xB4F1;&#xACFC; &#xAC19;&#xC740; &#xD2B9;&#xC815; &#xC138;&#xD3EC; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC885;&#xC0AC; &#xD558;&#xB294; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;.

AAA ATPase &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; Yta7 &#xBE44;&#xC815;&#xADDC; bromodomain &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC704;&#xCE58; &#xBC0F; &#xC7A5;&#xBCBD; chromatin &#xD65C;&#xB3D9;&#xC744; &#xC9C0;&#xD718;&#xD558; &#xACE0; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Saccharomyces cerevisiae Yta7 es una prote&#xED;na barrera activa que modula estados transcripcional en el locus de apareamiento en silencio, HMR. Adem&#xE1;s, Yta7 regula la transcripci&#xF3;n de genes de histonas y tiene funciones superpuestas con las chaperonas de histonas conocidas. Este estudio se centr&#xF3; en descifrar el papel funcional de la no can&#xF3;nica Yta7 bromodomain. Mediante el uso de an&#xE1;lisis gen&#xE9;ticos y epistasis, el bromodomain Yta7 se demostr&#xF3; que era necesario para la actividad barrera a HMR y haber superposici&#xF3;n de funciones con los reguladores histonas (Asf1 y Spt16). Bromodomains Canonical se puede unir a lisinas acetiladas en las histonas, sin embargo, el bromodomain Yta7 mostr&#xF3; una asociaci&#xF3;n con las histonas que era independiente de la modificaci&#xF3;n postraduccional. Investigaciones posteriores mostraron que las regiones que no sea el bromodomain Yta7 confiere la asociaci&#xF3;n de histonas. Cromatina inmunoprecipitaci&#xF3;n de chips-an&#xE1;lisis revel&#xF3; que el bromodomain Yta7 no era el &#xFA;nico responsable de la asociaci&#xF3;n de histonas, pero tambi&#xE9;n era necesario para el correcto posicionamiento de los cromosomas Yta7. Este trabajo demuestra que la bromodomain Yta7 histonas se dedica a determinadas funciones celulares como el mantenimiento de la barrera de la cromatina y particulares Spt16/Asf1 v&#xED;as celulares de regulaci&#xF3;n de la cromatina.

Un bromodomain no can&#xF3;nicos en la AAA prote&#xED;na ATPasa Yta7 Dirige el posicionamiento cromos&#xF3;mica y la actividad de la cromatina Barrera

&#x5728;&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#xFF0C;DNA &#x73AF;&#x7ED5;&#x79F0;&#x4E3A;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#xFF0C;&#x51DD;&#x7ED3;&#x6210;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x3002;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x540E;&#x4FEE;&#x9970;&#x53EF;&#x4EE5;&#x5BFC;&#x81F4;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;&#x6700;&#x7CBE;&#x5FC3;&#x7814;&#x7A76;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x4FEE;&#x9970;&#x4E4B;&#x4E00;&#x662F;&#x8D56;&#x6C28;&#x9178;&#x5BF9;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D; H3 4 (H3K4) &#x7684;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x6B8B;&#x4F59;&#x53EF;&#x4EE5;&#x5355;&#x3001; &#x7532;&#x57FA; di &#x6216;&#x4E09;&#x5316;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x72B6;&#x6001;&#x5DF2;&#x4E0E;&#x4E0D;&#x540C;&#x7EA7;&#x522B;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;&#x4E86;&#x89E3;&#x5230;&#x5E95;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x56FD;&#x5BB6;&#x7684;&#x76EE;&#x7684;&#x4EC0;&#x4E48;&#xFF0C;&#x5728;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x65B9;&#x9762;&#x4E00;&#x76F4;&#x5F88;&#x591A;&#x7814;&#x7A76;&#x8BFE;&#x9898;&#x8FD1;&#x5E74;&#x6765;&#x3002;&#x9176;&#x53EF;&#x4EE5;&#x6DFB;&#x52A0; &#xFF08;&#x7532;&#x57FA;&#x8F6C;&#x79FB;&#x9176;&#xFF09; &#x548C;&#x5220;&#x9664; &#xFF08;demethylases&#xFF09;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x4FEE;&#x6539;&#x662F;&#x7279;&#x522B;&#x611F;&#x5174;&#x8DA3;&#x3002;&#x7B2C;&#x4E00;&#x6B21;&#x8131;&#x53D1;&#x73B0;&#xFF0C;LSD1&#xFF0C;&#x662F;&#x6700; well-classified &#x548C;&#x7275;&#x8FDE;&#x5728;&#x4E3A;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x764C;&#x75C7;&#x548C; DNA &#x635F;&#x4F24;&#x53CD;&#x5E94;&#x901A;&#x8DEF;&#x505A;&#x51FA;&#x8D21;&#x732E;&#x3002;&#x76EE;&#x524D;&#xFF0C;&#x6709;&#x6709;&#x9650;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#x51C6;&#x786E;&#x5730;&#x7814;&#x7A76; demethylases &#x5728;&#x4F53;&#x5916;&#x6216;&#x4F53;&#x5185;&#x7684;&#x6D3B;&#x52A8;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x9879;&#x5DE5;&#x4F5C;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x63D0;&#x51FA;&#x4E86; MassSQUIRM &#xFF08;&#x4F7F;&#x7528;&#x540C;&#x4F4D;&#x7D20;&#x8FD8;&#x539F;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x8D28;&#x8C31;&#x5B9A;&#x91CF;&#xFF09;&#xFF0C;&#x8D56;&#x6C28;&#x9178;&#x6807;&#x8BB0;&#x7684;&#x4E00;&#x79CD;&#x7814;&#x7A76;&#x7684; demethylases &#x80FD;&#x591F;&#x6D88;&#x9664;&#x5355;&#x58F0;&#x9053;&#x548C; di-&#x7532;&#x57FA;&#x6D3B;&#x6027;&#x5B9A;&#x91CF;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x4FA7;&#x91CD;&#x5177;&#x4F53; LSD1 &#x7531;&#x4E8E;&#x5176;&#x6F5C;&#x529B;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x75BE;&#x75C5;&#x7684;&#x4E3B;&#x8981;&#x6CBB;&#x7597;&#x76EE;&#x6807;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x5B9A;&#x91CF;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#x5C06;&#x4F7F; LSD1 &#x548C;&#x5176;&#x4ED6;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x4FEE;&#x9970;&#x9176;&#x4F53;&#x5916;&#x3001; &#x4F53;&#x5185;&#x6216;&#x6291;&#x5236;&#x5242;&#x7684;&#x54CD;&#x5E94;&#x7684;&#x6D3B;&#x52A8;&#x66F4;&#x597D;&#x5730;&#x8868;&#x5F81;&#x3002;

MassSQUIRM&#xFF1A; &#x8D56;&#x6C28;&#x9178;&#x8131;&#x6D3B;&#x6027;&#x5B9A;&#x91CF;&#x6D4B;&#x5B9A;&#x6CD5;&#x6D4B;&#x5B9A;&#x3002;

In eukaryotes, DNA is wrapped around proteins called histones and is condensed into chromatin. Post-translational modification of histones can result in changes in gene expression. One of the most well-studied histone modifications is the methylation of lysine 4 on histone H3 (H3K4). This residue can be mono-, di- or tri-methylated and these varying methylation states have been associated with different levels of gene expression. Understanding exactly what the purpose of these methylation states is, in terms of gene expression, has been a topic of much research in recent years. Enzymes that can add (methyltransferases) and remove (demethylases) these modifications are of particular interest. The first demethylase discovered, LSD1, is the most well-classified and has been implicated in contributing to human cancers and to DNA damage response pathways. Currently, there are limited methods for accurately studying the activity of demethylases in vitro or in vivo. In this work, we present MassSQUIRM (mass spectrometric quantitation using isotopic reductive methylation), a quantitative method for studying the activity of demethylases capable of removing mono- and di-methyl marks from lysine residues. We focus specifically on LSD1 due to its potential as a prime therapeutic target for human disease. This quantitative approach will enable better characterization of the activity of LSD1 and other chromatin modifying enzymes in vitro, in vivo or in response to inhibitors.

MassSQUIRM: An assay for quantitative measurement of lysine demethylase activity.

Chez les eucaryotes, l&#x26;#39;ADN est enroul&#xE9; autour de prot&#xE9;ines appel&#xE9;es histones et se condense sous forme de chromatine. Modification post-traductionnelle des histones peut entra&#xEE;ner des changements dans l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes. Une des modifications les plus bien &#xE9;tudi&#xE9;s histones est la m&#xE9;thylation de la lysine 4 sur l&#x26;#39;histone H3 (H3K4). Ce r&#xE9;sidu peut &#xEA;tre mono-, di-ou tri-m&#xE9;thyl&#xE9; et ces &#xE9;tats de m&#xE9;thylation diff&#xE9;rentes ont &#xE9;t&#xE9; associ&#xE9;s &#xE0; diff&#xE9;rents niveaux d&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes. Comprendre exactement quel est le but de ces &#xE9;tats de m&#xE9;thylation est, en termes d&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes, a &#xE9;t&#xE9; un sujet de beaucoup de recherches ces derni&#xE8;res ann&#xE9;es. Les enzymes qui peuvent ajouter (m&#xE9;thyltransf&#xE9;rases) et supprimer (d&#xE9;m&#xE9;thylases) ces modifications sont d&#x26;#39;un int&#xE9;r&#xEA;t particulier. La d&#xE9;m&#xE9;thylase d&#x26;#39;abord d&#xE9;couvert, LSD1, est le plus bien-annonce et a &#xE9;t&#xE9; impliqu&#xE9; dans les cancers de contribuer &#xE0; l&#x26;#39;homme et de voies de dommages de l&#x26;#39;ADN de r&#xE9;ponse. Actuellement, il existe des m&#xE9;thodes limit&#xE9;es pour pr&#xE9;cis&#xE9;ment d&#x26;#39;&#xE9;tudier l&#x26;#39;activit&#xE9; de d&#xE9;m&#xE9;thylases in vitro ou in vivo. Dans ce travail, nous pr&#xE9;sentons MassSQUIRM (masse quantification par spectrom&#xE9;trie isotopique utilisant m&#xE9;thylation r&#xE9;ductrice), une m&#xE9;thode quantitative pour l&#x26;#39;&#xE9;tude de l&#x26;#39;activit&#xE9; de d&#xE9;m&#xE9;thylases capables d&#x26;#39;&#xE9;liminer les mono-et di-m&#xE9;thyle marques de r&#xE9;sidus lysine. Nous nous concentrons particuli&#xE8;rement sur LSD1 en raison de son potentiel en tant que cible de choix th&#xE9;rapeutique pour les maladies humaines. Cette approche quantitative permettra une meilleure caract&#xE9;risation de l&#x26;#39;activit&#xE9; de la chromatine et LSD1 autre modification des enzymes in vitro, in vivo ou en r&#xE9;ponse aux inhibiteurs.

MassSQUIRM: Un test pour la mesure quantitative de l&#x26;#39;activit&#xE9; D&#xE9;m&#xE9;thylase Lysine

In Eukaryoten DNA um Proteine genannt Histone gewickelt und wird in Chromatin kondensiert. Post-translationale Modifikation der Histone f&uuml;hrt zu Ver&auml;nderungen in der Genexpression. Eine der am meisten gut erforscht Histon &Auml;nderungen ist die Methylierung von Lysin 4 auf Histon H3 (H3K4). Diese R&uuml;ckst&auml;nde kann Mono-, di - oder Tri-methyliert und diese unterschiedlichen Methylierung-Staaten wurden mit verschiedenen Ebenen der Genexpression. Verstehen genau, was der Zweck dieser Methylierung-Staaten, in Bezug auf die Genexpression, ist ein Thema der viel Forschung in den letzten Jahren gewesen. Von besonderem Interesse sind Enzyme, die (Methyltransferasen) hinzuf&uuml;gen und entfernen (Demethylasen) k&ouml;nnen diese &Auml;nderungen. Die ersten Demethylase entdeckt, LSD1, ist die am meisten well-classified und hat verwickelt wurde, DNA Sch&auml;den Antwort Bildungswege zur menschlichen Krebserkrankungen beizutragen. Derzeit gibt es begrenzte Methoden f&uuml;r die Aktivit&auml;t der Demethylasen in vitro noch in vivo genau zu studieren. In dieser Arbeit pr&auml;sentieren wir Ihnen MassSQUIRM (massenspektrometrische Bestimmung mit Isotopen reduktive Methylierung), eine quantitative Methode zur Untersuchung der T&auml;tigkeit der Demethylasen f&auml;hig Mono - und di-Methyl zu entfernen markiert von Lysin-Resten. Wir setzen speziell auf LSD1 aufgrund seines Potentials als therapeutische Zielscheibe f&uuml;r menschliche Krankheit. Diese quantitative Ansatz erm&ouml;glicht bessere Charakterisierung der Aktivit&auml;t der LSD1 und andere Enzyme, die in-vitro, in vivo oder in Reaktion auf Inhibitoren &auml;ndern Chromatin.

MassSQUIRM: Ein Assay f&uuml;r die quantitative Messung von Lysin-Demethylase-Aktivit&auml;t.

Negli eucarioti, il DNA &egrave; avvolto attorno a proteine chiamate istoni ed &egrave; condensato in cromatina. Modifica alberino-di traduzione degli istoni pu&ograve; causare cambiamenti nell&#39;espressione genica. Una delle modifiche dell&#39;istone ben pi&ugrave; studiate &egrave; la metilazione di lisina 4 su istone H3 (H3K4). Questo residuo pu&ograve; essere mono-, di - o tri-metilato e questi diversi stati di metilazione sono stati associati con diversi livelli di espressione genica. Capire esattamente che cosa lo scopo di questi stati di metilazione &egrave;, in termini di espressione del gene, &egrave; stato un argomento di molta ricerca negli ultimi anni. Di particolare interesse sono gli enzimi che possono aggiungere (methyltransferases) e rimuovere (demethylases) queste modifiche. Il primo demethylase scoperto, LSD1, &egrave; pi&ugrave; rinomati ed &egrave; stato implicato nel contribuire a tumori umani e a percorsi di risposta danni del DNA. Attualmente, ci sono metodi limitate per studiare accuratamente l&#39;attivit&agrave; di demethylases in vitro o in vivo. In questo lavoro, vi presentiamo MassSQUIRM (spettrometria di massa quantificazione mediante metilazione riduttiva isotopica), un metodo quantitativo per studiare l&#39;attivit&agrave; di demethylases in grado di rimuovere mono - e di-metil segna da residui di lisina. Ci concentriamo in particolare su LSD1 a causa del suo potenziale come un primo obiettivo terapeutico per la malattia umana. Questo approccio quantitativo consentir&agrave; migliore caratterizzazione dell&#39;attivit&agrave; di LSD1 e altre modificando gli enzimi in vitro, in vivo o in risposta agli inibitori di cromatina.

MassSQUIRM: Un test per la misurazione quantitativa dell&#39;attivit&agrave; di lisina demetilasi.

&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x306B;&#x304A;&#x3044;&#x3066;&#x3001;DNA&#x306F;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x3068;&#x547C;&#x3070;&#x308C;&#x308B;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306B;&#x5DFB;&#x304D;&#x3064;&#x3051;&#x3066;&#x304A;&#x308A;&#x3001;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306B;&#x51DD;&#x7E2E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x306E;&#x7FFB;&#x8A33;&#x5F8C;&#x4FEE;&#x98FE;&#x306F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x3092;&#x3082;&#x305F;&#x3089;&#x3059;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6700;&#x3082;&#x3088;&#x304F;&#x7814;&#x200B;&#x200B;&#x7A76;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x4FEE;&#x98FE;&#x306E;&#x4E00;&#x3064;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;H3&#xFF08;H3K4&#xFF09;&#x306E;&#x30EA;&#x30B8;&#x30F3;4&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x6B8B;&#x57FA;&#x306F;&#x3001;&#x30E2;&#x30CE; - &#x3001;&#x30B8; - &#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x30C8;&#x30EA;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x69D8;&#x3005;&#x306A;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x72B6;&#x614B;&#x304C;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x89B3;&#x70B9;&#x304B;&#x3089;&#x3001;&#x8FD1;&#x200B;&#x200B;&#x5E74;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x8A71;&#x984C;&#x3068;&#x306A;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x72B6;&#x614B;&#x306E;&#x76EE;&#x7684;&#x306F;&#x6B63;&#x78BA;&#x306B;&#x4F55;&#x3092;&#x7406;&#x89E3;&#x3059;&#x308B;&#x3002;&#x8FFD;&#x52A0;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x9175;&#x7D20;&#xFF08;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30D5;&#x30A7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#xFF09;&#x304A;&#x3088;&#x3073;remove&#xFF08;&#x8131;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x9175;&#x7D20;&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x306F;&#x7279;&#x306B;&#x8208;&#x5473;&#x6DF1;&#x3044;&#x3082;&#x306E;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x767A;&#x898B;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x30C7;&#x30E1;&#x30C1;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x3001;LSD1&#x306F;&#x3001;&#x6700;&#x3082;&#x3088;&#x304F;&#x5206;&#x985E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x304A;&#x308A;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x306E;&#x764C;&#x3092;&#x3001;DNA&#x640D;&#x50B7;&#x5FDC;&#x7B54;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3078;&#x306E;&#x8CA2;&#x732E;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x73FE;&#x5728;&#x3001;&#x6B63;&#x78BA;&#x306B;in vitro&#x307E;&#x305F;&#x306F;in vivo&#x3067;&#x306E;&#x8131;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x7814;&#x7A76;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x9650;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x65B9;&#x6CD5;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;MassSQUIRM&#xFF08;&#x540C;&#x4F4D;&#x4F53;&#x306E;&#x9084;&#x5143;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x305F;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x306E;&#x5B9A;&#x91CF;&#xFF09;&#x3001;&#x30EA;&#x30B8;&#x30F3;&#x6B8B;&#x57FA;&#x304B;&#x3089;&#x30E2;&#x30CE; - &#x53CA;&#x3073;&#x30B8; - &#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AF;&#x3092;&#x9664;&#x53BB;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x8131;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x7814;&#x7A76;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x5B9A;&#x91CF;&#x7684;&#x306A;&#x624B;&#x6CD5;&#x3092;&#x63D0;&#x6848;&#x3059;&#x308B;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x306E;&#x75BE;&#x60A3;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x4E3B;&#x306A;&#x6CBB;&#x7642;&#x6A19;&#x7684;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x306E;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x3001;LSD1&#x306B;&#x7279;&#x306B;&#x7126;&#x70B9;&#x3092;&#x5F53;&#x3066;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x5B9A;&#x91CF;&#x7684;&#x306A;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306F;&#x3001;&#x30A4;&#x30F3;&#x30D3;&#x30DC;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x963B;&#x5BB3;&#x306B;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3057;&#x3066;&#x3001;LSD1&#x6D3B;&#x6027;&#x306E;&#x512A;&#x308C;&#x305F;&#x7279;&#x6027;&#x3068;in vitro&#x3067;&#x306E;&#x9175;&#x7D20;&#x3092;&#x5909;&#x66F4;&#x3059;&#x308B;&#x4ED6;&#x306E;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x3092;&#x6709;&#x52B9;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

MassSQUIRM&#xFF1A;&#x30EA;&#x30B8;&#x30F3;&#x8131;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x9175;&#x7D20;&#x6D3B;&#x6027;&#x306E;&#x5B9A;&#x91CF;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30A2;&#x30C3;&#x30BB;&#x30A4;

&#xC9C4;&#xD575;&#xC0DD;&#xBB3C;, DNA&#xB294; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xC774;&#xB77C;&#xB294; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xAC10;&#xC2F8; &#xD558; &#xACE0; chromatin &#xC751;&#xCD95;. &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4;&#xC758; &#xD3EC;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xBC88;&#xC5ED; &#xC0C1; &#xC218;&#xC815; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBCC0;&#xACBD; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD558;&#xB098; &#xAC00;&#xC7A5; &#xC774;&#xC57C;&#xAE30;&#xB3C4; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xC218;&#xC815; lysine 4 &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; h3&#xC5D0; (H3K4)&#xC758; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xC774;&#xB2E4;. &#xC774; &#xCC0C; &#xAEBC;&#xC774; &#xAE30; &#xC218; &#xBAA8;&#xB178;-&#xB514; &#xB610;&#xB294; &#xD2B8;&#xB77C;&#xC774; &#xAC20; &#xACE0; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xC0C1;&#xD0DC;&#xB97C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; &#xB2E4;&#xB978; &#xC218;&#xC900;&#xC5D0; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xD574; &#xC815;&#xD655; &#xD558; &#xAC8C; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xC0C1;&#xD0DC;&#xC758; &#xBAA9;&#xC801;, &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; &#xAD00;&#xC810;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCD5C;&#xADFC; &#xBA87; &#xB144; &#xB3D9;&#xC548;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB9CE;&#xC740; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC758; &#xC8FC;&#xC81C; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD6A8;&#xC18C; (methyltransferases)&#xB97C; &#xCD94;&#xAC00; &#xD558; &#xACE0; &#xC81C;&#xAC70; (demethylases) &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC218;&#xC815; &#xC791;&#xC5C5;&#xC758; &#xD2B9;&#xC815; &#xAD00;&#xC2EC;&#xC774; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; demethylase, LSD1, &#xAC00;&#xC7A5; well-classified &#xC774;&#xBA70; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC554;&#xACFC; DNA &#xC190;&#xC0C1; &#xBC18;&#xC751; &#xACBD;&#xB85C; &#xAE30;&#xC5EC;&#xC5D0; &#xC5F0;&#xB8E8; &#xB418;&#xC5B4;&#xC788;&#xB2E4;. &#xD604;&#xC7AC;, demethylases &#xCCB4; &#xC678; &#xB610;&#xB294; &#xC0DD;&#xCCB4; &#xC870;&#xAC74; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC744; &#xC815;&#xD655; &#xD558; &#xAC8C; &#xACF5;&#xBD80;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC81C;&#xD55C; &#xB41C; &#xBC29;&#xBC95;&#xC774; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC791;&#xC5C5;&#xC5D0;&#xC11C;&#xB294; MassSQUIRM (isotopic reductive &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xB300;&#xB7C9; spectrometric &#xC815;&#xB7C9;), &#xC18C;&#xAC1C; &#xACF5;&#xBD80; demethylases &#xBAA8;&#xB178; &#xBC0F; &#xB514; &#xBA54; &#xD2F8; &#xC81C;&#xAC70; &#xD560; &#xC218;&#xC758; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC815;&#xB7C9;&#xC801; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; lysine &#xC794;&#xB958;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC9C8;&#xBCD1;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC8FC;&#xC694; &#xCE58;&#xB8CC; &#xB300;&#xC0C1;&#xC73C;&#xB85C; lsd1&#xC758; &#xAC00;&#xB2A5;&#xC131; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xD2B9;&#xD788; &#xCD08;&#xC810;&#xC744;. &#xC774; &#xC591;&#xC801; &#xC811;&#xADFC;&#xC5D0;&#xB294; LSD1 &#xBC0F; &#xB2E4;&#xB978; chromatin &#xD6A8;&#xC18C; &#xCCB4; &#xC678; &#xC0DD;&#xCCB4; &#xC870;&#xAC74; &#xB610;&#xB294; &#xC800; &#xD574;&#xC81C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC218;&#xC815; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC758; &#xB354; &#xB098;&#xC740; &#xD2B9;&#xC131;&#xD654; &#xC218; &#xC788;&#xAC8C; &#xB41C;&#xB2E4;.

MassSQUIRM: lysine demethylase &#xD65C;&#xB3D9;&#xC758; &#xC815;&#xB7C9;&#xC801; &#xCE21;&#xC815;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBD84;&#xC11D; &#xACB0;&#xACFC;.

En eucariotas, el ADN se enrolla alrededor de prote&#xED;nas llamadas histonas y se condensa en la cromatina. Modificaciones post-traduccionales de las histonas puede resultar en cambios en la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica. Una de las modificaciones m&#xE1;s bien estudiadas las histonas es la metilaci&#xF3;n de la lisina 4 de la histona H3 (H3K4). Este residuo puede ser mono-, di o tri-metilada y estos estados diferentes de metilaci&#xF3;n se han asociado con diferentes niveles de expresi&#xF3;n g&#xE9;nica. Entender exactamente cu&#xE1;l es el prop&#xF3;sito de estos estados de metilaci&#xF3;n es, en t&#xE9;rminos de la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica, ha sido un tema de mucha investigaci&#xF3;n en los &#xFA;ltimos a&#xF1;os. Las enzimas que se pueden a&#xF1;adir (methyltransferases) y remove (desmetilasas) estas modificaciones son de particular inter&#xE9;s. El desmetilasa descubri&#xF3; por primera vez, LSD1, es el m&#xE1;s bien clasificado y se ha implicado en la contribuci&#xF3;n a los c&#xE1;nceres humanos y las v&#xED;as de respuesta al da&#xF1;o del ADN. Actualmente, existen m&#xE9;todos limitados para estudiar con precisi&#xF3;n la actividad de desmetilasas in vitro o in vivo. En este trabajo se presenta MassSQUIRM (cuantificaci&#xF3;n mediante espectrometr&#xED;a de masas isot&#xF3;pica metilaci&#xF3;n reductiva), un m&#xE9;todo cuantitativo para el estudio de la actividad de desmetilasas capaces de eliminar los mono-y di-metil marcas de los residuos de lisina. Nos centramos espec&#xED;ficamente en debido a su potencial como principal objetivo terap&#xE9;utico para la enfermedad humana LSD1. Este enfoque cuantitativo permitir&#xE1; una mejor caracterizaci&#xF3;n de la actividad de la cromatina LSD1 y otra modificaci&#xF3;n de enzimas in vitro, in vivo o en respuesta a los inhibidores.

MassSQUIRM: un ensayo para la medici&#xF3;n cuantitativa de la actividad desmetilasa Lisina

&#x7C7B;&#x4F3C;&#x4E8E;&#x9057;&#x4F20;&#x6539;&#x5EFA;&#x3001; &#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20;&#x53D8;&#x5F02;&#x5927;&#x5927;&#x6709;&#x52A9;&#x4E8E;&#x80BF;&#x7624;&#x542F;&#x52A8;&#x548C;&#x8FDB;&#x5C55;&#x3002;&#x5728;&#x8BB8;&#x591A;&#x60C5;&#x51B5;&#x4E0B;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x53D8;&#x5316;&#x88AB;&#x5F15;&#x8D77;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x6216;&#x706D;&#x6D3B;&#x4FDD;&#x6301;&#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20;&#x5B66;&#x56FD;&#x5BB6;&#x7684;&#x76D1;&#x7BA1;&#x673A;&#x6784;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6211;&#x4EEC;&#x68C0;&#x8BA8;&#x6211;&#x4EEC;&#x76EE;&#x524D;&#x6240;&#x77E5;&#x7684;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D; demethylases KDM5/JARID1 &#x5BB6;&#x5EAD;&#x95EE;&#x9898;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E2A;&#x5BB6;&#x5EAD;&#x7684;&#x9176;&#x5305;&#x542B; JmjC &#x57DF;&#xFF0C;&#x662F;&#x80FD;&#x591F;&#x6D88;&#x9664;&#x4ECE;&#x8D56;&#x6C28;&#x9178;&#x5728;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D; H3 &#x7684; 4-&#x7532;&#x57FA;&#x4E09;&#x548C; di &#x7684;&#x6807;&#x8BB0;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E4B;&#x95F4; RBP2 &#x4ECB;&#x5BFC;&#x8010;&#x836F;&#xFF0C;&#x800C; JARID1B &#x662F;&#x9ED1;&#x8272;&#x7D20;&#x7624;&#x7EF4;&#x4FEE;&#x6240;&#x9700;&#x3002;&#x4E34;&#x5E8A;&#x524D;&#x7814;&#x7A76;&#x8868;&#x660E;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x9176;&#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x4F5C;&#x7528;&#x53EF;&#x4EE5;&#x6291;&#x5236;&#x80BF;&#x7624;&#x53D1;&#x751F;&#x7684;&#x5173;&#x7CFB;&#x5E76;&#x4E3A;&#x5176;&#x6291;&#x5236;&#x5242;&#x5728;&#x80BF;&#x7624;&#x6CBB;&#x7597;&#x4E2D;&#x4F7F;&#x7528;&#x7684;&#x53D1;&#x5C55;&#x63D0;&#x4F9B;&#x5F3A;&#x6709;&#x529B;&#x7684;&#x7406;&#x7531;&#x3002;

&#x8D56;&#x6C28;&#x9178;&#x8131; 5 (KDM5) &#x7684;&#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20;&#x8C03;&#x63A7;&#x9176;&#x7684;&#x764C;&#x75C7;&#x3002;

Similar to genetic alterations, epigenetic aberrations contribute significantly to tumor initiation and progression. In many cases, these changes are caused by activation or inactivation of the regulators that maintain epigenetic states. Here we review our current knowledge on the KDM5/JARID1 family of histone demethylases. This family of enzymes contains a JmjC domain and is capable of removing tri- and di- methyl marks from lysine 4 on histone H3. Among these proteins, RBP2 mediates drug resistance while JARID1B is required for melanoma maintenance. Preclinical studies suggest inhibition of these enzymes can suppress tumorigenesis and provide strong rationale for development of their inhibitors for use in cancer therapy.

Epigenetic Regulation by Lysine Demethylase 5 (KDM5) Enzymes in Cancer.

Des alt&eacute;rations semblables &agrave; la g&eacute;n&eacute;tique, des aberrations &eacute;pig&eacute;n&eacute;tiques contribuent de mani&egrave;re significative &agrave; la progression et l&#39;initiation de la tumeur. Dans de nombreux cas, ces changements sont caus&eacute;es par l&#39;activation ou l&#39;inactivation des organismes de r&eacute;glementation qui maintiennent les &Eacute;tats &eacute;pig&eacute;n&eacute;tiques. Ici nous passons en revue nos connaissances actuelles sur la famille de KDM5/JARID1 de d&eacute;m&eacute;thylases d&#39;histones. Cette famille d&#39;enzymes contient un domaine JmjC et est capable d&#39;&eacute;liminer les marques de tri - et di-m&eacute;thyl de lysine 4 sur l&#39;histone H3. Parmi ces prot&eacute;ines, RBP2 intervient dans la r&eacute;sistance aux m&eacute;dicaments, tandis que JARID1B est n&eacute;cessaire pour l&#39;entretien de m&eacute;lanome. Les &eacute;tudes pr&eacute;cliniques sugg&egrave;rent l&#39;inhibition de ces enzymes peut supprimer la tumorigen&egrave;se et fournir une justification solide pour le d&eacute;veloppement de leurs inhibiteurs pour utilisation dans le traitement du cancer.

R&eacute;gulation &eacute;pig&eacute;n&eacute;tique de la Lysine d&eacute;m&eacute;thylase 5 (KDM5) Enzymes dans le Cancer.

&Auml;hnlich wie genetische Ver&auml;nderungen, tragen epigenetische Aberrationen erheblich zur Tumor-Initiierung und Progression. In vielen F&auml;llen werden diese Ver&auml;nderungen verursacht durch Aktivierung oder Inaktivierung der Regulierungsbeh&ouml;rden, die epigenetische Staaten unterhalten. Hier &uuml;berpr&uuml;fen wir unsere aktuelle Kenntnisse &uuml;ber die KDM5/JARID1-Familie von Histon-Demethylasen. Diese Familie der Enzyme enth&auml;lt eine JmjC-Dom&auml;ne und kann Tri - und di-Methyl-Marken von Lysin 4 auf Histon H3 zu entfernen. Unter dieser Proteine vermittelt RBP2 Resistenzen, w&auml;hrend JARID1B f&uuml;r Melanom-Wartung erforderlich ist. Pr&auml;klinische Studien legen nahe, Hemmung dieser Enzyme deutlich Begr&uuml;ndung f&uuml;r die Entwicklung von deren Inhibitoren f&uuml;r den Einsatz in der Krebstherapie bieten kann und Tumorentstehung unterdr&uuml;cken.

Epigenetische Regulierung durch Lysin-Demethylase 5 (KDM5) Enzyme im Krebs.

Alterazioni simili alla genetica, aberrazioni epigenetiche contribuiscono significativamente alla progressione e iniziazione tumorale. In molti casi, questi cambiamenti sono causati dall&#39;attivazione o inattivazione dei regolatori che mantenere stati epigenetici. Qui rivediamo la nostra conoscenza attuale sulla famiglia di istone demethylases KDM5/JARID1. Questa famiglia di enzimi &egrave; in grado di rimuovere i segni di tri - e di-metil da lisina 4 su istone H3 e contiene un dominio JmjC. Tra queste proteine, RBP2 media resistenza ai farmaci, mentre JARID1B &egrave; necessaria per la manutenzione di melanoma. Studi preclinici suggeriscono l&#39;inibizione di questi enzimi pu&ograve; sopprimere la tumorigenesi e fornire forti motivazioni per lo sviluppo dei loro inibitori per l&#39;uso nella terapia del cancro.

Regolazione epigenetica di lisina demetilasi 5 (KDM5) gli enzimi nel cancro.

&#x306B;&#x4F3C;&#x3066;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x6539;&#x5909;&#x3001;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x7570;&#x5E38;&#x306F;&#x5927;&#x5E45;&#x306B;&#x816B;&#x760D;&#x306E;&#x958B;&#x59CB;&#x305D;&#x3057;&#x3066;&#x9032;&#x884C;&#x306B;&#x8CA2;&#x732E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x5834;&#x5408;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x306F;&#x3001;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x3001;&#x4E0D;&#x6D3B;&#x6027;&#x306E;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x72B6;&#x614B;&#x3092;&#x7DAD;&#x6301;&#x3059;&#x308B;&#x898F;&#x5236;&#x5F53;&#x5C40;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5F15;&#x304D;&#x8D77;&#x3053;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306E;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x30C7;&#x30E1;&#x30C1;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC; KDM5/JARID1 &#x5BB6;&#x65CF;&#x306B;&#x95A2;&#x3059;&#x308B;&#x73FE;&#x5728;&#x306E;&#x77E5;&#x898B;&#x3092;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x30D5;&#x30A1;&#x30DF;&#x30EA;&#x30FC;&#x9175;&#x7D20;&#x306E; JmjC &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3057;&#x3001;&#x30C8;&#x30E9;&#x30A4;&#x3068;&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB; &#x30DE;&#x30FC;&#x30AF;&#x3092;&#x524A;&#x9664;&#x3059;&#x308B;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3; H3 &#x306E;&#x30EA;&#x30B7;&#x30F3; 4 &#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x53EF;&#x80FD;&#x3067;&#x3059;&#x3002;JARID1B &#x304C;&#x60AA;&#x6027;&#x9ED2;&#x8272;&#x816B;&#x306E;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C6;&#x30CA;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x5FC5;&#x8981;&#x304C;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x306F;&#x85AC;&#x5264;&#x8010;&#x6027; RBP2 &#x3092;&#x4EF2;&#x4ECB;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x524D;&#x81E8;&#x5E8A;&#x8A66;&#x9A13;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x963B;&#x5BB3;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x816B;&#x760D;&#x5F62;&#x6210;&#x306E;&#x6291;&#x5236;&#x3057;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x963B;&#x5BB3;&#x5264;&#x764C;&#x6CBB;&#x7642;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x4F7F;&#x7528;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x306E;&#x5F37;&#x529B;&#x306A;&#x7406;&#x8AD6;&#x7684;&#x6839;&#x62E0;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x5236;&#x5FA1;&#x30EA;&#x30B8;&#x30F3; &#x30C7;&#x30E1;&#x30C1;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC; 5 (KDM5) &#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x764C;&#x306E;&#x9175;&#x7D20;&#x3002;

&#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640; &#xC720;&#xC0AC;&#xD55C; &#xBCC0;&#xACBD; epigenetic aberrations &#xC885;&#xC591; &#xAC1C;&#xC2DC; &#xBC0F; &#xC9C4;&#xD589;&#xC5D0; &#xD06C;&#xAC8C; &#xAE30;&#xC5EC;&#xD560;. &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xACBD;&#xC6B0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xBCC0;&#xD654;&#xB294; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xB610;&#xB294; &#xBE44;&#xD65C;&#xC131;&#xD654; epigenetic &#xC0C1;&#xD0DC;&#xB97C; &#xC720;&#xC9C0; &#xD558;&#xB294; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xD130;&#xC758; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;&#xC11C; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; demethylases KDM5/JARID1 &#xC81C;&#xD488;&#xAD70;&#xC5D0; &#xD604;&#xC7AC; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC9C0;&#xC2DD;&#xC744; &#xAC80;&#xD1A0;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD6A8;&#xC18C;&#xC758;&#xC774; &#xAC00;&#xC871;&#xACFC; JmjC &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; &#xD3EC;&#xD568; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; h3&#xC5D0; lysine 4&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD2B8;&#xB77C;&#xC774; &#xBC0F; &#xB514; &#xBA54; &#xD2F8; &#xC790;&#xAD6D;&#xC744; &#xC81C;&#xAC70; &#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC911;&#xC5D0;&#xC11C; RBP2 jarid1b&#xB294; &#xD751;&#xC0C9; &#xC885; &#xC720;&#xC9C0; &#xBCF4;&#xC218;&#xC5D0; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; &#xC57D;&#xBB3C; &#xC800;&#xD56D; &#xC911;&#xC7AC;. &#xC804; &#xC784;&#xC0C1; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xD6A8;&#xC18C;&#xC758; &#xC800;&#xD574; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; tumorigenesis&#xC744; &#xC5B5;&#xC81C; &#xD558; &#xACE0; &#xC554; &#xCE58;&#xB8CC;&#xC5D0; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xC5B5;&#xC81C;&#xC81C;&#xC758; &#xAC1C;&#xBC1C;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xAC15;&#xB825;&#xD55C; &#xADFC;&#xAC70;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xAC83;&#xC774; &#xC88B;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Lysine Demethylase 5 (KDM5) &#xD558; &#xC5EC; epigenetic &#xC870;&#xC808; &#xD6A8;&#xC18C;&#xAC00; &#xC554;.

Alteraciones similares a gen&eacute;tica, epigen&eacute;ticas aberraciones contribuyen significativamente a la progresi&oacute;n y la iniciaci&oacute;n del tumor. En muchos casos, estos cambios son causados por la activaci&oacute;n o inactivaci&oacute;n de los reguladores que mantienen Estados epigen&eacute;ticos. Aqu&iacute; revisamos nuestros conocimientos actuales sobre la familia de KDM5/JARID1 de histonas demetilasas. Esta familia de enzimas contiene un dominio de JmjC y es capaz de eliminar marcas de tri - y di-metil de lisina 4 en la histona H3. Entre estas prote&iacute;nas, RBP2 media resistencia a los medicamentos, mientras que JARID1B es necesaria para el mantenimiento de melanoma. Estudios precl&iacute;nicos sugieren la inhibici&oacute;n de estas enzimas puede suprimir la tumorig&eacute;nesis y proporcionar fuerte fundamento para el desarrollo de sus inhibidores para uso en el tratamiento del c&aacute;ncer.

Regulaci&oacute;n epigen&eacute;tica por lisina demetilasa 5 (KDM5) enzimas en c&aacute;ncer.

&#x50CF;&#x5DEE;&#x5728;&#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x5982;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x53EF;&#x80FD;&#x4F1A;&#x5BFC;&#x81F4;&#x764C;&#x75C7;&#x3002;&#x89C6;&#x7F51;&#x819C;&#x6BCD;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7624;&#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D; 2 (RBP2 &#xFF1B; &#x4E5F;&#x79F0;&#x4E3A; JARID1A &#x6216; KDM5A&#xFF09; &#x53EF;&#x4EE5; demethylate &#x4E09;&#x548C; dimethylated &#x6C28;&#x9178; 4 &#x5728;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D; H3&#xFF0C;&#x54EA;&#x4E9B;&#x4ECB;&#x5BFC;&#x6D3B;&#x6027;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x7684;&#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20;&#x6807;&#x8BB0;&#xFF0C;&#x800C;&#x591A;&#x5185;&#x5206;&#x6CCC;&#x817A;&#x7624;&#x952E;&#x5165; 1 (MEN1) &#x80BF;&#x7624;&#x6291;&#x5236;&#x56E0;&#x5B50;&#x4FC3;&#x8FDB; H3K4 &#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x3002;&#x4EE5;&#x524D;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x8868;&#x660E; RBP2 &#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x4F5C;&#x7528;&#x6709;&#x52A9;&#x4E8E;&#x80BF;&#x7624;&#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x89C6;&#x7F51;&#x819C;&#x6BCD;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7624;&#x86CB;&#x767D; (pRB)&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x663E;&#x793A;&#x7684;&#x9057;&#x4F20; Rbp2 &#x6D88;&#x878D;&#x51CF;&#x5C11;&#x80BF;&#x7624;&#x7684;&#x5F62;&#x6210;&#x548C;&#x5EF6;&#x957F; Rb1(+/-) &#x5C0F;&#x9F20;&#x548C; Men1 &#x7F3A;&#x9677;&#x5C0F;&#x9F20;&#x751F;&#x5B58;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7814;&#x7A76; RBP2 &#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x8131;&#x6D3B;&#x52A8;&#x94FE;&#x63A5;&#x5230;&#x80BF;&#x7624;&#xFF0C;&#x764C;&#x75C7;&#x6CBB;&#x7597;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x6F5C;&#x5728;&#x76EE;&#x6807;&#x63D0;&#x540D; RBP2&#x3002;

&#x635F;&#x5931;&#x89C6;&#x7F51;&#x819C;&#x6BCD;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7624;&#x7ED3;&#x5408;&#x86CB;&#x767D; 2 (RBP2) &#x7684;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x8131;&#x6291;&#x5236;&#x7F3A;&#x4E4F; Rb1 &#x6216; Men1 &#x7684;&#x5C0F;&#x9F20;&#x80BF;&#x7624;&#x7684;&#x53D1;&#x751F;&#x3002;

Aberrations in epigenetic processes, such as histone methylation, can cause cancer. Retinoblastoma binding protein 2 (RBP2; also called JARID1A or KDM5A) can demethylate tri- and dimethylated lysine 4 in histone H3, which are epigenetic marks for transcriptionally active chromatin, whereas the multiple endocrine neoplasia type 1 (MEN1) tumor suppressor promotes H3K4 methylation. Previous studies suggested that inhibition of RBP2 contributed to tumor suppression by the retinoblastoma protein (pRB). Here, we show that genetic ablation of Rbp2 decreases tumor formation and prolongs survival in Rb1(+/-) mice and Men1-defective mice. These studies link RBP2 histone demethylase activity to tumorigenesis and nominate RBP2 as a potential target for cancer therapy.

Loss of the retinoblastoma binding protein 2 (RBP2) histone demethylase suppresses tumorigenesis in mice lacking Rb1 or Men1.

Aberrations dans les processus &#xE9;pig&#xE9;n&#xE9;tiques, tels que la m&#xE9;thylation des histones, peuvent causer le cancer. Prot&#xE9;ine du r&#xE9;tinoblastome liaison 2 (RBP2, aussi appel&#xE9; JARID1A ou KDM5A) peut d&#xE9;m&#xE9;thyler tri-et dim&#xE9;thyl&#xE9;e la lysine 4 de l&#x26;#39;histone H3, qui sont des marques &#xE9;pig&#xE9;n&#xE9;tiques pour la chromatine transcriptionnellement actif, alors que le type n&#xE9;oplasie endocrinienne multiple 1 (NEM1) suppresseur de tumeur favorise la m&#xE9;thylation H3K4. Des &#xE9;tudes ant&#xE9;rieures ont sugg&#xE9;r&#xE9; que l&#x26;#39;inhibition de RBP2 contribu&#xE9; &#xE0; la suppression des tumeurs par la prot&#xE9;ine du r&#xE9;tinoblastome (pRB). Ici, nous montrons que l&#x26;#39;ablation g&#xE9;n&#xE9;tique de Rbp2 diminue la formation de la tumeur et prolonge la survie des Rb1 (+ / -) des souris et des Men1 d&#xE9;fectueux souris. Ces &#xE9;tudes &#xE9;tablissent un lien RBP2 activit&#xE9; histone d&#xE9;m&#xE9;thylase &#xE0; la tumorigen&#xE8;se et de nommer RBP2 comme une cible potentielle pour le traitement du cancer.

Perte de la r&#xE9;tinoblastome Protein 2 (RBP2) D&#xE9;m&#xE9;thylase fixation sur les histones Supprime tumorigen&#xE8;se chez les souris d&#xE9;pourvues Rb1 ou Men1

Aberrationen in epigenetische Prozesse wie Histon-Methylierung, k&ouml;nnen Krebs verursachen. Retinoblastom verbindliches Protein 2 (RBP2; auch genannt JARID1A oder KDM5A) k&ouml;nnen demethylate Tri- und Dimethylated Lysin 4 in Histon H3, die epigenetischen Markierungen f&uuml;r transcriptionally aktiv Chromatin sind, w&auml;hrend die multiple endokrine Neoplasie Typ 1 (MEN1)-Tumorsuppressor f&ouml;rdert H3K4 Methylierung. Fr&uuml;here Studien vorgeschlagen, dass die Hemmung der RBP2 Tumor Unterdr&uuml;ckung durch das Retinoblastom-Protein (pRB) beigetragen. Hier zeigen wir, dass genetische Ablation des Rbp2 verringert die Tumorbildung und verl&auml;ngert das &Uuml;berleben bei Rb1(+/-) M&auml;usen und Men1-Genen M&auml;usen. Diese Studien link RBP2 Histon Demethylase Aktivit&auml;t zu Tumorentstehung und RBP2 als m&ouml;gliches Angriffsziel f&uuml;r Krebstherapie benennen.

Verlust des Retinoblastom verbindliches Protein 2 (RBP2) unterdr&uuml;ckt Histon Demethylase Tumorentstehung in M&auml;usen fehlt Rb1 oder Men1.

Aberrazioni nei processi epigenetici, come ad esempio la metilazione dell&#39;istone, possono provocare il cancro. Retinoblastoma binding protein 2 (RBP2; anche chiamato JARID1A o KDM5A) possono demethylate tri - e dimetilata lisina 4 in istone H3, che sono marchi epigenetici per cromatina transcriptionally active, considerando che la neoplasia endocrina multipla tipo 1 (MEN1) tumor suppressor promuove la metilazione H3K4. Precedenti studi ha suggerito che l&#39;inibizione della RBP2 hanno contribuito alla soppressione del tumore dalla proteina retinoblastoma (pRB). Qui, vi mostriamo quello genetici ablazione di Rbp2 riduce la formazione di tumori e prolunga la sopravvivenza in topi Rb1(+/-) e topi Men1-difettoso. Questi studi linkare RBP2 attivit&agrave; di istone demethylase tumorigenesi e nominano RBP2 come un potenziale bersaglio per la terapia del cancro.

Perdita della proteina del retinoblastoma 2 (RBP2) dell&#39;istone demethylase sopprime la tumorigenesi in topi privi di Rb1 o Men1.

&#x3053;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x306E;&#x7570;&#x5E38;&#x306F;&#x3001;&#x764C;&#x3092;&#x5F15;&#x304D;&#x8D77;&#x3053;&#x3059;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7DB2;&#x819C;&#x82BD;&#x7D30;&#x80DE;&#x816B;&#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;2&#xFF08;RBP2&#x3001;&#x307E;&#x305F;JARID1A&#x307E;&#x305F;&#x306F;KDM5A&#x3068;&#x3082;&#x547C;&#x3070;&#x308C;&#x308B;&#xFF09;&#x591A;&#x767A;&#x6027;&#x5185;&#x5206;&#x6CCC;&#x816B;&#x760D;1&#x578B;&#xFF08;MEN1&#xFF09;&#x816B;&#x760D;&#x30B5;&#x30D7;&#x30EC;&#x30C3;&#x30B5;&#x30FC;&#x306F;H3K4&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3092;&#x4FC3;&#x9032;&#x3059;&#x308B;&#x4E00;&#x65B9;&#x3001;&#x30C8;&#x30EA; - &#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x8EE2;&#x5199;&#x6D3B;&#x6027;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AF;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x3001;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;H3&#x306E;4&#x3001;&#x30B8;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x30EA;&#x30B8;&#x30F3;&#x8131;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x307E;&#x3067;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;RBP2&#x306E;&#x963B;&#x5BB3;&#x304C;&#x7DB2;&#x819C;&#x82BD;&#x7D30;&#x80DE;&#x816B;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#xFF08;PRB&#xFF09;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x816B;&#x760D;&#x6291;&#x5236;&#x306B;&#x5BC4;&#x4E0E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x305F;&#x3002; &#xFF08;+ /  - &#xFF09;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x3068;MEN1&#x6B20;&#x640D;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;Rbp2&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x30A2;&#x30D6;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;&#x816B;&#x760D;&#x5F62;&#x6210;&#x3092;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3055;&#x305B;&#x308B;&#x3068;RB1&#x306B;&#x751F;&#x5B58;&#x671F;&#x9593;&#x3092;&#x5EF6;&#x9577;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x3001;&#x816B;&#x760D;&#x5F62;&#x6210;&#x306B;RBP2&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x8131;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x3057;&#x3001;&#x304C;&#x3093;&#x6CBB;&#x7642;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x3068;&#x3057;&#x3066;RBP2&#x3092;&#x6307;&#x540D;&#x3059;&#x308B;&#x3002;

&#x7DB2;&#x819C;&#x82BD;&#x7D30;&#x80DE;&#x816B;&#x7D50;&#x5408;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;2&#xFF08;RBP2&#xFF09;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x8131;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x640D;&#x5931;&#x306F;&#x3001;Rb1&#x306E;&#x304B;&#x3001;MEN1&#x306E;&#x6B20;&#x640D;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x3067;&#x816B;&#x760D;&#x5F62;&#x6210;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3059;&#x308B;

&#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xB4F1;&#xC758; epigenetic &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xCC29;&#xC624;&#xB294; &#xC554;&#xC744; &#xC77C;&#xC73C;&#xD0AC; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Retinoblastoma &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; 2 (RBP2; &#xB610;&#xD55C; &#xB77C;&#xB294; JARID1A &#xB610;&#xB294; KDM5A)&#xC744; &#xBB36;&#xB294; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; demethylate transcriptionally &#xD65C;&#xC131; chromatin epigenetic &#xB9C8;&#xD06C;&#xB294; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; H3&#xC5D0;&#xC11C; dimethylated &#xBC0F; &#xD2B8;&#xB77C;&#xC774;-lysine 4, &#xC5EC;&#xB7EC; &#xB0B4; &#xBD84; &#xBE44; &#xC2E0; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xC785;&#xB825; 1 (MEN1) &#xC885;&#xC591; &#xC5B5;&#xC555; &#xD558;&#xB294; &#xBC18;&#xBA74; H3K4 &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654;&#xB97C; &#xCD09;&#xC9C4;. &#xC774;&#xC804; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294; rbp2&#xC758; &#xC800;&#xD574; retinoblastoma &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; (pRB)&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC885;&#xC591; &#xC5B5;&#xC81C;&#xC5D0; &#xAE30;&#xC5EC;&#xB97C; &#xC81C;&#xC548; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC790;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xADF8; &#xC720;&#xC804;&#xC790; rbp2&#xC758; &#xC808;&#xC81C; &#xC885;&#xC591;&#xC758; &#xD615;&#xC131;&#xC744; &#xAC10;&#xC18C; &#xD558; &#xACE0; Rb1(+/-) &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4; &#xBC0F; Men1 &#xACB0;&#xD568; &#xC950;&#xC758; &#xC0DD;&#xC874;&#xC744; &#xC5F0;&#xC7A5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC5F0;&#xAD6C; RBP2 &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; demethylase &#xD65C;&#xB3D9; tumorigenesis&#xC5D0; &#xC5F0;&#xACB0; &#xD558; &#xACE0; &#xC554; &#xCE58;&#xB8CC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xB300;&#xC0C1;&#xC73C;&#xB85C; rbp2&#xB97C; &#xC9C0;&#xBA85;.

&#xC190;&#xC2E4; retinoblastoma &#xC758;&#xBB34;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; (RBP2) 2&#xC758; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; demethylase Rb1 &#xB610;&#xB294; Men1 &#xBD80;&#xC871; &#xD55C; &#xC950;&#xC5D0;&#xC11C; tumorigenesis&#xB97C; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Aberraciones en los procesos epigen&#xE9;ticos, como la metilaci&#xF3;n de las histonas, pueden causar c&#xE1;ncer. La prote&#xED;na retinoblastoma vinculante 2 (RBP2, tambi&#xE9;n llamado JARID1A o KDM5A) puede demethylate tri-y dimetilado lisina 4 de la histona H3, que son las marcas epigen&#xE9;ticas de la cromatina para transcripcionalmente activo, mientras que el tipo de neoplasia endocrina m&#xFA;ltiple 1 (MEN1) supresor tumoral promueve H3K4 metilaci&#xF3;n. Estudios previos han sugerido que la inhibici&#xF3;n de RBP2 contribuido a la supresi&#xF3;n de tumores por la prote&#xED;na retinoblastoma (pRB). En este sentido, muestran que la ablaci&#xF3;n gen&#xE9;tica de Rbp2 disminuye la formaci&#xF3;n de tumores y prolonga la supervivencia en el Rb1 (+ / -) ratones y ratones hombres1 defectuosos. Estos estudios relacionan la actividad RBP2 desmetilasa histona a la tumorig&#xE9;nesis y nominar RBP2 como un objetivo potencial para la terapia del c&#xE1;ncer.

La p&#xE9;rdida de la desmetilasa Retinoblastoma prote&#xED;na de uni&#xF3;n 2 (RBP2) Histona Suprime la tumorig&#xE9;nesis en ratones que carecen Rb1 o hombres1

Lauren P. Blair

Department of Biochemistry and Molecular Biology

University of Arkansas for Medical Sciences

Application of MassSQUIRM for Quantitative Measurements of Lysine Demethylase Activity

Lauren P. Blair

.css-o250i3{font-size:18px;font-family:Open Sans,sans-serif;line-height:21.6px;}Department of Biochemistry and Molecular Biology

University of Arkansas for Medical Sciences

Application of MassSQUIRM for Quantitative Measurements of Lysine Demethylase Activity

Department of Biochemistry and Molecular Biology