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Resumen

Un método de alto rendimiento para la purificación negativa de un solo paso de Helicobacter pylori recombinante proteína activadora de neutrófilos (HP-PAN) sobreexpresado en Escherichia coli mediante el uso de resinas de dietilaminoetilo en modo batch se describe. HP-PAN purificado por este método es beneficioso para el desarrollo de vacunas, medicamentos o diagnósticos para H. pylori -asociado enfermedades.

Resumen

Helicobacter pylori proteína activadora de neutrófilos (HP-PAN) es un importante factor de virulencia de Helicobacter pylori (H. pylori). Desempeña un papel crítico en H. pylori inducida por inflamación gástrica mediante la activación de varios leucocitos innatos incluyendo neutrófilos, monocitos y mastocitos. Las propiedades inmunogénicas e inmunomoduladoras de HP-NAP lo convierten en un candidato potencial de diagnóstico y de vacuna para H. pylori y un nuevo fármaco candidato para la terapia del cáncer. Con el fin de obtener cantidades sustanciales de purificado HP-NAP utilizado por sus aplicaciones clínicas, un método eficaz para purificar esta proteína con alto rendimiento y pureza necesita ser establecido.

En este protocolo, hemos descrito un método para una sola etapa de purificación cromatográfica negativo de HP-NAP recombinante sobreexpresada en Escherichia coli (E. coli) mediante el uso de dietilaminoetilo resinas de intercambio iónico (DEAE) (por ejemplo., Sephadex) iel modo por lotes n. Recombinante HP-PAN constituye casi el 70% del total de proteínas en E. coli y está casi completamente recuperado en la fracción soluble tras la lisis celular a un pH de 9,0. Bajo la condición óptima a pH 8,0, la mayoría de HP-NAP se recupera en la fracción no unida, mientras que las proteínas endógenas de E. coli se eliminan de manera eficiente por la resina.

Este método de purificación mediante cromatografía de lote modo negativo con resinas de intercambio iónico DEAE produce funcional HP-NAP de E. coli en su forma nativa con alto rendimiento y pureza. El HP-PAN purificada podría ser utilizado más para la prevención, tratamiento y pronóstico de la H. pylori -asociado enfermedades, así como la terapia del cáncer.

Introducción

Helicobacter pylori (H. pylori) es una causa importante de gastritis y úlcera péptica. Esta bacteria también ha sido clasificado como un carcinógeno en humanos por parte de la Agencia Internacional para la Investigación sobre el Cáncer, que forma parte de la Organización Mundial de la Salud, en el año 1994. Se ha estimado que la prevalencia de H. pylori es del 70% en los países en desarrollo y del 30-40% en los países industrializados 1. A pesar de que la tasa de infección de H. pylori está disminuyendo en los países industrializados, la tasa de infección de H. pylori en los países en desarrollo sigue siendo alta 2. El tratamiento estándar para erradicar H. pylori consiste en la administración de un inhibidor de la bomba de protones, IBP y dos antibióticos, claritromicina o metronidazol más amoxicilina 3. Sin embargo, el aumento de la resistencia a los antibióticos en H. pylori relacionados con la PI terapia de úlceras insta al desarrollo de nuevas estrategias para prevenir or curar la infección. Desarrollo de la vacunación preventiva y / o terapéutica contra H. pylori podría proporcionar un enfoque alternativo para el control de H. pylori.

Helicobacter pylori proteína activadora de neutrófilos (NAP-HP), un importante factor de virulencia de H pylori, se identificó por primera vez en extractos de agua de H. pylori con la capacidad de activar los neutrófilos a adherirse a las células endoteliales y producir especies de oxígeno reactivas (ROS) 4. La infiltración de neutrófilos de la mucosa gástrica se encuentra en H. pylori pacientes infectados con gastritis activa pueden resultar en la inflamación y el daño tisular del estómago. Por lo tanto, HP-NAP puede jugar un papel patológico mediante la activación de los neutrófilos para inducir inflamación gástrica, lo que hace aún más úlcera o H. pylori -asociado enfermedades gástricas. Sin embargo, HP-PAN es un candidato potencial para aplicaciones clínicas 5,6. Debido a la pro inmunogénica e inmunomoduladorpiedades de HP-NAP, esta proteína se podrían utilizar para desarrollar vacunas, agentes terapéuticos, y herramientas de diagnóstico. Un ensayo clínico se ha realizado para el uso de HP-NAP recombinante como uno de los componentes de una vacuna de proteína contra H. pylori. Esta vacuna consiste en HP-NAP recombinante, asociado a la citotoxina gen A (CagA), y las proteínas vacuolizante citotoxina A (VacA) formulado con hidróxido de aluminio y además se ha demostrado que es segura e inmunogénica en humanos 7. Además, HP-PAN actúa como un potente inmunomodulador para desencadenar T auxiliares de tipo 1 (Th1) -polarized respuestas inmunes para la terapia del cáncer 8 y para regular hacia abajo las respuestas inmunitarias mediadas por Th2 provocadas por reacciones alérgicas e infecciones parasitarias 9,10. Como para el diagnóstico, recombinante ELISA basado en HP-PAN se ha aplicado a la detección de anticuerpos séricos contra HP-NAP en H. pylori pacientes infectados 11. Un estudio mostró que el nivel de anticuerpos HP-PAN-específica en sueros de H. pylori pacientes infectados con cáncer gástrico fue significativamente mayor que la de los pacientes con gastritis crónica 12. Otro estudio también demostró que los anticuerpos séricos contra HP-NAP se asocian con la presencia de no cardia adenocarcinoma gástrico 13. Por lo tanto, recombinante ELISA basado en HP-NAP se puede aplicar a la detección de anticuerpos séricos contra HP-NAP para el pronóstico del cáncer gástrico en H. pylori pacientes infectados. En su conjunto, el HP-PAN purificada podría ser utilizado más para la prevención, tratamiento y pronóstico de la H. pylori -asociado enfermedades, así como la terapia del cáncer.

Entre los diversos métodos utilizados para la purificación de recombinante HP-NAP expresado en Escherichia coli (E. coli) en su forma nativa informado hasta ahora, se necesita una cromatografía de filtración en gel segunda etapa de purificación que implica obtener alta pureza HP-NAP 14-16 . Aquí, un método que utiliza cromatografía de modo por lotes negativa condietilaminoetilo (DEAE) resinas de intercambio iónico se describe para la purificación de HP-NAP sobreexpresa en E. coli con alto rendimiento y alta pureza. Esta técnica de purificación se basa en la unión de proteínas y / o impurezas que no sean HP-PAN a la resina de la célula huésped. A pH 8,0, casi no hay otras proteínas, excepto HP-NAP se recuperan de la fracción no unida. Este enfoque purificación utilizando cromatografía de intercambio iónico de DEAE en el modo negativo es simple y ahorrando al permitir la purificación de HP-PAN recombinante mediante cromatografía de un solo paso a través de la recogida de la fracción no unida tiempo. Además de HP-NAP, varias otras biomoléculas, tales como virus 17, la inmunoglobulina G (IgG) 18, la hemoglobina 19, la proteína fosfatasa 20, y el factor de virulencia flagelina 21, también se han informado de que se purificó por cromatografía de intercambio de iones en negativo modo. Se prefiere el modo negativo para la cromatografía de intercambio iónico, si las impurezas son el menorcomponentes presentes en la muestra sometida a purificarse 22. La aplicación de la cromatografía negativo en la purificación de biomoléculas naturales o recombinantes se ha revisado recientemente 23.

El presente informe ofrece un paso a paso el protocolo para la expresión de HP-PAN recombinante en E. coli, lisis de las células, y la purificación de HP-NAP usando cromatografía por lotes modo negativo con resinas de intercambio iónico de DEAE. Si una proteína deseada para la purificación es adecuado para cromatografía de intercambio iónico en el modo negativo, el protocolo descrito también podría ser adaptado como punto de partida para el desarrollo de un proceso de purificación.

Protocolo

La sangre humana se obtuvo de voluntarios sanos con consentimiento informado por escrito antes y aprobación de la Junta de Revisión Institucional de la Universidad Nacional Tsing Hua, en Hsinchu, Taiwán.

1. La expresión del recombinante HP-PAN en E. coli

  1. Preparar el plásmido pET42a-NAP que contiene la secuencia de ADN de HP-NAP de H. pylori cepa 26695 16 como se describió previamente. Preparar los plásmidos que contienen la secuencia de ADN de HP-NAP con las mutaciones puntuales deseadas como se describe (véase el Protocolo, paso 8).
  2. Transformar 10 ng de los plásmidos de ADN anteriores en E. coli BL21 (DE3) células competentes por choque térmico durante 45 segundos a 42 ° C, las células consecutivas en caldo lysogeny (LB) placas de agar que contenían 50 mg / ml de kanamicina, e incubar las placas a 37 ° C durante 16 horas.
  3. Inocular colonias individuales en tubos individuales que contienen 5 ml de caldo LB con 50 mg / ml de kanamicina y crecer como cultivos previos en 37 ° C durante 16 horas con agitación a 170 rpm.
  4. Inocular 2 ml de las células pre-cultivo anterior en 200 ml de caldo LB que contenía 50 mg / ml de kanamicina en un matraz de 1 L. Incubar el matraz de cultivo inoculado a 37 ° C durante 2 horas con agitación a 170 rpm hasta que la absorbancia a 600 nm alcanza aproximadamente desde 0,4 hasta 0,5 detectado por un espectrofotómetro UV / VIS.
  5. Añadir 80 l de 1 M isopropílico β-D-1-tiogalactopiranósido (IPTG) en el cultivo anterior a una concentración final de 0,4 mM para inducir la expresión de HP-NAP. Incubar el cultivo durante 3 horas hasta que la absorbancia a 600 nm alcanza aproximadamente 1/6 a 1/7.
  6. Centrifugar las células a 6000 xga 4 ° C durante 15 minutos para eliminar el sobrenadante. Almacenar el sedimento de células a -70 ° C hasta la purificación.

2. Preparación de la fracción de proteína soluble que contiene HP-PAN

Nota: Todas las siguientes etapas se llevan a cabo a 4 ° C.

  1. Resuspender 50 ml de la célula pEllet preparado en el Protocolo de paso 1,6 en 20 ml de 20 mM Tris-HCl, pH 9,0, NaCl 50 mM que contiene 0,13 mM de fluoruro de fenilmetilsulfonilo (PMSF), 0,03 mM N-alfa-tosil-L-lisinil-clorometilcetona (TLCK), y 0,03 mM N-tosil-L-phenylalaninyl-clorometilcetona (TPCK) a 4 ° C como se ha descrito previamente 16.
  2. Romper las células de bacterias haciendo pasar la suspensión bacteriana a través de un homogeneizador de alta presión que funciona a una gama de 15.000 a 20.000 psi durante 7 veces a 4 ° C.
  3. Centrifugar el lisado de células a 30.000 × g a 4 ° C durante 1 hora para separar las fracciones de proteínas solubles e insolubles mediante el uso de una ultracentrífuga. Transferir el sobrenadante como la fracción de proteína soluble a un vaso de precipitados.
  4. Medir la concentración de proteína de la fracción de proteína soluble por el método de Bradford utilizando un kit comercial con albúmina de suero bovino (BSA) como el estándar de acuerdo con las instrucciones del fabricante.
  5. Añadir 177,6 l de HCl 1 N en 20 ml de THe fracción de proteína soluble obtenida de Protocolo paso 2.3, para ajustar el valor de pH desde pH 9,0 a pH 8,0.
  6. Añadir 20 mM Tris-HCl, pH 8,0, NaCl 50 mM a la solución de proteína de arriba para hacer la concentración de proteínas final sea 0,5 mg / ml.

3. Purificación de recombinante HP-NAP de E. coli mediante cromatografía modo por lotes negativo con resinas de intercambio iónico DEAE

  1. Preparar 15 ml de resinas DEAE.
    1. Pesar 0,6 g de polvo seco de resinas DEAE y suspenderlo en 30 ml de 20 mM Tris-HCl, pH 8,0, NaCl 50 mM a temperatura ambiente durante al menos 1 día.
    2. Se centrifuga la resina a 10.000 x g a 4 ° C durante 1 min.
    3. Retirar y desechar el sobrenadante.
    4. Añadir 15 ml de 20 mM Tris-HCl, pH 8,0, NaCl 50 mM.
    5. Repetir los pasos Protocolo 3.1.2 a 3.1.4 de cuatro veces más.
    6. Almacenar los 15 ml se establecieron resina (suspensión al 50% en 30 ml de tampón Tris) a 4 ° C para su uso posterior.
      Nota: Todos los siguientes pasoss se llevan a cabo a 4 ° C.
  2. Añadir 45 ml de las proteínas solubles preparadas en el Protocolo paso 2,6-15 ml de la resina y se agita la suspensión de proteína / resina con un agitador magnético a 4 ° C durante 1 hr.
  3. Se vierte la suspensión de proteína / resina en una columna de plástico o de vidrio equipado con una llave de paso. Deje que la resina se asiente por gravedad.
  4. Abrir la llave de paso para permitir que la solución de proteína a través de la columna por flujo de gravedad hasta que el nivel de líquido en la columna es justo por encima de la resina. Recoger el flujo a través de como la fracción no unida, que contiene el purificada HP-NAP.
  5. Añadir 15 ml de helado de 20 mM Tris-HCl, pH 8,0, NaCl 50 mM en la columna.
  6. Abrir la llave de paso para permitir que el tampón de lavado a través de la columna por flujo de gravedad hasta que el nivel de líquido en la columna es justo por encima de la resina. Recoger el flujo a través de como la fracción de lavado.
  7. Repetir los pasos Protocolo de 3.5 a 3.6 cuatro veces más para recoger las fracciones de lavado adicionales.
  8. Añadir 15 ml de helado de 20 mM Tris-HCl, pH 8,0, 1 M NaCl en una columna.
  9. Abrir la llave de paso para permitir que el tampón de elución a través de la columna por flujo de gravedad hasta que el nivel de líquido en la columna es justo por encima de la resina. Recoger el flujo a través de como la fracción de elución.
  10. Repetir los pasos Protocolo de 3,8 a 3,9 cuatro veces más para recoger las fracciones de elución adicionales.

4. El cambio de tampón y la eliminación de endotoxina de HP-PAN purificó mediante cromatografía en modo batch negativa con DEAE Resinas

Nota: El purificada HP-NAP expresa en E. coli tiene que ser sometido a intercambio de tampón y la eliminación de endotoxina antes de estimular neutrófilos.

  1. Realizar la diálisis para cambiar el tampón de la purificado HP-PAN a la solución salina tamponada con fosfato de Dulbecco (D-PBS), pH 7,2, a 4 ° C mediante el uso de un tubo de diálisis con corte de peso molecular de 14 kDa como se ha descrito previamente 24.
  2. Se filtra la HP-PAN se dializa a través de un syringfiltro de correo con una membrana cargada positivamente, hidrófila unida a una jeringa desechable de 20 ml a velocidades de flujo entre 2,5 y 4 ml / minuto a 4 ° C para eliminar la endotoxina.

5. Caracterización de las propiedades moleculares de recombinante purificada HP-PAN por dodecil sulfato de sodio-poliacrilamida electroforesis en gel (SDS-PAGE), Western Blot, nativo-PAGE, cromatografía de filtración en gel y dicroísmo circular Espectroscopía

  1. Analizar el purificada HP-NAP recombinante por SDS-PAGE y transferencia Western con sobrenadantes de cultivo de hibridoma que contiene el anticuerpo monoclonal de ratón MAb 16F4 25 como se describió anteriormente 24.
  2. Analizar el HP-PAN se purifica mediante nativo-PAGE y cromatografía de filtración en gel para examinar su estado oligomérico como se ha descrito previamente 26.
  3. Analizar el purificada HP-PAN recombinante mediante espectroscopía de dicroísmo circular para examinar su estructura secundaria como se ha descrito previamente 26.

6. Evaluación de la pureza de HP-PAN por tinción de plata de un gel SDS-PAGE

  1. Preparar la solución de fijación, solución, solución de plata, solución de revelado sensibilizante, la solución de parada, y la solución de lavado de acuerdo con las instrucciones del fabricante de un kit de tinción de plata.
  2. Realizar tinción de plata de un gel SDS-PAGE de acuerdo con las instrucciones del fabricante de un kit de tinción de plata.
  3. Adquirir la imagen del gel con un sistema de imagen.

7. Medición de la Producción de ROS por los neutrófilos inducida por HP-PAN

  1. Aislar los neutrófilos humanos a partir de sangre heparinizada humana mediante sedimentación con dextrano seguido de centrifugación en gradiente de densidad como se describió anteriormente 24.
  2. Medición de la producción de ROS por los neutrófilos estimulados con HP-NAP mediante el uso de un ensayo de quimioluminiscencia de luminol-dependiente.
    1. Encienda un lector de placas y ajustar la temperatura a 37 ° C. Coloque unainferior plato vacío plana de 96 pocillos blanca dentro de la cámara de lector de placas, lo que permite que se caliente a 37 ° C.
    2. Preparar las mezclas de estímulo en el D-PBS, pH 7,2, que contiene 0,9 mM CaCl 2, 0,5 mM MgCl 2, y 13,3 M 5-amino-2,3-dihidro-1,4-phthalazinedione (luminol) con la presencia y ausencia de 0,67 M-endotoxina eliminado HP-PAN preparado a partir de Protocolo paso 4.2.
    3. Ajustar la concentración de neutrófilos humanos preparados a partir de Protocolo de paso 7,1 a 2 x 10 6 células / ml en D-PBS, pH 7,2, que contenía glucosa 5 mM.
    4. Añadir 50 l de suspensión de neutrófilos en cada pocillo de la placa de 96 pocillos tiempo.
    5. Añadir 150 l de las mezclas preparadas a partir de estímulo Protocolo paso 7.2.2 en los neutrófilos así que contienen en un intervalo de tiempo de 5 segundos por pocillo.
    6. Medir la emisión de quimioluminiscencia durante 5 segundos por pocillo durante un período de tres horas usando un lector de placas.

8.Construcción de plásmidos de ADN que albergan HP-PAN mutantes por Reacción en Cadena de Polimerasa (PCR) a base de mutagénesis directa

Nota: mutagénesis directa basada en PCR fue generado básicamente como se ha descrito previamente 27, excepto que los sitios de restricción "silenciosas" fueron introducidos en los cebadores de mutagénesis por mutagénesis dirigida (SDM) software -Ayudar 28.

  1. Realizar la reacción de PCR.
    1. Añadir 10 ng de plásmido pET42a-NAP, 1 M de pares de cebadores de mutagénesis listados en la Tabla 1, 200 mM de trifosfatos de desoxinucleósidos (dNTP), y 3 unidades de alta fidelidad mezcla de enzimas PCR en un tubo de PCR que contiene agua desionizada, dando una final volumen de 25 l.
    2. Iniciar los ciclos de PCR en 95 ° C durante 10 minutos para desnaturalizar el ADN molde, y sigue con 12 ciclos de amplificación a 95 ° C durante 1 minuto, Tm sin -5 ° C durante 1 minuto y 72 ° C durante 6 minutos.
    3. Terminar los ciclos de PCR conuna etapa de recocido en T m pp -5 ° C durante 1 minuto y una etapa de extensión a 72 ° C durante 30 min.
  2. Tratar 15 l de producto de PCR con 0,4 l de enzima de restricción Dpn I a 37 ° C durante 2 horas y luego analizar 2 l del producto de PCR tratado con Dpn I mediante electroforesis en gel de agarosa.
  3. mutantes de pantalla.
    1. Transformar 2 l de producto de PCR en E. coli DH5a células competentes por choque térmico de 45 segundos a 42 ° C.
    2. Propagar las células transformadas en una placa LB que contiene 50 mg / ml de kanamicina y se incuba la placa a 37 ° C durante 16 horas.
    3. Aislar el ADN plasmídico de las colonias bacterianas utilizando un kit comercial de lisis alcalina de acuerdo con el protocolo del fabricante.
    4. Se trata el ADN de plásmido aislado en el Protocolo paso 8.3.3 con enzima de restricción XhoI para verificar la presencia de las mutaciones silenciosas deseado de acuerdo con el protocolo del fabricante.
    5. secuencia de laplásmido de ADN verificado por paso Protocolo 8.3.4 con el cebador promotor T7 para confirmar la corrección de las secuencias codificantes de mutantes HP-NAP según el protocolo del fabricante.

Resultados

El diagrama esquemático del procedimiento experimental de la purificación negativa de recombinante HP-NAP expresa en E. coli mediante el uso de resinas de intercambio iónico de DEAE en modo por lotes se muestra en la Figura 1. Esta técnica de purificación se basa en la unión de proteínas y / o impurezas que no sean HP-PAN a la resina de la célula huésped. A pH 8,0, casi no hay otras proteínas, excepto HP-NAP en su forma nativa se recuperan de la fracci...

Discusión

La cromatografía por lotes modo negativo con resinas de intercambio aniónico DEAE que aquí se presenta es adecuado para la purificación de HP-NAP recombinante sobreexpresada en E coli. Los valores de pH de los tampones utilizados en las etapas de lisis celular y la purificación son muy críticos para asegurar la solubilidad de HP-NAP en E. Los lisados ​​de E. coli y la separación eficiente de HP-NAP recombinante a partir de las impurezas de la célula huésped, respectivamente. Las c...

Divulgaciones

HWF and YCY are inventors of patents TW I 432579 and US 8,673,312 for the method of one-step purification of Helicobacter pylori neutrophil-activating protein. All materials described in the manuscript will be available for research purposes. The authors confirm that this does not alter their adherence to all of the JoVE's policies on sharing data and materials.

Agradecimientos

We thank Dr. Chao-Sheng Cheng at National Tsing Hua University, Taiwan, for performing the circular dichroism measurement. We also thank Drs. Evanthia Galanis and Ianko D. Iankov at Mayo Clinic, USA, for providing the anti-HP-NAP monoclonal antibody. We appreciate Drs. Han-Wen Chang and Chung-Chu Chen at Mackay Memorial Hospital, Hsinchu, Taiwan, for providing advice for IRB application, Mr. Te-Lung Tsai at the Mackay Memorial Hospital, Hsinchu, Taiwan, for supervising the analysis of isolated neutrophils, and Ms. Ju-Chen Weng at National Tsing Hua University, Taiwan, for her technical assistance. This work was supported by grants from the Ministry of Science and Technology of Taiwan (MOST 104-2311-B-007-003, NSC101-2311-B-007-007 and NSC98-2311-B-007-006-MY3), the Joint Research Program of National Tsing Hua University and Mackay Memorial Hospital (100N7727E1, 101N2727E1, 103N2773E1), and the research program of National Tsing Hua University (104N2052E1).

Materiales

NameCompanyCatalog NumberComments
Material
pET42a-NAP N/AN/Aprepared as described in Supplementary data of Refernce 15 
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006291X08018317
E. coli BL21 (DE3)Thermo Fisher Scientific IncC6000-03https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/C600003
KanamycinAmresco25389-94-0http://www.amresco-inc.com/KANAMYCIN-SULFATE-0408.cmsx
Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside (IPTG)MD Biomedical Inc101-367-93-1http://www.antibody-antibodies.com/product_det.php?id=238064&supplier=search&name
=IPTG%20
phenylmethylsulfonyl fluoride (PMSF)Sigma-Aldrich10837091001protease inhibitor
http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/roche/PMSFRO?lang=en&region=TW
N-alpha-tosyl-L-lysinyl-chloromethylketone (TLCK)Sigma-AldrichT7254protease inhibitor
http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/t7254?lang=en&region=TW
N-tosyl-L-phenylalaninyl-chloromethylketone (TPCK)Sigma-AldrichT4376protease inhibitor
http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/t4376?lang=en&region=TW
Protein standard (bovine serum albumin)Sigma-AldrichP5619 a standard protein for Bio-Rad Protein Assay
http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/fluka/p5619?lang=en&region=TW
DEAE–Sephadex  A-25 chloride formSigma-AldrichA25120http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/a25120?lang=en&region=TW
Spectrum/Por dialysis tubingSpectrum Laboratories132720with molecular weight cutoff of 14 kDa
http://www.spectrumlabs.com/dialysis/RCtubing.html?Pn=132720;
Acrodisc® units with Mustang® E membranePallMSTG25E3for endotoxin removal; operated at flow rates ranging from 1 to 4 ml/min
http://www.pall.com/main/laboratory/product.page?id=19992
mouse monoclonal antibody MAb 16F4N/AN/Araised against the purified HP-NAP of H. pylori strain NCTC 11637 as described in Refernce 23;  A gift from Drs. Evanthia Galanis and Ianko D. Iankov at Mayo Clinic, USA
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0264410X10017585
HiLoad 16/600 Superdex 200 pgGE Healthcare Life Sciences28989335for gel filtration chromatography
http://www.gelifesciences.com/webapp/wcs/stores/servlet/productById/en/GELifeSciences-tw/28989335
PlusOne silver staining kit, proteinGE Healthcare Life Sciences17-1150-01http://www.gelifesciences.com/webapp/wcs/stores/servlet/productById/en/GELifeSciences-tw/17115001
Ficoll-Paque PLUSGE Healthcare Life Sciences17-1440-02for density gradient centrifugation to purify human neutrophils
http://www.gelifesciences.com/webapp/wcs/stores/servlet/catalog/en/GELifeSciences-tw/products/AlternativeProductStructure
_16963/17144002
Flat bottom 96-well white plateThermo Fisher Scientific Inc236108http://www.thermoscientific.com/en/product/nunc-f96-microwell-black-white-polystyrene-plate.html
LuminolSigma-AldrichA8511protected from light
http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/a8511?lang=en&region=TW
Expand  long template PCR systemSigma-Aldrich11681834001source of High Fidelity PCR enzyme mix
http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/roche/elongro?lang=en&region=TW
Dpn INew England BiolabsR0176Shttps://www.neb.com/products/r0176-dpni
Xho INew England BiolabsR0146Shttps://www.neb.com/products/r0146-xhoi
E. coli DH5αThermo Fisher Scientific Inc18265-017https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/18265017
NameCompanyProduct NumberComments
Equipment
 
U-2800 double beam UV/VIS spectrophotometerHitachi N/Aout of market and upgraded to a new model
http://hitachi-hta.com/products/life-sciences-chemical-analysis/uvvisible-spectrophotometers
EmulsiFlex-C3 high pressure homogenizerAvestin IncC315320http://www.avestin.com/English/c3page.html
Hitachi Koki himac CP80WX general ultracentrifugeHitachi Koki Co90106401for separation of the soluble and insoluble protein fractions from E. coli lysates
http://centrifuges.hitachi-koki.com/products/ultra/cp_wx/cp_wx.html
ÄKTA FPLCGE Healthcare Life Sciences18-1900-26for gel filtration chromatography
http://www.gelifesciences.com/webapp/wcs/stores/servlet/productById/en/GELifeSciences-tw/18190026
Aviv model 62ADS CD spectrophotometerAviv BiomedicalN/Aout of market and upgraded to a new model http://www.avivbiomedical.com/circular.php
LAS-3000 imaging systemFujifilmN/Adiscontinued and replaced
http://www.gelifesciences.com/webapp/wcs/stores/servlet/productById/en/GELifeSciences-tw/28955810
Wallac 1420 (Victor2) multilabel counterPerkin-Elmer1420-018for chemiluminescence detection
http://www.perkinelmer.com/catalog/product/id/1420-018

Referencias

  1. Brunette, G. W., et al. Chapter 3, Infectious diseases related to travel. CDC Health Information for International Travel 2016. , (2015).
  2. Bauer, B., Meyer, T. F. The human gastric pathogen Helicobacter pylori its association with gastric cancer and ulcer disease. Ulcers. 2011, 340157 (2011).
  3. Malfertheiner, P., et al. Management of Helicobacter pylori infection--the Maastricht IV/ Florence Consensus Report. Gut. Gut. 61 (5), 646-664 (2012).
  4. Evans, D. J., et al. Characterization of a Helicobacter pylori neutrophil-activating protein. Infect. Immun. 63 (6), 2213-2220 (1995).
  5. Fu, H. W. Helicobacter pylori neutrophil-activating protein: from molecular pathogenesis to clinical applications. World J. Gastroenterol. 20 (18), 5294-5301 (2014).
  6. de Bernard, M., D'Elios, M. M. The immune modulating activity of the Helicobacter pylori HP-NAP: Friend or foe?. Toxicon. 56 (7), 1186-1192 (2010).
  7. Malfertheiner, P., et al. Safety and immunogenicity of an intramuscular Helicobacter pylori in noninfected volunteers: a phase I study. Gastroenterology. 135 (3), 787-795 (2008).
  8. Codolo, G., et al. HP-NAP inhibits the growth of bladder cancer in mice by activating a cytotoxic Th1 response. Cancer Immunol. Immunother. 61 (1), 31-40 (2012).
  9. Codolo, G., et al. The neutrophil-activating protein of Helicobacter pylori Th2 inflammation in ovalbumin-induced allergic asthma. Cell. Microbiol. 10 (11), 2355-2363 (2008).
  10. Del Prete, ., G, , et al. Immunosuppression of TH2 responses in Trichinella spiralis by Helicobacter pylori neutrophil-activating protein. J. Allergy Clin. Immunol. 122 (5), 908-913.e5 (2008).
  11. Tang, R. X., Luo, D. J., Sun, A. H., Yan, J. Diversity of Helicobacter pylori in expression of antigens and induction of antibodies. World J. Gastroenterol. 14 (30), 4816-4822 (2008).
  12. Long, M., Luo, J., Li, Y., Zeng, F. Y., Li, M. Detection and evaluation of antibodies against neutrophil-activating protein of Helicobacter pylori in patients with gastric cancer. World J. Gastroenterol. 15 (19), 2381-2388 (2009).
  13. Song, H., et al. A CagA-independent cluster of antigens related to the risk of noncardia gastric cancer: associations between Helicobacter pylori and gastric adenocarcinoma explored by multiplex serology. Int. J. Cancer. 134 (12), 2942-2950 (2014).
  14. Kottakis, F., et al. Helicobacter pylori neutrophil-activating protein activates neutrophils by its C-terminal region even without dodecamer formation, which is a prerequisite for DNA protection--novel approaches against Helicobacter pylori inflammation. FEBS J. 275 (2), 302-317 (2008).
  15. Thoreson, A. C., et al. Differences in surface-exposed antigen expression between Helicobacter pylori isolated from duodenal ulcer patients and from asymptomatic subjects. J. Clin. Microbiol. 38 (9), 3436-3441 (2000).
  16. Wang, C. A., Liu, Y. C., Du, S. Y., Lin, C. W., Fu, H. W. Helicobacter pylori neutrophil-activating protein promotes myeloperoxidase release from human neutrophils. Biochem. Biophys. Res. Commun. 377 (1), 52-56 (2008).
  17. Iyer, G., et al. Reduced surface area chromatography for flow-through purification of viruses and virus like particles. J. Chromatogr. A. 1218 (26), 3973-3981 (2011).
  18. Wongchuphan, R., et al. Purification of rabbit polyclonal immunoglobulin G using anion exchangers. Process Biochem. 46 (1), 101-107 (2011).
  19. Lu, X., Zhao, D., Su, Z. Purification of hemoglobin by ion exchange chromatography in flow-through mode with PEG as an escort. Artif. Cells Blood Substit. Immobil. Biotechnol. 32 (2), 209-227 (2004).
  20. Brooks, S. P., Storey, K. B. Purification and characterization of a protein phosphatase that dephosphorylates pyruvate kinase in an anoxia tolerant animal. Biochem. Mol. Biol. Int. 38 (6), 1223-1234 (1996).
  21. Gewirtz, A. T., et al. Salmonella typhimurium translocates flagellin across intestinal epithelia, inducing a proinflammatory response. J. Clin. Invest. 107 (1), 99-109 (2001).
  22. Levison, P. R. Large-scale ion-exchange column chromatography of proteins: Comparison of different formats. J. Chromatogr. B Analyt. Technol. Biomed. Life Sci. 790 (1-2), 17-33 (2003).
  23. Lee, M. F. X., Chan, E. S., Tey, B. T. Negative chromatography: Progress, applications and future perspectives. Process Biochem. 49 (6), 1005-1011 (2014).
  24. Yang, Y. C., et al. High yield purification of Helicobacter pylori neutrophil-activating protein overexpressed in Escherichia coli. BMC biotechnol. 15 (23), (2015).
  25. Iankov, I. D., Haralambieva, I. H., Galanis, E. Immunogenicity of attenuated measles virus engineered to express Helicobacter pylori neutrophil-activating protein. Vaccine. 29 (8), 1710-1720 (2011).
  26. Shih, K. S., et al. One-step chromatographic purification of Helicobacter pylori protein expressed in Bacillus subtilis. PLoS One. 8 (4), e60786 (2013).
  27. Liu, H., Naismith, J. H. An efficient one-step site-directed deletion, insertion, single and multiple-site plasmid mutagenesis protocol. BMC biotechnol. 8 (91), (2008).
  28. Karnik, A., Karnik, R., Grefen, C. SDM-assist software to design site-directed mutagenesis primers introducing 'silent' restriction sites. BMC bioinformatics. 14 (105), (2013).

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