Una vez que se ha recopilado un conjunto de datos TIMS TOF MS/MS en el modo pasivo de adquisición dependiente de datos, o DDA, ejecute la adquisición independiente de datos, o DIA, en la aplicación de software de movilidad iónica. Para ello, primero cargue el método DDA guardado anteriormente. Cambie la espectrometría de masas a fragmentación pasiva DIA.
Deje todos los demás ajustes igual. En la pestaña MS/MS, seleccione editar ventanas, luego use el botón abrir análisis ubicado en la parte superior de la ventana emergente de DIA y cargue el conjunto de datos de DDA guardado anteriormente. Cuando aparezca un mapa de calor en la parte inferior izquierda, que muestra un polígono de ventanas que se extiende en diagonal a través del gráfico, haga clic y arrastre para cambiar el tamaño del polígono para que se ajuste a los datos del mapa de calor.
Establezca el número de ventanas de movilidad en el ancho por masa y la superposición. Haga clic en calcular ventanas en la parte inferior derecha de la ventana emergente para ver las ventanas que se muestran con la nueva configuración. Una vez que sea adecuado, haga clic en aplicar.
