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Concentration of Metabolites from Low-density Planktonic Communities for Environmental Metabolomics using Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy

Environmental metabolomics is an emerging field that is promoting new understanding in how organisms respond to and interact with the environment and each ...

RIKEN Advanced Science Institute

&#x5F88;&#x5C11;&#x7814;&#x7A76;&#x4E86;&#x4EE5;&#x4E0A;&#x6D77;&#x6C34;&#x76D0;&#x5EA6;&#x5728; 45 &#x6444;&#x6C0F;&#x5EA6;&#x4EE5;&#x4E0A;&#x7684;&#x6E29;&#x5EA6;&#x4E0B;&#x751F;&#x957F;&#x7684;&#x84DD;&#x85FB;&#x3002;&#x4ECE;&#x7845;&#x8D28;&#x58F3;&#x5728; 40-45 &#x5EA6; C &#x5728;&#x897F;&#x5357;&#x51B0;&#x5C9B;&#x5730;&#x70ED;&#x6D77;&#x6C34;&#x54B8;&#x6C34;&#x6E56;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x79CD;&#x7C7B;&#x578B;&#x7684;&#x70ED;&#x55DC;&#x76D0;&#x8131;&#x8272;&#x84DD;&#x85FB;&#x662F;&#x9694;&#x7EDD;&#x7684;&#x3002;&#x51B0;&#x5C9B;&#x514B;&#x9686; 2e&#xFF0C;Leptolyngbya &#x53D8;&#x5F02;&#x73B0;&#x8C61;&#x88AB;&#x9009;&#x4F5C;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x6587;&#x5316;&#x589E;&#x957F;&#x4EA6;&#x53EA;&#x5728; 45-50 &#x6444;&#x6C0F;&#x5EA6;&#xFF0C;&#x5728;&#x4ECB;&#x8D28;&#x4ECE; 28 &#x5230; 94 g L(-1) TDS&#xFF0C;&#x5B83;&#x8868;&#x73B0;&#x4E86; 3 &#x5E76;&#x5408;&#x6570; 24 h(-1) &#x4E0B;&#x8FDE;&#x7EED;&#x7167;&#x660E;&#x3002;&#x67D0;&#x79CD;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x4E0A;&#x51CF;&#x5C11;&#x6B64;&#x901F;&#x7387; 54 &#x6444;&#x6C0F;&#x5EA6;&#xFF0C;&#x548C;&#x6B7B;&#x4EA1;&#x53D1;&#x751F;&#x5728; 58 &#x6444;&#x6C0F;&#x5EA6;&#x3002;&#x4E0E; NCBI &#x6570;&#x636E;&#x5E93;&#x4E2D;&#x7684;&#x6240;&#x6709;&#x5176;&#x4ED6;&#x4EBA;&#x7684; 16S rDNA &#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x6BD4;&#x8F83;&#x663E;&#x793A; 2 &#x4ECE;&#x683C;&#x9675;&#x5170;&#x5C9B;&#x6E29;&#x6CC9; (13-16 g L(-1) TDS) &#x6709;&#x5173; Leptolyngbya &#x682A;&#x3002;&#x4E09;&#x4E2A;&#x5176;&#x4ED6;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x662F;&#x4ECE; Leptolyngbya &#x5206;&#x79BB;&#x7269;&#x5E72;&#x71E5;&#x3001; endolithic &#x751F;&#x5883;&#x5728;&#x9EC4;&#x77F3;&#x56FD;&#x5BB6;&#x516C;&#x56ED;&#x3002;&#x6240;&#x6709; 6 &#x90FD;&#x5F62;&#x6210;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x53D1;&#x80B2;&#x8FDB;&#x5316;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x8868;&#x660E;&#x5171;&#x540C;&#x7684;&#x7956;&#x5148;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x83CC;&#x682A;&#x5171;&#x4EAB;&#x5BF9;&#x6E29;&#x5EA6;&#x548C;&#x76D0;&#x5EA6;&#x8303;&#x56F4;&#x548C; optima &#x51B0;&#x5C9B;&#x514B;&#x9686; 2e &#x7684;&#x8BB8;&#x591A;&#x76F8;&#x4F3C;&#x4E4B;&#x5904;&#x3002;&#x4E24;&#x4E2A; endolithic Leptolyngbya &#x682A;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x524D;&#x5728; 23 &#x6444;&#x6C0F;&#x5EA6;&#x751F;&#x957F;&#x5728;&#x6DE1;&#x6C34;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x589E;&#x957F;&#x4E5F;&#x5728; 50 &#x6444;&#x6C0F;&#x5EA6;&#xFF0C;&#x4F46;&#x53EA;&#x6709;&#x5728;&#x76D0;&#x6C34;&#x4ECB;&#x8D28;&#x4E2D;&#x3002;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x663E;&#x793A;&#x6709;&#x9650;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x578B;&#x76F8;&#x4F3C;&#x6027;&#x53EF;&#x663E;&#x793A;&#x51FA;&#x4E00;&#x4E9B;&#x7A81;&#x51FA;&#x7684;&#x8868;&#x578B;&#x76F8;&#x4F3C;&#x4E4B;&#x5904;&#xFF0C;&#x751A;&#x81F3;&#x5F53;&#x76F8;&#x5173;&#x7684;&#x84DD;&#x85FB;&#x4ECE;&#x6781;&#x4E3A;&#x4E0D;&#x540C;&#x548C;&#x8FDC;&#x7A0B;&#x7684;&#x6816;&#x606F;&#x5730;&#x3002;

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Cyanobacteria that grow above seawater salinity at temperatures above 45 degrees C have rarely been studied. Cyanobacteria of this type of thermo-halophilic extremophile were isolated from siliceous crusts at 40-45 degrees C in a geothermal seawater lagoon in southwest Iceland. Iceland Clone 2e, a Leptolyngbya morphotype, was selected for further study. This culture grew only at 45-50 degrees C, in medium ranging from 28 to 94 g L(-1) TDS, It showed 3 doublings 24 h(-1) under continuous illumination. This rate at 54 degrees C was somewhat reduced, and death occurred at 58 degrees C. A comparison of the 16S rDNA sequence with all others in the NCBI database revealed 2 related Leptolyngbya isolates from a Greenland hot spring (13-16 g L(-1) TDS). Three other similar sequences were from Leptolyngbya isolates from dry, endolithic habitats in Yellowstone National Park. All 6 formed a phylogenetic clade, suggesting common ancestry. These strains shared many similarities to Iceland Clone 2e with respect to temperature and salinity ranges and optima. Two endolithic Leptolyngbya isolates, grown previously at 23 degrees C in freshwater medium, grew well at 50 degrees C but only in saline medium. This study shows that limited genotypic similarity may reveal some salient phenotypic similarities, even when the related cyanobacteria are from vastly different and remote habitats.

An unusual cyanobacterium from saline thermal waters with relatives from unexpected habitats.

Les cyanobact&eacute;ries qui poussent au-dessus de salinit&eacute; de l&#39;eau de mer &agrave; une temp&eacute;rature sup&eacute;rieure &agrave; 45 degr&eacute;s C ont rarement &eacute;t&eacute; &eacute;tudi&eacute;s. Les cyanobact&eacute;ries de ce type d&#39;extremophile thermo-halophile ont &eacute;t&eacute; isol&eacute;s d&#39;encro&ucirc;tements siliceuses &agrave; 40-45 degr&eacute;s C dans une lagune d&#39;eau de mer g&eacute;othermique dans le sud-ouest de l&#39;Islande. Islande Clone 2e, un morphotype Leptolyngbya, a &eacute;t&eacute; s&eacute;lectionn&eacute; pour une &eacute;tude plus approfondie. Cette culture a augment&eacute; seulement &agrave; 45-50 degr&eacute;s C, en moyenne allant de 28 &agrave; 94 g L(-1) TDS, il a montr&eacute; 3 doublements 24 &eacute;vidence sous un &eacute;clairement continu. Ce taux &agrave; 54 degr&eacute;s C &eacute;tait quelque peu r&eacute;duit, et le d&eacute;c&egrave;s est survenu &agrave; 58 degr&eacute;s C. Une comparaison de la s&eacute;quence de l&#39;ADNr 16 s avec tous les autres dans la base de donn&eacute;es NCBI a r&eacute;v&eacute;l&eacute; 2 associ&eacute;s Leptolyngbya isolats provenant d&#39;une source chaude de Groenland (13-16 g L(-1) TDS). Trois autres s&eacute;quences semblables ont &eacute;t&eacute; de Leptolyngbya isolats provenant de milieux secs, d&#39;endolithiques dans le Parc National de Yellowstone. Tous les 6 forment un clade phylog&eacute;n&eacute;tique, sugg&eacute;rant une ascendance commune. Ces souches partagent beaucoup de similitudes &agrave; Islande Clone 2e en ce qui concerne les plages de temp&eacute;rature et de salinit&eacute; et optima. Deux isolats de Leptolyngbya endolithiques, cultiv&eacute;es auparavant &agrave; 23 degr&eacute;s C dans un milieu d&#39;eau douce, a grandi bien &agrave; 50 degr&eacute;s C, mais seulement dans un milieu salin. Cette &eacute;tude montre que similitude g&eacute;notypique limit&eacute;e peut r&eacute;v&eacute;ler certaines similitudes ph&eacute;notypiques saillants, m&ecirc;me lorsque les cyanobact&eacute;ries connexes sont des habitats tr&egrave;s diff&eacute;rents et distants.

Une cyanobact&eacute;rie inhabituelle d&#39;eaux thermales salines avec les membres de la famille des habitats inattendus.

Cyanobakterien, die wachsen oben Meerwasser Salzgehalt bei Temperaturen &uuml;ber 45 Grad C wurden nur selten untersucht. Cyanobakterien dieser Art von Thermo-halophilic Extremophile wurden isoliert von Boreo Krusten bei 40-45 Grad C in eine geothermale Meerwasser-Lagune im S&uuml;dwesten Islands. Island-Klon 2e, ein Leptolyngbya Morphotype, wurde f&uuml;r weitere Studie ausgew&auml;hlt. Diese Kultur wuchs nur bei 45-50 Grad C, im mittleren Bereich von 28 bis 94 g L(-1) TDS, es zeigte 3 Verdoppelungen 24 h(-1) unter Dauerleuchten. Dieser Satz bei 54 Grad C war etwas verringert, und Tod ereignete sich bei 58 Grad C. Ein Vergleich der 16S rDNA Sequenz mit allen anderen in der Datenbank des NCBI ergab, dass 2 Leptolyngbya Isolate aus einer Thermalquelle Gr&ouml;nland (13-16 g L(-1) TDS) verwandt. Drei andere &auml;hnlichen Sequenzen wurden aus Leptolyngbya pur aus trocken, Endolithic Lebensr&auml;ume im Yellowstone-Nationalpark. Alle 6 bildeten eine phylogenetische Klade, schl&auml;gt gemeinsame Vorfahren. Diese St&auml;mme teilten viele &Auml;hnlichkeiten mit Island-Klon 2e in Bezug auf Temperatur und Salzgehalt Ranges und Optima. Zwei Endolithic Leptolyngbya Isolate, zuvor bei 23 Grad C in S&uuml;&szlig;wasser Medium, angebaut wuchs gut bei 50 Grad C, aber nur in saline Medium. Diese Studie zeigt, dass begrenzte genotypische &Auml;hnlichkeit einige auffallenden ph&auml;notypischen &Auml;hnlichkeiten zeigen kann, auch wenn die zugeh&ouml;rigen Cyanobakterien aus enorm unterschiedliche und entfernte Lebensr&auml;ume sind.

Eine ungew&ouml;hnliche Cyanobacterium aus salzhaltigen Thermalwasser mit Verwandten aus unerwarteten Lebensr&auml;ume.

Raramente sono state studiate cianobatteri che crescono sopra la salinit&agrave; dell&#39;acqua di mare a temperature superiori a 45 gradi C. Cianobatteri di questo tipo di termo-alofili estremofili sono stati isolati da croste silicei a 40-45 gradi C in una laguna di acqua geotermica in Islanda sud-occidentale. Islanda Clone 2e, un morfotipo Leptolyngbya, &egrave; stato selezionato per ulteriore studio. Questa cultura &egrave; cresciuto solo a 45-50 gradi C, in medie che vanno da 28 a 94 g L(-1) TDS, ha mostrato 3 accoppiamenti 24 h(-1) sotto illuminazione continua. Questo tasso a 54 gradi C era un po&#39; ridotto, e morte avvenuta a 58 gradi C. Un confronto della sequenza 16S rDNA con tutti gli altri nel database NCBI ha rivelato 2 correlati Leptolyngbya isolati da una primavera calda della Groenlandia (13-16 g L(-1) TDS). Tre altre sequenze simili erano da Leptolyngbya isolati da asciutto, endolitici habitat nel parco nazionale di Yellowstone. 6 Tutti formano un clade filogenetico, suggerendo la comune discendenza. Questi ceppi condiviso molte somiglianze a Islanda Clone 2e per quanto riguarda gli intervalli di temperatura e salinit&agrave; e optima. Due endolitici Leptolyngbya isolati, precedentemente coltivati a 23 gradi C in mezzo d&#39;acqua dolce, &egrave; cresciuto bene a 50 gradi C, ma solo nella media fisiologica. Questo studio dimostra che somiglianza genotipica limitata pu&ograve; rivelare alcune somiglianze fenotipiche saliente, anche quando i cianobatteri correlati sono da habitat notevolmente diverso e remoto.

Un insolito cyanobacterium da acque termali saline con parenti da habitat inaspettato.

&#x6D77;&#x6C34;&#x5869;&#x5206; 45 &#x2103; &#x4EE5;&#x4E0A;&#x306E;&#x6E29;&#x5EA6;&#x3067;&#x4E0A;&#x8A18;&#x6210;&#x9577;&#x30B7;&#x30A2;&#x30CE; &#x30D0;&#x30AF;&#x30C6;&#x30EA;&#x30A2;&#x306F;&#x3001;&#x3081;&#x3063;&#x305F;&#x306B;&#x7814;&#x7A76;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;.&#x30B7;&#x30A2;&#x30CE; &#x30D0;&#x30AF;&#x30C6;&#x30EA;&#x30A2; &#x30B5;&#x30FC;&#x30E2;&#x597D;&#x5869;&#x6027;&#x6975;&#x9650;&#x751F;&#x547D;&#x306E;&#x3053;&#x306E;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x306E;&#x73EA;&#x8CEA;&#x75C2;&#x76AE;&#x30A2;&#x30A4;&#x30B9;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C9;&#x5357;&#x897F;&#x90E8;&#x306E;&#x5730;&#x71B1;&#x6D77;&#x6C34;&#x30E9;&#x30B0;&#x30FC;&#x30F3;&#x3067;&#x306E; 40-45 &#x2103; &#x304B;&#x3089;&#x5206;&#x96E2;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30A2;&#x30A4;&#x30B9;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C9; &#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30F3; 2e Leptolyngbya &#x632F;&#x76EA;&#x3001;&#x3055;&#x3089;&#x306A;&#x308B;&#x7814;&#x7A76;&#x306B;&#x9078;&#x3070;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;L(-1) TDS 45-50 &#x2103; &#x4E2D; 28 &#x304B;&#x3089; 94 g &#x306B;&#x81F3;&#x308B;&#x307E;&#x3067;&#x306E;&#x3067;&#x3060;&#x3051;&#x3053;&#x306E;&#x6587;&#x5316;&#x304C;&#x80B2;&#x3063;&#x305F;&#x3001;3 doublings 24 h(-1) &#x9023;&#x7D9A;&#x7167;&#x660E;&#x4E0B;&#x3067;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x30EC;&#x30FC;&#x30C8; 54 &#x2103; &#x3067;&#x306F;&#x3084;&#x3084;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3057;&#x305F;&#x3068; 58 &#x6442;&#x6C0F;&#x6E29;&#x5EA6;&#x3067;&#x306E;&#x6B7B;&#x304C;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;16S rdna NCBI &#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x5185;&#x306E;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x4ED6;&#x306E;&#x30E6;&#x30FC;&#x30B6;&#x30FC;&#x3068;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03; 2 &#x30B0;&#x30EA;&#x30FC;&#x30F3;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C9; &#x30DB;&#x30C3;&#x30C8; &#x30B9;&#x30D7;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0; (13 16 g L(-1) TDS) &#x304B;&#x3089;&#x306E; Leptolyngbya &#x5206;&#x96E2;&#x682A;&#x306E;&#x95A2;&#x9023;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x4ED6;&#x306E; 3 &#x3064;&#x306E;&#x4F3C;&#x305F;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9; Leptolyngbya &#x83CC;&#x682A;&#x304B;&#x3089;&#x751F;&#x606F;&#x5730;&#x9AA8;&#x683C;&#x5185;&#x4E7E;&#x71E5;&#x3001;&#x30A4;&#x30A8;&#x30ED;&#x30FC;&#x30B9;&#x30C8;&#x30FC;&#x30F3;&#x56FD;&#x7ACB;&#x516C;&#x5712;&#x304B;&#x3089;&#x3060;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E; 6 &#x5171;&#x901A;&#x306E;&#x7956;&#x5148;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x7CFB;&#x7D71;&#x30C4;&#x30BF;&#x30CE;&#x30CF;&#x30AC;&#x30A4;&#x3092;&#x7D50;&#x6210;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x83CC;&#x682A;&#x306B;&#x30A2;&#x30A4;&#x30B9;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C9; &#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30F3; 2e &#x6E29;&#x5EA6;&#x3068;&#x5869;&#x5206;&#x6FC3;&#x5EA6;&#x306E;&#x7BC4;&#x56F2;&#x3068;&#x30AA;&#x30D7;&#x30C6;&#x30A3;&#x30DE;&#x306B;&#x95A2;&#x3057;&#x3066;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x985E;&#x4F3C;&#x70B9;&#x3092;&#x5171;&#x6709;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x4EE5;&#x524D; 23 &#x2103; &#x3067;&#x6DE1;&#x6C34;&#x306E;&#x5A92;&#x4F53;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x6210;&#x9577;&#x3057;&#x3066;&#x3001;2 &#x3064;&#x306E;&#x9AA8;&#x683C;&#x5185; Leptolyngbya &#x83CC;&#x682A;&#x306F; 50 &#x2103; &#x3067;&#x3088;&#x304F;&#x3001;&#x751F;&#x7406;&#x98DF;&#x5869;&#x6C34;&#x5A92;&#x4F53;&#x3067;&#x3060;&#x3051;&#x3067;&#x80B2;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x95A2;&#x9023;&#x306E;&#x85CD;&#x85FB;&#x985E;&#x304C;&#x5927;&#x5E45;&#x306B;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x3068;&#x30EA;&#x30E2;&#x30FC;&#x30C8;&#x306E;&#x751F;&#x606F;&#x5730;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x5834;&#x5408;&#x3067;&#x3082;&#x9650;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x985E;&#x4F3C;&#x6027;&#x8868;&#x73FE;&#x578B;&#x9855;&#x8457;&#x306A;&#x985E;&#x4F3C;&#x70B9;&#x304C;&#x3001;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x304B;&#x3082;&#x3057;&#x308C;&#x306A;&#x3044;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x98DF;&#x5869;&#x6E29;&#x6CC9;&#x6C34;&#x304B;&#x3089;&#x73CD;&#x3057;&#x3044;&#x85CD;&#x85FB;&#x4E88;&#x60F3;&#x5916;&#x306E;&#x751F;&#x606F;&#x5730;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x89AA;&#x621A;&#x3068;&#x306F;&#x3002;

45&#xB3C4; C &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xC628;&#xB3C4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD574; &#xC218; &#xC5FC; &#xBD84; &#xC704;&#xC5D0; &#xC131;&#xC7A5; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xB294; &#xAC70;&#xC758; &#xACF5;&#xBD80; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC720;&#xD615;&#xC758; &#xC628;&#xB3C4; halophilic extremophile &#xB0A8;&#xC870;&#xB958; &#xB0A8;&#xC11C; &#xC544;&#xC774;&#xC2AC;&#xB780;&#xB4DC;&#xC758; &#xC9C0; &#xC5F4; &#xD574; &#xC218; &#xC11D;&#xD638;&#xC5D0;&#xC11C; 40-45&#xB3C4; C&#xC5D0;&#xC11C; &#xADDC; &#xC313;&#xC5EC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xACE0;&#xB9BD; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC544;&#xC774;&#xC2AC;&#xB780;&#xB4DC; &#xD074;&#xB860; 2e, Leptolyngbya morphotype, &#xCD94;&#xAC00; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC120;&#xC815; &#xB410;&#xB2E4;. &#xC774; &#xBB38;&#xD654; &#xC131;&#xC7A5;&#xB9CC; 45-50&#xB3C4; C, &#xC2DC;&#xB0B4; &#xB9E4;&#xCCB4; 94 g 28&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC30;&#xC5F4;&#xC5D0; L(-1) TDS, &#xC5F0;&#xC18D; &#xC870;&#xBA85; &#xC544;&#xB798; 3 doublings 24 h(-1) &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4;. 54 &#xC12D;&#xC528;&#xC5D0;&#xC774; &#xC18D;&#xB3C4; &#xB2E4;&#xC18C; &#xC904;&#xC5B4;&#xB4E4;&#xACE0; &#xC8FD;&#xC74C; 58&#xB3C4; C&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xC0DD; NCBI &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xBCA0;&#xC774;&#xC2A4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xC0AC;&#xB78C;&#xB4E4;&#xACFC; 16S rDNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC758; &#xBE44;&#xAD50; 2 &#xADF8;&#xB9B0; &#xB79C;&#xB4DC; &#xC628;&#xCC9C; (13-16 g L(-1) TDS)&#xC5D0;&#xC11C; Leptolyngbya &#xACA9;&#xB9AC; &#xAD00;&#xB828; &#xACF5;&#xAC1C; &#xD588;&#xB2E4;. 3 &#xB2E4;&#xB978; &#xC720;&#xC0AC;&#xD55C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC11C;&#xC2DD; &#xC9C0; endolithic &#xAC74;&#xC870;, &#xC610;&#xB85C;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xAD6D;&#xB9BD;&#xACF5;&#xC6D0;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; Leptolyngbya &#xACA9;&#xB9AC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD588;&#xB2E4;. &#xBAA8;&#xB4E0; 6 &#xACF5;&#xD1B5; &#xC870;&#xC0C1; &#xC81C;&#xC548; phylogenetic clade &#xD615;&#xC131;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xBCC0;&#xC885; &#xC628;&#xB3C4; &#xC5FC; &#xBD84; &#xBC94;&#xC704; &#xBC0F; &#xC635; &#xD2F0; &#xB9C8;&#xC5D0; &#xB300;&#xD574; &#xC544;&#xC774;&#xC2AC;&#xB780;&#xB4DC; &#xD074;&#xB860; 2e&#xC5D0; &#xB9CE;&#xC740; &#xC720;&#xC0AC;&#xC810;&#xC744; &#xACF5;&#xC720;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; 23&#xB3C4; C&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2F4; &#xC218; &#xB9E4;&#xCCB4; &#xC131;&#xC7A5; &#xB450; endolithic Leptolyngbya &#xACA9;&#xB9AC; 50&#xB3C4; C&#xC5D0;&#xC11C; &#xC798; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xC5FC; &#xBD84; &#xB9E4;&#xCCB4;&#xC5D0;&#xB9CC; &#xC131;&#xC7A5; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294; &#xAD00;&#xB828;&#xB41C; &#xB0A8;&#xC870;&#xB958; &#xD06C;&#xAC8C; &#xB2E4;&#xB974;&#xACE0; &#xC6D0;&#xACA9; &#xC11C;&#xC2DD; &#xC9C0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xACBD;&#xC6B0;&#xC5D0; &#xC81C;&#xD55C; &#xB41C; genotypic &#xC720;&#xC0AC;&#xC131;, &#xD604;&#xC800;&#xD55C; phenotypic &#xC720;&#xC0AC;&#xC810;&#xC744; &#xBC1D;&#xD790; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC608;&#xAE30;&#xCE58; &#xC54A;&#xC740; &#xC11C;&#xC2DD; &#xC9C0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCE5C;&#xCC99; &#xB4E4;&#xACFC; &#xC5FC; &#xBD84;&#xC744; &#xD568;&#xC720;&#xD55C; &#xC628;&#xCC9C;&#xC218;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD2B9;&#xC774; &#xD55C; cyanobacterium.

Cianobacterias que crecen por encima de la salinidad del agua de mar a temperaturas superiores a 45 grados C raramente han sido estudiados. Cianobacterias de este tipo de termo-hal&oacute;filos extrem&oacute;filos se aislaron de la cortezas sil&iacute;ceas a 40-45 grados C en una laguna de agua de mar geot&eacute;rmico en Islandia sudoeste. Islandia clon 2e, un morfotipo de Leptolyngbya, fue seleccionado para continuar los estudios. Esta cultura creci&oacute; s&oacute;lo a 45-50 grados C, en medio desde 28 hasta 94 g L(-1) TDS, demostr&oacute; 3 doblajes 24 h bajo iluminaci&oacute;n continua. Esta tasa a 54 grados C se redujo un poco, y la muerte ocurri&oacute; en 58 grados cent&iacute;grados. Una comparaci&oacute;n de la secuencia del rDNA 16S con todos los dem&aacute;s en la base de datos NCBI revel&oacute; 2 relacionados Leptolyngbya aislados de una fuente termal de Groenlandia (13-16 g L(-1) TDS). Tres otras secuencias similares fueron de Leptolyngbya aislados de h&aacute;bitats de endol&iacute;tica seco, en el Parque Nacional de Yellowstone. 6 Todos forman un clado filogen&eacute;tico, sugiriendo la ascendencia com&uacute;n. Estas cepas comparten muchas similitudes con el clon de Islandia 2e con respecto a los rangos de temperatura y salinidad y optima. Dos endol&iacute;tica Leptolyngbya aislantes, crecidos previamente a 23 grados C en medio de agua dulce, crecieron en 50 grados C, pero s&oacute;lo en medio salino. Este estudio demuestra que limitada similitud genot&iacute;pica puede revelar algunas semejanzas fenot&iacute;picas sobresalientes, incluso cuando la cianobacteria relacionada es de h&aacute;bitats muy diferentes y remotos.

Una cianobacteria inusual de aguas termales Salinas con parientes de h&aacute;bitats inesperados.

&#x751F;&#x6001;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x53EF;&#x4EE5;&#x4ECE;&#x6982;&#x5FF5;&#x4E0A;&#x8BB2;&#x601D;&#x60F3;&#x7684;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x76F8;&#x4E92;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x73AF;&#x5883;&#x548C;&#x4EE3;&#x8C22;&#x7CFB;&#x7EDF;&#xFF0C;&#x5230;&#x5B8F;&#x5206;&#x5B50;&#x5C0F;&#x5206;&#x5B50;&#x901A;&#x8FC7;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x7F51;&#x7EDC;&#x8FDB;&#x884C;&#x4EA4;&#x4E92;&#x3002;&#x5148;&#x8FDB;&#x7684;&#x6280;&#x672F;&#x5728;&#x540E;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x79D1;&#x5B66;&#x63D0;&#x4F9B;&#x68C0;&#x67E5;&#x548C;&#x5206;&#x6790;&#x6B64;&#x751F;&#x7269;&#x5206;&#x5B50;&#x7F51;&#x7AD9;&#x4F7F;&#x7528;&#x57FA;&#x4E8E;&#x7EC4;&#x5B66;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;&#x63A2;&#x7D22;&#x6709;&#x76CA;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x9176;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x8D1F;&#x8D23;&#x5408;&#x6210;&#x4EE3;&#x8C22;&#x548C;&#x5206;&#x89E3;&#x4EE3;&#x8C22;&#x751F;&#x6001;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x5185;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x8D44;&#x6E90;&#x5C06;&#x6709;&#x52A9;&#x4E8E;&#x66F4;&#x597D;&#x5730;&#x4E86;&#x89E3;&#x73AF;&#x5883;&#x529F;&#x80FD;&#x548C;&#x5176;&#x5728;&#x751F;&#x7269;&#x6280;&#x672F;&#x4E2D;&#x7684;&#x5E94;&#x7528;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6211;&#x4EEC;&#x4ECB;&#x7ECD; ECOMICS&#xFF0C;&#x57FA;&#x4E8E; web &#x7684;&#x5DE5;&#x5177;&#x5957;&#x4EF6;&#xFF0C;&#x751F;&#x6001;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x8DE8;&#x5B66;&#x8C03;&#x67E5;&#x5B8F;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x3001; metatranscriptomic &#x548C;&#x5143;-&#x4EE3;&#x8C22;&#x7EC4;&#x5B66;&#x7684;&#x7CFB;&#x7EDF;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x6765;&#x81EA;&#x751F;&#x7269;&#x8D28;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x5927;&#x5206;&#x5B50;&#x6DF7;&#x5408;&#x7269;&#x4E3A;&#x76EE;&#x6807;&#x3002;ECOMICS &#x662F;&#x7531;&#x56DB;&#x4E2A;&#x96C6;&#x6210; webtool &#x662F;&#x3002;E &#x7C7B;&#x5141;&#x8BB8;&#x7684;&#x771F;&#x6838;&#x548C;&#x539F;&#x6838;&#x6838;&#x7CD6;&#x4F53;&#x6570;&#x636E;&#x57FA;&#x4E8E;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x5206;&#x7C7B;&#x548C;&#x529F;&#x80FD;&#x5206;&#x7C7B;&#x4E2D;&#x7684;&#x6240;&#x9009;&#x7684;&#x9176;&#x3002;FT2B &#x5141;&#x8BB8;&#x6570;&#x5B57;&#x5904;&#x7406;&#x7684;&#x6838;&#x78C1;&#x5171;&#x632F;&#x5149;&#x8C31;&#x7684;&#x4E0B;&#x6E38;&#x7684;&#x4EE3;&#x8C22;&#x6216;&#x5316;&#x5B66;&#x9707;&#x64BC;&#x3002;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x5DE5;&#x4F5C;&#x5206;&#x914D;&#x7684;&#x7279;&#x5B9A;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x53D1;&#x73B0;&#x57FA;&#x4E8E;&#x6728;&#x8D28;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x7D20;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x91CF;&#x3001; &#x5141;&#x8BB8; Bm Char &#x548C; HetMap &#x662F;&#x4E00;&#x4E2A;&#x6570;&#x636E;&#x77E9;&#x9635;&#x751F;&#x6210;&#x5668;&#x548C;&#x76F8;&#x5173;&#x6027;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x548C;&#x5176;&#x4ED6; web &#x5DE5;&#x5177;&#x53EF;&#x5E94;&#x7528;&#x4E8E;&#x8DE8;&#x7EC4;&#x5B66;&#x6570;&#x636E;&#x96C6;&#x7684;&#x8BA1;&#x7B97;&#x5668;&#x3002;&#x6B64; web &#x5957;&#x4EF6;&#x662F;&#x72EC;&#x7279;&#x7684;&#x5B83;&#x5141;&#x8BB8;&#x76D1;&#x6D4B;&#x4ECE;&#x9AD8;&#x5206;&#x5B50;&#x914D;&#x5408;&#x7269; &#xFF08;FT2DB &#x548C; Bm Char&#xFF09; &#x5373;&#x5728;&#x7279;&#x5B9A;&#x7684;&#x73AF;&#x5883;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x751F;&#x7269;&#x8D28;&#x4EE3;&#x8C22;&#x7684;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x7EC4;&#x6210;&#x548C;&#x9000;&#x5316; &#xFF08;E &#x7C7B;&#xFF09;&#xFF0C;&#x5E76;&#x4F7F;&#x53EF;&#x80FD;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x548C;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x5143;&#x7D20; (HetMap) &#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x5173;&#x7CFB;&#x7684;&#x7406;&#x89E3;&#x3002;&#x672C;&#x7F51;&#x7AD9;&#x662F;&#x63D0;&#x4F9B;&#x7ED9;&#x5728;&#x516C;&#x5171;&#x57DF;&#xFF1A; https://database.riken.jp/ecomics/&#x3002;

ECOMICS&#xFF1A; &#x8C03;&#x67E5;&#x4F7F;&#x7528;&#x8DE8;&#x7EC4;&#x5B66;&#x65B9;&#x6CD5;&#x7684;&#x751F;&#x6001;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x4E2D;&#x751F;&#x7269;&#x5206;&#x5B50; web &#x5DE5;&#x5177;&#x5305;&#x57FA;&#x4E8E; web &#x7684;&#x3002;

Ecosystems can be conceptually thought of as interconnected environmental and metabolic systems, in which small molecules to macro-molecules interact through diverse networks. State-of-the-art technologies in post-genomic science offer ways to inspect and analyze this biomolecular web using omics-based approaches. Exploring useful genes and enzymes, as well as biomass resources responsible for anabolism and catabolism within ecosystems will contribute to a better understanding of environmental functions and their application to biotechnology. Here we present ECOMICS, a suite of web-based tools for ECosystem trans-OMICS investigation that target metagenomic, metatranscriptomic, and meta-metabolomic systems, including biomacromolecular mixtures derived from biomass. ECOMICS is made of four integrated webtools. E-class allows for the sequence-based taxonomic classification of eukaryotic and prokaryotic ribosomal data and the functional classification of selected enzymes. FT2B allows for the digital processing of NMR spectra for downstream metabolic or chemical phenotyping. Bm-Char allows for statistical assignment of specific compounds found in lignocellulose-based biomass, and HetMap is a data matrix generator and correlation calculator that can be applied to trans-omics datasets as analyzed by these and other web tools. This web suite is unique in that it allows for the monitoring of biomass metabolism in a particular environment, i.e., from macromolecular complexes (FT2DB and Bm-Char) to microbial composition and degradation (E-class), and makes possible the understanding of relationships between molecular and microbial elements (HetMap). This website is available to the public domain at: https://database.riken.jp/ecomics/.

ECOMICS: a web-based toolkit for investigating the biomolecular web in ecosystems using a trans-omics approach.

Les &#xE9;cosyst&#xE8;mes peuvent &#xEA;tre conceptuellement consid&#xE9;r&#xE9; comme interconnect&#xE9;s syst&#xE8;mes environnementaux et m&#xE9;taboliques, dans lequel de petites mol&#xE9;cules &#xE0; des macro-mol&#xE9;cules interagissent &#xE0; travers des r&#xE9;seaux divers. State-of-the-art technologies dans la post-g&#xE9;nomique offrent des moyens scientifiques pour inspecter et analyser cette web biomol&#xE9;culaire en utilisant des approches fond&#xE9;es sur omique. Exploration des g&#xE8;nes et des enzymes utiles, ainsi que les ressources de la biomasse responsables de l&#x26;#39;anabolisme et le catabolisme dans les &#xE9;cosyst&#xE8;mes contribuera &#xE0; une meilleure compr&#xE9;hension des fonctions environnementales et leur application &#xE0; la biotechnologie. Ici, nous pr&#xE9;sentons ECOMICS, une s&#xE9;rie de des outils Web pour l&#x26;#39;&#xE9;cosyst&#xE8;me trans-OMICS enqu&#xEA;te que les syst&#xE8;mes m&#xE9;tag&#xE9;nomiques cible, m&#xE9;tatranscriptomiques, et une m&#xE9;ta-m&#xE9;tabolomique, y compris les m&#xE9;langes biomacromolecular issus de la biomasse. ECOMICS est constitu&#xE9; de quatre webtools int&#xE9;gr&#xE9;s. E-classe permet la classification taxonomique bas&#xE9;e sur une s&#xE9;quence de donn&#xE9;es eucaryotes et procaryotes ribosomique et la classification fonctionnelle des enzymes s&#xE9;lectionn&#xE9;es. FT2B permet le traitement num&#xE9;rique des spectres RMN pour m&#xE9;taboliques en aval ou ph&#xE9;notypage chimique. Bm-Char permet l&#x26;#39;attribution statistique de compos&#xE9;s sp&#xE9;cifiques trouv&#xE9;s dans la biomasse ligno-cellulosique &#xE0; base, et HetMap est un g&#xE9;n&#xE9;rateur de matrice de donn&#xE9;es et le calculateur de corr&#xE9;lation qui peut &#xEA;tre appliqu&#xE9; &#xE0; trans-omique ensembles de donn&#xE9;es analys&#xE9;e par des outils web ci et d&#x26;#39;autres. Cette suite web est unique en ce qu&#x26;#39;il permet la surveillance du m&#xE9;tabolisme de la biomasse dans un environnement particulier, c&#x26;#39;est &#xE0; dire, &#xE0; partir de complexes macromol&#xE9;culaires (FT2DB et Bm-Char) &#xE0; la composition microbienne et la d&#xE9;gradation (classe E), et rend possible la compr&#xE9;hension des relations entre les &#xE9;l&#xE9;ments mol&#xE9;culaires et microbiennes (HetMap). Ce site est &#xE0; la disposition du domaine public &#xE0; l&#x26;#39;adresse: https://database.riken.jp/ecomics/.

ECOMICS: une bo&#xEE;te &#xE0; outils sur le Web pour les enqu&#xEA;tes sur le Web biomol&#xE9;culaire dans les &#xE9;cosyst&#xE8;mes &#xE0; l&#x26;#39;aide d&#x26;#39;une approche trans-omique

&Ouml;kosysteme k&ouml;nnen konzeptionell als Umwelt- und metabolische Verbundnetzen betrachtet werden in denen kleinen Molek&uuml;le zu Makro-Molek&uuml;le durch vielf&auml;ltige Netzwerke interagieren. Zustand-of-the-Art Technologien in der postgenomischen Wissenschaft bieten M&ouml;glichkeiten zum inspizieren und analysieren diese Biomolekulare Web mit Omics-basierten Ans&auml;tzen. Erkunden n&uuml;tzliche Gene und Enzyme sowie Biomasse-Ressourcen verantwortlich f&uuml;r Anabolismus und Katabolismus innerhalb &Ouml;kosysteme tr&auml;gt zu einem besseren Verst&auml;ndnis der &ouml;kologischen Funktionen und deren Anwendung auf Biotechnologie. Hier pr&auml;sentieren wir WIRTSCHAFTWISSENSCHAFT, eine Suite von Web-basierten Tools f&uuml;r &Ouml;kosystem Trans-OMICS Untersuchung f&uuml;r durchgef&uuml;hrte metagenomische, Metatranscriptomic und Meta-metabolische Systeme, einschlie&szlig;lich Biomacromolecular-Mischungen, die aus Biomasse abgeleitet. WIRTSCHAFTWISSENSCHAFT besteht aus vier integrierten Webtools. E-Klasse erm&ouml;glicht die Sequenz-basierte taxonomische Klassifikation der eukaryotischen und prokaryotischen ribosomal Daten und funktionale Klassifizierung der ausgew&auml;hlten Enzyme. FT2B erm&ouml;glicht die digitale Verarbeitung von NMR-Spektren f&uuml;r nachgeschaltete metabolischen oder chemische pathologies. BM-Char erm&ouml;glicht statistische Zuordnung von bestimmten Verbindungen fanden in Lignocellulose-basierte Biomasse und HetMap ist ein Data-Matrix-Generator und Korrelation Rechner, die Trans-Omics Datasets angewendet werden kann, wie durch diese und andere Web-Tools analysiert. Diese Web-Suite ist einzigartig, sie erlaubt die &Uuml;berwachung der Biomasse Stoffwechsel in einer bestimmten Umgebung, d.h. aus Makromolekulare komplexe (FT2DB und Bm-Char) mikrobiellen Zusammensetzung und Abbau (E-Klasse) und erm&ouml;glicht das Verst&auml;ndnis der Beziehungen zwischen Molekulare und mikrobielle Elementen (HetMap). Diese Website ist bei der &ouml;ffentlichen Dom&auml;ne verf&uuml;gbar: https://database.riken.jp/ecomics/.

WIRTSCHAFTWISSENSCHAFT: ein Web-basiertes Toolkit f&uuml;r die Untersuchung des biomolekularen Webs in &Ouml;kosystemen mit einem Trans-Omics-Ansatz.

Gli ecosistemi possono essere concettualmente pensati come interconnessi sistemi ambientali e metabolici, in cui piccole molecole di macro-molecole interagiscono attraverso diverse reti. Stato-of-the-art tecnologie nel campo della genomica scienza offrono modi per controllare e analizzare questo web biomolecolare mediante approcci basati su omiche. Esplorando i geni utili e gli enzimi, come pure le risorse di biomassa responsabile per anabolismo e catabolismo all&#39;interno di ecosistemi contribuir&agrave; a una migliore comprensione delle funzioni ambientali e la loro applicazione alla biotecnologia. Qui vi presentiamo ECOMICS, una suite di strumenti web-based per inchiesta trans-OMICS ecosistema destinate a sistemi metagenomica, metatranscriptomic e meta-metabolomica, compresi i miscugli di biomacromolecular derivati da biomasse. ECOMICS &egrave; costituito da quattro webtools integrato. Classe E permette la classificazione tassonomica basata sulla sequenza di dati ribosomal eucariote e procariote e la classificazione funzionale degli enzimi selezionati. FT2B consente l&#39;elaborazione digitale degli spettri NMR per fenotipi metabolici o chimici a valle. BM-Char permette di statistica assegnazione di specifici composti trovati in biomassa lignocellulosa, e HetMap &egrave; un generatore di dati matrice di correlazione calcolatrice che pu&ograve; essere applicati ai trans-omics DataSet come analizzato da questi e altri strumenti web. Questa suite di web &egrave; unica in quanto permette il monitoraggio del metabolismo di biomassa in un ambiente particolare, cio&egrave;, da complessi macromolecolari (FT2DB e Bm-Char) a composizione microbica e la degradazione (classe E) e rende possibile la comprensione delle relazioni tra gli elementi molecolari e microbici (HetMap). Questo sito &egrave; disponibile per il pubblico dominio presso: https://database.riken.jp/ecomics/.

ECOMICS: un toolkit basato su web per indagare il web biomolecolare in ecosistemi utilizzando un approccio trans-omics.

&#x751F;&#x614B;&#x7CFB;&#x306F;&#x6982;&#x5FF5;&#x7684;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x30DE;&#x30AF;&#x30ED;&#x5206;&#x5B50;&#x306B;&#x5C0F;&#x5206;&#x5B50;&#x306F;&#x3001;&#x591A;&#x69D8;&#x306A;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x76F8;&#x4E92;&#x306B;&#x4F5C;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x76F8;&#x4E92;&#x63A5;&#x7D9A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x74B0;&#x5883;&#x3084;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x7CFB;&#x3001;&#x3068;&#x8003;&#x3048;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30AA;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x306E;&#x30A6;&#x30A7;&#x30D6;&#x3092;&#x691C;&#x67FB;&#x3057;&#x3001;&#x5206;&#x6790;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30DD;&#x30B9;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x79D1;&#x5B66;&#x306E;&#x63D0;&#x4F9B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3067;&#x3001;&#x6700;&#x5148;&#x7AEF;&#x306E;&#x6280;&#x8853;&#x3002;&#x6709;&#x7528;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3084;&#x9175;&#x7D20;&#x3068;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x3001;&#x751F;&#x614B;&#x7CFB;&#x5185;&#x306E;&#x540C;&#x5316;&#x4F5C;&#x7528;&#x3068;&#x7570;&#x5316;&#x306E;&#x8CAC;&#x4EFB;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30DE;&#x30B9;&#x8CC7;&#x6E90;&#x3092;&#x63A2;&#x7D22;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3001;&#x74B0;&#x5883;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3068;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30C6;&#x30AF;&#x30CE;&#x30ED;&#x30B8;&#x30FC;&#x3078;&#x306E;&#x5FDC;&#x7528;&#x306E;&#x7406;&#x89E3;&#x306B;&#x8CA2;&#x732E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;ECOMICS&#x3001;metatranscriptomic&#x751F;&#x614B;&#x7CFB;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;OMICS&#x8ABF;&#x67FB;&#x3001;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#xB7;&#x30E1;&#x30BF;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30DE;&#x30B9;&#x7531;&#x6765;&#x306E;&#x751F;&#x4F53;&#x9AD8;&#x5206;&#x5B50;&#x306E;&#x6DF7;&#x5408;&#x7269;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x30E1;&#x30BF;&#x30E1;&#x30BF;&#x30DC;&#x30ED;&#x30FC;&#x30E0;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;Web&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x306E;&#x30B9;&#x30A4;&#x30FC;&#x30C8;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002; ECOMICS&#x306F;&#x3001;4&#x3064;&#x306E;&#x7D71;&#x5408;&#x3055;&#x308C;&#x305F;webtools&#x3067;&#x4F5C;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002; E-&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x306F;&#x3001;&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x3068;&#x539F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x30EA;&#x30DC;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3068;&#x9078;&#x629E;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x9175;&#x7D20;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x5206;&#x985E;&#x306E;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x5206;&#x985E;&#x5B66;&#x4E0A;&#x306E;&#x5206;&#x985E;&#x304C;&#x53EF;&#x80FD;&#x306B;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002; FT2B&#x306F;&#x3001;&#x4E0B;&#x6D41;&#x306E;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x7684;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x8868;&#x73FE;&#x578B;&#x89E3;&#x6790;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;NMR&#x30B9;&#x30DA;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x306E;&#x30C7;&#x30B8;&#x30BF;&#x30EB;&#x51E6;&#x7406;&#x3092;&#x53EF;&#x80FD;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002; BM-Char&#x306F;&#x30EA;&#x30B0;&#x30CE;&#x30BB;&#x30EB;&#x30ED;&#x30FC;&#x30B9;&#x7CFB;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30DE;&#x30B9;&#x3067;&#x898B;&#x3064;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x306E;&#x7D71;&#x8A08;&#x7684;&#x306A;&#x5272;&#x308A;&#x5F53;&#x200B;&#x200B;&#x3066;&#x3092;&#x53EF;&#x80FD;&#x306B;&#x3057;&#x3001;HetMap&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x4ED6;&#x306E;Web&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5206;&#x6790;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AA;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306B;&#x9069;&#x7528;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#xB7;&#x30DE;&#x30C8;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#xB7;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30EC;&#x30FC;&#x30BF;&#x3068;&#x76F8;&#x95A2;&#x96FB;&#x5353;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x30A6;&#x30A7;&#x30D6;&#x30B9;&#x30A4;&#x30FC;&#x30C8;&#x306F;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x304C;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x74B0;&#x5883;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30DE;&#x30B9;&#x306E;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x306E;&#x30E2;&#x30CB;&#x30BF;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x53EF;&#x80FD;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x3044;&#x3046;&#x70B9;&#x3067;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3001;&#x3059;&#x306A;&#x308F;&#x3061;&#x3001;&#x9AD8;&#x5206;&#x5B50;&#x200B;&#x200B;&#x8907;&#x5408;&#x4F53;&#x304B;&#x3089;&#xFF08;FT2DB&#x3068;BM-char&#xFF09;&#x306F;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x7D44;&#x6210;&#x3068;&#x5206;&#x89E3;&#xFF08;E-&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#xFF09;&#x306B;&#x3001;&#x30EA;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x30B7;&#x30C3;&#x30D7;&#x306E;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x3092;&#x7406;&#x89E3;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x5206;&#x5B50;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x8981;&#x7D20;&#xFF08;HetMap&#xFF09;&#x306E;&#x9593;&#x3002; https://database.riken.jp/ecomics/&#xFF1A;&#x5F53;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x306F;&#x30D1;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x3067;&#x5229;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

ECOMICS&#xFF1A;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AA;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x306E;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x751F;&#x614B;&#x7CFB;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x751F;&#x4F53;&#x5206;&#x5B50;&#x306E;Web&#x3092;&#x8ABF;&#x67FB;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;Web&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x30AD;&#x30C3;&#x30C8;

&#xC0DD;&#xD0DC;&#xACC4;&#xB294; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xC791;&#xC740; &#xBD84;&#xC790; &#xB9E4;&#xD06C;&#xB85C; &#xBD84;&#xC790;&#xC5D0; &#xC791;&#xC6A9;, &#xC0C1;&#xD638; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; &#xD658;&#xACBD; &#xBC0F; &#xB300;&#xC0AC; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC73C;&#xB85C;&#xC758; &#xAC1C;&#xB150;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xAC04;&#xC8FC;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Post-genomic &#xACFC;&#xD559;&#xC5D0; &#xCD5C;&#xC2E0;&#xC758; &#xAE30;&#xC220; &#xAC80;&#xC0AC; omics &#xAE30;&#xBC18;&#xC758; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;&#xC774; &#xBD84;&#xC790; &#xC6F9; &#xBD84;&#xC11D; &#xD558;&#xB294; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBC14;&#xC774;&#xC624; &#xB9E4;&#xC2A4; &#xC790;&#xC6D0; anabolism&#xB97C; &#xD480;&#xC5B4; &#xC0DD;&#xD0DC;&#xACC4; &#xB0B4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xC720;&#xC6A9; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640; &#xD6A8;&#xC18C;, &#xD0D0;&#xD5D8; &#xD658;&#xACBD; &#xAE30;&#xB2A5; &#xBC0F; &#xC0DD;&#xBA85; &#xACF5;&#xD559;&#xC5D0; &#xC751;&#xC6A9; &#xD504;&#xB85C;&#xADF8;&#xB7A8;&#xC758; &#xB354; &#xB098;&#xC740; &#xC774;&#xD574;&#xC5D0; &#xAE30;&#xC5EC;&#xD560; &#xAC83;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;&#xC5D0; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xD604;&#xC7AC; ECOMICS, metagenomic, metatranscriptomic, &#xBC0F; &#xBA54;&#xD0C0;-metabolomic &#xBC14;&#xC774;&#xC624; &#xB9E4;&#xC2A4; &#xB85C;&#xBD80;&#xD130; &#xD30C;&#xC0DD; &#xB41C; biomacromolecular &#xD63C;&#xD569;&#xBB3C;&#xC744; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC744; &#xB300;&#xC0C1;&#xC73C;&#xB85C; &#xD558;&#xB294; &#xC0DD;&#xD0DC;&#xACC4; &#xD2B8;&#xB79C;&#xC2A4;-OMICS &#xC870;&#xC0AC;&#xB97C; &#xC704;&#xD55C; &#xC6F9; &#xAE30;&#xBC18; &#xB3C4;&#xAD6C; &#xBAA8;&#xC74C;. ECOMICS&#xB294; 4 &#xAC1C;&#xC758; &#xD1B5;&#xD569; &#xB41C; webtools&#xC758; &#xC774;&#xB8E8;&#xC5B4;&#xC9D1;&#xB2C8;&#xB2E4;. E &#xD074;&#xB798;&#xC2A4;&#xB294; &#xC9C4; &#xD575; &#xBC0F; prokaryotic ribosomal &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC21C;&#xC11C; &#xAE30;&#xBC18; taxonomic &#xBD84;&#xB958;&#xC640; &#xC120;&#xD0DD; &#xB41C; &#xD6A8;&#xC18C;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5; &#xBD84;&#xB958;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. FT2B &#xB2E4;&#xC6B4;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB9BC; &#xC2E0;&#xC9C4; &#xB300;&#xC0AC; &#xB610;&#xB294; &#xD654;&#xD559; &#xD615;&#xC9C8;&#xC758; NMR &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC;&#xC758; &#xB514;&#xC9C0;&#xD138; &#xCC98;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Bm Char lignocellulose &#xAE30;&#xBC18; &#xBC14;&#xC774;&#xC624; &#xB9E4;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xD2B9;&#xC815; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C;&#xC758; &#xD1B5;&#xACC4; &#xD560;&#xB2F9;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD5C8;&#xC6A9; &#xBC0F; Hetmap&#xC740; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xB9E4;&#xD2B8;&#xB9AD;&#xC2A4; &#xC0DD;&#xC131;&#xAE30; &#xBC0F; &#xC0C1;&#xAD00; &#xAD00;&#xACC4; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xBC0F; &#xB2E4;&#xB978; &#xC6F9; &#xB3C4;&#xAD6C; &#xBD84;&#xC11D;&#xC73C;&#xB85C; &#xD2B8;&#xB79C;&#xC2A4;-omics &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC9D1;&#xD569;&#xC5D0; &#xC801;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xACC4;&#xC0B0;&#xAE30;. &#xC774; &#xC6F9; &#xC2A4;&#xC704;&#xD2B8; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xC870;&#xC131;&#xACFC; &#xC800;&#xD558; (E &#xD074;&#xB798;&#xC2A4;)&#xC5D0; &#xBAA8;&#xB2C8;&#xD130;&#xB9C1;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xD2B9;&#xC815; &#xD658;&#xACBD;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC14;&#xC774;&#xC624; &#xB9E4;&#xC2A4; &#xB300;&#xC0AC;&#xC758; &#xC989;, &#xACE0;&#xBD84;&#xC790; &#xBCF5;&#xD569;&#xBB3C; (FT2DB &#xBC0F; Bm Char)&#xC5D0;&#xC11C; &#xC218; &#xC788;&#xB2E4;&#xB294; &#xC810;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;&#xC640; &#xBD84;&#xC790;&#xC640; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xC694;&#xC18C; (HetMap) &#xAC04;&#xC758; &#xAD00;&#xACC4;&#xC758; &#xC774;&#xD574;&#xB97C; &#xAC00;&#xB2A5; &#xD558; &#xAC8C; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC6F9;&#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xACF5;&#xAC1C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xAC00;&#xB2A5;: https://database.riken.jp/ecomics/.

ECOMICS: &#xC6F9; &#xAE30;&#xBC18; &#xB3C4;&#xAD6C;&#xB97C; &#xB300; &#xD55C; &#xD2B8;&#xB79C;&#xC2A4;-omics &#xBC29;&#xC2DD;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC0DD;&#xD0DC;&#xACC4;&#xC5D0; &#xC0DD;&#xBA85; &#xC6F9; &#xC870;&#xC0AC;.

Los ecosistemas pueden ser conceptualmente considerados como sistemas interconectados ambientales y metab&#xF3;licos, en el que las mol&#xE9;culas peque&#xF1;as a las macro-mol&#xE9;culas interact&#xFA;an a trav&#xE9;s de diversas redes. Estado actual de la m&#xE1;s moderna tecnolog&#xED;a en post-gen&#xF3;micas ofrecen formas de la ciencia para inspeccionar y analizar esta web biomoleculares utilizando enfoques basados &#x200B;&#x200B;en &#xF3;micas. Explorando los genes &#xFA;tiles y enzimas, as&#xED; como los recursos de biomasa responsables de anabolismo y catabolismo de los ecosistemas contribuir&#xE1; a una mejor comprensi&#xF3;n de las funciones ambientales y su aplicaci&#xF3;n a la biotecnolog&#xED;a. Aqu&#xED; presentamos eComics, un conjunto de herramientas basadas en web para los ecosistemas trans-&#xF3;micas de investigaci&#xF3;n que los sistemas de metagen&#xF3;mica objetivo, metatranscriptomic, y metabol&#xF3;mica de meta-, incluidas las mezclas biomacromolecular derivados de la biomasa. EComics est&#xE1; formado por cuatro WebTools integrados. Clase E permite la clasificaci&#xF3;n taxon&#xF3;mica basada en la secuencia de datos ribosomal eucariotas y procariotas y la clasificaci&#xF3;n funcional de las enzimas seleccionadas. FT2B permite el procesamiento digital de espectros de RMN para el metabolismo intermedio o el fenotipo qu&#xED;mica. Bm-Char permite la asignaci&#xF3;n estad&#xED;stica de los compuestos espec&#xED;ficos que se encuentran en lignocelulosa basado en la biomasa, y HetMap es un generador de matriz de datos y una calculadora de correlaci&#xF3;n que se puede aplicar a trans-&#xF3;micas conjuntos de datos seg&#xFA;n el an&#xE1;lisis de herramientas web estos y otros. Esta suite de web es la &#xFA;nica que permite el control del metabolismo de la biomasa en un entorno determinado, es decir, a partir de complejos macromoleculares (FT2DB y Bm Char-) a la composici&#xF3;n microbiana y la degradaci&#xF3;n (clase E), y hace posible la comprensi&#xF3;n de las relaciones entre los elementos moleculares y microbiana (HetMap). Este sitio web est&#xE1; a disposici&#xF3;n del dominio p&#xFA;blico en: https://database.riken.jp/ecomics/.

EComics: un kit de herramientas basado en Web para la Investigaci&#xF3;n de la Web Biomolecular en los ecosistemas mediante un enfoque trans-&#xF3;micas

&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x57AB;&#x542B;&#x4E1D;&#x4E2D;&#x4E0D;&#x4EA7;&#x6C27;&#x5149;&#x5408;&#x7EC6;&#x83CC; Chloroflexus aggregans &#x5728; Nakabusa &#x6E29;&#x6CC9;&#x5728;&#x65E5;&#x672C;&#x53D1;&#x5C55;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x57AB;&#x5728;&#x538C;&#x6C27;&#x6761;&#x4EF6;&#x4E0B;&#x79CD;&#x83CC;&#x79CD;&#x95F4;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x786B;&#x9178;&#x76D0;&#x8FD8;&#x539F;&#x7EC6;&#x83CC;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x786B;&#x5316;&#x751F;&#x4EA7;&#x8005;&#x548C;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x786B;&#x5316;&#x6D88;&#x8D39;&#x8005; C.aggregans &#x63D0;&#x51FA;&#xFF0C;&#x6784;&#x6210;&#x4E00;&#x79CD;&#x786B;&#x5FAA;&#x73AF; &#xFF1B;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x7528;&#x4E8E;&#x5728; Nakabusa &#x7684;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x786B;&#x5316;&#x751F;&#x4EA7;&#x7535;&#x5B50;&#x6350;&#x52A9;&#x4ECD;&#x6709;&#x5F85;&#x786E;&#x5B9A;&#x3002;&#x4E3A;&#x4E86;&#x786E;&#x5B9A;&#x8FD9;&#x4E00;&#x7535;&#x5B50;&#x6350;&#x52A9;&#x8005;&#x548C;&#x5176;&#x6E90;&#xFF0C;&#x4E8B;&#x540E;&#x73B0;&#x573A;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x63A2;&#x8BA8;&#x4E86;&#x5B75;&#x5316;&#x7684;&#x5730;&#x57AB;&#x3002;&#x94BC;&#x9178;&#x76D0;&#xFF0C;&#x6291;&#x5236;&#x786B;&#x9178;&#x76D0;&#x751F;&#x7269;&#x8FD8;&#x539F;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x5B58;&#x5728;&#x6C22;&#x6C14;&#x88AB;&#x91CA;&#x653E;&#x4ECE;&#x57AB;&#x6837;&#x54C1;&#xFF0C;&#x8BE5;&#x503C;&#x6307;&#x793A;&#x6B64;&#x6C22;&#x901A;&#x5E38;&#x6D88;&#x8017;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E00;&#x4E2A;&#x7535;&#x5B50;&#x6350;&#x52A9;&#x56FD;&#x7684;&#x786B;&#x9178;&#x76D0;&#x8FD8;&#x539F;&#x83CC;&#x3002;&#x6C22;&#x751F;&#x4EA7;&#x51CF;&#x5C11;&#x5149;&#x7167;&#xFF0C;&#x6307;&#x793A;&#x8BE5; C.aggregans &#x8FD8;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x6C22;&#x6D88;&#x8D39;&#x51FD;&#x6570;&#x4E0B;&#x3002;&#x5C11;&#x91CF;&#x7684;&#x6C22;&#x53EF;&#x80FD;&#x8FD8;&#x6D88;&#x8017;&#x786B;&#x51CF;&#x5C11;&#x3002;16S rRNA &#x57FA;&#x56E0;&#x6269;&#x589E;&#x4ECE;&#x57AB;&#x5B50;&#x514B;&#x9686;&#x5E93;&#x5206;&#x6790;&#x8868;&#x660E;&#x51E0;&#x4E2A;&#x7269;&#x79CD;&#x7684;&#x4EA7;&#x6C22;&#x53D1;&#x9175;&#x7EC6;&#x83CC;&#x7684;&#x5B58;&#x5728;&#x3002;&#x5176;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x6700;&#x4E3B;&#x8981;&#x7684;&#x53D1;&#x9175;&#x7F50;&#xFF0C;Fervidobacterium sp.&#xFF09;&#xFF0C;&#x662F;&#x6210;&#x529F;&#x5730;&#x5B64;&#x7ACB;&#x3002;&#x6B64;&#x5206;&#x79BB;&#x4EA7;&#x751F;&#x6C22;&#x901A;&#x8FC7;&#x53D1;&#x9175;&#x7684;&#x6709;&#x673A;&#x78B3;&#x3002;&#x5206;&#x6563;&#x7684;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x57AB;&#x5BFC;&#x81F4;&#x6C22;&#x751F;&#x4EA7;&#x5982;&#x679C;&#x6CA1;&#x6709;&#x94BC;&#x9178;&#xFF0C;&#x53E6;&#x5916;&#x5EFA;&#x8BAE;&#xFF0C;&#x540C;&#x65F6;&#x751F;&#x4EA7;&#x548C;&#x57AB;&#x4E2D;&#x6C22;&#x7684;&#x6D88;&#x8D39;&#x8981;&#x6C42;&#x5BC6;&#x5B9E;&#x586B;&#x5145;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x5185;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x7684;&#x5730;&#x57AB;&#x3001; &#x5FAA;&#x73AF;&#x7535;&#x5B50;&#x6D41;&#x5373;&#x7535;&#x5B50;&#x6D41;&#x53D1;&#x751F;&#x901A;&#x8FC7;&#x4E09;&#x4E2A;&#x5143;&#x7D20;&#xFF1A; S &#xFF08;&#x5355;&#x8D28;&#x786B;&#x3001; &#x786B;&#x5316;&#x7269;&#x3001; &#x786B;&#x9178;&#x76D0;)&#x3001; C (&#x4E8C;&#x6C27;&#x5316;&#x78B3;&#x3001; &#x6709;&#x673A;&#x78B3;) &#x548C; H (di &#x6C22;&#x3001; &#x8D28;&#x5B50;)&#x3002;

&#x751F;&#x4EA7;&#x548C;&#x6D88;&#x8D39;&#x4E2D;&#x5360;&#x4E3B;&#x5BFC;&#x5730;&#x4F4D;&#x7684;&#x4E1D;&#x72B6;&#x4E2D;&#x4E0D;&#x4EA7;&#x6C27;&#x5149;&#x5408;&#x7EC6;&#x83CC;&#x7684;&#x6E29;&#x6CC9;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x57AB;&#x6C22;&#x3002;

Microbial mats containing the filamentous anoxygenic photosynthetic bacterium Chloroflexus aggregans develop at Nakabusa hot spring in Japan. Under anaerobic conditions in these mats, interspecies interaction between sulfate-reducing bacteria as sulfide producers and C. aggregans as a sulfide consumer has been proposed to constitute a sulfur cycle; however, the electron donor utilized for microbial sulfide production at Nakabusa remains to be identified. In order to determine this electron donor and its source, ex situ experimental incubation of mats was explored. In the presence of molybdate, which inhibits biological sulfate reduction, hydrogen gas was released from mat samples, indicating that this hydrogen is normally consumed as an electron donor by sulfate-reducing bacteria. Hydrogen production decreased under illumination, indicating that C. aggregans also functions as a hydrogen consumer. Small amounts of hydrogen may have also been consumed for sulfur reduction. Clone library analysis of 16S rRNA genes amplified from the mats indicated the existence of several species of hydrogen-producing fermentative bacteria. Among them, the most dominant fermenter, Fervidobacterium sp., was successfully isolated. This isolate produced hydrogen through the fermentation of organic carbon. Dispersion of microbial cells in the mats resulted in hydrogen production without the addition of molybdate, suggesting that simultaneous production and consumption of hydrogen in the mats requires dense packing of cells. We propose a cyclic electron flow within the microbial mats, i.e., electron flow occurs through three elements: S (elemental sulfur, sulfide, sulfate), C (carbon dioxide, organic carbon) and H (di-hydrogen, protons).

Production and consumption of hydrogen in hot spring microbial mats dominated by a filamentous anoxygenic photosynthetic bacterium.

Tapis microbiens contenant la bact&eacute;rie photosynth&eacute;tique organismes filamenteux Chloroflexus aggregans se d&eacute;veloppent &agrave; Nakabusa thermales au Japon. Dans des conditions ana&eacute;robies dans ces nattes, interaction intersp&eacute;cifique entre sulfato-r&eacute;ductrices bact&eacute;ries comme producteurs de sulfure et c. aggregans comme un consommateur de sulfure a &eacute;t&eacute; propos&eacute; de constituer un cycle de soufre ; le donneur d&#39;&eacute;lectrons utilis&eacute; pour la production microbienne de sulfure &agrave; Nakabusa reste toutefois &agrave; &ecirc;tre identifi&eacute;e. Afin de d&eacute;terminer ce donneur d&#39;&eacute;lectrons et de sa source, ex-situ exp&eacute;rimental incubation du tapis a &eacute;t&eacute; explor&eacute;e. En pr&eacute;sence de molybdate, qui inhibe la sulfator&eacute;duction biologique, gaz d&#39;hydrog&egrave;ne a &eacute;t&eacute; lib&eacute;r&eacute; de matelas &eacute;chantillons, ce qui indique que cet hydrog&egrave;ne est habituellement consomm&eacute; comme donneur d&#39;&eacute;lectrons par sulfato-r&eacute;ductrices bact&eacute;ries. Production d&#39;hydrog&egrave;ne a diminu&eacute; sous illumination, indiquant que c. aggregans &eacute;galement des fonctions en tant que consommateur d&#39;hydrog&egrave;ne. De petites quantit&eacute;s d&#39;hydrog&egrave;ne peuvent &eacute;galement ont &eacute;t&eacute; consomm&eacute;es pour la r&eacute;duction du soufre. Clone biblioth&egrave;que analyse des g&egrave;nes des ARNr 16 s amplifi&eacute;s &agrave; partir des nattes ont r&eacute;v&eacute;l&eacute; l&#39;existence de plusieurs esp&egrave;ces de bact&eacute;ries fermentatives productrices d&#39;hydrog&egrave;ne. Parmi eux, la cuve de fermentation plus dominante, Fervidobacterium SP., a &eacute;t&eacute; isol&eacute; avec succ&egrave;s. Cet isolat produit hydrog&egrave;ne gr&acirc;ce &agrave; la fermentation du carbone organique. Dispersion des cellules microbiennes dans les tapis a donn&eacute; lieu &agrave; la production d&#39;hydrog&egrave;ne sans addition de molybdate, sugg&eacute;rant que la production simultan&eacute;e et consommation d&#39;hydrog&egrave;ne dans les tapis n&eacute;cessite un emballage dense de cellules. Nous proposons un flux d&#39;&eacute;lectrons cycliques dans les tapis microbiens, c.-&agrave;-d., flux d&#39;&eacute;lectrons se fait par trois &eacute;l&eacute;ments: S (soufre &eacute;l&eacute;mentaire, sulfure, sulfate), C (dioxyde de carbone, carbone organique) et H (di-hydrog&egrave;ne, protons).

Production et consommation d&#39;hydrog&egrave;ne dans la source chaude des tapis microbiens domin&eacute;e par une bact&eacute;rie photosynth&eacute;tique organismes filamenteux.

Mikrobielle Matten, enth&auml;lt das filament&ouml;se anoxygenen photosynthetische Bakterium Chloroflexus Aggregans entwickeln bei Nakabusa hei&szlig;er Fr&uuml;hling in Japan. Unter anaeroben Bedingungen in Matten, Interspezies Interaktion zwischen Sulfat-reduzierenden Bakterien als Sulfid-Produzenten und C. Aggregans als Sulfid Verbraucher vorgeschlagen bilden einen Schwefel-Zyklus; Allerdings bleibt der Elektron-Spender f&uuml;r mikrobielle Sulfid-Produktion am Nakabusa genutzt um identifiziert werden. F&uuml;r die Feststellung dieses Elektron Spender und seine Quelle, ex-Situ experimentelle wurde Inkubation von Matten erforscht. In Anwesenheit von Molybdat, die biologischen Sulfat-Reduktion hemmt, Wasserstoffgas erschien von Mat-Proben, darauf hinweist, dass dieser Wasserstoff als einem Elektron Spender normalerweise, von Sulfat-reduzierenden verbraucht wird Bakterien. Wasserstoffproduktion fiel unter Beleuchtung, angibt, dass C. Aggregans auch Funktionen als Wasserstoff Verbraucher. Kleine Mengen von Wasserstoff k&ouml;nnen auch f&uuml;r Schwefel Reduktion verwendet wurden. Klon-Bibliothek-Analyse der 16S rRNA gene verst&auml;rkt aus der Matten angegeben die Existenz mehrerer Arten von Wasserstoff erzeugenden Zuckerverg&auml;rung Bakterien. Unter ihnen war die dominante Fermenter, Fervidobacterium SP., erfolgreich isoliert. Dieses Isolat produziert Wasserstoff durch die Verg&auml;rung von organischem Kohlenstoff. Streuung der mikrobiellen Zellen in die Matten f&uuml;hrte Wasserstofferzeugung ohne Zusatz von Molybdat, was darauf hindeutet, dass gleichzeitige Produktion und Verbrauch von Wasserstoff in die Matten erfordert dichten Verpackung von Zellen. Wir schlagen eine zyklische Elektron-Str&ouml;mung innerhalb der mikrobiellen Matten, d.h. Elektronen flie&szlig;en erfolgt durch drei Elemente: S (elementarem Schwefel, Sulfide, Sulfate), C (Kohlendioxid, organischer Kohlenstoff) und H (di-Wasserstoff, Protonen).

Produktion und Verbrauch von Wasserstoff in hei&szlig;er Fr&uuml;hling mikrobielle Matten dominiert ein filament&ouml;sen anoxygenen photosynthetische Bakterium.

Tappeti microbici contenenti il batterio fotosintetico filamentose anossigenica Chloroflexus aggregans sviluppano a molla calda Nakabusa in Giappone. In condizioni anaerobiche in questi tappeti, interazione interspecifica tra solfato-riduzione batteri come produttori di solfuro e c. aggregans come un consumatore di solfuro &egrave; stato proposto a costituire un ciclo di zolfo; il donatore di elettroni utilizzato per la produzione di solfuro microbica a Nakabusa rimane, tuttavia, essere identificato. Al fine di determinare questo donatore di elettroni e la relativa origine, ex situ sperimentale &egrave; stato esplorato l&#39;incubazione di stuoie. In presenza di molibdato, che inibisce la riduzione biologica solfato, idrogeno gassoso &egrave; stato rilasciato da campioni mat, che indica che questo idrogeno &egrave; normalmente consumato come un donatore di elettroni riducendo solfato batteri. Produzione di idrogeno diminuito sotto illuminazione, che indica che c. aggregans anche funzioni come un consumatore di idrogeno. Piccole quantit&agrave; di idrogeno possono sono anche state consumate per la riduzione dello zolfo. Clone libreria analisi dei geni rRNA 16S amplificati dalle stuoie indicano l&#39;esistenza di diverse specie di batteri fermentativi producendo idrogeno. Tra di loro, il fermentatore pi&ugrave; dominante, Fervidobacterium SP., &egrave; stato isolato con successo. Questo isolato del prodotto idrogeno attraverso la fermentazione di carbonio organico. Dispersione delle cellule microbiche nelle stuoie ha provocato la produzione di idrogeno senza l&#39;aggiunta di molibdato, suggerendo che la produzione simultanea e consumo di idrogeno le stuoie richiede imballaggio denso delle cellule. Proponiamo un flusso ciclico degli elettroni all&#39;interno di tappeti microbici, cio&egrave; flusso di elettroni si verifica attraverso tre elementi: S (zolfo elementare, solfuro, solfato), C (biossido di carbonio, carbonio organico) e H (di-idrogeno, protoni).

Produzione e il consumo di idrogeno in primavera calda tappeti microbici dominato da un batterio fotosintetico anossigenica filamentose.

&#x65E5;&#x672C;&#x7523;&#x306E;&#x30B1;&#x30A4;&#x83EF;&#x4E2D;&#x6E29;&#x6CC9;&#x7CF8;&#x72B6;&#x767A;&#x751F;&#x578B;&#x5149;&#x5408;&#x6210;&#x7D30;&#x83CC; Chloroflexus aggregans &#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x30DE;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x958B;&#x767A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30DE;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x5ACC;&#x6C17;&#x6761;&#x4EF6;&#x3001;&#x7A2E;&#x9593;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x786B;&#x9178;&#x9084;&#x5143;&#x4E0B;&#x3067;&#x786B;&#x5316;&#x7269;&#x306E;&#x751F;&#x7523;&#x8005;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x306E;&#x7D30;&#x83CC;&#x3068;&#x786B;&#x5316;&#x30B3;&#x30F3;&#x30B7;&#x30E5;&#x30FC;&#x30DE;&#x30FC;&#x3068;&#x3057;&#x3066; c. aggregans &#x304C;&#x63D0;&#x6848;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x786B;&#x9EC4;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EB;; &#x3092;&#x69CB;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x786B;&#x5316;&#x751F;&#x7523;&#x7523;&#x306E;&#x30B1;&#x30A4;&#x83EF;&#x4E2D;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x6D3B;&#x7528;&#x96FB;&#x5B50;&#x30C9;&#x30CA;&#x30FC;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x307E;&#x307E;&#x306B;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x96FB;&#x5B50;&#x4F9B;&#x4E0E;&#x4F53;&#x3068;&#x5143;&#x5834;&#x5B9F;&#x9A13;&#x305D;&#x306E;&#x30BD;&#x30FC;&#x30B9;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x30DE;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x5B75;&#x5316;&#x304C;&#x691C;&#x8A0E;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x751F;&#x7269;&#x786B;&#x9178;&#x9084;&#x5143;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3059;&#x308B;&#x3001;&#x30E2;&#x30EA;&#x30D6;&#x30C7;&#x30F3;&#x9178;&#x5B58;&#x5728;&#x4E0B;&#x3067;&#x306F;&#x3053;&#x306E;&#x6C34;&#x7D20;&#x304C;&#x901A;&#x5E38;&#x3001;&#x96FB;&#x5B50;&#x4F9B;&#x4E0E;&#x4F53;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x786B;&#x9178;&#x3092;&#x6E1B;&#x3089;&#x3059;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x6D88;&#x8CBB;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3001;&#x30DE;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x304B;&#x3089;&#x6C34;&#x7D20;&#x30AC;&#x30B9;&#x304C;&#x30EA;&#x30EA;&#x30FC;&#x30B9;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x7D30;&#x83CC;&#x3002;&#x305D;&#x306E; C. aggregans &#x306F;&#x307E;&#x305F;&#x6C34;&#x7D20;&#x6D88;&#x8CBB;&#x8005;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x7167;&#x660E;&#x4E0B;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x6C34;&#x7D20;&#x751F;&#x7523;&#x304C;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5C11;&#x91CF;&#x306E;&#x6C34;&#x7D20;&#x306F;&#x786B;&#x9EC4;&#x4F4E;&#x6E1B;&#x3082;&#x6D88;&#x8CBB;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30F3; &#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x5206;&#x6790;&#x304B;&#x3089;&#x30DE;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x5897;&#x5E45; 16S rRNA &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x6C34;&#x7D20;&#x767A;&#x9175;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x7A2E;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x305D;&#x306E;&#x4E2D;&#x3067;&#x6700;&#x3082;&#x652F;&#x914D;&#x7684;&#x306A;&#x767A;&#x9175;&#x69FD;&#x3001;Fervidobacterium sp. &#x6B63;&#x5E38;&#x306B;&#x5206;&#x96E2;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x5206;&#x96E2;&#x306F;&#x3001;&#x6709;&#x6A5F;&#x70AD;&#x7D20;&#x306E;&#x767A;&#x9175;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x6C34;&#x7D20;&#x3092;&#x751F;&#x7523;&#x3002;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5206;&#x6563;&#x30DE;&#x30C3;&#x30C8;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x6C34;&#x7D20;&#x751F;&#x7523;&#x306E;&#x30E2;&#x30EA;&#x30D6;&#x30C7;&#x30F3;&#x9178;&#x3001;&#x8FFD;&#x52A0;&#x306A;&#x3057;&#x305D;&#x306E;&#x540C;&#x6642;&#x751F;&#x7523;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x5BC6;&#x306A;&#x30D1;&#x30C3;&#x30AD;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x30DE;&#x30C3;&#x30C8;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x6C34;&#x7D20;&#x306E;&#x6D88;&#x8CBB;&#x91CF;&#x304C;&#x5FC5;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x30DE;&#x30C3;&#x30C8;&#x5185;&#x306E;&#x5FAA;&#x74B0;&#x7684;&#x96FB;&#x5B50;&#x4F1D;&#x9054;&#x3092;&#x63D0;&#x6848;&#x3059;&#x308B;&#x3059;&#x306A;&#x308F;&#x3061;&#x3001;3 &#x3064;&#x306E;&#x8981;&#x7D20;&#x3092;&#x901A;&#x3057;&#x3066;&#x96FB;&#x5B50;&#x306E;&#x6D41;&#x308C;&#x304C;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#xFF1A; S (&#x5143;&#x7D20;&#x786B;&#x9EC4;&#x3001;&#x786B;&#x5316;&#x7269;&#x3001;&#x786B;&#x9178;&#x5869;)&#x3001;C (&#x4E8C;&#x9178;&#x5316;&#x70AD;&#x7D20;, &#x6709;&#x6A5F;&#x70AD;&#x7D20;)&#x3001;H (&#x30C7;&#x30A3;&#x6C34;&#x7D20;&#x3001;&#x967D;&#x5B50;&#xFF09;&#x3002;

&#x751F;&#x7523;&#x3068;&#x6D88;&#x8CBB;&#x7CF8;&#x72B6;&#x767A;&#x751F;&#x578B;&#x5149;&#x5408;&#x6210;&#x7D30;&#x83CC;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x652F;&#x914D;&#x6E29;&#x6CC9;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30DE;&#x30C3;&#x30C8;&#x4E2D;&#x306E;&#x6C34;&#x7D20;&#x306E;&#x3002;

&#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xB9E4;&#xD2B8; filamentous anoxygenic &#xAD11;&#xD569;&#xC131; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544; Chloroflexus aggregans&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; Nakabusa &#xC77C;&#xBCF8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC628;&#xCC9C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC1C;&#xBC1C;. &#xC774; &#xB9E4;&#xD2B8;&#xC5D0; &#xD610; &#xAE30;&#xC131; &#xC870;&#xAC74;, &#xD669;&#xC0B0;&#xC744; &#xC904;&#xC774;&#xB294; interspecies &#xC0C1;&#xD638;&#xC791;&#xC6A9;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD669;&#xD654; &#xC0DD;&#xC0B0;&#xC790;&#xB85C; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC640; &#xD669; &#xD654;&#xBB3C; &#xC18C;&#xBE44;&#xC790;&#xB85C; C. aggregans; &#xC720;&#xD669; &#xC0AC;&#xC774;&#xD074;&#xC744; &#xAD6C;&#xC131; &#xD558;&#xB294; &#xAC83; &#xC81C;&#xC548; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xD669;&#xD654; Nakabusa &#xC0DD;&#xC0B0;&#xC744; &#xC704;&#xD574; &#xD65C;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xC804;&#xC790; &#xAE30;&#xC99D;&#xC790; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC804;&#xC790; &#xAE30;&#xC99D;&#xC790; &#xBC0F; &#xC6D0;&#xB798;&#xC758; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xC804; &#xADF8; &#xC18C;&#xC2A4; &#xD655;&#xC778; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xB9E4;&#xD2B8;&#xC758; &#xBD80; &#xD654;&#xB97C; &#xD0D0;&#xD5D8; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559;&#xC801; &#xD669;&#xC0B0; &#xC5FC; &#xAC10;&#xC18C; &#xC5B5;&#xC81C; molybdate &#xC874;&#xC7AC; &#xC218;&#xC18C; &#xAC00;&#xC2A4;&#xAC00;&#xC774; &#xC218;&#xC18C; &#xD669;&#xC0B0; &#xC904;&#xC5EC; &#xC804;&#xC790; &#xAE30;&#xC99D;&#xC790;&#xB85C; &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC18C;&#xBAA8; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; &#xB9E4;&#xD2B8; &#xC0D8;&#xD50C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB098;&#xC628; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;. &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; C. aggregans&#xB294; &#xB610;&#xD55C; &#xAE30;&#xB2A5; &#xC218;&#xC18C; &#xC18C;&#xBE44;&#xC790;&#xB85C; &#xC11C; &#xC870;&#xBA85; &#xC544;&#xB798; &#xC218;&#xC18C; &#xC0DD;&#xC0B0; &#xAC10;&#xC18C;. &#xC18C;&#xB7C9;&#xC758; &#xC218;&#xC18C; &#xB610;&#xD55C; &#xC720;&#xD669; &#xAC10;&#xC18C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB41C; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB9E4;&#xD2B8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC99D;&#xD3ED; 16S rRNA &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xBCF5;&#xC81C; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC; &#xBD84;&#xC11D; &#xD574;&#xBD80;&#xD559; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544; &#xC218;&#xC18C; &#xC0DD;&#xC0B0;&#xC758; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xC885;&#xC758; &#xC874;&#xC7AC;&#xB97C; &#xAC00;&#xB9AC;&#xD0A8;&#xB2E4;. &#xADF8; &#xC911; &#xAC00;&#xC7A5; &#xC9C0;&#xBC30;&#xC801;&#xC778; fermenter Fervidobacterium sp. &#xC131;&#xACF5;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xACA9;&#xB9AC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774; &#xBD84;&#xB9AC;&#xB294; &#xC720;&#xAE30; &#xD0C4;&#xC18C;&#xC758; &#xBC1C;&#xD6A8;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xC218;&#xC18C; &#xC0DD;&#xC0B0;. &#xB9E4;&#xD2B8;&#xC5D0; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xBD84;&#xC0B0; &#xADC0;&#xCC29;&#xB418; &#xC5C8; molybdate, &#xCD94;&#xAC00; &#xC5C6;&#xC774; &#xC218;&#xC18C; &#xC0DD;&#xC0B0;&#xC744; &#xB3D9;&#xC2DC; &#xC0DD;&#xC0B0;&#xC744; &#xC81C;&#xC548; &#xD558;&#xBA70; &#xB9E4;&#xD2B8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC218;&#xC18C;&#xC758; &#xC18C;&#xBE44; &#xC140;&#xC758; &#xACE0;&#xBC00;&#xB3C4; &#xD328;&#xD0B9;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xC81C;&#xC548; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xB9E4;&#xD2B8; &#xB0B4; &#xC21C;&#xD658; &#xC804;&#xC790; &#xD750;&#xB984; &#xC989;, &#xC138; &#xAC00;&#xC9C0; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD558;&#xB294; &#xC804;&#xC790; &#xD750;&#xB984;: S (&#xC6D0;&#xC18C; &#xC720;&#xD669;, &#xD669; &#xD654;&#xBB3C;, &#xD669;&#xC0B0; &#xC5FC;), C (&#xC774;&#xC0B0;&#xD654; &#xD0C4;&#xC18C;, &#xC720;&#xAE30; &#xD0C4;&#xC18C;)&#xC640; H (&#xB514;-&#xC218;&#xC18C;, &#xC591;&#xC131;&#xC790;).

&#xC0DD;&#xC0B0;&#xACFC; &#xC18C;&#xBE44;&#xC758; &#xC218;&#xC18C; &#xC628;&#xCC9C; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xB9E4;&#xD2B8; filamentous anoxygenic &#xAD11;&#xD569;&#xC131; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC9C0;&#xBC30;.

Tapetes microbianos que contiene la bacteria fotosint&eacute;tica anoxig&eacute;nica filamentosos Chloroflexus aggregans se convierten en Nakabusa termales en Jap&oacute;n. Bajo condiciones anaer&oacute;bicas en estas esteras, interacci&oacute;n entre las especies de Sulfato-reducci&oacute;n bacterias como productores de sulfuro y C. aggregans como un consumidor de sulfuro se ha propuesto constituir un ciclo de azufre; sin embargo, el donante del electr&oacute;n utilizado para la producci&oacute;n de sulfuro microbiana en Nakabusa queda identificarse. Para determinar este donante del electr&oacute;n y su fuente, ex situ experimental fue explorado incubaci&oacute;n de esteras. En presencia de molibdato, que inhibe la reducci&oacute;n del sulfato biol&oacute;gica, gas de hidr&oacute;geno fue liberado de estera muestras, indicando que este hidr&oacute;geno se consume normalmente como donante de electrones por Sulfato-reducci&oacute;n bacterias. Disminuci&oacute;n de la producci&oacute;n de hidr&oacute;geno bajo iluminaci&oacute;n, indicando aggregans C. tambi&eacute;n funciones como un consumidor de hidr&oacute;geno. Peque&ntilde;as cantidades de hidr&oacute;geno pueden se tambi&eacute;n han consumido para la reducci&oacute;n de azufre. Clon biblioteca an&aacute;lisis de 16S rRNA genes amplificados de las esteras indic&oacute; la existencia de varias especies de bacterias fermentativas producci&oacute;n de hidr&oacute;geno. Entre ellos, el fermentador m&aacute;s dominante, Fervidobacterium SP., fue correctamente aislado. Este aislante producido hidr&oacute;geno mediante la fermentaci&oacute;n de carbono org&aacute;nico. Dispersi&oacute;n de las c&eacute;lulas microbianas en las esteras dio lugar a la producci&oacute;n de hidr&oacute;geno sin la adici&oacute;n de molibdato, sugiriendo que la producci&oacute;n simult&aacute;nea y consumo de hidr&oacute;geno en las esteras requiere embalaje densa de las c&eacute;lulas. Proponemos un flujo c&iacute;clico de electrones en los Tapetes microbianos, es decir, flujo de electrones se produce a trav&eacute;s de tres elementos: S (azufre elemental, sulfuro, sulfato), C (di&oacute;xido de carbono, el carbono org&aacute;nico) y H (di-hidr&oacute;geno, protones).

Producci&oacute;n y consumo de hidr&oacute;geno en Tapetes microbianos termales, dominado por una bacteria fotosint&eacute;tica anoxig&eacute;nica filamentosos.

R. Craig Everroad

Biosphere Oriented Biology Research Unit

RIKEN Advanced Science Institute

Concentration of Metabolites from Low-density Planktonic Communities for Environmental Metabolomics using Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy

R. Craig Everroad

.css-o250i3{font-size:18px;font-family:Open Sans,sans-serif;line-height:21.6px;}Biosphere Oriented Biology Research Unit

RIKEN Advanced Science Institute

Concentration of Metabolites from Low-density Planktonic Communities for Environmental Metabolomics using Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy

Biosphere Oriented Biology Research Unit