Le système de dénomination IUPAC pour les alcènes remplace -an- par -en- dans les alcanes parents correspondants. En conséquence, un alcène simple remplace le suffixe -ane de l'alcane par -ène.
Conformément aux règles de l'IUPAC, la chaîne carbonée la plus longue contenant le nombre maximum de doubles liaisons est identifiée comme la chaîne mère et est numérotée de telle sorte que les atomes de carbone doublement liés reçoivent le nombre le plus bas possible. L'emplacement de la double liaison est indiqué par le numéro de son premier atome de carbone. Dans les alcènes ramifiés, la préférence de numérotation est donnée à la double liaison plutôt qu'aux substituants. Les substituants sont numérotés selon leur position dans la chaîne mère et classés par ordre alphabétique. Cependant, le nom et la position des groupes substituants sont cités avant la double liaison. Dans les cycloalcènes, le cycle est considéré comme la chaîne mère et les nombres les plus bas possibles sont attribués à la double liaison. Les alcènes ayant plusieurs doubles liaisons dans la chaîne mère sont appelés polyènes et ont les infixes -adien- et -atrien- pour deux et trois doubles liaisons, respectivement.
Certains alcènes plus petits portent des noms communs reconnus par l'IUPAC. Par exemple, l’éthène est communément appelé éthylène, le propène est appelé propylène, etc.