<p class="jove_content"> Le dispositif de micro-miroirs dans cette recherche a été financée par subvention de la Fondation Whitaker RG-02-0682 à N. Boustany. Les travaux en cours est financé par la NSF accorde-DBI-0852857 à N. Boustany. Pasternack RM a été partiellement soutenue par une bourse de Rutgers présidentielle supérieures. Nous tenons également à remercier le Dr E. White pour les cellules iBMK utilisé dans nos études et le Dr Metaxas DN pour la discussion utile sur les stratégies de filtrage optique. </p>

<ol>
	<li>Pasternack, R. M., Qian, Z., Zheng, J. -. Y., Metaxas, D. N., White, E., Boustany, N. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Measurement+of+Subcellular+Texture+by+Optical+Gabor-Like+Filtering+with+a+Digitial+Micromirror+Device.">Measurement of Subcellular Texture by Optical Gabor-Like Filtering with a Digitial Micromirror Device.</a> <em style='font-style: italic'>Optics Letters</em>. <b>33</b> (19), 2209-2211 (2008).</li><li>Pasternack, R. M., Qian, Z., Zheng, J. -. Y., Metaxas, D. N., Boustany, N. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Highly+sensitive+size+discrimination+of+submicron+objects+using+optical+Fourier+filtering+based+on+two-dimensional+Gabor+filters.">Highly sensitive size discrimination of submicron objects using optical Fourier filtering based on two-dimensional Gabor filters.</a> <em style='font-style: italic'>Optics Express</em>. <b>17</b> (14), 12001-12012 (2009).</li><li>Zheng, J. -. Y., Pasternack, R. M., Boustany, N. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optical+scatter+imaging+with+a+digital+micromirror+device.">Optical scatter imaging with a digital micromirror device.</a> <em style='font-style: italic'>Optics Express</em>. <b>17</b> (22), 20401-20414 (2009).</li></ol>

Certains aspects de ces méthodes ont été inclus à l&#39;intérieur et de divulgation d&#39;invention, Rutgers University Dossier # 09-049.

<p class="jove_content"> La méthode décrite ci-dessus cartes rendements morphométrique de l&#39;objet qui peut coder la taille des particules ou l&#39;orientation par exemple. Cette information structurale peut être utilisé de plusieurs façons: </p><ol><li> Il peut être utilisé comme un écran initial pour identifier les régions de tissus ou de cellules qui sont modifiées au cours d&#39;un traitement spécifique et ensuite d&#39;analyser plus avant ces régions avec des dosages moléculaires et biochimiques. </li><li> Il peut être ut...

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<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>DMEM</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Low glucose DMEM</td>
</tr>
<tr>
<td>Liebowitz L15 medium</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Without phenol red</td>
</tr>
<tr>
<td>L-glutamine</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Mitotracker Green</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Bovine Brain Extract</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Clonetics</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Fetal Bovine Serum</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Gemini Biosciences</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Heparin</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Staurosporine</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Dymethylsulfoxide</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Inverted microscope</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Carl Zeiss</td>
<td>Axiovert 200M</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>DMD</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Texas Instruments</td>
<td>TI 0.7 XGA DMD 1100</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>CCD</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Roper Scientific</td>
<td>Cascase 512B</td>
<td>High (16 bit) dynamic range CCD</td>
</tr>
<tr>
<td>CCD</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Roped Scientific </td>
<td>Coolsnap cf</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>
	

optical scatter microscopy based on two-dimensional gabor filters

<p class="jove_content"> Nous démontrons un instrument microscopiques qui peuvent mesurer la texture subcellulaire découlant de la morphologie et l&#39;organisation des organites dans les cellules vivantes non colorées. L&#39;instrument proposé s&#39;étend de la sensibilité de l&#39;étiquette sans la microscopie optique à des changements dans la taille nanométrique des organelles et la forme et peut être utilisé pour accélérer l&#39;étude de la relation structure-fonction se rapportant à la dynamique sous-jacente organelle processus biologiques fondamentaux, tels que la mort cellulaire programmée ou cellulaire différenciation. Le microscope peut être facilement mis en œuvre sur les plates-formes de microscopie existant, et peut donc être diffusé aux laboratoires individuels, où les scientifiques peuvent mettre en œuvre et utiliser les méthodes proposées avec un accès illimité. </p><p class="jove_content"> La technique proposée est en mesure de caractériser la structure subcellulaire par l&#39;observation des cellules à travers deux dimensions filtres de Gabor optique. Ces filtres peuvent être réglés à l&#39;échelle nanométrique sens avec (10 nm de) la sensibilité, des attributs spécifiques morphologiques relatives à la taille et l&#39;orientation de la non-sphériques organites subcellulaires. Bien que basé sur le contraste généré par la diffusion élastique, la technique ne repose pas sur un modèle de diffusion inverse détaillée ou sur la théorie de Mie pour extraire des mesures morphométriques. Cette technique est donc applicable aux non-sphériques organites pour lesquels une description précise de dispersion théorique n&#39;est pas facile étant donné, et fournit des paramètres morphométriques distinctifs qui peuvent être obtenues dans les cellules vivantes non colorées pour évaluer leur fonction. La technique est avantageuse par rapport à traitement d&#39;images numériques en ce qu&#39;elle opère directement sur le champ de l&#39;objet plutôt que de transformer l&#39;intensité de l&#39;objet discrétisé est. Il ne repose pas sur les taux d&#39;échantillonnage d&#39;image et peut donc être utilisé pour dépister rapidement l&#39;activité morphologique au sein de centaines de cellules à un moment, ce qui facilite grandement l&#39;étude de la structure des organelles delà organite la segmentation individuelle et de la reconstruction par microscopie confocale de fluorescence fortement agrandie des images numériques des champs de vision limité. </p><p class="jove_content"> Dans cette démonstration, nous montrons les données d&#39;une diatomée marine pour illustrer la méthodologie. Nous montrons aussi les données préliminaires recueillies auprès des cellules vivantes pour donner une idée de comment la méthode peut être appliquée dans un contexte biologique pertinent. </p>

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Optical Scatter Microscopy Based on Two-Dimensional Gabor Filters

<p class="jove_content">Nous démontrons une méthode de microscopie en champ sombre repose sur Gabor-like de filtrage pour mesurer la dynamique subcellulaire dans les cellules vivantes unique. La technique est sensible aux modifications dans la structure des organelles, comme la fragmentation mitochondriale.</p>

Microscopie dispersion optique basé sur des filtres de Gabor bidimensionnelle

We demonstrate a microscopic instrument that can measure subcellular texture arising from organelle morphology and organization within unstained living ...

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Biology

9.5K vues.  Rutgers University. Nous démontrons une méthode de microscopie en champ sombre repose sur Gabor-like de filtrage pour mesurer la dynamique subcellulaire dans les cellules vivantes unique. La technique est sensible aux modifications dans la structure des organelles, comme la fragmentation mitochondriale.