Extracting the 3D Region of the Liver and Computing Liver Fat Fraction Using MRI-Dixon Data

Pour commencer à extraire la région 3D du foie à partir des données IRM de Dixon, ouvrez le logiciel Mimics et choisissez un nouveau projet. Dans la boîte de dialogue suivante, localisez le dossier contenant les images de la phase de sortie de Dixon. Cliquez sur suivant, puis cliquez sur continuer, puis appuyez sur convertir pour entrer dans le mode d’édition de séquence.

Cliquez sur nouveau dans la boîte de dialogue du masque située sur le côté droit pour générer un masque vide et opter pour le seuil maximum. Utilisez l’outil Modifier les masques situé sous l’étiquette du segment pour délimiter la zone hépatique dans toutes les vues horizontales. Choisissez le masque hépatique représenté précédemment et cliquez sur calculer la partie du masque pour créer une représentation spatiale 3D du foie.

Accédez au fichier, puis sélectionnez Exporter, puis choisissez l’option DICOM. Dans la boîte de dialogue contextuelle, sélectionnez le masque de foie, spécifiez le chemin d’accès et les noms des fichiers, puis cliquez sur OK pour exporter la région du foie 3D vers les fichiers DICOM désignés. Remplacez le répertoire par le dossier des images en phase et sélectionnez la fonction Volume_In pour générer le volume en phase.

Remplacez le répertoire par le dossier des images d’eau uniquement et sélectionnez la fonction Volume_Water pour générer le volume d’eau uniquement. Sélectionnez la fonction de volume FF et utilisez les deux volumes précédemment générés comme entrées pour obtenir le volume FF de l’IRM abdominale. Utilisez la fonction LFF, en lui fournissant la région hépatique 3D et la carte de rigidité hépatique comme paramètres d’entrée.

Exécutez la fonction de distribution LFF en utilisant les mêmes paramètres d’entrée que le volume LFF pour produire la distribution spatiale de la fraction de graisse hépatique 3D. La fusion du contour du foie 3D avec la carte FF 2D a généré un modèle de distribution FF 3D intégré. Cela a révélé des valeurs de fraction de graisse à différentes positions hépatiques, permettant une mesure précise de la proportion du foie à différents niveaux de stéatose.

La comparaison entre un foie normal et une stéatose hépatique a validé la capacité de la technique à discerner différents modèles de distribution 3D LFF.