Pour commencer, capturez des images de glomérules marqués sous un microscope confocal ou un microscope à fluorescence à feuille de lumière. Importez les fichiers d’image dans le logiciel d’analyse d’images. Cliquez sur le bouton de surface pour créer une nouvelle surface.
Suivez le guide en bas à gauche de l’écran. Cliquez sur le bouton suivant. Cochez la case de l’option de lissage et entrez un nombre pour contrôler le détail de la surface.
Sélectionnez la soustraction de l’arrière-plan dans le seuillage et remplissez la zone avec le diamètre moyen approximatif des glomérules. Cliquez sur le bouton suivant, ajustez si nécessaire, puis cliquez sur le bouton suivant. Sélectionnez la plage appropriée, puis cliquez sur le bouton suivant pour créer une surface.
Cliquez ensuite sur filtrer, puis sur le bouton Ajouter pour ajouter de la sphéricité afin de filtrer les objets non sphériques. Cliquez sur le bouton Dupliquer pour copier cette nouvelle surface. Cliquez sur le bouton Statistiques, puis sur le bouton Général.
Le logiciel présentera le nombre de glomérules comme le nombre total de surface. Pour calculer le volume des glomérules, cliquez sur le bouton de sélection pour sélectionner les objets cibles et présenter le volume de chaque objet. Exportez les statistiques vers une feuille de calcul pour une analyse plus approfondie.
Pour calculer le volume de la tranche, ou du rein entier, importez d’abord les images dans le logiciel d’analyse d’images. Après avoir cliqué sur le bouton de surface et saisi un nombre dans l’option de lissage, sélectionnez l’intensité absolue et le seuillage. Cliquez sur le bouton suivant.
Ajustez la surface jusqu’à ce qu’elle recouvre l’ensemble du tissu, puis cliquez sur le bouton suivant pour créer la surface. Cliquez sur le bouton de sélection pour sélectionner la surface de l’ensemble du tissu et présenter le volume du tissu. Enfin, exportez les statistiques vers une feuille de calcul.
À l’aide d’un logiciel de traitement d’image, le nombre et le volume des glomérules ont été comptés dans une tranche de rein dans un rein entier, ou dans une bandelette. À l’aide de ces valeurs, le rapport volumique et la fréquence des glomérules ont pu être calculés.
