Après l’analyse LCMS des extraits de racines de plantes, examinez le chromatogramme ionique total des balayages Q1 et Q3, y compris le balayage ionique du produit dépendant des données. Observez la masse mère d’ions abondants avec des caractéristiques semblables à celles des alcaloïdes tropanes, y compris une masse inférieure à 500 daltons pour l’ion chargé positivement, typiquement, un nombre pair. Temps de rétention compris entre deux et 22 minutes, et fragments correspondant à des valeurs de charge maîtresse compatibles avec les alcaloïdes tropanes.
Examinez le chromatogramme ou le canal de balayage ionique précurseur spécifiquement pour la charge maîtresse 124, et déterminez quels pics ou ions auxquels les temps de rétention produisent ce fragment spécifique. Cliquez balayage par balayage, à travers le chromatogramme et examinez l’ensemble des spectres MS-MS à partir du balayage ionique du produit dépendant des données, en particulier pour les espèces moins abondantes. Ensuite, analysez ensemble les chromatogrammes à balayage d’ions précurseurs pour les charges maîtresses 122 et 140, qui indiquent des alcaloïdes tropanes disubstitués, et les charges maîtresses 138 et 156, indiquant des alcaloïdes tropanes trisubstitués.
Examinez le chromatogramme ou les canaux de balayage de perte neutre pour les charges principales 160 et 166. Identifiez les pics ou les ions qui produisent des pertes neutres et notez leurs temps de rétention. Cliquez balayage par balayage sur le chromatogramme et comparez avec la fragmentation du balayage d’ions de produit dépendante des données, en particulier pour les espèces moins abondantes.
Utilisez la combinaison de données de balayage d’ions précurseurs et de données de balayage de perte neutre, soutenue par des résultats de balayage d’ions de produit dépendants des données, pour effectuer des annotations présumées des alcaloïdes observés. Commencez par la plus petite masse tropane, puis ajoutez la perte neutre et tenez compte de la masse restante. Comparez les annotations d’alcaloïdes avec celles rapportées dans la littérature pour déterminer le modèle de substitution des alcaloïdes tropanes.
De plus, utilisez des étalons disponibles dans le commerce d’alcaloïdes tropanes courants pour confirmation. Le chromatogramme complet Q1 de l’extrait de racine de Datura metel a révélé divers alcaloïdes tropanes avec des abondances variables. Les caractéristiques de la charge maîtresse 124, 122, 140, 138 et 156 indiquaient la présence d’alcaloïdes tropanes.
Beaucoup de ces alcaloïdes tropanes étaient acétylés, tigloylés ou dérivés de l’acide phénolactique ou tropique, comme en témoignent les signaux dans les chromatogrammes à balayage à perte neutre. L’utilisation des données spectrales a permis d’annoter des alcaloïdes spécifiques, notamment l’identification d’un composé avec une masse apparente de charge maîtresse 224. La méthode a permis de déduire une structure composée par son modèle de fragmentation et sa perte neutre, confirmant la présence de groupes tigloyl en tant que substitutions.
L’examen d’un extrait aqueux au méthanol de graines de Datura stramonium a permis d’obtenir un chromatogramme de pointe de base de balayage Q1 complet, identifiant un alcaloïde tropane monosubstitué très abondant, probablement de l’hyoscyamine. Le spectre MS-MS à haute résolution permet également d’identifier de nouveaux alcaloïdes à partir de graines de Datura stramonium.
