Pour commencer, utilisez un système de transfert d’autographes ostéochondrals pour créer un défaut de 4,75 millimètres de diamètre dans le condyle latéral d’un mouton euthanasié. À l’aide d’un marteau orthopédique, créez un défaut de 10 millimètres de profondeur, et récupérez l’explant ostéochondral du condyle. Préparez le ciment de phosphate de calcium, complété par 40 microgrammes par millilitre de BMP 2, et chargez la pâte de ciment dans une seringue de trois millilitres.
Injectez ensuite le ciment dans le défaut de l’explant à l’aide d’une aiguille de calibre 18. Allumez l’appareil de microtomographie à rayons X et placez le tube d’explant sur le porte-échantillon. Réglez la résolution à 10,7 micromètres et le temps d’exposition à 1 200 millisecondes, avec un filtre en aluminium d’un millimètre à 80 kilovolts et 125 microampères.
Faites la moyenne de trois images pour chaque incrément de rotation de 0,45 degré afin d’améliorer le rapport signal/bruit. Pour effectuer la segmentation d’image, utilisez l’assistant de segmentation intégré pour entraîner un modèle d’apprentissage profond afin de distinguer l’os du ciment. Sélectionnez une zone représentative contenant de l’os, du ciment et de l’arrière-plan à partir des images de micro-tomodensitométrie reconstruites, et segmentez cette première image.
Maintenant, dans l’onglet modèle, générez un modèle de Deep Learning et sélectionnez la routine de réseau 3D. Ensuite, faites un clic droit sur le modèle généré et définissez les paramètres expérimentaux comme la profondeur de cinq, la taille du patch 32 par 32, l’algorithme, le rapport de foulée de 0,25. Et 10 x données.
Utilisez le cadre segmenté pour entraîner le modèle de Deep Learning en cliquant sur le bouton Entraîner. Une fois l’entraînement terminé, définissez une deuxième image et segmentez-la automatiquement à l’aide de la fonction de prédiction. Cliquez ensuite sur exporter pour publier le modèle entraîné et l’appliquer à l’ensemble du jeu de données de micro-tomographie assistée par ordinateur en sélectionnant segment, modèle exporté, segment, jeu de données complet.
