Method Article
פרוטוקול זה מתאר כיצד ליצור מערכת כתב כי ניתן להשתמש כדי לזהות ולכמת קולטן-ליגנד אינטראקציות.
אינטראקציות בין קולטני ליגנדים מהווים תהליך ביולוגי בסיסי. אולם, ישירה ניסויים עם תאים המבטאים את הקולטן מקורית, ליגנד מאתגרת כיוון ליגנד של קולטן מסוים עשוי להיות לא ידוע בצרות עם ליגנד מקורי יכול להיות מסובך טכנית. כדי לטפל מכשולים אלה, נתאר מערכת הכתב כדי לזהות את איגוד והפעלה של קולטן ספציפי ליגנד עניין. מערכת זו כתב, המחשבים חוץ-תאי של קולטן מסוים היא מצומדת העכבר CD3ζ, חלבון chimeric זה מתבטא ואז העכבר BW תאים. אז יכול להיות מודגרות תאים אלה-BW transfected עם מטרות שונות (למשל, תאים או נוגדנים). הפעלה של קולטן transfected מוביל הפרשת interleukin-2 העכבר (mIL-2) אשר ניתן להבחין מקושרים-אנזים immunosorbent assay (אליסה). מערכת הכתב הזה יש את היתרונות של להיות רגיש וספציפי על קולטן בודד. בנוסף, רמת ההפעלה של קולטן ספציפי בקלות ניתן לכמת והוא יכול לשמש גם במקרים בו ליגנד של הקולטן אינו ידוע. מערכת זו יושמה בהצלחה ברבות מן המחקרים שלנו לאפיון אינטראקציות קולטן-ליגנד. יש לנו עובדים לאחרונה מערכת זו כדי ללמוד את ההפעלה של רצפטורים Fcγ האנושית (FcγRs) באמצעות נוגדנים anti-CD20 monoclonal שונים בשימוש קליני.
מערכת הכתב BW היא שיטת לימוד אינטראקציות קולטן-ליגנד1. מערכת זו היא יתרון במיוחד כאשר ליגנד של קולטן מסוים אינו ידוע או ניסויים ליגנד אנדוגני קשים מבחינה טכנית. זה יכול לשמש גם ללמוד את הכריכה של נוגדנים חד-שבטיים FcγRs האנושי. השיטה מבוססת על ביטוי חלבון chimeric בתאים העכבר BW. חלבון chimeric זה מורכב תחום חוץ-תאי של הקולטן עניין דבוקה על התחומים transmembrane, תאיים של הרשת אפי ' עכבר '. איגוד של ליגנדים המתאים של הקולטן מוביל הפרשת il-2 העכבר, אשר ניתן לאתרם בקלות על ידי אליסה, כמופיע באיור1. שיטה זו היא רגיש ואת ספציפי לקולטן בודדים, קלה לתפעול, במיוחד לשחזור. זה יכול ובכך משלימים כלים נוספים ללמוד אינטראקציות קולטן-ליגנד. לדוגמה, ניתן להשתמש למסך מספר שורות תאים לנוכחות של ליגנד על קולטן ספציפי (גם אם ליגנד עצמה לא זוהתה) או כדי לזהות את ההפעלה של האדם FcγRs על ידי נוגדנים חד-שבטיים או בנסיוב אדם המכילים אנטי-ויראליות נוגדנים. למרות ראשי תאים חיסוניים אקספרס FcγRs אנדוגני, הם בדרך כלל קשה להתמודד עם ולבטא בדרך כלל מספר הקולטנים Fc.
השתמשנו במערכת זו בהצלחה ברבות מן המחקרים שלנו לאפיון אינטראקציות קולטן-ליגנד. אלה כוללים זיהוי haemagglutinin ליגנד של הקולטן התא NK NKp462, זיהוי PVR ו- nectin-2 ליגנדים עבור האדם והעכבר TIGIT3,4, ומאגד להראות את זה nucleatum fusobacterium את החיידק, הפעלת TIGIT האנושי5. בנוסף, BW תאים המבטאים קולטנים Fc שימשו בהצלחה לזהות נוגדנים אנטי ויראלית של המטופלים סרה6,7,8. באופן ספציפי, לאחרונה הקמנו BW תאים המבטאים FcγRs האנושית לזהות הפעלת ה-FcR דיפרנציאלית של נוגדנים אנטי-CD20 המשמש לטיפול של לוקמיה לימפוציטית כרונית (CLL)9. חשוב, יש התוצאות של מערכת הכתב BW מאומתים בניסויים משלימים.
1. דור של פלסמיד המבטאת את Chimeric לבנות
הערה: המטרה היא ליצור פלסמיד המבטאת את התחום חוץ-תאי של הקולטן עניין דבוקה על התחומים transmembrane, תאיים על העכבר שרשרת CD3ζ (איור 2 א).
2. תקנים של פלסמיד המבטאת את החלבון Chimeric לתאי BW
הערה: שיטות שונות יכול גם להיות מועסק על תרביות תאים (למשל., על-ידי זיהום lentiviral). לפני אלקטרופורציה, לבצע אתנול משקעים של ה-DNA כפי שמתואר להלן. הפעולות הבאות דורשות בתנאים סטריליים.
3. אימות של הביטוי של הקולטן Transfected בתאים הבארות חיובי.
4. דגירה של התאים Transfected BW עם מטרות
הערה: בעת שימוש התאים BW transfected בפעם הראשונה, עדיף לבדוק אותם על מטרות המבטאים של ליגנד הידוע של הקולטן של עניין או על צלחת מכורך נוגדנים במיוחד מכוונת כנגד הקולטן עניין (cross-linking ניסויים; ראה להלן, סעיף 4.2.1.3).
5. אליסה
איור 3 ממחיש את התוצאות של ניסוי עם מערכת הכתב BW. בניסוי זה, תאים CLL מודגרות מראש עם נוגדנים anti-CD20 שונים (rituximab ו- obinutuzumab), ואז מתפשט במשותף עם transfected BW תאים המבטאים CD16a-CD3ζ. ניסויים דומים נערכו שלנו לימוד9. איור 3A מציג תמונה של צלחת אליסה raw איפה עוצמת הצבע המתאים ריכוז של מיליון-2. הניסוי בוצע דולר. ניסוי זה כלל מספר פקדים: תאים CLL מודגרות עם הורים untransfected BW תאים (בשורה העליונה), תאים CLL מודגרות עם תאים BW אקספרס CD16a-CD3ζ אבל בלי נוגדן או עם נוגדן של שליטה (שש בארות בשורה השנייה משמאל) . הדגירה של תאים BW לידי ביטוי CD16 עם תאים CLL היו מודגרות מראש עם נוגדנים anti-CD20 המושרה על הפרשת mIL-2 לעומת רמת mIL-2 מן הבארות שליטה משמעותית. חשוב, דגירה מראש של תאים CLL עם obinutuzumab anti-CD20 מופעל CD16 בצורה חזקה יותר מאשר rituximab, ידוע מציאת אשר היה recapitulated על ידי המערכת שלנו. השורה האחרונה מראה יורד ריכוז מוגדרים מראש של מיליון-2 רקומביננטי (ללא התוספת של תאים). הבאר נכון בשורה האחרונה אין מיל-2 ומייצג הקריאה רקע המופיע הדומה הבארות שליטה. איור 3B מציג כימות של התוצאות של צלחת אליסה שמוצג באיור 3 א. רמות צפיפות אופטית (OD) הומרו mIL-2 ריכוזים בהתבסס על העקומה סטנדרטי עם מיליון רקומביננטי-2. איור 3C מציג ניסוי תגובת המינון בו מינונים שונים של נוגדנים היו מודגרות מראש עם תאים CLL, ואז מתפשט עם תאים BW לבטא CD16.
איור 1: ייצוג סכמטי של מערכת הכתב BW- BW5147 התאים הם stably transfected עם החלק חוץ-תאי של קולטנים שונים דבוקה על התחומים transmembrane, cytoplasmic של העכבר שרשרת CD3ζ (chimeric recptor-CD3ζ). הפעלה של CD3ζ-קולטן ספציפי על-ידי ליגנד התוצאה הפרשת mIL-2 אשר יכולים להתגלות על ידי אליסה. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.
איור 2: המבנה של הקולטן-CD3ζ chimeric את העיצוב של ה-PCR תחל. (א) מבנה כללי של קולטן חוץ-תאית התמזגו לתחומים transmembrane, תאיים של העכבר CD3ζ. (ב) התחום חוץ-תאי של הקולטן היה מוגבר עם 3' פריימר אשר כללה גם את נוקלאוטידים של CD3ζ. (ג) דומיינים תאיים ו transmembrane של CD3ζ היו מוגבר עם 5' פריימר שכלל גם קולטן נוקלאוטידים. (ד), בעקבות תגובות PCR הסופי, שני המקטעים, אשר יש חפיפה רצפים, שימשו את תבנית ה-DNA. כל דמות פאנלים, חלבונים שונים תחומים קטגוריות מקודדות לפי צבעים, לכוד מלבנים כחול (רצף CD3ζ) ומלבנים אדום (הרצף קולטן). אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.
איור 3: איור של המוצר הסופי של מערכת הכתב BW- (A, B, C) תאים CLL היו מראש incubated עם או בלי שני נוגדנים anti-CD20 (rituximab ו- obinutuzumab) או של נוגדן שליטה. לאחר מכן, התאים נוגדן מכורך היו מודגרות עם תאים BW הורים או תאים BW המבטאות CD16a-CD3ζ. הרמה של 2 מיליון ב- תגובת שיקוע נקבע על ידי אליסה. (א) תמונה של צלחת אליסה raw. עוצמת צבע מציין את ריכוז mIL-2 ב- תגובת שיקוע. הניסוי בוצע דולר. השורה התחתונה מציגה את המדידה אליסה להפחתת ריכוזי רקומביננטי mIL-2 אשר נותחו באותה הצלחת. (ב) כימות של אליסה קריאת באיור (א). רמות mIL-2 חושבו באמצעות עיקול רגיל של מיליון-2. (ג) ניסוי של תגובת המינון שבו היו מינונים שונים של נוגדנים מודגרות מראש עם תאים CLL, ואז מתפשט עם תאים BW לבטא CD16a-CD3ζ. , P < 0.001; מבחן t של סטודנט (B) או ANOVA עם השוואות מרובות (C). ההשוואה היחידה ב (ג) ולא היה שונה באופן משמעותי היה rituximab ו אל פקד Ab הריכוז הראשון (0.01 µg/mL). קווי שגיאה לייצג סטיית התקן של triplicates. ניסויים דומים נערכו כחלק אחד של המחקר האחרונה שלנו9. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.
כאן אנו מציגים פרוטוקול ליצירת מערכת הכתב לחקור אינטראקציות קולטן-ליגנד (ראה צורה מקוצרת של פרוטוקול זה1). הפרוטוקול מורכב משלושה חלקים עיקריים: שיבוט של חלבון chimeric, הכולל את תחום חוץ-תאי קולטן ספציפי התמזגו לתחום תאיים של CD3ζ, תרביות תאים של פלסמיד המבטאת את חלבון כימרי לתאים BW (למשל , מאת אלקטרופורציה), וזיהוי כמותי של העכבר il-2 מאת אליסה. המוצר הסופי של כל אחד מחלקים אלה צריך לאמת באופן עצמאי: תהליך השיבוט צריך להיות מאומת על ידי רצף שלם של החלבון פיוז'ן של פלסמיד היעד, תרביות תאים של תאי BW צריך לאמת על ידי בחינת הביטוי של קולטן עניין ב BW התאים (למשל, על ידי cytometry זרימה), ואת התהליך אליסה צריך לאמת על-ידי פקדים חיובי הכללית (למשל, 2 מיליון recombinant), כמו גם עם פקדים ספציפיים עבור התאים BW transfected; קרי, מטרות המבטאים של ליגנד הידוע של הקולטן עניין (לדוגמה, תאים CD48 אקספרס ניתן כפקד חיובי עבור תאים BW המבטאים את NK תא קולטן 2B4). למשל, תהליך השיבוט יכול להיות מוצלח, אבל חלבון כימרי אינו מתבטא על ידי תאים BW. במקרה כזה, יש לחזור על אלקטרופורציה. לחלופין, אם אין סימן מעל פני הרקע של צלחת אליסה (במיוחד עבור הפקדים חיובי) התאים BW transfected עשוי נכשלו להביע את הקולטן (או הביטוי אבד) או בעיה טכנית ייתכן שאירעה במהלך התהליך אליסה.
מספר שינויים יכול להתבצע על פרוטוקול זה תוך שמירה על עקרונות כלליים של ההליך. שינויים אלה כוללים את הווקטור המשמש כדי לבטא את חלבון כימרי, שיטת העבודה transfecting את פלסמיד לתאים BW ו פרמטרים ספציפיים הקשורים הדגירה אליסה כגון סוג היעד (למשל, התאים, נוגדנים, וכו ') , מספר התאים היעד או ריכוז נוגדן אם רלוונטי (אנו משתמשים 50,000 תאים לכל טוב, נוגדן מתחיל במינון של µg 0.5/טוב), זמן הדגירה (אנו משתמשים זמן הדגירה של 48 שעות) ונפח supernatant שמועבר לצלחת אליסה.
שיטה זו היא רגישה, ספציפית ולא ניתן לכמת בקלות. זה אידיאלי לסינון לנוכחות של ליגנדים עבור קולטני מסוימים (במיוחד אם ליגנד עצמה לא הוכר). לאחר הכנת transfected BW תאים המבטאים קולטן ספציפי, תאים אלה יכולים להיות קפוא, המשמש בעת הצורך לניסויים נוספים. אנחנו ואחרים השתמשו במערכת זו בהצלחה במחקרים קודמים כדי לחקור את קולטן-ליגנד אינטראקציות (לדוגמה2,3,5,12,13,14 15,16) ואת התוצאות המתקבלות על-ידי מערכת זו אומתו על ידי טכניקות אחרות. בשיטה זו יכול לשמש גם כדי ללמוד את ההפעלה של רצפטורים שונים FcγR האנושי באמצעות נוגדנים, כפי שעשו עבור נוגדנים אנטי-ויראליות בסרום-6,-7,-8 או עם נוגדנים חד-שבטיים כנגד CD20 9.
מאחר שזוהי מערכת הכתב שבו מבוטא רק על קטע חוץ-תאי של הקולטן, הממצאים שבידי מערכת זו יש השלמה על ידי ניסויים נוספים עם הקולטן אנדוגני, כגון מבחני cytotoxicity עם הטבע תאים הרוצח (NK) ללמוד אינטראקציות עם NK התא קולטנים. יתר על כן, אינטראקציות ליגנד/קולטן מסוים עלולה לא הפרשת mIL-2 על ידי מערכת הכתב, לכן אולי אפשר להתעלם. בנוסף, כמו כל הגדרת הניסוי, התוצאות צריך לאמת עבור פרמטרים שונים כפי שתואר לעיל. הדבר חשוב במיוחד במקרים בהם השוואה של שני תנאים נדרשים (למשל, הפעלת הקולטן Fc אותו באמצעות נוגדנים שונים). חשוב גם לוודא הרגישות של אינטראקציה ליגנד מסוים-קולטן הוא בתוך הטווח. ליניארית של המערכת. אחרת זה יכול להוביל ערכי הרוויה אשר עשוי למנוע השוואה תקפה בכל התנאים. זו יכולה להיות מושגת באמצעות עיקול תקן mIL-2, כמו גם על ידי יצירת עקומת מנה-תגובה עם ליגנד שנבדקו (במקרה של קולח ערכים, הפרמטרים ניסיוני צריך להיות שונה; למשל, נפח קטן יותר של תגובת שיקוע צריך להיות מנותח על ידי אליסה). עוד מגבלה אפשרי של מערכת זו הוא השימוש של התאים היעד עם הפרשות אנדוגני של מיליון-2 (למשל, העכבר T תאים) אשר יסתיר את הפרשת il-2 תאים BW. כדי להתגבר על התרחשויות אלה יוצאת דופן אשר מרותקים לתאים העכבר, מערכת זו כתב יכולים להשתפר באמצעות עיתונאי שונים (למשל, ה-GFP) אשר לא בא לידי ביטוי על-ידי תאי היעד.
המחברים מצהירים אין אינטרסים כלכליים מתחרים.
המחברים מודים אסתר זמר על עריכת שפה. מחקר זה נתמך על ידי המועצה האירופית למחקר תחת תכנית המסגרת השביעית של האיחוד האירופי (FP/2007-2013) / הסכם גרנט ERC מספר 320473-BacNK. תמיכה נוספת סופק על ידי אני-ליבת התוכנית התכנון ואת ועדת תקציב הקרן הלאומית למדע על ידי אני-הליבה-כרומטין ו- RNA הכונה, קרן GIF, הקרן המשפחתית על לואיס, המענק פרופסורה ICRF, הלמהולץ ישראל גרנט, הקרן Rosetrees (הכל כדי וכך). מחקר זה נתמך גם על ידי הקרן הלאומית למדע (גרנט 502/15), פרס מחקר רפואי קס ומענק מחקר של האגודה ישראל להמטולוגיה ורפואה עירוי (כדי חווה). O.M הוא פרופסור הכתר של אימונולוגיה מולקולרית.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
AccuPrep, Plasmid Mini Extraction Kit | Bioneer | K-3030 | |
Anti-mouse IL-2 | BioLegend | 503702 | |
Biotin anti-mouse IL-2 | BioLegend | 503804 | |
ELISA plates | De-groot | 60-655061 | |
Fetal Bovine Serum | Sigma | F7524-500ml | |
G418 | Mercury | MBS3458105GM | |
Gene Pulser II | Bio-Rad | 165-2105, 165-2106, 165-2107, 165-2108, 165-2109, 165-2110 | |
L-Glutamine | Biological industry | 03-020-1B | |
MEM Non-Essential Amino Acids Solution | Biological industry | 01-340-1B | |
Penicillin-Streptomycin Solution | Biological industry | 03-031-1B | |
peroxidase streptavidin | Jackson ImmunoResearch | 016-030-084 | |
PureLink HiPure Plasmid Filter Maxiprep Kit | ThermoFisher Scientific | K210016 | |
RPMI-1640 Medium | Biological industry | 30-2001 | |
Sodium Pyruvate | Biological industry | 03-042-1B | |
TMB | SouthernBiothech | 0410-01 |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved