הפעל את ההקפאה וחתך חלקים בעובי 12 מיקרון של רקמת הכבד הקפואה שנאספה מחולדה. הניחו את המקטעים על שקופיות המיקרוסקופ המסומנות בטמפרטורת החדר. לצביעת BODIPY, שטפו את חלקי הרקמה שלוש פעמים עם PBS במשך חמש דקות כל אחד.
לאחר השטיפה האחרונה, הקיפו את המקטעים בשקופית בשכבה הידרופובית באמצעות עט מחסום. הכינו תמיסת צביעה המכילה BODIPY 493/503 ו-DAPI. לאחר מכן, פיפטה 75 מיקרוליטר של התמיסה על כל שקופית.
דגרו על המגלשות בטמפרטורת החדר במשך 40 דקות בחושך. לאחר הדגירה, שטפו את המגלשות שלוש פעמים עם PBS במשך חמש דקות כל אחת. לאחר מכן, באמצעות אמצעי הרכבה פלואורסצנטי, הרכבו בזהירות את החלקות הכיסוי על כל שקופית.
הניחי למגלשות להתייבש במשך 30 דקות לפני שאיטום הקצוות בלק.