Installing CLOCCS and Using it to Parameterize the Experiments

כדי להתחיל, הורד את מאגר היישור CLOCCS על-ידי הזנת הפקודה לתוך המסוף. צור סביבת קונדה באמצעות conda.rec. קובץ yml על ידי הזנת הפקודה למסוף בתיקייה שבה שוכפל מאגר היישור CLOCCS.

לחץ פעמיים על הלחצן cloccs_v2023. קובץ jar הממוקם בתיקייה CLOCCS במאגר היישור של CLOCCS והמתן לפתיחת ממשק משתמש גרפי. המסך מאפשר אפשרויות קלט עבור הפעלת CLOCCS ומציג את התוצאות לאחר הפעלתן.

הזן את תנאי הניסוי על-ידי ציון הטמפרטורה בצלזיוס באמצעות תיבת הטקסט שכותרתה טמפרטורה וציין את שיטת הסינכרון באמצעות התפריט הנפתח Synchro.method. כדי להזין את ההגדרות עבור נתוני ניצנים, בחר באפשרות Bud עבור שמרים ניצנים מהתפריט הנפתח של סוג הדגם. יבא את הנתונים על-ידי העלאת קובץ באמצעות הלחצן Select File או על-ידי הקלדתו בתיבות קלט הטקסט בחלונית Data Import.

העמודה הראשונה מציינת את נקודות הזמן, ושתי העמודות האחרות מציינות את נתוני ניצנים. להזנת ההגדרות לנתונים ציטומטריים של זרימה, בחרו באזור 'זרימה' מהתפריט הנפתח 'סוג דגם'. ייבא את הנתונים בחלונית Data Import ולחץ על Select File.

לאחר מכן בחר את נקודות הזמן בתיבה Times for fitting שעבורן יש להתוות התאמה ציטומטרית של זרימה. לאחר שכל הקלטים נבחרו עבור ציטומטריה ניצנית או זרימה, לחץ על הלחצן החל ולאחר מכן על הלחצן דוגמה בחלק העליון של המסך. הצג את עקומת ניצנים או תרשים ציטומטריית זרימה בכרטיסיה התאמות חזויות.

השג את פרמטרי CLOCCS מההתאמה על-ידי בחירה בכרטיסייה פרמטרים אחוריים. הטבלה המתקבלת כוללת כל שורה המורכבת מהפרמטר, כאשר השורה האחרונה היא האחורית. העמודות מורכבות מהפרמטר החזוי עבור הממוצע, רווח בר-סמך נמוך ב-2.5%, רווח בר-סמך עליון של 97.5% ושיעור קבלה.

עקומות ניצני CLOCCS הותאמו כראוי כפי שהודגם על ידי נקודות הנתונים המכסות את עקומת ההתאמה המתאימה עם רצועת ביטחון קטנה של 95%. עם נתוני שלב מחזור תא ציטומטריה של זרימה, CLOCCS מייצרת התאמה CLOCCS לכל נקודת זמן שנבחרה.