Comparing Budding Curves, Flow Cytometry Data, and Experimental Data

התווה את העקומות הניצניות לפני היישור באמצעות פונקציית השירות Python על-ידי הזנת הפקודה לתא חדש. לאחר מכן, שרטט את עקומות הניצנים לאחר היישור. שימוש בפונקציית השירות Python.

השתמש בהשוואת תרשימי קווי העלילה שסופקו בבקבוקון כלי השירות של Python כדי לבצע השוואות של תרשימי קו במסגרת הנתונים המקורית, המיושרת או המיושרת והאינטרפולציה. על-ידי הקלדת הפקודה בתא חדש, יבא קובץ רשימת גנים CSV או TSV למחברת באמצעות הפקודה בתא חדש. לאחר מכן, השתמש בתרשים מפת החום של הפונקציה שסופקה בקובץ כלי השירות של Python כדי לבצע השוואת מפת חום במסגרת הנתונים המיושרת אינטרפולציה ומיושרת פאזה על-ידי הקלדת הפקודה בתא חדש.

השוואה בין נתוני השעתוק המיושרים והבלתי מיושרים הראתה כי לפני היישור, ביטוי השיא הראשון של ניסויי המיקרו-מערך נראה מיושר עם השיא השני של ניסוי ה-RNA-seq. עם זאת, לאחר היישור, שיאי מחזור התא הראשון של כל ערכת נתונים מיושרים כראוי. השוואה של נתוני פאזות מחזור התא על פני ניסויים עם תקופות משתנות הראתה הבדלי תקופות נראים לעין בעקומות הניצנים הלא מיושרות.

בעוד יישור השעונים גרם לשלוש העקומות להיראות דומות להפליא, מה שאיפשר השוואה של נתוני ניסוי, נתוני פאזת מחזור התא עבור כל נקודת עורק חיים דומה לא היו זהים בין שני התנאים. השוואה של נתוני התמלול על פני ניסויים עם תקופות משתנות הראתה כי לפני היישור דינמיקת התמליל של CDC20 לא הייתה חופפת. אבל לאחר היישור, הפסגות התרחשו באותו שלב מחזור התא, אך צורות העקומות היו שונות.

הגנים שורטטו כמפות חום באותו סדר עבור כל שלושת התנאים עבור שניהם לא מיושרים ולא מיושרים.