Data Processing and Quantification of Glomeruli from Microscopy Images

כדי להתחיל, צלם תמונות של גלומרולי מסומן תחת מיקרוסקופ פלואורסצנטי קונפוקלי או גיליון אור. ייבא את קובצי התמונה לתוכנת ניתוח התמונות. לחצו על לחצן 'משטח' ליצירת משטח חדש.

עקוב אחר המדריך בחלק השמאלי התחתון של המסך. לחץ על הלחצן הבא. סמן את התיבה עבור האפשרות חלקה והזן מספר כדי לשלוט בפרטי המשטח.

בחר חיסור רקע בסף, ומלא את התיבה בקוטר הממוצע המשוער של הגלומרולי. לחץ על הלחצן הבא, התאם במידת הצורך ולחץ על הלחצן הבא. בחרו בטווח המתאים ולחצו על הלחצן הבא ליצירת משטח.

לאחר מכן לחץ על מסנן, ואחריו הוסף כפתור כדי להוסיף ספיריות כדי לסנן אובייקטים שאינם כדוריים. לחץ על לחצן השכפול כדי להעתיק משטח חדש זה. לחץ על לחצן הסטטיסטיקה ואחריו על הלחצן הכולל.

התוכנה תציג את מספר glomeruli כמספר הכולל של פני השטח. כדי לחשב את עוצמת הקול של glomeruli, לחץ על לחצן הבחירה כדי לבחור את אובייקטי היעד ולהציג את עוצמת הקול של כל אובייקט. ייצוא נתונים סטטיסטיים לגיליון אלקטרוני לצורך ניתוח נוסף.

כדי לחשב את נפח הפרוסה, או הכליה כולה, ראשית, ייבא את התמונות לתוכנת ניתוח התמונות. לאחר לחיצה על לחצן המשטח והזנת מספר באפשרות החלקה, בחרו 'עוצמה מוחלטת וסף'. לחץ על הלחצן הבא.

התאימו את המשטח עד שיכסה את כל הרקמה, ולחצו על הלחצן הבא ליצירת המשטח. לחץ על לחצן הבחירה כדי לבחור את פני השטח של הרקמה כולה ולהציג את נפח הרקמה. לבסוף, יצא את הנתונים הסטטיסטיים לגיליון אלקטרוני.

באמצעות תוכנת עיבוד תמונה, מספר ונפח של glomeruli נספר בפרוסת כליה בכליה שלמה, או ברצועה. באמצעות ערכים אלה, יחס נפח ותדירות של glomeruli ניתן לחשב את הגלומרולי.