LC-TIMS-TOF MS/MS DATA ANALYSIS לבדיקת שומנים עם תיוג איזוטופים יציב

כדי להתחיל, פתח את תוכנת ניתוח הנתונים. בפינה השמאלית העליונה, לחץ על כפתור הקובץ ובחר פתח. כדי לבחור את הקבצים הנבחרים, לחץ לחיצה ימנית על שם הקובץ ובחר מאפיינים.

לאחר מכן בחר מצב כיול. בתיבה הנפתחת, בחר כיול פנימי עבור ספקטרומטר המסות. ודא שכל השגיאות הן פחות מחלק אחד למיליון.

לאחר מכן, בחר כיול ניידות פנימי ואשר כי השגיאה היא פחות מחלק אחד למיליון. לאחר מכן, לחץ לחיצה ימנית על כרומטוגרמה ובחר ערוך כרומטוגרמה. בהקלדה, לחץ על התיבה הנפתחת ובחר כרומטוגרמה של יונים שחולצו.

תחת מסנן, בחר הכל MS, ועבור מצב סריקה, בחר הכל כדי להציג את הפסגות של המולקולה המעניינת ולא רק את המקטעים שלה. ישנן שתי אפשרויות סינון לבחירת מולקולות, מסות או נוסחה. אם בוחרים מסות, בוחרים את M התיאורטי על פני Z של המולקולה המעניינת, שבמקרה זה היא 829.7985.

אם נבחרה נוסחה, בחר את הנוסחה עבור המולקולה ואת צורות היונים של עניין, אשר במקרה זה הוא אמוניום. עבור רוחב, בחר פלוס או מינוס אחד. עבור קוטביות, ודא שהיא שומרת על המצב החיובי.

תחת ניידות, בחר 1.455 עד 1.465 כדי לבודד את המולקולה המעניינת ולסנן מולקולות שאינן נופלות בערכים אלה. לאחר בחירת הפרמטרים, לחץ על שנה ואחריו אישור בפינה השמאלית העליונה. לאחר זמן קצר, התוכנה תעבד את הבחירות ותפיק כרומטוגרמה.

לחץ באמצעות לחצן העכבר הימני על קו הבסיס של מקור שיא העניין וגרר תוך החזקת סוף הפסגה כדי לקבל ספקטרום מסה חי של מקטעים בתוך זמן שמירה זה. לחץ לחיצה ימנית בצד שמאל של המסך על mobilogram ובחר ערוך mobilogram. יופיע חלון בשם Edit mobilogram traces.

בצע את השלבים שהודגמו קודם לכן. עבור זמן שמירה, הזן את זמן השמירה של שיא הריבית. לאחר בחירת הפרמטרים, לחץ על הוסף, ובסדר בפינה השמאלית העליונה.

המתן עד שהתוכנה תעבד את הבחירות ותוציא כרומטוגרמה. לחילוץ יונים, חזור על השלבים שהודגמו קודם לכן עד ליצירת רשימה של יונים. בתחתית החלון MS, בחר פרופיל MS וקטע MS כדי לאפשר תצוגת ספקטרום של יונים מסריקה מלאה ופסיבית.

לתצוגת הספקטרום, לחץ לחיצה ימנית ובחר העתק ספקטרום מורכב. נתוני הספקטרום המופיעים מימין יכולים לספק מידע נוסף על התרכובת, כגון רזולוציה של פתרון הספק, עוצמה ויחס אות לרעש. כדי לעבד את הנתונים, שלב באופן ידני את הכרומטוגרמה ואת פסגות הניידות כדי להפיק מידע רב ערך על המולקולה המעניינת.

לחץ לחיצה ימנית למצוא ולבחור תרכובות באופן ידני כרומטוגרמה או mobilogram. לחץ לחיצה שמאלית וסמן את הפסגה הרצויה. המידע המתקבל כולל זמן שמירה, שטח, יחס אות לרעש וניידות.