התחילו בפתיחת התמונות המיטוכונדריאליות עם קיטועי הזמן בתמונה J2.1.0. הפרד ערימות מיקום בהתבסס על השדה החזותי על-ידי ניווט לשורת התפריטים ולחיצה על תמונה. לאחר מכן, עברו אל 'שכפל', 'הזן פרוסה' או 'מספר מסגרת' ולחצו על הלחצן 'אשר'. לאחר מכן, צייר אזור עניין סביב התא באמצעות כלי הבחירה החופשית.
כדי להפעיל את המאקרו, פתח את Image J, נווט אל שורת התפריטים ולחץ על תוספים, פקודות מאקרו והפעלה. לאחר מכן, בחר נקה את הרקע ושמור את המאקרו של התמונה. כדי לקבוע את גודל הפיקסלים ואת עומק הווקסל, פתחו את Image J ובחרו Image.
גש לשורת התפריטים, בחר תמונה ולחץ על מאפיינים. לאחר קביעת גודל הפיקסלים ועומק הווקסל, ציירו אזור עניין המקיף את התא כולו בעזרת הכלי בחירה חופשית כדי לכלול את התא כולו בכל 15 המסגרות. נווט אל שורת התפריטים, לחץ על תוספים, פקודות מאקרו, ובחר נקה את הרקע, ושמור את המאקרו של התמונה.
בחרו בתיקיית השמירה הרצויה ולחצו על 'שמור' לאחסון הקובץ בתבנית TIFF. לאחר מכן, צור שלוש תיקיות ראשיות שכותרתן כל המסלולים, מסלולים פרי-גרעיניים ומסלולים טלגרעיניים. צור תיקיית משנה ממוספרת עבור כל תמונה לעיבוד בתוך כל תיקייה ראשית, החל מתיקייה אחת.
הוסיפו עותק של שני הקבצים המשלימים למיטוב שגרתי לכל תיקיית תמונה. כדי לזהות או לשנות את גרסת קובץ המזרן המוגדרת כברירת מחדל, נווטו אל הכרטיסייה 'בית' באזור 'סביבה' ולחצו על 'העדפות'. לאחר מכן, בחרו MATLAB.
פתחו את תוכנת MATLAB במחשב, נווטו לשורת התפריטים, בחרו אפליקציות ופתחו את מיטומטר. בחר Start 3D והגדר את גודל הפיקסלים ל- 0.1395089 מיקרומטר, זמן בין מסגרות ל- 15 שניות, מספר מישורי z ל- 8 ומרחק ציר בין מישורי z ל- 0.418809 מיקרומטר. בחרו תמונות להזנה.
כעת, עבור לתפריט הצד של המיטומטר, בחר תמונה ולחץ על בחר מסומן. נווט אל שורת התפריט של המיטומטר, בחר בחר רצועות ולאחר מכן עקוב אחר תצוגות. לאחר מכן, בחר מבין כל המסלולים, Telenuclear, או Perinuclear אפשרויות.
שמור את התוצאות בקובץ טקסט על-ידי בחירה באפשרות שמור ב- txt וחילץ את קובצי התוצאות לתיקיות שנוצרו. הכן את קובץ xlsx האקראי, המכיל את המפתח לקידוד תמונה. הוסף רצף של מספרים שלמים עוקבים, החל מאחד, בעמודה A, אכלס את עמודה B בתווים אלפאנומריים, המהווים את המשתנים האנליטיים.
לחץ פעמיים על mlx ההפעלה, הזן את מספר התיקיות, לחץ על ציין את ספריית התיקיה ובחר שמור ספרייה. בחר את שם הגיליון האלקטרוני בקובץ הפלט ולחץ על הפעל. לאחר מכן, בצע את הניתוח הסטטיסטי הדרוש.
מוצגות תמונות מייצגות של המיטוכונדריה לאחר הטיפול, חלקות פני השטח המתאימות ופילוח אוטומטי. ירידה משמעותית באורך המיטוכונדריה הממוצע נצפתה בתאים שטופלו ב-AM580. שטח הפנים של המיטוכונדריה ירד משמעותית בתאים שטופלו ב-AM580 וב-BMS493.
עוצמת TMRM מנורמלת לנפח המיטוכונדריה הראתה ירידה משמעותית בתאים שטופלו בחומצה רטינואית וב-CH55.
