The authors would like to thank Joshua Kimani, clinical director of the research program at the University of Nairobi, for his assistance with mucosal immunology studies related to this protocol. The authors would like to acknowledge funding from CHVI grant MOP 86721.

שמירה על אתיקה: לוחות האתיקה המחקריות של שניהם מאוניברסיטת מניטובה וקניאטה הלאומית בית חולים / אוניברסיטת ניירובי אישרו מחקר זה וכתב הסכמה מהדעת התקבלה מכל משתתפי המחקר. 1. הכנת מדיה וCMC אוסף צינורות <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן ופר פוספט פתרון (PBS) (137.93 mM NaCl, 2.67 מ&quot;מ KCl, 8.1 מ&quot;מ Na 2 HPO 4, 1.47 מ&quot;מ KH 2 PO 4). החיטוי על סטריליות. זה יכול להיות מאוחסן על 4 מעלות צלזיוס במשך כמה חודשים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> טרום aliquot 5 מיליליטר PBS לתוך צינור 50 מיליליטר בז (אחד לדגימה שנאסף) ולאחסן ב 4 מעלות צלזיוס עד למועד איסוף דגימה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תווית 2-4 cryovials או 1.5 מיליליטר microcentrifuge צינורות לדגימה לאסוף שטיפה לאחסון. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן תקשורת תרבית תאים: RPMI 1640 1% פניצילין / סטרפטומיצין / amphotericin B + (ריכוז סופי 100 יחידות / מיליליטר, 100 מיקרוגרם / מיליליטר ו250 ng / ml, respectivאיליי, ללא FCS / FBS הוסיף. </li></ol> 2. איסוף דגימות Cytobrush איסוף דגימות cytobrush הוא הליך פולשני שחייבת להתבצע על ידי MD או גינקולוג מיומנים. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> איסוף תאי צוואר הרחם מונונוקלארים (CMC) באמצעות שני cytobrush ומגרד עץ או פלסטיק. לאסוף CMC מהמשתתף בבדיקת ספקולום ידי הוספת המגרד ומסתובב סביב מערכת ההפעלה צוואר הרחם (איור 1). הכנס את cytobrush לתוך מערכת ההפעלה האנדוצרוויקאלית, לסובב 360 °, ואת המקום באופן מיידי שני cytobrush והמגרד לתוך הצינור הבז 50 מיליליטר המכיל 5 מיליליטר של PBS. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שמור על דגימות קרח / על 4 מעלות צלזיוס עד לעיבוד. כדי לשמור על כדאיות תא, דוגמאות תהליך תוך 2 שעות של אוסף. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> במידת האפשר, לאסוף דגימות דם מתאימים בvacutainers הפרין העליון הירוק לתא הדם היקפי mononuclear בידוד (PBMC) לשמש כמשווה / שליטה לניתוח CMC. </li&gt; </ol> 3. בידוד של CMCs לבצע עיבוד דגימה במעבדה ברמת בטיחות ביולוגית 2, בתוך ארון בטיחות ביולוגי סטרילי עם כפפות כפולות. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> במהלך איסוף, דגימות CMC יכולות להיות מזוהמות בדם. תכלול דגימות עם זיהום דם גלוי מהמחקר כדי למנוע הכללה של בלבול PBMC במדגם הסופי. בשל המספר הנמוך של לימפוציטים שבודדו דגימות CMC, זיהום דם קטין יכול בקלות להכריע את מרכיב הלימפוציטים CMC. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> צינורות בז ורטקס המכילים את שני cytobrush ומגרד ל45 שניות לנתק תאים מהמברשות. דוגמאות עשויות להיות קצף בתהליך זה; זה נורמלי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש cytobrush לגרד כל חומר שנותר מן המגרד, וזורקים את המגרד לפתרון אקונומיקה. לאסוף את כל תאים שנותרו צמודים למברשת / המגרד, השתמש כפפה טרי לסחוט המגרד בין האגודל לאצבע.להחליק במורד המברשת, המאפשר לתאים וPBS להיות שנאספו באותו צינור מיליליטר 50. מחק את cytobrush לפתרון אקונומיקה, וזורקים את הכפפה. חשוב: השתמש בכפפות חדשות עבור כל דגימה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להתאים מסננת תא ניילון 100 מיקרומטר לצינור בז טרי 50 מיליליטר. בעזרת פיפטה העברה, לאסוף את ההשעיה PBS התאים מצינור המדגם ולסנן דרך המסננת לתוך הצינור הטרי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף 5 מיליליטר של RPMI 1640 לצינור המדגם המקורי. באמצעות פיפטה ההעברה, לשטוף את הצדדים של צינור המדגם עם RPMI, ולהעביר דרך המסנן לצינור האיסוף החדש. שטוף את החלק התחתון של מסנן הניילון עם RPMI גם כן. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> צנטריפוגה הדגימות 10 דקות ב 514 x גרם. זה חיוני כדי להשאיר את בלם צנטריפוגות מבמהלך שלב זה, על מנת למנוע דחיקה של גלולה CMC. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בעדינות להסיר את supernatant מהצינור, נזהר שלא להפריע גלולה. גודל גלולה יהיה משתנה מאוד; בכךלי דוגמאות, גלולה היא די גדולה בשל נוכחותם של מספר הגדול של תאי אפיתל, ואילו במקרים אחרים, גלולה היא בקושי נראית ושקופה מאוד. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Resuspend את הכדור על ידי תסיסה עדינה של הצינור הבז. הוסף 5 מיליליטר של PBS לשטוף את המדגם. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שוב צנטריפוגות במשך 10 דקות ב XG 514 עם בלם לא צנטריפוגות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להשליך בזהירות את supernatant מחדש להשעות גלולה כאמור לעיל. התאים מוכנים או הקפאה (באמצעות פרוטוקול הקפאת PBMC), גירוי או cytometry זרימת phenotyping. </li></ol> 4. מכתים משטח CMC וזרימת cytometry <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Resuspend את הכדור מהצעד 3.10 בחסימת פתרון 100 μl ולהעביר או לתוך צלחת 96 היטב או צינור FACS. פתרון החסימה (לחסום קולטני Fcγ) מתכון הוא כדלקמן: IgG עכבר 1.8 μl (ריכוז סופי 0.2 מיקרוגרם / μl), 5 FBS μl ו93.2 μl FACS לשטוף (PBS 2% FBS).צביעה יכולה להתבצע בצלחת גם אם 96 גדלי גלולה קטנים מספיק, אבל ייתכן שתצטרך להתבצע בצינורות FACS אם כדורים הם גדולים באופן שיגרתי. חשוב לכיל נוגדנים בהתאם. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חסום את הדגימות עבור 10 דקות ב/ קרח ב 4 ° C. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשטוף את התאים עם FACS של שטפי (FBS +2% PBS) 100 μl בצלחות 96 היטב, או 500 μl בצינורות FACS. צנטריפוגה ב XG 600 10 דקות ב 4 ° C עם הבלם על נמוך (או כבוי, אם הגדרת בלם נמוכה אינה זמינה). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את supernatant מחדש להשעות את התא גלולה על ידי תסיסה. תוסיף כתם כדאיות (צבע כדאיות בשידור חי המלח ניתן לתקן). הכן את צבע כדאיות פי הוראות יצרן. זה ייתכן שיהיה צורך טיטרציה לשימוש בכל התקנת המעבדה / cytometer. דגירה במשך 30 דקות בחושך ב 4 ° C. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשטוף את התאים של PBS 100 μl/500 μl (לצינורות צלחת / FACS 96 היטב). צנטריפוגה ב XG 600 עבור 10 דקות עם נמוך / לא בלם. הסר supernatant ותאי resuspend. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> דגירה התאים עם הקוקטייל של נוגדני סמן פני השטח, בהיקף כולל של 100 μl. חשוב: ייעל ולכייל כל תזרים cytometry פנל לפני לדגום מכתים. דגירה תאים עבור 30 דקות בחושך ב 4 ° C. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חזור על שלב 4.5. אם מכתים בצלחת, תאי העברה 96 היטב לצינור FACS ולדלל את נפח סופי של μl 750 של FACS לשטוף מכיל paraformaldehyde 1% (PFA) (או CytoFix, בדילול מלא 1 ב 4). המשך לרכישת נתונים על cytometer זרימה. </li></ol> 5. איסוף והכנה של צוואר הרחם בנרתיק שטיפה (CVL) <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לפני cytobrush דגימה, להשתמש במזרק כדי לשטוף endocervix עם 2 מיליליטר של PBS סטרילי ולשאוב את שטיפה מfornix האחורי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאסוף את דגימת שטיפת aspirated לתוך צינור בז 15 מיליליטר ולשמור על קרח / על 4 מעלות צלזיוס עד לעיבוד. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> צנטריפוגה מדגם ב XG 400 במשך 7 דקות כדי להסיר פסולת הסלולר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שיתוףllect supernatant, aliquot המדגם לתוך 1 מיליליטר או 500 aliquots μl, ולאחסן ב -70 ° C. Aliquots יכולים להיות מופשרים לELISA או ניתוח מערך חרוז של חלבוני CVL, אך להימנע מהקפאה / הפשרה מחזורים מרובים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> אם תרצה, resuspend את הכדור של פסולת הסלולר בRNA מאוחר יותר כדי למדוד ביטוי RNA על ידי ביצוע הפרוטוקול של היצרן. </li></ol> 6. רכישת נתונים <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להכין סט של צינורות פיצוי התואם את פנל הנוגדנים. הפעל את צינורות הפיצוי להתאים חפיפה ספקטרלית. הפעל את הדגימות על כל זרימת ססגוניות cytometer שמוגדר עבור הנוגדנים מצומדות fluorochrome בשימוש בלוח. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לרכוש מדגם PBMC הראשון כדי להתאים קדימה פיזור (FSC) וצד פיזור מתח (SSC) על מנת לזהות את אוכלוסיית הלימפוציטים. נסה לשמור אותם ב100 על כל ציר בקנה מידה ליניארי. פועל שליטת PBMC יקל באופן משמעותי כדי למצוא את אוכלוסיית הלימפוציטים CMC. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> סף FSC עבור דגימות CMC ייתכן שיהיה הצורך מוגבר בהשוואה לדגימות PBMC בשל למרוח את ציר SSC בערכי FSC נמוכים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מערבולת בצינור אחד לפני הרכישה. לרכוש את כל הצינור על מנת למקסם את מספר אירועי שער הלימפוציטים שנאספו. לנטר את המכונה בזהירות כדי למנוע סתימה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לייצא את הנתונים לתכנית ניתוח התזרים cytometric כגון FlowJo. </li></ol> 7. Gating אסטרטגיה <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בחר צד פיזור קדימה גבוה (FSC-H) / אזור קדימה פיזור הצד (FSC-) כדי לקבוע את אוכלוסיית הגופייה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בחר זמן לעומת סמן פלואורסצנטי (כמו בדוגמא של FITC) כדי לשלוט על האיכות של הרכישה. שינוי בקצב זרימה עשוי להציג את הממצאים בנתונים. תכלול כל אזור שמראה פער בקצב זרימה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לזהות את אוכלוסיית הלימפוציטים בעלילת SSC-A/FSC-A. השתמש בשליטת PBMC כדי להקל על זיהוי. שים לב שאוכלוסיית הלימפוציטים CMC לא יכולה להיות ברורה כמו שליטת PBMC. &lt;/ Li&gt; <li style=";text-align:right;direction:rtl"> השער בSSC-A/viability לצבוע להוציא תאים מתים מהתאים חיים. תאים מתים שאינו יכולים לשלב באופן ספציפי הנוגדנים, אשר יציגו ממצאים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שער בSSC-A/CD3 לזהות את אוכלוסיית תאי T. מהשער הזה, לזהות את האוכלוסיות מסוג CD4 + ו CD8 +. </li></ol>

<ol>
	<li>. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=UNAIDS.+Global+Report+2013.">UNAIDS. Global Report 2013.</a> http://www.unaids.org/en/media/unaids/contentassets/documents/epidemiology/2013/gr2013/UNAIDS_Global_Report_2013_en.pdf. , (2013).</li><li>Rodriguez-Garcia, M., Patel, M. V., Wira, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Innate+and+adaptive+anti-HIV+immune+responses+in+the+female+reproductive+tract.">Innate and adaptive anti-HIV immune responses in the female reproductive tract.</a> Journal of reproductive immunology. 97, 74-84 (2013).</li><li>Douek, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HIV+disease+progression:+immune+activation,+microbes,+and+a+leaky+gut.">HIV disease progression: immune activation, microbes, and a leaky gut.</a> Topics in HIV medicine : a publication of the International AIDS Society, USA. 15, 114-117 (2007).</li><li>Hofer, U., Speck, R. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Disturbance+of+the+gut-associated+lymphoid+tissue+is+associated+with+disease+progression+in+chronic+HIV+infection.">Disturbance of the gut-associated lymphoid tissue is associated with disease progression in chronic HIV infection.</a> Seminars in immunopathology. 31, 257-266 (2009).</li><li>Kaushic, C., Ferreira, V. H., Kafka, J. K., Nazli, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HIV+infection+in+the+female+genital+tract:+discrete+influence+of+the+local+mucosal+microenvironment.">HIV infection in the female genital tract: discrete influence of the local mucosal microenvironment.</a> American journal of reproductive immunology. 63, 566-575 (2010).</li><li>Hladik, F., Hope, T. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HIV+infection+of+the+genital+mucosa+in+women.">HIV infection of the genital mucosa in women.</a> Current HIV/AIDS reports. 6, 20-28 (2009).</li><li>Sharkey, D. J., Tremellen, K. P., Jasper, M. J., Gemzell-Danielsson, K., Robertson, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Seminal+fluid+induces+leukocyte+recruitment+and+cytokine+and+chemokine+mRNA+expression+in+the+human+cervix+after+coitus.">Seminal fluid induces leukocyte recruitment and cytokine and chemokine mRNA expression in the human cervix after coitus.</a> Journal of immunology. 188, 2445-2454 (2012).</li><li>Saba, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Productive+HIV-1+infection+of+human+cervical+tissue+ex+vivo+is+associated+with+the+secretory+phase+of+the+menstrual+cycle.">Productive HIV-1 infection of human cervical tissue ex vivo is associated with the secretory phase of the menstrual cycle.</a> Mucosal immunology. 6, 1081-1090 (2013).</li><li>St John, E. P., Martinson, J., Simoes, J. A., Landay, A. L., Spear, G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dendritic+cell+activation+and+maturation+induced+by+mucosal+fluid+from+women+with+bacterial+vaginosis.">Dendritic cell activation and maturation induced by mucosal fluid from women with bacterial vaginosis.</a> Clinical immunology. 125, 95-102 (2007).</li><li>Liebenberg, L. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stability+and+transport+of+cervical+cytobrushes+for+isolation+of+mononuclear+cells+from+the+female+genital+tract.">Stability and transport of cervical cytobrushes for isolation of mononuclear cells from the female genital tract.</a> Journal of immunological methods. 367, 47-55 (2011).</li><li>Hirbod, T., Kaldensjo, T., Broliden, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+situ+distribution+of+HIV-binding+CCR5+and+C-type+lectin+receptors+in+the+human+endocervical+mucosa.">In situ distribution of HIV-binding CCR5 and C-type lectin receptors in the human endocervical mucosa.</a> PloS one. 6, (2011).</li><li>Hasselrot, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Feasibility+and+safety+of+cervical+biopsy+sampling+for+mucosal+immune+studies+in+female+sex+workers+from+Nairobi,+Kenya.">Feasibility and safety of cervical biopsy sampling for mucosal immune studies in female sex workers from Nairobi, Kenya.</a> PloS one. 7, (2012).</li><li>McKinnon, L. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optimizing+viable+leukocyte+sampling+from+the+female+genital+tract+for+clinical+trials:+an+international+multi-site+study.">Optimizing viable leukocyte sampling from the female genital tract for clinical trials: an international multi-site study.</a> PloS one. 9, (2014).</li><li>Lajoie, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+distinct+cytokine+and+chemokine+profile+at+the+genital+mucosa+is+associated+with+HIV-1+protection+among+HIV-exposed+seronegative+commercial+sex+workers.">A distinct cytokine and chemokine profile at the genital mucosa is associated with HIV-1 protection among HIV-exposed seronegative commercial sex workers.</a> Mucosal immunology. 5, (2012).</li><li>Burgener, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comprehensive+Proteomic+Study+Identifies+Serpin+and+Cystatin+Antiproteases+as+Novel+Correlates+of+HIV-1+Resistance+in+the+Cervicovaginal+Mucosa+of+Female+Sex+Workers.">Comprehensive Proteomic Study Identifies Serpin and Cystatin Antiproteases as Novel Correlates of HIV-1 Resistance in the Cervicovaginal Mucosa of Female Sex Workers.</a> Journal of proteome research. 10, (2011).</li><li>Burgener, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+systems+biology+examination+of+the+human+female+genital+tract+shows+compartmentalization+of+immune+factor+expression.">A systems biology examination of the human female genital tract shows compartmentalization of immune factor expression.</a> Journal of virology. 87, (2013).</li><li>Bere, A., Denny, L., Naicker, P., Burgers, W. A., Passmore, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HIV-specific+T+cell+responses+detected+in+the+genital+tract+of+chronically+HIV-infected+women+are+largely+monofunctional.">HIV-specific T cell responses detected in the genital tract of chronically HIV-infected women are largely monofunctional.</a> Immunology. 139, (2013).</li><li>McKinnon, L. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+a+Human+Cervical+CD4++T+Cell+Subset+Coexpressing+Multiple+Markers+of+HIV+Susceptibility.">Characterization of a Human Cervical CD4+ T Cell Subset Coexpressing Multiple Markers of HIV Susceptibility.</a> Journal of immunology. , (2011).</li><li>Bere, A., Denny, L., Burgers, W. A., Passmore, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Polyclonal+expansion+of+cervical+cytobrush-derived+T+cells+to+investigate+HIV-specific+responses+in+the+female+genital+tract.">Polyclonal expansion of cervical cytobrush-derived T cells to investigate HIV-specific responses in the female genital tract.</a> Immunology. 130, 23-33 (2010).</li><li>Iqbal, S. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Elevated+T+cell+counts+and+RANTES+expression+in+the+genital+mucosa+of+HIV-1-resistant+Kenyan+commercial+sex+workers.">Elevated T cell counts and RANTES expression in the genital mucosa of HIV-1-resistant Kenyan commercial sex workers.</a> The Journal of infectious diseases. 192, 728-738 (2005).</li><li>Hirbod, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stable+CD4+expression+and+local+immune+activation+in+the+ectocervical+mucosa+of+HIV-infected+women.">Stable CD4 expression and local immune activation in the ectocervical mucosa of HIV-infected women.</a> Journal of immunology. 191, 3948-3954 (2013).</li><li>Horton, R. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+comparative+analysis+of+gene+expression+patterns+and+cell+phenotypes+between+cervical+and+peripheral+blood+mononuclear+cells.">A comparative analysis of gene expression patterns and cell phenotypes between cervical and peripheral blood mononuclear cells.</a> PloS one. 4, (2009).</li><li>Begaud, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reduced+CD4+T+cell+activation+and+in+vitro+susceptibility+to+HIV-1+infection+in+exposed+uninfected+Central+Africans.">Reduced CD4 T cell activation and in vitro susceptibility to HIV-1 infection in exposed uninfected Central Africans.</a> Retrovirology. 3, 35 (2006).</li><li>McLaren, P. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HIV-exposed+seronegative+commercial+sex+workers+show+a+quiescent+phenotype+in+the+CD4++T+cell+compartment+and+reduced+expression+of+HIV-dependent+host+factors.">HIV-exposed seronegative commercial sex workers show a quiescent phenotype in the CD4+ T cell compartment and reduced expression of HIV-dependent host factors.</a> The Journal of infectious diseases. 202 Suppl 3, (2010).</li><li>Card, C. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reduced+Cellular+Susceptibility+to+In+Vitro+HIV+Infection+Is+Associated+with+CD4T+Cell+Quiescence.">Reduced Cellular Susceptibility to In Vitro HIV Infection Is Associated with CD4T Cell Quiescence.</a> PloS one. 7, (2012).</li><li>Prodger, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Foreskin+T-cell+subsets+differ+substantially+from+blood+with+respect+to+HIV+co-receptor+expression,+inflammatory+profile,+and+memory+status.">Foreskin T-cell subsets differ substantially from blood with respect to HIV co-receptor expression, inflammatory profile, and memory status.</a> Mucosal immunology. 5, 121-128 (2012).</li><li>Reusch, L. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nonlinear+optical+microscopy+and+ultrasound+imaging+of+human+cervical+structure.">Nonlinear optical microscopy and ultrasound imaging of human cervical structure.</a> Journal of biomedical optics. 18, (2013).</li><li>Oertelt-Prigione, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Immunology+and+the+menstrual+cycle.">Immunology and the menstrual cycle.</a> Autoimmunity reviews. 11, (2012).</li><li>Rahman, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mucosal+serpin+A1+and+A3+levels+in+HIV+highly+exposed+sero-negative+women+are+affected+by+the+menstrual+cycle+and+hormonal+contraceptives+but+are+independent+of+epidemiological+confounders.">Mucosal serpin A1 and A3 levels in HIV highly exposed sero-negative women are affected by the menstrual cycle and hormonal contraceptives but are independent of epidemiological confounders.</a> American journal of reproductive immunology. 69, 64-72 (2013).</li></ol>

The authors have nothing to disclose.

לאור פערים הגדולים בידע בנוגע לחסינות בדרכי המין הנשית (FGT), ניתוח פנוטיפי של CMCs יכול לספק מגוון רחב של תובנות אוכלוסיות לימפוציטים מרובות בצוואר הרחם. בשילוב עם ניתוח proteomic ומדידות עומס נגיפיים בשטיפת צוואר הרחם, חסינות לזיהומים המועברים במגע מיני (STI) של ופתוגנים אחר...

רוב זיהומי HIV החדשים ברחבי העולם להתעורר באמצעות שידור הטרוסקסואלים, עם נשים המייצגות 47% מזיהומים חדשים ב2011 (1 UNAIDS). הבנה בדרכי המין הנשית (FGT), אחד מפורטלי הכניסה העיקריים ל-HIV ופתוגנים מועברים במגע מיני אחרים, הוא בעל חשיבות גבוהה בדרך למציאת אסטרטגיות יעילה למניעת זיהום. תגובה חיסונית ברירית איברי המין הם בבירור ייחודיות ושונים מאלו שנמדדו בדם היקפי 2. עם זאת, ידע הנוכחי של הדינמיקה החיסונית בFGT מוגבל במקרה הטוב. עד כה, מחקרים של הסביבה החיסונית ברירית התמקדו בעיקר ברקמות הקשורים בטן הלימפה (גאלט), שבו התברר שיש לי האירועים המוקדמים ברקמות הריריות בעקבות זיהום השפעה חזקה על התקדמות מחלה לאחר 3,4. איסוף דגימות מרירית איברי המין מהווה אתגר גדול ולפחות בחלקו אחראי לאקk הבנה של אימונולוגיה של FGT. פתרון החידה מהדינמיקה החיסונית בין המארח והפתוגן בהקשר של הסביבה ברורה שהיא FGT מחייב שיטות יעילה לאיסוף וניתוח של דגימות מאזור זה. FGT מחולק לשני חלקים: מערכת הרבייה העליונה הכוללת חצוצרות, רירית הרחם וendocervix, ודרכים נמוכות יותר המכילה את ectocervix והנרתיק (נסקר על ידי Kaushic אח&#39; 5). זה עדיין לא ברור מה תרומתו היחסית של אתרים השונים אלה היא הידבקות ב-HIV, אבל הוא האמין כי שני האתרים יכולים לתרום לכניסת ה-HIV 6. תאי T מייצגים 40-50% מleucocytes בקטעים העליונים ותחתונים הרבייה, ואילו מקרופאגים מהווים כ 10% (בדיקה ב-רודריגז גרסיה ואח&#39; 2). ניתן לאתר תאי T בנרתיק, צוואר הרחם, ורירית הרחם. המקרופאגים הם חזקים יותר localized ברירית הרחם ורקמת חיבור myometrial מצוואר הרחם, למרות שהם יכולים להיות מזוהים בשתי הרקמות. לבסוף, תאים הדנדריטים plasmacytoid (PDC) ותאים לנגרהנס יכולים גם להתגלות ברקמות FGT. הפנוטיפ והפרופורציות של אוכלוסיות חיסוניים והרגישות שלהם להידבקות ב-HIV עשויים להשתנות חשוב פי מחזורים הורמונליים, השימוש באמצעי מניעה הורמונליים, וגינוזיס חיידקים או פעילות מינית 5,7-9. מגוון שיטות פותחו כדי ללמוד את האוכלוסיות וסביבה חיסוניים של FGT. ביופסיה צוואר הרחם, צוואר הרחם וcytobrushes lavages הצרויקו (CVL) 10-12 הם נפוץ ביותר על פני הספרות. CVL אוסף ידי שטיפת PBS הוא השיטה הפשוטה ומאפשר הלימוד של חלבוני ויסות מערכת החיסון, אך תוצאות בתשואה נמוכה מאוד של תאים, ולכן הוא אינו מתאים ללימוד אוכלוסיות תאים חיסוניים של FGT 13. דגימות CVL הן, לעומת זאת, very שימושי להערכת הסביבה החיסונית של FGT ידי מדידת הביטוי של ציטוקינים שונים, כמוקינים או גורמים מיקרוביאלית באמצעות שיטות כגון ELISA, מערך חרוז ציטוקינים 14 או ספקטרומטריית מסת 15,16. אפיון של תדרים חיסוניים תא, פנוטיפים ופונקציות יכול להיות מושגת על ידי איסוף תאים חד גרעיניים בצוואר הרחם (CMC) על ידי cytobrush צוואר הרחם או על ידי דגימת ביופסיה בצוואר הרחם. דגימת ביופסיה צוואר הרחם היא שיטה פולשנית המגבירה את אי הנוחות וסיכון לדימום ולוקח 2-11 ימים כדי להחלים לאחר ההליך בהתאם למצב החיסונית של האישה 12. מצד השני, cytobrushes צוואר הרחם, למרות התשואה נמוכה יותר של תאים שנאספו, היא שיטה פחות פולשנית ונוחה יותר לאיסוף תאים חיסוניים מFGT. שני שיטות יכולות להגיע לאותה תשואה של leucocytes CD45 +, אבל שתי cytobrushes צוואר הרחם רציף נחוצות כדי להשיג את אותה הכמות של תאים הכיל in ביופסיה אחת 13. יחד עם זאת, דגימת cytobrush עדיין מספקת מספר מקובל של תאים (כ -5,000 CD45 + תאים / cytobrush) עבור vivo phenotyping נוסף לשעבר על ידי cytometry זרימה 14. כמו כן, אפיון פונקציונלי יכול להתבצע על דגימות אלה, כגירוי וזרימת cytometry תאית או qPCR בוצעו באמצעות CMCs נגזר cytobrush לזהות תגובות HIV-ספציפיות חיסוניים 17 או ה תא קיטוב 18. התרחבות של אוכלוסיית תאי T עשויה גם להקל על מחקרים פונקציונליים עם CMCs 19. חשוב לציין כי ביופסיות וcytobrushes לטעום מנות שונות של FGT. ביופסיות נגזרות מהחלק העליון של האפיתל ו stroma של ectocervix 12,13, בעוד cytobrushes צוואר הרחם לדגום את מערכת ההפעלה בצוואר הרחם, איסוף תאים שמקורם האפיתל של endocervix ומן הסתם אזור טרנספורמציה. דגימות Cytobrush לכן לדגום מחדשגיון מורכב משכבה יחידה של אפיתל עמודים, בעוד ביופסיות, כוללות אזור בשורה של אפיתל מרובדת קשקש 5. כתוצאה מכך, האופי של אוכלוסיות יקוציט שנאספו על ידי ביופסיה וcytobrush צוואר הרחם שונה. ביופסיות לאסוף שיעור גבוה יותר של תאי CD3 + T, ואילו cytobrushes לגרום לאוסף של שיעור גבוה יותר של מונוציטים CD14 + / מקרופאגים 13. לומד אימונולוגיה של FGT כבר עניין לשנים רבות ו20-22 שצברנו מומחיות רבה בחקר CMCs נגזר cytobrush. המחקרים שלנו מתמקדים בעיקר בלימוד seronegative HIV-נגוע, נגוע ונחשף ב-HIV (HESN) עובדי מין נשיים מניירובי, קניה. HIV משכפל מעדיף בתאי T מופעלים 23 ונמוכות מספרים של תאים מופעלים שיכול להיות ממוקד על ידי HIV בFGT יכולים לתרום להגנה מפני רכישת ה-HIV. בקנה אחד עם השערה זו, כמה Studies תיאר הפעלה חיסונית נמוך יותר בקרב עובדי תעשיית מין HESN שנמצאים בחשיפה גבוהה לאיידס עדיין יישאר נגוע 24,25, והפנוטיפ שקט זה נצפה גם בFGT 14. כאן, אנו מתארים מתודולוגיה לעיבוד והערכת הפעלת תאי T בדגימות CMC נגזרות מcytobrushes צוואר הרחם על ידי vivo לשעבר cytometry זרימה.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="768">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:295px;">Name of Material/ Equipment</td>
			<td style="width:136px;">Company</td>
			<td style="width:133px;">Catalog Number</td>
			<td style="width:205px;">Comments/Description</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:295px;">100uM Cell Strainer for 50 ml Falcon tube</td>
			<td style="width:136px;">BD</td>
			<td style="width:133px;">352360</td>
			<td>CMC processing</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:295px;">RPMI 1640</td>
			<td style="width:136px;">Hyclone</td>
			<td style="width:133px;">SH30027.01</td>
			<td>CMC processing</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:295px;">Fetal Bovine serum&#160;</td>
			<td style="width:136px;">Life technology</td>
			<td style="width:133px;">16000044</td>
			<td>CMC processing</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:295px;">Fungizone</td>
			<td style="width:136px;">Life technology</td>
			<td style="width:133px;">15290-018</td>
			<td>CMC processing</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:295px;">Penicillin/streptomycin</td>
			<td style="width:136px;">Sigma</td>
			<td style="width:133px;">P4333-20ml</td>
			<td>CMC processing</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:295px;">50ml Falcon tube</td>
			<td style="width:136px;">Fisher</td>
			<td style="width:133px;">14-959-49A</td>
			<td>CMC processing</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:295px;">Blood Bank disposable transfer pipette</td>
			<td style="width:136px;">Fisher&#160;</td>
			<td style="width:133px;">13-711-6M</td>
			<td>CMC processing</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:295px;">Cytobrush plus</td>
			<td style="width:136px;">Cooper surgical</td>
			<td style="width:133px;">C0121</td>
			<td>CMC sampling</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:295px;">Disposable cervical scraper</td>
			<td style="width:136px;">Quick medical</td>
			<td style="width:133px;">2183</td>
			<td>CMC sampling</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:295px;">15 ml Falcon tube&#160;</td>
			<td style="width:136px;">Fisher&#160;</td>
			<td style="width:133px;">14-959-70c</td>
			<td>CVL processsing</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:295px;">1.5ml tube ependroff</td>
			<td style="width:136px;">Fisher</td>
			<td style="width:133px;">05-402-18</td>
			<td>CVL storage</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">LIVE/DEAD Fixable Cell Stain Kit</td>
			<td style="width:136px;">Invitrogen</td>
			<td>Various</td>
			<td>Flow cytometry reagent</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Fixation Buffer (4% PFA)</td>
			<td style="width:136px;">BD</td>
			<td>554655</td>
			<td>Flow cytometry regeant&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:295px;">IgG mouse&#160;</td>
			<td style="width:136px;">Sigma</td>
			<td style="width:133px;">I8765</td>
			<td>Flow cytometry regeant&#160;</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

collection, isolation, and flow cytometric analysis of human endocervical samples

Despite the public health importance of mucosal pathogens (including HIV), relatively little is known about mucosal immunity, particularly at the female genital tract (FGT). Because heterosexual transmission now represents the dominant mechanism of HIV transmission, and given the continual spread of sexually transmitted infections (STIs), it is critical to understand the interplay between host and pathogen at the genital mucosa. The substantial gaps in knowledge around FGT immunity are partially due to the difficulty in successfully collecting and processing mucosal samples. In order to facilitate studies with sufficient sample size, collection techniques must be minimally invasive and efficient. To this end, a protocol for the collection of cervical cytobrush samples and subsequent isolation of cervical mononuclear cells (CMC) has been optimized. Using ex vivo flow cytometry-based immunophenotyping, it is possible to accurately and reliably quantify CMC lymphocyte/monocyte population frequencies and phenotypes. This technique can be coupled with the collection of cervical-vaginal lavage (CVL), which contains soluble immune mediators including cytokines, chemokines and anti-proteases, all of which can be used to determine the anti- or pro-inflammatory environment in the vagina.

זרימת multiparameter cytometry הוא כלי רב עוצמה כדי לנתח את פנוטיפים ופונקציות של תת תא ברקמות uncharacterized בעבר. ניתוח של דגימות CMC יכול להניב מידע על שני הלימפוציטים ואוכלוסיות מונוציטים עם אסטרטגיות gating מתאימות. אסטרטגית gating נציג CMC, בהשוואה ל...

Watch this Scientific Journal Video about Collection, Isolation, and Flow Cytometric Analysis of Human Endocervical Samples at JoVE.com

Collection, Isolation, and Flow Cytometric Analysis of Human Endocervical Samples

The use of cytobrush sampling to collect lymphocytes and monocytes from the endocervix is a minimally invasive technique that provides samples for analysis of female genital tract immunity. In this protocol, we describe the collection of cytobrush samples and immune cell isolation for flow cytometry assays.

אוסף, בידוד, וניתוח תזרים cytometric של דוגמאות האנדוצרוויקאלית אדם

Despite the public health importance of mucosal pathogens (including HIV), relatively little is known about mucosal immunity, particularly at the female ...

collection-isolation-flow-cytometric-analysis-human-endocervical

Research

JoVE Journal

Medicine

19.0K Views.  University of Manitoba. The use of cytobrush sampling to collect lymphocytes and monocytes from the endocervix is a minimally invasive technique that provides samples for analysis of female genital tract immunity. In this protocol, we describe the collection of cytobrush samples and immune cell isolation for flow cytometry assays. 

Video: Collection, Isolation, and Flow Cytometric Analysis of Human Endocervical Samples

Isolation of Human Islets from Partially Pancreatectomized Patients

Investigations into the pathogenesis of type 2 diabetes and islets of Langerhans malfunction 1 have been hampered by the limited availability of type 2 diabetic islets from organ donors2. Here we share our protocol for isolating islets from human pancreatic tissue obtained from type 2 diabetic and non-diabetic patients who have undergone partial pancreatectomy due to different pancreatic diseases (benign or malignant pancreatic tumors, chronic pancreatitis, and common bile duct or duodenal tumors). All patients involved gave their consent to this study, which had also been approved by the local ethics committee. The surgical specimens were immediately delivered to the pathologist who selected soft and healthy appearing pancreatic tissue for islet isolation, retaining the damaged tissue for diagnostic purposes. We found that to isolate more than 1,000 islets, we had to begin with at least 2 g of pancreatic tissue. Also essential to our protocol was to visibly distend the tissue when injecting the enzyme-containing media and subsequently mince it to aid digestion by increasing the surface area.
To extend the applicability of our protocol to include the occasional case in which a large amount (&gt;15g) of human pancreatic tissue is available , we used a Ricordi chamber (50 ml) to digest the tissue. During digestion, we manually shook the Ricordi chamber3 at an intensity that varied by specimen according to its level of tissue fibrosis. A discontinous Ficoll gradient was then used to separate the islets from acinar tissue. We noted that the tissue pellet should be small enough to be homogenously resuspended in Ficoll medium with a density of 1.125 g/ml. After isolation, we cultured the islets under stress free conditions (no shaking or rotation) with 5% CO2 at 37 &deg;C for at least 48 h in order to facilitate their functional recovery. Widespread application of our protocol and its future improvement could enable the timely harvesting of large quantities of human islets from diabetic and clinically matched non-diabetic subjects, greatly advancing type 2 diabetes research.

The supply of type 2 diabetic islets for research is insufficient. Here we share our protocol for isolating islets from patients undergoing partial pancreatectomy. This approach represents a unique venue for obtaining islets from type 2 diabetic and clinically matched non-diabetic subjects in adequate numbers for basic and clinical studies.

הבידוד של איי האדם מן המטופלים Pancreatectomized חלקית

Investigations into the pathogenesis of type 2 diabetes and islets of Langerhans malfunction 1 have been hampered by the limited availability of type 2 ...

Collection Protocol for Human Pancreas

This dissection and sampling procedure was developed for the Network for Pancreatic Organ Donors with Diabetes (nPOD) program to standardize preparation of pancreas recovered from cadaveric organ donors. The pancreas is divided into 3 main regions (head, body, tail) followed by serial transverse sections throughout the medial to lateral axis. Alternating sections are used for fixed paraffin and fresh frozen blocks and remnant samples are minced for snap frozen sample preparations, either with or without RNAse inhibitors, for DNA, RNA, or protein isolation. The overall goal of the pancreas dissection procedure is to sample the entire pancreas while maintaining anatomical orientation.
Endocrine cell heterogeneity in terms of islet composition, size, and numbers is reported for human islets compared to rodent islets 1. The majority of human islets from the pancreas head, body and tail regions are composed of insulin-containing &beta;-cells followed by lower proportions of glucagon-containing &alpha;-cells and somatostatin-containing &delta;-cells. Pancreatic polypeptide-containing PP cells and ghrelin-containing epsilon cells are also present but in small numbers. In contrast, the uncinate region contains islets that are primarily composed of pancreatic polypeptide-containing PP cells 2. These regional islet variations arise from developmental differences. The pancreas develops from the ventral and dorsal pancreatic buds in the foregut and after rotation of the stomach and duodenum, the ventral lobe moves and fuses with the dorsal 3. The ventral lobe forms the posterior portion of the head including the uncinate process while the dorsal lobe gives rise to the rest of the organ. Regional pancreatic variation is also reported with the tail region having higher islet density compared to other regions and the dorsal lobe-derived components undergoing selective atrophy in type 1 diabetes4,5.
Additional organs and tissues are often recovered from the organ donors and include pancreatic lymph nodes, spleen and non-pancreatic lymph nodes. These samples are recovered with similar formats as for the pancreas with the addition of isolation of cryopreserved cells. When the proximal duodenum is included with the pancreas, duodenal mucosa may be collected for paraffin and frozen blocks and minced snap frozen preparations.

This video demonstrates a dissection procedure for processing human pancreas into multiple storage formats. Anatomical orientation is maintained throughout the pancreatic regions to allow definition of regional islet composition and density.

אוסף פרוטוקול לבלב אנוש

This dissection and sampling procedure was developed for the Network for Pancreatic Organ Donors with Diabetes (nPOD) program to standardize preparation ...

Isolation, Culture, and Imaging of Human Fetal Pancreatic Cell Clusters

For almost 30 years, scientists have demonstrated that human fetal ICCs transplanted under the kidney capsule of nude mice matured into functioning endocrine cells, as evidenced by a significant increase in circulating human C-peptide following glucose stimulation1-9. However in vitro, genesis of insulin producing cells from human fetal ICCs is low10; results reminiscent of recent experiments performed with human embryonic stem cells (hESC), a renewable source of cells that hold great promise as a potential therapeutic treatment for type 1 diabetes. Like ICCs, transplantation of partially differentiated hESC generate glucose responsive, insulin producing cells, but in vitro genesis of insulin producing cells from hESC is much less robust11-17. A complete understanding of the factors that influence the growth and differentiation of endocrine precursor cells will likely require data generated from both ICCs and hESC. While a number of protocols exist to generate insulin producing cells from hESC in vitro11-22, far fewer exist for ICCs10,23,24. Part of that discrepancy likely comes from the difficulty of working with human fetal pancreas. Towards that end, we have continued to build upon existing methods to isolate fetal islets from human pancreases with gestational ages ranging from 12 to 23 weeks, grow the cells as a monolayer or in suspension, and image for cell proliferation, pancreatic markers and human hormones including glucagon and C-peptide. ICCs generated by the protocol described below result in C-peptide release after transplantation under the kidney capsule of nude mice that are similar to C-peptide levels obtained by transplantation of fresh tissue6. Although the examples presented here focus upon the pancreatic endoderm proliferation and &#946;&#160;cell genesis, the protocol can be employed to study other aspects of pancreatic development, including exocrine, ductal, and other hormone producing cells.

A protocol to isolate, culture, and image islet cell clusters (ICCs) derived from human fetal pancreatic cells is described.&#160; The method details the steps necessary to generate ICCs from tissue, culture as monolayers or in suspension as aggregates, and image for markers of proliferation and pancreatic cell fate decisions.

בידוד, תרבות והדמיה של צבירי תאים עוברי האנושי לבלב

For almost 30 years, scientists have demonstrated that human fetal ICCs transplanted under the kidney capsule of nude mice matured into functioning ...

Isolation and Functional Characterization of Human Ventricular Cardiomyocytes from Fresh Surgical Samples

Cardiomyocytes from diseased hearts are subjected to complex remodeling processes involving changes in cell structure, excitation contraction coupling and membrane ion currents. Those changes are likely&#160;to be responsible for the increased arrhythmogenic risk and the contractile alterations leading to systolic and diastolic dysfunction in cardiac patients. However, most information on the alterations of myocyte function in cardiac diseases has come from animal models.
Here we describe and validate a protocol to isolate viable myocytes from small surgical samples of ventricular myocardium from patients undergoing cardiac surgery operations. The protocol is described in detail. Electrophysiological and intracellular calcium measurements are reported to demonstrate the feasibility of a number of single cell measurements in human ventricular cardiomyocytes obtained with this method.
The protocol reported here can be useful for future investigations of the cellular and molecular basis of functional alterations of the human heart in the presence of different cardiac diseases. Further, this method can be used to identify novel therapeutic targets at cellular level and to test the effectiveness of new compounds on human cardiomyocytes, with direct translational value.

Current knowledge on the cellular basis of cardiac diseases mostly relies on studies on animal models. Here we describe and validate a novel method to obtain single viable cardiomyocytes from small surgical samples of human ventricular myocardium. Human ventricular myocytes can be used for electrophysiological studies and drug testing.

בידוד ואפיון פונקציונלי של אדם חדרית שריר לב מדוגמאות כירורגי טריות

Cardiomyocytes from diseased hearts are subjected to complex remodeling processes involving changes in cell structure, excitation contraction coupling and ...

Isolation of Cancer Stem Cells From Human Prostate Cancer Samples

The cancer stem cell (CSC) model has been considerably revisited over the last two decades. During this time CSCs have been identified and directly isolated from human tissues and serially propagated in immunodeficient mice, typically through antibody labeling of subpopulations of cells and fractionation by flow cytometry. However, the unique clinical features of prostate cancer have considerably limited the study of prostate CSCs from fresh human tumor samples. We recently reported the isolation of prostate CSCs directly from human tissues by virtue of their HLA class I (HLAI)-negative phenotype. Prostate cancer cells are harvested from surgical specimens and mechanically dissociated. A cell suspension is generated and labeled with fluorescently conjugated HLAI and stromal antibodies. Subpopulations of HLAI-negative cells are finally isolated using a flow cytometer. The principal limitation of this protocol is the frequently microscopic and multifocal nature of primary cancer in prostatectomy specimens. Nonetheless, isolated live prostate CSCs are suitable for molecular characterization and functional validation by transplantation in immunodeficient mice.

The isolation of cancer stem cells (CSCs) directly from human tissues is requisite for their biological characterization. This manuscript describes a methodology for the isolation of prostate CSCs from human tissues, while also providing tips on troubleshooting difficult steps.

בידוד של תאי גזע סרטני מדגימות אדם סרטן הערמונית

The cancer stem cell (CSC) model has been considerably revisited over the last two decades. During this time CSCs have been identified and directly ...

Rapid Fractionation and Isolation of Whole Blood Components in Samples Obtained from a Community-based Setting

Collection and processing of whole blood samples in a non-clinical setting offers a unique opportunity to evaluate community-dwelling individuals both with and without preexisting conditions. Rapid processing of these samples is essential to avoid degradation of key cellular components. Included here are methods for simultaneous peripheral blood mononuclear cell (PBMC), DNA, RNA and serum isolation from a single blood draw performed in the homes of consenting participants across a metropolitan area, with processing initiated within 2 hr of collection. We have used these techniques to process over 1,600 blood specimens yielding consistent, high quality material, which has subsequently been used in successful DNA methylation, genotyping, gene expression and flow cytometry analyses. Some of the methods employed are standard; however, when combined in the described manner, they enable efficient processing of samples from participants of population- and/or community-based studies who would not normally be evaluated in a clinical setting. Therefore, this protocol has the potential to obtain samples (and subsequently data) that are more representative of the general population.

We outline a methodology for the processing of whole blood to obtain a variety of components for further analysis. We have optimized a streamlined protocol that enables rapid, high-throughput simultaneous processing of whole blood samples in a non-clinical setting.

פלזמה מהירה ובידוד של מרכיבי דם שלמים בדגימות שהתקבלה מהגדרה מבוססת-קהילה

Collection and processing of whole blood samples in a non-clinical setting offers a unique opportunity to evaluate community-dwelling individuals both ...

Isolation and Profiling of MicroRNA-containing Exosomes from Human Bile

Exosome research in the last three years has greatly extended the scope towards identification and characterization of biomarkers and their therapeutic uses.
Exosomes have recently been shown to contain microRNAs (miRs). MiRs themselves have arisen as valuable biomarkers for diagnostic purposes. As specimen collection in clinics and hospitals is quite variable, miRNA isolation from whole bile varies substantially. To achieve robust, accurate and reproducible miRNA profiles from collected bile samples in a simple manner required the development of a high-quality protocol to isolate and characterize exosomes from bile. The method requires several centrifugations and a filtration step with a final ultracentrifugation step to pellet the isolated exosomes. Electron microscopy, Western blots, flow cytometry and multi-parameter nanoparticle optical analysis, where available, are crucial characterization steps to validate the quality of the exosomes. For the isolation of miRNA from these exosomes, spiking the lysate with a non-specific, synthetic miRNA from a species like Caenorhabditis elegans, i.e., Cel-miR-39, is important for normalization of RNA extraction efficiency. The isolation of exosome from bile fluid following this method allows the successful miRNA profiling from bile samples stored for several years at -80 &#176;C.

Bile fluid is a valuable source of extracellular vesicles/exosomes that contain potentially important biomarkers. This protocol represents a robust method to isolate exosomes from human bile for further analyses including miRNA profiling.

בידוד Profiling של MicroRNA המכיל Exosomes מן האדם מר

Exosome research in the last three years has greatly extended the scope towards identification and characterization of biomarkers and their therapeutic ...

Simultaneous Flow Cytometric Characterization of Multiple Cell Types Retrieved from Mouse Brain/Spinal Cord Through Different Homogenization Methods

Recent advances in viral vector and nanomaterial sciences have opened the way for new cutting-edge approaches to investigate or manipulate the central nervous system (CNS). However, further optimization of these technologies would benefit from methods allowing rapid and streamline determination of the extent of CNS and cell-specific targeting upon administration of viral vectors or nanoparticles in the body. Here, we present a protocol that takes advantage of the high throughput and multiplexing capabilities of flow cytometry to allow a straightforward quantification of different cell subtypes isolated from mouse brain or spinal cord, namely microglia/macrophages, lymphocytes, astrocytes, oligodendrocytes, neurons and endothelial cells. We apply this approach to highlight critical differences between two tissue homogenization methods in terms of cell yield, viability and composition. This could instruct the user to choose the best method depending on the cell type(s) of interest and the specific application. This method is not suited for analysis of anatomical distribution, since the tissue is homogenized to generate a single-cell suspension. However, it allows to work with viable cells and it can be combined with cell-sorting, opening the way for several applications that could expand the repertoire of tools in the hands of the neuroscientist, ranging from establishment of primary cultures derived from pure cell populations, to gene-expression analyses and biochemical or functional assays on well-defined cell subtypes in the context of neurodegenerative diseases, upon pharmacological treatment or gene therapy.

We present a flow cytometry method to identify simultaneously different cell types retrieved from mouse brain or spinal cord. This method could be exploited to isolate or characterize pure cell populations in neurodegenerative diseases or to quantify the extent of cell targeting upon in vivo administration of viral vectors or nanoparticles.

אפיון מרובה של סוגי תאים שאוחזרו ממוח העכבר/חוט השדרה דרך שיטות הומוקות שונות

Recent advances in viral vector and nanomaterial sciences have opened the way for new cutting-edge approaches to investigate or manipulate the central ...

Hemocompatibility Testing of Blood-Contacting Implants in a Flow Loop Model Mimicking Human Blood Flow

The growing use of medical devices (e.g., vascular grafts, stents, and cardiac catheters) for temporary or permanent purposes that remain in the body&#39;s circulatory system demands a reliable and multiparametric approach that evaluates the possible hematologic complications caused by these devices (i.e., activation and destruction of blood components). Comprehensive in vitro hemocompatibility testing of blood-contacting implants is the first step towards successful in vivo implementation. Therefore, extensive analysis according to the International Organization for Standardization 10993-4 (ISO 10993-4) is mandatory prior to clinical application. The presented flow loop describes a sensitive model to analyze the hemostatic performance of stents (in this case, neurovascular) and reveal adverse effects. The use of fresh human whole blood and gentle blood sampling are essential to avoid the preactivation of blood. The blood is perfused through a heparinized tubing containing the test specimen by using a peristaltic pump at a rate of 150 mL/min at 37 &#176;C for 60 min. Before and after perfusion, hematologic markers (i.e., blood cell count, hemoglobin, hematocrit, and plasmatic markers) indicating the activation of leukocytes (polymorphonuclear [PMN]-elastase), platelets (&#946;-thromboglobulin [&#946;-TG]), the coagulation system (thombin-antithrombin III [TAT]), and the complement cascade (SC5b-9) are analyzed. In conclusion, we present an essential and reliable model for extensive hemocompatibility testing of stents and other blood-contacting devices prior to clinical application.

This protocol describes a comprehensive hemocompatibility evaluation of blood-contacting devices using laser-cut neurovascular implants. A flow loop model with fresh, heparinized human blood is applied to mimic blood flow. After perfusion, various hematologic markers are analyzed and compared to the values gained directly after blood collection for hemocompatibility evaluation of the tested devices.

בדיקות הומותאימות של דם-יצירת קשר שתלים בלופ זרימה לולאה דגם מחקה זרימת הדם האנושית

The growing use of medical devices (e.g., vascular grafts, stents, and cardiac catheters) for temporary or permanent purposes that remain in the ...

Validated LC-MS/MS Panel for Quantifying 11 Drug-Resistant TB Medications in Small Hair Samples

Drug resistant-tuberculosis (DR-TB) is a growing public health threat, and assessment of therapeutic drug levels may have important clinical benefits. Plasma drug levels are the current gold standard assessment, but require phlebotomy and a cold chain, and capture only very recent adherence. Our method uses hair, a matrix that is easily collected and reflective of long-term adherence, to test for 11 anti-TB medications. Previous work by our group shows that antiretroviral drug levels in hair are associated with HIV outcomes. Our method for DR-TB drugs uses 2 mg of hair (3 cm proximal to the root), which is pulverized and extracted in methanol. Samples are analyzed with a single LC-MS/MS method, quantifying 11 drugs in a 16 min run. Lower limits of quantification (LLOQs) for the 11 drugs range from 0.01 ng/mg to 1 ng/mg. Drug presence is confirmed by comparing ratios of two mass spectrometry transitions. Samples are quantified using the area ratio of the drug to the deuterated, 15N-, or 13C-labeled drug isotopologue. We used a calibration curve ranging from 0.001-100 ng/mg. Application of the method to a convenience sample of hair samples collected from DR-TB patients on directly observed therapy (DOT) indicated drug levels in hair within the linear dynamic range of nine of the eleven drugs (isoniazid, pyrazinamide, ethambutol, linezolid, levofloxacin, moxifloxacin, clofazimine, bedaquiline, pretomanid). No patient was on prothionamide, and the measured levels for ethionamide were close to its LLOQ (with further work instead examining the suitability of ethionamide&#8217;s metabolite for monitoring exposure). In summary, we describe the development of a multi-analyte panel for DR-TB drugs in hair as a technique for therapeutic drug monitoring during drug-resistant TB treatment.

Current methods of analyzing patients&#8217; adherence to complex drug resistant-tuberculosis (DR-TB) regimens can be inaccurate and resource-intensive. Our method analyzes hair, an easily collected and stored matrix, for concentrations of 11 DR-TB medications. Using LC-MS/MS, we can determine sub-nanogram drug levels that can be utilized to better understand drug adherence.

מאומת LC-MS/MS הפאנל לכמת 11 תרופות עמידות לפני שחפת בדגימות שיער קטן

Drug resistant-tuberculosis (DR-TB) is a growing public health threat, and assessment of therapeutic drug levels may have important clinical benefits. ...