עבודה זו נתמכה על ידי הסוכנות גרנט פנימית של הפקולטה של טרופי AgriSciences, (פרויקט מס: 20175013), את 20182023 סיגרית שניהם מעניק, מן הצ'כית באוניברסיטה של מדעי החיים.

1. בשר הכנה
<ol><li>להשיג על ירך קצרה של בשר (בשר בקר טרי מן הדו-ראשי) של שחיטה מקומיים ולהעביר אותו למעבדה. הערה: מומלץ להעביר את ירך בקר בטמפרטורת החדר (20-25 ° C), במשך תקופה לא יותר מ 20 דקות בשק אטום הרמטי.</li>
	<li>לחטא את המשטח החיצוני של שריר בקר, בבטיחות למינריות cabinet, לשטוף את השריר ע י ריסוס עם אתנול 70% (v/v) 10 s באמצעות בקבוק לחיץ 500 מ"ל. החל 0.025 גרם אתנול לכל 1 ס מ2 משטח שריר.</li>
	<li>הסר את המשטח החיצוני של הבשר גילוח ורחיצה כירורגית עם סכין כדי להימנע אתנול שנותרו על הפנים שריר. הסר כ 3 מ מ הפנים שרירים כדי לשמור על אחידות פני השטח של השריר.</li>
	<li>לארוז את השריר בשקית אטומה, להעביר אותו מקפיא.</li>
	<li>אחסן את השריר ב-18 ° C עבור יום אחד. לאחר מכן, להפשיר את השריר קפוא ב 4 מעלות צלזיוס במשך 6 שעות. הערה: לקבלת מפשיר, מומלץ להעביר את השריר מהמקפיא המקרר.</li>
	<li>ב- cabinet בטיחות למינריות, פורסים כל שריר לפרוסות בעובי 0.5 ס מ עם חותך בשר. לאחר מכן, עם סכין לחתוך אותו ל קטן 5 × 2.5 ס מ2 דגימות מלבני.</li>
	<li>חבילת הדגימות בשר מלבני בשקיות פלסטיק ולאחסן אותם בתא ההקפאה ב-18 ° C לשימוש מאוחר יותר.</li>
</ol>2. הכנת Inoculum מתוקננת מספקת וההליך חיסון בארון זכוכית בטיחות
<ol><li>להכין inoculum סטנדרטית (1.5 × 108 CFU/mL) של e. coli בקרת האוויר 25922 לחסן את הדגימות בשר.<ol>
<li>עבור הכנת inoculum מניות, קודם לוותר על התרבות חיידקי lyophilized (נמסר על ידי הספק) לתוך צינור סטיריליים 15-mL מלא מראש עם 10 מ"ל של סטיריליים Buffered מולר הינטון מרק בשר (BMHB). לטפח זו השעיה במשך 24 שעות ביממה ב- 37 מעלות צלזיוס.<ol>
<li>להכין את הפתרון מניות חיידקי כדלקמן: לקחת כ 0.1 - 0.2 מ"ל של השעיה חיידקי ורכים לתוך בקבוקון 20-mL סגור עם פקק גומי עם כובע אלומיניום מלא מראש עם 15 מ"ל של BMHB מעוקר. לטפח זו השעיה במשך 24 שעות ביממה ב- 37 מעלות צלזיוס.</li>
			<li>לאחסן בתוך המקרר ב 4 ° C עבור הכנת inoculum סטנדרטית.</li>
		</ol>
</li>
		<li>מהפתרון מניות (ראה שלב 2.1.1) של E. coli לקחת כ 0.1 - 0.2 מ"ל של השעיה חיידקי ורכים ב פלסטיק 15-mL לעקר צינור מלא מראש עם 10 מ"ל של סטיריליים Buffered מולר הינטון מרק בשר (BMHB). דגירה הצינור ב 37 מעלות צלזיוס במשך 24 שעות ביממה.</li>
		<li>עבור הכנת inoculum סטנדרטית (1.5 × 108 CFU/mL), להוסיף כמויות קטנות של ההשעייה 15-mL סטיריליים צינור מלא מראש עם 10 מ"ל של BMHB מעוקר.</li>
		<li>מערבולת ביסודיות התערובת ולמדוד צפיפות אופטית (OD)-600 ננומטר על ידי דחיסות32.</li>
		<li>חזור על שלבים 2.1.3 - 2.1.4 עד OD הביע כמו הערך מקפרלנד מתגברת על ידי 0.5 לעומת הערך של BMHB נקי.</li>
	</ol>
</li>
	<li>עבור ההליך חיסון, מקום הדגימות בשר מלבני שני שונים אלומיניום foils (20 ס"מ על 30 ס"מ), אחד עבור דגימות הבקרה והשני על הדגימות בשר חוסנו.<ol>
<li>מעל רדיד האלומיניום השני, לחסן את הדגימות בשר נא מלבני עם 800 µL של חיידקים השעיה של המתח שנבחר (זה תואם ל- 1.2 × 108 CFU לדגימה בשר) על-ידי הפצת באופן שווה את inoculum על פני השטח.<ol>
<li>פיפטה µL 400 בצד אחד של המדגם, בעדינות מתפשטים באמצעות מפזר תא סטרילי על פני השטח. תנו להן להתייבש במשך 10 דקות חוזר ההליך אותו לשארית המתלה בצד השני של המדגם.</li>
		</ol>
</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. ייבוש ויישום TEO
<ol><li>העברת שני foils אלומיניום המכיל את הדגימות בשר מלבני הבטיחות למינריות ארון למייבש: לכסות את כל אחד עם רדיד אלומיניום, ולאחר מכן מקם את הדגימות בתוך המייבש.</li>
	<li>לבצע את הייבוש מייבש במעבדה רגילה. הערה: ראשית, מחממים התנור ל- 55 מעלות צלזיוס. הליך זה יכול להימשך למשך 20 דקות.<ol>
<li>נגב את דגימות הבקרה עבור 6-אייץ '-55 ° C, ייבוש אוויר שלחותו ערכים הנע בין 30-45%. הערה: ייבוש אוויר שלחותו ערכים משתנים עם הזמן בהתאם קצב אידוי של נוזל מן הבשר.</li>
	</ol>
</li>
	<li>לחשב את עוצמת הקול של תיאו מוחל, ולבטא את ריכוז שמן חיוני כאמצעי אחסון של תיאו לכל אמצעי אחסון מייבש (אוויר mL/L). לדוגמה, המינון של 1.5 מ של תיאו ב L 53 (נפח של המייבש) תוצאות ריכוז של 0.028 mL/ליטר אוויר. כדי לקבוע את המיקרופון של תיאו עבור e. coli, להשתמש במינון של 1.5 mL (מ 0.028/L אוויר), 1 מ"ל (0.019 גרם/ליטר אוויר) ו- 0.75 מ ל (אוויר 0.014 mL/L).</li>
	<li>לפני ייבוש, של יישום TEO משרים ואדים (עם תימול בתור הראשי במתחם 79%), נייר סינון (12 ס"מ x 20 ס"מ) עם מנה 1.5 mL TEO ומקום לתוך המייבש מול המאוורר.</li>
	<li>יבש את הדגימות בשר TEO שטופלו באמצעות ההליך אותו באשר הדגימות שליטה (שלבים 3.1 ו- 3.2). הערה: לאחר מסתיים תהליך ייבוש ודוגמאות יוסרו, להדליק את התנור ל-3 שעות ב 80 ° C, מוגדר הסימן שסתום אוויר אוורור 100% כדי לנקות את שאריות שמנים אתריים מן התנור.</li>
</ol>4. ניתוח מיקרוביאלי
<ol><li>לפני חיסון בשר עם חיידקים, לבחון את הדגימות בשר עבור כל מהילה. המראה של רפש, הגילוי של כל ריח חריף וחזק מעידים על קלקול הבשר. אם המרקם מרגיש מגעיל, החיידק עלול החלו להתרבות על פני השטח של הבשר.</li>
	<li>כדי להעריך את יעילות חיסון, בדיקת הדגימות חוסנו raw לנוכחות של e. coli בקרת האוויר 25922 ולהשוות אותם עם דגימות הבקרה שאינו מחוסן לפני ההליך ייבוש. למטרה זו:<ol>
<li>לשטוף כל מדגם בשר (2 דגימות הבקרה ו- 2 דוגמאות חוסנו). להשעות כל מדגם בשר בבקבוקון סטיריליים עם peptone במאגר מים (8.5 גרם של NaCl, 1g של peptone, 5 טבליות של באגירה פוספט תמיסת מלח, 1 g של Polysorbate 80 ב- 1 ליטר של מים) על יחס של 1:10 (w/v) עם טווח pH שבין 7-7.3. לנער בעזרת מטרף-140 סל ד 10 דקות בטמפרטורת החדר. הערה: לשטוף מיד לאחר הניתוח חיסון.</li>
		<li>להעריך את מספר החיידקים על ידי מנוכי עונתיות 6 × 6 טיפה את הצלחת הליך מסוכמים על-ידי חן Nace, ארווין33 על ספירת צלחת אגר (PCA) ו MacConkey אגר (MCA). הערה: השיטה טיפה 6 × 6 משתמשת בשיטת מיקרו דילול מרק להכין 10-fold טורי דילולים המדגם ובדוקים עם פיפטה רב-ערוצי, שהינו פחות עבודה אינטנסיבית וחסכוני יותר לעומת השיטה המקובלת33, 34.</li>
		<li>לטפח את דילולים מדגם טורי 10-fold על-ידי הפרוצדורה צלחת 6 × 6 טיפה על ההערכה של e. coli. הערה: במיוחד עבור 6 × 6 טיפה השיטה, טיפוח לשימוש 6 5 µL-טיפות, 6-נבחרת דילולים המדגם ובדוקים עם פיפטה רב-ערוצי. על צלחות פטרי יבשים כראוי, הטיפות לספוג במהירות לתוך אגר, נטיעת בשיטה זו הוא מאוד נוח, לניהול34.</li>
		<li>דגירה של צלחות פטרי-37 מעלות צלזיוס במשך 24 שעות ביממה. לאחר תקופת טיפוח, להעריך את מספר מושבות של e. coli על צלחות פטרי (CFU g-1 של בשר מיובש) כמתואר בסעיף 5.</li>
	</ol>
</li>
	<li>לאחר הייבוש, לקחת שתי דגימות מיובשים חוסנו ולהשוות אותם עם שתי דגימות הבקרה שאינו מחוסן יבשים עבור קיימא e. coli, בהתאמה. כדי לקבוע נוכחות או היעדרות של e. coli של אלה amples sארבע, לבצע את התהליך העשרה מראש של כל מדגם בשר כדלקמן:<ol>
<li>להשעות כל מדגם בשר בבקבוקון סטיריליים עם peptone במאגר מים (ראה שלב 4.2.1) וללחוץ בעזרת מטרף-140 סל ד 10 דקות בטמפרטורת החדר. ואז תדגור בכל הבקבוק ב 37 מעלות צלזיוס במשך 6 שעות העשרה קדם</li>
		<li>על ההערכה ועל טיפוח החיידקים, בצע את ההליך כמתואר בצעדים 4.2.2 - 4.2.4.</li>
	</ol>
</li>
</ol>5. סקירת תוצאות
<ol><li>בתום הדגירה, להסיר את צלחות פטרי החממה וסקירת התוצאות כדלקמן:<ol>
<li>כדי להעריך את המספר הכולל של מושבות, לבחון את הצלחות נוכחות של חיידקים אירוביים mesophilic PCA (כתמים לבנים), טיפוסי e. coli מושבות (אדום עד ורוד כהה) ב- MCA. אם המחלה נעדר, שני agars להציג צמיחה אין.</li>
		<li>לספור את המושבות, לקבוע את כמות e. coli (CFU/g-1 של בשר מיובש) הנוכחי. הערה: לספור את מספר מושבות (N)-שני דילולים רצופים המכיל 30 או פחות מושבות לכל טיפה (איור 1). מספר N של CFU/g-1 של בשר מיובש נקבע כדלקמן35 <img alt="Equation" src="/files/ftp_upload/57054/57054eq1.jpg"> איפה, C הוא הסכום של המושבות של טיפות כל נספרים v הוא הנפח של דילול הדגימה המשמש לכל טיפה (כאן, 0.05 mL), n1 הוא מספר טיפות בשימוש בדילול הראשון, n2 הוא מספר טיפות השתמשו בדילול השני ומייצג d דילול שממנו נלקחו בשבי הסעיפים הראשונים.</li>
	</ol>
</li>
	<li>כדי לנתח את הנתונים מיקרוביולוגית, להמיר את המספר של המושבות כדי להיכנס CFU g-1 , מעמיד אותם בפני השונות (ANOVA) על ההשפעות העיקריות של טיפול36.<ol>
<li>לבצע במבחן Tukey כנה הבדל משמעותי (Tukey HSD) כלומר השוואות מרובות36 ולקבוע את הבדלים משמעותיים בין הטיפולים.</li>
	</ol>
</li>
</ol>

<ol>
	<li>Eklund, M. W., Peterson, M. E., Poysky, F. T., Paranjpye, R. N., Pelroy, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Control+of+bacterial+pathogens+during+processing+of+cold-smoked+and+dried+salmon+strips.">Control of bacterial pathogens during processing of cold-smoked and dried salmon strips.</a> J. Food Prot. 67 (2), 347-351 (2004).</li><li>Mahmoud, B. S. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preservative+effect+of+combined+treatment+with+electrolyzed+NaCl+solutions+and+essential+oil+compounds+on+carp+fillets+during+convectional+air-drying.">Preservative effect of combined treatment with electrolyzed NaCl solutions and essential oil compounds on carp fillets during convectional air-drying.</a> Int. J. Food Microbiol. 106 (3), 331-337 (2006).</li><li>Rahman, M. S., Guizani, N., Al-Ruzeiki, M. H., Al Khalasi, A. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microflora+Changes+in+Tuna+Mince+During+Convection+Air+Drying.">Microflora Changes in Tuna Mince During Convection Air Drying.</a> Dry. Technol. 18 (10), 2369-2379 (2000).</li><li>Faith, N. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Viability+of+Escherichia+coli+O157:+H7+in+ground+and+formed+beef+jerky+prepared+at+levels+of+5+and+20%+fat+and+dried+at+52,+57,+63,+or+68+C+in+a+home-style+dehydrator.">Viability of Escherichia coli O157: H7 in ground and formed beef jerky prepared at levels of 5 and 20% fat and dried at 52, 57, 63, or 68 C in a home-style dehydrator.</a> Int. J. Food Microbiol. 41 (3), 213-221 (1998).</li><li>Hierro, E., De La Hoz, L., Ord&#243;&#241;ez, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Headspace+volatile+compounds+from+salted+and+occasionally+smoked+dried+meats+(cecinas)+as+affected+by+animal+species.">Headspace volatile compounds from salted and occasionally smoked dried meats (cecinas) as affected by animal species.</a> Food Chem. 85 (4), 649-657 (2004).</li><li>Nummer, B. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+Preparation+Methods+on+the+Microbiological+Safety+of+Home-Dried+Meat+Jerky.">Effects of Preparation Methods on the Microbiological Safety of Home-Dried Meat Jerky.</a> J. Food Prot. 67 (10), 2337-2341 (2004).</li><li>Greig, J. D., Ravel, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+of+foodborne+outbreak+data+reported+internationally+for+source+attribution.">Analysis of foodborne outbreak data reported internationally for source attribution.</a> Int. J. Food Microbiol. 130 (2), 77-87 (2009).</li><li>Eidson, M., Sewell, C. M., Graves, G., Olson, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Beef+jerky+gastroenteritis+outbreaks.">Beef jerky gastroenteritis outbreaks.</a> J. Environ. Health. 62 (6), 9-13 (2000).</li><li>Allen, K., Cornforth, D., Whittier, D., Vasavada, M., Nummer, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+of+high+humidity+and+wet+marinade+methods+for+pasteurization+of+jerky.">Evaluation of high humidity and wet marinade methods for pasteurization of jerky.</a> J. Food Sci. 72 (7), (2007).</li><li>Levine, P., Rose, B., Green, S., Ransom, G., Hill, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pathogen+testing+of+ready-to-eat+meat+and+poultry+products+collected+at+federally+inspected+establishments+in+the+United+States,+1990+to+1999.">Pathogen testing of ready-to-eat meat and poultry products collected at federally inspected establishments in the United States, 1990 to 1999.</a> J. Food Prot. 64 (8), 1188-1193 (1990).</li><li>Keene, W. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+outbreak+of+Escherichia+coli+O157:H7+infections+traced+to+jerky+made+from+deer+meat.">An outbreak of Escherichia coli O157:H7 infections traced to jerky made from deer meat.</a> JAMA. 277 (15), 1229-1231 (1997).</li><li>Oliver, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+viable+but+nonculturable+state+in+bacteria.">The viable but nonculturable state in bacteria.</a> J. Microbiol. 43, 93-100 (2005).</li><li>Oliver, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Recent+findings+on+the+viable+but+nonculturable+state+in+pathogenic+bacteria.">Recent findings on the viable but nonculturable state in pathogenic bacteria.</a> FEMS Microbiol. Rev. 34 (4), 415-425 (2010).</li><li>Khamisse, E., Firmesse, O., Christieans, S., Chassaing, D., Carpentier, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Impact+of+cleaning+and+disinfection+on+the+non-culturable+and+culturable+bacterial+loads+of+food-contact+surfaces+at+a+beef+processing+plant.">Impact of cleaning and disinfection on the non-culturable and culturable bacterial loads of food-contact surfaces at a beef processing plant.</a> Int. J. Food Microbiol. 158 (2), 163-168 (2012).</li><li>Li, L., Mendis, N., Trigui, H., Oliver, J. D., Faucher, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+importance+of+the+viable+but+non-culturable+state+in+human+bacterial+pathogens.">The importance of the viable but non-culturable state in human bacterial pathogens.</a> Front. Microbiol. 5, 258 (2014).</li><li>Hern&#225;ndez, H., Claramount, D., Ku&#269;erov&#225;, I., Banout, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effects+of+modified+blanching+and+oregano+essential+oil+on+drying+kinetics+and+sensory+attributes+of+dried+meat.">The effects of modified blanching and oregano essential oil on drying kinetics and sensory attributes of dried meat.</a> J. Food Process. Preserv. , (2016).</li><li>Garc&#237;a-D&#237;ez, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Impact+of+Essential+Oils+on+Consumer+Acceptance+of+Chouri&#231;o+de+vinho+-+A+Dry-Cured+Sausage+Made+from+Wine-Marinated+Meat+-+Assessed+by+the+Hedonic+Scale,+JAR+Intensity+Scale+and+Consumers'+&amp;#34;Will+to+Consume+and+Purchase.&amp;#34.">The Impact of Essential Oils on Consumer Acceptance of Chouri&#231;o de vinho - A Dry-Cured Sausage Made from Wine-Marinated Meat - Assessed by the Hedonic Scale, JAR Intensity Scale and Consumers' &amp;#34;Will to Consume and Purchase.&amp;#34.</a> J. Food Process. Preserv. 41 (4), (2017).</li><li>Govaris, A., Solomakos, N., Pexara, A., Chatzopoulou, P. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+antimicrobial+effect+of+oregano+essential+oil,+nisin+and+their+combination+against+Salmonella+Enteritidis+in+minced+sheep+meat+during+refrigerated+storage.">The antimicrobial effect of oregano essential oil, nisin and their combination against Salmonella Enteritidis in minced sheep meat during refrigerated storage.</a> Int. J. Food Microbiol. 137 (2-3), 175-180 (2010).</li><li>Holley, R. A., Patel, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improvement+in+shelf-life+and+safety+of+perishable+foods+by+plant+essential+oils+and+smoke+antimicrobials.">Improvement in shelf-life and safety of perishable foods by plant essential oils and smoke antimicrobials.</a> Food Microbiol. 22 (4), 273-292 (2005).</li><li>Petrou, S., Tsiraki, M., Giatrakou, V., Savvaidis, I. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chitosan+dipping+or+oregano+oil+treatments,+singly+or+combined+on+modified+atmosphere+packaged+chicken+breast+meat.">Chitosan dipping or oregano oil treatments, singly or combined on modified atmosphere packaged chicken breast meat.</a> Int. J. Food Microbiol. 156 (3), 264-271 (2012).</li><li>Ballester-costa, C., Sendra, E., Viuda-martos, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessment+of+Antioxidant+and+Antibacterial+Properties+on+Meat+Homogenates+of+Essential+Oils+Obtained+from+Four+Thymus+Species+Achieved+from+Organic+Growth.">Assessment of Antioxidant and Antibacterial Properties on Meat Homogenates of Essential Oils Obtained from Four Thymus Species Achieved from Organic Growth.</a> Foods. 6 (8), 59 (2017).</li><li>Hern&#225;ndez, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effect+of+oregano+essential+oil+on+microbial+load+and+sensory+attributes+of+dried+meat.">The effect of oregano essential oil on microbial load and sensory attributes of dried meat.</a> J. Sci. Food Agric. 97 (1), 82-87 (2017).</li><li>Garc&#237;a-D&#237;ez, J., Alheiro, J., Falco, V., Fraqueza, M. J., Patarata, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemical+characterization+and+antimicrobial+properties+of+herbs+and+spices+essential+oils+against+pathogens+and+spoilage+bacteria+associated+to+dry-cured+meat+products.">Chemical characterization and antimicrobial properties of herbs and spices essential oils against pathogens and spoilage bacteria associated to dry-cured meat products.</a> J. Essent. Oil Res. 29 (2), 117-125 (2017).</li><li>Cavanagh, H. M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antifungal+Activity+of+the+Volatile+Phase+of+Essential+Oils:+A+Brief+Review.">Antifungal Activity of the Volatile Phase of Essential Oils: A Brief Review.</a> Nat. Prod. Commun. 2 (12), 1297-1302 (2007).</li><li>Tajkarimi, M. M., Ibrahim, S. A., Cliver, D. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antimicrobial+herb+and+spice+compounds+in+food.">Antimicrobial herb and spice compounds in food.</a> Food Control. 21 (9), 1199-1218 (2010).</li><li>Nedorostova, L., Kloucek, P., Kokoska, L., Stolcova, M., Pulkrabek, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antimicrobial+properties+of+selected+essential+oils+in+vapour+phase+against+foodborne+bacteria.">Antimicrobial properties of selected essential oils in vapour phase against foodborne bacteria.</a> Food Control. 20 (2), 157-160 (2009).</li><li>Burt, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Essential+oils:+Their+antibacterial+properties+and+potential+applications+in+foods+-+A+review.">Essential oils: Their antibacterial properties and potential applications in foods - A review.</a> Int. J. Food Microbiol. 94 (3), 223-253 (2004).</li><li>Ramanathan, L., Das, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Studies+on+the+control+of+lipid+oxidation+in+ground+fish+by+some+polyphenolic+natural+products.">Studies on the control of lipid oxidation in ground fish by some polyphenolic natural products.</a> J. Agric. Food Chem. 40 (1), 17-21 (1992).</li><li>Yamazaki, K., Yamamoto, T., Kawai, Y., Inoue, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Enhancement+of+antilisterial+activity+of+essential+oil+constituents+by+nisin+and+diglycerol+fatty+acid+ester.">Enhancement of antilisterial activity of essential oil constituents by nisin and diglycerol fatty acid ester.</a> Food Microbiol. 21 (3), 283-289 (2004).</li><li>Garc&#237;a-D&#237;ez, J., Alheiro, J., Falco, V., Fraqueza, M. J., Patarata, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synergistic+activity+of+essential+oils+from+herbs+and+spices+used+on+meat+products+against+food+borne+pathogens.">Synergistic activity of essential oils from herbs and spices used on meat products against food borne pathogens.</a> Nat. Prod. Commun. 12 (2), 281-286 (2017).</li><li>Hussein Hamdy Roby, M., Atef Sarhan, M., Abdel-Hamed Selim, K., Ibrahim Khalel, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+of+antioxidant+activity,+total+phenols+and+phenolic+compounds+in+thyme+(Thymus+vulgaris+L.),+sage+(Salvia+officinalis+L.),+and+marjoram+(Origanum+majorana+L.)+extracts.">Evaluation of antioxidant activity, total phenols and phenolic compounds in thyme (Thymus vulgaris L.), sage (Salvia officinalis L.), and marjoram (Origanum majorana L.) extracts.</a> Ind. Crops Prod. 43, 827-831 (2013).</li><li>Gouveia, A. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Antimicrobial+Effect+of+Essential+Oils+Against+Listeria+monocytogenes+in+Sous+vide+Cook-Chill+Beef+during+Storage.">The Antimicrobial Effect of Essential Oils Against Listeria monocytogenes in Sous vide Cook-Chill Beef during Storage.</a> J. Food Process. Preserv. 41 (4), (2017).</li><li>Chen, C., Nace, G., Irwin, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+6+x+6+drop+plate+method+for+simultaneous+colony+counting+and+MPN+enumeration+of+Campylobacter+jejuni,+Listeria+monocytogenes,+and+Escherichia+coli.">A 6 x 6 drop plate method for simultaneous colony counting and MPN enumeration of Campylobacter jejuni, Listeria monocytogenes, and Escherichia coli.</a> J. Microbiol. Methods. 55 (2), 475-479 (2003).</li><li>Herigstad, B., Hamilton, M., Heersink, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=How+to+optimize+the+drop+plate+method+for+enumerating+bacteria.">How to optimize the drop plate method for enumerating bacteria.</a> J. Microbiol. Methods. 44 (2), 121-129 (2001).</li><li>. Practical food microbiology Available from: <a target="_blank" href="https://drive.google.com/file/d/0BzyVOLllJ0B1YmlEemZ5M1RZekU/view?ts=590d8019">https://drive.google.com/file/d/0BzyVOLllJ0B1YmlEemZ5M1RZekU/view?ts=590d8019</a> (2003)</li><li>Smith-Palmer, A., Stewart, J., Fyfe, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antimicrobial+properties+of+plant+essential+oils+and+essences+against+five+important+food-borne+pathogens.">Antimicrobial properties of plant essential oils and essences against five important food-borne pathogens.</a> Lett. Appl. Microbiol. 26 (2), 118-122 (1998).</li><li>Burt, S. a., Reinders, R. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antibacterial+activity+of+selected+plant+essential+oils+against+Escherichia+coli+O157:H7.">Antibacterial activity of selected plant essential oils against Escherichia coli O157:H7.</a> Lett. Appl. Microbiol. 36 (3), 162-167 (2003).</li></ol>

המחברים אין לחשוף.

מחקרים קודמים הראו כי מיקרואורגניזמים גרימת מחלות במזון לשרוד הייבוש10. לכן, יש להחיל חומרים משמרים לפני ייבוש כדי להבטיח בטיחות המזון. במחקר זה, אנו מתמקדים באמצעות תיאו. הסיבה לכך היא כפולה: ראשית, ישנו ביקוש גבוה מן הצרכנים להשתמש במוצרים טבעיים תוספים חלופי כדי לשפר את איכו...

ייבוש כשיטה מסורתיים כדי לשמר את המזון כבר בשימוש מאז ימי קדם. כיום, יש עניין הולך וגובר ב ייבוש בתור שיטה יעילה עבור מזון שימור1,2,3. הוא משמש כדי ליצור מגוון של בשר מעובד במיוחד. אחת הידועה ביותר היא קופצניות.
קבנוס באחת השיטות העתיקות לשימור בשר, מבוסס על ריפוי וייבוש לפעילות מים נמוכה יותר ולכן כדי להאריך את חיי המדף שלה4. כיום, מיובש כמו בשר משומר נרפא עדיין פופולרית מאוד, איפה בטיחות המזון, טעם ומרקם חיוניים. הכנה קופצניות יכול לשמש עבור כמעט כל סוג של בשר, כולל בשר בקר, חזיר, עוף או משחק5, וזה דורש קיצוץ הבשר ברצועות רזה ולא מייבש אותו. בדרך כלל, שאציף את הבשר פתרון ריפוי או עישון משמשים יחד עם ייבוש לתת. את הבשר שלה טעם אופייני6.
למרות העניין העצום של ייבוש כדי באמת לשמר מזון, הסיכון של התפרצויות והקאה על ידי e. coli מן הבשר המיובש לקוי הוא קריטי וצריך להיות נשלט. ישנם מספר מחקרים דיווח והקאה התפרצויות להרעלתו במיוחד עם O157:H7 e. coli , לייחס חום לקוי עיבוד בזמן הבית-ייבוש. מקרים דומים התרחשו גם מסחרית מוכנה קופצניות7,8,9. לוין ואח. 10 הציע כי מיקרואורגניזמים והקאה יכולים לשרוד תנאים מתונים ייבוש (כ 60 ° C) בשימוש על ידי מפיקים מסחריים קופצניות. E. coli O157:H7 התפרצויות של מחלות במזון באמצע שנות ה-90 יוחסו6,מוצרי בשר טחון מיובש11. מעניין, בכל המקרים הקודמים, הסיכון העיקרי נגרם על ידי פתוגנים חיידקיים הוכרו קיימא אבל הלא-culturable (VBNC). תחת לחצים שונים כגון שינויי טמפרטורה או רעב, התאים e. coli יכול להיכנס למצב מסוים המכונה12,המדינה VBNC13. התאים VBNC ייתכן ואז להחיותו בחזרה לתאים culturable בחשיפה לאור התנאים המתאימים ולאחר מכן להציג איום לבריאות האדם בשל והקאה זיהום14,15. משמעות הדבר היא כי אם הבשר הוא נצרך מיד לאחר הייבוש המוצר זה בטוח. עם זאת, במקרה של אחסון לקוי, כגון לחות מוגברת, יש סיכון גבוה של שהפעלה של גורמי מחלה, גידול חיידקים.
מלבד ייבוש המרינדה ושיטות, יש ביקוש גבוה מן הצרכנים להשתמש במוצרים טבעיים כחלופה תוספים לשיפור מזון איכות16,17. יש כבר עניין מסוים ביישום של תוספי מזון טבעיים בשר במקום קלאסית סינתטי לחומרים משמרים18,19,20,21. למרות שיש חוסר ראיות מספיקות בשימוש של שמנים אתריים בעת ייבוש הבשר, בתחילת המחקר בתחום זה מדגים כבר תוצאות חיוביות22,23.
מאז ימי הביניים, אנשים יש מוכר שמן אתרי תרכובות (EOCs)25,שלהם24,chracteristics מיקרוביאלית, חרקים, antiparasitic26. היום, EOCs הם חלק אחד של הקבוצה החשובה ביותר של תרכובות ביו טבעי. בין EOCs שונים, תימול הוא אחד הידועה ביותר. הוא מורכב יותר מ-85% של תיאו23. פנול הזה מונע הידרדרות מיקרוביאלי וכימיים בעת הוספת מזון. בנוסף, שלה תכונות אנטיבקטריאליות עשוי להשתפר בשילוב עם שאר חומרים משמרים טבעיים2,27,28,29,30. כיום, טימין (קורנית דלקתית), תבלין השייך למשפחת השפתניים , הוכר סוכן חומרי טעם, כמו גם שימור של בשר מאוד יעיל31. מחקר מאת גארסיה-Díez et al. 30 על מוצרי בשר מצא כי TEO להציג דפוס עיכוב רחבה יותר נגד פתוגנים והקאה בהשוואה שמנים אתריים אחרים. לכן, יש הזדמנות להגדיל את הערך של בשר מיובש, להפחית את הסיכון של מחלות ממזון על-ידי החלת שמנים אתריים במהלך תהליך הייבוש.
פרוטוקול זה, אנו מציגים שיטה של החלת TEO במהלך בשר ייבוש, ובמיוחד באמצעות אותו בצורת אדים ישירות ב איזה ייבוש קאמרית. להערכה, אנו משתמשים את המיקרופון כדי לקבוע העדר של חיידקים פתוגניים הדגימות שטופלו לעומת אלה raw. תוצאות ראשוניות עולה כי שיטה זו היא חלופה יעילה סינתטי לחומרים משמרים, כי זה מפחית באופן משמעותי עומס מיקרוביאלי בשר מיובש.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Meat cutter</td>
			<td>Kalorik</td>
			<td>KP 3530</td>
			<td>from Miami Gardens, FL, USA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Laminar safety cabinet</td>
			<td>Faster s.r.l</td>
			<td></td>
			<td>from Italy</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Squeeze bottle of 500 mL</td>
			<td>Merci</td>
			<td>632 524 325 025</td>
			<td>from CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Standard laboratory drier UFE 400</td>
			<td>Memmert</td>
			<td>DE 66812464</td>
			<td>from Germany</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Incubator</td>
			<td>BT 120</td>
			<td>N/A</td>
			<td>from CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Refrigerator and Freezer</td>
			<td>Bosch</td>
			<td>KGN34VW20G</td>
			<td>from DE</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Densitometer</td>
			<td>Biosan</td>
			<td>220 000 050 122</td>
			<td>Latvia; supplier Merci, CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Escherichia coli ATCC 25922</td>
			<td>Oxoid</td>
			<td>CL7050</td>
			<td>from CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vortex</td>
			<td>Chromservis</td>
			<td>22008013</td>
			<td>from CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sterilized plastic tubes 15 mL</td>
			<td>Gama</td>
			<td>331 000 020 115</td>
			<td>from CZ, supplier Merci</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>20 mL injection vial</td>
			<td>Healthy vial</td>
			<td>hvft169</td>
			<td>from China</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>20 mm sterile butyl rubber stopper</td>
			<td>Merci</td>
			<td>22008013</td>
			<td>from CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>20 mm aluminum cap</td>
			<td>Healthy vial</td>
			<td>N/A</td>
			<td>from China</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thyme essential oil</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>W306509</td>
			<td>from St Louis, MO, USA</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Mueller Hinton Broth</td>
			<td>Oxoid</td>
			<td>CM0337</td>
			<td>from CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NaCl</td>
			<td>Penta</td>
			<td>16610-31000</td>
			<td>from CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Peptone</td>
			<td>Oxoid</td>
			<td>LP0034</td>
			<td>from CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phosphate-buffered saline</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>P4417</td>
			<td>from CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Polysorbate 80 (Tween 80)</td>
			<td>Roth</td>
			<td>T 13502</td>
			<td>from DE, supplier P-lab</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Shaker SHO-1D</td>
			<td>Verkon</td>
			<td>DH.WSR04020</td>
			<td>from CZ,&#160; 10 - 300 rpm. 350 x 350 mm with a platform for flasks</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethanol 70%</td>
			<td>Bioferm</td>
			<td>N/A</td>
			<td>from CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MacConkey Agar</td>
			<td>Oxoid</td>
			<td>CM007</td>
			<td>from CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Plate Count Agar</td>
			<td>Oxoid</td>
			<td>CM0325</td>
			<td>from CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Filter paper</td>
			<td>Merci</td>
			<td>480 622 080 040</td>
			<td>from CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Erlenmeyer flasks 250 mL</td>
			<td>Simax</td>
			<td>610 002 122 636</td>
			<td>from CZ; supplier Merci CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Multichannel pipette</td>
			<td>Socorex</td>
			<td>S852820</td>
			<td>from Switzerland; supplier P lab, CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microtiter plate</td>
			<td>Gamma</td>
			<td>V400916</td>
			<td>CZ</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microlitre pipette 100-1000 &#956;L</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>333 120 000 062</td>
			<td>from Germany; supplier Merci, CZ</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

the effect of the application of thyme essential oil on microbial load during meat drying

בשר זה ארוחה חלבון המשמש בהכנת בשר משומר, חטיף מזון פופולרי, איפה שימור והבטיחות חשובים. כדי להבטיח בטיחות המזון וכדי להאריך את חיי המדף של בשר ומוצרי בשר, השימוש של חומרים משמרים טבעיים או סינתטיים הוחלו על שליטה ולמחוק חיידקים והקאה. עניין הולך וגובר ביישום של תוספי מזון טבעיים לבשר גדל. מיקרואורגניזמים, כגון Escherichia coli, לזהם בשר ומוצרי בשר, גרימת מחלות והקאה. לכן, זה הכרחי כדי לשפר את תהליך שימור בשר. עם זאת, השימוש בשמנים אתריים כאשר הבשר היא מיובשת לא עמוקות נחקרה. בהקשר זה, יש הזדמנות להגדיל את הערך של בשר מיובש, להפחית את הסיכון של מחלות ממזון על-ידי החלת שמנים אתריים במהלך תהליך הייבוש. פרוטוקול זה, אנו מציגים שיטה של החלת שמן קורנית חיוני (TEO) במהלך בשר ייבוש, במיוחד בצורת אדים ישירות בחדר הייבוש. להערכה, אנו משתמשים ריכוז מעכבות מינימלי (MIC) כדי לזהות את המספר של חיידקים מזיקים הדגימות שטופלו לעומת דגימות raw. תוצאות ראשוניות עולה כי שיטה זו היא אפשרות מעשית ואלטרנטיבית סינתטי לחומרים משמרים, כי זה מפחית באופן משמעותי עומס מיקרוביאלי בשר מיובש.

ראשון קודם לכן פיתחנו שיטה זו באמצעות שמן אתרי אורגנו (OEO) כדי לשפר את בטיחות המזון ולהגדיל את הערך של בשר מיובש. באופן כללי, ניסויים הקודם הראו כי החיידק נכנס לתוך המדינה VBNC במהלך הייבוש כאסטרטגיה הישרדות. זה מומחש את העובדה שהיו אין בקטריות culturable לאחר הייבוש סיום<sup cl...

Watch this Scientific Journal Video about The Effect of the Application of Thyme Essential Oil on Microbial Load During Meat Drying at JoVE.com

The Effect of the Application of Thyme Essential Oil on Microbial Load During Meat Drying

השפעת היישום של שמן קורנית חיוני על עומס מיקרוביאלי במהלך הייבוש בשר

מיקרואורגניזמים כגון Escherichia coli אשר לזהם את מוצרי בשר לגרום מחלות והקאה. השימוש בשמנים אתריים בתהליך ייבוש בשר לא נחקרה לעומק. כאן, אנו מציגים שיטה של החלת שמן קורנית חיוני לבשר במהלך הייבוש כדי להפחית את עומס מיקרוביאלי בשר מיובש.

Meat is a high protein meal that is used in the preparation of jerky, a popular food snack, where preservation and safety are important. To assure food ...

the-effect-application-thyme-essential-oil-on-microbial-load-during

Research

JoVE Journal

Environment

9.2K Views.  Czech University of Life Sciences Prague. מיקרואורגניזמים כגון Escherichia coli אשר לזהם את מוצרי בשר לגרום מחלות והקאה. השימוש בשמנים אתריים בתהליך ייבוש בשר לא נחקרה לעומק. כאן, אנו מציגים שיטה של החלת שמן קורנית חיוני לבשר במהלך הייבוש כדי להפחית את עומס מיקרוביאלי בשר מיובש.

Video: The Effect of the Application of Thyme Essential Oil on Microbial Load During Meat Drying

Determination of Microbial Extracellular Enzyme Activity in Waters, Soils, and Sediments using High Throughput Microplate Assays

Much of the nutrient cycling and carbon processing in natural environments occurs through the activity of extracellular enzymes released by microorganisms. Thus, measurement of the activity of these extracellular enzymes can give insights into the rates of ecosystem level processes, such as organic matter decomposition or nitrogen and phosphorus mineralization. Assays of extracellular enzyme activity in environmental samples typically involve exposing the samples to artificial colorimetric or fluorometric substrates and tracking the rate of substrate hydrolysis. Here we describe microplate based methods for these procedures that allow the analysis of large numbers of samples within a short time frame. Samples are allowed to react with artificial substrates within 96-well microplates or deep well microplate blocks, and enzyme activity is subsequently determined by absorption or fluorescence of the resulting end product using a typical microplate reader or fluorometer. Such high throughput procedures not only facilitate comparisons between spatially separate sites or ecosystems, but also substantially reduce the cost of such assays by reducing overall reagent volumes needed per sample.

Microplate based procedures are described for the colorimetric or fluorometric analysis of extracellular enzyme activity. These procedures allow for the rapid assay of such activity in large numbers of environmental samples within a manageable time frame.

קביעת מיקרוביאלית התאית אנזים הפעילות במים, קרקעות, ומשקעים באמצעות מבחני Microplate תפוקה גבוהה

Much of the nutrient cycling and carbon  processing in natural environments occurs through the activity of extracellular  enzymes released by ...

Methods for Facilitating Microbial Growth on Pulp Mill Waste Streams and Characterization of the Biodegradation Potential of Cultured Microbes

The kraft process is applied to wood chips for separation of lignin from the polysaccharides within lignocellulose for pulp that will produce a high quality paper. Black liquor is a pulping waste generated by the kraft process that has potential for downstream bioconversion. However, the recalcitrant nature of the lignocellulose resources, its chemical derivatives that constitute the majority of available organic carbon within black liquor, and its basic pH present challenges to microbial biodegradation of this waste material. Methods for the collection and modification of black liquor for microbial growth are aimed at utilization of this pulp waste to convert the lignin, organic acids, and polysaccharide degradation byproducts into valuable chemicals. The lignocellulose extraction techniques presented provide a reproducible method for preparation of lignocellulose growth substrates for understanding metabolic capacities of cultured microorganisms. Use of gas chromatography-mass spectrometry enables the identification and quantification of the fermentation products resulting from the growth of microorganisms on pulping waste. These methods when used together can facilitate the determination of the metabolic activity of microorganisms with potential to produce fermentation products that would provide greater value to the pulping system and reduce effluent waste, thereby increasing potential paper milling profits and offering additional uses for black liquor.

Industrial wastes can be collected and modified to analyze microbial growth. Lignocellulose extraction techniques provide components to analyze specific biodegradation ability. Gas chromatography-mass spectrometry identifies fermentation products of microorganisms grown on pulping waste. These methods determine the metabolic capacity of microorganisms to degrade pulping waste.

The kraft process is applied to wood chips for separation of lignin from the polysaccharides within lignocellulose for pulp that will produce a high ...

Application of Two-spotted Spider Mite Tetranychus urticae for Plant-pest Interaction Studies

The two-spotted spider mite, Tetranychus urticae, is a ubiquitous polyphagous arthropod herbivore that feeds on a remarkably broad array of species, with more than 150 of economic value. It is a major pest of greenhouse crops, especially in Solanaceae and Cucurbitaceae (e.g., tomatoes, eggplants, peppers, cucumbers, zucchini) and greenhouse ornamentals (e.g., roses, chrysanthemum, carnations), annual field crops (such as maize, cotton, soybean, and sugar beet), and in perennial cultures (alfalfa, strawberries, grapes, citruses, and plums)1,2. In addition to the extreme polyphagy that makes it an important agricultural pest, T. urticae has a tendency to develop resistance to a wide array of insecticides and acaricides that are used for its control3-7.
T. urticae is an excellent experimental organism, as it has a rapid life cycle (7 days at 27 &#176;C) and can be easily maintained at high density in the laboratory. Methods to assay gene expression (including in situ hybridization and antibody staining) and to inactivate expression of spider mite endogenous genes using RNA interference have been developed8-10. Recently, the whole genome sequence of T. urticae has been reported, creating an opportunity to develop this pest herbivore as a model organism with equivalent genomic resources that already exist in some of its host plants (Arabidopsis thaliana and the&#160;tomato Solanum lycopersicum)11. Together, these&#160;model organisms could provide insights into molecular bases of plant-pest interactions.
Here, an efficient method for quick and easy collection of a large number of adult female mites, their application on an experimental plant host, and the assessment of the plant damage due to spider mite feeding are described. The presented protocol enables fast and efficient collection of hundreds of individuals at any developmental stage (eggs, larvae, nymphs, adult males, and females) that can be used for subsequent experimental application.

Application of Two-spotted Spider Mite Tetranychus urticae for Plant-pest Interaction Studies

Protocols for efficient preparation of homogenous samples of spider mites, infestation of experimental plants, and assessment of plant damage, as required for studies of plant-pest interaction were developed.

יישום של קרדית העכביש הבחין-Two<em&gt; Tetranychus urticae</em&gt; לאינטראקצית צמח-מזיקים ללימודים

The two-spotted spider mite, Tetranychus urticae, is a ubiquitous polyphagous arthropod herbivore that feeds on a remarkably broad array of species, with ...

A New Application of the Electrical Penetration Graph (EPG) for Acquiring and Measuring Electrical Signals in Phloem Sieve Elements

Electrophysiological properties of cells are often studied in vitro, after dissociating them from their native environments. However, the study of electrical transmission between distant cells in an organism requires in vivo, artifact-free recordings of cells embedded within their native environment. The transmission of electrical signals from wounded to unwounded areas in a plant has since long piqued the interest of botanists. The phloem, the living part of the plant vasculature that is spread throughout the plant, has been postulated as a major tissue in electrical transmission in plants. The lack of suitable electrophysiological methods poses many challenges for the study of the electrical properties of the phloem cells in vivo. Here we present a novel approach for intracellular electrophysiology of sieve elements (SEs) that uses living aphids, or other phloem-feeding hemipteran insects, integrated in the electrical penetration graph (EPG) circuit. The versatility, robustness, and accuracy of this method made it possible to record and study in detail the wound-induced electrical signals in SEs of central veins of the model plant Arabidopsis thaliana1. Here we show that EPG-electrodes can be easily implemented for intracellular electrophysiological recordings of SEs in marginal veins, as well as to study the capacity of SEs to respond with electrical signals to several external stimuli. The EPG approach applied to intracellular electrophysiology of SEs can be implemented to a wide variety of plant species, in a large number of plant/insect combinations, and for many research aims.

A New Application of the Electrical Penetration Graph EPG for Acquiring and Measuring Electrical Signals in Phloem Sieve Elements

Electrical Penetration Graph (EPG) is a well-established technique for studying the feeding behavior of stylet-bearing insects. Here we show a new application of EPG as a non-invasive tool for the acquisition of intracellular electrophysiology recordings of sieve elements (SEs), the cells that form the phloem vasculature in plants.

יישום חדש של החשמל חדירה הגרף (EPG) לרכישה ומדידת אותות חשמליים שביפים מסננת אלמנטים

Electrophysiological properties of cells are often studied in vitro, after dissociating them from their native environments. However, the study of ...

Measurement of H2S in Crude Oil and Crude Oil Headspace Using Multidimensional Gas Chromatography, Deans Switching and Sulfur-selective Detection

A method for the analysis of dissolved hydrogen sulfide in crude oil samples is demonstrated using gas chromatography. In order to effectively eliminate interferences, a two dimensional column configuration is used, with a Deans switch employed to transfer hydrogen sulfide from the first to the second column (heart-cutting). Liquid crude samples are first separated on a dimethylpolysiloxane column, and light gases are heart-cut and further separated on a bonded porous layer open tubular (PLOT) column that is able to separate hydrogen sulfide from other light sulfur species. Hydrogen sulfide is then detected with a sulfur chemiluminescence detector, adding an additional layer of selectivity. Following separation and detection of hydrogen sulfide, the system is backflushed to remove the high-boiling hydrocarbons present in the crude samples and to preserve chromatographic integrity. Dissolved hydrogen sulfide has been quantified in liquid samples from 1.1 to 500 ppm, demonstrating wide applicability to a range of samples. The method has also been successfully applied for the analysis of gas samples from crude oil headspace and process gas bags, with measurement from 0.7 to 9,700 ppm hydrogen sulfide.

Measurement of H2S in Crude Oil and Crude Oil Headspace Using Multidimensional Gas Chromatography, Deans Switching and Sulfur-selective Detection

A multidimensional gas chromatography method for the analysis of dissolved hydrogen sulfide in liquid crude oil samples is presented. A Deans switch is used to heart-cut light sulfur gases for separation on a secondary column and detection on a sulfur chemiluminescence detector.

מדידה של H<sub&gt; 2</sub&gt; S בנפט גולמי ונפט הגולמי Headspace שימוש רב מימדי גז כרומטוגרפיה, דיקני מיתוג ואיתור גופרית סלקטיבי

A method for the analysis of dissolved hydrogen sulfide in crude oil samples is demonstrated using gas chromatography. In order to effectively eliminate ...

Evaluating the Effect of Environmental Chemicals on Honey Bee Development from the Individual to Colony Level

The presence of pesticides in the beekeeping environment is one of the most serious problems that impacts the life of a honey bee. Pesticides can be brought back to the beehive after the bees have foraged on flowers that have been sprayed with pesticides. Pesticide contaminated food can be exchanged between workers which then feed larvae and therefore can potentially affect the development of honey bees. Thus, residual pesticides in the environment can become a chronic damaging factor to honey bee populations and gradually lead to colony collapse. In the presented protocol, honey bee feeding methods are described and applied to either an individual honey bee or to a colony. Here, the insect growth regulator (IGR) pyriproxyfen (PPN), which is widely used to control pest insects and is harmful to the development of honey bee larvae and pupae, is used as the pesticide. The presenting procedure can be applied to other potentially harmful chemicals or honeybee pathogens for further studies.

Herein we present a method to feed pesticide contaminated food to both an individual honey bee and a beehive colony. The procedure evaluates the pesticide effect on individual honey bees by in vivo feeding of basic larval diet and also on the natural condition of beehive colony.

הערכת ההשפעה של כימיקלים סביבתיים על התפתחות דבורת דבש מן הפרט אל רמת קולוני

The presence of pesticides in the beekeeping environment is one of the most serious problems that impacts the life of a honey bee. Pesticides can be ...

Measurement of the Rheology of Crude Oil in Equilibrium with CO2 at Reservoir Conditions

A rheometer system to measure the rheology of crude oil in equilibrium with carbon dioxide (CO2) at high temperatures and pressures is described. The system comprises a high-pressure rheometer which is connected to a circulation loop. The rheometer has a rotational flow-through measurement cell with two alternative geometries: coaxial cylinder and double gap. The circulation loop contains a mixer, to bring the crude oil sample into equilibrium with CO2, and a gear pump that transports the mixture from the mixer to the rheometer and recycles it back to the mixer. The CO2 and crude oil are brought to equilibrium by stirring and circulation and the rheology of the saturated mixture is measured by the rheometer. The system is used to measure the rheological properties of Zuata crude oil (and its toluene dilution) in equilibrium with CO2 at elevated pressures up to 220 bar and a temperature of 50 &#176;C. The results show that CO2 addition changes the oil rheology significantly, initially reducing the viscosity as the CO2 pressure is increased and then increasing the viscosity above a threshold pressure. The non-Newtonian response of the crude is also seen to change with the addition of CO2.

Measurement of the Rheology of Crude Oil in Equilibrium with CO2 at Reservoir Conditions

A method for measuring the rheology of crude oil in equilibrium with carbon dioxide at reservoir conditions is presented.

מדידה של ראולוגיה של נפט גולמי שיווי משקל עם CO<sub&gt; 2</sub&gt; בתנאים מאגר

A rheometer system to measure the rheology of crude oil in equilibrium with carbon dioxide (CO2) at high temperatures and pressures is described. The ...

Lab-Scale Model to Evaluate Odor and Gas Concentrations Emitted by Deep Bedded Pack Manure

A lab-scaled simulated bedded pack model was developed to study air quality and nutrient composition of deep-bedded packs used in cattle mono-slope facilities. This protocol has been used to effectively evaluate many different bedding materials, environmental variables (temperature, humidity), and potential mitigation treatments that can improve air quality in commercial deep-bedded mono-slope facilities. The model is dynamic and allows researchers to easily collect many chemical and physical measurements from the bedded pack. Weekly measurements, collected over the course of six to seven weeks, allows sufficient time to see changes in air quality measurements over time as the bedded pack matures. The data collected from the simulated bedded packs is within the range of concentrations previously measured in commercial deep-bedded mono-slope facilities. Past studies have demonstrated that 8 - 10 experimental units per treatment are sufficient to detect statistical differences among the simulated bedded packs. The bedded packs are easy to maintain, requiring less than 10 minutes of labor per bedded packs per week to add urine, feces, and bedding. Sample collection using the gas sampling system requires 20 - 30 minutes per bedded pack, depending on the measurements that are being collected. The use of lab-scaled bedded packs allows the researcher to control variables such as temperature, humidity, and bedding source that are difficult or impossible to control in a research or commercial facility. While not a perfect simulation of &#34;real-world&#34; conditions, the simulated bedded packs serve as a good model for researchers to use to examine treatment differences among bedded packs. Several lab-scale studies can be conducted to eliminate possible treatments before trying them in a research or commercial-sized facility.

A protocol has been developed to measure gases, odors, and nutrient composition in lab-scaled bedded manure packs, which can be used to study ways to improve air quality in commercial cattle facilities using deep-bedded manure packs.

המעבדה-מודל להערכת ריח וריכוזי גזים הנפלטת עמוק עם מיטות Pack זבל

A lab-scaled simulated bedded pack model was developed to study air quality and nutrient composition of deep-bedded packs used in cattle mono-slope ...

The Plant Infection Test: Spray and Wound-Mediated Inoculation with the Plant Pathogen Magnaporthe Grisea

Plants possess a powerful system to defend themselves against potential threats by pathogenic fungi. For agriculturally important plants, however, current measures to combat such pathogens have proved too conservative and, thus, not sufficiently effective, and they can potentially pose environmental risks. Therefore, it is extremely necessary to identify host-resistance factors to assist in controlling plant diseases naturally through the identification of resistant germplasm, the isolation and characterization of resistance genes, and the molecular breeding of resistant cultivars. In this regard, there is need to establish an accurate, rapid, and large-scale inoculation method to breed and develop plant resistance genes. The rice blast fungal pathogen Magnaporthe grisea causes severe disease symptoms and yield losses. Recently, M. grisea has emerged as a model organism for studying the mechanisms of plant-fungal pathogen interactions. Hence, we report the development of a plant virulence test method that is specific for M. grisea. This method provides for both spray inoculation with a conidial suspension and wounding inoculation with mycelium cubes or droplets of conidial suspension. The key step of the wounding inoculation method for detached rice leaves is to make wounds on plant leaves, which avoids any interference caused by host penetration resistance. This spray/wounding protocol contributes to the rapid, accurate, and large-scale screening of the pathotypes of M. grisea isolates. This integrated and systematic plant infection method will serve as an excellent starting point for gaining a broad perspective of issues in plant pathology.

The Plant Infection Test: Spray and Wound-Mediated Inoculation with the Plant Pathogen Magnaporthe Grisea

Here, we present a protocol to test plant virulence with the plant pathogen Magnaporthe grisea. This report will contribute to the large-scale screening of the pathotypes of fungi isolates and serve as an excellent starting point for understanding the resistant mechanisms of plants during molecular breeding.

הבדיקה זיהום צמח: ריסוס, בתיווך הפצע חיסון עם הפתוגן של צמח Magnaporthe Grisea

Plants possess a powerful system to defend themselves against potential threats by pathogenic fungi. For agriculturally important plants, however, current ...

Experimental Study of the Relationship Between Particle Size and Methane Sorption Capacity in Shale

The amount of adsorbed shale gas is a key parameter used in shale gas resource evaluation and target area selection, and it is also an important standard for evaluating the mining value of shale gas. Currently, studies on the correlation between particle size and methane adsorption are controversial. In this study, an isothermal adsorption apparatus, the gravimetric sorption analyzer, is used to test the adsorption capacity of different particle sizes in shale to determine the relationship between the particle size and the adsorption capacity of shale. Thegravimetric method requires fewer parameters and produces better results in terms of accuracy and consistency than methods like the volumetric method. Gravimetric measurements are performed in four steps: a blank measurement, preprocessing, a buoyancy measurement, and adsorption and desorption measurements. Gravimetric measurement is presently considered to be a more scientific and accurate method of measuring the amount of adsorption; however, it is time-consuming and requires a strict measuring technique. A Magnetic Suspension Balance (MSB) is the key to verify the accuracy and consistency of this method. Our results show that adsorption capacity and particle size are correlated, but not a linear correlation, and the adsorptions in particles sieved into 40 - 60 and 60 - 80 meshes tend to be larger. We propose that the maximum adsorption corresponding to the particle size is approximately 250 &#181;m (60 mesh) in the shale gas fracturing.

We use an isothermal adsorption apparatus, the gravimetric sorption analyzer, to test the adsorption capacity of different particle sizes of shale, in order to find out the relationship between particle size and the adsorption capacity of shale.

ניסויי חקר הקשר בין גודל החלקיקים מתאן וספיחה מתוקף פצלי

The amount of adsorbed shale gas is a key parameter used in shale gas resource evaluation and target area selection, and it is also an important standard ...