כרומטוגרפיית גז - ספקטרומטריית מסות מבוססת מטבולומיקה ממוקדת של דגימות אלמוגים קשים

כמו בכל אורגניזם, אלמוגים תלויים בתזונה מעולה כדי לגדול ולבנות שוניות לחסינות ולרבייה ולעמוד בתנאי סביבה משתנים. אולם אנו יודעים מעט מאוד על תזונה אופטימלית לאלמוגים בתנאים רגילים או משתנים, וכיצד כל חבר בהולוביונט האלמוגים תורם למצב התזונתי הזה. אלמוגים הם הולוביונטים המורכבים מהפונדקאי וממיקרואורגניזמים סימביוטיים שונים.

אלה כוללים Symbiodiniaceae, פרוטיסטים, חיידקים, וירוסים ופטריות. הכושר של ההולוביונט תלוי באינטראקציות המטבוליות בין חברים אלה. לדוגמה, Symbiodiniaceae מספקים פוטוסינתאט כדי לתמוך בחילוף החומרים של הפונדקאי ולעזור לו להסתגל לתנאים משתנים.

כדי להבין את השותפות החיונית הזו, עלינו ללמוד את ההרכב הכימי והמטבולי של כל שותף בנפרד. ממצאים אלה הראו כי ניתן לקבל מידע נוסף על ידי הפרדת שברים מארחים וסימביונטים לצורך ניתוח מטבולי. עם זאת, ההחלטה לנתח שברים נפרדים לעומת ההולוביונט נשלטת בסופו של דבר על ידי שאלת המחקר.

לכן, במקרים בהם ניתוח ההולוביונט עדיף, סיפקנו מתודולוגיה למיצוי מטבוליטים של הולוביונט, והצעות לקבלת מידע רב ככל האפשר במהלך הניתוח. השיטות בהן נעשה שימוש במחקר זה פותחות אפיקי מחקר חדשים. אלה כוללים חשיפת סמנים ביולוגיים פוטנציאליים, זיהוי מטבוליטים מרכזיים במהלך שלבי חיים ספציפיים או תנאי עקה, הבנת היתרונות של שיוך עם מינים מסוימים, וחקירת אינטראקציות בתוך ההולוביונט.

מחקר עתידי יתמקד ביישום הפרוטוקולים שנקבעו כאן למספר תחומי מחקר, כולל איתור סמנים ביולוגיים עם יישומים בשימור ושיקום שוניות אלמוגים. מתודולוגיה זו יכולה להיות מיושמת גם כאשר הפרדת שברים אינה אפשרית עבור מדדים פיזיולוגיים אחרים. לדוגמה, בעת ניתוח פליטות מטבוליטים נדיפים ממושבות אלמוגים.