חקרנו את האינטראקציה בין חיידקים למארח, והגורם הפנימי והחיצוני שלנו שינה את הקשר הזה כדי לשנות את הבריאות. באופן ספציפי, אנו מעוניינים להבין את תפקידם של חיידקים בהתפתחות, התקדמות וטיפולים בסרטן. אנו ומעבדות מיקרוביום אחרות משתמשות במערכת כלובים חיובית ISO כדי להעביר קהילה צואתית מנבדק אנושי למארח עכברי מקבל כדי ליצור קהילה מיקרוביאלית יציבה וארוכת טווח.
טכנולוגיה זו אפשרה לנו לייצר תגלית חדשה על תפקידם של חיידקים קליניים רלוונטיים בבריאות ובחולי. ניסויים קליניים פרוספקטיביים רבים מצאו קשרים בין חיידקים ספציפיים להתפתחות סרטן, התקדמות ותגובה לטיפול, אך מתאם אינו מרמז על סיבתיות. האנשה של עכברים נטולי חיידקים עם דגימות צואה אנושיות מאפשרת לאמת קשר סיבתי במודלים רלוונטיים של סרטן.
באמצעות מערכת הכלוב החיובי ISO, הראינו כי זנים ספציפיים של בקטרואידים ממגיבים לאימונותרפיה אנושית, חולי סרטן ריאות של תאים לא קטנים מעניקים תגובה לעכברים הנושאים גידולי ריאה אורתוטופיים. כדי להתחיל, הכניסו 10 מגבונים למיכל הטבילה הסטרילנטי של כלור דו חמצני וודאו שהם סבונים במלואם. לאחר מכן, בעזרת גליל מדורג, מלאו שקית ניילון גדולה בלפחות 100 מיליליטר של מעקר כלור דו חמצני.
יש לנער את השקית כדי לוודא שכל המשטחים הפנימיים ספוגים ולהניח אותה בצד. הסר כלוב ISO יחיד מהמתלה והנח אותו במיכל הטבילה המעקר כלור דו חמצני, תוך הבטחת מגע מלא עם נוזלים. השתמש במגבונים ספוגים כדי לקרצף את כל משטחי הכלוב.
לאחר השריית הכלוב, בקש מעוזר לפתוח את שקית הניילון הספוגה. הנח את הכלוב בפנים וסגור מיד את הפתח. בעזרת בקבוק ריסוס יש לרסס את פתח השקית בחומר מעקר כלור דו חמצני.
לאחר שכל הכלובים והאספקה ארוזים, טבלו כפפות עמידות לכימיקלים בחומר מעקר כלור דו חמצני. בינתיים, העבירו את המגבונים הספוגים לארון הבטיחות הביולוגית והשרו את כל המשטחים. עבור משטחים לא מוגנים, סחטו עליהם את המגבונים מבלי לגעת בהם.
לאחר 20 דקות, באמצעות כפפות מעוקרות עמידות לכימיקלים, העבירו כל כלוב ובקבוק לארון הבטיחות הביולוגית המעוקר. כדי לפתוח את כלוב ה-ISO האטום הרמטית, הרם את הלשוניות הלבנות בשני המהדקים בצידי המכסה ומשוך החוצה כל מהדק הצידה כדי לפתוח את המכסה. בעזרת המלקחיים הסטריליים בתוך הכלוב על גבי מתלה החוט, הסר את בקבוק המים הריק והנח אותו בחלק הפנימי של המכסה.
הסר את אטם הגומי ושפך מים לבקבוק כדי למלא אותו. בעזרת מלקחיים סטריליים, הנח את הזרבובית על בקבוק המים ולחץ כלפי מטה בחוזקה כדי לאטום. לאחר מכן, בעזרת מלקחיים סטריליים, הרם את מתלה החוט והחלק אותו לאחור כמה סנטימטרים כדי ליצור פתח לתחתית הכלוב.
הנח את המלקחיים הסטריליים על מתלה החוט, וודא שהידיות לא יבואו במגע עם משטחי הכלוב. עם קבלת דיסק ההעברה, בקש מהעוזר להחזיק ולפרוק חלקית את מכסה הפלסטיק כך שהמשטח הספוג ייחשף אך לא ייגע בו. לבישת כפפות עמידות לכימיקלים ספוגות בסטרילנט כלור דו חמצני, הסר את דיסק ההעברה מעטיפת הפלסטיק והנח אותו על משטח ישר בתוך ארון הבטיחות הביולוגית המעוקר.
כדי לפתוח את דיסק ההעברה, קלף את הסרט האוטם את היקף הדיסק ולאחר מכן הסר את המכסה. לאחר מכן, בעזרת המלקחיים הסטריליים שהונחו קודם לכן על מתלה החוט, תפעל את מכסה התא כדי ליישר את הפתח עם העכבר שיש להעביר. באמצעות מלקחיים סטריליים, אחוז בבסיס זנב העכבר דרך הפתח במכסה דיסק ההעברה, הרם והעביר את העכבר לכלוב ISO דרך הפתח שבין מתלה החוט לכלוב.
לאחר העברת כל העכברים, החלף את מתלה החוט במלקחיים הסטריליים. הרם את מכסה הכלוב והנח אותו בחזרה על גבי הכלוב. הרם כל מהדק של מכסה הכלוב כלפי מעלה והורד אותו בזהירות מעל דפנות הכלוב.
דחוף כלפי מטה את הלשוניות הלבנות כדי לאטום היטב את מכסה הכלוב. כעת, בקש מהעוזר לרסס כל זרבובית של אתר העגינה על מתלה הכלוב בחומר חיטוי כלור דו חמצני. הסר את הכלוב מארון הבטיחות הביולוגית ועגן אותו על מתלה הכלוב.
שחר חלוק כירורגי סטרילי חדש וכפפות כירורגיות סטריליות במקום הכפפות העמידות לכימיקלים. כדי להכין את מחטי הגוואג', פרקו כל שקית עיקור והשתמשו בחלק הפנימי של השקית כמשטח מנוחה סטרילי יבש. חבר את מחט הגוואג' למזרק.
פתח את צינור התרחיץ הצואתי ומשוך 200 מיקרוליטר של התרחיץ לכל מזרק. בעזרת מלקחיים, אחוז בבסיס זנב העכבר והנח אותו על מתלה החוט. רסנו בעדינות את העכבר על ידי שפשוף העור הרפוי מאחורי הצוואר.
תוך כדי החזקת העכבר במצב אנכי זקוף, הכנס את מחט הגאווג' והזריק בעדינות את תרחיץ הצואה. הסר מיד את המחט לאחר ההזרקה. הנח את העכבר ישירות לתוך אחת הכוסות המעוקרות להשגחה.
לאחר שכל העכברים קיבלו את הגוואג', השתמשו במלקחיים כדי להחזיר כל עכבר למיטת הכלוב. מבנה קהילת הצואה של העכברים המואנשים היה שונה באופן משמעותי בין פנוטיפים של תגובה בכל שלוש נקודות הזמן. עכברי הצואה המגיבים לא הראו הבדל במבנה הקהילה המיקרוביאלית בין שבוע ראשון לשבוע שני, ושבוע שני ושבוע רביעי.
בעוד שצואה שלא מגיבה, עכברים שהתיישבו הראו מבנה קהילתי מיקרוביאלי שונה בין השבוע הראשון לשבוע השני, אך מבנה דומה בין השבוע השני לשבוע הרביעי. החיסונים מתורמים אנושיים הראו ייצוג מוגבר של Blautia, Eubacterium, ruminococcus ו-Streptococcus, בעוד שבעכברים המקבלים היה שפע יחסי מוגבר של בקטרואידים, Lachnoclostridium, Marvinbryantia ו-Parabecteroides.
