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Analisi di singola cellula viene effettuata mediante spettrometria di massa su cellule animali e vegetali a pressione atmosferica, utilizzando una fibra ottica affilato per assaggiare le cellule per la ionizzazione elettrospray ablazione laser (LAESI) spettrometria di massa.
Analisi di sostanze biochimiche in singole cellule è importante per comprendere il metabolismo cellulare, ciclo cellulare, l'adattamento, stati di malattia, ecc Anche i tipi di cellule stessa mostra eterogenea composizione biochimica a seconda delle loro condizioni fisiologiche e le interazioni con l'ambiente. Metodi convenzionali di spettrometria di massa (MS) per l'analisi di biomolecole in singole cellule contare su di preparazione del campione esteso. Rimuovere le cellule dal loro ambiente naturale e trattamento del campione ampio potrebbe portare a cambiamenti nella composizione cellulare. Metodi di ionizzazione ambiente consentire l'analisi di campioni nel loro ambiente nativo e senza preparazione del campione esteso. 1 Le tecniche basate sul medio infrarosso (mid-IR) ablazione laser di materiali biologici a 2,94 micron di lunghezza d'onda utilizzano l'eccitazione improvvisa di acqua che si traduce in fase di esplosione. 2 tecniche di ionizzazione ambientale sulla base di mid-IR radiazione laser, come la ionizzazione elettrospray ablazione laser (LAESI) e pressione atmosferica infrarossi matrix-assisted laser ionizzazione desorbimento (IR AP-MALDI), hanno dimostrato con successo la capacità di analizzare direttamente acqua tessuti ricchi e biofluidi a pressione atmosferica. 3-11 LAESI Nella metà degli IR pennacchio ablazione laser che consiste principalmente di particelle neutre sotto il campione si fonde con le goccioline elettrospray alta carica per la produzione di ioni. Recentemente, a metà IR ablazione di singole cellule è stata effettuata con la consegna dei mid-IR radiazione attraverso una fibra inciso. Il pennacchio generato da questo ablazione è stata postionized da un elettrospray consentendo l'analisi dei metaboliti diversi in singole cellule da LAESI-MS. 12 L'articolo descrive il protocollo dettagliato per l'analisi singola cella utilizzando LAESI-MS. Il video presentato mostra l'analisi di una singola cellula epidermica dalla pelle di una lampadina Allium cepa. Lo schema del sistema è mostrata in Figura 1. Un esempio rappresentativo di ablazione singola cellula e spettro di massa LAESI dalla cella sono forniti in Figura 2.
1. I componenti ottici
2. Elettrospray installazione
3. Esempio di Manipolazione
4. Sistema di visualizzazione
5. Acquisizione di spettri di massa
6. Rappresentante Risultati
Ablazione riuscita di un risultato singola cella nel scoppio della parete cellulare e la raccolta di uno spettro di massa LAESI. Un esperimento fallito risultati generalmente in nessun ablazione e / o non spettro di massa. A scopo dimostrativo, presentiamo i risultati del LAESI-MS analisi di una singola cellula epidermica incorporato di una A. CEPA lampadina. Figura 2a mostra un'immagine rappresentativa di microscopia ottica, dopo il prelievo di una cellula. La parete cellulare è forata e l'estensione della perforazione è limitata dai confini con le cellule vicine. Le celle adiacenti sembra essere intatto. Figura 2b mostra un rappresentante spettro di massa LAESI prodotta dalla cella. Una grande varietà di ioni vengono rilevati dalla A. cepa delle cellule e in base alle loro masse accurate, modelli di distribuzione isotopica e, in alcuni casi, spettri di massa tandem, sono provvisoriamente assegnati a metaboliti endogeni. Gli ioni rilevato da una singola cellula erano simili a quelli osservati per l'analisi del tessuto stesso convenzionali LAESI-MS di più celle 13.
Figura 1. Schematico di analisi singola cellula da LAESI-MS. Un mid-IR impulso laser è accoppiato ad una fibra ottica e consegnato al campione immessi sul vetrino. La punta della fibra affilato concentra la luce nella cella di destinazione e l'energia depositata scoppia la cellula. Il pennacchio ablazione prodotti (punti rossi) è fusa con un pennacchio elettrospray (punti neri), le goccioline si uniscono (punti verdi) con conseguente produzione di ioni campione specifico. Questi ioni vengono analizzati e rilevati dal spettrometro di massa (MS). Due lunghi microscopi video di distanza, Microscopio Microscopio 1 e 2, sono utilizzati per monitorare distanza tra la punta della fibra e la superficie cellulare e selezionare una cella per l'analisi, rispettivamente.
Figura 2a. Ablazione segno su una singola cellula epidermica di una A. CEPA lampadina. Le celle adiacenti non presentano danni visibili e, successivamente, possono essere analizzati separatamente.
Figura 2b. Spettro di massa corrispondente alla ablazione di un singolo A. cepa cellule epidermiche mostra la presenza di metaboliti primari e secondari.
Il contenuto di acqua del citoplasma cellulare e la resistenza alla trazione della parete cellulare o la membrana sono i fattori critici che disciplinano l'ablazione di singole cellule durante LAESI-MS. La fluenza laser deve essere regolata per raggiungere le soglie di ablazione dei diversi tipi di cellule. La fluenza laser consegnato dipende dall'energia dell'impulso laser e della distanza tra la punta della fibra e la superficie cellulare. Minimizzare la perturbazione delle cellule vicine durante l'analisi singola cella è fondamentale. Mantenere l'energia laser sulla soglia di ablazione limita l'effetto di analisi sulle cellule adiacenti.
Una delle potenziali applicazioni è usando le cellule unico come il naturale pixel volumetrico (voxel) per l'industria chimica di imaging da MS. Rispetto alla raccolta di dati su una griglia rettangolare spesso artificiale, l'imaging chimica di una cellula del tessuto, uno alla volta ha più probabilità di conservare l'organizzazione spaziale delle interazioni biochimiche tra le cellule.
Gli autori riconoscono sostegno finanziario dalle seguenti istituzioni: la National Science Foundation (Grant 0.719.232), il Dipartimento dell'Energia (Grant DEFG02-01ER15129), il WM Keck Foundation (Grant 041.904), e la George Washington University Fondo Valorizzazione della Ricerca. Gli autori sono grati per le fibre ottiche GeO2 basato generosamente forniti da Fiber Systems infrarossi (Silver Spring, MD), così come per la discussione iniziale sul protocollo relativo alle fibre di incisione da Mark E. Reeves e Joan A. Hoffmann della George Washington Università. Gli autori desiderano inoltre ringraziare Jessica A. Stolee per il suo aiuto durante la videoregistrazione del protocollo.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Acetic acid | Fluka | 45727 | |
Methanol | Fluka | 65548 | |
1-methyl-2-pyrrolidinon | Sigma-Aldrich | M79603 | |
Water | Fluka | 39259 |
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