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Method Article
Analysis of the mitochondrial structure-function relationship is required for a thorough understanding of the regulatory mechanisms of mitochondrial functionality. Specific methods for studying mitochondrial structure and function in live and fixed Drosophila ovaries are described and demonstrated in this paper.
Analysis of the mitochondrial structure-function relationship is required for a thorough understanding of the regulatory mechanisms of mitochondrial functionality. Fluorescence microscopy is an indispensable tool for the direct assessment of mitochondrial structure and function in live cells and for studying the mitochondrial structure-function relationship, which is primarily modulated by the molecules governing fission and fusion events between mitochondria. This paper describes and demonstrates specific methods for studying mitochondrial structure and function in live as well as in fixed tissue in the model organism Drosophila melanogaster. The tissue of choice here is the Drosophila ovary, which can be isolated and made amenable for ex vivo live confocal microscopy. Furthermore, the paper describes how to genetically manipulate the mitochondrial fission protein, Drp1, in Drosophila ovaries to study the involvement of Drp1-driven mitochondrial fission in modulating the mitochondrial structure-function relationship. The broad use of such methods is demonstrated in already-published as well as in novel data. The described methods can be further extended towards understanding the direct impact of nutrients and/or growth factors on the mitochondrial properties ex vivo. Given that mitochondrial dysregulation underlies the etiology of various diseases, the described innovative methods developed in a genetically tractable model organism, Drosophila, are anticipated to contribute significantly to the understanding of the mechanistic details of the mitochondrial structure-function relationship and to the development of mitochondria-directed therapeutic strategies.
I mitocondri sono classicamente descritti come la centrale elettrica cellulare, dal momento che sono le principali sedi di produzione di energia nelle cellule differenziate. Inoltre, i mitocondri hanno un ruolo fondamentale nel metabolismo, la generazione di calore, la modifica dei lipidi, calcio e redox omeostasi, l'orchestrazione dei processi di segnalazione cellulare, ecc 1. I mitocondri anche svolgere un ruolo attivo nella induzione della morte cellulare 2, nonché nella regolazione del ciclo cellulare 3. Tale multifunzionalità pone le seguenti domande fondamentali: a) come fanno i mitocondri svolgono tutte queste funzioni contemporaneamente e b) ci sono piscine mitocondriali specifici o sottozone che sono specializzati per funzioni distinte? In questo contesto, è importante notare che i mitocondri multifunzionali sono dinamici nella forma, dimensioni, e la struttura all'interno delle singole cellule e che la forma a regime di mitocondri possono variare tra i tipi di cellule. Decenni di ricerca provenienti da varie laboratoriooratori suggeriscono che l'alterazione della forma mitocondriale, le dimensioni e la struttura, chiamati collettivamente dinamiche mitocondriali, è fondamentale per mantenere le varie funzioni mitocondriali 4,5,6. Questi risultati sollevano la possibilità che i mitocondri possano compiere la loro multifunzionalità in virtù della loro dinamismo strutturale.
Ampi sforzi sono in corso per capire il rapporto struttura-funzione mitocondriale. La dinamicità della struttura mitocondriale viene mantenuta principalmente dalla loro capacità di subire eventi di fissione e fusione con l'altro. Fissione di grandi mitocondri li converte in elementi mitocondriali più piccoli, mentre la fusione tra due mitocondri piccoli li fonde in un elemento mitocondriale grande 7. Inoltre, può verificarsi la fusione transitorio di due mitocondri per consentire la miscelazione del loro contenuto. La fissione e fusione eventi delle membrane mitocondriali interne ed esterne sono attentamente regolate da specificheific imposta di proteine. Il macchinario nucleo fissione è composto dynamin-related protein 1 (DRP1), che viene assunto dal citosol ai mitocondri dalla sua interazione con certa bona proteine mitocondriali fide (ad esempio, Fis1 o Mff1), mentre la funzione DRP1 può anche essere regolata altre proteine sulla superficie mitocondriale 4. Anche se DRP1 opera sulla membrana esterna, la sua capacità di fissione impatto la membrana interna pure. L'orchestrazione della fissione delle membrane mitocondriali esterne ed interne non è ben compreso. D'altra parte, la fusione della membrana interna è regolata al centro dalle attività di OPA1, mentre mitofusins regolano la fusione della membrana esterna 5. Il saldo dei fissione e fusione di contrasto eventi di mitocondri dettare la forma mitocondriale stato stazionario in una cella. Ad esempio, la repressione di fissione mitocondriale comporterebbe fusione completa e senza opposizione, mentre l'eccessiva attività dei mitocondril fissione comporterebbe la frammentazione dei mitocondri 3.
Lo studio della relazione struttura-funzione mitocondriale coinvolge principalmente due approcci complementari: a) analisi dei fenotipi cellulari e organismal dopo la manipolazione genetica delle proteine fissione / fusione mitocondriali e b) le valutazioni diretti di struttura e funzione mitocondriale. È interessante notare che le analisi genetiche non sempre rivelare la funzionalità diretta della molecola in questione (in questo caso, mitocondriale proteine fissione / fusione), come i fenotipi possono sorgere a causa di effetti secondari. Pertanto, è di fondamentale importanza per sviluppare e utilizzare strumenti per studiare la struttura e la funzione mitocondriale direttamente. Qualsiasi valutazione della struttura dei mitocondri coinvolge vari strumenti di microscopia. L'uso della microscopia a fluorescenza delle cellule vive è notevolmente avanzato gli studi di dinamiche mitocondriali, dal momento che il dinamismo mitocondriale può essere controllato sia qualitativamente che Quantitätvamente utilizzando gli strumenti e le tecniche di microscopia a fluorescenza 8 appropriate. Strumenti microscopia a base di fluorescenza sono stati sviluppati per studiare la struttura e la funzione mitocondriale in tessuti Drosophila melanogaster vivi e fisse, chiarire il significato di dinamismo mitocondriale in vivo 9. Questi e metodi relativi sono descritti qui, con l'obiettivo di studiare la struttura e la funzione mitocondriale nelle ovaie Drosophila.
L'ovaio Drosophila è composto da germinali e somatiche lignaggi, che derivano dalle rispettive cellule staminali adulte che si trovano nel germarium 10,11. Sedici cellule germinali sinciziale (GCS) vengono incapsulati dalle cellule follicolari somatiche (FC) per formare singole camere d'uovo che emergono dalla germarium (Figura 1). Uno dei 16 CV ottenere impegna a diventare un ovocita, e il restante 15 CV svilupparsi in cellule infermiere che supportano la crescita della camera di ovociti, Facilitando la maturazione dell'uovo prima che venga deposto. La maggior parte degli FC subiscono 9 turni di divisioni mitotiche, prima di uscire dal ciclo cellulare mitotico a differenziarsi terminale in uno strato di cellule epiteliali modellato costituito da cellule anteriore follicolo (AFCS), cellule posteriore follicolo (PFC), e principali cellule del corpo (MBC) . Le camere di uova consecutivi sono collegati da cellule gambo, che si differenziano le cellule che sono anche derivati da FC nelle prime fasi di sviluppo. Forma mitocondriale regolato dalla proteina DRP1 fissione mitocondriale è attivamente coinvolto nel processo di differenziazione durante il normale sviluppo del ovarico strato di FC Drosophila 9,12. I metodi utilizzati in questi studi per identificare il coinvolgimento di DRP1 in Drosophila sviluppo strato di cellule del follicolo sono descritte qui.
1. Preparazione di Drosophila (gli strumenti necessari sono descritte nella Figura 2A)
2. La dissezione di Drosophila ovaie (gli strumenti necessari sono descritte nella Figura 2A)
3. Preparazione per microscopia Live-tessuto
NOTA: Gli strumenti necessari sono descritte nella Figura 2A.
4. Perdita Fluorescence In Photobleaching (FLIP) Assay per valutare mitocondriale Matrix Continuità
NOTA: mitocondriale continuità matrice in una struttura mitocondriale fusa viene stabilita dopo la fusione completa delle membrane interna ed esterna mitocondriale seguenti una progressione attraverso i passaggi intermedi. Fissione dei mitocondri può seguire la stessa procedura, ma in senso inverso (Figura 3A). FLIP è un metodo semi-quantitativa microscopia a base time-lapse che può essere utilizzato per valutare la continuità mitocondriale matrice neldef stato fuso di ex vivo mitocondri (punti 3 e 4 nella figura 3A) in vivo ovaie Drosophila 9. Il dosaggio FLIP viene eseguita come una piccola regione di interesse (ROI) dei mitocondri esprimono una molecola fluorescente nella matrice mitocondriale che viene fotodecolorate a intervalli regolari (FLIP ROI in Figura 3A). Come risultato, ogni regione circostante mitocondriale che è continua con la ROI FLIP (ROI sperimentale nella Figura 3A) perderà segnale dovuto allo scambio di molecole nella matrice mitocondriale continuo. Gli esperimenti FLIP dimostrato qui vengono eseguite su transgenici Drosophila esprimere mitoYFP, che contiene la sequenza di targeting mitocondriale del citocromo ossidasi subunità VIII umano contrassegnate con YFP di indirizzare alla matrice mitocondriale in una forma liberamente diffusibile. Un esperimento simile può anche essere eseguita con il transgene mito pUASP-mito-GFP, come riportato in precedenza 9. Un simile protocollo FLIP può essere utilizzato con una sonda mirato allo spazio inter-membrana mitocondriale per essere in grado di rilevare la continuità risultante dalla fusione del esterno, ma non le membrane mitocondriali interne (fase 2 nella Figura 3A).
5. La colorazione fluorescente live con mitocondriale Coloranti
NOTA: la struttura dei mitocondri stabilizzati e delle potenzialità possono essere valutati utilizzando coloranti che incorporano nei mitocondri in particolare in cellule vive e tessuti. Live ovaie Drosophila possono essere colorati ex vivo con mitocondriale fluorescentemacchie di visualizzare i mitocondri, per valutare le specie reattive dell'ossigeno mitocondriali (mito-ROS), e per valutare il potenziale mitocondriale per unità di massa. Questo può essere ottenuto mediante co-colorazione con l'estere mitocondriale potenziometrico colorante tetramethylrhodamine etile (TMRE) e una macchia mitocondriale vivo compatibili che rappresenta la massa mitocondriale (vedi Materiali Tavolo per i coloranti specifici).
6. Generazione di DRP1 Null Mosaici
NOTA: La strategia clonale utilizzato qui introduce verdi proteina fluorescente (GFP) -negativi DRP1 cloni nulli sullo sfondo di un GFP-positive, fenotipicamente wild-type sfondo che è eterozigote genotipicamente per l'DRP1 null mutazione 9. Da shock termico indotto bersaglio riconoscimento flippase-flippase (FLP-FRT) mediata site-specific mitotico ricombinazione crea cloni omozigoti dell'allele drpKG03815 funzionalmente nullo. Il genotipo di Drosophila portare il mutante DRP1 è drpKG03815 FRT40A / CYO, mentre il genotipo che porta la FLP shock termico indotto (hsFLP) e UbiGFP marcatore clonale è hsflp; NLS-GFP ubiquitina (UbiGFP) FRT 40A / cyo. Il genotipo della SEprole zionato della croce tra i genotipi di cui sopra è hsFLP / +; drpKG03815 FRT40A / UbiGFPFRT40A.
7. Co-immunocolorazione per ciclina E e I mitocondri
NOTA: Per rilevare Drosophila ciclina E (dCyclinE), abbiamo utilizzato un anticorpo commerciale ottenuto in rilievo in particolare contro dCyclinE 9 (vedi Materiali Tavolo). Come marcatore mitocondriale, abbiamo utilizzato un anticorpo contro ATP-B (una subunità del complesso mitocondriale ATP sintasi) 9.
I metodi descritti possono essere utilizzati per studiare la struttura e la funzione mitocondriale in ovaie Drosophila vivi e fissi (Figura 2B). A condizione sono alcuni esempi di risultati attesi ottenuti con i metodi descritti.
La dissezione delle ovaie Drosophila: Quando sezionato ulteriormente, gli addomi mozzate (Figura 3B) da tutta la Drosophila ...
I passaggi critici all'interno del protocollo
Photobleaching: Prevenire indebite photobleaching dei campioni fluorescenti è assolutamente necessario per l'esecuzione efficiente microscopia confocale. Pertanto, il tempo utilizzato per individuare i campioni attraverso l'oculare o per impostare i parametri di acquisizione di immagini attraverso la modalità di scansione dal vivo deve essere ridotto al minimo per ridurre al minimo photobleaching.
The authors have no competing financial interests.
We acknowledge Leena Patel and Diamond Woodard for helping in the Drosophila medium preparation and Dr. Igor Chesnokov for providing access to the camera-attached stereomicroscope.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Grace's Media (Insect Dissecting Medium) | Fisher Scientific | 30611031-2 | |
41 Paraformaldehyde AQ | Electronic Microscopy Sciences | 50-259-99 | |
Mitotracker Green (overall mitochondrial stain) | Life Technologies | m7514 | Reconstitute and Aliquot |
Tetramethylrhodamine ethyl ester perchlorate | Sigma Aldrich | 87917-25MG | Reconstitute and Aliquot |
MitoSox (Mito-Ros stain) | Life Technologies | m36008 | Reconstitute and Aliquot |
PolyLysine | MP Biomedicals | ICN15017625 | |
Fly Vials | Fisher Scientific | AS-515 | |
Fly Conicals | Fisher Scientific | AS-355 | |
Fly Vial Flugs | Fisher Scientific | AS273 | |
Fly Conical Flugs | Fisher Scientific | AS 277 | |
Jazzmix Drosophila food (Drosophila food) | Fisher Scientific | AS153 | |
Bovine Serum Albumin | Sigma Aldrich | A9647-50G | |
Cyclin E Antibody (d-300) | Santa Cruz | sc- 33748 | |
ATPB antibody [3D5] - Mitochondrial Marker | AbCam | ab14730 | |
Cy3 AffiniPure Goat Anti-Mouse IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 115-165-146 | |
Cy5 AffiniPure Goat Anti-Rabbit IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch | 111-175-144 | |
Hoechst | Fisher Scientific | H3570 | |
VectaShield | Fisher Scientific | H100 | |
Azer Scientific EverMark Select Microscope Slides | Fisher Scientific | 22-026-252 | |
Microscope Cover Glass | Fisher Scientific | 12-542-B | |
Mat Tek Corp Glass Bottom Mircrowell Dish | Fisher Scientific | P35G-0-14-C | |
Active Dried Yeast | Fisher Scientific | ICN10140001 | |
Confocal Microscope | Carl Zeiss | LSM 700 | |
Dumont #5 Forceps | Fine Science Technologies | 11251-20 | |
Moria Nickel Plated Pin Holder | Fine Science Technologies | 26016-12 | |
Minutien Pins | Fine Science Technologies | 26002-15 | |
MYFP ( w[*]; P{w[+mC]=sqh-EYFP-Mito}3 ) | Bloomington Stock Center | 7194 | |
Fly Pad | Fly stuff | 59-118 | |
Blowgun | Fly stuff | 54-104 | |
Blowgun needle | Flystuff | 54-119 | |
Dissecting Microscope | Carl Zeiss | Stemi 2000 | |
Analyses software | Carl Zeiss | Zen | |
Analyses software | Open source | Image J | |
Research Macro Zoom Microscope | Olympus | MVX10 | |
QICAM Fast 1394 Cooled Digital Camera, 12-bit, Mono | QImaging | QIC-F-M-12-C | |
QCapture Pro 5.1 | QImaging |
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