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Method Article
Il presente protocollo descrive come misurare i dati dei parametri di vita comuni nelle zanzare Aedes aegypti , tra cui fecondità, dimensioni delle ali, fertilità, rapporto tra i sessi, vitalità, tempi di sviluppo, contributo maschile e longevità adulta. Queste misurazioni possono essere utilizzate per valutare l'idoneità delle zanzare transgeniche.
Le zanzare transgeniche spesso mostrano costi di fitness rispetto alle loro controparti di tipo selvatico. A questo proposito, gli studi sui costi di fitness prevedono la raccolta di dati sui parametri di vita da zanzare geneticamente modificate e il loro confronto con zanzare prive di transgeni dello stesso background genetico. Questo manoscritto illustra come misurare i tratti comuni della storia della vita della zanzara Aedes aegypti, tra cui la fecondità, le dimensioni e la forma delle ali, la fertilità, il rapporto tra i sessi, la vitalità, i tempi di sviluppo, il contributo maschile e la longevità adulta. Questi parametri sono stati scelti perché riflettono il successo riproduttivo, sono semplici da misurare e sono comunemente riportati in letteratura. I risultati rappresentativi quantificano i costi di fitness associati a un knock-out genico o a un singolo inserimento di un elemento gene drive. Standardizzare il modo in cui vengono raccolti i dati sui parametri di vita è importante perché tali dati possono essere utilizzati per confrontare la salute delle zanzare transgeniche generate negli studi o per modellare il tasso di fissazione transgenica in una popolazione di zanzare di tipo selvatico simulata. Sebbene questo protocollo sia specifico per l'Aedes aegypti transgenica, il protocollo può essere utilizzato anche per altre specie di zanzare o altre condizioni di trattamento sperimentale, con l'avvertenza che alcuni contesti biologici possono richiedere adattamenti speciali.
La sopravvivenza del più adatto è l'idea darwiniana che gli individui che ospitano i geni più adattati al loro ambiente trasmetteranno quei genialle generazioni successive. Ciò significa che è la fitness che determina se i loro geni sopravviveranno. Questo concetto di oltre 150 anni fa è forse il fattore determinante più significativo per l'ingegnerizzazione di un gene drive di successo nelle zanzare transgeniche. I gene drive, o il modello di ereditarietà super-mendeliana di un elemento genetico egoista che gli permette di diffondersi attraverso le popolazioni2, sono in fase di studio per la gestione geneticadei parassiti 3. Nel contesto del controllo dei vettori, questa strategia mira a sostituire gli artropodi wild-type (WT) con quelli resistenti ai patogeni (modificazione della popolazione) o a eliminarli del tutto (soppressione della popolazione)4. Tuttavia, le zanzare transgeniche spesso mostrano costi di fitness (chiamati anche carico genetico) rispetto alle loro controparti WT, il che significa che il transgene andrà perso nelle popolazioni che possono superarle. L'accoppiamento dei transgeni con un sistema di gene drive è quindi necessario per compensare eventuali costi di fitness e spingere il transgene attraverso la popolazione a livelli maggiori di quelli attesi dalla tipica eredità mendeliana4.
Studi di laboratorio su specie di zanzare vettori hanno dimostrato che i transgeni spesso mostrano costi di fitness 5,6,7. Ad esempio, Irvin et al. ha misurato vari parametri di vita in Aedes (Ae.) aegypti ingegnerizzati per esprimere la proteina fluorescente verde potenziata (eGFP) o i geni della trasposizione sotto Drosophila actin 5C o promotori sintetici 3XP3 e li ha confrontati con il ceppo Orlando wild-type (lo stesso background genetico da cui sono derivati)5. In particolare, hanno scoperto che tutti i ceppi transgenici avevano una capacità riproduttiva significativamente ridotta5. A seconda del transgene, alcune zanzare Anopheles (An.) che esprimono transgeni che inibiscono lo sviluppo del parassita Plasmodium hanno anche mostrato costi di fitness6. In particolare, An. stephensi che esprime una fosfolipasi veleno d'api (PLA2) sotto promotori costitutivi o inducibili dal pasto di sangue ha deposto un numero significativamente inferiore di uova rispetto ai controlli6. Questi autori hanno anche scoperto che gli Anopheles transgenici che esprimono un transgene diverso, un tetramero dodecapeptide SM1, non mostravano costi di fitness, portandoli a concludere che i costi di fitness conferiti dal transgene sono dipendenti, almeno probabilmente in parte, dall'effetto della proteina transgenica prodotta6. In effetti, i costi di fitness possono essere attribuiti a prodotti transgenici, effetti posizionali, effetti off-target, mutagenesi inserzionale o effetti di consanguineità in ceppi allevati in laboratorio7. I gene drive devono quindi essere sufficientemente robusti da compensare questi costi di fitness indotti dai transgeni, evitando al contempo lo sviluppo di inserzioni e delezioni (indel) che bloccano il drive stesso.
I costi dello sviluppo o dell'idoneità riproduttiva possono essere misurati in studi di laboratorio o in gabbia7, con l'avvertenza che anche fattori sconosciuti nel campo possono avere un impatto. Ciononostante, gli studi controllati di fitness sono un primo passo importante quando si pianificano o si valutano i rilasci di zanzare geneticamente modificate, come un programma di gene drive, per determinare se la linea transgenica persisterà nelle generazioni successive. Ad esempio, Hammond et al. valutato Un gene drive basato su CRISPR/Cas9 di gambiae destinato a interrompere i geni necessari per la fertilità femminile8. Attraverso studi in gabbia mantenuti per almeno 25 generazioni, gli autori hanno scoperto che le zanzare incorrevano in alleli resistenti al gene drive che bloccavano la scissione mirata a CRISPR e ripristinavanola fertilità femminile. I loro sforzi di modellazione hanno suggerito che la fertilità nelle femmine eterozigoti per il gene drive ha avuto gli impatti più drammatici sulla fissazione del gene drive in condizioni simulate8. Sulla stessa linea, Ae. aegypti (Higgs' White Eye strain, HWE) ingegnerizzato per esprimere cassette di gene drive autonomo sotto diversi promotori o in diversi loci intergenici ha mostrato diversi tassi di fissazione del gene drive nelle popolazioni simulate9. Utilizzando il modello MGDrivE10, combinato con i tassi misurati di formazione di indel, gli effetti materni e i dati dei parametri di vita raccolti in laboratorio, gli autori hanno scoperto che la fitness delle zanzare ha influenzato maggiormente la persistenza del gene drive in condizioni simulate9. I costi di fitness che hanno maggiori probabilità di compromettere l'efficienza del gene drive sono attribuibili alla (sovra)espressione somatica di Cas9 o al gene che è bersaglio, in particolare negli eterozigoti, piuttosto che al drive intrinseco stesso 11,12,13,14,15,16,17.
Data la sua importanza, l'idoneità è un fattore importante per la capacità di una linea transgenica di persistere nelle generazioni successive e può essere utilizzata come indicatore di eventuali effetti fisiologici associati a un transgene. Ad esempio, gli effetti fuori bersaglio possono essere associati ai costi di fitness. In questo caso, si consiglia di reincrociare una linea transgenica per diverse generazioni. Inoltre, l'attraversamento della linea transgenica con una che riflette una popolazione di campo può anche essere necessario per studiare quanto bene la popolazione transgenica possa competere nel mondo reale. Per quantificare i costi di fitness in modo che possano essere confrontabili, questo manoscritto fornisce semplici protocolli per misurare i tratti comuni della storia di vita nelle zanzare Ae. aegypti, con particolare enfasi sui costi di fitness associati ai transgeni, in modo che tali studi possano essere riprodotti più facilmente. I protocolli includono fecondità, fertilità, rapporto tra i sessi, vitalità, tempi di sviluppo, contributo maschile e longevità adulta. Anche la misurazione della lunghezza e dell'area delle ali è stata scelta come misura di fitness in quanto è correlata alla lunghezza del torace18,19 e alle misure delle dimensioni del corpo, che è direttamente collegata alle dimensioni, alla fecondità e all'immunità del pasto di sangue20,21. Sebbene esistano molti modi per valutare l'idoneità, questi parametri sono stati scelti perché riflettono il successo riproduttivo, sono semplici da misurare e sono comunemente riportati in letteratura.
NOTA: Questo protocollo è stato scritto per le linee transgeniche e wild-type di Ae. aegypti che sono state precedentemente convalidate e stabilite. Per ulteriori informazioni sulla generazione transgenica di Ae. aegypti, vedere Kistler et al.22 e Coates et al.23. Tutti gli esperimenti descritti di seguito sono stati eseguiti secondo le procedure standard di allevamento di Ae. aegypti . Le zanzare sono state mantenute a 28 °C con un'umidità relativa del 75%-80% e un ciclo di 12 ore di luce/12 ore di buio. A fini statistici si consiglia vivamente un minimo di 100 cartine per uova singole per macchia di zanzara. Gli studi completi sulla fitness richiedono circa 3 mesi per essere completati (Figura 1).
1. Misurare la fecondità nelle zanzare femmine
2. Misurazione della lunghezza, dell'area e delle dimensioni del baricentro delle ali
3. Valutazione della fertilità degli ovuli
4. Determinazione del rapporto tra i sessi nelle pupe
5. Determinazione della vitalità delle larve
6. Determinazione del tempo di sviluppo larve-pupe
7. Determinazione del contributo maschile
8. Determinazione della longevità delle zanzare
Seguendo il protocollo di cui sopra, è stata valutata l'idoneità di due linee di zanzara: (1) knock out mediato da CRISPR/Cas9 della proteina salivare Ae. aegypti D7L1 (AAEL006424) e (2) linee di Ae. aegypti che esprimono gene drive autonomi mediati da CRISPR/Cas99. Nel primo caso, è stata stabilita una linea di knock-out omozigote D7L1 sfruttando la via di giunzione delle estremità non omologhe (NHEJ) per generare l'interruzione dopo la microiniezione di embrioni con sgRNA s...
Gli studi di fitness di Ae. aegypti sono spesso eseguiti in laboratorio per valutare i costi di fitness associati al carico transgenico (ad esempio, elementi gene drive) o knock out genici, come discusso in questo manoscritto; tuttavia, questi studi possono essere eseguiti per una varietà di scopi, qualsiasi che miri a valutare la salute di un gruppo di Ae. aegypti, come30,31 infetto da Wolbachia,32,33<...
Gli autori non hanno nulla da rivelare.
Gli autori desiderano ringraziare i dottori Bill Reid e Alexander Franz dell'Università del Missouri per il loro sostegno a questo protocollo. Gli autori desiderano anche ringraziare il Dr. Benjamin Krajacich del NIH/NIAID per il suo supporto con l'analisi R. Questo studio è stato finanziato dal NIH, sovvenzione numero R01 AI130085 (KEO) e dalla NIH/NIAID Division of Intramural Research Program AI001246 (EC).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1 oz. translucent plastic souffle cups | WebstaurantStore | 301100PC | |
2 oz. translucent polystyrene souffle cups | WebstaurantStore | 760P200N | |
3 mL plastic pipettors | Cornin | 357524 | |
50 mL conical tubes | Any brand | ||
64 oz. white double poly-coated paper food cup | WebstaurantStore | 999SOUP64WB | for mosquito enclosement |
65 mm lens | Canon | MP-E 65mm f/2.8 1-5x Macro Photo | Canon Macro Photo MP-E 65mm, 7D-65mm-1X; zoom=1, 200, 6.3, ISO=100; for photographing wings or egg papers, although other cameras are likely sufficient |
Aedes aegypti mosquitoes | BEI | multiple strains as eggs are available | |
Artifical membrane feeders | https://lillieglassblowers.com/ | Meduim membrane feeder, Custom made, 33mm | Chemglass also offers, but sizes are wrong for us. Ours are about 3 cm? |
ATP | MP Biomedical | ICN15026605 | Any good quality ATP, 10mM filter sterile aliquots at -20 |
Autoclave | for sterilizing water for hatching | ||
Canon EOS 7D camera | Canon | 3814B004 | for photographing wings or egg papers, although other cameras are likely sufficient |
defibrinated sheep blood | Colorado Serum Co. | 60 ml, every 2 weeks | https://colorado-serum-com.3dcartstores.com/sheep-defibrinated |
Dual Gooseneck Microscope Illuminator | Dolan Jenner Fiber-Lite 180 | 181-1 System | |
Ethanol | |||
Forceps | Dumont | 5SF | |
Gauze | omnisorb ii | 4" non-woven sponges | |
glass microscope slide | Fisher Scientific | 12-544-2 | |
Glass Petri dishes, 100 × 15 mm | VWR | 75845-546 | for anesthesizing/manipulating mosquitoes on ice |
Hogs' gut | Any Deli | we buy in bulk, split, wash and store in small aliquots of ~4X12" at -20 in 50 ml conical | |
Ice | |||
Ice bucket | |||
Kimwipe | Fisher Scientific | 06-666A | |
Leica GZ4 StereoZoom microscope | for screening transgenic mosquitoes (if applicable) | ||
Paintbrush | AIT synthetic brush | size 10-0 | for manipulating larvae/pupae (Amazon) |
Panty hose | Walmart | L'eggs Everyday | Women's Nylon Plus Knee Highs Sheer Toe, 16 pairs (plus fits the carton) |
Pencils | Any brand | ||
Plastic containers for 2° storage of cartons | Walmart | Sterilite 58 Qt Storage Box Clear Base White Lid Set of 8 | |
Plastic containers for growing larvae | Walmart | Sterilite 28 Qt. Storage Box Plastic, White, Set of 10 | |
Plastic containers for hatching larvae | Walmart | Sterilite 6 Qt. Storage Box Plastic, White | |
polypropylene clear deli containers | WebstaurantStore | 127DM12BULK | 12 oz, or 16 oz if needed for bigger (127RD16BULK) |
Rubber bands | Office Max | #100736/#909606 /#3777415 | 12", #64 and #10 |
Rubber stopper | VWR | 217-0515 | for mosquito enclosement |
Sugar source, such as sugar cubes or raisins | |||
Tetramin flake food | Tetramin | 16106 | |
tpsDig | Stony Brook Morphometrics | A free morphometric image-processing software distributed online available at https://www.sbmorphometrics.org/ | |
tpsUtil | Stony Brook Morphometrics | A free morphometric image-processing software distributed online available at https://www.sbmorphometrics.org/ | |
White organza fabric 8” × 8” | FabricWholesale.com | 4491676 | Joann Casa Collection Organza Fabric by Casa Collection |
Whitman Grade 1 Qualitative Filter paper | Whitman | 1001-824 | for egg papers. The white color makes it easier to see the black eggs. |
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