Tracciare le curve in erba prima dell'allineamento usando la funzione di utilità Python immettendo il comando in una nuova cella. Quindi, tracciate le curve in erba dopo l'allineamento. Utilizzando la funzione di utilità Python.
Utilizzare il confronto del grafico a linee di stampa fornito nel riquadro delle utilità Python per eseguire confronti grafici a linee sul frame di dati originale, allineato o allineato e interpolato. Digitando il comando in una nuova cella, importare un file di elenco di geni CSV o TSV nel blocco appunti utilizzando il comando in una nuova cella. Quindi, usa il confronto della mappa di calore della funzione fornita nel file delle utilità Python per eseguire un confronto della mappa di calore sul frame di dati interpolato e allineato di fase digitando il comando in una nuova cella.
Un confronto dei dati trascrittomatici allineati e non allineati ha mostrato che prima dell'allineamento la prima espressione di picco degli esperimenti di microarray appariva allineata con il secondo picco dell'esperimento RNA-seq. Tuttavia, dopo l'allineamento, i primi picchi del ciclo cellulare di ciascun set di dati sono allineati in modo appropriato. Il confronto dei dati della fase del ciclo cellulare tra esperimenti con periodi variabili ha mostrato differenze di periodo visibili nelle curve di gemmazione non allineate.
Mentre l'allineamento degli orologi rendeva le tre curve notevolmente simili, rendendo possibile il confronto dei dati sperimentali, i dati della fase del ciclo cellulare per ogni punto della linea di vita comparabile non erano identici tra le due condizioni. Il confronto dei dati trascrittomici tra esperimenti con periodi variabili ha mostrato che prima dell'allineamento le dinamiche della trascrizione di CDC20 non si sovrapponevano. Ma dopo l'allineamento, i picchi si sono verificati nella stessa fase del ciclo cellulare, ma le forme delle curve erano diverse.
I geni sono stati tracciati come mappe di calore nello stesso ordine per tutte e tre le condizioni sia per i non allineati che per quelli allineati.
