Per iniziare la fusione dei geni associati alla malattia, posiziona i file TXT salvati in precedenza da cinque database contenenti il nome dell'erbe, l'ID dell'ingrediente, l'ID del gene e lo script Malattia. R nella stessa cartella. Apri il codice R.
Copia e incolla il percorso in cui è memorizzato il file TXT nella riga in cui si trova il setwd nel codice R. Apri il software R. Eseguire il codice R modificato e fare clic su Salva.
Imposta il gene e assegna al file un nome Disease.txt. Apri il sito Web del diagramma di Venn. Nella sezione Input, copia e incolla il contenuto di testo già salvato nell'elenco.
Assegna un nome al contenuto con il rispettivo database. e fai clic su Invia. Fai clic su Salva immagine come PNG sotto l'immagine e salva il risultato del testo nella stessa cartella.
Posiziona il simbolo alltargets.symbol. txt e la malattia. txt nella stessa cartella.
Apri il codice R. Copia e incolla il percorso in cui è memorizzato il file txt nella riga in cui si trova il setwd nel codice R. Apri il software R.
Eseguire il codice R modificato e fare clic su Salva. Imposta il gene e assegna un nome al file Drug_Disease.txt. Apri il sito Web del diagramma di Venn.
Nella sezione Input, copia e incolla alltargets.symbol. txt e Malattia. txt nell'elenco e denominare i file.
Fai clic su Salva immagine come PNG sotto l'immagine e salva i risultati del testo nella stessa cartella. Apri il sito Web delle stringhe e fai clic su Più proteine. Fai clic su Sfoglia e carica DrugDisease.
Txt. quindi seleziona Homo sapiens in Organismi. Fare clic su CERCA, quindi su CONTINUA.
Ora, fai clic su Impostazioni e imposta il punteggio di interazione minimo richiesto sulla massima affidabilità. Dall'opzione Visualizzazione rete, selezionare Nascondi nodi disconnessi nella rete, quindi fare clic su AGGIORNA>Regola i nodi nel diagramma di rete in modo che non vi siano sovrapposizioni o occlusioni. Fare clic su Esportazioni, seguito da Scarica come bitmap ad alta risoluzione per ottenere la mappa della rete di interworking delle proteine in formato PNG, scaricare il file TSV come breve output di testo tabulare.
Salva i file PNG e TSV in una cartella unificata.
