Per iniziare, il virus adeno-associato o il campione AAV e centrifugare per assicurarsi che tutto il liquido rimanga sul fondo della provetta. Aggiungere 45 microlitri di soluzione contenente DNasi I a una provetta PCR da 0,2 millilitri a otto provette. Trasferire cinque microlitri del campione AAV nella provetta contenente la soluzione di DNasi.
Dopo il vortex, centrifugare brevemente il campione per assicurarsi che tutto il liquido rimanga sul fondo. Utilizzando un termociclatore, incubare i campioni per un'ora a 37 gradi Celsius, quindi raffreddarli a quattro gradi Celsius. Successivamente, preparare un'appropriata diluizione del campione trattato con DNasi in un tampone di diluizione AAV in una striscia fresca di otto provette PCR da 0,2 millilitri.
Dopo la diluizione in serie, agitare i campioni e centrifugare per assicurarsi che tutto il liquido rimanga sul fondo. Combinare i primer diretti e inversi della sonda ddPCR Supermix e DNase's-Free Water nei volumi richiesti. Agitare la miscela master e centrifugare brevemente la provetta.
Quindi trasferire 19,8 microlitri della miscela master in ciascuna provetta su una striscia fresca di otto provette PCR da 0,2 millilitri.