リボソームRNA、トランスファーRNA、snoRNA、マイクロRNAなどのノンコーディングRNAは、タンパク質をコードしないが、それ自体が最終生成物であるRNAです。

リボソームRNAは、ノンコーディングRNAの中で最も多く存在し、リボソームの主要な構造成分です。真核生物のリボソームには、5S、5.8S、18S、28Sの4種類のrRNAが含まれています。

4つのrRNA遺伝子のうち3つは、転写されたスペーサーDNAが間隔を空けて1つのDNA要素にコードされています。4番目のrRNAである5S rRNAは、別々にコードされています。

核小体内では、3つのrRNAがRNAポリメラーゼIによって一緒に転写され、45S前駆体rRNAと呼ばれる単一の大きな前駆体rRNAになります。

転写後、前駆体rRNAは広範囲に修飾されます。2つの一般的な修飾には、ヌクレオシドメチル化とシュードウリジル化が含まれます。

ヌクレオシドメチル化では、ヌクレオチド糖上の2プライムヒドロキシル位がメチル化されます。シュードウリジル化では、塩基性ウリジンが異性化し、「シュードウリジン」と呼ばれる別の形態が生成されます。

これらの修飾は、「small nucleolr RNA-protein complexes」または「snoRNPs」と呼ばれるRNA-タンパク質複合体のカテゴリーによって触媒されます。各snoRNP複合体は、1つのsnoRNAと、修飾反応を触媒する酵素を含む4つまたは5つのタンパク質で構成されています。

snoRNAは、前駆体rRNA上の相補配列に塩基対を組み込むことにより、修飾部位を決定します。次に、関連するRNA修飾酵素を修飾する塩基に運びます。

化学的に修飾されると、前駆体rRNAは成熟した個々の5.8S、18S、および28S rRNAに切断され、これらはリボソームサブユニットに組み込まれます。

核小体の外部では、5S rDNAはRNAポリメラーゼIIIによって120ヌクレオチド長転写産物として転写されます。他のリボソームRNAとは異なり、5S rRNAは修飾されないままです。その後、未修飾の5S rRNAを核小体に取り込み、他のリボソーム成分とアセンブルします。