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Method Article
* これらの著者は同等に貢献しました
体外培養は、生菌の存在を直接検出する方法です。このプロトコルは、ボレリア・ブルグドルフェリ・センス・ラト複合体、再発熱ボレリア種、およびボレリア・ミヤモトイのものを含む、多様なボレリア・スピロヘータの培養方法について説明しています。これらの種は潔癖で成長が遅いですが、培養することができます。
ボレリアは、ライムボレリア症(LB)グループの3つの種グループで構成され、B.ブルグドルフェリセンスラト(s.l.)としても知られ、最近ボレリエラ、再発熱(RF)グループボレリア、およびスピロヘータの3番目の爬虫類関連グループに再分類されました。体液または組織からの病原体の培養が複製病原体を直接検出し、研究のためのソース材料を提供するため、培養ベースの方法は、研究と臨床作業の両方で細菌感染の実験室検出のゴールドスタンダードであり続けています。ボレリアとボレリエラ・スピロヘータは潔癖で成長が遅いため、一般的に臨床目的で培養されていません。 しかし、研究には文化が必要です。このプロトコルは、B. afzelii、B. americana、B. andersonii、B. bavariensis、B. bissettii/bissettiae、B. burgdorferi sensu stricto(s.s)、B. californiensis、B. carolinensis、B. chilensis、B. finlandensis、B. garinii、B. japonica、B. kurtenbachii、B. lanei、 B. lusitaniae, B. maritima, B. mayonii, B. spielmanii, B. tanukii, B. turdi, B. sinica, B. valaisiana, B. yangtzensis, and RFspirochetes, B. anserina, B. coriaceae, B. crocidurae, B. duttonii, B. hermsii, B. hispanica, B. persica, B. recurrentis, B. miyamotoi.LBおよびRFスピロヘータを成長させるための基本的な培地は、確立された培養物におけるスピロヘータの成長を確実にサポートするバーバー・ストーナー・ケリー(BSK-IIまたはBSK-H)培地です。接種材料中で初期スピロヘータ数が低いダニまたは宿主由来のサンプルから新たに単離されたボレリア分離株を増殖させることができるように、修飾ケリー・ペッテンコーファー(MKP)培地が好ましい。この培地は、B. miyamotoiの増殖もサポートします。RFスピロヘータの栽培の成功は、成分の品質にも大きく依存します。
ボレリアは、ライムボレリア症(LB)グループ、再発熱(RF)グループ、および爬虫類に限定されているように見えるあまり特徴のないグループの3つの主要なクレードを含むスピロヘータ細菌の属です。ボレリア分類学は、他のほとんどの分類群1,2,3,4,5,6,7と同様に、ゲノムとプロテオームの比較を可能にする分子方法論の出現により流動的である。LBグループ(ライム病グループとも呼ばれます)は、伝統的に、その最も特徴的なメンバーであるボレリア・ブルグドルフェリ・センス・ストリクトにちなんでボレリア・ブルグドルフェリ・センス・ラトと呼ばれています。この論文では、現在最も広く使用されている用語であるLB、RF、および爬虫類関連グループを使用し、LBおよびRFグループの培養プロトコルについて説明します。
スピロヘタ科のメンバーに期待されるように、ボレリアは、典型的には長さ20〜30μm、幅0.2〜0.3μmの独特の長くて細いらせん形状を採用することができる。しかし、ボレリア細胞は非常に多形性であり、それらの複雑な細胞および遺伝子構造の結果として、培養およびin vivoの両方で他の多くの形状を採用することができます1,8。そのスピロヘータ形態では、平面正弦波形態は、内膜と外膜の間のペリプラズム空間で回転する軸方向の鞭毛藻に起因します。この構造は、細胞が宿主組織と相互作用することを可能にするタンパク質を含む外膜を有する、細胞を高度に運動させることを可能にする9,10。外膜タンパク質の発現は厳密に調節されており、宿主組織への浸潤だけでなく、宿主免疫系との相互作用にも影響を及ぼす11。この複雑な遺伝子発現により、ボレリア細胞は脊椎動物宿主と無脊椎動物ベクターの非常に異なる環境の間を行き来することができます。ボレリアのゲノムは原核生物の間では珍しく、環状染色体ではなく線状染色体で構成されています。直鎖染色体に加えて、ボレリア種は7〜21個のプラスミドを含み、いくつかは線状およびいくつかは環状である。プラスミドは宿主の適応と病原性に必要な遺伝子の大部分を保持しており、プロファージに由来する環状プラスミドは、スピロヘータ細胞間の水平遺伝子流動の大部分を担っていると考えられています12,13。宿主適応における役割と一致して、ライムボレリア症群の一部、おそらく多くまたはすべてのメンバーは、培養においてプラスミドを失う14。B. burgdorferiの最も研究されている「実験室適応」株であるB31は、この種の野生分離株に見られる9つのプラスミドのうち7つだけを持っています15。同様に、B. gariniiは培養16でプラスミドを失います。いくつかの研究では、RF種とB. miyamotoiが培養時にプラスミドを保持することが示されています14,17が、最近の研究では、長期間のin vitro培養でプラスミドと感染力が変化していることが示されています18。
培養ベースの方法は、研究と臨床研究の両方において、細菌感染症の実験室検出のゴールドスタンダードであり続けています14,17。体液または組織からの病原体の培養は、複製病原体を直接検出し、研究のためのソース材料を提供します14,17。このプロトコルは、LBグループ、RFボレリアおよびB.miyamotoiのスピロヘータをうまく培養するために必要な方法論とレシピを示しています。ボレリア・スピロヘータを増殖させるための基本的な培地は、汚染された原核生物の増殖を減少させるための抗生物質の有無にかかわらず、バーバー・ストーナー・ケリー培地(BSK-IIまたは市販のBSK-H)である。この培地は、もともとRFボレリア19をサポートするために使用されていた培地から適応され、Stoenner20によってさらに変更され、次にBarbour21によって修正されました。それ以来、多くの改変が開発されており、それぞれが細菌生理機能に影響を及ぼし、成長、感染力、および病原性に影響を与える可能性があります22。この培地は、確立された培養物におけるスピロヘータの成長を確実に支持し、ダニ、哺乳類、および臨床サンプルからスピロヘータを単離するために使用されています23。より最近開発されたバリエーションである修飾ケリー・ペッテンコーファー(MKP)培地は、培養物の播種に利用可能なサンプル中に存在するスピロヘータの数が少ない場合に、環境サンプルから新しいボレリア分離株を単離する際に、より良い単離成功、形態、および運動性を提供できます23,24。すべての場合において、栽培の成功は、新たに調製された培地と適切な成分の使用に大きく依存しています。すべての市販の原料が高品質の培地を生産するわけではありません。接種培養物は、少量の残留周囲酸素の存在下で、従来の32〜34°Cのインキュベーター内で振とうすることなく便利にインキュベートすることができる。ボレリア・スピロヘータは嫌気性菌ですが、自然界では酸素と二酸化炭素の濃度の変動にさらされ、遺伝子発現の変化に応答します26,27,28,29。したがって、遺伝子発現、成長、およびその他の代謝研究は、酸素制御インキュベーターまたは嫌気性チャンバーを使用して酸素および二酸化炭素レベルを制御する必要があります。培養では、培養物は毎週、またはより頻繁に、暗視野顕微鏡または位相差顕微鏡のいずれかでスピロヘータの存在についてチェックされます。培養塗抹標本は、銀染色、免疫組織化学、または蛍光タグ付き株29、30のいずれかで染色することができる。PCRとそれに続くDNAシーケンシングは、ボレリア種を検出し、遺伝的に同定または確認するための高感度で特異的な方法です30、31、32、33。
BSK-IIには多くのマイナーなバリエーションが存在し、一部は市販されています。セクション1でここで説明されているプロトコルは、Barbour (1984)21から適応されています。液体MKP培地は、より最近開発された培地であり、セクション2に記載されている。これは、以前に報告されたプロトコル33,34に従って調製され、BSK培地と同様に、基本培地の調製および完全培地の調製の2つの工程からなる。ボレリア培養培地は、セクション3に記載されているように、抗生物質の有無にかかわらず調製できます。抗生物質は、セクション4で説明されているように、臨床サンプルまたは環境サンプルを接種するときに導入される汚染細菌を減らすように機能します。純粋なボレリアsp.培養物を接種する場合、抗生物質は必要ないかもしれません。ボレリアの長期株を作ることはしばしば重要であり、そのためのプロトコルはセクション5で説明されています。セクション6では、これらの培地を使用して、臨床サンプルまたは環境サンプルから純粋なボレリアセンスラトクローンを単離する方法について説明します。可能なアプローチはいくつかあります36。以下は効果的であることが判明したものです。このプロトコルで使用されるプレーティング媒体は、BSK-IIメッキ培地37およびMKP培地34の改変です(ウサギ血清を10%38に増加)。
ヒト被験者から得られたサンプルを含むすべての研究は、関連する大学および/または医療施設の治験審査委員会によって承認され、サンプルが収集される前に参加者から書面によるインフォームドコンセントが得られました。動物から得られたサンプルを含むすべての研究は、施設動物倫理委員会のガイドラインの下で承認され、実施されました。必要に応じて、環境サンプリングの承認が得られています。
注:文化の成功は、食材の品質に大きく依存しています。市販のBSK培地が利用可能であり、実験室に適応した純粋な B.ブルグドルフェリ および高用量の接種材料を使用して培養物を播種できる関連種の増殖を強力にサポートします。一次生物学的材料からの菌株の単離物の場合、新たに調製された培地が好ましく、しばしば必要である。
ボレリア sp.は既知または疑われる病原体であり、スクリーニングされていないヒトまたは動物の組織もバイオハザードになる可能性があります。感染の可能性のある物質の取り扱いには、治験責任医師の安全のために個人用保護具と滅菌技術が必要です。さらに、培地は非常に栄養が豊富であるため、培養物は簡単に汚染されます。この作業にはバイオセーフティレベル2の封じ込めが一般的に必要であり、 Borrelia sp.またはサンプルを使用したすべての作業は生物学的安全キャビネットで実施する必要があります。
1. BSK-II培地の作り方
成分 | 量 (/L) |
BSAフラクションV | 50グラム |
CMRL-1066 (10倍速) | 100ミリリットル |
ネオペプトン | 5グラム |
ヘペス | 6グラム |
クエン酸三ナトリウム二水和物 | 0.7 グラム |
グルコース | 5グラム |
TC酵母ート | 2グラム |
ピルビン酸(Na塩) | 0.8グラム |
N-アセチル-D-グルコースアミン | 0.4グラム |
炭酸水素ナトリウム | 2.2 グラム |
水(高純度) | 900ミリリットル |
表1:BSK-II培地1Lの組成。
源 | 相応 |
Serva GmbH, ハイデルベルク, ドイツ | はい |
プロリアントバイオロジカルズ、ブーンIA、米国 | はい |
Sigma (Millipore-Sigma & Sigma- Aldrich), St. Louis, MO, アメリカ合衆国 | いいえ |
表2:BSAの供給源とBSK-II培地への適合性。
2. MKPの作成手順
成分 | 量 (/L) |
CMRL-1066 (グルタミンなしで10回) | 100 mL (液体の場合)/9.7 g/L (粉末の場合) |
ネオペプトン | 3グラム |
ヘペス | 6グラム |
クエン酸 | 0.7 グラム |
グルコース | 3グラム |
ピルビン酸 | 0.8グラム |
N-アセチルグルコースアミン | 0.4グラム |
炭酸水素ナトリウム | 2グラム |
表3:1Lの塩基性MKP(変性ケリー・ペッテンコーファー)培地の組成。
成分 | 使用量(mL) |
基本メディア | 500 |
7%ゼラチン(H2O中)(オートクレーブしたてだが熱くない) | 100 |
ウサギ血清 | 36 |
35% BSA | 17.5 |
表4:MKP(修飾ケリー・ペッテンコーファー)完全培地の組成。
3.抗生物質の有無にかかわらず 、ボレリアの文化
4. ボレリア 培養物の長期保存
5.環境または臨床源からのスピロヘータの分離
注意: 人間、動物、または環境源から材料を分離する場合は、必要に応じて、研究倫理、動物の世話、または生態学的認証を取得する必要があります。
6. 固体培地培養による液体培養物からのB. burgdorferi sensu lato spirochetesおよびB. miyamotoiのモノクローナル集団の単離
ボレリア 培地BSKおよびMKP、およびバリアントは、順次調製および滅菌する必要がある成分を含む豊富な培地です。正しく調製されると、BSK培地は赤橙色で透明になります(図1)。加温後も持続する濁度と沈殿は、問題のある成分、中程度の生産、または汚染を示しています。そのような培地は捨てるのが一番です。ゼラチンをBSKおよびMKPに添加すると、冷蔵すると...
細菌の実験室培養は研究の出発点です。培養能力によってもたらされる大きな利点は、梅毒の病因であるスピロヘータであるトレポネーマパリダムを培養するために、ごく最近成功に至った1世紀以上にわたる闘争によって例示されます44。ボレリア・スピロヘータも培養に挑戦的であるが、培養は可能である23、24、<...
利益相反は宣言されていません。
この作業は、カナダ自然科学工学研究評議会とカナダライム病財団(ABおよびVL)、スウェーデン研究評議会(SB、M-LF、IN)、TAČR GAMA 2プロジェクト-「生物学センターCASでのアプリケーションポテンシャル検証2.0のサポート」(TP01010022)(MGおよびNR)、およびチェコ共和国保健省NV19-05-00191(MGおよびNR)からの助成金によって部分的にサポートされました。図4の画像についてはS. Vranjes(2021、Rudenkoラボ)に、図5の画像についてはJ. Thomas-Ebbett(2021、ロイドラボ)に感謝します。この分野に貢献したすべての研究者に感謝し、スペースの制限のために引用できなかった研究者に謝罪します。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1.7 mL tubes | VWR | 87003-294 | Standard item - any supplier will do |
0.2 µm Sterile syringe filter | VWR | 28145-501 | Standard item - any supplier will do |
10 µL barrier pipette tip | Neptune | BT10XLS3 | Standard item - any supplier will do |
10 mL Serological pipettes | Celltreat | 229011B | Standard item - any supplier will do |
1000 µL barrier pipette tip | Neptune | BT1000.96 | Standard item - any supplier will do |
15 mL tube | Celltreat | 188261 | Standard item - any supplier will do |
20 µL barrier pipette tip | Neptune | BT20 | Standard item - any supplier will do |
20 mL Sterile syringe | BD | 309661 | Standard item - any supplier will do |
200 µL barrier pipette tip | Neptune | BT200 | Standard item - any supplier will do |
25 mL Screw Cap Culture Tubes | Fisher Scientific | 14-933C | Standard item - any supplier will do |
25 mL Serological pipettes | Celltreat | 229025B | Standard item - any supplier will do |
3 mL Sterile syringe | BD | 309657 | Standard item - any supplier will do |
35% BSA | Sigma | A-7409 | Source is important - see note |
5 mL Serological pipettes | Celltreat | 229006B | Standard item - any supplier will do |
50 mL tube | Celltreat | 229421 | Standard item - any supplier will do |
6.5 ml MKP glass tubes | Schott | Schott Nr. 26 135 115 | Standard item - any supplier will do |
Amikacine | Sigma | PHR1654 | Standard item - any supplier will do |
Amphotericin B | Sigma | A9528-100MG | Standard item - any supplier will do |
Bactrim/rimethoprim/sulfamethoxazole | Sigma | PHR1126-1G | Standard item - any supplier will do |
BBL Brucella broth | BD | 211088 | Standard item - any supplier will do |
Biosafety Cabinet | Labconco | 302419100 | Standard item - any supplier will do |
Blood collection tubes (yellow top - ACD) | Fisher Scientific | BD Vacutainer Glass Blood Collection Tubes with Acid Citrate Dextrose (ACD) | Standard item - any supplier will do |
BSK-H Medium [w 6% Rabbit serum] | Darlynn biologicals | BB83-500 | Standard item - any supplier will do |
centrifuge | Eppendorf | model 5430 | Standard item - any supplier will do |
Citric acid TrisodiumSaltDihydrate | Sigma | C-8532 100 g | Standard item - any supplier will do |
CMRL | Gibco BRL | 21540 500 mL | Standard item - any supplier will do |
CMRL-1066 | Gibco | 21-510-018 | Standard item - any supplier will do |
Cryogenic Tubes (Nalgene) | Fisher Scientific | 5000-0020 | Standard item - any supplier will do |
Deep Petri with stacking ring 100 mm × 25 mm | Sigma | P7741 | Standard item - any supplier will do |
Digital Incubator | VWR | model 1545 | Standard item - any supplier will do |
DMSO | ThermoFisher | D12345 | Standard item - any supplier will do |
Filters for filter sterilization | Millipore 0.22μm GPExpressPLUS Membrane | SCGPU05RE | Standard item - any supplier will do |
Gelatin | Difco BD | 214340 500 g | Standard item - any supplier will do |
Glass Culture Tubes | Fisher Scientific | 99449-20 | Standard item - any supplier will do |
Glucose | Sigma | G-7021 1 kg | Standard item - any supplier will do |
Glycerol | Sigma | G5516 | Standard item - any supplier will do |
Hemafuge (Hematocrit & Immuno hematology centrifuge ) | Labwissen | Model 3220 | Standard item - any supplier will do |
HEPES | Sigma | H-3784 100 g | Standard item - any supplier will do |
N-acetylglucoseamine | Sigma | A-3286 25 g | Standard item - any supplier will do |
Neopeptone | Difco BD | 211681 500 g | Standard item - any supplier will do |
Neubauer Hematocytometer | Sigma | Z359629 | Standard item - any supplier will do |
Phase contrast microscope | Leitz | Standard item - any supplier will do | |
Phosphomycin | Sigma | P5396-1G | Standard item - any supplier will do |
Phosphomycine | Sigma | P5396 | Standard item - any supplier will do |
Pipetboy | Integra | Standard item - any supplier will do | |
Precision Standard Balance | OHAUS | model TS200S | Standard item - any supplier will do |
Pyruvic acid (Na salt) | Sigma | P-8574 25 g | Standard item - any supplier will do |
Rabbit Serum | Gibco | 16-120-032 | Source is important |
Rabbit Serum | Sigma | R-4505 100 mL | Source is important |
Rifampicin | Sigma | R3501-1G | Standard item - any supplier will do |
Sodium bicarbonate | Sigma | S-5761 500 g | Standard item - any supplier will do |
Sufametaxazole | Sigma | PHR1126 | Standard item - any supplier will do |
TC Yeastolate | Difco BD | 255752 100 g | Standard item - any supplier will do |
Transfer Pipettes | VWR | 470225-044 | Standard item - any supplier will do |
Trimethoprim | Sigma | PHR1056 | Standard item - any supplier will do |
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