PBSTを除去し、パラホルムアルデヒド固定ショウジョウバエ幼虫の死骸をブロッキング剤に室温で40分間浸漬します。ブロッキング剤を、0.2%PBSTで希釈した200マイクロリットルの一次抗体と交換します。幼虫を摂氏4度で一晩孵化させます。
翌日、幼虫を0.2%PBSTで10分間洗浄します。次に、PBSTをチューブから取り出し、200マイクロリットルの希釈した二次抗体を加えます。暗所で常温で1.5時間インキュベートします。
TO-PRO R 3ヨウ化物などの核色素をインキュベーションチューブに30分間導入し、暗所で微小管を染色します。最後に、二次抗体と核色素を0.2%PBSTで10分間洗い流します。