安定同位体標識による脂質スクリーニングのための LC-TIMS-TOF MS/MS データ解析(英語)

まず、データ分析ソフトウェアを開きます。左上隅にあるファイルボタンをクリックし、[開く]を選択します。選択したファイルを選択するには、ファイル名を右クリックしてプロパティを選択します。

次に、キャリブレーションステータスを選択します。ドロップダウンボックスで、質量分析計の内部キャリブレーションを選択します。すべてのエラーが 100 万分の 1 未満であることを確認します。

その後、内部モビリティ キャリブレーションを選択し、誤差が 100 万分の 1 未満であることを確認します。次に、クロマトグラムを右クリックし、[クロマトグラムの編集]を選択します。[type]でドロップダウンボックスをクリックし、[extracted ion chromatogram]を選択します。

「filter」で「all MS」を選択し、「scan mode」で「all」を選択すると、目的の分子のフラグメントだけでなく、そのピークが表示されます。分子の選択には、質量とフォーミュラの2つのフィルターオプションがあります。質量を選択した場合は、対象の分子の理論上の M over Z (この場合は 829.7985) を選択します。

式を選択した場合は、分子と目的のイオン型(この場合はアンモニウム)の式を選択します。幅には、プラスまたはマイナスの 1 を選択します。極性については、プラスモードを維持していることを確認してください。

mobilityの下で、1.455から1.465を選択して目的の分子を分離し、これらの値に該当しない分子を除外します。パラメータを選択したら、右上の[変更]をクリックしてから[OK]をクリックします。しばらくすると、ソフトウェアは選択を処理し、クロマトグラムを出力します。

目的のピークの原点の基線で右クリックし、ピークの端まで保持しながらドラッグすると、その保持時間内のフラグメントのライブ質量スペクトルが得られます。mobilogramの画面左側を右クリックし、[edit mobilogram]を選択します。edit mobilogram tracesという名前のウィンドウが表示されます。

前に示した手順に従います。保持時間には、対象のピークの保持時間を入力します。パラメータを選択したら、右上の[追加]をクリックし、[OK]をクリックします。

ソフトウェアが選択を処理し、クロマトグラムを出力するまで待ちます。イオンを抽出するには、イオンのリストが形成されるまで、前に示した手順を繰り返します。MSウィンドウの下部で、プロファイルMSとフラグメントMSを選択して、フルスキャンとパッシブスキャンからのイオンのスペクトル表示を可能にします。

スペクトルビューでは、右クリックして「複合スペクトルをコピー」を選択します。右側に表示されるスペクトルデータから、分解能、分解能、強度、S/N比など、化合物に関する詳細な情報を得ることができます。データを処理するには、クロマトグラムと移動度ピークを手動で波形解析し、目的の分子に関する貴重な情報を得ることができます。

右クリックして、化合物を手動でクロマトグラムまたはモビログラムで見つけて選択します。左クリックして、目的のピークをハイライトします。取得される情報には、保持時間、面積、信号対雑音比、および移動度が含まれます。