まず、ゼブラフィッシュの胚を採取し、摂氏28.5度のインキュベーターで受精後72時間まで育てます。同時に、所望の濃度で試験する化学物質を準備します。受精後72時間の胚を調べます。
死んだ胚や孵化していない胚を取り除きます。9ミリリットルのE3培地を入れた6センチメートルの組織培養皿にそれぞれ10個の胚を入れます。これらは露出板と呼ばれます。
各曝露プレートに、化合物名、曝露濃度、および反復回数をラベル付けします。各プレートに1ミリリットルの曝露溶液を最低濃度から加え、プレートを静かに渦巻きさせます。溶解度の低い化合物の場合は、培地10ミリリットル全体を曝露溶液に置き換えてください。
化合物溶液を胚に添加した順序を記録し、インキュベーター内の加湿チャンバー内で摂氏28.5度でプレートを48時間インキュベートします。振動驚愕アッセイを開始するには、コンピュータと振動装置の電源を入れます。構成ファイルのスプレッドシートを作成します。
5 つのプレート位置のそれぞれに曝露情報を含め、化合物、濃度、および繰り返しを指定します。振動驚愕アッセイキットの一般ユーザーインターフェースまたはGUIプログラムを開きます。GUIプログラムでさまざまな位置を選択して、カメラの動きを確認し、カメラの応答を観察します。
サンプルプレートをインキュベーターから取り外します。それらを5つの指定された位置に置き、胚を数分間落ち着かせます。GUIプログラムで、[記録]をクリックすると、新しいウィンドウが表示されます。
このウィンドウで、前に準備した構成ファイルを選択します。サンプルの説明が各位置のサンプルと一致することを確認します。プログラムによって音波パルスがアクティブになるとLEDが点灯するのを観察します。
録画後、カメラは位置1に戻り、ソフトウェアはファイルの圧縮を開始します。測定したサンプルを次のセットと交換し、実証に従って次の分析に進みます。次に、すべての測定プレートから曝露溶液を収集し、ふるいを使用して胚を同時に保持します。
データ解析を開始するには、バーチャルダブまたは別の視聴ソフトウェアでビデオデータを開きます。音波パルスに反応する胚の数を視覚的にスコアリングします。化合物名、複製数、化合物の濃度、および運動性胚の割合をスプレッドシートに記録します。
R スクリプトが埋め込まれた KNIME ワークフローを使用して、ベンチマーク濃度分析を実施します。未処理の野生型胚の運動性の評価では、振動刺激を受けた場合の平均運動性は14.33%であり、クラッチによってばらつきがありました。運動性に対するトリカイン効果の基準濃度計算では、1%濃度で運動性の低下が示され、164.9マイクロモルのベンチマーク濃度50で2.5%を超えると活動が停止しました。.
最適でないアッセイの例では、胚反応に一貫性が見られず、驚愕反応の頑健性に影響を与える発達上の問題が示唆されました。