解剖顕微鏡下で、以前に分離された胎児の頭部から脳を採取することに進みます。湾曲した鉗子を使用して鼻を持ち、5番の鉗子を使用して頭蓋骨キャップから皮膚を慎重に剥がし、鼻に取り付けたままにして持ちやすくします。脳に対して約75度に保持し、鉗子を正中線に沿って、発達中の頭蓋骨部分の透明な膜が両側に来るまで動かします。
鉗子を頭蓋骨と平行にずらし、頭蓋骨の下に挿入し、片側につまんで剥がします。片面を取り外した後、残りの面を鉗子でつかみ、反対側に剥がします。マイクロスプーンを使用して、頭蓋骨から脳をそっとすくい取ります。
冷たいPBSが入った新鮮な60ミリメートルの皿に脳を移します。湾曲した鉗子を使用して、後脳と前脳の接合部で脳を非利き手で保持します。利き手で、刃を脳の表面と平行にしてメスを持ちます。
次に、皮質中央部をしっかりと押し下げます。後脳を保持したまま、後脳の前に2回目の切開を行い、前脳から分離します。中央部で、腹面の小さな線形空間、つまり第3脳室を探します。
5番の鉗子を使用して、心室表面の両側の内壁を慎重につまみ、新鮮で清潔な1.5ミリリットルの微量遠心チューブに移します。チューブを液体窒素のクライオセーフ容器にすばやく入れます。