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우리는 mtDNA의 biogenesis를 공부하기 위해서는 각각의 세포에서 새로 합성된 DNA mitochondrial (mtDNA)를 라벨에 민감한 기술을 개발했습니다. 기술은 뉴런의 subcellular 구획 내에 mtDNA 복제를 시각화하는 tyramide 신호 증폭 (TSA) 프로토콜과 함께 에듀의 결합이 결합되어 있습니다.
Mitochondria 세포 에너지와 mitochondrial biogenesis의 핵심 규제 1-3 건강한 세포의 mitochondria 번호를 규제의 필수 구성 요소입니다됩니다. mitochondrial biogenesis 모니터링을위한 하나의 접근 방식은 mitochondrial DNA (mtDNA) 복제 4의 속도를 측정하는 것입니다. 우리는 mtDNA의 biogenesis를 공부하기 위해서는 각각의 세포에서 새로 합성 mtDNA를 라벨에 민감한 기술을 개발했습니다. 기술은 뉴런의 subcellular 구획 내에 mtDNA 복제를 시각화하는 tyramide 신호 증폭 (TSA) 8 프로토콜 5월 5일에서 7일까지 - ethynyl - 2' - deoxyuridine (EDU)의 결합이 결합되어 있습니다. 5-7 레이블 에듀에 초기 클릭 반응 BrdU 에피토프 노출에 필요한 거친 산성 트리 트먼트 또는 효소가 소화를 요구하지 않기 때문에 에듀는 등 5 브로모 - 2 - deoxyuridine (BrdU) 같은 다른 thymidine의 analogs에 우수합니다 . 이두의 milder 라벨링은 다른 세포 마커 9-10와의 정관의 직접 비교하실 수 있습니다. mtDNA의 biogenesis를 시각화하고 계량하는 능력은 mitochondrial biogenesis 조절하고 약물 독성, 노화, 암 및 neurodegenerative 질병와 관련된 pathogenesis에 대한 통찰력을 제공하는 데 사용되는 메커니즘을 조사를위한 필수 도구를 제공합니다. 우리의 기술은 감각 뉴런뿐만 아니라 다른 세포 유형에 적용됩니다. mtDNA의 biogenesis를 측정하는이 기법의 사용은 모두 정상 세포 생리학뿐만 아니라 장애인 질병 상태에 대한 이해를 발전에 중요한 의미가 있습니다.
1. 뉴런의 준비
클릭 IT 에듀 Microplate 어세이 키트의 준비
클릭 IT 에듀 Microplate 분석 키트에서 대부분의 구성 요소와 미리 만들어 4 저장됩니다 ° C [2X 클릭 IT 반응 버퍼 (10X 컴포넌트 E), CuSO4 (100 MM, 구성 요소 F)를 클릭 - IT 이두 정착액 ( 구성 요소 D) 및 차단 버퍼 (2X 구성 요소 H)]. 클릭 IT 에듀 버퍼 첨가제 (10X 구성 요소 G)은 시간이 지남에 따라 노란색 - 갈색 변하는 그것을 방지하기 위해 -20 ° C에 저장됩니다. 이 구성 요소는 반복 동결 - 해동 사이클을 허용합니다.
오레곤 그린 488 azide (컴포넌트 B)은 동결 - 해동 사이클을 최소화하기 위해 작은 aliquots (10-20 μL)으로 나누어 -20 ° C.에 보관해야
안티 - 오레곤 그린 HRP 공액 (구성 요소 I)의 주식 솔루션을 준비하려면, 유리병에 밀리 Q DH 2 O 75 μL를 추가합니다. 거품 방지 및 저장 4 ° C.에 부드러운 pipetting 또는 반전에 의해 믹스 와동하지 마십시오.
TSA 키트의 준비 HRP 염소 안티 - 토끼 IgG와 알렉사 플루어 488 Tyramide 키트와 함께 # 12,
tyramide 재고 솔루션을 준비하려면, DMSO (구성 요소 B) 150 μL에 (알렉사 플루어 488 tyramide, 구성 요소 A) 고체 물질을 분해. 모든 tyramide 코팅에게 유리병의 측면을 분해하기 위해 유리병 여러 번 반전. ≤ -20에서 작은 aliquots의 상점 재고 솔루션 (10-20 μL) ° C, desiccated과 빛으로부터 보호.
2. 클릭 IT 5 - ethynyl - 2 - deoxyuridine (이두) 레이블
참고 : 모든 솔루션 부드럽게 상실 세포없이 액체를 제거하는 끝에 부착된 200 μL 팁과 벌브 전송 피펫과 함께 제거됩니다. 보통 너무 적극적으로 해결책을 제거하는 진공 라인을 사용하지 마십시오. 전구의 피펫은 부드럽게 철저 이전 솔루션을 씻어 씻으 솔루션의 200-300 μL와 coverslips을 범람하는 데 사용됩니다.
2 X 반응 칵테일 구성 요소를 클릭합니다 - IT 에듀 Microplate 어세이 키트에서 아르 | 하프 볼륨 : 1280 μL |
밀리 Q DH 2 O | 1132.8 μL |
2X 클릭 IT 반응 버퍼 (10X 컴포넌트 E) | 100.3 μL |
클릭 IT 에듀 버퍼 첨가제 (10X 컴포넌트 G) | 25.6 μL |
CuSO 4 (100 MM, 컴포넌트 F) | 25.6 μL |
오레곤 그린 Azide (구성 요소) | 6.4 μL |
합계 | 1290.7 μL |
3. 에듀 신호의 Tyramide 신호 증폭 (TSA)
4. 대표 결과 : Mitochondrial DNA 복제의 시각화 Mitochondrial Biogenesis의 마커로
우리는 감각 뉴런 (그림 1)는 mitochondria의 수를 조절하는 방법에 관심이 있습니다. 이 프로토콜은 새로운 mitochondria을 측정하는 방법으로 형광 마커와 새로 합성된 mtDNA 레이블을 것입니다. 녹색 형광 신호 (그림 2)와 mtDNA의 라벨에있는 알렉사 - 플루어 488 tyramide 결과 오레곤 그린 - azide와 후속 증폭의 Click 화학 다음에 합성 염기 에듀의 결합. 제대로하면, 증폭 녹색 신호는 형광 배경 (예 : 셀룰러 autofluorescence 또는 HRP - TSA 반응의 부작용 등)보다 충분히 높다.
이 기술은 뉴런 (그림 3)의 subcellular 구획 내에 mtDNA biogenesis를 시각화하고 계량하기 위해 새로 복제 mtDNA 레이블을하도록 설계되었습니다. 에듀 라벨은 neurofilament (그림 3D) 등 다른 세포 마커를 라벨 이후 형광등 immunocytochemistry를 허용합니다.
TSA 반응은 이러한 알렉사 플루어 594 - tyramide 등 다른 형광 알렉사 플루어의 tyramides와 함께 할 수 있습니다. 핵에있는 오레곤 그린 - azide 클릭 반응하지만 전에 TSA에 감지됩니다 mtDNA에없이 녹색 신호에서 녹색 형광 신호를 핵이 발생합니다. 알렉사 플루어 594 - tyramide로 증폭이 핵 라벨을 intensifies과 빨간색 형광 신호 (그림 4)와 mtDNA의 통합 에듀를 보여준다. 유사한 증폭 절차가 새로 합성 mtDNA (그림 5)에 BrdU의 설립을 시각화하는 데 사용됩니다 그러나,이 방법은 추가 단계 에듀에 필요한도 않았습니다 가혹한 산성 (HCL) 또는 효소 소화에 의해 BrdU 에피토프를 복구할 필요 라벨.
그림 1. 대표 차등 간섭 대비 (DIC) 배아의 이미지 (왼쪽)와 성인 (오른쪽) 일반적으로 분석. 바 = 10 μm의에 사용되는 등의 루트 신경절 (DRG) 뉴런.
그림 2. 녹색 형광 신호와 mtDNA의 이두를 라벨에 대한 절차를 나타내는 설계도를 그림. 도식은 녹색 형광 신호와 mtDNA의 이두를 라벨에 대한 3 단계 프로토콜을 나타냅니다. Mitotically 활성 F11 neuroblastoma 세포는 긍정적인 제어 역할과 핵 및 mitochondrial DNA에 통합되었다 에듀의 상표 패턴을 보여줍니다. 첫 번째 단계 (P1)은 에듀의 존재의 세포를 잠복기가 새로 합성 mtDNA에 thymidine 아날로그를 포함하는 것입니다. 두 번째 단계 (P2)는 오레곤 그린 - azide와 통합 에듀 레이블을 클릭하여 화학을 기반으로합니다. 녹색 신호는 핵 DNA를 복제 세포의 핵에서 볼 수 있습니다. 마지막 단계는 (P3) 오레곤 할머니를 증폭하는 것입니다오레곤 그린에 대한 HRP - 복합 토끼 항체와 잠복기에 의해 een - azide 신호는 알렉사 플루어 mtDNA에서 녹색 신호를 시각화하는 과산화수소의 존재에 표시된 tyramide 488 (H 2 O 2)와 부화하여 따라갔다.
그림 3. 지느러미 루트 신경절에서 mtDNA의 에듀 라벨 (DRG) 뉴런. 뉴런은 에듀와 함께 incubated되며 신호가 연속적으로 mtDNA되는 통합 EDU을 나타내기 위해 증폭됩니다. 배아 (A)와 성인 (BD) DRG의 신경 모두 새로 합성된 mtDNA에 포함 증폭 에듀 (EDU - OG - TSA, 녹색)의 작은 반점이있는 녹색 신호를 보여주는 전송 조명에 중첩 대표 형광 이미지. 에듀 라벨 절차는 neurofilament (D, αNF, 빨간색)으로의 연결을 마커의 후속 immunofluorescence 얼룩을 허용합니다. 스케일 바 = 10 μm의.
그림 4. 붉은 형광 신호와 mtDNA의 이두를 라벨에 대한 절차를 나타내는 설계도를 그림. 개략도 붉은 형광 신호와 mtDNA의 이두를 라벨에 대한 3 단계 프로토콜을 나타냅니다. Mitotically 활성 F11 neuroblastoma 세포는 긍정적인 제어 역할과 핵 및 mitochondrial DNA에 통합되었다 에듀의 상표 패턴을 보여줍니다. 첫 번째 단계 (P1)은 에듀의 존재의 세포를 잠복기가 새로 합성 mtDNA에 thymidine 아날로그를 포함하는 것입니다. 두 번째 단계 (P2)는 오레곤 그린 - azide와 통합 에듀 레이블을 클릭하여 화학을 기반으로합니다. 녹색 신호는 핵 DNA를 복제 세포의 핵에서 볼 수 있습니다. 마지막 단계는 (P3) 오리건 그린에 대한 HRP - 복합 토끼 항체와 잠복기하여 오레곤 그린 - azide 신호를 증폭하는 것은 알렉사 플루어 시각화하는 과산화수소의 존재에 594 표시 tyramide (H 2 O 2)와 인큐베이션 다음 mtDNA의 빨간 신호.
그림 5. BrdU 분류 및 mtDNA에 녹색 또는 빨간색 형광 신호 tyramide 신호 증폭. 설계도 그림 중 녹색 또는 빨간색 형광 신호를 새롭게 합성 mtDNA에 BrdU를 라벨에 대한 절차를 나타냅니다. 초기 단계는 에듀 라벨에 대한 필요하지 않습니다 중 하나 산성 (HCL) 또는 효소 소화에 의해 BrdU 에피토프를 복구해야합니다. 다음 단계는 마우스 기본 방지 BrdU 항체와 잠복기 있습니다. 이 양고추냉이 퍼옥시데이즈 (HRP) 복합 염소 항 마우스 항체와 잠복기옵니다. 마지막으로, 신호는 mtDNA의 신호를 시각화하는 과산화수소의 존재에 녹색 또는 빨간색 찬란 분류 tyramide (H 2 O 2)와 함께 증폭됩니다.
우리는 이두의 tyramide 신호 증폭을 사용하여 개별 셀을 새로 합성 mtDNA를 라벨에 민감한 분석을 개발했습니다. 이 프로토콜의 최적화 중에 가장 큰 문제 중 하나는 coverslips 사이에 일관성없는 결과가되었다. 변경 사항은 개별 coverslips에 작은 볼륨을 혼합하고 마스터 솔루션은 모든 coverslips에 사용할 수 있도록 피하기 위해 Invitrogen 키트 프로토콜되었다. 각 12mm 원형 유리 coverslip에 사용되는 75-80 μL는 샘플 사이에 일관성있는 결과를 줄 정도로 솔루션을 제공하면서 완전히 표면 영역을 커버하는 이상적인 볼륨입니다. 배양 시간 및 시약의 농도가 최적화된했지만 개선은 그들에게 조정과 함께 볼 수 있습니다.
프로토콜은 한 번 각각의 프로세스를 실행하도록 설계되었습니다. 그러나, 몇 가지 단계는 첫 번째 시도 후 실패 샘플을 복구할 수있는 새로운 솔루션을 반복했습니다. 특히, 에듀 클릭 반응 단계 (3.4-3.6)는 형광 배경에 상당한 증가없이 반복되었습니다. 안티 오레곤 그린 - HRP 항체 보육 (4.1-4.3) 및 tyramide 증폭 (4.4-4.5) 단계는 반복하지만, 더 자주하기 때문에 증가 배경 형광의 노이즈 비율에 가난한 신호를 발생합니다.했습니다
가장 민감한 시약은 클릭 IT 에듀 Microplate 분석 키트에서 클릭 IT 에듀 버퍼 첨가제 (컴포넌트 G)와 토끼 방지 오레곤 그린 - HRP 항체 (구성 요소 I)입니다. ° C 및 6-12 개월 사이가 상당히 어두워 4 저장할 때 클릭 IT 에듀 버퍼 첨가제 점차 시간이 지남에 따라 노란색으로 변합니다. -20 °에서 클릭 IT 에듀 버퍼 첨가제의 스토리지 C는이 문제를 완화합니다. 레이블 및 tyramide 증폭 단계 토끼 방지 오레곤 그린 - HRP 항체가 MilliQ DH 2 O.에서 reconstituting의 4-6개월 이내에 사용할 때 최고의 작품
mtDNA의 이두의 온화 라벨링 추가 셀룰러 마커 9-11과 직접 비교를 허용하고 같은 취급은 복구할 수 있어야합니다 5 - 브로모 - 2 - deoxyuridine (BrdU), 다른 thymidine의 analogs를 통해이 기술의 유틸리티를 향상 DNA 이내에 에피토프. 저희 연구실 11-12과 다른 13-15 성공적으로 mtDNA를 레이블에 BrdU를 사용했습니다. BrdU 라벨 기술은 에듀에 사용되는 것과 비슷하지만 몇 가지 중요한 차이점 (그림 5)을하고 있습니다. 위에 나열된 permeabilization 단계 (3.1-3.2) 후, BrdU 에피토프은 변성 단계로 복구됩니다 (37시 30 분 2 N HCL ° C가 1X PBS 세 세척 다음). BrdU는 다음 BrdU에 대한 일차 항체로 분류된다 (벡터 실험실 TSA 키트에서 1퍼센트 차단 솔루션 1시 50분 희석 4 ° C에서 하룻밤 incubated). 이차 항체 단계 이전에 BrdU 신호 (염소 안티 - 마우스 IgG 1% 차단 솔루션 1:100 희석 TSA 키트 # 2와 # 5에서 HRP을 복합하여 실온에서 45 분 incubated)를 증폭하기 위해 필요 TSA 단계 (위 4.3-4.5). 레이블 mtDNA 두 thymidine의 analogs, 에듀와 BrdU를하는 것이 mtDNA가 순차적으로 펄스 분류 패러다임 11 표시 수있는 이중 레이블 실험을 수행하는 데 유리합니다.
저희 연구실은 당뇨병 신경 장해, 당뇨병의 일반적인 합병증의 맥락에서 mitochondrial biogenesis의 규정을 검토 에듀와 mtDNA의 BrdU 라벨을 사용하고 있습니다. 우리는 성공적으로 개별 뉴런 11-12의 mtDNA biogenesis의 변화를 측정하기 위해 신호 증폭을 사용합니다. 이 기술은 mtDNA 복제 및 매출이나 mtDNA 합성을 억제 약물을 식별을위한 메커니즘을 탐구하기위한 다른 실험에 유용하게 사용될 것입니다. 또한, 확장 에듀와 BrdU 신호의 기본 원리는 다른 연구에 적용할 수 수 측정 DNA 복제 또는 복구합니다.
이 작품은 보건 기금의 국립 연구소 NS - 38849과 DK - 076160, 당뇨병의 합병증 연구에 대한 소아 당뇨병 연구 재단 센터에 의해 지원 되었음 : 신경과 연구와 발견과에서 A. 알프레드 타어브먼 의학 연구소에 대한 프로그램 미시간 대학. 이 작품은 형태론과 당뇨병과 소화기 및 신장 질환 국립 연구소에서 보건 부여 5P60 DK - 20572 국립 연구소에 의해 자금 미시간 당뇨병 연구 및 교육 센터의 이미지 분석 코어를 사용했습니다. 저자에 그의 귀중한 조언을 분자 프로브 / Invitrogen에서 스콧 T. 클라크 감사 다양한 클릭 그것이 에듀의 증폭 기술의 초기 개발을 지원하는 키트와 시약의 관대한 기부 라벨 이두.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
12 mm coverslips | Fisher Scientific | 12-545-82 | |
245 mm x 245 mm BioAssay Dish | Corning | 431111 | |
Parafilm M | Fisher Scientific | PM-996 | |
paraformaldehye | Sigma-Aldrich | P6148 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T-8532 | |
Phosphate buffered saline 10X solution | Fisher Scientific | BP399 | |
Transfer Pipet | Fisher Scientific | 13-711-7M | |
Hydrogen peroxide, 30% in water | Fisher Scientific | BP2633 | |
Click-iT EdU Microplate Assay Kit | Invitrogen | C10214 | |
TSA Kit #12, with HRP—goat anti-rabbit IgG and Alexa Fluor 488 tyramide | Invitrogen | T20922 | |
TSA Kit #15, with HRP–goat anti-rabbit IgG and Alexa Fluor 594 tyramide | Invitrogen | T20925 | |
ProLong Gold antifade reagent with DAPI | Invitrogen | P-36931 | |
Polyclonal rabbit Neurofilament antibody | Chemicon International | AB1981 | |
Mouse monoclonal anti-BrdU antibody | Vector Laboratories | VP-B209 | |
TSA Kit #2, with HRP—goat anti-mouse IgG and Alexa Fluor 488 tyramide | Invitrogen | T20912 | |
TSA Kit #5, with HRP—goat anti-mouse IgG and Alexa Fluor 594 tyramide | Invitrogen | T20915 |
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