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Method Article
이 프로토콜은 라벨이 없는 임피던스 측정을 사용하여 단일 마이크로 전극에서 성장한 단일 세포 층으로부터 작용제 유발 GPCR 활성화에 대한 전체 용량 응답 관계를 실시간으로 기록하는 것을 보여줍니다. 새로운 도징 방식은 시간 해결 의 손실없이 처리량을 크게 증가시킵니다.
라벨프리 임피던스 계 세포 계 세포 배양 실험에서 리간드 유도 GPCR 활성화를 비침습적으로 연구하는 데 점점 더 사용되고 있다. 이 접근 방식은 수십 밀리초까지 디바이스 에 의존하는 시간 해상도로 실시간 셀 모니터링을 제공하며 고도로 자동화되어 있습니다. 그러나, 샘플 수치가 높아지면(예를 들어, 다양한 리간드에 대한 투여량-응답 연구), 일회용 전극 어레이에 대한 비용뿐만 아니라 순차적 웰바이웰 레코딩에 대한 가용 시간 분해능이 제한될 수 있다. 따라서, 우리는 여기에서 라벨없는 GPCR 분석의 출력을 현저하게 증가시킬 가능성이 있는 직렬 작용제 추가 프로토콜을 제시합니다. 직렬 작용제 추가 프로토콜을 사용하여 GPCR 주작동근은 샘플의 임피던스(agonist 모드)를 지속적으로 모니터링하면서 단일 세포 층에 농도를 증가시키면서 순차적으로 추가됩니다. 이 직렬 접근법을 통해, 이제 단 하나의 단일 세포 층에서 GPCR 작용제에 대한 전체 투여량 응답 곡선을 확립할 수 있다. 직렬 작용제 첨가 프로토콜은 상이한 GPCR 커플링 유형, Gq Gi/0 또는 Gs에 적용 가능하며, 연구 하에 수용체의 재조합 및 내인성 발현 수준과 호환된다. GPCR 길항제에 의한 수용체 차단은 또한 평가할 수 있다(길항제 모드).
본 보고서는 라벨프리 임피던스 측정에 의해 부착적으로 성장한 세포에서 리간드 유도 G 단백질 결합 수용체(GPCR) 활성화의 정량화를 위해 개발된 직렬 첨가 프로토콜에 대한 상세한 설명을 제시한다. G 단백질 결합 수용체(GPCRs)는 다수의 생리적 기능 및 인간 질환에 관여한다1. 이 것 및 세포 표면에 그들의 좋은 접근성 때문에, GPCRs는 가장 중요 한 약물 목표 중 하나입니다. 이 평가는 GPCR을 표적으로 하는 ~700의 승인된 약의 추정수에 반영됩니다, 모든 판매된 약에 ~ 35% 점유율에 해당2.
새로운 약물의 개발은 두 가지 중앙 프로세스로 구성됩니다 : (i) 생물학적 표적 분자의 식별 및 기능적 특성화, (ii) 새로운 납 물질의 발견 및 관리 가능한 약물로의 개발. 두 프로세스 에서, 효율적인 방법은 정량적으로 약물 표적 상호 작용 및 후속 생물학적 다운스트림 반응을 평가하는 데 필요합니다. 전 임상 약물 개발 과정의 다른 단계는 약물과 표적 간의 생체 분자 상호 작용 연구, 배양 세포에 대한 기능적 연구, 절제된 장기 물질 또는 전체 동물에 대한 실험에 이르기까지 다양한 분석 방법을 사용합니다. 둘 다, 생리적 중요성과 생물학적 복잡성은전자에서 후자3로 증가한다. 동물 실험을 최소화하는 것이 전반적인 목표이지만, 실험실 동물 또는 전체 동물의 고립 된 장기를 사용한 약리학 연구는 신약 후보물질의 포괄적 특성화에 불가피한 것으로 간주됩니다. 분석 판독의 관점에서, 장기 약리학 연구는 가장 높은 생리적 관련성의 원위, 통합 "전체론적"기능 적 반응을 제공합니다. 이러한 실험의 단점은 기술적 및 윤리적 이유에 대한 높은 처리량 스크리닝과 호환되지 않으며 체외 세포 배양에 기초한 연구에 의해 대체되었다는 것이다4.
세포 배양에서 GPCR 활성화를 정량화하는 방법은 상이한 라벨 기반 화학 분석을 포함하며, 이는 특히 제2 메신저, 다운스트림 신호 단백질의 인산화 상태, 특정 전사 인자 또는 리간드 유도 세포내 수용체 인신매매를 통한 전사 활성화를검출하는4,5. 이러한 라벨 기반 검사의 단점은 잠재적으로 유해한 염료 또는 방사성 마커로 세포를 라벨하는 필요성입니다. 이는 종종 선행을 지정해야 하는 노출 시간에 대한 엔드포인트 결정으로 분석기를실행해야 합니다. 라벨 기반 종점 분석을 사용 하 여 실험의이 매우 제한 되 고 편향 된 타이밍 및 화학 라벨 및 프로브 일반 세포 생리를 방해할 수 있는 위험에서 고통 – 잠재적으로 실험자에 의해 주목.
최근에는 GPCR 활성화를 모니터링하기 위한 라벨없는 검정법이 등장하고 있으며, 임피던스 기반 기술 또는 공진 도파관격자를적용하는 광학 적 방법 등5,6. 세포의 라벨링은 실험적으로 이러한 접근법에 필요하지 않습니다. 이러한 물리적 판독은 낮은 진폭 신호에서 작동하므로, 이러한 방법은 비침습적으로 간주되며, 잠재적으로 실시간으로 연속 적인 세포 모니터링을 허용하고 관찰 시간은 판독이 아닌 셀 배양에 의해서만 제한된다. 전체 기관에서 판독과 유사, 라벨없는 접근은 일반적으로 전체적인 세포 응답에 보고, 전체 신호 네트워크를 따라 통합 할 때 수용체 활성화의 멀리 하류는 시간 의존하지만 오히려 비특이적 인 변화로 이어질 세포 형태 또는 대량 재분배. 임피던스 계 측정은 세포 형상7,8의변화의 유전체 서명을 측정하는 반면, 공진 도파관 격자를 이용한 측정은 동적 질량 재분배(DMR) 9에서발생하는 세포 기판 계면에서굴절률의 변화에 민감하다. 통합 문자는 G 단백질의 유형 (Gq,Gi/0,Gs, G12/13)또는 β-arrestin 신호 캐스케이드6에 관여하는 수용체 매개 사건에 관계없이 매우 민감하고 수용체의 내인성 발현 수준에 매우 적합한 무첨가 방법을 만든다.
표준 라벨 프리 임피던스 계 분석에서 세포는 각 웰10의바닥에 증착된 코플라나 금막 전극을 가진 다중 웰 플레이트에서 부착적으로 성장한다. 이러한 전극 어레이는 임피던스 분석기와 연결되어 있으며 실험 자극에 대한 셀 응답은 시간 해결된 임피던스 판독값에 의해 개별 우물에서 기록됩니다. 전형적인 GPCR 분석에서 리간드가 각 개인에게 개별적으로 상이한 농도로 잘 첨가된다. 임피던스 시간 코스에서 리간드-유도 변화는 리간드의 효능 및 효능을 정량화하기 위해 최대 신호 변화, 곡선 아래 영역, 지정된 시간 간격 또는 곡선의 기울기 내의 신호 변화와 같은 특성 곡선 특징에 대하여 분석된다(11).
전극 어레이의 비용은 높은 처리량 스크리닝(HTS) 캠페인에서 이 기술의 적용을 제한할 수 있습니다. 더욱이, 병렬로 따라야 할 샘플의 수가 증가함에 따라 개별 측정의 수가 증가하고, 따라서 각 웰에 대한 사용 가능한 시간 분해능을 점차적으로 감소시킵니다 - 심지어 최첨단 멀티 채널 기록의 경우에도 마찬가지입니다. 이러한 조건하에서 빠르고 과도적인 세포 반응은 측정을 피할 수 있다. 또한, 종래의 웰-하나의 집중 접근법은 리간드-GPCR 상호작용 분석에서의 적합성과 관련하여 관전된 오르간 온 칩 또는 바디 온 칩 개발에 상당한 시간과 비용 계수를 부과한다.
이러한 이유로, 우리는 주작동근 농도가 단계적으로 증가하는 동안 단일 웰의 임피던스를 지속적으로 모니터링하여 배양 된 세포 단층에서 리간드 유도 GPCR 활성화의 전체 용량 응답 곡선의 기록을 가능하게하는 단계적 투약 프로토콜을 개발했습니다. 직렬 작용제 첨가 프로토콜은 히스타민 1 수용체(H1R)를 내인성으로 발현하는 인간 U-373 MG 세포의 현재 예에 나타난 바와 같이, 1농도에서 10개 이상의 농도로 웰당 처리량을 크게 증가시킨다. 따라서, 이 방법은 라벨없는 투여 량 응답 연구에서 처리량을 크게 향상시킬 수있는 잠재력을 가지고 있으며, 시간 해상도는 도구 최대값으로 유지됩니다.
1. 전극 어레이의 셀 시딩
참고: 전극 레이아웃 선택은 연구 중인 셀수의 민감도와 수 간의 절충입니다. 전극이 작을수록 측정값이 더 민감하지만 연구 중인 셀 수가 작아지다. 기준 선 조건 하에서 시간이 지남에 따라 강한 임피던스 변동을 보이는 셀의 경우 더 크거나 디지털화된 전극이 바람직합니다.
2. 혈청이없는 배지에서 세포의 평형화
3. 임피던스 판독값으로 셀 평형 모니터링
4. 주작동근 모드에서 실험을위한 주작동제 솔루션 준비
참고: 복제 수를 고려하고 각 농도 단계에 대한 "솔루션-추가"의 총 볼륨을 계산합니다. 일반적인 계산 결과는 표 1-4에표시됩니다. 상기 범위가 직렬 첨가 동안 투여될 부분의 농도 및 수를 정의함에 따라 연구될 작용제 농도 범위에 대한 일반적인 아이디어가 필요하다. 직렬 작용제 첨가 프로토콜을 사용하여 작용제 농도가 단계적으로 증가한다. 따라서, 다음 투여량이 첨가될 때 이미 웰에 있는 작용제의 양을 고려해야 한다. 웰내에 이미 존재하는 작용제 분자의 수가 nx=c x∙V x(현재 농도 cx 및 부피 Vx)이고다음 첨가 후 웰 내의 분자 수가 nx+y인경우,ny를 첨가할 분자의 수는 웰에 적용될 용액의 농도 cy 및 부피Vy에 의해 결정된다(ny=c y.y). 주 작동 근의 일부를 추가 한 후, 웰에 있는 작용제 분자의 새로운 양은: cx+y ∙ Vx+y = c+V + cy ∙ Vy. 이 계산은 각 후속 단계에 적용됩니다. 각 단계마다 첨가되는 부분의 아고니스트 농도및 아고니스트의 양이 상호 의존하기 때문에, 각 단계 마다 미리 최종 농도를 정의하는 것이 중요하다.
모드 1: 액체가 지속적으로 첨가됨에 따라 우물의 부피가 각 단계마다 증가합니다.
이 모드와 8웰 형식을 사용하여 Vx1 = 200 μL 및 Vy1을 사용합니다....
모드 2: 각 단계에 추가된 볼륨이 후속 추가 직전에 제거됨에 따라 웰의 볼륨은 일정합니다.
이 모드와 96웰 형식을 사용하여 Vx1 = 150 μL 및 Vy1을 사용합니다.... Vyi = 75 μL.
5. 길항제 모드에서 실험을위한 주작동근 솔루션의 준비
참고: 전체에 적용할 농도로 길항제 용액을 준비합니다. 길항제 용액의 부피 와 농도는 작용제 첨가 모드 (1 또는 2)에 따라 달라집니다. 추가 모드에서 8-웰 또는 96 웰 포맷의 실험예:(A) 8웰 포맷(Vx1 = 200 μL, V길항제 = 200μL); (B) 96 웰 포맷 (Vx1 = 150 μL, V길항제 = 75 μL).
6. 주작동근 모드에서 직렬 추가 프로토콜 수행
A : 모드 1 / 8 웰 형식
B : 모드 2 / 96 웰 형식
참고: 96웰 형식으로 실험을 실행할 때 임피던스 계측기의 소프트웨어를 통해 각 액체 처리 단계(추가/제거)에서 데이터 수집을 일시 중지합니다. 보다 정교한 액체 처리는 데이터 수집을 방해할 수 있습니다. 다중 채널 파이펫을 사용합니다.
7. 길항 모드에서 직렬 추가 프로토콜 수행
8. 데이터 내보내기 및 분석
참고: c는 작용제 농도를 나타내고,A1은 최소이고 A2는 지그모이드 투여량-반응 곡선의 최대 점근수(A2 = E Max)이다. EC50은 곡선의 변곡점에서의 농도이며, n은 언덕 경사에 해당한다.
다양한 주작동근 용액을 준비하기 위한 전형적인 계획은 표 1-4에서히스타민과 함께 8웰 전극 어레이를 이용한 실험에 대해 도시된다. 표 1 및 표 2는 추가 모드 1(cf., 도 1)을사용하여 실험에 대한 부피 및 농도를 제시하고, 표 3 및 표 4는 추가 모드 2(참조, 도 1)에따...
이 프로토콜은 동일한 수용체에 대한 특정 길항제의 부재 또는 존재 시 작용제-유도 GPCR 활성화의 투여량-반응 관계를 결정하기 위한 무임피던스 측정 방법을 기술한다. 이 방법의 개념 증명은 최근 간행물12에발표되었다. 우리의 지식에 그것은 시험관에서 단일 세포 층을 사용 하 여 주 작동 근 중재 GPCR 활성화의 전체 복용량 응답 곡선의 설립을 설명 하는 첫 번째 연구. 접근은 ...
저자는 공개 할 것이 없다.
우리는 세포 배양 및 실험 용액의 준비에 도움을 주셔서 바바라 고릭크와 나드자 힌터리터에게 감사드립니다. 저자는 감사하게도 연구 훈련 그룹에 의해 재정 지원을 인정 1910 "선택적 GPCR 리간드의 의약 화학" 보조금 번호에 따라 독일 연구 재단에 의해 자금 (DFG) 222125149. JAS는 특히 바이에른 남녀 평등 프로그램에 의해 부여된 장학금에 감사드립니다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Bürker counting chamber | Marienfeld (Lauda-Königshofen, Germany) | 640210 | |
cell culture flasks 25 cm2 | Greiner bio-one (Frickenhausen, Germany) | 690175 | |
Cell incubator (Heraeus Function Line BB15) | Thermo Scientific (Darmstadt, Germany) | \ | |
Centrifuge (Heraeus 1S-R) | Thermo Scientific (Darmstadt, Germany) | \ | |
Diphenhydramine hydrochloride | Sigma Aldrich (Taufkirchen, Germany) | D3630 | |
Eagle's Minimum Essential Medium with 4.5 g/L D-Glucose and 2.2 g/L NaHCO3 | Sigma Aldrich (Taufkirchen, Germany) | D5671 | |
Impedance Instrument (ECIS Zθ) | Applied BioPhysics Inc. (Troy, NY, USA) | \ | |
8-well electrode Arrays (8W1E PET) | Applied BioPhysics Inc. (Troy, NY, USA) | \ | PET base with 0.049 mm2 working electrode and ~50 mm2 counter electrode (gold) |
96-well electrode arrays (96W1E+ PET) | Applied BioPhysics Inc. (Troy, NY, USA) | \ | PET base with two electrodes (gold) with 0.256 mm2 total electrode area |
Fetal calf serum (FCS) | Biochrom (Berlin, Germany) | S0615 | |
Histamine dihydrochloride | Carl Roth (Karlsruhe, Germany) | 4017.1 | |
Laminar flow hood (Herasafe, KS 12) | Thermo Scientific (Darmstadt, Germany) | 51022515 | class II safety cabinet |
Leibovitz' L-15 medium | Thermo Scientific (Darmstadt, Germany) | 21083-027 | |
L-glutamine | Sigma Aldrich (Taufkirchen, Germany) | G7513 | |
Micropipette large (100 - 1000 µL) | Brandt (Wertheim, Germany) | 704780 | |
Micropipette large (20 - 200 µL) | Brandt (Wertheim, Germany) | 704778 | |
Microscope (phase contrast, Nikon Diaphot) | Nikon (Düsseldorf, Germany) | ||
Penicillin/streptomycin | Sigma Aldrich (Taufkirchen, Germany) | P0781 | |
Phosphate buffered saline (PBS) | Sigma Aldrich (Taufkirchen, Germany) | D8537 | |
Pipette, serological | Greiner bio-one (Frickenhausen, Germany) | 607 180 | |
Pipettor (accu-jet pro) | Brandt (Wertheim, Germany) | 26300 | |
Trypsin | Sigma Aldrich (Taufkirchen, Germany) | T4174 | in PBS with 1 mM EDTA |
Tube, 15 mL | Greiner bio-one (Frickenhausen, Germany) | 188 271 | |
Tube, 50 mL | Greiner bio-one (Frickenhausen, Germany) | 210 261 | |
U-373 MG cells | ATCC (Rockville, MD, USA) | ATCC HTB-17 | |
water bath (TW21) | Julabo (Seelbach, Germany) | \ |
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