신경 문장 세포에서 기계적 신호를 연구하기 위한 최적화된 O9-1/하이드로겔 시스템

요약

상세한 단계별 프로토콜은 다성 성 O9-1 신경 문장 세포및 다양한 강성의 폴리 아크릴아미드 하이드로겔을 사용하여 시험관 내 기계적 신호를 연구하기 위해 여기에 설명되어 있습니다.

초록

신경 문장 세포 (NCC)는 다양한 장기와 조직을 초래하는 세포 모형의 넓은 배열로 이동하고 분화할 수 있는 척추동물 배아 다능성 세포입니다. 조직 강성은 NCC 분화에서 중요한 역할을 하는 물리적 인 단서인 기계적 힘을 생성합니다. 그러나 메커니즘은 불분명합니다. 여기에 설명된 방법은 다양한 강성의 폴리아크릴아미드 하이드로겔의 최적화된 생성, 이러한 강성의 정확한 측정, 그리고 생체 내 를 모방하는 NCC 라인인 O9-1 셀에서 기계적 신호의 영향 평가를 위한 상세한 정보를 제공한다.

하이드로겔 강성은 원자력 현미경검사(AFM)를 사용하여 측정되었으며 그에 따라 상이한 강성 수준을 나타냈다. 다양한 강성의 하이드로겔에 배양된 O9-1 NcC는 기계적 신호 변화로 인한 다양한 생물학적 효과를 나타내는 스트레스 섬유의 세포 형태와 유전자 발현을 상이하게 나타냈다. 더욱이, 하이드로겔 강성을 변화시켜 젤 강성을 변경하고 NcC의 분자 및 유전적 규제를 분석함으로써 기계적 신호를 조작하는 효율적인 체외 계통이 발생한다는 것을 확립했습니다. O9-1 NcC는 해당 분화 매체의 영향으로 광범위한 세포 유형으로 분화할 수 있으며, 생체 내에서화학 신호를 조작하는 것이 편리하다. 따라서, 이 체외 시스템은 NNC에서 기계 신호의 역할과 화학 신호와의 상호 작용을 연구하는 강력한 도구이며, 이는 연구원이 신경 문장 발달 및 질병의 분자 및 유전 메커니즘을 더 잘 이해하는 데 도움이됩니다.

서문

신경 문장 세포 (NCC)는 다양한 장기및 조직의 개발에 기여하고 마이그레이션하고 기여하는 놀라운 능력을 가진 척추 동물 배아 발생 시 줄기 세포의 그룹입니다. NCC는 감각 뉴런, 연골, 뼈, 멜라닌세포 및 원활한 근육 세포를 포함한 상이한 세포 유형으로 분화할 수 있으며, 축 기원의 위치와 NCC^1,2의 국소 환경 지침에 따라 분화할 수^있다. 다양한 세포 유형으로 분화할 수 있는 능력으로, 신경 문장(NC) 발달단계에서 난독증을 유발하는 유전적 이상이 수많은 선천성 질환으로 이어질 수^{있다 2.} 예를 들어, NcC의 형성, 이동 및 발달 중 의 혼란은 신경^{근증증1,3로}통칭되는 발달 장애로 이어진다. 이러한 질병은 트리처 콜린스 증후군과 같은 NCC 형성의 실패로 인한 두개골 면결에서 부터 흑색종^{3,4,5,6에서}볼 수 있듯이 NCC 전이성 철새 능력으로 인한 다양한 암의 발달에 이르기까지 다양하다. 지난 수십 년 동안, 연구원은 개발 및 질병에 있는 NcC의 역할 그리고 기계장치에 관하여 현저한 발견을 했습니다, 사실 인정의 대다수는 화학^신호에집중되고 있는^7,8. 최근에는 NCC 개발^9,10에서기계적 신호가 중요하지만 제대로 이해되지 않은 역할을 하도록 지시되었습니다.

NCC의 환경 단서는 다양한 세포 유형으로 NCC 분화의 규제를 포함하여 개발 중에 중요한 역할을합니다. 환경 단서, 예를 들어, 물리적 단서, 기능 적 다양화와 같은 중추적 인 행동 및 세포 반응에 영향을 미칩니다. 메카노트랜스듀션은 세포가 다양한 생물학적 과정을 유지하기 위해 이러한 단서를 감지하고 반응할 수^{있도록 2.} NCC는 세포외 매트릭스(ECM)와 같은 주변 세포 및 상이한 기판에 둘러싸여 있어 항상성을 유지하고 운명 결정, 증식 및 세포멸을 통해 변화에 적응하기 위해 기계적 자극을 야기할 수^있다. 메카노트랜스듀션은 기계적 세포외 자극의 감각 성분이 발생하는 플라즈마 멤브레인에서 시작하여^{세포(12)의}세포내 조절을 초래한다. 플라즈마 멤브레인의 통합, 초점 접착 및 접합부는 전단력, 응력 및 주변 기판의 강성과 같은 기계적 신호를 화학 신호로 전달하여 세포^{반응(12)을}생성한다. 플라즈마 멤브레인에서 최종 세포 조절에 이르는 화학 신호의 릴레이는 분화와 같은 유기체에 대한 중요한 프로세스를 마무리하기 위해 상이한 신호 경로를 통해 수행됩니다.

몇몇 연구 결과는 기질 강성에서 기계신호가 세포 분화^13,14에있는 역할을 한다는 것을 건의했습니다. 예를 들어, 이전 연구는 뇌 조직의 강성과 연약한 기판에서 자란 중간엽 줄기 세포(MSC)가 뇌 조직(0.1-1.0 kPa 범위)과 유사한 강성을 가진 것으로 나타났으며, 그 결과 뉴런 세포^{분화(15,16)가}발생한것으로 나타났다. 그러나, 더 많은 MSC는 근육의 강성을 모방8-17 kPa 기판에 성장할 때 근구와 같은 세포로 분화하고, MSC가 뻣뻣한 기판 (25-40 kPa)에 배양될 때 골세포와 같은 분화를 관찰하였다^15,16. 메카노트랜스덕션의 중요성은 잠재적으로 암, 심혈관 질환 및골다공증^17,18,19를포함한 심각한 발달 결함 및 질병으로 이어질 수 있는 기계적 신호 경로의 요철 및 이상에 의해 강조된다. 암에서는 정상적인 유방 조직이 연약하며 유방암의 위험은 뻣뻣하고 조밀한 유방 조직에서 증가하며, 유방 종양에 더 유사한^환경(15). 이러한 지식을 바탕으로 NCC 발달에 대한 기계적 신호의 효과는 체외 시스템을 통해 기질 강성의 간단한 조작을 통해 연구될 수 있으며, NC 관련 질병 진행 및 병인학의 기초를 이해하는 데 있어 추가적인 이점과 가능성을 제공한다.

NcC에서 기계 신호의 영향을 연구하기 위해, 우리는 이전에 발표 된 방법의 최적화및 다른 기계적^{신호20,21에}대한 NcC의 응답의 평가를 기반으로 NcC에 대한 효율적인 시험관 시스템을 설립했다. 다양한 하이드로겔 강성 제제 및 NNC에서 의 기계적 신호의 영향에 대한 평가를 위한 상세한 프로토콜이 제공되었습니다. 이를 위해 O9-1 NCC는 NC 모델로 활용되어 경직대 소프트 하이드로겔에 대한 반응으로 효과와 변화를 연구한다. O9-1 NCC는 8.5일째에 마우스 배아(E)로부터 분리된 안정적인 NC 세포주이다. O9-1 NcC는 정의된 분화^{매체(22)에서}다양한 NC 유래 세포 유형으로 분화할 수 있기 때문에 생체 내에서 NcC를 모방한다. NcC의 기계적 신호를 연구하기 위해, 매트릭스 기판은 생물학적기질 강성(20,^21,23)과상관관계가 있는 원하는 강성을 달성하기 위해 아크릴아미드및 비스 아크릴아미드 용액의 다양한 농도로부터 튜닝 가능한 탄성으로 제조되었다. NcC, 특히 O9-1 셀에 대한 매트릭스 기판의 조건을 최적화하기 위해 이전에 게시된^{프로토콜(20)에서}수정하였다. 이 프로토콜에서 한 가지 변화는 콜라겐 I에서 하이드로겔을 배양하는 것이었는데, 50m HEPES 대신 0.2% 아세트산으로 희석되어 하룻밤 사이에 37°C에서 이루어졌다. 아세트산의 낮은 pH는 균일한 분포와 더 높은 콜라겐 I 통합으로 이어지므로 ECM^{단백질(24)의}보다 균일한 부착을 가능하게 한다. 또한, 말 혈청과 태아소 혈청(FBS)의 조합은 인큐베이터에 하이드로겔을 저장하기 전에 인산염 완충식염수(PBS)에서 각각 10% 및 5%의 농도에서 사용되었다. 말 혈청은 10%^25의농도에서 세포 증식 및 분화를 촉진하는 능력으로 인해 FBS에 대한 추가 보충제로 사용되었다.

이 방법으로, 생물학적 환경은 ECM 단백질 코팅(예를 들어, 콜라겐 I)에 의해 모방되어^{NcC가 20,21로}성장하고 생존할 수 있는 정확한 체외 환경을 조성하였다. 준비된 하이드로겔의 강성은 탄성 계수를 묘사하는 잘 알려진 기술인 원자력 현미경검사(AFM)를통해 정량적으로 분석되었다. NcC에 대한 상이한 강성 수준의 효과를 연구하기 위해 야생형 O9-1 세포는 기판 강성의 변화에 대응하여 세포 접착및 형태학의 차이를 보여주기 위해 면역형 형광(IF)을 위한 하이드로겔에 배양및 제조되었다. 이 체외 시스템을 활용하여 연구자들은 NcC에서 기계 신호의 역할과 다른 화학 신호와의 상호 작용을 연구하여 NcC와 기계 신호 사이의 관계를 더 깊이 이해할 수 있습니다.

프로토콜

1. 하이드로겔 준비

참고: 모든 단계는 멸균을 유지하기 위해 사용하기 전에 에탄올과 자외선(UV)에 소독된 세포 배양 후드에서 수행해야 합니다. 핀셋과 파이펫과 같은 도구는 에탄올로 분사되어야 합니다. 버퍼 솔루션도 멸균 필터링되어야 합니다.

1. 아미노살란 코팅 유리 커버립의 준비
   1. 원하는 수의 유리 커버립을 실험실 닦아 조각에 놓습니다.
      참고: 3-4 커버립을 추가로 준비하여 쉽게 파손될 때 충분한 백업 소모품을 보장합니다. 유리 커버의 다른 재료는 세포 시딩과 부착의 다른 호환성을 얻을 것이다. 실험을 시작하기 전에 실험에 가장 적합한 유형을 결정하는 것이 좋습니다(재료 표참조).
   2. 알코올 버너 또는 분젠 버너를 사용하여 불꽃을 앞뒤로 통과하여 각 커버슬립을 살균하십시오(단백질 분석 실험용 30s). 각 유리 커버슬립을 실험실 닦아에 놓아 식힙니다.
   3. 유리 커버를 식히면 파막이 늘어선 페트리 접시에 옮겨 미끄러짐을 방지합니다.
      참고: 커버립이 충분히 식지 않으면 잔류 열이 파라필름을 슬립에 녹여 사용할 수 없게 됩니다.
   4. 커버립은 각각 약 200 μL 및 800 μL및 0.1 M NaOH800 μL로 커버하여 각각 12mm및 25mm 커버슬립으로 5분 동안 앉게 합니다. 그런 다음 0.1 M NaOH를 흡인하고 커버립이 5분 동안 공기 건조하여 균일한 필름을 형성할 수 있도록 합니다.
   5. 커버립이 건조되면 피펫은 각각 12mm 및 25mm 커버립을 위한 3-아미노프로필 트리에톡시실레인(APTS)의 약 80 μL 및 150 μL(150 μL)입니다. 파라필름에 용액이 유출되지 않도록 주의하십시오. 솔루션이 5분 동안 앉을 수 있도록 허용합니다.
   6. 가능한 한 많은 초과 APTS를 흡인하고 잔류 APTS가 5 분 동안 건조 할 수 있습니다. 커버를 잘 헹구면 멸균, 디온화(DI) H₂O3회5분으로 매번 침수하여 커버스립을 잘 헹구는 다.
      참고: 유리 커버립이 잘 헹구지 않으면 잔류 APTS는 글루타랄데히드와 원치 않는 반응을 일으켜 흰색 침전이 형성되어 사용할 수 없는 커버립을 생성합니다.
   7. 커버립을 새로운 페트리 요리로 옮기고 반응하는 면을 향하게 합니다. 페트리 접시에 0.5% 글루타랄데히드를 추가하여 커버립을 완전히 덮고 커버립이 30분 동안 앉을 수 있도록 합니다.
   8. 0.5% 글루타랄데히드를 흡인하고 3분 동안 DI H₂O로 다시 커버립을 헹구세요. 커버립을 실험실 닦기 또는 깨끗한 페트리 접시에 반응성 측면을 설정하여 사용하기 전에 완전히 공기 건조시하십시오.
      참고: 프로토콜은 여기에서 일시 중지할 수 있습니다. 커버립은 사용 전까지 멸균 DI H₂O에 배치해야 합니다.
2. 실리콘 커버립 준비
   1. 아미노실란 코팅 커버립(1.1.1단계)과 동일한 수의 커버립을 파라필름이 늘어선 페트리 접시에 놓습니다.
   2. 피펫 40 μL 또는 150 μL 12mm 및 25mm 커버립립은 각각 디클로로메틸릴레인(DCMS)을 커버슬립의 한쪽에 대고 용액이 5분 동안 앉을 수 있도록 합니다.
   3. 커버슬립에서 남은 용액을 1분 동안 멸균 DI H₂O로 1회 세척하고, 반응형 커버립을 실험실 닦아에 올려 놓고 다음 단계로 이동합니다.
3. 하이드로겔 준비
   1. 아크릴아미드, 비스 아크릴아미드 및 DI H₂O를 1.5mL 원심분리기 튜브에 혼합하여 다양한 강성으로 500μL의 용액을 준비합니다(표 1참조). 30 s가 완전히 혼합 할 수있는 용액을 소용돌이.
   2. 신속하게 작업하여 10% 암모늄 감산용액(APS)과 테트라메틸레틸레틸렌디아민(TEMED)을 튜브에 추가하고 솔루션을 다시 혼합하여 용액을 소용돌이시다.
      참고: 신선한 10% APS를 준비하고 얼음위에 두거나 민감한 동결/해동 주기로 인해 일회용 알리쿼트로 동결하십시오.
   3. 파이펫약 33 μL 또는 100 μL의 용액은 각각 건조된 12mm 또는 25mm 아미노릴란 코팅 커버립(section 1.1)에 각각 이다.
   4. 곡선 핀셋을 사용하여 즉시 DCMS 처리 커버슬립을 젤 용액위에 놓고 젤 용액을 만지고 DCMS 처리 커버슬립과 아미노릴로 코팅된 커버슬립 사이에 젤 용액을 끼워 줍니다.
   5. 겔 용액이 5-15분 동안 중합화되는 동시에 튜브 내의 남은 용액의 겔 중합화를 적극적으로 모니터링할 수 있도록 한다.
   6. 젤이 중합되면 DCMS 처리 커버슬립을 곡선 핀셋 또는 면도날로 분리하여 원래 아미노시란 코팅 커버슬립에 부착된 젤을 남깁니다.
   7. 부착된 하이드로겔을 부착된 커버슬립을 500 μL 및 멸균 PBS 또는 DI H₂O2M로 각각 12mm 및 25mm 커버립으로 덮인 6웰 플레이트에 부착된 하이드로겔을 부착하여 젤이 건조되는 것을 방지합니다.
   8. 모든 커버립에 대해 1.3.4-1.3.7 단계를 반복합니다.
   9. 하이드로겔을 멸균 PBS 또는 DI H₂O에 30분 동안 잠수하여 과도한 아크릴아미드 용액을 제거합니다. 하이드로겔을 멸균 PBS 또는 DI H₂O에 4°C에 저장하여 여기서 절차적 정지를 한다.
   10. 어두운 방에서, 설포스니미딜 6-(4'-아지도-2'-니트로페닐라미노) 헥사노아테(sulfo-SANPAH) 혼합물을 50mMM 2-[4]의 2.5mL를 혼합하여 준비합니다.4-(2-하이드록세틸) 파이펫라진-1-yl] 에탄설포닉산(HEPES) (pH=8.5)와 50 μg/mL sulfo-SANPAH의 25μL을 원추형 튜브에서, 빛으로부터 보호하기 위해 알루미늄 호일로 싸여 있습니다. 파이펫을 사용하여 사용하기 전에 솔루션을 잘 혼합합니다.
       참고: 2.5mL의 설포-SANPAH 용액은 약 2512mm 하이드로겔 또는 5 25mm 하이드로겔에 충분합니다.
   11. 웰 플레이트에서 PBS 또는 DI H₂O를 흡인합니다. 젤을 커버하기 위해 각각 12mm 및 25mm 커버립에 약 100 μL 또는 500 μL을 추가합니다. 용액이 젤을 완전히 커버하도록 하십시오.
       참고: 강한 힘이 하이드로겔을 찢거나 방해하지 않도록 진공 흡입 강도를 조정합니다.
   12. 15W, 365 nm UV 광 아래 용액으로 젤을 10분 동안 놓고, 설포-SANPAH와 반응하는 UV 광의 간섭을 최소화합니다.
   13. 가능한 한 많은 용액을 수집하기 위해 플레이트를 기울여 과도한 설포-SANPAH를 흡인시합니다. 젤을 50m HEPES로 2~3회 세척합니다.
   14. 500 μL 및 2 mL을 12mm 및 25mm 젤에 넣고, 50 mg/mL 콜라겐을 각각 0.2% 아세트산으로 희석하여 하이드로겔을 함유하고 있습니다. 젤이 37°C, 5% CO₂ 인큐베이터에서 하룻밤 동안 배양하도록 허용합니다.
       참고: 콜라겐 I를 50m HEPES 대신 0.2% 아세트산으로 희석시켜 콜라겐 I의 균질분포와 부착을 촉진합니다.
   15. 콜라겐 I를 흡인시키고 살균 PBS로 젤을 세 번 세척하여 세척 할 때마다 5 분 동안 과도한 콜라겐 I를 제거합니다. PBS에서 하이드로겔을 10% 말 세럼으로 배양하고, 37°C에서 2h, 5% CO₂ 인큐베이터로 5%의 FBS를 배양합니다.
       참고: 10%의 말 세럼을 첨가하면 이전 간행물에서와 마찬가지로 FBS만 사용하는 것과 비교하여 더 높은 증식을 촉진합니다.
   16. 매체를 흡인합니다. 멸균 여과DMEM(DMEM)의 500mL에 10% FBS와 1% 페니실린-연쇄절제술(P/S)을 각 웰에 추가합니다. 젤을 세포 배양에 대비할 때까지 37°C, 5% CO₂ 인큐베이터에 저장합니다.
   17. 일단 준비되면, 배양 접시에 있는 기저 배지에 약 1.5 × 10⁴ O9-1 세포/cm^2를 접시. 37°C, 5% CO_2에서인큐베이터에서 2일 동안 세포를 배양한다. 세포가 젤에 충분히 부착되어 있는지 확인하고 분석을 위해 수집하기 전에 세포 수가 충분하도록 결합을 확인하십시오.
       참고: O9-1^셀(20)의복구, 통로 및 컬렉션 단계에 대해 이전에 게시된 프로토콜을 참조하십시오.
   18. 하이드로겔의 추가 분석을 위해 섹션 2, 3 또는 4로 진행합니다.

2. AFM을 통한 강성의 정량적 분석

1. AFM 시스템 컴퓨터를 시작하고 AFM 컨트롤러(재료 표참조)를 시작합니다.
2. AFM 프로브 홀더에 AFM 캔틸레버를 장착합니다. 캔틸레버 끝에 장착된 0.5 μm 실리카 비드(구형 비드 캔틸레버)가 장착된 구형 캔틸레버를 사용하십시오.
   참고: 10kPa, 20kPa 및 40kPa와 같은 더 단단한 하이드로겔의 경우 스프링 상수 0.24 N/m의 스프링 상수와 함께 더 단단한 프로브를 사용했습니다. 0.5kPa 및 1kPa와 같은 부드러운 하이드로겔에 부드러운 프로브가 사용되었으며 스프링 상수는 0.059 N/m입니다.
3. 접촉 모드로 AFM 소프트웨어를 설정합니다.
4. 실리콘 웨이퍼를 AFM 샘플 스테이지에 장착하여 캔틸레버를 클릭하여 힘 곡선을 수집하여 힘 곡선을 생성하여 힘 곡선을 생성합니다.
5. 위의 힘 곡선(2.4)을 사용하여 교정을 위해 제어 소프트웨어의 교정을 클릭하여 열 조정 조건에서 캔틸레버의 평균 스프링 상수를 얻고 제어 소프트웨어에서 보정된 값을 저장합니다.
6. 60mm 페트리 접시에 부착된 하이드로겔로 커버슬립을 AFM 스캐닝 스테이지에 배치하여 시료를 장착합니다. 젤이 건조되는 것을 방지하기 위해 측정을 수행하기 전에 PBS 3mL을 접시에 넣습니다.
7. AFM을 접촉 모드(유체)에서 작동하도록 설정하여 측정을 시작합니다. 구형 비드를 참여하여 젤 샘플에서 지속적으로 터치하고 들어올립니다.
8. 캔틸레버를 설정하여 편향 임계값이 10nm에 유지되도록 합니다. 프로브의 램핑 크기를 10μm로 유지합니다. 그런 다음 2.4 단계에서와 같이 힘 곡선을 기록합니다.
9. 하이드로겔 표면을 가로질러 적어도 3~10개의 다른 반점으로부터 최소 20개의 힘 곡선을 획득한다.
10. AFM 이미징 및 분석 소프트웨어를 사용하여 각 스팟마다 평균 영의 계수를 ~20개의 힘 곡선을 계산합니다. 확장 램프 힘 곡선과 선형화된 모델(구형)을 사용합니다. 각 샘플의 모든 반점의 평균을 계산하여 최종 강성을 산출합니다.
    참고: 영의 계수 및 관련데이터(예: 표준 편차)는 스프레드시트로 자동으로 저장됩니다.
11. 모든 샘플에 대해 2.6-2.10 단계를 반복합니다.

3. 면역 형광 염색을 통한 강성의 분자 분석

1. 핀셋을 사용하여 덮개 슬립을 새 플레이트로 운반하여 플레이트에 직접 자라는 세포의 거짓 신호를 최소화합니다. 멸균 PBS의 500 μL로 세포를 세 번 세척하여 죽은 세포와 남은 배양 배지를 제거하십시오.
2. 실온에서 10분 동안 4% 파라포름알데히드(PFA)의 500 μL을 사용하여 세포를 수정합니다. 그런 다음 PBS/웰500 μL을 사용하여 각각 2분 동안 세포를 세 번 다시 세척합니다.
   참고: 4°C에 보관하여 절차상의 정지를 위해 보관하십시오.
3. 실온에서 15분 동안 500 μL의 0.1% 트리톤 X-100으로 세포를 치료한다. 그런 다음 PBS/웰의 500 μL로 셀을 세 번 씻으시다.
4. 실온에서 30분 동안 양당 당나귀 혈청(PBS에서 희석되고 0.1% Tween 20)의 250 μL로 세포를 차단합니다.
5. 실온에서 2시간 또는 4°C에서 하룻밤 동안 1차 항체의 250 μL로 세포를 배양한다. 그런 다음, PBS/웰의 500 μL로 세포를 각각 5분 동안 세 번 씻는다.
   참고: 안티 빈컬린(Vcl) (1:250) 및 항 AP2 알파(1:250)가 이 실험에서 사용되었고 당나귀 혈청10%로 희석하였다.
6. 10% 당나귀 혈청의 250 μL에서 1:400의 희석시 F액틴 염색에 사용되는 해당 이차 항체 및/또는 프할로이드딘으로 세포를 실온에서 30분 동안 배양한다. 그런 다음 PBS로 세포를 각각 5 분 동안 세 번 씻으신다.
   참고: 568 nm Phalloidin 488 nm 또는 647 nm 이차 항체 또는 자체적으로 공동 배양 될 수 있습니다.
7. 10분 동안 PBS의 250 μL에서 4′,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI, 1:1000 희석)로 세포를 배양하고 2 분 동안 PBS의 마지막 세척을 합니다.
8. 각 웰에 3-4 방울의 장착 매체를 추가합니다. 시료를 4°C에 저장하여 이미징 전에 적어도 2시간 동안 설정하여 마운팅 매체가 제대로 설정되었는지 확인합니다.
9. 형광 현미경으로 하이드로겔 샘플 당 최소 3 개의 무작위 프레임의 이미지를 캡처하여 개별 및 병합 채널을 생성합니다.

4. 정량적 실시간 PCR (RT-qPCR)

1. RNA 수집을 위한 부착 된 세포로 하이드로겔을 새로운 플레이트로 전달하여 세포 판에 부착 된 세포로부터 원치 않는 RNA를 최소화합니다. 죽은 세포와 배양 배지를 제거하기 위해 PBS로 세포를 세 번 세척합니다.
2. RNA 추출 키트를 사용하여 총 mRNA를 추출합니다. 제조업체의 지시에 따라 역전사 슈퍼믹스를 사용하여 CDNA에 RNA의 역전사를 수행한다.
3. 선택의 강성 마커로 Vcl에 대한 프라이머와 RT-qPCR을 수행하고^2-ΔΔCT 방법을 사용하여 분석한다.
   참고: Vcl의 프라이머 시퀀스: 포워드 5' GCTTCAGTCAGACCCATACTCG 3'; 리버스 5' AGGTAAGCAGTAGGTCAGATGT 3'.

결과

AFM 및 Hertz 모델을 통한 하이드로겔 제제 및 강성 평가
여기서, 아크릴아미드와 비스 아크릴아미드의 비율을 조절함으로써 다양한 강성의 폴리아크릴아미드 하이드로겔을 생성하기 위한 상세한 프로토콜이 제공된다. 그러나, 폴리아크릴아미드 하이드로겔은 ECM 단백질의 부족으로 인한 세포의 접착을 위한 준비가 되어 있지 않다. 따라서, 설포-SANPAH는, 링커로서 작용하는, 하이드로...

토론

현재 연구의 목표는 NNC에서 기계적 신호의 영향을 더 잘 이해하기 위해 효과적이고 효율적인 체외 시스템을 제공하는 것입니다. 위에서 언급한 단계별 프로토콜을 따르는 것 외에도, 연구자들은 O9-1 NcC의 세포 배양이 하이드로겔을 준비하는 데 사용되는 유리 커버립의 유형에 의해 영향을 받는다는 것을 명심해야 합니다. 예를 들어, 특정 유형의 유리 커버슬립(재료 표 참조)에 시드된 세포...

자료

Name	Company	Catalog Number	Comments
12 mm #1 Corning 0211 Glass Coverslip	Chemglass Life Sciences	CLS-1763-012
2% Bis-Acrylamide	Sigma Aldrich	M1533
24-well plate	Greiner Bio-one	662165
25 mm #1 Corning 0211 Glass Coverslip	Chemglass Life Sciences	CLS-1763-025
3-aminopropyl triethoxysilane (APTS)	Sigma Aldrich	A3648
4-well cell culture plate	Thermo Scientific	179830
4% Paraformaldehyde	Sigma Aldrich	J61899-AP
40% Acrylamide	Sigma Aldrich	A4058
50% glutaraldehyde	Sigma Aldrich	G7651
6-well cell culture plate	Greiner Bio-one	657160
AFM cantilever (spherical bead)	Novascan
AFM software	Catalyst NanoScope		Model: 8.15 SR3R1
Alexa Fluor 488 Phalloidin	Thermo Fisher	A12379
Ammonium Persulfate (APS)	Sigma Aldrich	248614	Powder
anti-AP-2α Antibody	Santa Cruz	sc-12726
anti-Vinculin antibody	Abcam	ab129002
Atomic Force Microscopy (AFM) Bioscope Catalyst	Bruker Corporation
Collagen type I (100mg)	Corning	354236
DAPI (4',6-Diamidino-2-Phenylindole, Dihydrochloride)	Thermo Fisher	D1306
Dichloromethylsilane (DCMS)	Sigma Aldrich	440272
Donkey serum	Sigma Aldrich	D9663
Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM)	Corning	10-017-CV
Fetal bovine serum (FBS)	Corning	35-010-CV
Fluorescence microscope	Leica		Model DMi8
Fluoromount-G mounting medium	SouthernBiotech	0100-35
HEPES	Sigma Aldrich	H3375	Powder
Horse serum	Corning	35-030-CI
iScript Reverse Transcription Supermix	Bio-Rad	1708841
Penicillin-Streptomycin antibiotic	Thermo Fisher	15140148
RNeasy micro kit	Qiagen	74004
Sterile 1x PBS	Hyclone	SH30256.02
Sterile deionized water	Hardy Diagnostics	U284
sulfo-SANPAH	Thermo Fisher	22589
SYBR green	Applied Biosystems	4472908
TEMED	Sigma Aldrich	T9281
Triton X-100	Sigma Aldrich	X100
Tween 20	Sigma Aldrich	P9416