1 시작하려면 데스크탑에서 Cytoscape 3.9.1 소프트웨어 2를 실행하고항문 습진의 핵심 단백질이 포함된 tsv 파일 3을 가져옵니다. 4 제어판 5에서 스타일 표시줄을 클릭하여 네트워크 노드의 색상, 글꼴 및 크기를 최적화합니다. 6 네트워크 토폴로지 분석의 경우, 7 analyze network 기능을 사용합니다.
8 허브 유전자를 얻기 위해서는 CytoHubba 9를 사용하여 약물 구성 요소 질환 타겟 네트워크를 구축하십시오. 10 Metascape 웹사이트를 엽니다. 11 파일을 선택하거나 유전자 목록을 대화 상자 12에 붙여넣고 제출 버튼을 클릭합니다.
13 그런 다음 species 14로 입력하고, species, 15로 analysis를 선택하고 사용자 정의 분석 기능을 활성화합니다. 16 농축 옵션에서 17개는 GO 분자 기능, GO 생물학적 과정, 18개의 GO 세포 구성 요소 및 KEGG Pathway 데이터베이스를 선택합니다. 19 선택적인 GO 클러스터, 20을 선택하고 농축 분석 버튼을 클릭합니다.
21 진행률 표시줄이 완료되면 22 분석 보고서 페이지를 시작하고 23을 클릭하여 농축 결과를 검색합니다. 24 GEO2R 도구를 열어 25를 검색하고 GEO 유전자 칩 데이터베이스를 분석합니다. 26 GEO 데이터베이스 웹 사이트를 엽니 다.
27 그런 다음 키워드 또는 GEO 가입 28을 입력하고 검색 버튼을 클릭합니다. 29 가장 일치하는 결과 30을 선택하고 참조 계열을 찾습니다. 31 이제 GEO2R 도구 웹 사이트에서 32 GEO 가입 상자 (33)에 참조 시리즈를 입력하고 설정 버튼을 클릭합니다.
34 실험군으로 아토피 피부염을 선택하고, 대조군으로 비아토피 대조군을 선택한다. 36 분석 버튼을 클릭하고 결과가 나타날 때까지 기다립니다. 59개의 주요 표적에 대한 37개의 KEGG 및 GO 농축 분석, 38개 식별 218개의 경로와 3,000개 이상의 생물학적 과정, 39개는 SDG 및 항문 습진의 중요한 경로를 강조합니다.
생물학적 과정, 세포 조성, 41 및 분자 기능 42에 대한 40 GO 분석은 SDG 및 항문 습진의 공통 목표를 강조했습니다. 43 관련 생물학적 기능에는 펩티딜-티로신 44, 인산화 및 세포-세포 접착 조절이 포함되었습니다.
