시작하려면 Xanthatin과 Keap1의 결정 구조를 다운로드하십시오. 구조를 처리한 후 두 가지 작업을 탐색하고 리간드 도킹 옵션을 선택합니다. 파일에서 receptor grid를 선택하고 Browse를 클릭합니다.
그런 다음 바탕 화면을 클릭하고 분자 도킹 폴더를 연 다음 glide-grid 2FLU 파일을 두 번 클릭합니다. glide-grid 2FLU zip 파일을 선택하고 열기를 클릭합니다. 이제 파일에서 리간드 사용을 클릭하십시오.
그런 다음 Browse(찾아보기)를 클릭하고 Desktop(데스크톱)을 선택합니다. 분자 도킹 폴더를 선택하고 ligprep_1 파일을 엽니다. 그런 다음 ligprep_1-out-maegz 파일을 선택하고 열기를 클릭합니다.
설정에 액세스하고 정밀도를 XP, 추가 정밀도, 옵션으로 선택합니다. 작업 이름을 글라이드로 수정합니다. xp2flu를 입력한 다음 실행을 클릭합니다.
도킹 결과를 보려면 파일(File)을 클릭하고 구조체 임포트 옵션(Import Structures Options)을 선택합니다. 바탕 화면으로 이동하여 분자 도킹 폴더를 엽니다. 그런 다음 glide-dock XP 2FLU 파일을 선택합니다.
글라이드 독 XP 1 pv를 선택합니다. maegz 파일을 열고 열기를 클릭합니다. 그런 다음 작업 공간에서 점을 두 번 클릭하여 리간드를 선택합니다.
sitemap_1_protein를 선택합니다. 표를 클릭하고 맨 오른쪽으로 밀어 도킹 점수를 확인합니다. 2D 결과를 시각화하려면 앞에서 설명한 대로 sitemap_1_protein 선택합니다.
Ligand Interaction(리간드 상호 작용)을 클릭하고 View(보기)를 선택한 다음 LID legend(LID 범례) 상자를 선택합니다. 그런 다음 파일을 클릭하고 스크린샷 저장을 선택한 다음 너비로 6, 000을 입력합니다. 투명한 배경 상자의 선택을 취소하고 확인을 클릭합니다. 파일을 바탕 화면에 2D-xanthatin-2FLU로 저장합니다.
분자 도킹 분석은 Xanthatin과 Keap1 단백질 간의 상호 작용을 예측했습니다.
