시작하려면 2밀리리터 튜브의 무게를 측정하고 초기 무게를 w0로 기록합니다. 공동 배양된 애기장대(Arabidopsis thaliana) 뿌리 조직을 수확하고 멸균수로 세 번 세척합니다. 여과지에 뿌리를 올려 여분의 물을 제거합니다.
뿌리를 미리 계량된 마이크로 원심분리기 튜브로 옮깁니다. 튜브로 뿌리의 무게를 측정하고 w1로 기록합니다. 다음으로, 튜브에 PBS 1밀리리터를 넣고 최대 속도로 8분 동안 Vortex를 추가합니다.
뿌리 집락화 된 박테리아 세포를 포함하는 현탁액을 1 x 10에서 음수 1 번째, 1 x 10에서 음성 5까지 희석합니다. 희석된 박테리아 현탁액을 Luria-Bertani 한천 플레이트에 펴 바르고 섭씨 37도에서 10시간 동안 배양합니다. 배양 후 Luria-Bertani 한천 플레이트의 박테리아 군집을 계산합니다.
해당 희석에 따라 콜로니 형성 단위를 계산하고 루트 신선 중량으로 데이터를 정규화하여 루트 그램당 콜로니화된 박테리아 세포 수를 얻습니다. 접종 2일 후, 바실러스 벨레젠시스(Bacillus velezensis) 야생형 SQR9 및 파생 돌연변이인 델타 8mcp의 집락화는 델타 8mcp의 뿌리 집락화 감소를 입증했으며, 이는 박테리아 집락화 측정에서 이 조건과 방법의 효과를 시사합니다.