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Ice-Cap: A Method for Growing <em>Arabidopsis</em> and Tomato Plants in 96-well Plates for High-Throughput Genotyping

It is becoming common for plant scientists to develop projects that require the genotyping of large numbers of plants. The first step in any genotyping ...

Oregon State University 

&#x6211;&#x4EEC;&#x4EE5;&#x524D;&#x5F00;&#x53D1;&#x4E00;&#x4E2A;&#x53EB;&#x505A; &#39;&#x51B0;&#x5E3D;&#39; 96 &#x4E95;&#x683C;&#x5F0F;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x80B2;&#x82D7;&#x548C;&#x5FEB;&#x901F;&#x6536;&#x96C6;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x968F;&#x540E; DNA &#x7684;&#x63D0;&#x53D6;&#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x5206;&#x578B;&#x7684;&#x9AD8;&#x541E;&#x5410;&#x91CF;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x6700;&#x521D;&#x63CF;&#x8FF0;&#x7684;&#x51B0;&#x5E3D;&#x65B9;&#x6CD5;&#x662F;&#x9AD8;&#x901A;&#x91CF;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x5206;&#x578B;&#x7684;&#x6709;&#x6548;&#x5DE5;&#x5177;&#xFF0C;&#x51B0;&#x5E3D;&#x7684;&#x7B2C;&#x4E00;&#x4E2A;&#x7248;&#x672C;&#x7684;&#x7F3A;&#x70B9;&#x4E4B;&#x4E00;&#x662F;&#x6700;&#x4F18;&#x5E7C;&#x82D7;&#x751F;&#x957F;&#x662F;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x4F9D;&#x8D56;&#x4E8E;&#x7279;&#x5B9A;&#x7684;&#x73AF;&#x5883;&#x6761;&#x4EF6;&#x3002;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6211;&#x4EEC;&#x4ECB;&#x7ECD;&#x51E0;&#x4E2A;&#x6280;&#x672F;&#x7ED9;&#x51B0;&#x5E3D;&#x65B9;&#x6CD5;&#x7684;&#x6539;&#x8FDB;&#xFF0C;&#x4F7F;&#x5B83;&#x66F4;&#x52A0;&#x5065;&#x58EE;&#x548C;&#x4E3A;&#x5B9E;&#x65BD;&#x8BE5;&#x65B9;&#x6CD5;&#x63D0;&#x4F9B;&#x8BE6;&#x7EC6;&#x7684;&#x534F;&#x8BAE;&#x3002;

&#x534F;&#x8BAE;&#xFF1A; &#x65B9;&#x6CD5;&#x7684;&#x6539;&#x8FDB;&#x7684;&#x9AD8;&#x541E;&#x5410;&#x91CF;&#x5728;&#x690D;&#x7269;&#x57FA;&#x56E0;&#x5206;&#x578B; (&#x51B0;&#x5E3D; 2.0) 96 &#x4E95;&#x683C;&#x5F0F;&#x751F;&#x6210;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x6837;&#x672C;&#x3002;

We previously developed a high-throughput system called 'Ice-Cap' for growing Arabidopsis seedlings in a 96-well format and rapidly collecting tissue for subsequent DNA extraction and genotyping. While the originally described Ice-Cap method is an effective tool for high-throughput genotyping, one shortcoming of the first version of Ice-Cap is that optimal seedling growth is highly dependent on specific environmental conditions. Here we describe several technical improvements to the Ice-Cap method that make it much more robust and provide a detailed protocol for implementing the method.

Protocol: An improved high-throughput method for generating tissue samples in 96-well format for plant genotyping (Ice-Cap 2.0).

Nous avons d&#xE9;j&#xE0; d&#xE9;velopp&#xE9; un syst&#xE8;me &#xE0; haut d&#xE9;bit appel&#xE9; &#xAB;Ice-Cap&#xBB; pour de plus en plus jeunes plants d&#x26;#39;Arabidopsis dans un format de 96 puits et rapidement recueillir des tissus pour l&#x26;#39;extraction ult&#xE9;rieure de l&#x26;#39;ADN et le g&#xE9;notypage. Alors que le d&#xE9;crit &#xE0; l&#x26;#39;origine de glace-Cap m&#xE9;thode est un outil efficace pour g&#xE9;notypage &#xE0; haut d&#xE9;bit, une lacune de la premi&#xE8;re version de la calotte glaciaire, c&#x26;#39;est que la croissance des semis optimale est fortement d&#xE9;pendante des conditions environnementales sp&#xE9;cifiques. Nous d&#xE9;crivons ici plusieurs am&#xE9;liorations techniques &#xE0; la m&#xE9;thode de glace-Cap qui font qu&#x26;#39;il est beaucoup plus robuste et de fournir un protocole d&#xE9;taill&#xE9; pour la mise en &#x153;uvre de la m&#xE9;thode.

Protocole: Un Am&#xE9;lioration haut d&#xE9;bit M&#xE9;thode pour g&#xE9;n&#xE9;rer des &#xE9;chantillons de tissus en format de 96 puits pour le g&#xE9;notypage des plantes (Ice Cap-2.0)

Entwickelten wir zuvor eine Hochdurchsatz-genannt &#39;Eiskappe&#39; f&uuml;r den Anbau von Arabidopsis S&auml;mlinge in einem 96-Well-Format und schnell sammeln Gewebe f&uuml;r sp&auml;tere DNA-Extraktion und Genotypisierung. W&auml;hrend die urspr&uuml;nglich beschriebene Eiskappe Methode ein wirksames Instrument f&uuml;r Hochdurchsatz-Genotypisierung, ist ein Manko der ersten Version der Eiskappe, dass optimale S&auml;mlingwachstum stark abh&auml;ngig von bestimmten Umweltbedingungen. Hier beschreiben wir einige technische Verbesserungen der Eiskappe-Methode, die machen es viel robuster und bieten ein ausf&uuml;hrliches Protokoll f&uuml;r die Implementierung der Methode.

Protokoll: Eine verbesserte Hochdurchsatz-Methode zum Generieren von Gewebeproben in 96-Well-Format f&uuml;r Pflanze Genotypisierung (Eiskappe 2.0).

Abbiamo sviluppato in precedenza un sistema high-throughput chiamato &#39;Calotta&#39; per la coltivazione di piantine di Arabidopsis in un formato a 96 pozzetti e rapidamente raccogliendo il tessuto per la successiva estrazione del DNA e tipizzazione. Mentre il metodo originariamente descritto calotta di ghiaccio &egrave; uno strumento efficace per high-throughput genotyping, una lacuna della prima versione della calotta di ghiaccio &egrave; che sviluppo del semenzale ottimale dipende altamente specifiche condizioni ambientali. Qui descriviamo alcuni miglioramenti tecnici al metodo calotta di ghiaccio che lo rendono molto pi&ugrave; robusto e forniscono un protocollo dettagliato per l&#39;implementazione del metodo.

Protocollo: Un metodo migliorato di high-throughput per la generazione di campioni di tessuto in formato 96 pozzetti per genotipizzazione vegetale (calotta 2.0).

&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x4EE5;&#x524D;&#x3001;96&#x30A6;&#x30A7;&#x30EB;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30DE;&#x30C3;&#x30C8;&#x3067;&#x306E;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x5B9F;&#x751F;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x3068;&#x6025;&#x901F;&#x306B;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x5F8C;&#x306E;DNA&#x62BD;&#x51FA;&#x3068;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CE;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x3092;&#x53CE;&#x96C6;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E; &#x26;quot;&#x30A2;&#x30A4;&#x30B9;&#xB7;&#x30AD;&#x30E3;&#x30C3;&#x30D7;&#x26;quot;&#x3068;&#x547C;&#x3070;&#x308C;&#x308B;&#x9AD8;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x3092;&#x958B;&#x767A;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5F53;&#x521D;&#x306F;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x305F;&#x30A2;&#x30A4;&#x30B9;&#x30AD;&#x30E3;&#x30C3;&#x30D7;&#x6CD5;&#x306F;&#x30CF;&#x30A4;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CE;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x52B9;&#x679C;&#x7684;&#x306A;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x3067;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x30A2;&#x30A4;&#x30B9;&#x30AD;&#x30E3;&#x30C3;&#x30D7;&#x306E;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x30D0;&#x30FC;&#x30B8;&#x30E7;&#x30F3;&#x306E;&#x4E00;&#x3064;&#x306E;&#x6B20;&#x70B9;&#x306F;&#x3001;&#x6700;&#x9069;&#x306A;&#x82D7;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x306F;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x74B0;&#x5883;&#x6761;&#x4EF6;&#x306B;&#x5927;&#x304D;&#x304F;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3068;&#x3044;&#x3046;&#x3053;&#x3068;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x305D;&#x308C;&#x3092;&#x306F;&#x308B;&#x304B;&#x306B;&#x5805;&#x7262;&#x306A;&#x4F5C;&#x308A;&#x3001;&#x30E1;&#x30BD;&#x30C3;&#x30C9;&#x3092;&#x5B9F;&#x88C5;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x8A73;&#x7D30;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C8;&#x30B3;&#x30EB;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x30A2;&#x30A4;&#x30B9;&#x30AD;&#x30E3;&#x30C3;&#x30D7;&#x65B9;&#x5F0F;&#x306B;&#x306F;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x6280;&#x8853;&#x7684;&#x306A;&#x6539;&#x5584;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30D7;&#x30ED;&#x30C8;&#x30B3;&#x30EB;&#xFF1A;&#x690D;&#x7269;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CE;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x7528;96&#x30A6;&#x30A7;&#x30EB;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30DE;&#x30C3;&#x30C8;&#x3067;&#x7D44;&#x7E54;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6539;&#x5584;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30CF;&#x30A4;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x6CD5;&#xFF08;&#x30A2;&#x30A4;&#x30B9;&#x30AD;&#x30E3;&#x30C3;&#x30D7;2.0&#xFF09;

&#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; 96-&#xC798; &#xD615;&#xD0DC;&#xB85C; Arabidopsis &#xBB18; &#xBAA9; &#xC131;&#xC7A5; &#xD558; &#xACE0; &#xC2E0;&#xC18D; &#xD558; &#xAC8C; &#xD6C4;&#xC18D; DNA &#xCD94;&#xCD9C; &#xBC0F; &#xC720;&#xC804;&#xD615;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC870;&#xC9C1; &#xC218;&#xC9D1; &#39; &#xC5BC;&#xC74C; &#xBAA8;&#xC790; &#39; &#xB77C;&#xB294; &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; &#xAC1C;&#xBC1C;. &#xC6D0;&#xB798; &#xC124;&#xBA85;&#xB41C; Ice Cap &#xBA54;&#xC11C;&#xB4DC;&#xB294; &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9; &#xC720;&#xC804;&#xD615; &#xD6A8;&#xACFC;&#xC801;&#xC778; &#xB3C4;&#xAD6C;, Ice Cap&#xC758; &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; &#xBC84;&#xC804;&#xC758; 1 &#xACB0;&#xC810;&#xC740; &#xCD5C;&#xC801;&#xC758; &#xBAA8; &#xC885; &#xC131;&#xC7A5;&#xC744; &#xC774;&#xB2E4; &#xD2B9;&#xC815; &#xD658;&#xACBD; &#xC870;&#xAC74;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xD06C;&#xAC8C; &#xB2EC;&#xB77C; &#xC9D1;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xD6E8;&#xC52C; &#xB354; &#xAC15;&#xB825;&#xD55C;&#xC73C;&#xB85C; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD558; &#xACE0; &#xBA54;&#xC11C;&#xB4DC;&#xB97C; &#xAD6C;&#xD604; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD55C; &#xC0C1;&#xC138;&#xD55C; &#xD504;&#xB85C;&#xD1A0;&#xCF5C;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xB294; Ice Cap &#xBC29;&#xBC95; &#xAE30;&#xC220; &#xD5A5;&#xC0C1; &#xAE30;&#xC220;.

&#xD504;&#xB85C;&#xD1A0;&#xCF5C;:&#xB294; &#xD5A5;&#xC0C1; &#xB41C; &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9; &#xBC29;&#xBC95; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xC720;&#xC804;&#xD615; (Ice Cap 2.0) 96-&#xC798; &#xD615;&#xD0DC;&#xB85C; &#xC870;&#xC9C1; &#xC0D8;&#xD50C;&#xC744; &#xC0DD;&#xC131; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD55C;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Anteriormente hemos desarrollado un sistema de alto rendimiento llamada &#x26;quot;capa de hielo&#x26;quot; para el crecimiento de pl&#xE1;ntulas de Arabidopsis en un formato de 96 pocillos y r&#xE1;pido de recopilaci&#xF3;n de tejido para su posterior extracci&#xF3;n de ADN y el genotipado. Mientras que el descrito originalmente capa de hielo m&#xE9;todo es una herramienta eficaz para el genotipado de alto rendimiento, una deficiencia de la primera versi&#xF3;n de la capa de hielo es que el crecimiento de pl&#xE1;ntulas &#xF3;ptimo depende en gran medida las condiciones ambientales espec&#xED;ficas. Aqu&#xED; se describen varias mejoras t&#xE9;cnicas en el m&#xE9;todo de capa de hielo que lo hacen mucho m&#xE1;s robusto y proporcionar un protocolo detallado para la aplicaci&#xF3;n del m&#xE9;todo.

Protocolo: Un Mejor M&#xE9;todo de alto rendimiento para la generaci&#xF3;n de muestras de tejido en el formato de 96 pocillos para la genotipificaci&#xF3;n de la planta (Ice Cap 2.0)

Sammlungen von Arabidopsis Thaliana bestellt Zeilen mit zugeordnete T-DNA-Einf&uuml;gungen eine wichtige Ressource f&uuml;r Pflanze Wissenschaftler Durchf&uuml;hrung genetische Untersuchungen geworden. Fr&uuml;here Berichte gaben an, dass die T-DNA Einf&uuml;gung Linien k&ouml;nnen chromosomale Translokationen der T-DNA Einf&uuml;gung Website zugeordnet haben, aber die Pr&auml;valenz von diese Umlagerungen nicht gut dokumentiert. Um die Frequenz zu bestimmen mit der Umsiedlung in eine weit verbreitete Sammlung von T-DNA Einf&uuml;gung Zeilen vorhanden sind, analysierten wir 64 unabh&auml;ngige Leitungen aus der Salk T-DNA-mutant-Auflistung. Chromosomale Translokationen wurden bei 12 der Befragten 64 Linien (19 %) festgestellt. Zwei Proben wurden verwendet, um die T-DNA-Linien f&uuml;r Umsiedlung des Bildschirms: Bl&uuml;tenstaub Lebensf&auml;higkeit und genomweiten genetische Zuordnung. Obwohl die Messung der Bl&uuml;tenstaub Lebensf&auml;higkeit eine indirekte Bildschirm f&uuml;r das Vorhandensein einer Translokation ist, wurden alle 11 der T-DNA Linien zeigen eine abnorme Bl&uuml;tenstaub-Ph&auml;notyp festgestellt, dass eine Translokation bei Analyse der genetischen Zuordnung enthalten. Ein normalen Bl&uuml;tenstaub-Ph&auml;notyp garantiert jedoch nicht, ohne eine Translokation. Wir beobachteten eine T-DNA-Linie mit normalen Pollen, die dennoch eine Translokation hatte basierend auf genetische Zuordnung Ergebnisse. Eine zus&auml;tzliche Ph&auml;nomen, das wir durch unsere genetische Zuordnung-Experimenten beobachtet wurde, dass die T-DNA-Kreuzungen auf die 5&#39;-und 3&#39;-Seiten eines gezielten Gens k&ouml;nnen in einigen F&auml;llen genetisch voneinander trennen. Zwei Zeilen in unserer Umfrage angezeigt diese &#39; t-DNA Grenzen Separate&#39; Ph&auml;nomen. Experimentelle Verfahren f&uuml;r das screening von T-DNA-Linien f&uuml;r das Vorhandensein von Chromosomenanomalien effizient werden vorgestellt und diskutiert.

Chromosomale Translokationen sind ein weit verbreitetes Ph&auml;nomen in der Arabidopsis Thaliana T-DNA Einf&uuml;gung Linien.

&#x5E8F;&#x7684;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x96C6;&#x5408;&#x5305;&#x542B;&#x6620;&#x5C04;&#x7684; T DNA &#x63D2;&#x5165;&#x7684;&#x884C;&#x5DF2;&#x6210;&#x4E3A;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x8D44;&#x6E90;&#x690D;&#x7269;&#x79D1;&#x5B66;&#x5BB6;&#x5F00;&#x5C55;&#x9057;&#x4F20;&#x7814;&#x7A76;&#x3002;&#x4EE5;&#x524D;&#x7684;&#x62A5;&#x544A;&#x8868;&#x660E; T-DNA &#x63D2;&#x5165;&#x884C;&#x53EF;&#x4EE5;&#x6709;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x6613;&#x4F4D;&#x4E0E; T-DNA &#x63D2;&#x5165;&#x7F51;&#x7AD9;&#xFF0C;&#x76F8;&#x5173;&#x7684;&#x4F46;&#x662F;&#x6CA1;&#x6709;&#x5F97;&#x5230;&#x5145;&#x5206;&#x8BB0;&#x8F7D;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x91CD;&#x6392;&#x7684;&#x6D41;&#x884C;&#x3002;&#x82E5;&#x8981;&#x786E;&#x5B9A;&#x6613;&#x4F4D;&#x7684;&#x76EE;&#x524D;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x4F7F;&#x7528;&#x7684; T-DNA &#x63D2;&#x5165;&#x884C;&#x96C6;&#x5408;&#x4E2D;&#x7684;&#x9891;&#x7387;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5206;&#x6790;&#x4E86;&#x4ECE; Salk T DNA &#x7A81;&#x53D8;&#x96C6;&#x5408; 64 &#x72EC;&#x7ACB;&#x884C;&#x3002;12 64 &#x7EBF;&#x8F83;&#x4E0A;&#x5E74;&#x540C;&#x671F; (19%) &#x4E2D;&#x53D1;&#x73B0;&#x4E86;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x7684;&#x6613;&#x4F4D;&#x3002;&#x4E24;&#x79CD;&#x68C0;&#x6D4B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x7528;&#x4E8E;&#x5C4F;&#x5E55;&#x6613;&#x4F4D;&#x7684; T-DNA &#x884C;&#xFF1A; &#x82B1;&#x7C89;&#x548C;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x9057;&#x4F20;&#x56FE;&#x8C31;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x82B1;&#x7C89;&#x751F;&#x6D3B;&#x529B;&#x7684;&#x6D4B;&#x91CF;&#x662F;&#x6613;&#x4F4D;&#x7684;&#x5B58;&#x5728;&#x95F4;&#x63A5;&#x5C4F;&#x5E55;&#xFF0C;&#x663E;&#x793A;&#x5F02;&#x5E38;&#x82B1;&#x7C89;&#x8868;&#x578B;&#x7684; T-DNA &#x7EBF;&#x6761;&#x7684;&#x6240;&#x6709; 11 &#x88AB;&#x90FD;&#x53D1;&#x73B0;&#x542B;&#x6709;&#x6613;&#x4F4D;&#x65F6;&#x4F7F;&#x7528;&#x9057;&#x4F20;&#x56FE;&#x8C31;&#x5206;&#x6790;&#x3002;&#x4F46;&#x662F;&#xFF0C;&#x6B63;&#x5E38;&#x82B1;&#x7C89;&#x8868;&#x578B;&#x4E0D;&#x4FDD;&#x8BC1;&#x6CA1;&#x6709;&#x6613;&#x4F4D;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x4E00;&#x79CD;&#x4E0E;&#x6B63;&#x5E38;&#x82B1;&#x7C89;&#xFF0C;&#x4E0D;&#x8FC7;&#x5DF2;&#x7ECF;&#x6613;&#x4F4D; T DNA &#x884C;&#x57FA;&#x4E8E;&#x9057;&#x4F20;&#x6D4B;&#x7ED8;&#x6210;&#x679C;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x901A;&#x8FC7;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x9057;&#x4F20;&#x56FE;&#x8C31;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x989D;&#x5916;&#x73B0;&#x8C61;&#x662F; T DNA &#x8DEF;&#x53E3; 5&#39;-3&#39;-&#x53CC;&#x65B9;&#x7684;&#x9776;&#x5411;&#x6027;&#x57FA;&#x56E0;&#x53EF;&#x4EE5;&#x57FA;&#x56E0;&#x5F7C;&#x6B64;&#x5206;&#x5F00;&#x5728;&#x67D0;&#x4E9B;&#x60C5;&#x51B5;&#x4E0B;&#x548C;&#x3002;&#x4E24;&#x6761;&#x7EBF;&#x5728;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x8C03;&#x67E5;&#x4E2D;&#x663E;&#x793A;&#x6B64;&#x4E0D;&#x8981; DNA &#x8FB9;&#x754C;&#x5355;&#x72EC; &#39; &#x73B0;&#x8C61;&#x3002;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x6709;&#x6548;&#x7B5B;&#x67E5;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x5F02;&#x5E38;&#x7684;&#x5B58;&#x5728; T DNA &#x884C;&#x63D0;&#x51FA;&#x548C;&#x8BA8;&#x8BBA;&#x3002;

&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x6613;&#x4F4D;&#x662F;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x5357;&#x82A5; T DNA &#x63D2;&#x5165;&#x884C;&#x4E2D;&#x7684;&#x5E38;&#x89C1;&#x73B0;&#x8C61;&#x3002;

Ordered collections of Arabidopsis thaliana lines containing mapped T-DNA insertions have become an important resource for plant scientists performing genetic studies. Previous reports have indicated that T-DNA insertion lines can have chromosomal translocations associated with the T-DNA insertion site, but the prevalence of these rearrangements has not been well documented. To determine the frequency with which translocations are present in a widely-used collection of T-DNA insertion lines, we analyzed 64 independent lines from the Salk T-DNA mutant collection. Chromosomal translocations were detected in 12 of the 64 lines surveyed (19%). Two assays were used to screen the T-DNA lines for translocations: pollen viability and genome-wide genetic mapping. Although the measurement of pollen viability is an indirect screen for the presence of a translocation, all 11 of the T-DNA lines showing an abnormal pollen phenotype were found to contain a translocation when analyzed using genetic mapping. A normal pollen phenotype does not, however, guarantee the absence of a translocation. We observed one T-DNA line with normal pollen that nevertheless had a translocation based on genetic mapping results. One additional phenomenon that we observed through our genetic mapping experiments was that the T-DNA junctions on the 5'- and 3'-sides of a targeted gene can genetically separate from each other in some cases. Two of the lines in our survey displayed this 'T-DNA borders separate' phenomenon. Experimental procedures for efficiently screening T-DNA lines for the presence of chromosomal abnormalities are presented and discussed.

Chromosomal translocations are a common phenomenon in Arabidopsis thaliana T-DNA insertion lines.

Collections ordonn&#xE9;es de lignes d&#x26;#39;Arabidopsis thaliana contenant mapp&#xE9;s insertions d&#x26;#39;ADN-T sont devenus une ressource importante pour les scientifiques de plantes de la sc&#xE8;ne des &#xE9;tudes g&#xE9;n&#xE9;tiques. Les rapports pr&#xE9;c&#xE9;dents ont indiqu&#xE9; que les lignes d&#x26;#39;insertion ADN-T peut avoir des translocations chromosomiques associ&#xE9;es avec le site d&#x26;#39;insertion ADN-T, mais la pr&#xE9;valence de ces r&#xE9;arrangements n&#x26;#39;a pas &#xE9;t&#xE9; bien document&#xE9;s. Pour d&#xE9;terminer la fr&#xE9;quence avec laquelle les translocations sont pr&#xE9;sents dans une collection largement utilis&#xE9; de lign&#xE9;es d&#x26;#39;insertion ADN-T, nous avons analys&#xE9; 64 lignes ind&#xE9;pendantes de la Salk ADN-T une collection de mutants. Translocations chromosomiques ont &#xE9;t&#xE9; d&#xE9;tect&#xE9;es dans 12 des 64 lignes interrog&#xE9;s (19%). Deux essais ont &#xE9;t&#xE9; utilis&#xE9;s pour cribler les lignes d&#x26;#39;ADN-T pour des translocations: la viabilit&#xE9; du pollen et l&#x26;#39;&#xE9;chelle du g&#xE9;nome cartographie g&#xE9;n&#xE9;tique. Bien que la mesure de la viabilit&#xE9; du pollen est un &#xE9;cran indirecte de la pr&#xE9;sence d&#x26;#39;une translocation, tous les 11 des lignes d&#x26;#39;ADN-T montrant un ph&#xE9;notype du pollen anormaux ont &#xE9;t&#xE9; trouv&#xE9;s pour contenir une translocation lorsqu&#x26;#39;ils sont analys&#xE9;s en utilisant la cartographie g&#xE9;n&#xE9;tique. Un ph&#xE9;notype du pollen normal n&#x26;#39;a pas, cependant, de garantir l&#x26;#39;absence d&#x26;#39;une translocation. Nous avons observ&#xE9; un ADN-T en ligne avec le pollen normal que n&#xE9;anmoins eu une translocation &#xE0; partir des r&#xE9;sultats de cartographie g&#xE9;n&#xE9;tique. Un ph&#xE9;nom&#xE8;ne suppl&#xE9;mentaire que l&#x26;#39;on observe &#xE0; travers les essais de cartographie g&#xE9;n&#xE9;tique est que les jonctions d&#x26;#39;ADN-T sur les 5&#x26;#39;-3&#x26;#39;-et c&#xF4;t&#xE9;s d&#x26;#39;un g&#xE8;ne cible peut g&#xE9;n&#xE9;tiquement s&#xE9;parer les uns des autres dans certains cas. Deux des lignes de notre enqu&#xEA;te affich&#xE9; ce ph&#xE9;nom&#xE8;ne des fronti&#xE8;res d&#x26;#39;ADN-T s&#xE9;par&#xE9;e &#xBB;. Les proc&#xE9;dures exp&#xE9;rimentales pour le d&#xE9;pistage efficace d&#x26;#39;ADN-T des lignes pour la pr&#xE9;sence d&#x26;#39;anomalies chromosomiques sont pr&#xE9;sent&#xE9;s et discut&#xE9;s.

Translocations chromosomiques sont un ph&#xE9;nom&#xE8;ne courant dans les lignes chez Arabidopsis Thaliana insertion ADN-T

Ordinato raccolte di Arabidopsis thaliana righe contenenti gli inserimenti di T-DNA mappati sono diventati una risorsa importante per gli scienziati di pianta eseguendo studi genetici. Rapporti precedenti hanno indicato che linee di inserimento del T-DNA possono avere traslocazioni cromosomiche associate al sito di inserimento del T-DNA, ma la prevalenza di questi riarrangiamenti non &egrave; stata ben documentata. Per determinare la frequenza con cui le traslocazioni sono presenti in un insieme di linee di inserimento del T-DNA ampiamente utilizzato, abbiamo analizzato 64 linee indipendenti dalla collezione Salk T-DNA mutante. Traslocazioni cromosomiche sono state rilevate in 12 delle 64 linee intervistate (19%). Due dosaggi sono stati utilizzati per lo screening delle linee di T-DNA per traslocazioni: vitalit&agrave; del polline e la mappatura genetica genome-wide. Anche se la misura della vitalit&agrave; del polline &egrave; uno schermo indiretto per la presenza di una traslocazione, 11 tutte le linee di T-DNA che mostrano un fenotipo anormale di polline sono stati trovati per contenere una traslocazione quando analizzato usando la mappatura genetica. Un fenotipo normale polline non, tuttavia, garantisce l&#39;assenza di una traslocazione. Abbiamo osservato una linea di T-DNA con polline normale che tuttavia aveva una traslocazione basata sulla genetica mappatura risultati. Un ulteriore fenomeno che abbiamo osservato attraverso i nostri esperimenti di mappatura genetica era che le giunzioni di T-DNA sui lati 5&#39;-e 3&#39;-di un gene bersaglio geneticamente possono separare gli uni dagli altri in alcuni casi. Due delle linee nel nostro sondaggio visualizzato questo separato di confini &#39; t-DNA&#39; fenomeno. Procedure sperimentali per lo screening in modo efficiente linee T-DNA per la presenza di anomalie cromosomiche sono presentate e discussi.

Traslocazioni cromosomiche sono un fenomeno comune nelle linee di inserimento di Arabidopsis thaliana T-DNA.

&#x30DE;&#x30C3;&#x30D7;&#x3055;&#x308C;&#x305F;T-DNA&#x306E;&#x633F;&#x5165;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;&#x884C;&#x306E;&#x9806;&#x5E8F;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x30B3;&#x30EC;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B66;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x3092;&#x884C;&#x3046;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x79D1;&#x5B66;&#x8005;&#x306B;&#x3068;&#x3063;&#x3066;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x30EA;&#x30BD;&#x30FC;&#x30B9;&#x3068;&#x306A;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x524D;&#x56DE;&#x306E;&#x30EC;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x3067;&#x306F;&#x3001;T-DNA&#x633F;&#x5165;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x306F;T-DNA&#x633F;&#x5165;&#x90E8;&#x4F4D;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304C;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x518D;&#x914D;&#x7F6E;&#x306E;&#x6709;&#x75C5;&#x7387;&#x306F;&#x3001;&#x5341;&#x5206;&#x306B;&#x6587;&#x66F8;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x306F;&#x3001;T-DNA&#x633F;&#x5165;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;&#x5E83;&#x304F;&#x4F7F;&#x308F;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x30B3;&#x30EC;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x5185;&#x306B;&#x5B58;&#x5728;&#x3059;&#x308B;&#x983B;&#x5EA6;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x30BD;&#x30FC;&#x30AF;T-DNA&#x5909;&#x7570;&#x4F53;&#x30B3;&#x30EC;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x304B;&#x3089;64&#x306E;&#x72EC;&#x7ACB;&#x3057;&#x305F;&#x884C;&#x3092;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x306F;&#x3001;&#x8ABF;&#x67FB;&#x5BFE;&#x8C61;&#x306E;64&#x884C;&#x4E2D;12&#x4F8B;&#xFF08;19&#xFF05;&#xFF09;&#x3067;&#x691C;&#x51FA;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x82B1;&#x7C89;&#x751F;&#x5B58;&#x7387;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30EF;&#x30A4;&#x30C9;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#xFF1A;&#x4E8C;&#x3064;&#x306E;&#x30A2;&#x30C3;&#x30BB;&#x30A4;&#x306F;&#x3001;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;T-DNA&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x3092;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30FC;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x82B1;&#x7C89;&#x751F;&#x5B58;&#x7387;&#x306E;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x306F;&#x3001;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x306E;&#x9593;&#x63A5;&#x7684;&#x306A;&#x753B;&#x9762;&#x3067;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x7570;&#x5E38;&#x306A;&#x82B1;&#x7C89;&#x306E;&#x8868;&#x73FE;&#x578B;&#x3092;&#x793A;&#x3059;T-DNA&#x306E;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x884C;11&#x306F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x305F;&#x3068;&#x304D;&#x306B;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x5224;&#x660E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x901A;&#x5E38;&#x306E;&#x82B1;&#x7C89;&#x306E;&#x8868;&#x73FE;&#x578B;&#x306F;&#x3001;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x304C;&#x5B58;&#x5728;&#x3057;&#x306A;&#x3044;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x4FDD;&#x8A3C;&#x3059;&#x308B;&#x3082;&#x306E;&#x3067;&#x306F;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x305D;&#x308C;&#x306B;&#x3082;&#x304B;&#x304B;&#x308F;&#x3089;&#x305A;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x3092;&#x6301;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x6B63;&#x5E38;&#x306A;&#x82B1;&#x7C89;&#x3092;1 T-DNA&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x3092;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x5B9F;&#x9A13;&#x3092;&#x901A;&#x3057;&#x3066;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3057;&#x305F;&#x4E00;&#x3064;&#x306E;&#x8FFD;&#x52A0;&#x306E;&#x73FE;&#x8C61;&#x304C;&#x6A19;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;5&#x26;#39;-&#x304A;&#x3088;&#x3073;3&#x26;#39;-&#x5074;&#x306B;T-DNA&#x306E;&#x63A5;&#x5408;&#x306F;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x306B;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x30B1;&#x30FC;&#x30B9;&#x3067;&#x306F;&#x4E92;&#x3044;&#x304B;&#x3089;&#x5206;&#x96E2;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3068;&#x3044;&#x3046;&#x3053;&#x3068;&#x3067;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306E;&#x8ABF;&#x67FB;&#x3067;&#x306F;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;2&#x3064;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E; &#x26;quot;T-DNA&#x30DC;&#x30FC;&#x30C0;&#x30FC;&#x5225;&#x26;quot;&#x73FE;&#x8C61;&#x3092;&#x8868;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x52B9;&#x7387;&#x7684;&#x306B;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x7570;&#x5E38;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;T-DNA&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x3092;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30FC;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x5B9F;&#x9A13;&#x624B;&#x9806;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x3001;&#x8B70;&#x8AD6;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x306F;&#x3001;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;T-DNA&#x633F;&#x5165;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306A;&#x73FE;&#x8C61;&#x3067;&#x3042;&#x308B;

Arabidopsis thaliana&#xC758; &#xCEEC;&#xB809;&#xC158; &#xC8FC;&#xBB38; &#xB9E4;&#xD551;&#xB41C; T DNA &#xC0BD;&#xC785; &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C; &#xC904;&#xC740; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xACFC;&#xD559;&#xC790; &#xB4E4;&#xC740; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xC218;&#xD589;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC790;&#xC6D0; &#xB418;&#xACE0;&#xC788;&#xB2E4;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xC804; &#xBCF4;&#xACE0;&#xC11C;&#xB294; T-DNA &#xC0BD;&#xC785; &#xB77C;&#xC778; T DNA &#xC0BD;&#xC785; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; translocations&#xC744; &#xAC00;&#xC9C8; &#xC218; &#xC788;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC7AC;&#xBC30;&#xC5F4;&#xC758; &#xC720;&#xD589;&#xC744; &#xC798; &#xC124;&#xBA85; &#xD558;&#xC9C0; &#xD45C;&#xBA85; &#xD588;&#xB2E4;. Translocations T DNA &#xC0BD;&#xC785; &#xB77C;&#xC778;&#xC758; &#xB110;&#xB9AC; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB418;&#xB294; &#xCEEC;&#xB809;&#xC158;&#xC5D0;&#xB294; &#xBE48;&#xB3C4; &#xACB0;&#xC815; &#xD558;&#xB824;&#xBA74; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC194; &#xD06C; T DNA &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xCEEC;&#xB809;&#xC158;&#xC5D0;&#xC11C; 64 &#xB3C5;&#xB9BD; &#xB77C;&#xC778;&#xC744; &#xBD84;&#xC11D; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; translocations 12 &#xC870;&#xC0AC; &#xB300;&#xC0C1; 64 &#xC904; (19%)&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xACAC; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD654;&#xBA74; translocations&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; T DNA &#xB77C;&#xC778; &#xB370; &#xB450; &#xBD84;&#xC11D; &#xC2E4;&#xD5D8;: &#xAF43;&#xAC00;&#xB8E8; &#xC0DD;&#xC874; &#xB2A5;&#xB825; &#xBC0F; &#xAC8C;&#xB188; &#xC804;&#xCCB4; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB9E4;&#xD551;. &#xAF43;&#xAC00;&#xB8E8; &#xC0DD;&#xC874; &#xB2A5;&#xB825;&#xC758; &#xCE21;&#xC815;&#xC740; &#xC804; &#xC874;&#xC7AC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAC04;&#xC811;&#xC801;&#xC778; &#xD654;&#xBA74; &#xC774;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xBE44;&#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xAF43;&#xAC00;&#xB8E8; &#xD615; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC8FC;&#xB294; T DNA &#xB77C;&#xC778;&#xC758; &#xBAA8;&#xB4E0; 11 &#xC804; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB9E4;&#xD551;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xBD84;&#xC11D; &#xD558;&#xB294; &#xACBD;&#xC6B0; &#xD3EC;&#xD568;&#xC744; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098; &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xAF43;&#xAC00;&#xB8E8; &#xD615;&#xC740; &#xC804; &#xBD80;&#xC7AC;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC7A5; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7FC;&#xC5D0;&#xB3C4; &#xBD88;&#xAD6C; &#xD558; &#xACE0; &#xD55C; &#xC804; &#xC88C;&#xB97C; &#xAC00;&#xC9C4; &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xAF43;&#xAC00;&#xB8E8;&#xC640; T DNA &#xB77C;&#xC778;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xC720;&#xC804; &#xAD00;&#xCC30; &#xACB0;&#xACFC; &#xB9E4;&#xD551;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC720;&#xC804; &#xB9E4;&#xD551; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xAD00;&#xCC30; &#xD558;&#xB294; &#xD558;&#xB098;&#xC758; &#xCD94;&#xAC00; &#xD604;&#xC0C1; &#xC600;&#xC8E0; T DNA &#xC811;&#xD569;&#xBD80;&#xC5D0; 5&#39;-3&#39;-&#xBA74; &#xD0C0;&#xAC9F;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xACBD;&#xC6B0;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xC11C;&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978; &#xBCC4;&#xB3C4; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC218;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC124;&#xBB38; &#xC870;&#xC0AC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB77C;&#xC778;&#xC758; &#xB450;&#xC774; &#39; T DNA &#xD14C;&#xB450;&#xB9AC; &#xBCC4;&#xB3C4; &#xD45C;&#xC2DC; &#39; &#xD604;&#xC0C1;. &#xD6A8;&#xC728;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; T DNA &#xB77C;&#xC778;&#xC5D0; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC774;&#xC0C1;&#xC774; &#xC788;&#xB294;&#xC9C0;&#xB97C; &#xAC80;&#xC0AC; &#xD558;&#xB294; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xC808;&#xCC28;&#xB294; &#xC81C;&#xC2DC; &#xB418; &#xACE0; &#xB17C;&#xC758;.

&#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; translocations&#xB294; Arabidopsis thaliana T DNA &#xC0BD;&#xC785; &#xB77C;&#xC778;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xD604;&#xC0C1;.

Colecciones ordenadas de las l&#xED;neas de Arabidopsis thaliana que contienen asignadas inserciones de ADN-T se han convertido en un recurso importante para los cient&#xED;ficos que realizan estudios gen&#xE9;ticos de las plantas. Informes anteriores han indicado que el T-DNA de l&#xED;neas de inserci&#xF3;n puede tener translocaciones cromos&#xF3;micas asociadas con el sitio de inserci&#xF3;n de T-ADN, pero la prevalencia de estos reordenamientos no ha sido bien documentado. Para determinar la frecuencia con que las translocaciones est&#xE1;n presentes en una colecci&#xF3;n ampliamente utilizado de las l&#xED;neas de inserci&#xF3;n de T-ADN, se analizaron 64 l&#xED;neas independientes de la Salk T-DNA de la colecci&#xF3;n mutante. Translocaciones cromos&#xF3;micas fueron detectados en 12 de las 64 l&#xED;neas de encuestados (19%). Dos ensayos se utiliza para la inspecci&#xF3;n de las l&#xED;neas T-DNA de translocaciones: la viabilidad del polen y de todo el genoma de mapeo gen&#xE9;tico. Aunque la medici&#xF3;n de la viabilidad del polen es una pantalla indirecta de la presencia de una translocaci&#xF3;n, todas las l&#xED;neas 11 de T-ADN que muestran un fenotipo polen anormal se encontr&#xF3; que contienen una translocaci&#xF3;n cuando se analiz&#xF3; utilizando el mapeo gen&#xE9;tico. Un fenotipo polen normal no obstante, garantizar la ausencia de una translocaci&#xF3;n. Hemos observado una l&#xED;nea de T-ADN con el polen normal que sin embargo ten&#xED;a una translocaci&#xF3;n sobre la base de resultados de los mapas gen&#xE9;ticos. Un fen&#xF3;meno adicional que se observ&#xF3; a trav&#xE9;s de nuestros experimentos de mapeo gen&#xE9;tico fue que las uniones de ADN-T en los 5&#x26;#39;-3 &#x26;#39;y los lados de un gen dirigido gen&#xE9;ticamente pueden separar unos de otros en algunos casos. Dos de las l&#xED;neas de nuestra encuesta muestran este fen&#xF3;meno de T-ADN de las fronteras por separado &#x26;quot;. Los procedimientos experimentales para la eficiente detecci&#xF3;n del ADN-T para las l&#xED;neas de la presencia de anomal&#xED;as cromos&#xF3;micas se presentan y discuten.

Katie A. Clark

Department of Zoology

Oregon State University

Ice-Cap: A Method for Growing Arabidopsis and Tomato Plants in 96-well Plates for High-Throughput Genotyping

Katie A. Clark

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Oregon State University

Ice-Cap: A Method for Growing Arabidopsis and Tomato Plants in 96-well Plates for High-Throughput Genotyping

Department of Zoology