Imagem de organoides derivados de câncer colorretal imunocorados em hidrogel peptídico para avaliar os efeitos de peptídeos automontáveis na adesão celular

Para começar, imagine as amostras organoides derivadas de SW1222 coradas com um microscópio de epifluorescência a 10x. Use apenas os canais Rhod e DAPI. Inicie o software ImageJ e clique no plugin, seguido de macros.

Em seguida, execute para executar o conversor de ROI do ImageJ. py do site do GitHub do Cell Pose. Quando uma janela aparecer, selecione o primeiro arquivo da pasta organoide de dois pontos e clique em abrir.

Em seguida, escolha o seg. npy correspondente ao primeiro arquivo e clique em abrir. Em seguida, pressione selecionar tudo na janela do gerenciador de ROI e pressione medir.

Agora, clique em arquivo, seguido de salvar como na janela de resultados para salvar os resultados. Repita a conversão de imagem para a mesma imagem na pasta para o lúmen organoide do cólon. Em seguida, carregue o software Origin Pro, clique em dados, seguido de importar arquivo para localizar o assistente de importação.

Selecione os dois arquivos CSV correspondentes às propriedades organoide e em forma de lúmen para a mesma imagem. Copie as propriedades em forma de lúmen na coluna de resultados da colônia para emparelhar cada medição de lúmen com sua colônia correspondente. Em uma nova coluna, divida as áreas do lúmen e da colônia para obter a área relativa do lúmen de sua colônia correspondente.

Selecione a coluna correspondente à circularidade de cada colônia e a área do lúmen. Em seguida, clique sequencialmente no gráfico, 2D básico e dispersão. Clique com o botão direito do mouse na janela de plotagem e escolha os detalhes da plotagem.

Clique na guia centroid pro e selecione as opções mostrar ponto centróide para subconjunto, conectar-se a pontos de dados e mostrar elipse. As células cultivadas em 2D tiveram uma variação muito alta na circularidade da colônia. As células cultivadas em Matrigel tiveram uma distribuição mais extensa para o tamanho relativo do lúmen.