Promotor captura Oi-c: Alta resolução, todo o genoma caracterização das interações do promotor

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•

10:16 min

•

June 28th, 2018

DOI :

10.3791/57320-v

June 28th, 2018

•

Stefan Schoenfelder*¹, Biola-Maria Javierre*¹^,², Mayra Furlan-Magaril¹^,³, Steven W. Wingett¹^,⁴, Peter Fraser¹^,⁵

¹Nuclear Dynamics Programme, The Babraham Institute, Babraham Research Campus, ²IJC Building, Campus ICO-Germans Trias i Pujol, Josep Carreras Leukemia Research Institute, ³Departamento de Genética Molecular, Instituto de Fisiología Celular, Universidad Nacional Autónoma de México, ⁴Bioinformatics Group, The Babraham Institute, Babraham Research Campus, ⁵Department of Biological Science, Florida State University

Resumo

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Gen tica

quest o 136

organiza o do genoma 3D

promotores

melhoradores

intera es de longo alcance

Hi C

cis elementos reguladores

estudo de associa o de genoma larga GWAS

n o codificantes variantes da doen a

loops de cromatina

CHiCAGO

HiCUP

Capítulos neste vídeo

0:04

Title

0:52

Formaldehyde Fixation

2:14

HindIII Digestion and Biotinylation of Restriction Fragment Overhangs

4:09

Hybrid In-solution Capture

6:53

Isolation of Promoter Fragment-containing Ligation Products

8:55

Results: IL8 PCHi-C Profile in Human Hematopoietic Cells

9:34

Conclusion

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