белки образуют комплексы с другими маленькими и крупными молекулами, в том числе нуклеиновыми кислотами, углеводами и липидами. Их называют конъюгированные белки, что означает, что их комплексы состоят и из аминокислот, и из небелковых компонентов. Нуклеопротеины состоят из обоих:белков и нуклеиновых кислот.

Деоксирибонуклеопротеины, белки, или DNP, содержат ДНК и обычно находятся в ядре. В эукариотических клетках, ДНК плотно обернута вокруг белков гистона, формируя нуклеосомы, важую часть хромосомной структуры. Рибонуклеопротеины, Или RNР, содержат РНК и могут быть расположены как в ядре, так и в цитоплазме.

Сплайсеосома большой комплекс пяти малых ядерных RNP, или мяРНП, содержащие оба:РНК и белок, а также кофакторы. Эта сплайсосома удаляет нежелательные нуклеотиды из предшествеющей расшифровки генов. Гликопротеины и протеогликаны белковые комплексы.

Они содержат углеводы различных размеров. Антитела гликопротеины с короткими углеводными цепями, критические для нормального режима иммунной функции. Напротив, протеогликаны образуются долго, повторяя сахарные единицы.

Часто это модифицированные сахара, которые содержат другие функциональные группы вместо гидроксильной группы. Протеогликаны основной компонент внеклеточнй матрицы в длинном костяке, обеспечивающем беспрепятственное движение соединений. Липиды также комбинируются с белками для выполнения разнообразных функций.

Липопротеины водо-растворимые комплексы, имеющие гидрофобное липидное ядро и гидрофильную белковую поверхность. Нерастворимый холестерин не может свободно передвигаться по крови. Поэтому он связывается с липопротеиновым ядром, которое помогает в его транспортировке.

Напротив, протеолипиды-нерастворимые в воде комплексы, с гидрофобными остатками аминокислот, прикреплёнными к липидным молекулам. Липиды изобилуют в ткани мозга, где они могут образовывать изолирующее покрытие, которое сохраняет нормальные моторные функции. Кроме того, белки формируют комплексы с другими типами молекул.

Эритроциты получают цвет из гема, не-белкового компонента гемоглобина. У гема есть центральный атом железа, который связывает и транспортирует кислород через кровоток.