JoVE Logo
АВТОРЫ
СВЯЖИТЕСЬ С НАМИ

Войдите в систему

Для просмотра этого контента требуется подписка на Jove Войдите в систему или начните бесплатную пробную версию.

В этой статье

  • Резюме
  • Аннотация
  • Введение
  • протокол
  • Результаты
  • Обсуждение
  • Раскрытие информации
  • Благодарности
  • Материалы
  • Ссылки
  • Перепечатки и разрешения

Резюме

Рекомбинантный белок инженерии гидрогели являются выгодными для 3D клеточной культуры, поскольку они позволяют для полной перестройки полимера позвоночника и, следовательно, микроокружения клеток. Здесь мы описываем процесс очистки рекомбинантных белков эластина как и его применение в 3D гидрогеля клеток инкапсуляции.

Аннотация

Двухмерный (2D) культуры ткани методы имели важнейшее значение для нашего понимания фундаментальных клеточной биологии. Однако отсутствие систем традиционные 2D культуры ткани, матрицу трехмерного (3D), что привело к значительному разрыв между результаты собраны в пробирке и в естественных условиях. Чтобы устранить это ограничение, исследователи инженерии 3D гидрогеля культуры ткани платформ, которые могут имитировать биофизических и биохимических свойств микроокружения клеток в естественных условиях . Это исследование побудило необходимость разработки материалов платформ, которые поддерживают 3D клеток инкапсуляции и ниже по течению биохимических анализов. Рекомбинантный белок Инжиниринг предлагает уникальный набор инструментов для 3D гидрогеля материал дизайн и развития, позволяя для определенного контроля последовательности белка и, следовательно, выдвижением, потенциальные механических и биохимических свойств результирующей Матрица. Здесь мы представляем протокол для выражения recombinantly производные эластин как белка (ELP), который может использоваться для формы гидрогели самостоятельно перестраиваемый механических свойств и концентрации клеток клей лиганда. Мы далее представить методологию для инкапсуляции ячейки в пределах ELP гидрогелей и последующего immunofluorescent окрашивание встроенных клетки течению анализа и количественной оценки.

Введение

За последнее столетие двухмерный (2D) тканевой культуры превратился в составной набор инструментов для изучения основных клеток биологии в пробирке. Кроме того относительно недорогих и простых протоколов для 2D клеточной культуры привели к его принятию во многих биологических и медицинских дисциплин. Однако последние исследования показали, что традиционные 2D платформы может привести к результатам, что отклоняться заметно от этих собранных в естественных условиях, вызывая драгоценное время и средства впустую клинически ориентированных исследований1,2, 3. Мы и другие предполагают, что это расхождение может объясняться отсутствием родной биохимические и биофизические подсказки для ячейки, культивируемых на 2D-поверхностей, которые могут быть необходимы для оптимального распространения и созревания различных типов клеток.

Для устранения этих ограничений и помочь мост разрыва между 2D in vitro и in vivo исследования, исследователи имеют развитые трехмерные (3D) гидрогеля платформ для клеток инкапсуляции1,4,5 ,6. Гидрогели являются идеальным материалами для пилки эндогенного микроокружения внеклеточного матрикса (ECM) в естественных условиях из-за их механические свойства ткани, как и вода опухшие структуры, которая позволяет быстрый транспорт питательных веществ и сигнализации факторы7,8. Кроме того 3D гидрогели могут быть разработаны для независимого контроля над механических и биохимических свойств леса. Матрица механика9,10,,1112 и клеток клей лигандов13,,1415 хорошо известны влиять на клетки поведение в пробирке и в vivo. Таким образом 3D гидрогели с перестраиваемой свойства предлагают платформу для изучения причинно-следственных связей между клетками и их микроокружения. Критерии для идеального 3D гидрогеля матрицы включают простой, не цитотоксических клеток инкапсуляции, а также независимые перестройки физиологически соответствующих механических свойств и имитирует родной клеток клей мотивов.

Оба синтетические (например., полиэтиленгликоль, полимолочной кислоты, поли (гликолевая кислота)) и естественно производные (например., альгинат, коллаген, Matrigel) гидрогели имеют преимущества над 2D в vitro культуры платформ; Однако они также имеют существенные недостатки, ограничивающие их применимости. Во-первых, многие синтетические и естественно производные платформ требуют суровых сшивки условий, которые могут быть потенциально токсичными для клеток млекопитающих, ведущих к снижение жизнеспособности клеток7. Кроме того многие синтетические платформ не хватает родной биологическую и нужно быть функционализированных через вторичных химических реакций, которые можно добавить повышение стоимости и сложности16. Наконец в то время как естественно производные материалы обычно содержат встроенные био активных доменов, они часто страдают от высокой изменчивости партии к партии и часто ограничиваются формирования относительно слабый гели7,17.

Рекомбинантный белок инженерии представляет уникальный набор инструментов для дизайна материалов, позволяя явный контроль над последовательности белка и выдвижением, потенциальные механических и биохимических свойств окончательного гидрогеля эшафот18. Кроме того используя известные биологического механизма Escherichia coli (E. coli) выразить белков, могут изготавливаться материалы эффективно и последовательно с ограниченной Интер - и интра Пакетная изменчивости. Эластин подобных белков (ELP) представлены здесь имеет три инженерии доменов: (1 T7 и His6 тег, который позволяет для маркировки через дневно меткой антител, (2 «эластин как» регион, который наделяет упругой механических свойств и позволяет для химического сшивки и (3) «био активных» регион, который кодирует для клеток клей мотивы.

Наш регион эластин как основана на канонической (Валь-Pro-Gly-Xaa-Gly)5 эластина последовательности, где четыре из Xaa сайты аминокислоты изолейцина (Ile), но может быть разработан, чтобы быть любой аминокислот Кроме пролина. Эта последовательность наделяет рекомбинантных ELPs с нижней температуры (СМЕШЕНИЯ) поведением критические решения, которые могут быть использованы для простой очистки после выражения через тепловые Велоспорт19,20. Это свойство СМЕШЕНИЯ могут быть настроены для термически совокупных при разных температурах, изменяя гость «Xaa» остатков21,22.

Здесь «Xaa» позиции на одном из пяти повторений эластин как была заменена Амин представляя лизина (Lys) аминокислота, которая используется для сшивания гидрогеля. Наши предыдущие работы показал не цитотоксических и надежные сшивки реакции с Амин реактивный сшивателя тетракис (гидроксиметил) фосфониевых хлорид (THPC)23. По различной общее содержание и сшивателя концентрацию белка мы в состоянии производить гидрогели, которые могут быть настроены для диапазона23,9,физиологически соответствующей жесткости диапазона (~0.5-50 кПа)24. Помимо Тюнинг механических свойств, клеточной адгезии в пределах гидрогеля результаты от интеграции канонических клеток клей домены в пределах костяк ELP белка. Например включение расширенной фибронектин производные «RGDS» аминокислотной последовательности позволяет для клеточной адгезии и конформационные гибкость, а омлет, обязательной «RDGS» вариант ограничивает ячейки матрицы адгезии24. Путем модулирования соотношение клеток клей для не клей белков, а также концентрации общего белка, мы способны эффективно производить гидрогели, которые охватывают широкий спектр лигандом концентрации. Resultantly мы разработали платформу гидрогеля с развязкой биохимические и биофизические свойства, которые могут быть настроены независимо для оптимального 3D культуры различных типов клеток.

Помимо матрицы жесткости и клей лигандом перестройки рекомбинантных гидрогели предлагают возможности для разработки конкретных деградации материала профилей, который необходим для распространения клеток, распространением и миграции в рамках 3D контексте4 , 9. Эта деградация обеспечивается клеток секрецию протеаз, которые специально направлены на расширенной «RGDS»9 или эластин как последовательность25. ELP гидрогели, также было показано, для поддержки последующих биохимических анализов, которые необходимы для изучения жизнеспособности клеток и функции, включая immunocytochemistry, а также извлечения ДНК/РНК/белков для количественных реверс транскрипции полимеразной цепной реакции (qRT-PCR) и западной помарки9. ELP варианты также были использованы в ряде моделей в естественных условиях и, как известно, быть хорошо переносится иммунной системы26.

Вместе взятые, ELP как материальный платформу для исследования клеток инкапсуляции предлагает широкий спектр преимуществ по сравнению с синтетической или естественно производного материала платформы, которые зачастую не имеют такую же степень биохимические и биофизические перестройки и воспроизводимость. Кроме того, ПЭП простой и не цитотоксических использования с широкий спектр типов клеток (например., куриных Спинной корень ганглиев14,24, мышиных нейронных прародитель клетки9, человека мезенхимальных стволовых клеток27, говяжьи новорожденных хондроцитов28, человека эндотелиальных клеток29,30) позволяет для более физиологически соответствующие модели эндогенного 3D ECM, по сравнению с 2D клеточной культуры. Здесь мы представляем протокол для выражения recombinantly производные, ELPs для использования в качестве платформы перестраиваемый Гидрогель для 3D мобильных инкапсуляции. Далее мы представляем методологии вниз по течению люминесцентные маркировки и confocal микроскопии инкапсулированных клеток.

протокол

1. ELP выражение протокол

  1. День 1: Рост колонии стартера
    1. Подготовьте Ампициллин и Хлорамфеникол Агар пластины, автоклавирования 25 g Лурия бульон и 15 г агара на 1 Л ультрачистая вода. После того, как раствор остынет до ~ 60 ° C, добавьте 1 mL ампициллин запасов (100 мг/мл в ультрачистая вода) и 1 мл бульона Хлорамфеникол (34 мг/мл в 70% этиловом спирте) до 1 Л раствора агар для окончательного концентрации 100 мкг/мл и 34 мкг/мл , соответственно. 20 мл окончательного решения передать 10 см Петри с Серологические Пипетки и позволяют агар затвердеть. Оберните Петри с парафина и хранить при 4 ° C.
      Примечание: Петри могут храниться при температуре 4 ° C на срок до двух недель.
    2. Полоска небольшой образец BL21 pLysS E. coli (DE3) из готовых бактериальных запасов, содержащих pET15b вектор кодирования ELP интерес на Ампициллин и Хлорамфеникол Агар пластины.
      Примечание: Ампициллин и хлорамфеникол выбрать для бактерии, содержащие векторов pET15b и pLysS, соответственно.
    3. Переверните пластину прожилками в инкубаторе при 37 ° C. Разрешить колонии бактерий расти на ночь.
      Примечание: Не инкубировать пластины для более чем 16 h, как Ампициллин будет деградировать и могут образовывать колонии, которые не осуществляют ампициллин сопротивления.
  2. День 2: Подготовка начинающих культуры и выражения СМИ
    1. Удалите из инкубатора культуры е. coli . Парафина пластину и хранилище для максимум 4 дней при 4 ° C.
    2. Подготовьте стартовые культуры колбу (250 мл) и выражения культуры колбы (12 x 1 Л) и автоклав. На 1 Л выражения СМИ добавить 47.6 g потрясающий бульона и 4 мл глицерина в 1 Л сверхчистой воды в колбу озадачен культуры 2 Л и крышка с алюминиевой фольгой.
      Примечание: Типичный урожаи, 60-100 мг/Л белка выражения СМИ.
    3. Загрузить газобетона стартер в подогретым, пожимая инкубатора 37 ° C и инкубировать без агитации.
    4. Добавьте 250 мкл акций стерильной фильтрации (0.22 мкм фильтром) ампициллин (100 мг/мл в ультрачистая вода) для закваски для конечной концентрации 100 мкг/мл. Немедленно начнете, агитируя закваски на 250 об/мин.
      Примечание: Хлорамфеникол используется только для выбора колонии на плитах агара и не включается для жидких культур.
    5. Прививок закваски, добавив один ELP плазмида содержащих E. coli колонии с прожилками плиты и позволяют закваски пожать при 37 ° C для 16 h.
    6. Поместите выражение культуры средств массовой информации, которую колбы в предварительно разогретую, 37 ° C, автоклавы-смесители и инкубировать на ночь без агитации, так что колбы готовы прививок на следующее утро.
  3. День 3: Склонение выражение протеина в E. coli
    1. Сделайте свежий, стерильной фильтрации ампициллин фондовой (100 мг/мл в ультрачистая вода). Добавьте 1 mL ампициллин запасов для каждого настой выражения СМИ для конечной концентрации 100 мкг/мл.
    2. Начните, агитируя выражение СМИ на 250 об/мин.
    3. Взять образец 2 мл средства массовой информации из любого выражения колбу и добавить в кювет как пропуск для оптической плотности, чтение на 600 Нм (600OD).
    4. После завершения 16 h стартовые культуры инкубации прививать каждое выражение колбу путем передачи 20 мл закваски для каждого выражения настой через Серологические Пипетки.
    5. После завершения 1 h агитации Измерьте ОД600 одного из фляги выражение. После этого шага Измерьте ОД600 каждые 20 мин, проверка другой колбе каждый раз.
    6. В ОД600 0,6 Снизьте температуру шейкеры, содержащий выражение колбы до 32 ° C.
    7. Проверка ОД600 каждые 10 мин. В ОД600 0,8 побудить выражение, добавив 1 мл 1 м, стерильной фильтрации β-изопропиловый thiogalactoside (IPTG) в сверхчистого воды для каждого выражения колбу.
    8. Разрешить E. coli в колбах выражение выразить за 7 мин.
    9. 20 мин до конца выражения, предварительно охлаждать большие напольные центрифуги до 4 ° C.
    10. Соберите все 12 L выражение СМИ в отдельных центрифуги контейнеров и баланса.
    11. Центрифуга для выражения СМИ на > g 12000 x 15 мин при 4 ° C, с помощью напольные центрифуги.
    12. Слить супернатант из каждого контейнера центрифуги. С помощью шпателя, соберите клетки окатышей в предварительно взвешенный zip lock мешок.
    13. Вновь приостановить гранулы в стерильной фильтрации десять буфера (100 мл буфера на 25 г гранул) и удалите избыток воздушные пузыри, массируя гранулы. На 1 Л десяти буфера добавьте 5,8 г натрия хлорида, 1.21 g tris база и 0,37 g Этилендиамин tetraacetic кислоты (ЭДТА) динатриевой соли дигидрат 900 мл ультрачистая вода. Отрегулируйте пэ-аш до 8.0 и довести до 1 л. Для этого шага рН полоски являются достаточными.
    14. Поместите zip-lock мешок, содержащий вновь приостановлено клеток Пелле в вторичный контейнер и заморозить при температуре-80 ° C на ночь.
  4. 4-6 день: сверлении клеточной стенки бактерий через циклов замораживания оттаивания
    1. Удаление замороженных гранулы из морозильника и позволить ему медленно оттепели на 4 ° C с нежным агитация с использованием орбитальный шейкер.
    2. Разрешить Пелле таять до тех пор, пока некоторые жидкости присутствует. Добавить ~ 30-40 мг в дезоксирибонуклеаза я (DNase), чтобы разморозить lysate. Кроме того добавьте 1 мл 100 мм phenylmethylsulphonyl фтора (PMSF; ингибитор протеазы) в изопропаноле на 100 мл lysate клетки. Разрешить lysate трясти на ночь.
      Примечание: Добавление DNase и PMSF необходим только для первого цикла замораживания оттаивания.
      Предупреждение: PMSF токсичен при вдыхании. Маска должна использоваться при обработке PMSF порошок.
    3. После того, как полностью разморожен lysate клетки, заморозить lysate-80 ° c на ночь, или до полностью заморожены.
    4. Повторите процедуру замораживания оттаивания для в общей сложности трех циклов. Оставьте lysate разморозить при температуре 4 ° C после последнего замораживания оттаивания. Магазин 100 мкл сырья lysate анализа натрия Додециловый сульфат полиакриламидных гель электрофореза (SDS-PAGE) по завершении очистки.
    5. После последнего оттепель скорректировать рН талой lysate 9.0 с помощью 1 M NaOH. Для этого шага рН полоски являются достаточными. Инкубируйте на 4 ° C, по крайней мере 1 часа (ночь подходит) на орбитальный шейкер.
  5. 7-9 день: ELP очищение через холодного и горячего отжима тепловой Велоспорт
    1. Прохладный пол центрифуге до 4 ° C 20 мин до центрифугирования.
    2. Алиготе и баланс талой lysate в центрифуге контейнеры.
    3. Центрифугуйте образцы на > 15000 x g за 1 час при 4 ° C. Магазин 100 мкл супернатант для анализа SDS-PAGE после завершения очистки.
      Примечание: После центрифугирования, ELP белка должны оставаться в надосадке из-за его высокой растворимости в воде при температуре ниже ее СМЕШЕНИЯ (< 32 ° C).
    4. Передача супернатант новых центрифуг контейнеров и надлежащим образом сбалансировать.
    5. Добавление хлорида натрия (NaCl) в трех частях в конечной концентрации 1 м (5.84 г NaCl на каждые 100 мл супернатант). Убедитесь, что NaCl добавляется в трех частях для достаточного растворения.
    6. Агитируйте за 3 ч при 37 ° C на 250 об/мин в тряску инкубатора.
    7. 1 час до конца агитации, предварительно теплый пол центрифуге до 37 ° C.
    8. Центрифуга на > 15000 x g за 1 ч при 37 ° C. Хранить 100 мкл супернатант для анализа SDS-PAGE после завершения очистки и отменить оставшиеся супернатант.
      Примечание: После центрифугирования, белок ELP следует гранулированных в из-за его низкой растворимостью в воде при температуре выше его СМЕШЕНИЯ (> 32 ° C).
    9. Вновь приостановите гранулы, добавив 10 мл газобетона, сверхчистый воды на 1 г гранул. Использование металлической лопаткой пюре гранулы для помощи в распада белка.
    10. Отрегулируйте pH талой lysate 9.0 с помощью 1 M NaOH. Для этого шага рН полоски являются достаточными.
    11. Агитируйте на ночь при 4 ° C на орбитальный шейкер.
    12. Повторить процедуру циклирования, холодного и горячего отжима тепловой для в общей сложности трех циклов (т.е., повторите шаги 1.5.1 через 1.5.11 три всего цикла).
  6. 10-15 день: ELP диализа и лиофилизации
    1. Центрифуга вновь приостановлено гранулы в предварительно охлажденной центрифуге на > 15000 x g за 1 час при 4 ° C. Магазин 100 мкл супернатант для анализа SDS-PAGE после завершения очистки.
    2. Опреснения раствор белка, dialyzing оставшиеся супернатант в мембране диализа 3.5 кДа против 4 L предварительно охлажденные ультрачистая вода при 4 ° C. Меняйте воду диализа дважды в день в течение в общей сложности 6 раз на 3 дня.
      Примечание: Типичный супернатанта томов, между 5 и 30 мл.
    3. Центрифуга dialyzed решение в центрифугу предварительно охлажденным в > 15000 x g за 1 час при 4 ° C. Магазин 100 мкл супернатант для анализа SDS-PAGE в конце очистки.
    4. Заморозить результирующей супернатант в-80 ° C в предварительно взвешенный конические трубы.
    5. Lyophilize замороженные решение для 3 дней и массы конечного продукта для определения белка урожая.
    6. Парафина пробирки, содержащие финале лиофилизированный ELP продукта и хранить при 4 ° C.
    7. Запустите SDS-PAGE чтобы определить чистоту белка.
      Примечание: Протоколы для SDS-PAGE будет различаться в зависимости от условий конкретных агарозы гель. Для наших экспериментов окончательный лиофилизированные белка был распущен в концентрации 0,5 мг/мл в деионизированной воде и работать на 140 V для 70-100 мин в гель акриламида 12% (w/v) под денатурации условий.

2. ячейки Инкапсуляция в 3D эластин подобных белков гидрогели

  1. Подготовка силиконовые формы
    1. Используйте биопсии удар с нужного диаметра для создания отверстия в листе силиконовые толщиной 0,5 мм и Вырезать квадрат вокруг каждого отверстия. Повторите для количество требуемой формы.
      Примечание: Диаметр и толщину формы могут корректироваться для конкретного приложения и условий культуры клеток. На практике, для культур клеток 50 106 клеток/мл, толщиной 0,5 мм прессформы с 4 мм и диаметром 5 мм, рекомендуется для достаточно ДНК/РНК и белка добычу, соответственно. Для иммуноокрашивания 2 мм биопсии удар может использоваться вместо этого создавать три смежных отверстий за квадратный плесень, так что три реплицирует могут быть окрашены в хорошо.
    2. Удаление полиэтиленовой пленкой на каждой стороне отдельных форм с помощью пинцета.
      Примечание: Избегайте контакта с поверхности подвергаются силикона, как загрязнение может уменьшить будущие плазмы, склеивание эффективности.
    3. С помощью пинцета, организовать одинаковое количество голые силиконовые формы и coverslips стекла (№ 1, диаметр 12 мм) в чередующихся строках на крышке Перевернутый 48-ну плиты. После завершения, покрывают крышкой пластину 48-хорошо, чтобы избежать загрязнения.
    4. Кислородная плазма лечить весь 48-ну пластина крышки (т.е., плесени и стеклянных скольжениях). Сразу же после этого используйте щипцы для инвертировать силиконовые формы на прилегающих стекла coverslip. Нажмите твердо на плесень, чтобы обеспечить надлежащую степень склеиваемости. Пусть формы инкубации при комнатной температуре в течение 1 ч.
      Примечание: Продолжительность кислородной плазмы лечения будет варьироваться в зависимости от инструмент используется. Типичные условия для нашего инструмента являются рабочее окно давления газа между 0,3-4 мбар, кислорода газового потока в3мин. 20 см и пример воздействия плазмы для s 10-20.
    5. Стерилизация автоклавированием формы. Магазин формы при комнатной температуре в стерильных условиях до использования.
      Примечание: Формы может храниться на данном этапе на неопределенный срок.
  2. Подготовка Стоковый раствор белка эластина как
    1. Удаление лиофилизированные ELP из 4 ° C для хранения. Теплый белка до комнатной температуры перед открытием трубки для обеспечения без конденсации основывается на белок над многократного использования.
    2. Растворить в Дульбекко фосфат амортизированное saline (DPBS) на 4 ° C с постоянным перемешиванием ELP (т.е., спиннинг) на ночь.
      Примечание: ELP Стоковый раствор концентрации будет дополнительно разрежается с добавлением раствора сшивателя на определяемые пользователем объемный коэффициент. Например для окончательного ELP концентрации 3% (w/v), подготовьте 3,75% (w/v) ELP запасов решение, которое будет разведен в соотношении 4:1 объемного решения решение: сшивателя ELP. Отрегулируйте концентрацию как необходимые для нужного приложения.
    3. Стерильные фильтр ELP Стоковый раствор с помощью шприца фильтра 0.22 мкм. Хранить ELP на льду когда не в пользе.
  3. В области биобезопасности кабинета передачи стерильных форм, с использованием стерильных пинцетов к пластине 24-ну культуры ткани.
  4. Подготовка THPC раствор
    1. Развести THPC в DPBS просто предварительного использования. Отрегулируйте концентрацию раствора THPC согласно конечная концентрация ELP и желаемого сшивки соотношение.
      Примечание: Для протокола, окончательный ELP концентрации 3% (w/v) производится путем смешивания ELP Стоковый раствор с THPC раствора в объемном соотношении 4:1. Корректировать по мере необходимости.
    2. 2.6 мкл раствора THPC (80% в воде), для 997.4 мкл DPBS.
      Примечание: Эта концентрация THPC соответствует стехиометрического соотношения 1:1 гидрокси метильных групп на THPC и первичных аминов ELP белка при смешивании решения на описанных объемный коэффициент 4:1 для окончательного гидрогеля ELP 3% (w/v). Решение THPC вязкой и капель раствора может прилипнуть к стороне кончика пипетки. Точные концентрации Избегайте таких капель когда разбавления в DPBS. Очистите контейнер штока THPC азотом для предотвращения окисления фосфина и инактивации сшивателя.
    3. Вихрь решение смешивать и держать на льду.
    4. Стерильные фильтр THPC складе решения с помощью шприца фильтра 0.22 мкм. Разбавить THPC Стоковый раствор далее с стерильных DPBS для достижения более низкое соотношение стехиометрическим сшивки (например., 0.5:1 или 0.75:1).
      Примечание: THPC кислород чувствительной, и разбавленный раствор следует использовать в течение нескольких часов после приготовления.
  5. Разбить ячейки по инкубации с трипсина-ЭДТА в одну ячейку подвеска, Пелле клетки и подсчитать ячейки, вновь приостановлено в среде с помощью Горяева.
    Примечание: Точное протоколы для этого шага будет зависеть сильно нужной ячейки типа и приложения. Для нейронных прародитель ячеек, которые используются на протяжении всего этого протокола было проведено 0,025% трипсина-ЭДТА инкубации при комнатной температуре для 1,5 мин. Клетки были гранулированных на 200 x g на 2 мин. Для жизнеспособности рост клеток клеток должно быть приостановлено в обычных средних условиях. Типичный клеток плотности используется для инкапсуляции диапазон ячеек от 1-50 106 клеток/мл окончательного гидрогеля тома. Корректировать по мере необходимости.
  6. Алиготе нужное количество клеток в стерильных 1,5 мл пластиковых пробирок.
  7. Центрифуга клетки на ~ 200 x g на 3 мин тщательно, аспирационная супернатант и сохранить клетки гранул на льду.
    Примечание: Важно, чтобы полностью удалить все супернатант смягчения дальнейшего разбавления ELP и THPC сшивателя. Конкретные центрифугирования скорости будут зависеть от типа ячейки.
  8. Вновь приостановить Пелле клеток в ELP Стоковый раствор, таким образом, что объем составляет 80% от конечного объема (предполагая в соотношении 4:1 ELP решение: THPC раствора). Пипетка микс 20 - 25 раз для получения однородной смеси клеток и ELP.
    Примечание: Во избежание захвата в нижней части трубки для смягчения последствий повышения температуры и последующих фазового перехода ELP. Плесень каждый 2 мм с тремя реплицирует требует 7.5 мкл заключительного тома (т.е., 6 мкл ELP Стоковый раствор и 1,5 мкл THPC раствор) поровну разделены на 3 отверстия (т.е., 2.5 мкл окончательный объем в отверстие). Для формы 4 и 5 мм окончательный объем 7,5 мкл и 15,5 мкл требуется, соответственно.
  9. THPC запасов решение добавьте ячейки/ELP подвеска для окончательный объем оставшихся 20%. Пипетка микс 20 - 25 раз для получения однородной смеси.
  10. Сразу же Пипетка соответствующие окончательные объемы клеток/ELP/THPC смеси в каждом плесень на круговом движении. Повторите для всех форм.
  11. Проинкубируйте образцы при комнатной температуре 15 мин, следуют дополнительные инкубации при 37 ° C 15 мин.
    Примечание: Первый инкубационный период поможет облегчить первоначальный сшивки гидрогеля перед повышением температуры, выше ELP СМЕШЕНИЯ и заставить его тепловой фазы сегрегации.
  12. Медленно мкл 750 теплых клеток питательной среды для каждой скважины 24-ну пластины, избегая нарушая гели.
  13. Инкубируйте гидрогели при 37 ° C в течение 7 дней.
    Примечание: Полный среднего изменения рекомендуется каждые 1-2 дней в зависимости от типа ячейки. Ограничить нагрузку на гель, используйте стекло, пипетка Пастера, проставленный с кончиком пипетки 200 мкл, когда аспирационных среднего из колодца.

3. Immunocytochemistry клеток в 3D ELP гидрогели

  1. Приготовляют раствор фиксации, смешивая параформальдегида 16% (w/v) 10 мл (PFA) в 30 мл DPBS. Теплый раствор до 37 ° C.
  2. Аспирационная среднего от 24-ну пластины и осторожно промыть с 1 мл DPBS.
  3. 750 мкл раствора фиксации для каждой скважины и инкубировать при 37 ° C за 30 мин. Не использовать инкубатор культуры ткани во избежание загрязнения других культур с PFA паров.
  4. Тщательно удалить решение фиксации от каждой скважины, отбрасывая ПФА в контейнере соответствующего опасных отходов.
    Предупреждение: Воздействие PFA может вызвать раздражение кожи и глаз. Носите перчатки/очки и работать в химической зонта.
  5. Добавьте 1 мл DPBS для каждого образца. Немедленно аспирационная DPBS и отбросить в PFA контейнер для отходов.
  6. Стирайте образцы дважды с 1 мл DPBS за 10 мин.
    Примечание: Образцы можно хранить в DPBS на 4 ° C на срок до недели после запаечная пластина с парафина.
  7. Разрушения каждого образца с 750 мкл раствора permeabilization (100 мл DPBS и 0,25 мл Тритон X-100; PBST) за 1 ч при комнатной температуре на рокер на 15 об/мин.
  8. Аспирационная PBST и 750 мкл преграждая разрешение (95 мл PBS, 5 g бычьим сывороточным альбумином (БСА), 5 мл сыворотки и 0,5 мл Тритон X-100) для каждого образца. Инкубации при комнатной температуре 3 h на рокер на 15 об/мин.
    Примечание: Блокирование решения должен содержать сыворотки от видов хост, в котором были подняты вторичные антитела (например., коза, осел) и стерильные фильтруют через 0,22 мкм фильтр перед использованием.
  9. Приготовляют раствор разбавления антитела (97 мл DPBS, 2,5 г BSA, 2,5 мл сыворотки (от же хост видов как шаг 3,8) и 0,5 мл Тритон X-100). Разбавить основное антитело, используя раствор антител разрежения и 500 мкл раствора для каждого образца. Печать пластины с парафина и инкубировать на ночь при 4 ° C на рокер.
    Примечание: Нестин и Sox2 первичного антитела были разбавленных 1: 400 в растворе разбавления антитела от производителей оригинальных концентрации.
  10. Аспирационная раствор антител от каждого образца и стирать образцы с PBST 60 мин при комнатной температуре на рокер на 15 об/мин. Мыть повторите 3 раза.
  11. Разбавленных вторичных антител и 5 мг/мл фондовая DAPI (1:2, 000) с использованием решения разбавления антитела и 500 мкл раствора для каждого образца. Крышка 24-а с алюминиевой фольгой и инкубировать на ночь при 4 ° C на рокер.
    Примечание: Как вторичные антитела светочувствительных, образцы должны быть защищены от Фотообесцвечивание для всех последующих шагов. Анти мыши и коза анти кролик вторичные антитела козочки были разбавленных 1: 500 в растворе разбавления антитела от производителей оригинальных концентрации.
  12. Аспирационная раствор антител от каждого образца и стирать образцы с PBST за 30 мин при комнатной температуре на коромысле. Мыть повторите 3 раза.
  13. Расположите капли среднего hard-set монтажа на поверхность стекла слайда. С помощью щипцов, удалите излишки раствора из формы, слегка промокательной край плесень на бумажное полотенце. Тщательно место плесень вниз на носитель монтажа и избежать пузырей.
  14. Разрешить монтажа средних и затвердеть в течение 48 ч при комнатной температуре. Хранить образцы при комнатной температуре или 4 ° C. Позволяют монтаж среднего полностью установить за 48 ч до изображений как показатель преломления среды будет меняться в течение упрочнения. Печать образцов стекла Крышка слайд с четкой Лак для уменьшения загрязнения или образец движения.
  15. Изображения образцов с помощью конфокального микроскопа.

Результаты

ELPs, используемые в настоящем Протоколе состоят из пяти регионов: тег T7, тег His6, сайт расщепления enterokinase (EK), био активных региона и эластина как региона (рис. 1). Теги T7 и His6 позволяют легко идентифицировать через стандартный иммуноблоттинга методов. Введе?...

Обсуждение

Рекомбинантных белков и очистки является мощным инструментом для синтеза биоматериалов с высокой воспроизводимостью. Во многом обусловлено появлением коммерциализированной молекулярное клонирование, пользовательские рекомбинантных плазмид можно приобрести от нескольких поставщ?...

Раскрытие информации

Авторы не имеют ничего сообщать.

Благодарности

Авторы благодарят т. Палмер и H. Бабу (Stanford нейрохирургия) для предоставления мышиных РНУ. вектор искусства на рисунке 4 был использован и адаптированный Servier медицинского искусства под Creative Commons Attribution 3.0 Unported License (https://creativecommons.org/ Licenses/by/3.0/legalcode). Часть этой работы была выполнена в Стэнфордском Nano общий зал (SNSF), поддержке Национального научного фонда под награду ECCS-1542152. Металлофизики признает поддержку от национального института Генеральной медицинских наук национальных институтов здравоохранения (32GM 008412). C.M.M. признает поддержку от НРСА низ предварительного докторских стипендий (F31 EB020502) и программу Siebel ученых. S.C.H. признает поддержку от национальных институтов здравоохранения (U19 AI116484 и R21 EB018407), Национальный научный фонд (DMR 1508006) и Калифорнийского института регенеративной медицины (RT3-07948). Это исследование получил финансирование от Альянса для восстановительной реабилитации исследования и обучение (AR3T), который поддерживается Юнис Кеннеди Шрайвер национального института детского здоровья и развития человека (NICHD), Национальный институт Неврологических нарушений и инсульта (NINDS) и Национальный институт биомедицинских изображений и биоинженерии (NIBIB) национальных институтов здравоохранения под номером P2CHD086843 премии. Содержание является исключительно ответственности авторов и не обязательно отражают мнения национальных институтов здоровья.

Материалы

NameCompanyCatalog NumberComments
Elastin-Like Protein Expression and Purification
10 cm Petri DishesThermo Fisher ScientificFB0875713
70% EthanolRICCA Chemical2546.70-1
Ammonium SulfateSigma-AldrichA3920-500G
AmpicillinThermo Fisher ScientificBP1760-25G
Bacto AgarThermo Fisher Scientific9002-18-0 
BL21(DE3)pLysS Competent CellsInvitrogenC606003
ChloramphenicolAmresco0230-100G 
Deoxyribonuclease I from bovine pancreasSigma-AldrichDN25
EDTA disodium salt, dihydrateThermo Fisher ScientificO2793-500
GlycerolThermo Fisher ScientificBP229-4
IsopropanolThermo Fisher ScientificA451-4
Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside (IPTG) Thermo Fisher ScientificBP1755-10G
Luria BrothEMD Millipore1.10285.5007
ParafilmVWR52858-000
Phenylmethanesulfonyl fluoride (PMSF)MP Biomedicals195381
Sodium ChlorideThermo Fisher ScientificBP358-212
Sodium HydroxideSigma-AldrichS 8045-1KG
Syringe Filter Unit (0.22 μm)MilliporeSLGP033RB
Terrific BrothMillipore71754-4
Tris BaseThermo Fisher ScientificBP152-1
Cell Encapsulation in 3D ELP Hydrogels
0.22 μm syringe filtersMilliporeSLGV004SL
0.5 mm thick silicone sheetElectron Microscopy Science70338-05
24-well tissue culture plates Corning353047
Disposable Biopsy Punch (2 mm)Integra Miltex33-31
Disposable Biopsy Punch (4 mm)Integra Miltex33-34
Disposable Biopsy Punch (5 mm)Integra Miltex33-35
Dulbecco’s phosphate buffered saline (DPBS) Corning21-031-CM
No. 1 12 mm glass coverslipsThermo Fisher Scientific12-545-80
Tetrakis(hydroxymethyl)phosphonium chloride (THPC)Sigma-Aldrich404861-100ML
0.5% Tryspin/EDTAThermo Fisher 15400054
Immunocytochemistry of Cells in 3D ELP Hydrogels
16% (w/v) Paraformaldehyde (PFA)Electron Microscopy Sciences15701
Bovine Serum Albumin (BSA)Roche3116956001
DAPI (4',6-Diamidino-2-Phenylindole, Dihydrochloride)Molecular ProbesD1306 
Donkey SerumLampire Biological Labs7332100
Goat anti-mouse Secondary Antibody (AF488)Molecular ProbesA-11017
Goat anti-rabbit Secondary Antibody (AF546)Molecular ProbesA-11071
Goat SerumGibco16210-072
Mouse Nestin Primary AntibodyBD Pharmingen556309
Mouse Sox2 Primary AntibodyCell Signaling Technology23064S
Nail PolishElectron Microscopy Sciences72180
Triton X-100Sigma-AldrichX100-100ML
Vectashield Hardset Mounting Medium Vector LabsH-1400 

Ссылки

  1. Cukierman, E., Pankov, R., Stevens, D. R., Yamada, K. M. Taking Cell-Matrix Adhesions to the Third Dimension. Science. 294 (5547), 1708-1712 (2001).
  2. Birgersdotter, A., Sandberg, R., Ernberg, I. Gene expression perturbation in vitro-A growing case for three-dimensional (3D) culture systems. Seminars in Cancer Biology. 15 (5), 405-412 (2005).
  3. Gómez-Lechón, M. J., et al. Long-term expression of differentiated functions in hepatocytes cultured in three-dimensional collagen matrix. Journal of Cellular Physiology. 177 (4), 553-562 (1998).
  4. Baker, B. M., Chen, C. S. Deconstructing the third dimension - how 3D culture microenvironments alter cellular cues. Journal of Cell Science. 125 (13), 3015-3024 (2012).
  5. Pampaloni, F., Reynaud, E. G., Stelzer, E. H. K. The third dimension bridges the gap between cell culture and live tissue. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 8 (10), 839-845 (2007).
  6. Justice, B. A., Badr, N. A., Felder, R. A. 3D cell culture opens new dimensions in cell-based assays. Drug Discovery Today. 14 (1-2), 102-107 (2009).
  7. Caliari, S. R., Burdick, J. A. A practical guide to hydrogels for cell culture. Nature Methods. 13 (5), 405-414 (2016).
  8. Tibbitt, M. W., Anseth, K. S. Hydrogels as extracellular matrix mimics for 3D cell culture. Biotechnology and Bioengineering. 103 (4), 655-663 (2009).
  9. Madl, C. M., et al. Maintenance of neural progenitor cell stemness in 3D hydrogels requires matrix remodelling. Nature Materials. 16 (12), 1233-1242 (2017).
  10. Discher, D. E., Janmey, P., Wang, Y. Tissue Cells Feel and Respond to the Stiffness of Their Substrate. Science. 310 (5751), 1139-1143 (2005).
  11. Sun, Y., Villa-Diaz, L. G., Lam, R. H. W., Chen, W., Krebsbach, P. H., Fu, J. Mechanics Regulates Fate Decisions of Human Embryonic Stem Cells. PLoS ONE. 7 (5), e37178 (2012).
  12. Ehrbar, M., et al. Elucidating the Role of Matrix Stiffness in 3D Cell Migration and Remodeling. Biophysical Journal. 100 (2), 284-293 (2011).
  13. Rowlands, A. S., George, P. A., Cooper-White, J. J. Directing osteogenic and myogenic differentiation of MSCs: interplay of stiffness and adhesive ligand presentation. American Journal of Physiology - Cell Physiology. 295 (4), 1037-1044 (2008).
  14. Lampe, K. J., Antaris, A. L., Heilshorn, S. C. Design of three-dimensional engineered protein hydrogels for tailored control of neurite growth. Acta Biomaterialia. 9 (3), 5590-5599 (2013).
  15. Kilian, K. A., Mrksich, M. Directing Stem Cell Fate by Controlling the Affinity and Density of Ligand-Receptor Interactions at the Biomaterials Interface. Angewandte Chemie International Edition. 51 (20), 4891-4895 (2012).
  16. Tse, J. R., Engler, A. J. Preparation of Hydrogel Substrates with Tunable Mechanical Properties. Current Protocols in Cell Biology. , 10.16.1-10.16.16 (2010).
  17. Hughes, C. S., Postovit, L. M., Lajoie, G. A. Matrigel: A complex protein mixture required for optimal growth of cell culture. Proteomics. 10 (9), 1886-1890 (2010).
  18. DiMarco, R. L., Heilshorn, S. C. Multifunctional Materials through Modular Protein Engineering. Advanced Materials. 24 (29), 3923-3940 (2012).
  19. Meyer, D. E., Chilkoti, A. Purification of recombinant proteins by fusion with thermally-responsive polypeptides. Nature Biotechnology. 17 (11), 1112-1115 (1999).
  20. Aladini, F., Araman, C., Becker, C. F. W. Chemical synthesis and characterization of elastin-like polypeptides (ELPs) with variable guest residues. Journal of Peptide Science. 22 (5), 334-342 (2016).
  21. McMillan, R. A., Caran, K. L., Apkarian, R. P., Conticello, V. P. High-Resolution Topographic Imaging of Environmentally Responsive, Elastin-Mimetic Hydrogels. Macromolecules. 32 (26), 9067-9070 (1999).
  22. McMillan, R. A., Conticello, V. P. Synthesis and Characterization of Elastin-Mimetic Protein Gels Derived from a Well-Defined Polypeptide Precursor. Macromolecules. 33 (13), 4809-4821 (2000).
  23. Chung, C., Lampe, K. J., Heilshorn, S. C. Tetrakis(hydroxymethyl) Phosphonium Chloride as a Covalent Cross-Linking Agent for Cell Encapsulation within Protein-Based Hydrogels. Biomacromolecules. 13 (12), 3912-3916 (2012).
  24. Romano, N. H., Madl, C. M., Heilshorn, S. C. Matrix RGD ligand density and L1CAM-mediated Schwann cell interactions synergistically enhance neurite outgrowth. Acta Biomaterialia. 11, 48-57 (2015).
  25. Shah, M., Hsueh, P. Y., Sun, G., Chang, H. Y., Janib, S. M., MacKay, J. A. Biodegradation of elastin-like polypeptide nanoparticles. Protein Science. 21 (6), 743-750 (2012).
  26. Nettles, D. L., Chilkoti, A., Setton, L. A. Applications of elastin-like polypeptides in tissue engineering. Advanced Drug Delivery Reviews. 62 (15), 1479-1485 (2010).
  27. Madl, C. M., Heilshorn, S. C. Tyrosine-Selective Functionalization for Bio-Orthogonal Cross-Linking of Engineered Protein Hydrogels. Bioconjugate Chemistry. 28 (3), 724-730 (2017).
  28. Zhu, D., Wang, H., Trinh, P., Heilshorn, S. C., Yang, F. Elastin-like protein-hyaluronic acid (ELP-HA) hydrogels with decoupled mechanical and biochemical cues for cartilage regeneration. Biomaterials. , 132-140 (2017).
  29. Madl, C. M., Katz, L. M., Heilshorn, S. C. Bio-Orthogonally Crosslinked, Engineered Protein Hydrogels with Tunable Mechanics and Biochemistry for Cell Encapsulation. Advanced Functional Materials. 26 (21), 3612-3620 (2016).
  30. Cai, L., Dinh, C. B., Heilshorn, S. C. One-pot synthesis of elastin-like polypeptide hydrogels with grafted VEGF-mimetic peptides. Biomater Sci. 2 (5), 757-765 (2014).
  31. Straley, K. S., Heilshorn, S. C. Independent tuning of multiple biomaterial properties using protein engineering. Soft Matter. 5 (1), 114-124 (2009).
  32. Baneyx, F. Recombinant protein expression in Escherichia coli. Current Opinion in Biotechnology. 10 (5), 411-421 (1999).
  33. Graumann, K., Premstaller, A. Manufacturing of recombinant therapeutic proteins in microbial systems. Biotechnology Journal. 1 (2), 164-186 (2006).
  34. Tashiro, K., et al. A Synthetic Peptide Containing the IKVAV Sequence from the A Chain of Laminin Mediates Cell Attachment, Migration, and Neurite Outgrowth. Journal of Biological Chemistry. 264 (27), 16174-16182 (1989).

Перепечатки и разрешения

Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи

Запросить разрешение

Смотреть дополнительные статьи

1353D

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Конфиденциальность

Условия эксплуатации

Политика

СВЯЖИТЕСЬ С НАМИ

РЕКОМЕНДОВАТЬ БИБЛИОТЕКЕ

НОВОСТИ JoVE

Исследования

Образование

АВТОРЫ

Библиотекарь

О JoVE

Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены