Построение и применение атласа мозгового кровотока на основе церебральной функциональной области с использованием магнитно-резонансной томографии-артериального спин-мечения

Резюме

В этом исследовании была интегрирована магнитно-резонансная томография и изображения артериальной спиновой маркировки для получения атласа мозгового кровотока (КБТ) для функциональных областей головного мозга. Сравнение атласов типичной здоровой и хронической ишемии головного мозга выявило значительные различия в региональном распределении КБФ, что позволило провести быструю, неинвазивную оценку функциональной КБФ для помощи в диагностике и оценке лечения.

Аннотация

Церебральные заболевания часто требуют точной диагностики и мониторинга, что требует передовых методов визуализации. Существующие методы могут неадекватно выявлять ранние признаки обратимого повреждения тканей, что подчеркивает потребность в инновационных диагностических инструментах, которые могут количественно оценить изменения мозгового кровотока (КБТ) с высокой специфичностью и чувствительностью. В этом исследовании трехмерная артериальная спиновая маркировка (3D-ASL) сочетается со структурной МРТ для разработки комплексных атласов CBF, охватывающих все основные функциональные области мозга. Эта инновационная методология магнитно-резонансной томографии и спинового мечения артерий (MRI-ASL) обеспечивает быстрые и неинвазивные средства количественной оценки специфических для региона CBF, предлагая подробное представление об уровнях CBF в различных функциональных областях. Сравнение пациентов с хронической ишемией головного мозга (ХКБ) и здоровых пациентов выявило значительное снижение КБК в функциональных областях головного мозга в построенных атласах КБК для первых. Этот подход не только позволяет эффективно идентифицировать ЧМТ путем анализа одновременного снижения КБН в критических областях относительно здорового распределения, но также позволяет отслеживать реакцию на лечение и прогресс реабилитации с помощью продольных атласов ОАК. Атлас CBF, разработанный с использованием метода MRI-ASL, представляет собой новый шаг вперед в области церебральной диагностики и ухода за пациентами. Сравнивая региональные уровни КБФ с нормативными стандартами, этот метод расширяет диагностические возможности, позволяя клиницистам оказывать персонализированную помощь пациентам с церебральными заболеваниями.

Введение

В области нейровизуализации первостепенное значение имеет поиск точных, неинвазивных инструментов для оценки церебральной функции и патологии. Среди них мозговой кровоток (КБФ) является жизненно важным показателем, отражающим метаболические потребности и состояние здоровья тканей мозга¹. Традиционные подходы часто предполагают эмпирическую оценку, в значительной степени полагаясь на опыт клиницистов для интерпретации изображений и выявления патологических изменений². Тем не менее, достижения в области методов магнитно-резонансной томографии (МРТ), в частности артериального спинового мечения (ASL)³, открывают многообещающие возможности для количественного определения КБФ с большей точностью и^{объективностью4,5}.

В этом исследовании представлена новаторская методология, которая объединяет трехмерный ASL (3D-ASL) со структурной МРТ для построения всеобъемлющего атласа CBF по функциональным областям головного мозга⁶. Используя этот новый подход, клиницисты могут не только получить глобальное представление о КБФ, но и углубиться в конкретные функциональные области, что позволяет детально понять паттерны церебральной перфузии ^7,8. Это улучшение разрешения является прямым результатом технологического прогресса в области оборудования для обработки изображений, а не использования интерполированных вокселей. Стоит отметить, что большинство основных аппаратов МРТ, доступных сегодня на рынке, обычно обеспечивают точность визуализации лучше 1,5^мм9. Эти достижения в области технологий визуализации проложили путь к более детальной и точной оценке ОНБ. Это представляет собой смену парадигмы по сравнению с традиционной визуализацией, которой часто не хватает разрешения для обнаружения тонких изменений в КБФ, связанных с^{патологиями на} ранних стадиях.

Генезис данной методологии заключается в необходимости решения диагностических проблем, связанных с церебральными заболеваниями, включая хроническую ишемию головного мозга (ХМТ) и другие неврологические расстройства^11,12. Эти состояния требуют точной и своевременной оценки для эффективного руководства терапевтическими вмешательствами^13,14. Сравнивая атласы КБК между здоровыми людьми и пациентами с ЧМТ, это исследование выявило значительные различия в региональном распределении КБФ, предлагая понимание патологии заболевания и потенциальных путей лечения.

Полезность этого подхода MRI-ASL выходит за рамки диагностики, охватывая терапевтическую оценку и мониторинг прогрессирования заболевания¹⁵. Лонгитюдные атласы CBF имеют перспективы для отслеживания ответов на лечение и результатов реабилитации, предоставляя клиницистам бесценные инструменты для персонализированного ведения пациентов. Кроме того, способность различать незначительные изменения КБФ может служить ранним биомаркером надвигающихся тканевых аномалий, что позволяет проводить упреждающие вмешательства для смягчения неврологических повреждений до того, как они станут необратимыми¹⁶.

Несмотря на то, что эта методология представляет собой усовершенствованный инструмент, несколько путей ее совершенствования и расширения заслуживают рассмотрения. Стандартизация протоколов сканирования, методов нормализации КБФ и создание атласов здоровых КБФ с несколькими субъектами являются важнейшими шагами на пути к повышению точности диагностики и клинической полезности. Совместные усилия по лечению различных церебральных патологий имеют важное значение для валидации и совершенствования этого подхода для широкого клинического внедрения.

В этом исследовании представлен новый подход, в соответствии с которым атласы CBF, полученные с помощью МРТ, предлагают клиницистам глубокое понимание церебральной функции и патологии. Преодолевая разрыв между групповой визуализацией и клинической интерпретацией, эта методология может произвести революцию в диагностике и лечении множества неврологических заболеваний, открывая будущее точной медицины, адаптированной к уникальным потребностям каждого пациента.

протокол

Это исследование было одобрено Институциональным наблюдательным советом Пекинской больницы Дунчжимэнь, Пекин, Китай. Для 3D-мечения артериальных спиновых мечений (3D-ASL) был использован МРТ-сканер с импульсной последовательностью ASL (PASL) на основе турбоградиентного спинового эхо (TGSE) со следующими параметрами: TR 4000 мс, TE 25 мс, длительность болюса 700 мс, время инверсии 1990 мс. Программные средства, использованные в данном исследовании, перечислены в Таблице материалов.

1. Сбор и подготовка данных

ПРИМЕЧАНИЕ: Дисперсия параметров не зависит от исследовательского подхода. Оба формата DICOM и NIFTI используются для хранения цифровых данных медицинской визуализации, при этом DICOM является обычным выходным сигналом с устройств клинической визуализации. Тем не менее, формат NIFTI часто предпочитают из-за удобства вычислений в исследовательской деятельности. Преобразование из DICOM в NIFTI является простой и распространенной практикой¹⁷. В этом исследовании были получены подлинные данные DICOM, которые были преобразованы в формат NIFTI. Данные были получены с помощью МРТ-сканера мощностью 1,5 Тесла. В процессе регистрации перекрестных изображений в этом исследовании в основном использовалась последовательность восстановления инверсии с ослаблением жидкости (FLAIR), которая была объединена с изображениями CBF. Инструмент CBF Atlas (Table of Materials), использованный в данном исследовании, является коммерческим программным обеспечением.

1. Скопируйте данные в указанный рабочий каталог.
   1. Скопируйте все данные NIFTI в настраиваемый рабочий каталог.
      ПРИМЕЧАНИЕ: Рабочий каталог одинаков в операционной системе и MATLAB. Исследование проводится в соответствии со стандартом ориентации Right Anterior Upper (RAS).
   2. Перейдите в каталог, содержащий данные в текущем рабочем каталоге MATLAB, и используйте функцию niftiread для загрузки данных FLAIR в рабочее пространство. Используйте функцию size для проверки размеров последовательности FLAIR. Вызовите команду Flair_Slice для просмотра последовательности FLAIR (как показано на рисунке 1). Используйте конкретные команды следующим образом:
      FLAIR_XLF = niftiread('FLAIR_XFL.nii');
      размер(FLAIR_XLF)
      Flair_Slice(FLAIR_XLF);
   3. На рисунке 1 приведено изображение интерактивного графического пользовательского интерфейса (GUI) для последовательности FLAIR. Используйте нижнюю полосу прокрутки для быстрого просмотра различных последовательностей.
2. Быстрая проверка изображений CBF.
   1. Используйте функцию niftiread для загрузки данных CBF в рабочую область. Используйте функцию size для проверки размеров последовательности CBF. Вызовите команду CBF_Slice для просмотра последовательности CBF (как показано на рисунке 2). Используйте конкретные команды следующим образом:
      CBF_XLF = niftiread('CBF_XFL.nii');
      размер(CBF_XLF)
      CBF_Slice(CBF_XLF);
   2. На рисунке 2 приведен интерактивный скриншот последовательности CBF с графическим интерфейсом. Используйте нижнюю полосу прокрутки для быстрого просмотра различных последовательностей.
      ПРИМЕЧАНИЕ: На рисунке 2 диапазон значений КБФ обычно составляет 0-120 мл/100 г/мин. На рисунке 2 используется цветовая карта для представления различных уровней КБТ разными цветами.

2. Сегментация функциональных областей головного мозга по последовательности FLAIR

ПРИМЕЧАНИЕ: Последовательность FLAIR служит как для структурной визуализации, так и для обеспечения превосходных возможностей патологической диагностики. Таким образом, слияние FLAIR с CBF имеет важное диагностическое значение в клиниках. В этом исследовании сегментируются основные функциональные области головного мозга из последовательности FLAIR.

1. В рабочей области вызовите функцию FLAIR_Segment и запустите предварительно обученную программу сегментации изображений на основе 3-D U-Net для автоматического создания трипланарных представлений сегментации функциональных областей головного мозга, как показано на рисунке 3. Каждый цвет на рисунке 3 представляет собой отдельную функциональную область.
2. Для контроля различных функциональных областей головного мозга в режиме реального времени используйте взаимодействие перекрестия (рис. 3). Нажмите и перетащите центр перекрестия для произвольного 3D-исследования реконструированной анатомии мозга.
   ПРИМЕЧАНИЕ: Графический интерфейс пользователя на рисунке 3 также позволяет регулировать диапазон интенсивности оттенков серого, контрастность и яркость трипланарных видов.
3. Нажмите и перетащите левую кнопку мыши на любую область изображения для изменения уровней яркости и контрастности в режиме реального времени. Отпустите кнопку мыши, чтобы подтвердить и завершить корректировку.

3. Трипланарные представления о распределении КБТ по функциональным областям головного мозга

ПРИМЕЧАНИЕ: Изучение распределения КБК по различным функциональным областям головного мозга позволяет точно судить о состоянии пациента в клинике. В рамках функциональной области, показанной на рисунке 3, включение точных значений CBF из последовательности CBF и представление их в трипланарном виде позволяет проводить всестороннее обследование врачом.

1. Вызовите функцию CBF_triplanar для создания трипланарного представления графического интерфейса, показанного на рисунке 4, отображающего пространственное распределение CBF по функциональным областям. Переместите перекрестие, чтобы можно было изучить распределение CBF в интересующих регионах.
2. Нажмите кнопку « Подсказки по данным » в правом верхнем углу графического интерфейса, чтобы отобразить значения CBF в любом положении.
3. Нажмите и перетащите левую кнопку мыши на любую область изображения для изменения уровней яркости и контрастности в режиме реального времени. Отпустите кнопку мыши, чтобы подтвердить и завершить корректировку.

4. Атлас ОБТ по основным функциональным областям головного мозга

ПРИМЕЧАНИЕ: Нормализация распределений вероятностей КБФ по различным функциональным областям создает Атлас церебральных функциональных областей КБФ, выражающий уровни КБФ в церебральных функциональных областях субъекта.

1. Вызовите функцию CBF_Atlas для преобразования пространственного распределения CBF, показанного на рисунке 4 , в атлас CBF (как показано на рисунке 5).
   ПРИМЕЧАНИЕ: На рисунке 5 ось x представляет различные функциональные области головного мозга, а ось y представляет различные уровни CBF; Разные цвета обозначают разные уровни вероятности (чем краснее цвет, тем больше вокселей присутствует).
2. Нажмите кнопку Zoom In/Out в правом верхнем углу графического интерфейса, показанного на рисунке 5 , чтобы масштабировать частичные изображения.
   ПРИМЕЧАНИЕ: Кривая на рисунке 5 соединяет среднее значение КБМ по регионам.

5. Достоверные различия в CBF_Atlas между здоровыми субъектами и пациентами с ЧМТ

ПРИМЕЧАНИЕ: Используя тот же процесс, который описан в разделах 1-4, можно получить средние значения КБФ по различным функциональным областям головного мозга для пациентов с ЧМТ.

1. Используйте функцию CBF_Compare для построения сравнительного графика кривой КБФ у здорового пациента и пациента с ЧМТ (Рисунок 6).
2. Обратите внимание на значительные различия между кривой КБК пациента (окрашенной в черный цвет) и здоровой кривой (окрашенной в красный цвет) (Рисунок 6). Определите функциональные области с более выраженными каплями КБФ у пациента. Интегрируя шаг 3.3, повторно исследуйте области, в которых пациент показал худшие результаты по сравнению с другими областями.
   ПРИМЕЧАНИЕ: Шаг 3.3 позволяет просматривать уровни CBF пациента в трехмерном пространстве, что означает, что врачи могут использовать трипланарный вид графического интерфейса, показанный на рисунке 4 , для исследования CBF в любом положении пациента. При этом степень снижения КБН варьирует в зависимости от локализации у пациентов с ЧМТ. Врачи могут вернуться к рисунку 4 , чтобы сосредоточиться на областях мозга со значительным снижением КБФ.
3. Используйте значки в правом верхнем углу графического интерфейса пользователя (рисунок 5) для доступа к таким функциям, как уменьшение, увеличение, возврат к глобальному виду и пометка координат выбранного пикселя.
   ПРИМЕЧАНИЕ: Используя тот же принцип, результаты до и после лечения у одного и того же пациента также могут быть сравнены с использованием подхода, представленного на рисунке 6 , для оценки клинической эффективности с течением времени.

Результаты

В этом исследовании используются фактические данные о пациенте, полученные с помощью МРТ-сканера 1,5 Тл, для валидации количественной оценки мозгового кровотока (КБТ) и методологии построения атласа. Этапы предварительной обработки включали в себя структурные изображения FLAIR (

Обсуждение

Ключевые шаги (разделы 3 и 4) составляют основу для построения Атласа ОБТ, количественно оценивающего распределение ОБВ по функциональным областям головного мозга. Шаг 4.2 четко определяет уровни КБК для каждой области мозга, что является пионером новой методики. Это не только дает врача?...

Материалы

Name	Company	Catalog Number	Comments
CBF Atlas	Intelligent Entropy	CBF Atlas V1.0	Beijing Intelligent Entropy Science & Technology Co Ltd. Modeling for Thyroid Disease
MATLAB	MathWorks	2023B	Computing and visualization
MRI Device	Siemens	Amria 1.5 T	MRI scanner