MouseWalker (MW) Video Tracking and Kinematic Data Analysis

На компьютере откройте MATLAB. Добавьте папку, содержащую скрипт MouseWalker, в рабочий каталог и запустите MouseWalker. M в главной командной строке.

Загрузите папку с видео в качестве входного каталога. Перейдите в окно настроек, где находятся все параметры калибровки и порога. Протестируйте эффект от изменения некоторых параметров, нажав кнопку «Предварительный просмотр».

После настройки пороговых параметров убедитесь, что видео готово к автоматическому отслеживанию. Перейдите к первому кадру и нажмите «Авто», чтобы начать отслеживание. После завершения отслеживания, при необходимости, выполните ручную коррекцию, выбрав соответствующий след.

Сохраните изменения, нажав кнопку Сохранить. Затем нажмите «Оценить», чтобы создать выходные файлы из отслеживаемого видео. Убедитесь, что все графики графических выходных данных сохранены в папке «Результаты».

Затем убедитесь, что все количественные измерения, сгенерированные программным обеспечением MouseWwalker, сохраняются в электронной таблице Excel и суммируются в 1.Information_Sheet. Используйте MouseMultievaluate. M для объединения измерений из всех запусков в новый файл для анализа.

Чтобы выполнить анализ главных компонент, PCA, откройте pcaplotgenerator. py в Spyder и запустите код, нажав на кнопку Play. Выберите файл Excel для анализа и имя листа в автоматическом окне.

Если название листа не изменено, напишите Лист 1. В цифровом анализе чернил было обнаружено отсутствие поддержки задних лап. С уменьшением площади следа как для левой, так и для правой задних лап.

Общие следы стойки показали несколько уникальных особенностей. После травмы спинного мозга задние лапы имели более короткие следы стойки и более случайное положение пор как при приземлении, так и при взлете через 15 дней после травмы. Анализ главных компонент всех кинематических двигательных параметров показал 40-процентную дисперсию данных в первом компоненте, который отделил группу животных, имевших повреждение спинного мозга, от остальных во все моменты времени.

Используя другие сценарии, такие как сценарий тепловой карты, было обнаружено, что животные с травмой спинного мозга демонстрировали изменения в стратегиях походки во все моменты времени. Мыши с травмой спинного мозга также показали более низкий индекс прямолинейности стойки как в передних, так и в задних конечностях.