Conversion of Time Points to Lifeline Points Using the Python Conversion Functions and the CLOCCS Parameters

Для начала активируйте среду Conda, введя команду в терминал. Используйте команду, чтобы открыть интерактивную записную книжку Python. Создайте новую записную книжку Python в нужной папке, указав соответствующее имя.

Затем импортируйте файл Python, содержащий функции выравнивания, выполнив команду в первой ячейке. При использовании данных о почковании в качестве данных о фазе клеточного цикла. Импортируйте кадр данных, содержащий процент почкований в каждый момент времени, выполнив команду в новой ячейке.

Затем выровняйте почкующиеся данные по временной шкале точки жизни, введя функцию в новую ячейку. Затем импортируйте экспериментальный кадр данных в записную книжку, выполнив команду в новой ячейке. Выровняйте экспериментальные данные по шкале времени линии жизни, введя функцию в новую ячейку.

Затем введите команду в новую ячейку, чтобы загрузить набор данных, выровненный по линии жизни. Многообещающие данные, собранные с помощью РНК-секвенирования состояния 2, показали процент стыковки с течением времени как для невыровненной временной шкалы в минутах, так и для выровненной временной шкалы в точках линии жизни. Данные проточной цитометрии, собранные для набора данных Condition 2, построенного для выбранных моментов времени, показали, что данные соответствуют фазе, определенной выравниванием.