Чтобы получить доступ к плагинам с открытым исходным кодом для количественного автофлуоресцентного анализа или анализа QAF, в программном обеспечении Fiji. Нажмите Управление сайтами обновления, чтобы добавить отображаемый сайт обновления вычислений креативов на существующие сайты обновления. Чтобы установить плагин конвейера Spectralis, загрузите плагины и перезапустите Fiji.
Различные плагины Spectralis будут расположены в выпадающем меню плагинов в пакете Spectralis или Spectralis. Файлы экспорта Spectralis QAF XML, хранящиеся в красном, зеленом, синем или RGB-формате, ограничены измеренной шкалой значений автофокусировки от нуля до 255 и включают стандартные и черные калибровочные области. Чтобы создать изображение QAF, откройте выпадающее меню плагинов.
Нажмите Spectralis, выберите QAF XML reader и откажитесь от начального экрана. Появится новое окно с подсказкой, выберите директорию, содержащую спектральный экспорт XML QAF. Выберите каталог и нажмите кнопку «Выбрать».
В окне параметров QAF введите эталонный калибровочный коэффициент или RCF, включенный в информацию об изображении, и возраст пациента на момент получения изображения. После нажатия кнопки OK, когда появится всплывающее окно с меткой сопоставления с восемью битами, введите минимальное минимальное значение QAF или QAF минимальное и максимальное значение QAF или максимальное значение QAF для изображения QAF с цветовой кодировкой. Чтобы добавить по одному изображению за раз в разделе «Плагины», выберите «Spectralis», а затем «Добавить в стандартный retina_OCT» и закройте начальный экран.
Когда появится окно, выберите каталог, содержащий экспорт Spectralis OCT в формате XML. Выберите папку и нажмите кнопку «Выбрать», чтобы открыть BScan. После загрузки тома ОКТ и появления запроса выберите каталог, содержащий зарегистрированные изображения лица.
Выберите соответствующую папку и нажмите кнопку «Выбрать». На этом этапе выскочат три окна. Один помечен en Face stack, отображающий стек изображений из выбранной папки.
Второй помечен стеком BScan, отображающим сканирование OCTB, а средний или третий помечен выбором модальности. Выберите модальность из стека en Face. Как появится новое окно с всплывающим окном, выберите директорию, содержащую стандартную сетчатку, выберите или создайте директорию, содержащую стандартную сетчатку.
Изучите новую стандартную сетчатку глаза, прокрутите и переместите курсор, чтобы увидеть среднее значение и стандартное отклонение для этого конкретного местоположения. Нажмите на кнопку «Принять», чтобы либо добавить последнюю фотографию на стандартную сетчатку глаза, либо удалить ее. Чтобы добавить несколько изображений одновременно с помощью Batch_QAF_ стандартной сетчатки глаза, сначала подготовьте манифест.
txt в той же папке, что и идентификаторы случаев. Относительный путь от местоположения файла dot txt до OCT и стека enFace должен быть указан и разделен пробелом табуляции без каких-либо дополнительных пробелов до и после имен. Чтобы прокрутить стек BScan, перетащите панель внизу влево или вправо или выберите рамку BScan и используйте клавиши со стрелками влево и вправо на клавиатуре.
Обзор текущей области стека BScan представлен красной линией в окне стека enFace и в верхнем левом углу окна BScan, где отображается номер BScan. Чтобы отметить область, выберите отметку в сегменте линии рисования в окне BScan и начните с щелчка правой кнопкой мыши и перетаскивания курсора мыши до конца поражения. Нажмите клавишу «плюс» для увеличения масштаба и клавишу «минус» для уменьшения.
Наконец, нажмите OK, чтобы отметить область интереса. На снимке глаза 84-летнего пациента с промежуточной возрастной макулярной дегенерацией была обнаружена единичная выраженная мягкая друзы. Крупный план местности показал коричневый центр, представляющий отмеченные друзы, и цветные полосы, представляющие окружающие отверстия ISO.
Выходной файл содержал идентификатор случая, латеральность файла и выбранный метод визуализации. Каждая строка относилась к отверстию ISO, расстояния от внешнего края поражения которой указывались в нижней, а верхней колонках таблицы. Измерения QAF содержали минимальное медианное и максимальное значения пикселя в дыре ISO, количество пикселей, среднее значение пикселя и стандартное отклонение от среднего.
На снимке глаза 80-летнего пациента с ранней возрастной макулярной дегенерацией были обнаружены субретинальные, друзеноидные отложения. Вокруг каждого отмеченного поражения отверстия ISO были изображены с помощью цветного кодирования.
